Method Article
Bu iletişim kuralı birincil amniyotik sıvı ve membran Mezenkimal kök hücrelerin içine İndüklenmiş pluripotent kök hücreler tamamen kimyasal olarak tanımlanan koşullarda bir sigara entegre episomal yaklaşım kullanarak yeniden programlama açıklar. Yordamlar, ayıklama, kültür, yeniden programlama ve elde edilen İndüklenmiş pluripotent kök hücreler sıkı yöntemlerle karakterizasyonu ayrıntılı olarak açıklanmıştır.
Otolog hücre tabanlı terapiler gerçeklik İndüklenmiş pluripotent kök hücreler getirilmesi ile bir adım daha var. Cenin kök hücre, amniyotik sıvı ve membran Mezenkimal Kök hücre, gibi farklılaşmamış hücreleri söz doku Mühendisliği ve gelecekteki Pediatrik müdahaleler ve kök hücre Bankacılığı IPSC içine yeniden programlama için benzersiz bir tür temsil eder. Burada sunulan Protokolü ayıklamak için en iyi duruma getirilmiş bir yordam açıklanır ve birincil amniyotik sıvı ve membran Mezenkimal Kök hücre kültürü çalışmalarının ve episomal üreten tamamen kimyasal olarak tanımlanmış kültür bu hücreler pluripotent kök hücrelerden indüklenen insan rekombinant vitronectin ve E8 orta kullanan koşullar. -Akış Sitometresi, confocal görüntüleme, teratoma oluşumu ve transkripsiyon profil oluşturma – sıkı yöntemleri uygulayarak yeni satırlar karakterizasyonu ayrıca açıklanmıştır. Yeni oluşturulan satırları işaretleri embriyonik kök hücre – Oct3/4A, MicroRNAs, Sox2, TRA-1-60, TRA-1-81, SSEA-4-SSEA-1 işaretçisi için negatif olurken hızlı. Kök hücre hatları teratomas scid-bej farelerde 6-8 hafta içinde oluşturmak ve teratomas doku tüm üç germ katmandan temsilcisi içerir. Transkripsiyon hatlarını profil oluşturma genel ifade Mikroarray veri bioinformatic pluripotency değerlendirme algoritması göndererek tüm satırları pluripotent sayılır ve bu nedenle, bu yaklaşım hayvan test için cazip bir alternatif. Yeni IPSC hatları kolayca ayırt etme ve doku Mühendisliği optimizasyonu içeren aşağı akım deneylerde kullanılabilir.
İndüklenmiş pluripotent kök hücreler (IPSC) potansiyel hücre replasman tedavileri, hastalık ve gelişimsel modelleme ve uyuşturucu ve toksikolojik tarama1,2,3hakkında görülmemiș. Yedek terapiler kavramsal olarak hücre enjeksiyon tarafından elde edilebilir, In vitro doku (örneğin kalp yamalar) implantasyon ayrıştırılan veya rejenerasyon doku Mühendisliği aracılığıyla rehberlik. Amniyon sıvısı (AFSC) ve membran kök hücre (AMSC) olan hücreler bu müdahaleler için mükemmel bir kaynak ya da doğrudan4,5,6,7 veya yeniden programlama için başlangıç bir hücre nüfus olarak Pluripotent8,9,10,11,12.
Erken yaklaşımlar kullanılan tanımsız kültür sistemleri veya gerektirecektir genomik entegrasyonu gerektiren yöntemleri yeniden programlama yapıları9,10,11,12. Düz-se bile daha az tanımlanmış membran ek matris (BMM), IPSC amniyotik sıvı epitel hücreleri oluşturmak için kullanılan daha yeni yapılan bir çalışmada xeno-Alerjik orta istihdam. Ancak, teratoma oluşumu tahlil In vitro ve moleküler verileri zenginliği ile birlikte çalışmaya dahil değildi. Amniyotik sıvı epitel hücreleri yenidoğan fibroblastlar13ile karşılaştırıldığında bir kabaca 8-fold daha yüksek programlama verimliliği için bulunamadı. Başka bir çalışmada, amniyotik sıvı Mezenkimal kök hücrelerden de bir çok daha yüksek verimlilik ile12IPSC içine yeniden programlanan bulunmuştur.
