Method Article
* These authors contributed equally
We describe a technique for concurrently measuring force-regulated single receptor-ligand binding kinetics and real-time imaging of calcium signaling in a single T lymphocyte.
الغشاء مستقبلات يجند التفاعل تتوسط العديد من الوظائف الخلوية. ملزمة حركية وإشارات المصب الناجمة عن هذه التفاعلات الجزيئية المرجح تتأثر البيئة الميكانيكية التي ملزما ويشير تجري. أظهرت دراسة حديثة أن قوة ميكانيكية يمكن أن تنظم الاعتراف المستضد من قبل، ويتسبب في مستقبلات الخلايا التائية (TCR). وقد أصبح هذا ممكنا بفضل التكنولوجيا الجديدة التي قمنا بتطويرها ومضان يطلق قوة غشاء حيوي التحقيق (fBFP)، الذي يجمع بين جزيء واحد قوة التحليل الطيفي مع مضان المجهري. باستخدام خلايا الدم الحمراء في الانسان فائقة النعومة كما استشعار القوة حساسة، وكاميرا عالية السرعة والوقت الحقيقي تتبع تقنيات التصوير، وfBFP هو من ~ 1 السندات الإذنية (10 -12 N)، ~ 3 ~ نانومتر و 0.5 مللي ثانية في القوة، القرار المكانية والزمانية. مع fBFP، يمكن للمرء أن قياس بدقة حركية مستقبلات يجند واحدة ملزمة بموجب المادة القوة في وقت واحد صورة أثار ملزم كال داخل الخلاياcium يشير على خلية حية واحدة. هذه التكنولوجيا الجديدة يمكن استخدامها لدراسة أخرى الغشاء مستقبلات يجند التفاعل ويشير في الخلايا الأخرى في إطار التنظيم الميكانيكي.
خلية الى خلية والخلية الى خارج الخلية مصفوفة بوساطة (ECM) التصاق عن طريق الربط بين مستقبلات سطح الخلية والبروتينات ECM، و / أو الدهون 1. ملزمة تمكن خلايا لتشكيل هياكل وظيفية 1، وكذلك الاعتراف، والتواصل، والتفاعل مع البيئة 1-3. على عكس البروتينات القابلة للذوبان (مثل السيتوكينات وعوامل النمو) التي تربط من ثلاثي الأبعاد (3D) المائع على مستقبلات سطح الخلية، مستقبلات التصاق الخلايا تشكل السندات مع بروابط بهم عبر فجوة ضيقة صلي لسد سطحين معارضة التي تقيد الجزيئية نشر في الأبعاد (2D) واجهة اثنين 4-7. وعلى النقيض من حركية 3D والتي يتم قياسها عادة من قبل المقايسات ملزمة التقليدية (على سبيل المثال، صدى مأكل السطح أو SPR)، حركية 2D يجب أن يكون كميا مع تقنيات متخصصة مثل قوة المجهر الذري (AFM) 10/08، غرفة 11،12 التدفق، micropipette 13،14، البصريملاقط 15 وقوة غشاء حيوي التحقيق (حزب الحرية) 16-21.
أكثر من مجرد توفير الربط المادي للتماسك الخلوي، جزيئات الالتصاق هي العنصر الرئيسي في آلية إشارات للخلية للتواصل مع محيطه. لم يكن هناك اهتمام متزايد في فهم كيفية إشراك يجند من جزيئات الالتصاق يبدأ الإشارات بين الخلايا وكيفية transduced إشارة أولية داخل الخلية. حدسي، خصائص مستقبلات يجند ملزمة يمكن أن تؤثر على الإشارات التي يدفع. ومع ذلك، فإنه من الصعب تشريح العلاقات الميكانيكية بين التفاعل خارج الخلية والأحداث الإشارات بين الخلايا باستخدام الفرقة التقليدية للفحوصات البيوكيميائية بسبب العديد من القيود المفروضة عليها، على سبيل المثال، وهو القرار الزماني الفقراء والانعدام التام للقرار المكاني. الطرق التي تسمح لكل من الفيزياء الحيوية (2D حركية ملزمة مستقبلات يجند) والكيمياء الحيوية (إشارات) ملاحظات على الهواء مباشرة الحاليةوتشمل خلايا ركائز من صلابة الانضباطي 22، المطاط الصناعي صفائف العمود 23 والأجهزة تدفق غرفة / ميكروفلويديك تدمج مع القدرة مضان 24-26. ومع ذلك، قراءات من الإشارات وملزمة مستقبلات يجند لها التي يمكن الحصول عليها بشكل منفصل (في معظم الأحيان عن طريق وسائل مختلفة)، مما يجعل من الصعب تشريح العلاقات الزمانية والمكانية للخصائص السندات مع إشارات الأحداث.
