Method Article
* これらの著者は同等に貢献しました
We describe a technique for concurrently measuring force-regulated single receptor-ligand binding kinetics and real-time imaging of calcium signaling in a single T lymphocyte.
膜受容体 - リガンド相互作用は、多くの細胞機能を媒介します。これらの分子の相互作用によって引き起こさ結合動態および下流のシグナル伝達は、おそらく結合し、場所を取るシグナル伝達する機械的な環境の影響を受けています。最近の研究では、機械的な力により、抗原認識を調節し、T細胞受容体(TCR)をトリガすることができることを実証しました。これは、我々が開発した新技術によって可能になったし、蛍光顕微鏡で単一分子力分光法を組み合わせた蛍光生体膜力プローブ(fBFPを)、と呼ばれました。敏感な力センサー、高速度カメラとリアルタイムイメージング追跡技術として、超ソフトヒト赤血球を用いて、fBFPは約3 nmおよび〜0.5秒で約1 PN(10 -12 N)であります力、空間的および時間的分解能。 fBFPで、1は正確に力調節の下で単一の受容体 - リガンド結合反応速度と同時に、画像結合トリガー細胞内CALを測定することができます単一の生細胞上でシグナリングcium。この新技術は、機械的な規制の下に他のセルにおける他の膜受容体 - リガンド相互作用およびシグナル伝達を研究するために使用することができます。
細胞-細胞及び細胞-細胞外マトリックス(ECM)接着は、細胞表面受容体、ECMタンパク質、および/ または脂質の1との間の結合によって媒介されます。結合は、細胞が機能構造1を形成し、同様に認識し、通信し、環境1-3に対応することができます。可溶性タンパク質( 例えば 、サイトカインおよび成長因子)、3次元(3D)から結合する細胞表面受容体への液相とは異なり、細胞接着受容体は、分子拘束二つの対向面をブリッジする狭い接合ギャップを横切るそのリガンドとの結合を形成します2次元(2D)インターフェース4-7の拡散。一般的に、伝統的な結合アッセイ( 例えば 、表面プラズモン共鳴またはSPR)によって測定された3次元動態とは対照的に、2D速度は、原子間力顕微鏡(AFM)8-10のような特殊な技術を用いて定量化されなければならない、チャンバ11,12を流れ、マイクロピペット13,14、光ピンセット15と生体膜力プローブ(BFP)16-21。
単に携帯凝集のための物理的結合を提供するよりも、接着分子は、その周囲と通信するセルのシグナル伝達機構の主要な構成要素です。接着分子のリガンド係合は、細胞内シグナル伝達とどのように初期信号が細胞内に伝達されるがどのように開始するかを理解する上で関心が高まっています。直感的には、受容体 - リガンド結合の性質は、それが誘導信号に影響を与えることができます。しかし、それがために、例えば 、それらの多くの制限、貧しい時間分解能と空間分解能の完全な欠如の生化学的ア ッセイの伝統的なアンサンブルを使用して外の相互作用および細胞内シグナル伝達事象の間の機械的な関係を分析することは困難です。両方の生物物理学的(2D受容体 - リガンド結合反応速度)を可能にする既存の方法とライブの生化学(シグナリング)の観察細胞は、調整可能な剛性22、エラストマーピラーアレイ23と蛍光能力24〜26を組み込んだフローチャンバー/マイクロ流体デバイスの基材が挙げられます。しかし、シグナル伝達および受容体 - リガンド結合の読み出しは、それが困難なシグナル伝達事象との結合特性の時間的、空間的な関係を分析すること、(異なる方法によって、ほとんどの場合)別途入手する必要があります。
従来のBFPは、高時空間分解能17と超力分光法です。これは、単一分子の2D速度、機械的特性およびコンフォメーション変化14,16,19-21,27-29の測定を可能にする、力センサのような可撓性赤血球(RBC)を使用します。 BFP(fBFP)系蛍光イメージングは、単一分子スケールでのシグナリング結合誘発される細胞での受容体 - リガンド結合反応速度を相関させます。この設定では、 その場での細胞内の表面mechaniのコンテキストでの活動に信号を送ります的刺激は、T-27細胞で観察されました。 fBFPは用途が広く、他のセル内の他の分子によって媒介される細胞接着およびシグナル伝達の研究のために使用することができます。
このプロトコルは、のガイドラインに従っており、ジョージア工科大学の人間研究倫理委員会によって承認されています。
