Method Article
Burada, bir dizi indüksiyon için protokol ve kültürlü hücrelerdeki hücresel yaşlanma doğrulanmasını tartışmak. Biz farklı yaşlanma-inducing uyaranlara üzerinde odaklanmak ve ortak yaşlanma ilişkili işaretçileri miktar açıklayın. Fibroblastlar içerebilen bir model olarak kullanarak teknik ayrıntıları sağlar, ancak iletişim kuralları için çeşitli hücresel modelleri adapte edilebilir.
Hücresel yaşlanma kalıcı hücre döngüsü tutuklama farklı zararlı uyaranlara yanıt olarak aktif bir durumdur. Harekete geçirmek-in hücresel yaşlanma tümör giderme, yenileme ve yaşlanma doku dahil olmak üzere çeşitli patofizyolojik koşullar bir özelliğidir. Hücresel yaşlanma vivo içinde indükleyicileri hala kötü karakterizedir. Ancak, bir dizi uyaranlara hücresel yaşlanma ex vivotanıtmak için kullanılabilir. Bunların arasında en yaygın yaşlanma-indükleyicileri ikileştirici bitkinlik, iyonize ve iyonizan radyasyon, genotoksik uyuşturucu, oksidatif stres ve demethylating ve ajanlar acetylating vardır. Burada, bu uyaranlara fibroblastlar yaşlanma ikna etmek için kullanma hakkında ayrıntılı yönergeler sağlayacaktır. Bu iletişim kuralı kolayca primer hücre ve hücre hatları, kanser hücrelerinin de dahil olmak üzere farklı türleri için adapte edilebilir. Biz aynı zamanda yaşlanma indüksiyon doğrulama için farklı yöntemler açıklanmaktadır. Özellikle, biz lizozomal enzim yaşlanma ilişkili β-galaktozidaz (SA-β-gal), 5-ethynyl-2'-deoxyuridine (EdU) birleşme tahlil, ifadesi hücre döngüsünün düzeyi kullanarak DNA sentezi oranı etkinliğini ölçme üzerinde odaklanmak inhibitörleri p16 ve p21 ve ifade ve salgı üye Senescence-Associated salgı fenotip (SASP). Son olarak, örnek sonuçlar sağlar ve uygulamalar bu iletişim kurallarının tartışmak.
1961'de Hayflick ve Moorhead kültür birincil fibroblastlar sonra art arda pasajlar1proliferatif potansiyellerini kaybetmek bildirdi. Bu işlem sıralı telomerlerin kısalma her hücre bölünmesi sonra neden olur. Telomerlerin eleştirel kısa uzunluğu ulaştığında, nükleer silahların yayılmasına karşı geri dönüşü olmayan bir tutuklama etkinleştiren DNA hasarı yanıt (DDR) tarafından tanınır — de ikileştirici yaşlanma tanımlanır. İkileştirici yaşlanma Şu anda hücre mitogens hem apoptotik sinyal2,3duyarsız işler kalıcı hücre döngüsü tutuklama durumunu ikna etmek için bilinen birçok uyarinin biridir. Yaşlanma program normalde yüksek lizozomal etkinlik, mitokondrial disfonksiyon, nükleer değişiklikleri, kromatin düzenlemeler, endoplazmik retikulum stres, DNA hasarı ve yaşlanma ilişkili dahil olmak üzere ek özellikler ile karakterizedir salgı fenotip (SASP)3,4. Senescent hücreleri vücutta birden fazla işlevi var: geliştirme, yara iyileşmesi ve tümör bastırma2. Aynı şekilde, yaşlanma ve paradoksal olarak, tümör ilerleme5önemli bir rol oynamak için bilinir. Yaşlanma negatif ve kısmen çelişkili etkileri genellikle için SASP6atfedilen.
