Method Article
Рекомбинантный белок инженерии гидрогели являются выгодными для 3D клеточной культуры, поскольку они позволяют для полной перестройки полимера позвоночника и, следовательно, микроокружения клеток. Здесь мы описываем процесс очистки рекомбинантных белков эластина как и его применение в 3D гидрогеля клеток инкапсуляции.
Двухмерный (2D) культуры ткани методы имели важнейшее значение для нашего понимания фундаментальных клеточной биологии. Однако отсутствие систем традиционные 2D культуры ткани, матрицу трехмерного (3D), что привело к значительному разрыв между результаты собраны в пробирке и в естественных условиях. Чтобы устранить это ограничение, исследователи инженерии 3D гидрогеля культуры ткани платформ, которые могут имитировать биофизических и биохимических свойств микроокружения клеток в естественных условиях . Это исследование побудило необходимость разработки материалов платформ, которые поддерживают 3D клеток инкапсуляции и ниже по течению биохимических анализов. Рекомбинантный белок Инжиниринг предлагает уникальный набор инструментов для 3D гидрогеля материал дизайн и развития, позволяя для определенного контроля последовательности белка и, следовательно, выдвижением, потенциальные механических и биохимических свойств результирующей Матрица. Здесь мы представляем протокол для выражения recombinantly производные эластин как белка (ELP), который может использоваться для формы гидрогели самостоятельно перестраиваемый механических свойств и концентрации клеток клей лиганда. Мы далее представить методологию для инкапсуляции ячейки в пределах ELP гидрогелей и последующего immunofluorescent окрашивание встроенных клетки течению анализа и количественной оценки.
За последнее столетие двухмерный (2D) тканевой культуры превратился в составной набор инструментов для изучения основных клеток биологии в пробирке. Кроме того относительно недорогих и простых протоколов для 2D клеточной культуры привели к его принятию во многих биологических и медицинских дисциплин. Однако последние исследования показали, что традиционные 2D платформы может привести к результатам, что отклоняться заметно от этих собранных в естественных условиях, вызывая драгоценное время и средства впустую клинически ориентированных исследований1,2, 3. Мы и другие предполагают, что это расхождение может объясняться отсутствием родной биохимические и биофизические подсказки для ячейки, культивируемых на 2D-поверхностей, которые могут быть необходимы для оптимального распространения и созревания различных типов клеток.
Для устранения этих ограничений и помочь мост разрыва между 2D in vitro и in vivo исследования, исследователи имеют развитые трехмерные (3D) гидрогеля платформ для клеток инкапсуляции1,4,5 ,6. Гидрогели являются идеальным материалами для пилки эндогенного микроокружения внеклеточного матрикса (ECM) в естественных условиях из-за их механические свойства ткани, как и вода опухшие структуры, которая позволяет быстрый транспорт питательных веществ и сигнализации факторы7,8. Кроме того 3D гидрогели могут быть разработаны для независимого контроля над механических и биохимических свойств леса. Матрица механика9,10,,1112 и клеток клей лигандов13,,1415 хорошо известны влиять на клетки поведение в пробирке и в vivo. Таким образом 3D гидрогели с перестраиваемой свойства предлагают платформу для изучения причинно-следственных связей между клетками и их микроокружения. Критерии для идеального 3D гидрогеля матрицы включают простой, не цитотоксических клеток инкапсуляции, а также независимые перестройки физиологически соответствующих механических свойств и имитирует родной клеток клей мотивов.
Оба синтетические (например., полиэтиленгликоль, полимолочной кислоты, поли (гликолевая кислота)) и естественно производные (например., альгинат, коллаген, Matrigel) гидрогели имеют преимущества над 2D в vitro культуры платформ; Однако они также имеют существенные недостатки, ограничивающие их применимости. Во-первых, многие синтетические и естественно производные платформ требуют суровых сшивки условий, которые могут быть потенциально токсичными для клеток млекопитающих, ведущих к снижение жизнеспособности клеток7. Кроме того многие синтетические платформ не хватает родной биологическую и нужно быть функционализированных через вторичных химических реакций, которые можно добавить повышение стоимости и сложности16. Наконец в то время как естественно производные материалы обычно содержат встроенные био активных доменов, они часто страдают от высокой изменчивости партии к партии и часто ограничиваются формирования относительно слабый гели7,17.