BFP التقليدي هو التحليل الطيفي قوة فائق الحساسية لقرار الزمانية المكانية عالية (17). ويستخدم خلية مرنة الدم الحمراء (RBC) كجهاز استشعار القوة، مما يتيح قياس حركية 2D جزيء واحد، الخواص الميكانيكية والتغيرات متعلق بتكوين 14،16،19-21،27-29. A BFP التصوير الفلورسنت مقرها (fBFP) يرتبط حركية مستقبلات يجند الملزمة مع الخلايا مما يشير الى اثار ملزم على نطاق واسع جزيء واحد. مع هذا الإعداد، في أنشطة الخلايا مما يشير الى الوضع الطبيعي في سياق mechani السطحولوحظ التحفيز كال في الخلايا T-27. وfBFP هي متعددة ويمكن استخدامها لدراسات التصاق الخلايا والإشارات بوساطة جزيئات أخرى في خلايا أخرى.
هذا البروتوكول يتبع المبادئ التوجيهية للوتمت الموافقة من قبل لجنة أخلاقيات البحوث البشرية من معهد جورجيا للتكنولوجيا.
1. كرات الدم الحمراء الإنسان العزلة، Biotinylation والأسمولية تعديل
ملاحظة: الخطوة 1.1 يجب أن يؤديها الطبية المهنية مثل ممرضة مدربة، مع الموافقة على مجلس المراجعة المؤسسية البروتوكول.
2. الزجاج الخرزة Silanization
3. حبة Functionalization
4. خلية التحضير
ملاحظة: لتنقية الخلايا، اتبع القياسية بروتوكولات تنقية الخلايا المقابلة لنوع من الخلايا في الاستخدام، على سبيل المثال خلايا T-27 أو بعض خطوط الخلايا 21،29.
5. إعداد لبال micropipettes وغرفة خلية
6. BFP التجربة
الشكل 1: fBFP التجمع (أ) الصورة نظرة عامة على نظام الأجهزة fBFP. (ب) الرسم التخطيطي للنظام الأجهزة fBFP. (C) ونظام ثنائي كام "DC2" (البرتقالي) على الذي الكاميرا عالية السرعة (الأزرق) وكاميرا مضان (أبيض) تم تركيبه. (D) المرحلة المجهر أن تتكيف مع دائرة التجربة وثلاثة أنظمة التلاعب micropipette. الميكروسكوب لتحديد BFP في غرفة التجريبية (E و F). (E) بال micropipettes تظهر التجمع ماصة التحقيق (يسار)، ماصة الهدف (أعلى اليمين) والمساعد ماصة (أقل صآيت). (F) مسبار حبة التنسيب. تم التلاعب A حبة التحقيق من قبل ماصة مساعد وتعلق على قمة RBC لتشكيل قوة التحقيق. الرجاء انقر هنا لمشاهدة نسخة أكبر من هذا الرقم.