Son zamanlarda, bu fareler senescent hücrelerden ortadan kaldırılması ömrü uzatma ve yaşlanma özellikleri7,8,9,10,11, çoğunu ortadan kaldırılması yol gösterildi 12. aynı şekilde, birden çok uyuşturucu da senescent hücreleri (senolytics) ortadan kaldırmak için veya SASP13,14hedeflemek için geliştirilmiştir. Anti-aging tedavi potansiyel son zamanlarda alanına daha fazla dikkat çekti.
Çalışma mekanizmaları için hücresel yaşlanma ilişkili ve farmakolojik müdahaleler için gösterimleri özellikle de insan birincil fibroblastlar ex vivo modellerinde güveniyorsun. Ortak bazı özellikleri farklı yaşlanma indükleyicileri tarafından aktif olmakla birlikte, yaşlanma fenotip büyük bir değişkenlik gözlenen ve hücre türü, uyarıcı ve zaman noktası3,15gibi çeşitli faktörlere bağlıdır. 16,17. Eğitim ve senescent hücreleri hedefleme için heterojenite düşünün zorunludur. Bu nedenle, bu iletişim kuralı bir dizi farklı tedavileri kullanarak birincil fibroblastlar yaşlanma ikna etmek için kullanılan yöntem sağlamayı amaçlamaktadır. Bunu izah gibi yöntemler kolayca diğer hücre tipleri için adapte edilebilir.
İkileştirici yaşlanma dışında biz beş diğer yaşlanma-inducing tedaviler tarif: iyonlaştırıcı radyasyon, ultraviyole (UV) ışınları, doksorubisin, oksidatif stres ve epigenetik değişiklikler (yani promosyon histon asetilasyon veya DNA demethylation) . Hem, iyonizan radyasyon ve UV radyasyon doğrudan DNA hasarına neden ve yaşlanma18,19uygun doz tetik. Doksorubisin aynı zamanda yaşlanma DNA hasarı üzerinden olmak üzere DNA'ya enterkalasyon tarafından neden olur ve topoizomeraz II işlevi bozmakta ve böylece DNA durdurma mekanizmaları20onarmak. Genlerin yaşlanma için temel ifade normalde histon asetilasyon ve DNA metilasyonu tarafından kontrol edilir. Sonuç olarak, histon deacetylase inhibitörleri (Örneğin, sodyum bütrat ve SAHA) ve DNA demethylating (Örneğin, 5-aza) ajanlar yaşlanma Aksi takdirde normal hücreleri21,22tetikler.
Son olarak, dört senescent hücrelere ilişkili en yaygın veri işaretleyicilerini açıklanacaktır: yaşlanma ilişkili-β-galaktozidaz (SA-β-gal), DNA sentezi tarafından EdU birleşme tahlil, hücre döngüsü düzenleyiciler overexpression oranı etkinlik ve siklin bağımlı kinaz inhibitörleri p16 ve p21 ve overexpression ve SASP üyeleri salgılanmasını.
1. genel hazırlık
2. indüksiyon yaşlanma
3. yaşlanma işaretleri
SA-β-gal senescent fibroblastlar boyama zenginleştirme
Β-galaktozidaz (β-gal) bu tüm hücrelerde ifade edilir ve bir optimum pH 4.025,26olan lizozomal bir enzimdir. Ancak, yaşlanma sırasında organellerin Boyutu'nda artırın ve sonuç olarak, β-gal senescent hücreleri birikir. Bu enzim artan miktarda bir suboptimal pH 6,025,27, bile onun bir etkinlik tespit olanak sağlar. Şekil 1A karşı senescent birincil fibroblastlar Proliferasyona SA-β-gal boyama temsilcisi görüntüleri gösterir. Hücreleri de büyümüş ve düzensiz bir hücre gövdesi ile bakmak. Böylece bir boyama DAPI ile birlikte görselleştirme ve hücre (Şekil 1B) sayma kolaylaştırır belirtildiği gibi tek tek hücreler, ayırt etmek zor olabilir. Bir Floresan Mikroskobu DAPI boyama gözlemlemek için fotoğraf çekmek gereklidir. "Mavi" SA-β-gal boyama resimleri siyah görünmesi bu parlak alan kanal resimleri siyah/beyaz, alınacak anlamına gelir. Not, bir örnek içindeki tüm hücreleri β-gal için olumludur. Yaşlanma indüksiyon verimliliğini uyarıcı ve hücre tipi/kullanılan üzerindeki yükü son derece bağlıdır. Burada açıklanan protokoller vermiştir > % 50 β-gal pozitif hücrelerinin içinde bizim ellerde birincil fibroblastlar (BJ ve WI-38).