Рекомбинантный белок инженерии представляет уникальный набор инструментов для дизайна материалов, позволяя явный контроль над последовательности белка и выдвижением, потенциальные механических и биохимических свойств окончательного гидрогеля эшафот18. Кроме того используя известные биологического механизма Escherichia coli (E. coli) выразить белков, могут изготавливаться материалы эффективно и последовательно с ограниченной Интер - и интра Пакетная изменчивости. Эластин подобных белков (ELP) представлены здесь имеет три инженерии доменов: (1 T7 и His6 тег, который позволяет для маркировки через дневно меткой антител, (2 «эластин как» регион, который наделяет упругой механических свойств и позволяет для химического сшивки и (3) «био активных» регион, который кодирует для клеток клей мотивы.
Наш регион эластин как основана на канонической (Валь-Pro-Gly-Xaa-Gly)5 эластина последовательности, где четыре из Xaa сайты аминокислоты изолейцина (Ile), но может быть разработан, чтобы быть любой аминокислот Кроме пролина. Эта последовательность наделяет рекомбинантных ELPs с нижней температуры (СМЕШЕНИЯ) поведением критические решения, которые могут быть использованы для простой очистки после выражения через тепловые Велоспорт19,20. Это свойство СМЕШЕНИЯ могут быть настроены для термически совокупных при разных температурах, изменяя гость «Xaa» остатков21,22.
Здесь «Xaa» позиции на одном из пяти повторений эластин как была заменена Амин представляя лизина (Lys) аминокислота, которая используется для сшивания гидрогеля. Наши предыдущие работы показал не цитотоксических и надежные сшивки реакции с Амин реактивный сшивателя тетракис (гидроксиметил) фосфониевых хлорид (THPC)23. По различной общее содержание и сшивателя концентрацию белка мы в состоянии производить гидрогели, которые могут быть настроены для диапазона23,9,физиологически соответствующей жесткости диапазона (~0.5-50 кПа)24. Помимо Тюнинг механических свойств, клеточной адгезии в пределах гидрогеля результаты от интеграции канонических клеток клей домены в пределах костяк ELP белка. Например включение расширенной фибронектин производные «RGDS» аминокислотной последовательности позволяет для клеточной адгезии и конформационные гибкость, а омлет, обязательной «RDGS» вариант ограничивает ячейки матрицы адгезии24. Путем модулирования соотношение клеток клей для не клей белков, а также концентрации общего белка, мы способны эффективно производить гидрогели, которые охватывают широкий спектр лигандом концентрации. Resultantly мы разработали платформу гидрогеля с развязкой биохимические и биофизические свойства, которые могут быть настроены независимо для оптимального 3D культуры различных типов клеток.
Помимо матрицы жесткости и клей лигандом перестройки рекомбинантных гидрогели предлагают возможности для разработки конкретных деградации материала профилей, который необходим для распространения клеток, распространением и миграции в рамках 3D контексте4 , 9. Эта деградация обеспечивается клеток секрецию протеаз, которые специально направлены на расширенной «RGDS»9 или эластин как последовательность25. ELP гидрогели, также было показано, для поддержки последующих биохимических анализов, которые необходимы для изучения жизнеспособности клеток и функции, включая immunocytochemistry, а также извлечения ДНК/РНК/белков для количественных реверс транскрипции полимеразной цепной реакции (qRT-PCR) и западной помарки9. ELP варианты также были использованы в ряде моделей в естественных условиях и, как известно, быть хорошо переносится иммунной системы26.
Вместе взятые, ELP как материальный платформу для исследования клеток инкапсуляции предлагает широкий спектр преимуществ по сравнению с синтетической или естественно производного материала платформы, которые зачастую не имеют такую же степень биохимические и биофизические перестройки и воспроизводимость. Кроме того, ПЭП простой и не цитотоксических использования с широкий спектр типов клеток (например., куриных Спинной корень ганглиев14,24, мышиных нейронных прародитель клетки9, человека мезенхимальных стволовых клеток27, говяжьи новорожденных хондроцитов28, человека эндотелиальных клеток29,30) позволяет для более физиологически соответствующие модели эндогенного 3D ECM, по сравнению с 2D клеточной культуры. Здесь мы представляем протокол для выражения recombinantly производные, ELPs для использования в качестве платформы перестраиваемый Гидрогель для 3D мобильных инкапсуляции. Далее мы представляем методологии вниз по течению люминесцентные маркировки и confocal микроскопии инкапсулированных клеток.