ويتكون نظام حزب الحرية ودورة تجربتها (A) الفيديو صورة مجهرية تصور تحقيق قوة (يسار) وهدف T-الخلية (يمين) يستنشق من قبل المعنيين pipettes.The التحقيق قوة ثابتة لهم من RBC تورم والمرفقة: الرقم 2. حبة الحاملة يجند. وتحمل مستقبلاتهي التي شنت T-الخلية (الهدف) إلى piezotranslator الانحياز مقابل التحقيق. يشار إلى ROI باللون الأخضر. يشار إلى تعقب حافة في الخط الأزرق. إدراج يصور يجند (PMHC، جنبا حبة) ومستقبلات (TCR، جنبا T-الخلية) الزوج على اثنين من السطوح معارضة في منطقة تتميز باللون البرتقالي. (B) وملف كثافة من حافة حبة في (A). يتم رسم المنطقة ROI في x -direction كما س -axis (في عدد بكسل) وشدة الضوء (في قيمة مقياس الرمادية) التي تراوحت بحسب binning 30 بكسل على طول -direction ذ. (C) وانحراف لRBC وموقف حبة والهدف (T-الخلية) في دورة اختبار القوة المشبك الفحص. الخطوط المتقطعة الرأسي والأفقي تشير إلى موقف صفر قوة للقمة RBC وبالطبع الوقت، على التوالي. يظهر تعقب خط حافة تشوه RBC باللون الأزرق في كل لوحة. واعتمدت نفس الخطوات بعد أقل في وتيرة التصاقفحص (التي تفتقر إلى خطوات "المشبك" و "فصل") والحرارية تقلب فحص (التي تفتقر إلى خطوة "فصل").
7. الإسفار BFP (fBFP) التجربة
تحليل 8. البيانات
كان رائدا في تقنية BFP من قبل المختبر ايفانز في عام 1995 (17). وقد استخدمت هذه الأداة picoforce على نطاق واسع لقياس تفاعلات البروتينات ثبتوا على السطوح، وذلك لتحليل حركية ثنائي الأبعاد للجزيئات الالتصاق التفاعل مع بروابط بهم 16،19،20، 30، لقياس مرونة الجزيئية 21،29، وتحديد البروتين بتكوين يتغير 21. لfBFP، مجموعة إضافية من الأجهزة ذات الصلة برنامج التحصين الموسع ومضان مع نظام البرمجيات المقابلة (الجدول 1) يضاف (الشكل 1A - C).
ويتكون النظام fBFP نظام الأجهزة (المكونات البصرية والميكانيكية والكهربائية) ونظام البرمجيات (الجدول 1 والشكل 1A، B). المجهر (الشكل 1A، وسط) مقلوب مع المكونات البصرية تمكين مشرق الميدان وبرنامج التحصين الموسع ومضان المجهر تشكل الجسم الرئيسي للنظام fBFP، على الذي هي التي شنت على مرحلة التجربة والمتلاعبين ماصة. يتم استخدام وحدة تحكم مصدر ضوء مضان (الشكل 1A، الزاوية اليسرى العليا) لتسليم بالتناوب أضواء الإثارة. نظام مزدوج كام "DC2" يقسم الضوء إلى اثنين وتحيلها إلى كاميرا عالية السرعة (الأزرق) وكاميرا مضان (أبيض) (الشكل 1A، الزاوية السفلى اليسرى). السابق بجمع صورة التحقيق لتحديد موقف والصور مضان يجمع الأخيرة المنبعثة من الخلية المستهدفة في اثنين من أطوال الموجة. ويتم رصد هذه التجربة والتي تسيطر عليها اثنين من أجهزة الكمبيوتر التي المضيف PC 1 (1A الشكل، الزاوية اليمنى العليا، اقتصاص في الصورة نظرا لضيق المساحة) متصلة على حد سواء كاميرا عالية السرعة والكاميرا مضان ويكون مسؤولا عن تنفيذ التجربة ويرتبط الحصول على البيانات، وPC المضيف 2 إلى كاميرا مراقبة ومسؤولة عن تقديم مرأى ومسمع من من experi BFPمنة (الشكل 1A، B).