Pluripotent kök hücre tüm 3 germ tabakalarının doku temsilcisi ayrıştırılan ve böylece geniş bir potansiyele sahip. Pediatrik hastalarda hasat, yeniden programlama ve onların Otolog amniyotik sıvı kök hücre doku Mühendisliği prenatally faydalı olacağını ve amniyotik membran kök hücreleri perinatally. Ayrıca, fetal kök hücreleri (erişkin kök hücreleri14,15düşük) farklılaşma nispeten düşük düzeyde teorik olarak IPSC16kaynak hücrelerden epigenetik önyargı gözlenen tutma ele yardımcı olabilir.
Burada amniyotik sıvı yeniden programlama için bir iletişim kuralı mevcut ve membran kök hücre içinde pluripotency için kimyasal olarak E8 orta xeno-Alerjik episomal plazmid18kullanılarak rekombinant vitronectin17 tarihinde (VTN) tanımlanan.. En büyük avantajı amniyotik sıvı ve membran hücre hücre yeniden programlama için bir kaynak olarak kullanılabilirliklerini öncesi yatıyor ve perinatally ve bu nedenle bu yaklaşım esas olarak Pediatrik doku Mühendisliği içine araştırma yararlanacak.
Protokolü Etik Komitesi insan araştırma için kurumsal kuralları izler. Hastanın yazılı izni amniyotik sıvı araştırma için kullanmak için elde edildi.
Bu iletişim kuralı kurumsal hayvan bakım ve kullanım Komitesi South Alabama Üniversitesi politikaları izler.
1. izolasyon ve kültür birincil amniyotik Mezenkimal Kök hücre
2. yeniden programlama Pluripotency
3. karakterizasyonu ve Pluripotency onayı
Not: ayrıntılı bilgi için ek dosyaları Akış Sitometresi ve confocal mikroskobu bakın.
Bilinçli yazılı onayı için genetik test amaçlı ve araştırma için sıvı küçük bir aliquot ithaf amniyotik sıvı hasat önce hastalardan elde edildi. Plasenta tıbbi atık temsil eder gibi hiçbir onayı araştırma amniyotik membran kullanımı için gereklidir. Amniyotik sıvı ve membran kök hücreler tipik Mezenkimal özelliklerini görüntülemek, morfolojik hücrelerine seklinde ve faz parlak. Yeniden programlama, üzerine hücreler Mezenkimal-için-epitel (MET) geçiş geçmesi ve Arnavut kaldırımı benzeri morfoloji ve mekansal organizasyon epitel özellikleri gösteren kolonilerin elde etmek. Bu süreç 48-72 h episomal plazmid yeniden programlama giriş aşağıdaki gibi erken başlatılır. Bu koloniler tarafından yeniden programlama, 5 gün yokluğu deneme başarısızlık gösterir. MET kolonileri hücrelerin prolifere ve sonuç olarak, kolonilerin kompakt gün 5 ile 14 arasında olur. Kompakt MET koloniler ayrı ayrı kolayca fark edilebilir (resim 1A) olmayan hücreleri oluşmaktadır. Gün 14, tam olarak programlanmış kolonileri tanınmış, taşıyan bir monolayer içinde düzenlenmiş hücreler kolayca ayırt çekirdeği ve nükleulus görünür. Mekanik olarak izole ve koloniler uygun bir boyuta ulaşmak ve kompakt hale genişletilmiş hazırlar (şekil 1B).
Kısmen programlanmış kolonileri tam pluripotency elde var ama tamamen ve kısmen programlanmış kolonileri kültürler tüm programlama süresi boyunca mevcut. Şekil 2 gösterir bir temsilcisi akış sitometrik analizi embriyonik kök hücre (ESC) işaretçisi ifade tamamen ve kısmen pluripotent kolonileri ve onların karşılık gelen türleri Morfoloji. SSEA-1 ifade negatif19,20,21 (şekil 2A) ise tam pluripotency Oct4, MicroRNAs, Sox2, TRA antijenleri ve SSEA-4, ifade ile ilişkilidir. Kısmen pluripotent hücreler, ancak, MicroRNAs ve TRA antijenleri20 (şekil 2B) ifade yok. İfade ve yerelleştirme ESC işaretlerinin boyama ve geniş alanlı veya confocal mikroskop (şekil 3) kullanarak yansıma immunocytochemical tarafından onaylanması.