Daha az hücre EdU yaşlanma indüksiyon sonra dahil.
EdU bu etkin DNA sentezi sırasında DNA28dahil edilecek nükleozit timidin bir analog var. EdU birleşme DNA içine EdU, alkin grup28yoksun çünkü düzenli timidin gerçekleştirilemez reaksiyon için Copper-Catalyzed azid-alkin cycloaddition (CuAAC) yaptıktan sonra görüntülenmeyecektir. Bu belirli protokol için bir Sulfo-Cy3-azid kullanılıyor. Alkin azid kaplin yerini almıştır hücreleri floresan Cy3 filtre (Şekil 2A) altında görüntülenir. EdU birleşme tahlil gerçekleştirerek, Proliferasyona hücreleri olmayan Proliferasyona hücrelerden ayrılır ki dikkate almak önemlidir. Sigara Proliferasyona hücreler EdU birleşme tahlil hücre döngüsü tutuklama bu iki tür arasında ayırımcılık değil durgun veya senescent, anlamı olabilir.
Senescent fibroblastlar upregulate CDK inhibitörleri p16 ve p21
Senescent hücreleri oluşturmak CDKs inhibitörleri hücre döngüsü29durdurmak için kullanın. Özellikle p16 ve p21 genellikle senescent hücreleri3işaretleri ölçülür. Bir veya her iki işaretleri normal upregulated senescent hücrelerdeki upregulation çoğu zaman transkripsiyon düzeyinde ifade var... Her iki işaretleyiciyi de aynı anda bazı hücreler değil upregulate p16 transkripsiyon düzeyinde ve p21 evrensel ama özgü olmayan kalem yaşlanma15,17,30için kullanmadan önce teşvik edilmektedir. Şekil 3 p16 temsilcisi göreli quantifications gösterir ve fibroblastlar p21 mRNA yaşlanma için indüklenen. İmmunostaining ve/veya protein düzeyleri tespit etmek için Batı kurutma gibi diğer teknikleri da mümkündür.
Bir SASP senescent fibroblastlar görüntülemek
En senescent hücre transcriptionally upregulate çeşitli genler için kodlama salgılanan proteinler, SASP6adı verilen bir fenomen. SASP faktörler katılan inflamasyon, Örneğin, interlökin ve kemokinler dahildir veya hücre dışı matriks (ECM) bozulması, Örneğin, MMPs, ama son derece heterojen. İndüksiyon SASP faktörlerin ya mRNA ifade seviye qPCR üzerinden ya da salgılanan protein ile Enzyme-Linked IMMUNO jelleştirici Assay (ELISA) düzeyi ölçülerek değerlendirilir. Şekil 4 IL6, transkripsiyon ve salgılanan düzeyde upregulation gösterilen bir temsili resim gösterir. Biz sadece bir temsil IL6 kullanılır; Ancak, birden çok protokol 3.4 üzerinde önerilen listeden SASP üyeleri ölçmek için teşvik edilir.