خلال التجربة، يستخدم التجريبي ثلاثة بال micropipettes لانتزاع والتلاعب الخلايا والمجهرية على التوالي (الشكل 1E، F). صورة نموذجية من تجربة حزب الحرية وتتألف من تحقيق القوة التي يتم تجميعها عن طريق ربط حبة التحقيق على قمة أحد RBC يستنشق، والخلية المستهدفة / حبة (الشكل 2A). ، وتتبع المنطقة ذات الاهتمام (ROI)، الذي يحتوي على منطقة حافة حبة على RBC قمة بواسطة كاميرا السرعة السريعة (2000 إطارا في الثانية) لمراقبة تشوه RBC في الوقت الحقيقي. تشريد تعقب حبة ثم يمكن استخدامها لحساب قوة خارجية تمارس على لجنة التحقيق القوة (انظر الملاحظة في بروتوكول القسم 6.6)، نظرا ثابت ربيع BFP (الشكل 2A، B).
التصاق مقايسة التردد، والحرارية تقلب الفحص، وقوة المشبك الفحص هي وسائط التجريبية الثلاث التي يشيع استخدامها على نظام BFP. قبل إعلاناختيار أي من هذه الطرق الثلاث، ويتكون تجربة BFP دورات تكرار التجارب التي يتم تنفيذها بالتتابع.
في التصاق تردد الفحص، تقترب من الهدف والاتصالات حبة التحقيق في وقت الاتصال معين (على سبيل المثال، 1 ثانية) وتتراجع مباشرة إلى وضعه الأصلي وتبدأ الدورة التالية. وينعكس حدث التصاق بإشارة قوة الشد أثناء مرحلة التراجع. ويتكرر هذه الدورة نهج الاتصال وتراجع 50 مرة لا يقل عن 3 أزواج الهدف مسبار لحساب متوسط SEM تردد التصاق، P أ.
يستخدم الحراري تذبذب فحص لقياس مدى الحياة تحت الصفر القوة. في كل دورة، بعد أن لمس حبة التحقيق، وتراجعوا عن الهدف إلى موقف صفر القوة وفرضت على اتصال مع حبة من دون أي ضغط أو توتر لمدة 20 ثانية، ثم يعود إلى وضعه الأصلي لبدء دورة المقبلة. جمعية السندات / التفكك تحت الصفر القوةتتجلى بوصفها المفاجئة قطرة / زيادة في التقلبات الحرارية للحبة 16،30.
يستخدم المشبك قوة فحص لقياس مدى الحياة في إطار القوات. تم تعيين قوة المطلوب لقط (على سبيل المثال، 20 السندات الإذنية) قبل التجربة. هو الدافع وراء الهدف مرارا وتكرارا في الاتصال حبة التحقيق لوقت الاتصال معين (على سبيل المثال، 1 ثانية) للسماح بتشكيل لسندات مستقبلات / يجند (الشكل 2C، لوحات 2 و 3) ثم سحب (الشكل 2C، لوحة 4 ). إذا لم تؤلف السندات، التي تعكسها أي إشارة قوة الشد على RBC، أو إذا كان تمزقات السندات قبل الوصول إلى قوة تحامل مسبقا، فان الهدف العودة إلى الوضع الأصلي وتبدأ الدورة التالية. في أحداث الملزمة التي تعيش مرحلة تراجع، ويقام الهدف في القوة لقط مع استطالة المقابلة من RBC التي كتبها د حتى تنأى السندات (الشكل 2C، لوحات 5 و 6)، ثم يعود إلى posit الأصليأيون لبدء دورة القادمة (الشكل 2C، لوحة 7). ويعرف مدى الحياة كما الفاصل الزمني من لحظة عندما وصلت قوة المستوى المطلوب لحظة من التفكك السندات 20.
لجميع هذه الأساليب التجريبية الثلاث BFP، يجب أن يكون التجريبي قادرا على رؤية نهج تؤثر-اتصل-retract- (المشبك -) (dissociate-) اختبار عودة دورة (الشكل 2C)، والتي سوف تتكرر لعدة مرات 16،20 21.