1.ヒト赤血球の分離、ビオチン化および浸透圧の調整
注:治験審査委員会は、プロトコルを承認したとステップ1.1は、訓練を受けた医療専門家のような看護師が行ってください。
2.ガラスビーズシラン化
3.ビーズ機能化
4.細胞調製
注:細胞を精製するために、使用中の細胞の種類に応じた標準的な細胞精製プロトコールに従って、例えばT細胞27または特定の細胞株21,29。
5.マイクロピペットの準備及びセル室
6. BFP実験
図1:fBFPアセンブリ(A)fBFPハードウェアシステムの概要絵。 (B)fBFPハードウェアシステムの概略図。 (C)ハイスピードカメラ(青)と蛍光カメラ(白)を装着し、その上にデュアルカムシステム「DC2」(オレンジ)。 (D)実験室三マイクロピペット操作システムを適応させる顕微鏡ステージ。 (EおよびF)は、実験室でのBFP設定の顕微鏡写真。 (E)マイクロピペットアセンブリピペット( 右上 )とヘルパーピペット( 低いRをターゲットに 、( 左 )プローブピペットを示しますIGHT)。 (F)プローブビーズの配置。プローブビーズをヘルパーピペットによって操作力プローブを形成するために、RBCの頂点に取り付けた。 この図の拡大版を表示するには、こちらをクリックしてください。
図2:それぞれpipettes.The固定力プローブにより吸引BFP方式及びそのテストサイクル(A)ビデオ顕微鏡描写力プローブ( 左 )と、標的T細胞( 右 )腫れRBCで構成され、添付しますリガンドベアリングビーズ。受容体を有しますT細胞(標的)は、プローブと反対に整列piezotranslatorに取り付けられています。 ROIは緑色で示されています。エッジトラッカーは、青色の線で表示されます。インサートはオレンジ色でマークされた領域内の2つの対向する表面上のリガンド(のpMHC、 ビード側 )と受容体(TCR、T細胞側 )の対を示しています。 (B)(A)でビーズエッジの強度プロフィール。 Xの -方向におけるROI領域はx軸(画素数)と(グレースケール値の)光強度のY -方向に沿って30ピクセルをビニングによって平均としてプロットされています。 (C)RBCのたわみやビーズの位置と力クランプアッセイの試験サイクルにおけるターゲット(T細胞)。垂直および水平の破線は、それぞれ、RBCの頂点と時間経過の零力位置を示します。 RBC変形のラインエッジトラッカーが各パネルに青色で示されています。同じまだ少ないステップは、接着周波数で採用されています(「解離」の手順を欠く)と、熱揺らぎアッセイ(「クランプ」と「解離」の手順を欠いている)アッセイ。
7.蛍光BFP(fBFP)実験
8.データ解析
BFP技術は1995 17エバンス研究所によって開発された。このpicoforceツールは広く、そのリガンド16,19,20と相互作用する接着分子の二次元の動態を解析するように、表面上に固定化されたタンパク質の相互作用を測定するために使用されています30、分子21,29弾性を測定するため、およびタンパク質コンホメーション変化21を決定します。 fBFPために、対応するソフトウェアシステム( 表1)を用いてエピ蛍光関連デバイスの追加セットは、( - C図1A)を添加します。
fBFPシステムは、ハードウェアシステム(光学的、機械的および電気的構成要素)と、ソフトウェアシステム( 表1、図1A、B)からなります。明視野および落射蛍光顕微鏡を有効に光学部品との倒立顕微鏡(中央図1Aは 、)の本体を構成します実験段階とピペットマニピュレータが搭載され、その上にfBFPシステム。蛍光光源制御装置( 図1A、左上隅)が交互に励起光を送達するために使用されます。デュアルCAMシステム「DC2」は、2つに光を分割し、高速度カメラ(青)および蛍光カメラ(ホワイト)( 図1A、左下隅)に送信します。前者は、位置決意と2波長で標的細胞から放出された後者の収集蛍光画像のためのプローブ画像を収集します。実験は、ホストPC 1( 図1A、右上隅は、スペースの制限のために画像に切り取ら)高速度カメラと蛍光カメラの両方に接続されており、実験の実行を担当するれている2つのコンピュータによって監視および制御されます。データ取得、およびホストPC 2は、監視カメラに接続され、BFP experiの完全なビューを提示する責任がありますメント( 図1A、B)。