Pluripotent işlevsel bir onay IPSC satırları yeteneği hücrelerin Subkutan Enjeksiyon scid-bej fareler aşağıdaki formu teratomas göstererek elde edilir. 6-8 hafta son nokta boyutu ulaşmak teratomas için ihtiyaç vardır. H & E doku ve bir patolog tarafından muayene boyama doku temsilcisi tüm katmanların üç germ-endoderm, neuroectoderm ve mesoderm (şekil 4A) varlığını doğrulamak için yapılır sonra. Hayvan testleri için bir alternatif cDNA microarrays22,23gibi genomik yaklaşımlar pluripotency ile ilişkilendirilmiş transkripsiyon imza analiz etmektir. Örtüşen transkripsiyon profil oranı biriyle bir havuzu köklü IPSC ve ESC hatları sonra online bioinformatic pluripotency değerlendirme yazılımı iki sınıflandırıcı – pluripotency arsa şeklinde tarafından sayısal ve yenilik (şekil 4B). Yüksek pluripotency puanı daha fazla sorgu IPSC satırını kurulan hatları benzer. Bir yüksek yenilik puan, ancak, sapmalar veya bir yüksek pluripotency puanı (olduğu gibi teratocarcinoma çizgiler gibi)22rağmen bile kromozom anomalileri gösterebilir. Burada sunulan iletişim kuralı takip ederek oluşturulan tüm IPSC satırları pluripotent Akış Sitometresi, görüntüleme, teratoma oluşumu ve transkripsiyon analiz yöntemleri tarafından kabul edilmiştir.
Şekil 1: hücrelerinin morfolojik ilerlemesi sırasında yeniden programlama. (A) onlar Mezenkimal-için-epitel geçiş (MET) geçmesi kadar amniyotik sıvı ve membran kök hücre, yeniden programlama için kaynak hücreleri gösteren, daha uzun ve faz-parlak bir tipik Mezenkimal Morfoloji (solda) görüntüler hangi epitel özellikleri edinimi ve koloniler Arnavut kaldırımı Taşı benzeri hücreler (Merkezi) oluşumu yol açar. Bu koloniler çoğalırlar ve düzensiz hücresel kitleler MET hücre (sağda) oluşturun. (B) (14 gün başlayarak) yeniden programlama, daha sonraki aşamalarında kolonileri tam olarak programlanmış hücre ortaya-önemli çekirdeği ile tek tek fark edilebilir hücreleri ve nükleulus monolayers, iyi tanımlanmış sınırları (Merkezi)-ile düzenlenen ve daha çok sayıda (sol) MET kolonileri yanında mevcut. Tam olarak programlanmış bir izole olgun klon sağda tasvir edilir. Ölçek çubuğu 100 µm = Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.
Şekil 2: akış sitometrik analiz ESC işaretleri ifade içinde tamamen ve kısmen (MET) hücre kolonileri reprogrammed. (A) pluripotent ifade profil için Oct4, MicroRNAs, Sox2, TRA-1-60, TRA-1-81 ve SSEA-4, pozitif SSEA-1 için negatif tamamlayın. (B) kısmen pluripotent hücre kolonileri-MET geçirmiş, ancak tam pluripotency için ilerleme başarısız oldu bu-Oct4 ve Sox2 için olumlu ancak MicroRNAs, TRA ve SSEA antijenleri yok. İlişkili türleri Morfoloji yan yana karşılaştırma için dahil edilir. Ölçek Bar = 200 µm ve 50 µm. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.
Şekil 3: Confocal olgun amniyotik sıvı IPSC ESC işaretlerinin ifade analizi Imaging. Transkripsiyon faktörleri Oct3/4A, MicroRNAs ve Sox2 çekirdeklerin TRA süre içinde lokalizedir ve SSEA antijenleri membran üzerinde lokalize glikoproteinlerin vardır. Ölçek çubuğu = 50 µm. görüntüleri daha büyük büyütme (birleştirme 2 X) Oct3/4, MicroRNAs ve Sox2 için onların nükleer yerelleştirme daha iyi görselleştirme için dahil edildi. Ölçek çubuğu 25 µm. bulaşan – iletilen ışık alınan görüntüleri =. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.