1. ELP выражение протокол
2. ячейки Инкапсуляция в 3D эластин подобных белков гидрогели
3. Immunocytochemistry клеток в 3D ELP гидрогели
ELPs, используемые в настоящем Протоколе состоят из пяти регионов: тег T7, тег His6, сайт расщепления enterokinase (EK), био активных региона и эластина как региона (рис. 1). Теги T7 и His6 позволяют легко идентифицировать через стандартный иммуноблоттинга методов. Введение на сайте расщепления ЭК позволяет для ферментативного удаления тега региона, при необходимости. Био активные региона кодирует для расширенного, фибронектин, полученных клеток клей («RGDS») или не клей («RDGS») последовательности. Наконец Центральный повтор эластин как региона содержит лизина группу остатков гость на сайте, который позволяет сшивки через THPC, в то время как фланкируя повторяет содержат изолейцина для достижения СМЕШЕНИЯ ~ 32 ° C31.
Пост выражение, SDS-PAGE или Западная помарка может использоваться для визуализации молекулярный вес и подтвердить личность ELPs, которые содержат антитела теги, например T7 (MASMTGGQQMG) или His6 (HHHHHH) (рис. 2). Успешный выражение в контролируемых условиях дает весьма однородной продукции, представленной присутствие одной темные полосы на приблизительное молекулярный вес (~ 37 кДа) этих белков, используя оба SDS-PAGE (рисунок 2A) и западной помарке) Рисунок 2B).
В неконтролируемых условиях наличие нижней молекулярного веса полос на западной помарке предполагает, что некоторые фракции белков не была полностью переведена и/или были деградировавших после выражения (рис. 2 c). В частности масс здесь равномерно распределены по ~ 9 кДа, который примерно соответствует вес одного региона био активных и трех эластин подобных регионов («повторить»), или приблизительно четвертая часть целевого белка. Эти небольшие фрагменты белка обычно присутствуют, когда выражение осуществляется при более высокой температуре (> 32 ° C) как показано на рисунке 2 c. Наличие этих нижней низкомолекулярных белков может привести к непредсказуемым механических свойств. Таким образом регулярного скрининга выражение пост рекомендуется обеспечить высокое качество конечного продукта.
Механическая жесткость гидрогели на основе ELP может быть изменен путем манипулирования концентрации ELP или отношение THPC реактивной группы: ELP первичных аминов. Одновременно концентрация клеток клей лигандов могут быть настроены путем изменения соотношения ELP варианты с клетки клей (RGDS) для не клей (RDGS) последовательности в рамках любого режима жесткость. Изменяя эти две переменные, мы можем производить гели, которые имеют спектр механических свойств и лигандом концентрации (рис. 3).
Для инкапсуляции клетки внутри 3D ELP гидрогели, требуемое количество клеток приостановлено в средне- и центрифугировали производить гранулы клеток (рис. 4A). Средний придыханием из трубки, и клетки являются вновь приостановлено равномерно в решении ELP желаемой концентрации. Далее THPC раствор добавляется подвеска клеток/ELP и тщательно накапаны до образования однородной смеси. Это решение быстро переведен в стерильных силиконовые формы в пределах 24-ну пластину с помощью пипетки и разрешено crosslink при комнатной температуре и 37 ° C 15 мин каждый (рис. 4В). Наконец средство добавляется хорошо пластины и инкубировали при 37 ° C в эксперименте.
Пятнать жить/мертвые может использоваться для оценки жизнеспособности клеток и инкапсуляции успешных ячейки в пределах гидрогели ELP. Как показано на рисунке 5, взрослых мышиных прародитель нейронных клеток (НПС) Показать жизнеспособность клеток высокой свыше 7 дней в течение 3% (w/v) ELP гидрогеля.
3D ELP гидрогели было ранее показано, к обслуживанию NPC ствола измеряется через выражение канонических NPC белковых маркеров SRY (секс определение региона Y)-Вставка 2 (Sox2) и Нестин9. НИПы, инкапсулированные в 3% (w/v) ELP гидрогели с низкой THPC сшивки шоу высокая экспрессия-локализованных Sox2 и цитоплазматических Нестин нити через иммуноокрашивания и конфокальная томография (рис. 6).