Şekil 1: SA-β-gal senescent birincil fibroblastlar boyama zenginleştirme. BJ birincil sünnet derisi fibroblastlar (PD 34.1) iyonizan radyasyon (10 Gy) açarak yaşlanma için indüklenen. Hücreleri SA-βgal için on gün sonra ışınlama lekeli. SA-βgal (yukarı) tedavi edilmediği veya iyonizan radyasyon (aşağı) maruz BJ birincil fibroblastlar içinde boyama(a)temsilcisi sonuçları elde etmek için. Son büyütme: 100 X. (B) temsilcisi rakam SA-β-gal DAPI ile BJ birincil fibroblastlar için her iki tedavi edilmemiş (üç sol panel) Co lekeli veya (üç doğru panel) iyonlaştırıcı radyasyona maruz. (Mavi) boyama DAPI tek tek hücreler miktar kolaylaştırmak görselleştirmek için yardımcı olur. Parlak sahada çekilmiş olan fotoğraflar siyah/beyaz görünür. Bu nedenle, bu belirli resimleri SA-β-gal boyama siyah Perinükleer noktalar gibi görünür. Son büyütme: 100 X. SA-β-gal pozitif hücre Proliferasyona (Prol., beyaz) (C) miktar BJ fibroblastlar iyonlaştırıcı radyasyona maruz-tedavi karşılıkları (Senatör, mavi) karşı. Miktar standart hata ortalamaya gösterilen hata çubukları ile üç biyolojik çoğaltır kullanılarak gerçekleştirildi. İstatistiksel anlamlılık bir unpaired iki kuyruklu öğrenci t-testi delta-CT değerleri tarafından tespit edilmiştir. (n = 3, ± SEM, *** p değeri = < 0,01). Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.
Şekil 2: daha az sayıda hücre EdU dahil yaşlanma indüksiyon sonra. (A)temsilcisi görüntü EdU birleşme testin Proliferasyona WI-38 fibroblastlar PD 43.86 (solda) ve iyonlaşma radyasyonlu karşılıkları (sağda). Son büyütme: 100 X. EdU pozitif hücre Proliferasyona (Prol., beyaz) (B) miktar BJ fibroblastlar (PD 38,7) radyoaktif karşılıkları (Senatör, mavi) karşı. Miktar standart hata ortalamaya gösterilen hata çubukları ile üç biyolojik çoğaltır kullanılarak gerçekleştirildi. İstatistiksel anlamlılık kararlı bir unpaired iki kuyruklu öğrenci t-testi delta-CT değerleri tarafından (n = 3, ± SEM, *** p değeri = < 0,01). Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.
Şekil 3: Senescent fibroblastlar upregulate CDK inhibitörleri p16 ve p21. (A)miktar p16 mRNA ifadede Proliferasyona (Prol., beyaz, PD 35,3) veya 5 aza tedavi BJ hücrelerin (Senatör, mavi). (B) miktar p21 mRNA ifade Proliferasyona (Prol., beyaz, PD 35,3) içinde veya 5 aza tedavi BJ (Senatör, mavi) hücreleri. Miktar standart hata ortalamaya gösterilen hata çubukları ile üç biyolojik çoğaltır (her iki teknik çoğaltır) kullanılarak gerçekleştirildi. İstatistiksel anlamlılık kararlı bir unpaired iki kuyruklu öğrenci t-testi delta-CT değerleri tarafından (n = 3, ± SEM, *** = p değeri < 0,01). Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.
Şekil 4: Senescent fibroblastlar görüntülemek bir salgı fenotip (SASP). BJ fibroblastlar ifadede (A) IL6 miktar mRNA ya Proliferasyona (Prol., beyaz, PD 38,7) veya indüklenen yaşlanma için iyonizan radyasyon (Senatör, mavi) tarafından. (B) miktar IL6 protein ifade Proliferasyona PD 38.6 (Prol., beyaz) veya iyonizan radyasyon tedavi WI38 fibroblastlar (Senatör, mavi). Miktar standart hata ortalamaya gösterilen hata çubukları ile üç biyolojik çoğaltır kullanılarak gerçekleştirildi. QPCR veri söz konusu olduğunda her biyolojik REPLICATE iki teknik çoğaltmaları vardı. İstatistiksel anlamlılık kararlı bir unpaired iki kuyruklu öğrenci t-testi delta-CT değerleri tarafından (n = 3, ± SEM, ***p değeri = < 0,01). Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.