Şekil 4: Teratoma oluşumu ve transkripsiyon olgun amniyotik sıvı ve membran IPSC içinde profil oluşturma. (A) doku tüm üç germ katmanları (100 X büyütme) temsilcisi scid-bej farelerde subkutan yetiştirilen Teratomas içerir. (B) küresel ifade Mikroarray profilleri çevrimiçi pluripotency yazılım için gönderilmiş iki sınıflandırıcı – Pluripotent ve yenilik bir arsa döndürdü. Yüksek pluripotency puanları ve düşük yenilik puanları - kırmızı cloud - tipik bir ESC/IPSC satırının bir ifade profil gösterir. Soluk mavi bulut kısmen pluripotent hücreler için bir küme alan temsil ederken mavi bulut farklılaşmış hücreler için bir küme alanı temsil eder. Amniyon sıvısı (3 hat) ve membran (4 hat) IPSC pluripotent sınama tarafından kabul edildi. Bir ESC hattı WA25 bir denetim olarak dahil edildi ve burada siyah bir ok ile tanımlanır. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.
Cenin kök hücre nesilden IPSC başlangıç aşamasında kaynak hücreleri ayıklama fetal dokularda, kültür, genişleme ve episomal programlama plazmid getirilmesi üzerine kuruludur. Bu aşama yaklaşık 14-18 gün önce ilk tam olarak programlanmış kolonileri genişletilebilir bir kültür döneme göre izlenir. Olgunlaşma IPSC klonların son aşamasıdır. Amniyotik membran kök hücre ilk çıkarma bir kombine mekanik ve Enzimatik sindirim amnion aracılığıyla elde edilir. Bulduğumuz bu hücre ile en yüksek canlılık çıkarılan en yüksek sayısı 30 dk bir kuluçka zaman sonuçlandı. Sindirim yordam küçük parçalar halinde doku ve hücre kümeleri oluşturabilir. Bunlar tek hücreleri göreli oranı yüksektir, tüm yapışık hücreleri outgrowths için katkıda bulunabilir bu yana tüm kümeleri ve tek hücre bir gemi kaplama öneririz. Amniyotik sıvı kök hücre kaplama hücreleri yalnızca kültür orta ile karışık ve koloniler yapışık hücreleri yeterli boyuta ulaşana kadar inkübe şekilde basittir. Normal doku kültürü tedavi plasticware mükemmel uygundur ve bunlar ile biz alt viabilities ve passaging ile zorluklar gözlenen bu yana geliştirilmiş birincil hücre kültürü için tasarlanmıştır olsa bile biz özel yüzeyler, tavsiye etmiyorum işlem.
Amniyotik sıvı ve membran kök hücreleri genişletilmesini ve dondurulmuş stokları ancak, en kısa zamanda hücreleri kaynak hücreleri olarak yeniden programlama için kullanılabilir. Episomal plazmid giriş hücrelerine, burada 950 V, ayarla transfection parametreleri ile kullanılan transfection sistemi amacıyla 40 ms ve 1 darbe var çok iyi bir performans, tüm satırları ile çalıştı sonuçta başarılı bir şekilde programlanmış) 10 satır). Ana rakip dağıtım üzerinde benzer bir ilke işletim sistemini başarılı bir programlama deneme bizim ellerde üretmek değildi.
Transfected hücreleri üzerine vitronectin kaplı yemekleri AFMC orta ilk 3-5 gün boyunca tohumlari, sonra orta 100 µM sodyum bütrat ile desteklenmiş E8 için açık. Bu büyük tam pluripotency edinme hızını artırır. Morfolojik dönüştürme ilk belirtileri erken 48-72 h olarak görülebilir. Kaynak hücrelerde MET geçmesi ve koloniler hücre morfolojisi epitel ile görünür. Bunlar yavaş yavaş çoğalırlar ve kompakt hale gelir. Bir alt koloni tamamen pluripotent kök hücreler-tek tek fark edilebilir hücreleri önemli çekirdekleri ve nükleulus, Morfolojik özellikleri satın alacak aksine bulanık sınırları iyi tanımlanmış sınırları ile düz kolonileri kısmen gözlenen Pluripotent MET koloniler. Tam pluripotency edinimi an, üzerine önde gelen çekirdeklerin kompakt MET hücre kolonileri alacak ve tek tek hücreler benzersiz bir morfolojik desen oluşturulurken fark edilebilir hale. Eğitimli bir göz için bu model başarılı yeniden programlama açık bir ibret vardır. MET ve IPSC klonlar birbirimiz için yanlış olabilir ancak, PSC kültür eğitim yoksun bir dedektif için başarıyla tam pluripotency için hayli ilerlemiştir kolonileri tanımlaması dikkatli değerlendirme gerektirir. Şekil 1 ve Şekil 2 her ikisi de örneklerini verir. MET klonlar yerine aldı, ayrıntılı Akış Sitometresi inceleme hata ortaya ve özellikle, TRA-1-60 ve TRA-1-81 antijenleri olasılıkla yok olacak Şekil 2' de gösterildiği gibi. Nitekim, TRA antijenleri daha önce sıkı pluripotency işaretleri bulundu. Ancak, kısmen pluripotent MET hücreleri kanser araştırma25ilgi olabilir.