Рисунок 1 : Схематическое представление ELP и соответствующие аминокислотных последовательностей. ELP, используемые в данном исследовании содержится тег T7 и His6 для обработки изображений на основе антител, биоактивных региона для введения клеток клей доменов и эластин как региона, которая наделяет упругой механических свойств и позволяет для химической сшивки. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Рисунок 2 : Целевое выражение протеина могут быть проверены с SDS-PAGE и западную помарку для подтверждения молекулярная масса и личность конечного продукта лиофилизированные. Чисто полнометражного ELP работает на молекулярный вес 37 кДа, как сообщает SDS-PAGE (A) и Западная помарка, используя T7 (MASMTGGQQMG) или гистидина 6 тег (HHHHHH) (B). (C). Impure партий ELP из-за отклонений в протоколе ELP выражение может привести к выражение ELPs с ниже, молекулярным весом. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Рисунок 3: RGDS лигандом содержание могут быть настроены независимо от механических свойств в пределах ELP гидрогели. 5% (w/v) и 3% (w/v) ELP гидрогели имеют модули сдвига ~ 800 ПА и ~ 400 ПА, соответственно. Гидрогели с соотношением 1:1 THPC реактивной группы: ELP первичных аминов были высокоструктурированные при комнатной температуре в течение 15 мин, подогретой до 37 ° C и возможность сбалансировать 5 минут перед измерением. Данные являются среднее ± с.д., *p < 0,001. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Рисунок 4: Схема ячейки инкапсуляции в ELP гидрогели. (A). клетки первоначально отделить в одну ячейку подвеска в средне- и гранулированных с помощью центрифуги. Средний придыханием из трубки, и клетки являются вновь приостановлено в растворе ELP на желаемой концентрации и хорошо перемешивают. Наконец решение сшивки THPC и хорошо перемешивают. (B). сразу же после добавления THPC, решение будет брошена в силиконовые формы с пипеткой. Решение разрешается crosslink при комнатной температуре 15 мин, после чего второй инкубации 15 мин при температуре 37 ° C. Средний затем добавляется к культуре хорошо в течение всего эксперимента. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Рисунок 5: Нейронных прогениторных клеток поддерживать высокую жизнеспособность в ELP гидрогели. Представитель изображение нейронных прогениторных клеток инкапсулированы в 3% (w/v) ELP гидрогели с 1:1 сшивки (THPC реактивной группы: ELP первичных аминов) после 7 дней в культуре. Зеленый: жить окрашивание (Флуорексон AM); Красный: мертвые окрашивание (ethidium Антуану). Шкалы бар = 100 мкм.
Рисунок 6 : 3D ELP гидрогели поддерживают нейронных прогениторных клеток стволовых чайник выражение. Иммунофлюоресценции изображение нейронных прогениторных клеток выражая Sox2 и Нестин белков после 7 дней культуры в гидрогели ELP. Изображения показывают ячейки, инкапсулированные в 3% (w/v) ELP гели с 0.5:1 сшивки (THPC реактивной группы: ELP первичных аминов). Синий: DAPI (ядер); Красный: Sox2; Зеленый: Нестин. Шкалы бар = 25 µm. пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Рекомбинантных белков и очистки является мощным инструментом для синтеза биоматериалов с высокой воспроизводимостью. Во многом обусловлено появлением коммерциализированной молекулярное клонирование, пользовательские рекомбинантных плазмид можно приобрести от нескольких поставщиков, что значительно сокращает время для работы с материалами, такими как ELPs. Аналогично плазмиды может запрашиваться непосредственно из источника лаборатории когда оригинальное произведение было поддержано Федеральным контракт и будущая работа будет для некоммерческого использования. Полная последовательность аминокислот ELP ранее опубликовал несколько вариантов ELP31. Однако процесс от выражения для окончательной очистки рекомбинантных белков включает в себя ряд важных шагов, которые часто может привести к снижение урожайности или ниже качества продукта. Некоторые из наиболее распространенных проблем для подготовки ELP возникают в одном из следующих действий: (1) качество хранимых бактериальных запасов, (2 первого замораживания оттаивания цикл сорвать бактериальной мембраны и очистки (3) белка через тепловые Велоспорт.