ويمكن تحليل البيانات التي تم جمعها من كل واسطة التجريبي لحزب الحرية بطرق مختلفة لاستخلاص النتائج المرجوة. متوسط منحنى عمر هو نتيجة ممثل واحد من فحص قوة المشبك (الشكل 4). وهو يعكس متبادلة خارج معدلات من التفكك مستقبلات يجند تحت القوات. الحرارية تقلب فحص يسمح لتوصيف 2D على معدل وخارج معدل زوج مستقبلات يجند تحت الصفر القوة 16؛ في حين التصاق التكرارuency فحص يجعل 2D على معدل، خارج معدل وتقارب تحت الصفر القوة 13.
لفي الوظيفة وظيفة التصوير مضان يسمح لرصد الخلايا مستوى الكالسيوم 2+ من خلية واحدة، والذي يستخدم مثل قراءات من الإشارات الخلوية في هذا النظام. لاستخدام هذه الوظيفة خلال تجربة fBFP، ويحتاج المرء إلى ما قبل تحميل الخلايا مع 2+ مؤشر الكالسيوم. في حالة Fura2-AM كونها صبغة الفلورسنت، وسجلت الصور مضان من نفس الخلية تحت 340 نانومتر و 380 نانومتر قنوات الإثارة بالتناوب في التجربة وتفقد الزوج-من قبل الزوج في التحليل. تم تعيين عتبة كثافة لصورة الفلورسنت كل قناة لإزالة الضوضاء الخلفية والتعرف على كفاف الخلية (الشكل 5). مقارنة بين كل زوج من الصور مضان تسمح للحساب بين الخلايا كاليفورنيا مستوى 2+. الصور الفلورسنت واضحة من الخلية في إطار كل 340 نانومترو 380 نانومتر قنوات الإثارة ضرورية لقياس دقيق لمستوى الكالسيوم 2+ (الشكل 5A، B)، في حين أن الصور السيئة مع ضجيج في الخلفية لا يستهان سيؤدي إلى نتائج متحيزة ويجب تجنبها (الشكل 5C).
من خلال تقديم التحفيز الميكانيكية السيطرة على الخلية وسجل خلية كا مستوى 2+ في وقت واحد، وfBFP يوفر أداة قوية واحدة جزيء لدراسة والميكانيكية تنبيغ على الخلية الحية. ومن الجدير بالذكر أن منصة الموصوفة هنا هي متعددة للغاية. من حيث المبدأ، يمكن للمرء أن تصميم العديد من الطرق لاستخدام القوة إلى الخلية لتتناسب مع أغراض معينة وبالتزامن رصد الأحداث يشير الى مختلف المصالح. ثم يتم تحليل التفاصيل التي تعتمد على القوة الحركية في سياق قراءات تأشيري مختار لاستخراج خصائص مستقبلات يجند حركية التنظيم القوة، والإشارات التي يسببها، وترابطها. في المثال من TCR سيجnaling، تم اكتشاف TCR-PMHC الصيد السندات ناهض محددة أولا ثم تم التحقيق أهميتها بالنسبة لT-خلية الكالسيوم 2+ تدفق 27. كانت استراتيجية لأخذ قيمة الذروة من الكالسيوم 2+ تدفق كما قراءات يشير إلى التماس أفضل للتنبؤ بها بين مختلف المعلمات الحركية، بما في ذلك عدد من الالتصاقات، واتساع قوة الربط، ومتوسط عمر، وهي أطول مدى الحياة والتراكمي عمر بالتتابع شكلت الارتباطات. هو مبين في الشكل (6) مثال عمر السندات الفردية المسجلة في وقت واحد (حيث تم تطبيق قوة لقط من 10 السندات الإذنية) من خلايا T وتراكمها مع منحنى إشارة الكالسيوم 2+ المقابلة. في هذه الحالة، وقعت أربعة أحداث حياته قبل ذلك الوقت عندما بدأ مستوى الكالسيوم 2+ للارتقاء في 55 ثانية، وتراكم مبلغ 10 ثانية العمر السندات. وأثار هذا المستوى من تراكم عمر كا 2+ إشارة مع ذروة بلغت نسبة Fura2 تطبيع1.8 التي وقعت في 65 ثانية. وكشف التحليل الرياضي المنتظم لهذه البيانات التي تم جمعها من العديد من الخلايا الفردية أن أفضل المتعلقات من الكالسيوم 2+ يشير القوة والمتراكمة عمر في 1 شارع دقيقة من تكرار التفاعلات TCR-PMHC (الرجوع إلى مرجع 27 للحصول على التفاصيل الفنية).