Eritici | Hisse senedi çözüm | Çalışma çözüm | Seyreltme tedavisi için | Son konsantrasyonu | |
SAHA | DMSO | 100 mM | 1 mM | 1:1,000 | 1 ΜM |
Sodyum bütrat | Steril su | --- | 1 M | 1:250 | 4 mM |
5-aza-2'-deoxycytidine (5-aza) | DMSO | 100 mM | 10 mM | 1:1,000 | 10 ΜM |
Tablo 1: Stok ve çalışma çözümleri farklı Epigenetically kaynaklı yaşlanma için kullanılan tedaviler için.
Bileşen | Birim | Son konsantrasyonu |
20 mg/mL X-gal | 1 mL | 1 mg/mL |
0,2 M sitrik asit sodyum fosfat tampon ph 6,0 | 4 mL | 40 mM |
100 mM potasyum ferrocyanide | 1 mL | 5 mM |
100 mM potasyum ferricyanide | 1 mL | 5 mM |
5 M sodyum klorür | 0.6 mL | 150 mM |
1 M magnezyum klorür | 0,04 mL | 2 mM |
Su | 12.4 mL | - |
Toplam | 20 mL |
Tablo 2: Boyama boyama yaşlanma ilişkili (SA) - β - gal için kullanılan çözüm bileşimi.
Hedef | (5' 3' ->) astar ileri | Astar (5' 3' ->) ters | UPL sonda | ||
Tübülin | CTTCGTCTCCGCCATCAG | CGTGTTCCAGGCAGTAGAGC | #40 | ||
Aktin B | ccaaccgcgagaagatga | ccagaggcgtacagggatag | #64 | ||
P16 | GAGCAGCATGGAGCCTTC | CGTAACTATTCGGTGCGTTG | #67 | ||
P21 | tcactgtcttgtacccttgtgc | ggcgtttggagtggtagaaa | #32 | ||
IL6 | CAGGAGCCCAGCTATGAACT | GAAGGCAGCAGGCAACAC | #45 | ||
IL8 | GAGCACTCCATAAGGCACAAA | ATGGTTCCTTCCGGTGGT | #72 | ||
IL1a | GGTTGAGTTTAAGCCAATCCA | TGCTGACCTAGGCTTGATGA | #6 | ||
CXCL1 | CATCGAAAAGATGCTGAACAGT | ATAAGGGCAGGGCCTCCT | #83 | ||
CXCL10 | GAAAGCAGTTAGCAAGGAAAGGT | GACATATACTCCATGTAGGGAAGTGA | #34 | ||
CCL2 | AGTCTCTGCCGCCCTTCT | GTGACTGGGGCATTGATTG | #40 | ||
CCL20 | GCTGCTTTGATGTCAGTGCT | GCAGTCAAAGTTGCTTGCTG | #39 | ||
PAI1 | AAGGCACCTCTGAGAACTTCA | CCCAGGACTAGGCAGGTG | #19 | ||
MMP1 | GCTAACCTTTGATGCTATAACTACGA | TTTGTGCGCATGTAGAATCTG | #7 | ||
MMP3 | CCAGGTGTGGAGTTCCTGAT | CATCTTTTGGCAAATCTGGTG | #72 | ||
MMP9 | GAACCAATCTCACCGACAGG | GCCACCCGAGTGTAACCATA | #53 |
Tablo 3: Astar dizileri ve onların karşılık gelen UPL mRNA yaşlanma işaretlerinin içinde insan kaynaklı örnekleri algılamak için sonda.
Bileşen | Birim/örnek |
Sensifast yoklama Lo-Rox mix | 5 ΜL |
Astar-set (50 µM) | 0.1 ΜL |
UPL sonda | 0.1 ΜL |
Nükleaz ücretsiz su | 2.3 ΜL |
cDNA (~ 4 ng) | 2.5 ΜL |
Toplam | 7.5 ΜL |
Tablo 4: QPCR reaksiyon bileşimi UPL sistemi için karıştırın.