Основное различие между выражения протеина и других-биологических средств производства материалов является, что мы используя биологического механизма рекомбинантных хостов синтезировать полимеры. Впоследствии эта техника поставляется с уникальным ограничение: клеточную смерть или повреждения. Смерть клетки чаще всего проявляется как ограниченное количество бактериальных колоний после мелирование тарелку или аномально небольшими колониями, которые растут довольно медленно. Бактериальные запасов, если внимательно, может оставаться стабильным лет; Однако циклы последовательных замораживания оттаивания сбоя повторного использования или морозильник может уменьшить жизнеспособность клеток или приводят к повреждению ДНК. Типичный BL21 бактерий запасы использовать между 10% и 40% глицерина по объему, смешанного с отсрочкой клеток. Глицерин призвана уменьшить повреждение мембраны от Нуклеатор кристаллы льда при замерзании. Таким образом, использование низких концентрациях (< 10%) может привести к ослабленной мембраны, при более высоких концентрациях (> 40%) может подавить точки замерзания воды достаточно, чтобы где запасы никогда не замерзает приводит к гибели клеток. Однако даже в пределах оптимального глицерин уровней, бактериальных запасов должно не быть позволено полностью что оттепель как сочетание мембраны ущерба от повторного замораживания и цитотоксических эффектов от глицерина может привести к снижение жизнеспособности запасов и повреждение ДНК. Таким образом если видно, что бактериальные фондовом приводит к низкой колонии счетчик или что клетки делят последовательно медленными темпами (проявляется как медленный темп рамп600 ОД во время выражения), повторное преобразование плазмида и сделать новый запас является простой Первый подход для устранения этой проблемы. Имея это в виду и обеспечить долгосрочное содержание бактериальных запасов и целостности ДНК, лучше всего хранить копии ваших плазмида как очищенная ДНК, замороженные в воде и не внутри клетки. Хранение ДНК таким образом обеспечит что в непредвиденные события, такие как неудачной акции или морозильник неудачи, надежный источник оригинального ДНК может использоваться для преобразования.
Еще один важный шаг в изготовление ELP является очистка целевого белка от хоста выражение. Экстракции белка от кишечной палочки достигается путем ломать стены клетки с помощью затравок кристаллы льда, которые формируют течение приостановленных ячейки lysate после замораживания, который усугубляет с циклов подряд замораживания оттаивания. Альтернативные методы для сверлении клеточной стенки могут быть использованы как sonication или прессом. В частности подряд замораживания оттаивания lysate выгодно как только требует морозильной камерой и нет другого оборудования специальности. Однако эта процедура nonspecifically освобождает ДНК, РНК и белков загрязнителей, помимо протеаз, которые могут ухудшить целевого белка. Таким образом, чтобы избежать загрязнения и снижение урожайности, дезоксирибонуклеаза, я (DNase) и phenylmethanesulfonyl фтор (PMSF) добавляются к ячейке lysate деградации ДНК и препятствует протеаз, соответственно. Присутствие ДНК перед добавлением DNase можно наблюдать визуально как «тягучий» внешний вид на протяжении повторно подвесной клетки lysate после первой оттепели. DNase активно снижает ДНК и таким образом уменьшает вязкость ячейки lysate, что делает его легче очистить через центрифугирования. Оптимальное сломать ДНК может быть визуально подтверждена обеспечения что lysate клетки, как представляется, полностью жидкого и тягучий появление больше не видна. На практике мы наблюдали, что добавление ~0.1 мг DNase в lysate клетки мл достаточно для достижения необходимых деградации. Однако если по-прежнему наблюдается присутствие ДНК, больше DNase могут быть добавлены последовали еще два-три часа агитации. Аналогичная проблема может также возникнуть, если DNase добавляется преждевременно до любого из lysate имеет потенциал, чтобы достаточно оттепели. В этом случае холоднее температура может ограничить эффективность деградации ДНК из-за преждевременной инактивации DNase. Чтобы избежать этой проблемы, это часто лучший способ позволить вновь приостановлено Пелле таять приблизительно 8 часов до начала лечения с DNase. Кроме того Если сообщается низкопротеиновое урожайности и распад ДНК был недостаточным, Добавление более PMSF для дальнейшего снижения потенциальной деградации белка от протеаз могут потребоваться.