実験中、実験者はつかむと、それぞれの細胞およびマイクロスフェア( 図1E、F)を操作するために3つのマイクロピペットを使用しています。 BFP実験の代表的な画像は、吸引RBCの頂部上にプローブビーズを取り付けることによって組み立てられる力プローブ、および標的細胞/ビーズ( 図2A)からなります。 RBC上のビードエイペックスのエッジ領域を含んでいる関心領域(ROI)は、リアルタイムでのRBCの変形を監視するために速いスピードカメラ(2,000 FPS)によって追跡されます。ビーズの追跡変位は、外部の力を計算するために使用することができるBFP( 図2A、B)のバネ定数所定の力プローブ(プロトコルセクション6.6の注を参照)に加えられます。
接着周波数アッセイ、熱揺らぎアッセイ、及び力クランプアッセイは、BFPシステム上で一般的に使用される3つの実験モードです。広告によるこれらの3つのモードのいずれかを選ぶ、BFP実験を順次実行する反復試験サイクルで構成されています。
接着周波数アッセイでは、与えられた接触時の目標アプローチとコンタクトプローブビーズ(例えば、1秒)と元の位置に直接後退し、次のサイクルを開始します。接着イベントは後退期の間に引張力信号によって反映されます。このアプローチは、接触後退サイクルは、接着周波数の平均値SEM、Pを計算するために、少なくとも3つの標的プローブ対50回繰り返されます。
熱揺らぎアッセイは、ゼロ力で寿命測定のために使用されます。各サイクルにおいて、プローブビーズをタッチした後に、目標零力位置に退避され、20秒間圧縮又は張力のいずれかと接触することなく、ビーズに固定し、その後、次のサイクルを開始するために元の位置に戻ります。ボンドの会合/解離ゼロ力の下では、ビード16,30の熱変動の急激な低下/上昇として現れます。
強制クランプアッセイは、力の下で寿命測定のために使用されます。 (例えば、20 PN)所望のクランプ力を、実験の前に設定されています。標的が受容体/リガンド結合の形成を可能にするために(例えば、1秒)所定の接触時間のためにプローブビーズと接触するように繰り返し駆動される( 図2C、パネル2および3)、次いで、後退( 図2C、パネル4 )。何の結合が形成されていない場合は、予め設定型締力に到達する前に、ボンド破裂は、ターゲットが元の位置に戻り、次のサイクルが開始された場合、RBCのない引張力信号により反射、または。後退期を生き残る結合事象では、ターゲットは、結合が解離( 図2C、パネル5及び6)、その後、元の仮定に戻るまでdでRBCの対応伸びとクランプ力で保持されますイオンは、次のサイクル( 図2C、パネル7)を開始します。力は、結合解離20の瞬間に所望のレベルに達したときに寿命が瞬間の時間間隔として定義されます。
(dissociate-)リターン試験サイクル( 図2C)、複数回16,20のために繰り返されます-すべてのこれらの3 BFPの実験モードでは、実験者が接近衝突する接触-retract-(クランプ)を見ることができるはずです、21。
BFPの各実験モードから収集されたデータは、所望の結果を導き出すために、様々な方法で分析することができました。平均寿命曲線は力クランプアッセイ( 図4)からの1つの代表的な結果です。それは力の下で、受容体 - リガンド解離の逆数オフ速度を反映しています。熱揺らぎアッセイは速度オンとオフ速度ゼロ力16の下で、受容体-リガンド対の2次元の特徴付けを可能にします。接着FREQながらuencyアッセイはオフ速度と親和性ゼロ力13の下で、上のレート2Dをレンダリングします。
蛍光イメージング機能のアドインは、このシステムにおける細胞シグナルの読み出しとして使用される単一細胞の細胞内Ca 2+レベルを監視することを可能にします。 fBFP実験中にこの機能を使用するには、1は、Ca 2+指示薬を用いて細胞を事前にロードする必要があります。 FURA2-AMは、蛍光色素である場合には、340 nmおよび380 nmの励起チャネルの下の同じ細胞の蛍光画像は、実験に交互に記録され、分析にペアごとに対を検査しました。強度閾値は、バックグラウンドノイズを除去し、細胞輪郭( 図5)を認識するために、各チャンネルの蛍光画像に割り当てられていました。蛍光画像の各ペアの比較は、細胞内の計算を可能にします のCa 2+レベル。 340 nmの両方の下のセルの明確な蛍光画像380 nmの励起チャネルは、( 図5A、B)のCa 2+レベルの正確な測定のために必要であり、無視できないバックグラウンドノイズの悪いイメージが偏った結果をもたらすであろうと( 図5C)が回避されるべきです。