Bu kültür durum kaynak AFSC/AMSC için suboptimal ve sonunda, onların yayılması yavaşlatır ve düz, fibroblast benzeri Morfoloji kazanacaklardır. Bu olumsuz programlama işleminin etkilemez rağmen Kaynak hücrelerde yüzeyden yeniden programlama, daha sonraki aşamaları sırasında ayırmadan dokular oluştururlar. Aksine, işlemi bazen için boşaltma için programlanmış kolonileri yer istenmeyen un programlanmış hücresel malzeme ayrıcılıklarına olan yol açar. Müstakil doku kısmen bırakarak bir steril pipet ucu ve tamamen manuel seçim akıntı yönünde önemli ölçüde basitleştirme pluripotent kolonileri arkasında, kullanarak kolayca atılır.
Tam olarak programlanmış kolonileri el ile çekilmeye görüntüleme sistemi, güvenlik kabini veren, hava akımı rahatsız herhangi bir parça dışarı çıkıntılı eksik bir LCD ekranı kullanın. Malzeme çekme kendisi-ebilmek var olmak kılınmak düzenli Pipetler kullanarak gibi bu görüntüleme sistemi dışında hiçbir özel ekipman gereklidir. Çekilen kolonileri kısmen klonlar büyümeye hedef kuyu içine kaplama önce EDTA/PBS çözümde ayrışmış. Bağlı olarak satır ve çeşitli pasajlar için klon kültürler kendiliğinden hücreleri ile ayırt edilemez. El ile işleme ve seri passaging genellikle bu sorunu ortadan kaldırmak. Geniş farklılaşma ile delik deşik klonlar atılmalıdır, ancak, değerli klonlar başarı değişik derecelerde ile hücreleri ayırt atılması yerine pluripotent kolonileri toplama tekrarlanan el kitabı aracılığıyla kurtarılabilir. Episomal plazmid tamamen IPSC26kaybolmasına yaklaşık 15 pasajlar almak gösterilmiştir. Bu nedenle, bu klonlar için en az o kadar sayıda pasajlar aşağı akım uygulamaları ve analizleri TRA antijen ifade ve karyotip rutin kontrolü dışında için kullanmadan önce büyümeye izin vermek için tavsiye edilir. TRA antijen ifade kolayca Akış Sitometresi tarafından beri tahlil sadece 200,000 hücrelerin gerekli ve araştırmacılar olup kültürlü klonlar bakımı konusunda herhangi bir şüpheniz olduğunda gerçekleştirilen iletişim kuralında, burada açıklandığı şekilde izlenebilir Pluripotent düzgün. Akış Sitometresi Analizi ESC marker ifade pluripotency aday hatları19onaylamak için yeterli sayılır.