Дополнительные соображения для обеспечения оптимального выражение ELPs включают в себя тщательное понимание преимуществ и ограничений выбранной антибиотика. Здесь pET15b векторов, содержащий ампициллина сопротивления гена были использованы для выражения протеина. Функционально серии ПЭТ вектор предусматривают значительные белков с 50% экспрессии белков бактерий, посвященный целевого белка после успешного индукции32,33. Однако ампициллин как антибиотик выбор приходит с некоторыми ограничениями, которые могут помешать с оптимальным выражением. Во-первых деградации ампициллина присутствии E. coli быстро может произойти из-за выпуска бета лактамаз. Если достаточное количество ампициллин разлагается, ампициллина кодирования плазмида (т.е. плазмида ELP-кодирование) могут быть потеряны полностью. В результате когда выражая ELPs для более длинней продолжительности, уровнях выражения протеина должно тщательно контролироваться в точках раз подряд, чтобы обеспечить достаточное количество ELP-кодирование гена остается для обеспечения желательной выражения. Возможные методы для устранения неполадок накопление бета лактамаз включают спиннинг вниз закваски и повторного приостановления клетки антибиотик свободной среде до прививки средство выражения. Этот процесс эффективно ограничивает передачу унижающего достоинство антибиотикам ферментов и обеспечивает большую часть клетки содержат вектор кодирования целевого белка. Кроме того ампициллин имеет ограниченный срок годности около двух-трех недель. Таким образом культура пластины для выражения протеина должны храниться при температуре 4 ° C для максимум до двух недель использования. Наконец для обеспечения эффективности ампициллина в средствах стартера и выражение, ампициллин Стоковый раствор следует быть производства свежих сразу перед употреблением, длительного хранения может привести к менее эффективный антибиотик.
Наличие СМЕШЕНИЯ позволяет для простой очистки ELPs через тепловые Велоспорт. В частности при более высокой температуре и в присутствии солей энтропийной силы вызывают ELPs становятся менее растворимы и впоследствии формируют фазу coacervate полимер богатые. С другой стороны при низких температурах, ELPs остаются растворимых и легко растворяются в решение. Велоспорт между этих двух температурных режимов, в сочетании с центрифугированием шаги для сбора и отбросить этапа не содержащих ELP последовательно концентрирует белка и одновременно уменьшает существование не ELP загрязнений.
Однако существует ряд этапов, где ELPs могут быть потеряны в этот процесс очистки. Во-первых до каждый холодного отжима, белковые решение является алкализованный к рН 9,0. Этот высокий рН служит для deprotonate некоторые аминокислоты на хребте белка, эффективно оставляя их в заряженном состоянии и дальнейшего повышения их растворимость. Следовательно вышеизложенного этот шаг или не обеспечивают достаточное время для растворения белков может привести к сокращению урожайности, как-солюбилизирован белки будут гранулированных во время центрифугирования и отбрасывается.
Аналогичным образом целевых белков могут быть потеряны во время процедуры горячего отжима при гранулированных ELP. Первоначально NaCl добавляется в надосадке богатых белком для уменьшения растворимости ELP. Соли работать в том, чтобы оградить электростатического взаимодействия между молекулами белков и воды, вызывая белок отделить от водной фазе. Этот эффект усиливается путем нагревать решение, которое, благодаря энтропийной эффекты, далее ломает hydrous «Кейдж» окружающих ELPs и сил агрегации белков. При более низких концентрациях белка (т.е., первый тепловой цикл), добавлением солей только часто недостаточно, чтобы вызвать этот этап разделения. Однако, как концентрация белка увеличивается (т.е., позднее тепловых циклов) и есть меньше вторичных загрязнителей, взаимодействовать с солями, ПЭП, легче будет выпадать в осадок. В результате соли при добавлении слишком быстро, они могут стать физически ловушке путем агрегирования белки, который эффективно снижает концентрации соли раствора и ограничивает дальнейшее осадков белок. Таким образом следует добавить соль в трех небольших партий, чтобы убедиться, что они имеют достаточно времени для содержанием однородно распространять через решение. Как окончательное примечание вариации ELP основу, либо путем дальнейшего изменения остатков гость эластин как региона или изменения в области био активных может значительно влияют на поведение СМЕШЕНИЯ. Следовательно, для обеспечения оптимальной белка урожай через варианты белка, важно оптимизировать рН, концентрации соли и соли типа (например., моновалентная или двухвалентной) для холодной и горячей спинов.
Запуск SDS-PAGE по завершении протокол рекомендуется как он может использоваться, чтобы легко определить, если значительные потери ELP происходит во время любого из шагов очистки. Вкратце если ELP обнаружен в надосадке после горячего отжима, затем белок не будучи осаждается эффективно. Аналогично Если ELPs определены в образце растворимых гранул после холодного отжима, затем белок не распускается эффективно.