同時にセルとレコード細胞のCa 2+レベルに制御可能な機械的刺激を導入することにより、fBFPは生体細胞のメカノトランスダクションを研究するための強力な単一分子ツールを提供しています。それは、ここで説明するプラットフォームが非常に汎用性があり、ことは注目に値します。原理的には、ある特定の目的に適合するように細胞に力を加えると同時に、目的の種々のシグナル伝達事象を監視する多数の方法を設計することができます。力に依存する運動の詳細は、次に、力調節レセプター - リガンド反応速度、誘導されるシグナル、及びそれらの相関関係の特性を抽出するために選択されたシグナリング読み出しの文脈において分析されます。 TCR SIGの例でnaling、アゴニスト特異的TCR-のpMHCキャッチ結合が最初に発見され、その後、T細胞のCa 2+フラックスとの関連性は27を調査しました。戦略は、シグナリング読み出しが癒着の数、結合の力振幅、平均寿命、最長寿命および累積を含む、様々な動力学的パラメータのうちの最良の予測を求めることとしてのCa 2+フラックスのピーク値を取ることでした順次形成されたバインディングの寿命。 T細胞の(10 pNののクランプ力が適用された)および対応のCa 2+シグナル曲線と一緒にそれらの蓄積を同時に記録し、個々の結合寿命の例を図6に示されています。この場合には、4つの有効期限イベントが前のCa 2+レベルは10秒の結合寿命の和を蓄積、55秒で上昇し始めた時に発生しました。生涯の蓄積のこのレベルは、正規化されたFURA2率のピークとのCa 2+シグナルをトリガー65秒で発生した1.8の。多くの個々の細胞から回収そのようなデータの系統的な数学的分析は、最高のCa 2+シグナル伝達相関強度が繰り返さTCR-のpMHC相互作用(技術的な詳細については、27のリファレンスを参照してください)の1 番目の分に蓄積寿命であることを明らかにしました。
図3:非接着事象(A)の代表的な時間力生のデータ曲線、破断力イベント(B)と寿命イベント(C)。サイクルのさまざまなフェーズと対応する曲線セグメントがそれぞれのパネルにマークされています。 図2Cに示すように、力(y軸)は、プローブビーズの位置変化を追跡することに由来します。 (A)無接着:接触相戻るtの中の圧縮(負の)力後退時のOゼロ。 (B)の破断力イベント:引張(正)力が後退フェーズ中に破裂するRBCを、長くする受容体-リガンド結合を介して引っ張ります。 (C)生涯イベント:結合は、クランプ力が達成されるまで持続し、その後解離します。生涯のイベントの継続時間が示されています。破断力イベント(B)と寿命のイベント(C)の始まりは、アスタリスクで強調表示されます。
図4:OT1 T細胞は、そのアゴニストOVA(緑)、アンタゴニストG4(青)との相互作用の「平均寿命力対「カーブプールされたデータは、異なる力ビンにグループ化され、結合寿命の平均値±SEMです。力に対してプロット。
ポイントツーに基づいて、340 nmの(A)と380 nmの(B)チャネル内(赤で表示)T細胞の代表的なのCa 2+のイメージは、2つの波長で励起された(A、B)を修正した画像認識:図5。適切に割り当てられた強度閾値を用いたスクリーニングを指します。 (C)不良によるFURA2負荷に、340 nmの励起チャネルで(赤で表示)T細胞の蛍光画像を認識することができません。
図6:「細胞内Ca 2+レベル対時間(相対FURA2比)」とOT1 T細胞の曲線」対時間の累積生涯」の重ね合わせ、生成繰り返し300秒間にわたってOVAでコーティングされたビーズを有するT細胞をタッチすることにより、D。(A)は、非接着性、破断力、および時間をかけて繰り返し接触することによって生成された生涯のイベントのシーケンスを示す力曲線。 (B)T細胞における細胞内Ca 2+シグナルのエピ蛍光擬似カラー画像を異なる時点で。正規化されたCa 2+レベルは右側の擬似カラースケールで表示されます。のCa 2+信号曲線(赤)と同じ時間経過の累積寿命曲線(黄色)の(C)スーパーインポーズ。のCa 2+曲線はのCa 2+イメージングに基づいてプロットしました。のCa 2+フラックスは、正規化されたFURA2率の急激な上昇によって示されます。のCa 2+がピークに達する時間は、破線で示されています。各生涯イベントの開始時間は、累積寿命曲線(黒三角)でマークされます。
成功fBFP実験は、いくつかの重要な考慮事項を必要とします。まず、力計算のために、マイクロピペット、RBC信頼性があるとし、プローブビーズはできるだけ同軸の近くに位置合わせされるべきです。 RBCとピペットとの間の摩擦が無視できるように、ピペット内のRBCの突起は、約1プローブピペット径でなければなりません。典型的なヒトRBCのために、最適なピペットの直径は、式1 17,30のベストフィットをもたらす2.0〜2.4μmです。第二に、力クランプアッセイおよび熱揺らぎアッセイでの測定は単結合のために主にであることを確認するために、20%未満の接着周波数は10,13,30を維持する必要があります。