الرقم 3: المثالية الوقت قوة منحنيات البيانات الخام لحدث عدم التصاق (A)، وهو حدث تمزق قوة (B) والعمر الحدث (C). يتم وضع علامة مراحل مختلفة من دورة وشرائح منحنى المقابلة على التوالي في كل لوحة. ويستمد القوة (المحور Y-) من تتبع التغير موقف حبة التحقيق، كما هو مبين في الشكل 2C. (A) لا التصاق: وضغطي (السلبية) القوة في عوائد مرحلة الاتصال ر س صفر على التراجع. (B) في حالة القوة تمزق: أ الشد (إيجابية) قوة تسحب عن طريق سندات مستقبلات يجند لإطالة RBC، وتتمزق أثناء مرحلة التراجع. (C) A العمر الحدث: استمرار السندات حتى يتم الوصول إلى قوة تحامل وتنأى بعد ذلك. يشار إلى مدة الحدث مدى الحياة. وسلط الضوء على الحدث قوة تمزق (B) وبداية لهذا الحدث مدى الحياة (C) من قبل النجمة.
الرقم 4: "متوسط العمر في مقابل القوة" منحنى OT1 T-خلية التفاعل مع ناهض في OVA (الخضراء) وG4 خصم (الأزرق) يتم تجميع البيانات المجمعة في صناديق قوة مختلفة، ويعني ± SEM من عمر السندات غير رسم مقابل قوة.
= "دائما">
الرقم 5: الممثل الكالسيوم 2+ الصور متحمس على اثنين من الأطوال الموجية (A، B) التعرف على الصور الصحيحة لخلايا T (أشار باللون الأحمر) في 340 نانومتر (A) و 380 نانومتر (B) القنوات على أساس نقطة ل- يشير فحص باستخدام عتبة شدة تعيين بشكل صحيح. (C) عدم القدرة على التعرف على صورة مضان من خلايا T (المشار إليها باللون الأحمر) في قناة الإثارة 340 نانومتر، ويرجع ذلك إلى ضعف تحميل Fura2.
الشكل 6: التراكب من "الكالسيوم داخل الخلايا 2+ مستوى (نسبة النسبية Fura2) مقابل الوقت" و "عمر التراكمي مقابل الوقت" منحنيات من T-خلية OT1، وتوليدد عن طريق لمس مرارا وتكرارا على خلايا T مع حبة المغلفة OVA أكثر من 300 ثانية. (A) منحنى القوة تظهر سلسلة من عدم الالتصاق، من قوة تمزق، وأحداث الحياة التي تولدها الاتصالات المتكررة مع مرور الوقت. (B) وصور برنامج التحصين الموسع ومضان الزائفة اللون من الكالسيوم داخل الخلايا 2+ إشارات في T-الخلية عند نقاط زمنية مختلفة. يشار إلى تطبيع مستوى الكالسيوم 2+ من قبل على نطاق والزائفة اللون على اليمين. (C) استعلاء منحنى الكالسيوم 2+ الإشارة (الحمراء)، ومنحنى العمر التراكمي (الصفراء) على ملعب نفس الوقت. وقد تآمر منحنى الكالسيوم 2+ بناء على الكالسيوم 2+ التصوير. تدل A الكالسيوم 2+ تدفق من الارتفاع الحاد في نسبة Fura2 تطبيع. الوقت عندما كا 2+ تصل إلى الذروة يشار بخط متقطع. الوقت بداية كل حدث مدى الحياة يتم وضع علامة على منحنى العمر التراكمي (مثلث الصلبة).