ELP гидрогели предлагают много преимуществ над синтетических или естественно производные материалы. В частности использование сшивателя Амин реактивный THPC дает лоу кост, простой и настраиваемый механизм белка сшивки. Однако существуют различные ограничения в рамках протокола сшивки, который следует отметить. THPC это кислород чувствительной, и если хранятся в несоответствующих условиях, он может быстро ухудшиться в эффективности реакции. Кроме того из-за его реактивность с первичных аминов, THPC могут реагировать с окружающими белков в СМИ или те на поверхности клеток, которые богаты амины. Таким образом при формировании ELP гидрогели, рекомендуется избегать загрязнения СМИ с Пелле ячейки для уменьшения возможных внешних белков перекрестной реактивности и, таким образом, снижение эффективности сшивки. Наконец, этот механизм сшивки исключает последовательность био активные области, содержащие нет остатков лизина и таким образом, ограничивает потенциал интеграции некоторых клеток клей мотивы (например., IKVAV-34). Для устранения этих недостатков, изменения к ELP магистрали с азидом и bicyclononyne (BCN) реакции партнеров позволяет для Био ортогональных сшивки, как описано выше27.
Следует отметить, что поведение ELP СМЕШЕНИЯ играет важную роль в диктует гидрогеля микроструктуры. В температурных режимов выше СМЕШЕНИЯ ELPs осадок из решения, ведущего к формированию богатые белком и белка недостаточным фаз, которые могут влиять на матричная пористость и сшивки эффективность матрицы9. Поскольку большинство клеток культуры эксперименты проводятся при физиологически соответствующей температуре (~ 37 ° C) выше ELP СМЕШЕНИЯ, эти эффекты должны рассматриваться. Для гидрогели эффективно crosslink и формы сети взаимосвязанных белка, Первичные амины из лизина должны быть физически доступны для THPC сшивателя. Если ELP агрегации происходит до достижения достаточного сшивки, ELPs, захваченных в течение этапа богатых белком может быть недоступным и таким образом не в состоянии участвовать в сшивки. Чтобы устранить это ограничение, наш протокол требует сшивки период первоначального 15 мин при комнатной температуре, которая позволяет для предварительного сшивки гидрогеля, прежде чем ELP проходит его тепловой фазового перехода. Этот комнатной температуре инкубации следуют дополнительные 15 минут инкубации при 37 ° C доработать гидрогеля сшивки. Эта процедура имеет решающее значение для достаточно сшивки и надежные, воспроизводимые гелеобразования ELP материала.
В заключение гидрогели рекомбинантных белков, изготовленные с использованием ELP предлагают исключительные перестройки последовательности белка и, следовательно, 3D ячейки микроокружения. ELP полимеры были показано быть выражаются в высоких урожаев, легко очищаются из-за их поведение СМЕШЕНИЯ и биосовместимых в самых разнообразных систем in vitro и in vivo . Использование E. coli рекомбинантных принимающей обеспечивает простой и недорогой процедуру, которая вызывает почти идеальный контроль молекулярной массы полимера и функциональности. В совокупности эта техника позволяет для надежной перестройки и воспроизводимость гидрогеля платформы, позволяя для культуры широкого круга типов клеток в 3D. Наконец эта платформа гидрогеля ELP поддаются многие течению биохимических анализов, включая qRT-PCR, Западная помарка, экстракции ДНК и клетки иммуноокрашивания9.
Авторы не имеют ничего сообщать.