ここでは、非特異的な癒着は慎重に(BSAとの十分な遮断することにより、通常<5%)を制御する必要があります。また、データは、単一の力ドロップとの密着性事象からのみ収集する必要があります - シングルステップ消失に単一分子の挙動の特徴(類似)単一分子FRETの蛍光の。蛍光色素の第三に、添加濃度は、最良の結像性能を達成するために、ケースバイケースで最適化されるべきです。第四に、T細胞または関心のある他の細胞への色素負荷の毒性は慎重に、各実験の前に検討する必要があります。例えば、色素負荷時受容体 - リガンド相互作用の結合親和性は、色素負荷なしでそれに測定して比較する必要があります。結合親和性が劇的にローディング色素による変更の場合は、異なる色素または別の添加濃度が考慮されなければなりません。第五に、末端にビオチン標識タンパク質は、タンパク質のネイティブの向きを維持し、便利な特定、および強力な結合を可能にするために好ましいです。
fBFPの主な強みは、単一細胞上の単一の結合アッセイを行うことです。低いスループットにもかかわらず、単結合分析は、多くの場合、従来のアンサンブル私がアクセスできない重要な機能が明らかにthods。例えば、各力のビンで寿命分布を調べることによって、人は力が、タンパク質の立体構造変化を20,32を調節する方法についての洞察を提供し、タンパク質の立体配座状態で別の結合特性を相関させることができます。 BFPは、タンパク質コンホメーション力学20,21を調査するために使用することができる引き込み相の力とピエゾトランスレータ変位データから分子の剛性を測定することができます。
多くの方法は、受容体媒介性細胞接着およびシグナル伝達を研究するために開発されてきました。受容体 - リガンド結合反応速度は、一般に細胞環境から完全に分離して組換えタンパク質を用いて測定されます。このような習慣は潜在的に問題です。例えば、最近大幅に受容&#の新たな洞察を明らかにし、対応する組換えタンパク質14を用いて測定したものとは異なる生細胞で測定されたその場での動態が示されています8217; sの細胞機能。だけでなく、 その場での受容体-リガンドの動態を定量化することができるfBFPですが、より重要なのは、それはまた、同時に結合により誘導される細胞のシグナル伝達を記録することができます。 TCR 27について示されるように、結合特性および細胞シグナル伝達の豊富な情報がfBFPが彼らの関係を分析し、メカノトランスダクションの分子機構を理解するための前例のない機会を提供して使用して得られました。それはfBFPは他の重要な受容体 - リガンドシステムでより多くのアプリケーションを発見する可能性があります。
The authors have nothing to disclose.
Research related to this paper and the development of the fBFP technology in the Zhu lab were supported by NIH grants AI044902, AI077343, AI038282, HL093723, HL091020, GM096187, and TW008753. We thank Evan Evans for inventing this empowering experimental tool, and members of the Evans lab, Andrew Leung, Koji Kinoshita, Wesley Wong, and Ken Halvorsen, for helping us to build the BFP. We also thank other Zhu lab members, Fang Kong, Chenghao Ge and Kaitao Li, for their helps in the instrumentation development.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Sodium Phosphate Monobasic Monohydrate (NaH2PO4 • H2O) | Sigma-Aldrich | S9638 | Phosphate buffer preparation |
Anhy. Sodium Phosphate Dibasic (Na2HPO4) | Sigma-Aldrich | S7907 | Phosphate buffer preparation |
Sodium Carbonate (Na2CO3) | Sigma-Aldrich | S2127 | Carbonate/bicarbonate buffer preparation |