Teratoma oluşumu tahlil standart kesin pluripotency test27yaşında. Kimyasal olarak tanımlanan, xeno-Alerjik koşullarında yetiştirilen PSC özellikle duyarlı ayrılma kaynaklı ölüm ve bu nedenle, onları subkutan kümeleri enjekte onların başarılı implantasyonu8,28için gerekli. Enjeksiyonu, genellikle 4-6 hafta görünür olmasını xeno Greftler büyümesi için yeterlidir ve 8 hafta önce tüm olabilir hasat, H & E lekeli ve analiz. Hayvan refahı, maliyet ve uzun gereken dönem test alternatif yöntemler geliştirmek için nedenleri vardır. Genomik analizleri ile gelişmiş birlikte, makine öğrenme-yeti bioinformatic Yaklaşımlar küresel ifade profilleri doğru değerlendirilmesi sağlayabilir. Bu tür veri elde etme maliyeti teratoma oluşumu tahlil maliyet için karşılaştırılabilir olduğunu, ancak, genomik yaklaşım hızlıdır ve hiçbir hayvan kullanılması gerekir. Bu tür bir tahlil bioinformatic pluripotency değerlendirme yazılım22yaşında. Online bir arayüz (Tablo reçetesi) uygulanır. Artan popülaritesi ve RNA sıralama düşen maliyeti bu yaklaşım sürekliliğini sağlamak. Bu Pluripotent yazılım bir alternatif Johns Hopkins Üniversitesi23 (cellnet.hms.harvard.edu) mevcuttur ve benzer bir yaklaşım üzerinde temel alır ve insan örnekleri transcriptome analiz etmek Mikroarray veri kabul edebilir. Bu yazılım sadece pluripotent kök hücreler tanımlama yeteneği vardır ama aynı zamanda hücreleri ayrıştırılan ve küratörlüğünü, veri beri birincil dokular, yetiştirilen In vitro hücre arasındaki benzerliği düzeyini elde edilmiştir ki, avantajdır / doku ve ın-vivo doku farklılaşması protokolleri veya doku Mühendisliği gelişimi için mükemmel bir kalite kontrol sağlayan belirlenebilir. Test sorguları 20 farklı hücre-doku türleri sınıflandırmak için kapasitesine sahiptir. Şu anda, bu Mikroarray veri gerektirir ancak yazarlar için RNA platformu seçenekleri genişletilmesi doğru çalışan de sıralama.
Sunulan iletişim kuralı takip ederek, araştırmacılar IPSC satırları amniyotik sıvı ve membran kök hücrelerden tamamen kimyasal olarak tanımlanmış ve xeno-Alerjik orta ve bir sigara entegre programlama yöntemi kullanarak çok yüksek bir tekrarlanabilirlik ile oluşturabilirsiniz. Bu satırları temel araştırma farklılaşma protokolleri optimize etmek ve sonuçta çalışmalar Mühendislik eleme veya Pediatrik doku hastalığı modellemede ilaç kullanılabilir.
Yazarlar onlar rakip hiçbir mali çıkarları var bildirin.
Bu eser Fonds Medizinische Forschung Zürih Üniversitesi, Forschungskredit Zürih Üniversitesi, SCIEX NMSCh altında Arkadaş grupları 10.216 ve 12.176, Swiss, Kardiyoloji Derneği, İsviçre Ulusal Bilim tarafından desteklenmiştir Kuruluşu'nun altında Grant [320030-122273] ve [310030-143992], 7. çerçeve programı, hayat Vana, Grant [242008], Olga Mayenfisch Vakfı, EMDO Vakfı, Zürih Üniversitesi Hastanesi açılış hibe 2012 Avrupa Komisyonu ve iç Mitchell Kanser Enstitüsü finansman.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Tumor Dissociation Kit, human | Miltenyi Biotec | 130-095-929 | tissue dissociation system, reagent kit, includes tissue dissociation tubes and tissue dissociation enzymes |
gentleMACS Dissociator | Miltenyi Biotec | 130-093-235 | tissue dissociation system, dissociator |
Thermo Scientific™ Shandon™ Disposable Scalpel No. 10, Sterile, Individually Wrapped, 5.75 (14.6cm) | Thermo-Fisher | 3120032 | |
70 µm cell strainers | Corning | 10054-456 | |
RPMI 1640 medium | Thermo-Fisher | 32404014 | |
rocking platform | VWR | 40000-300 | |
50 ml centrifuge tubes | Thermo-Fisher | 339652 | |