Burada iletişim kuralları insan birincil fibroblastlar için optimize özellikle BJ ve WI-38 hücreleri. İkileştirici yaşlanma, iyonizan radyasyon ve doksorubisin, protokollerde başarıyla uygulanan diğer türlerini fibroblastlar (HCA2 ve IMR90) ve diğer hücre tipleri (Yani yenidoğan melanosit ve Lenfositi veya IPSC elde edilen cardiomyocytes) Bizim laboratuvarda. Ancak, ek hücre tipleri için uyarlamalar numaralı seribaşı hücreleri, yöntemleri ve hücreler ekleme/ayırma için plastik destekler için yardımcı kimyasallar ve toksisite önlemek için tedavi dozu gibi bazı ayrıntılar ayarlayarak optimize edilebilir.
Birincil fibroblastlar bile kullanımı bir dizi zorluklar teşkil etmektedir. Senescent hücreleri onların Proliferasyona göre daha ayırmak genellikle daha zordur ve çoğu zaman daha fazla duyarlı trypsinization veya diğer herhangi bir tür ayırma yöntemi, ayırma sonra canlılığı biri az olduğu anlamına gelir Proliferasyona hücreleri. Farklı yöntemleri yaşlanma-inducing için uygun denetimi zor bir seçimdir. Örneğin, doksorubisin gibi uyuşturucu dayalı tedaviler araçla kısa bir tedavi öneririm: PBS için 24 saat kontrol örnekleri doksorubisin tedavi hücreler için söz konusu olduğunda hemen hasat/işlem tarafından takip. Yaşlanma için indüklenen hücre tedavisi (altı gün kültür doksorubisin tedavi hücreler için) uygulandıktan sonra bir genişletilmiş kültür zaman geçmesi ve kontrol hücreleri zaman PBS çıkarıldıktan sonra kültürlü eşit miktarda olmalıdır iddia. Ancak, uzun bir kültür hücreleri daha fazla bölmek için aşırı birleşmesi olmak için veya daha fazla passaging gerektirecek şekilde sağlayacak ve PD. aşırı izdiham artırmak için korumak hücreleri rağmen görünmesini SA-β-gal gibi yaşlanma işaretleri neden olabilir onların potansiyel31Proliferasyona. Artan PD çoğaltma sınırlarını (ve ikileştirici yaşlanma) onları daha yakın almak ve onları daha az doksorubisin tedavi karşılıkları karşılaştırılabilir olun. Benzer bir durum diğer tedaviler için geçerli olacak. Biz her durum için daha uygun gördüğünüz denetimleri tavsiye ettiler.
Yaşlanma hücreleri uyarmak için kullanılan tekniklerin çoğu nispeten kolay ve düz ileri gibi görünüyor, ancak birçok faktör deneyler sonucu etkileyebilir. Örneğin, normal glikoz konsantrasyonu fibroblastlar için geleneksel hücre kültür ortamının 4,5 g/l. Diğerleri için daha yüksek konsantrasyonlarda erken yaşlanma33' e neden olabilir ancak, kök hücreler gibi bazı hücre türleri için glikoz düşük konsantrasyonlarda proliferatif onların potansiyel32, genişletebilir. Ayrıca, senescent hücreleri yüksek metabolik ve yüksek miktarda salgılanan faktörler34üretmek için enerji harcamak gibi diğer yaşlanma ilişkili fenotipleri salınımlarını glikoz konsantrasyonlarda tarafından etkilenebilir.
Başka bir potansiyel hücre kültür orta serum değişkendir. Kompozisyon serum normalde tanımlı değildir ve hayvan kaynak ve toplu iş göre değişir. Özellikle, büyüme faktörleri ve pro-inflamatuar protein miktarı yaşlanma35etkileyebilir. Önerdiğimiz bir serum aynı toplu iş için bütün deneyin gereksiz ve karıştırıcı değişkenlik önlemek için kullanılır. Ancak, bazı ELISA tabanlı iletişim kuralları için kullanılan orta serum ücretsiz kullanımı gibi kaçınılmaz bazı teknik koşullar SASP ifade azaltabilirsiniz.