Sodium Bicarbonate (NaHCO3) | Sigma-Aldrich | S5761 | Carbonate/bicarbonate buffer preparation |
Sodium chloride (NaCl) | Sigma-Aldrich | S7653 | N2-5% buffer preparation |
Potassium chloride (KCl) | Sigma-Aldrich | P9541 | N2-5% buffer preparation |
Potassium phosphate monobasic (KH2PO4) | Sigma-Aldrich | P5655 | N2-5% buffer preparation |
Sucrose | Sigma-Aldrich | S0389 | N2-5% buffer preparation |
MAL-PEG3500-NHS | JenKem | A5002-1 | Bead functionalization |
Biotin-PEG3500-NHS | JenKem | A5026-1 | RBC biotinylation |
Nystatin | Sigma-Aldrich | N6261 | RBC osmolarity adjustment |
Ammonium Hydroxide (NH4OH) | Sigma-Aldrich | A-6899 | Glass bead silanization |
Methanol | BDH | 67-56-1 | Glass bead silanization |
30% Hydrogen Peroxide (H2O2) | J. T. Barker | Jan-86 | Glass bead silanization |
Acetic Acid (Glacial) | Sigma-Aldrich | ARK2183 | Glass bead silanization |
3-Mercaptopropyltrimethoxysilane (MPTMS) | Uct Specialties, llc | 4420-74-0 | Glass bead functionalization |
Borosilicate Glass beads | Distrilab Particle Technology | 9002 | Glass bead functionalization |
Streptavidin−Maleimide | Sigma-Aldrich | S9415 | Glass bead functionalization |
BSA | Sigma-Aldrich | A0336 | Ligand functionalizing |
Fura2-AM | Life Technologies | F-1201 | Intracellular calcium fluorescence dye loading |
Dimethyl sulfoxide (DMSO) | Sigma-Aldrich | D2650 | Intracellular calcium fluorescence dye loading |
Quantibrite PE Beads | BD Biosciences | 340495 | Density quantification |
Flow Cytometer | BD Biosciences | BD LSR II | Density quantification |
Capillary Tube 0.7-1.0 mm x 30 inches | Kimble Chase | 46485-1 | Micropipette making |
Flaming/Brown Micropipette Puller | sutter instrument | P-97 | Micropipette making |
Pipette microforce | Narishige | MF-900 | Micropipette making |
Mineral Oil | Fisher Scientific | BP2629-1 | Chamber assembly |
Microscope Cover Glass | Fisher Scientific | 12-544-G | Chamber assembly |
Micro-injector | World Precision Instruments | MF34G-5 | Chamber assembly |