15 ml centrifuge tubes | Thermo-Fisher | 339650 | |
EBM-2 basal medium | Lonza | CC-3156 | basal medium for AFMC medium |
FGF 2 Human (expressed in E. coli, non-glycosylated) | Prospec Bio | CYT-218 | bFGF, supplement for AFMC medium |
EGF Human, Pichia | Prospec Bio | CYT-332 | EGF, supplement for AFMC medium |
LR3 Insulin Like Growth Factor-1 Human Recombinant | Prospec Bio | CYT-022 | IGF, supplement for AFMC medium |
Fetal Bovine Serum, embryonic stem cell-qualified | Thermo-Fisher | 10439024 | FBS |
Antibiotic-Antimycotic (100X) | Thermo-Fisher | 15240062 | for primary AFSC/AMSC, for routine AFSC/AMSC it should not be necessary, do not use in medium for transfected cells! |
Accutase cell detachment solution | StemCell Technologies | 07920 | cell detachment enzyme |
CryoStor™ CS10 | StemCell Technologies | 07930 | complete freezing medium |
PBS, pH 7.4 | Thermo-Fisher Scientific | 10010023 | |
EndoFree Plasmid Maxi Kit (10) | Qiagen | 12362 | for plasmid isolation |
pEP4 E02S EN2K | Addgene | 20925 | EN2K, reprogramming factors Oct4+Sox2, Nanog+Klf4 |
pEP4 E02S ET2K | Addgene | 20927 | ET2K, reprogramming factors Oct4+Sox2, SV40LT+Klf4 |
pCEP4-M2L | Addgene | 20926 | M2L, reprogramming factors c-Myc+LIN28 |
NanoDrop 2000c UV-Vis Spectrophotometer | Thermo-Fisher | ND-2000C | spectrophotometer |
Neon® Transfection System | Thermo-Fisher | MPK5000 | transfection system, components: Neon pipette - transfection pipette Neon device - transfection device |
Neon® Transfection System 10 µL Kit | Thermo-Fisher | MPK1025 | consumables kit for the Neon Transfection System, it contains: Neon tip - transfection tip Neon tube - transfection tube buffer R - resuspension buffer buffer E - electrolytic buffer |
Stemolecule™ Sodium Butyrate | StemGent | 04-0005 | small molecule enhancer of reprogramming |
TeSR-E8 | StemCell Technologies | 05940 | E8 medium |
Vitronectin XF™ | StemCell Technologies | 07180 | VTN, stock concentration 250 µg/ml, used for coating at 1 µg/cm2 in vitronectin dilution (CellAdhere) buffer |
CellAdhere™ Dilution Buffer | StemCell Technologies | 07183 | vitronectin dilution buffer |
UltraPure™ 0.5M EDTA, pH 8.0 | Thermo-Fisher | 15575020 | dilute with PBS to 0.5 mM before use |
EVOS® FL Imaging System | Thermo-Fisher Scientific | AMF4300 | LCD imaging microscope system |
CKX53 Inverted Microscope | Olympus | phase contrast cell culture microscope | |
Pierce™ 16% Formaldehyde (w/v), Methanol-free | Thermo-Fisher | 28908 | dilute to 4% with PBS before use, diluted can be stored at 2-8 °C for 1 week |
Perm Buffer III | BD Biosciences | 558050 | permeabilization buffer, chill to -20 °C before use |
Mouse IgG1, κ Isotype Control, Alexa Fluor® 488 | BD Biosciences | 557782 | isotype control for Oct3/4A, Nanog |
Mouse IgG1, κ Isotype Control, Alexa Fluor® 647 | BD Biosciences | 557783 | isotype control for Sox2 |
Mouse anti-human Oct3/4 (Human Isoform A), Alexa Fluor® 488 | BD Biosciences | 561628 | |
Mouse anti-human Nanog, Alexa Fluor® 488 | BD Biosciences | 560791 | |
Mouse anti-human Sox-2, Alexa Fluor® 647 | BD Biosciences | 562139 | |
Mouse IgGM, κ Isotype Control, Alexa Fluor® 488 | BD Biosciences | 401617 | isotype control for TRA-1-60 |
Mouse IgGM, κ Isotype Control, Alexa Fluor® 647 | BD Biosciences | 401618 | isotype control for TRA-1-81 |
Mouse anti-human TRA-1-60, Alexa Fluor® 488 | BD Biosciences | 330613 | |
Mouse anti-human TRA-1-81, Alexa Fluor® 647 | BD Biosciences | 330705 | |
Mouse IgG1, κ Isotype Control, Alexa Fluor® 488 | BD Biosciences | 400129 | isotype control for SSEA-1 |