Oksijen gerginlik tam yaşlanma indüksiyon için önemlidir. Böylece hücrelerin prolifere değil ama geri dönüşümsüz tutuklandı36değildir hipoksi geroconversion, inhibe olabilir. Ancak, en yaygın sorun deneysel kurulumunda hipoksi ama hyperoxia değildir. Nitekim, standart kültür koşulları kez % 20 oksijen "normoxia" kullanın., ancak çoğu hücre tipleri için fizyolojik şartlarda düşüktür. Fare blastokistlerin mevcut yaşlanma (SA-βgal ve DNA hasarı) işaretleri ne zaman % 20 oksijen, onların içinde vivoaksine, kültürlü-türetilmiş karşıtları ya da %5 oksijen37, kültürlü aynı hücreleri. Ayrıca, fare fibroblastlar daha fazla fizyolojik şartlarda (%3 oksijen) ve geleneksel görüntü olanlar (% 20 oksijen) SASP38kültürlü. Burada, tüm kültürler için %5 oksijen kullandık ve deneyler ve biz araştırmacılar ilgi belirli hücre türü için kullanılan oksijen konsantrasyonları yeniden gözden geçirilmesi için çağırıyorum.
Son olarak, başka bir faktör dikkate senescent hücrelerin içsel heterojenite olduğunu. Bir taraftan, farklı hücre tipleri ve hatta hücre suşları yaşlanma ilişkili fenotipleri farklılıkları görüntülemek. Ayrıca, bir upregulation görmek nerede rağmen gösterildiği Şekil 3A, olduğu gibi örneğin fibroblastlar bazı suşları değil upregulate p16 yaşlanma indüksiyon15,16,17, üzerine transkripsiyon düzeyinde yapmak P16, bu istatistiksel olarak anlamlı değildi. Protein düzeyleri ölçme bazı durumlarda bu CDK inhibitörü artan bir faaliyet göstermek bu yüzden P16 translasyonel ve translasyon düzeyinde de kontrol edilir. Ancak, bazı hücreler diğer CDK inhibitörleri p21 gibi sadece güveniyor olabilir. İkisi de transkripsiyon düzeylerini ölçme tavsiye ediyoruz. SASP tam bileşimi de3ürettiği cepten bağlıdır. Ayrıca, bazı hücreler yapısal β-galaktozidaz, SA-β-gal Bu yaşlanma3mutlaka göstergesi değildir boyama için olumlu bir sonuç veren yüksek seviyede hızlı. Bazı durumlarda, bu sorunu SA-β-gal boyama protokolü sırasında boyama çözüm ile kuluçka zamanı azaltarak aşmak. Belirtildiği gibi aşırı birleşmesi hücreleri de SA-β-gal ile onlar biz araştırmacılar bu boyama gerçekleştirmek için seyrek kültür hücrelere teşvik senescent31, varlık olmadan leke. Öte yandan, yaşlanma fenotip istikrarlı39değil. SASP bileşimi ve yaşlanma diğer işaretleri görünümünü çoğu saat-bağımlı17,40. Burada, hangi hücrelerin her tedavi sonrası zaman puan tamamen senescent olarak kabul edilir ve rutin olarak bizim Laboratuvarda kullanılan tavsiye ettiler. Önemlisi, işaretçileri daha kısa bir zamanda noktada ölçüm eksik yaşlanma40nedeniyle olumsuz sonuçları render. Beri senescent tedaviler çoğunda hücreler yüzdesi haline değil, Ayrıca, uzun bir zaman noktası kullanarak genişletmek ve ifade senescent işaretleri azaltır kültür sollamak kaç senescent hücre için yeterli zaman verebilir. Senescent hücreleri heterojen ve farklı veri işaretleyicilerini birden çok uyarılar görünümlerinde, biz son derece araştırmacılar aynı örnek içinde birden çok yaşlanma işaretleri kullanmak için teşvik.