1 ml syringe | BD | 309602 | chamber assembly |
Micropipette holder | Narishige | HI-7 | Chamber assembly |
Home-designed mechanical parts and adaptors fabrications using CNC machining. | Biophysics Instrument | All parts are customized according to the CAD designs. | BFP system |
Microscope (TiE inverted) | Nikon | MEA53100 | BFP system |
Objective CFI Plan Fluor 40x (NA 0.75, WD 0.72 mm, Spg) | Nikon | MRH00401 | BFP system |
Camera, GE680, 640 x 480, GigE, 1/3" CCD, mono | Graftek Imaging | 02-2020C | BFP system |
Prosilica GC1290 - ICX445, 1/3", C-Mount, 1280 x 960, Mono., CCD, 12 Bit ADC | Graftek Imaging | 02-2185A | BFP system |
Manual submicron probehead with high resolution remote control | Karl Suss | PH400 | BFP system |
Anti-vibration table (5’ x 3’) | TMC | 77049089 | BFP system |
3D manual translational stage | Newport | 462-XYZ-M | |
SolidWorks 3D CAD software | SOLIDWORKS Corp. | Version 2012 SP5 | BFP system |
LabVIEW software | National Instruments | Version 2009 | BFP system, BFP program |
3D piezo translational stage | Physik Instrumente | M-105.3P | BFP system |
Linear piezo accuator | Physik Instrumente | P-753.1CD | BFP system |
Micromanager software | Version 1.4 | fBFP system, fluorescence imaging program | |
Dual Cam (DC-2) | Photometrics | 77054724 | fBFP system |
Dual Cam emission filter (T565LPXR) | Photometrics | 77054725 | fBFP system |
Fluorescence Camera | Hamamatsu | ORCA-R2 C10600-10B | fBFP system |
Plastic paraffin film (Parafilm) | Bemis Company, Inc | PM996 | bottle sealing |
Carbonate/bicarbonate buffer (pH 8.5) | 8.4 g/L sodium carbonate (Na2CO3), 10.6 g/L sodium bicarbonate (NaHCO3) | ||
Phosphate buffer (pH 6.5-6.8) | 27.6 g/L NaPhosphate monobasic (NaH2PO4 • H2O), 28.4 g/L Anhy. NaPhosphate dibasic (Na2HPO4) | ||
N2-5% buffer (pH 7.2) | 20.77 g/L potassium chloride (KCl), 2.38 g/L sodium chloride (NaCl), 0.13 g/L potassium phosphate monobasic (KH2PO4), 0.71 g/L anhy. sodium phosphate dibasic (Na2HPO4), 9.70 g/L sucrose |
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