Авторы благодарят т. Палмер и H. Бабу (Stanford нейрохирургия) для предоставления мышиных РНУ. вектор искусства на рисунке 4 был использован и адаптированный Servier медицинского искусства под Creative Commons Attribution 3.0 Unported License (https://creativecommons.org/ Licenses/by/3.0/legalcode). Часть этой работы была выполнена в Стэнфордском Nano общий зал (SNSF), поддержке Национального научного фонда под награду ECCS-1542152. Металлофизики признает поддержку от национального института Генеральной медицинских наук национальных институтов здравоохранения (32GM 008412). C.M.M. признает поддержку от НРСА низ предварительного докторских стипендий (F31 EB020502) и программу Siebel ученых. S.C.H. признает поддержку от национальных институтов здравоохранения (U19 AI116484 и R21 EB018407), Национальный научный фонд (DMR 1508006) и Калифорнийского института регенеративной медицины (RT3-07948). Это исследование получил финансирование от Альянса для восстановительной реабилитации исследования и обучение (AR3T), который поддерживается Юнис Кеннеди Шрайвер национального института детского здоровья и развития человека (NICHD), Национальный институт Неврологических нарушений и инсульта (NINDS) и Национальный институт биомедицинских изображений и биоинженерии (NIBIB) национальных институтов здравоохранения под номером P2CHD086843 премии. Содержание является исключительно ответственности авторов и не обязательно отражают мнения национальных институтов здоровья.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Elastin-Like Protein Expression and Purification | |||
10 cm Petri Dishes | Thermo Fisher Scientific | FB0875713 | |
70% Ethanol | RICCA Chemical | 2546.70-1 | |
Ammonium Sulfate | Sigma-Aldrich | A3920-500G | |
Ampicillin | Thermo Fisher Scientific | BP1760-25G | |
Bacto Agar | Thermo Fisher Scientific | 9002-18-0 | |
BL21(DE3)pLysS Competent Cells | Invitrogen | C606003 | |
Chloramphenicol | Amresco | 0230-100G | |
Deoxyribonuclease I from bovine pancreas | Sigma-Aldrich | DN25 | |
EDTA disodium salt, dihydrate | Thermo Fisher Scientific | O2793-500 | |
Glycerol | Thermo Fisher Scientific | BP229-4 | |
Isopropanol | Thermo Fisher Scientific | A451-4 | |
Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside (IPTG) | Thermo Fisher Scientific | BP1755-10G | |
Luria Broth | EMD Millipore | 1.10285.5007 | |
Parafilm | VWR | 52858-000 | |
Phenylmethanesulfonyl fluoride (PMSF) | MP Biomedicals | 195381 | |
Sodium Chloride | Thermo Fisher Scientific | BP358-212 | |
Sodium Hydroxide | Sigma-Aldrich | S 8045-1KG | |
Syringe Filter Unit (0.22 μm) | Millipore | SLGP033RB | |
Terrific Broth | Millipore | 71754-4 | |
Tris Base | Thermo Fisher Scientific | BP152-1 | |
Cell Encapsulation in 3D ELP Hydrogels | |||
0.22 μm syringe filters | Millipore | SLGV004SL | |
0.5 mm thick silicone sheet | Electron Microscopy Science | 70338-05 | |
24-well tissue culture plates | Corning | 353047 | |
Disposable Biopsy Punch (2 mm) | Integra Miltex | 33-31 | |
Disposable Biopsy Punch (4 mm) | Integra Miltex | 33-34 | |
Disposable Biopsy Punch (5 mm) | Integra Miltex | 33-35 | |
Dulbecco’s phosphate buffered saline (DPBS) | Corning | 21-031-CM | |
No. 1 12 mm glass coverslips | Thermo Fisher Scientific | 12-545-80 | |
Tetrakis(hydroxymethyl)phosphonium chloride (THPC) | Sigma-Aldrich | 404861-100ML | |
0.5% Tryspin/EDTA | Thermo Fisher | 15400054 | |
Immunocytochemistry of Cells in 3D ELP Hydrogels | |||
16% (w/v) Paraformaldehyde (PFA) | Electron Microscopy Sciences | 15701 | |
Bovine Serum Albumin (BSA) | Roche | 3116956001 | |
DAPI (4',6-Diamidino-2-Phenylindole, Dihydrochloride) | Molecular Probes | D1306 | |
Donkey Serum | Lampire Biological Labs | 7332100 | |
Goat anti-mouse Secondary Antibody (AF488) | Molecular Probes | A-11017 | |
Goat anti-rabbit Secondary Antibody (AF546) | Molecular Probes | A-11071 | |
Goat Serum | Gibco | 16210-072 | |
Mouse Nestin Primary Antibody | BD Pharmingen | 556309 | |
Mouse Sox2 Primary Antibody | Cell Signaling Technology | 23064S | |
Nail Polish | Electron Microscopy Sciences | 72180 | |
Triton X-100 | Sigma-Aldrich | X100-100ML | |
Vectashield Hardset Mounting Medium | Vector Labs | H-1400 |
Запросить разрешение на использование текста или рисунков этого JoVE статьи
Запросить разрешениеThis article has been published
Video Coming Soon
Авторские права © 2025 MyJoVE Corporation. Все права защищены