Mouse IgG3, κ Isotype Control, Alexa Fluor® 647 | BD Biosciences | 401321 | isotype control for SSEA-4 |
Mouse anti-human SSEA-1, Alexa Fluor® 488 | BD Biosciences | 323010 | |
Mouse anti-human SSEA-4, Alexa Fluor® 647 | BD Biosciences | 330407 | |
Affinipure F(ab')2 Fragment Goat Anti-Mouse IgG+IgM, Alexa Fluor® 488 | Jackson Immunoresearch | 115-606-068 | use at a dilution of 1:600 or further optimize |
Affinipure F(ab')2 Fragment Goat Anti-Mouse IgG+IgM, Alexa Fluor® 647 | Jackson Immunoresearch | 115-546-068 | use at a dilution of 1:600 or further optimize |
DAPI | Thermo-Fisher Scientific | D21490 | stock solution 10 mM, further dilute to 1:12.000 for a working solution |
Corning® Matrigel® Growth Factor Reduced, Phenol Red-Free | Corning | 356231 | basement membrane matrix (BMM) |
scid-beige mice, female | Taconic | CBSCBG-F | |
RNeasy Plus Mini Kit (50) | Qiagen | 74134 | RNA isolation kit |
T-25 flasks, tissue culture-treated | Thermo-Fisher | 156367 | |
T-75 flasks, tissue culture-treated | Thermo-Fisher | 156499 | |
Nunc™ tissue-culture dish | Thermo-Fisher | 12-567-650 | 10 cm tissue culture dish |
6-well plates, tissue-culture treated | Thermo-Fisher | 140675 | |
Neubauer counting chamber (hemacytometer) | VWR | 15170-173 | |
Mr. Frosty™ Freezing Container | Thermo-Fisher | 5100-0001 | freezing container |
FACS tubes, Round Bottom Polystyrene Test Tube, 5ml | Corning | 352058 | 5 ml polystyrene tubes |
Eppendorf tubes, 1.5 ml | Thermo-Fisher | 05-402-96 | 1.5 ml microcentrifuge tubes |
PCR tubes, 200 µl | Thermo-Fisher | 14-222-262 | |
pipette tips, 100 to 1250 µl | Thermo-Fisher | 02-707-407 | narrow-bore 1 mL tips |
pipette tips, 5 to 300 µl | Thermo-Fisher | 02-707-410 | |
pipette tips, 0.1 to 10 µl | Thermo-Fisher | 02-707-437 | |
wide-bore pipette tips, 1000 µl | VWR | 89049-166 | wide-bore 1 mL tips |
glass Pasteur pipettes | Thermo-Fisher | 13-678-20A | |
ethanol, 200 proof | Thermo-Fisher | 04-355-451 | |
vortex mixer | VWR | 10153-842 | |
chambered coverglass, 8-well, 1.5mm borosilicate glass | Thermo-Fisher | 155409 | glass-bottom confocal-grade cultureware |
22G needles | VWR | 82002-366 | |
insulin syringes | Thermo-Fisher | 22-253-260 | |
Formalin solution, neutral buffered, 10% | Sigma-Aldrich | HT501128-4L | fixation of explanted teratomas |
Illumina HT-12 v4 Expression BeachChip | Illumina | BD-103-0204 | expression microarray, supported by PluriTest, discontinued by manufacturer |
PrimeView Human Genome U219 Array Plate | Thermo-Fisher | 901605 | expression microarray (formerly Affymetrix brand), soon to be supported by PluriTest |
GeneChip™ Human Genome U133 Plus 2.0 Array | Thermo-Fisher | 902482 | expression microarray (formerly Affymetrix brand), supported by CellNet, soon to be supported by PluriTest |
PluriTest® | Coriell Institute | www.pluritest.org, free service for bioinformatic assessment of pluripotency, accepts microarray data - *.idat files from HT-12 v4 platform, soon to support U133, U219 microarray and RNA sequencing data | |
CellNet | Johns Hopkins University | cellnet.hms.harvard.edu, free service for bioinformatic identification of cell type, including plutipotent stem cells, based on U133 microarray data - *.cel files, soon to support RNA sequencing data |
Bu JoVE makalesinin metnini veya resimlerini yeniden kullanma izni talebi
Izin talebiThis article has been published
Video Coming Soon
JoVE Hakkında
Telif Hakkı © 2020 MyJove Corporation. Tüm hakları saklıdır