N/A
Biz üyeleri verimli tartışmalar için yönetici laboratuar ve Thijmen van Vliet veri ve iletişim kuralı UV kaynaklı yaşlanma üzerinde paylaştığınız için teşekkür ederiz.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
DMEM Media - GlutaMAX | Gibco | 31966-047 | |
Fetal Bovine Serum | Hyclone | SV30160.03 | |
Penicillin-Streptomycin (P/S; 10,000 U/ml) | Lonza | DE17-602E | |
Dimethyl Sulfoxide (DMSO) | Sigma-Aldrich | SC-202581 | |
Nuclease-Free Water (not DEPC-Treated) | Ambion | AM9937 | |
T75 flask | Sarstedt | 833911002 | |
Trypsin/EDTA Solution | Lonza | CC-5012 | |
PBS tablets | Gibco | 18912-014 | |
1.5 ml microcentrifuge tubes | Sigma-Aldrich | T9661-1000EA | |
Corning 15 mL centrifuge tubes | Sigma-Aldrich | CLS430791 | |
6-well plate | Sarstedt | 83.3920 | |
24-well plate | Sarstedt | 83.3922 | |
13mm round coverslips | Sarstedt | 83.1840.002 | |
Steriflip | Merck Chemicals | SCGP00525 | |
Cesium137-source | IBL 637 Cesium-137γ-ray machine | ||
UV radiation chamber | Opsytec, Dr. Göbel BS-02 | ||
Doxorubicin dihydrochloride | BioAustralis Fine Chemicals | BIA-D1202-1 | |
Hydrogen peroxide solution | Sigma-Aldrich | 7722-84-1 | |
5-aza-2’-deoxycytidine | Sigma-Aldrich | A3656 | |
SAHA | Sigma-Aldrich | SML0061 | |
Sodium Butyrate | Sigma-Aldrich | B5887 | |
X-gal (5-Bromo-4-chloro-3-indolyl-β-D-galactopyranoside) | Fisher Scientific | 7240-90-6 | |
Citric acid monohydrate | Sigma-Aldrich | 5949-29-1 | |
Sodium dibasic phosphate | Acros organics | 7782-85-6 | |
Potassium ferrocyanide | Fisher Scientific | 14459-95-1 | |
Potassium ferricyanide | Fisher Scientific | 13746-66-2 | |
Sodium Chloride | Merck Millipore | 7647-14-5 | |
Magnesium Chloride | Fisher Chemicals | 7791-18-6 | |
25% glutaraldehyde | Fisher Scientific | 111-30-8,7732-18-5 | |
16% formaldehyde (w/v) | Thermo-Fisher Scientific | 28908 | |
EdU (5-ethynyl-2’-deoxyuridine) | Lumiprobe | 10540 | |
Sulfo-Cyanine3 azide (Sulfo-Cy3-Azide) | Lumiprobe | D1330 | |
Sodium ascorbate | Sigma-Aldrich | A4034 | |
Copper(II) sulfate pentahydrate (Cu(II)SO4.5H2O) | Sigma-Aldrich | 209198 | |
Triton X-100 | Acros organics | 215682500 | |
TRIS base | Roche | 11814273001 | |
LightCycler 480 Multiwell Plate 384, white | Roche | 4729749001 | |
Lightcycler 480 sealing foil | Roche | 4729757001 | |
Sensifast Probe Lo-ROX kit | Bioline | BIO-84020 | |
UPL Probe Library | Sigma-Aldrich | Various | |
Human IL-6 DuoSet ELISA | R&D | D6050 | |
Bio-Rad TC20 | Bio-Rad | ||
Counting slides | Bio-Rad | 145-0017 | |
Dry incubator | Thermo-Fisher Scientific | Heratherm | |
Dimethylformamide | Merck Millipore | 1.10983 | |
Parafilm 'M' laboratory film | Bemis | #PM992 | |
Tweezers | |||
Needles |
Bu JoVE makalesinin metnini veya resimlerini yeniden kullanma izni talebi
Izin talebiThis article has been published
Video Coming Soon
JoVE Hakkında
Telif Hakkı © 2020 MyJove Corporation. Tüm hakları saklıdır