تجربة ناجحة fBFP ينطوي على بعض الاعتبارات الهامة. أولا، لحساب القوة لتكون موثوقة، وmicropipette، وRBC، وحبة التحقيق يجب أن تكون محاذاة أقرب إلى محوري وقت ممكن. يجب أن يكون الإسقاط من RBC داخل ماصة حوالي واحد قطره التحقيق ماصة بحيث الاحتكاك بين RBC وماصة لا يكاد يذكر. لRBC البشري نموذجي، وقطرها ماصة الأمثل هو 2،0-2،4 ميكرون، والتي تعطي أفضل نوبة من المعادلة 1 17،30. ثانيا، لضمان قياسات في فحص قوة المشبك والحرارية تقلب الاختبار هي في الغالب للسندات واحدة، تردد التصاق أقل من 20٪ لابد من الحفاظ 10،13،30. هنا، التصاقات غير محددة يجب أن تسيطر عليها بعناية (عادة <5٪ خلال منع كاف مع BSA). بالإضافة إلى ذلك، ينبغي جمع البيانات فقط من الأحداث التصاق مع واحد قوة الإفلات - السمة المميزة للسلوك واحد جزيء (مماثلة إلى اختفاء خطوة واحدةمضان في جزيء واحد الحنق). يجب أن يكون الأمثل الثالث، وتركيز التحميل من صبغ مضان على أساس كل حالة على حدة لتحقيق أفضل جودة التصوير. رابعا، سمية صبغ التحميل إلى T-الخلية أو الخلايا الأخرى ذات الاهتمام تحتاج إلى أن تدرس بعناية قبل كل تجربة. على سبيل المثال، تقارب ملزمة التفاعلات مستقبلات يجند على صبغ التحميل تحتاج إلى قياس ومقارنة بما كان عليه من دون صبغ التحميل. إذا كانت تقارب ملزمة يتم تغيير بسبب بشكل كبير لصبغ تحميل، صبغة مختلفة أو التركيز تحميل مختلفة لابد من النظر فيها. خامسا، ويفضل البروتينات عضال الموسومة البيوتين للسماح اقتران مريحة، ومحددة، والقوي الذي يحافظ على التوجه البروتين الأصلي.
A القوة الرئيسية للfBFP هو أنه يقوم بإجراء فحص السندات واحد على خلية واحدة. على الرغم من سرعة منخفضة، وتحليل السندات واحد غالبا ما يكشف الميزات الهامة التي لا يمكن الوصول إليها من قبل الفرقة التقليدية ليthods. على سبيل المثال، عن طريق فحص توزيع أعماله في كل فرقة بن، يمكن للمرء أن ربط الخصائص ملزمة مختلفة مع الدول البروتين بتكوين وتقديم فكرة عن الطريقة التي ينظم قوة البروتين بتكوين يغير 20،32. ويمكن أيضا أن حزب الحرية استخدامها لقياس صلابة الجزيئية من القوة وبيزو الترجمة البيانات تشريد مرحلة التراجع، والتي يمكن استخدامها لتحقيق البروتين ديناميات بتكوين 20،21.
وقد وضعت العديد من الأساليب لدراسة بوساطة مستقبلات التصاق الخلايا والإشارات. يتم قياس حركية ملزمة مستقبلات يجند عموما مع البروتينات المؤتلف في عزلة تامة عن البيئة الخلوية. هذه الممارسة هي الإشكالية المحتملة. على سبيل المثال، تم مؤخرا تبين أن في الموقع حركية يقاس على الخلايا الحية يختلف جذريا عن أن تقاس باستخدام بروتينات المؤتلف الموافق 14، وكشف عن رؤى جديدة للمستقبل & #8217؛ ق الوظائف الخلوية. ليس فقط fBFP قادرة على قياس حركية مستقبلات يجند في الموقع، ولكن الأهم من ذلك، فإنه يمكن أيضا تسجيل في وقت واحد إشارات الخلايا الناجم ملزم. كما تبين للTCR 27، ومعلومات غنية من الخصائص ملزمة والخلايا الإشارات التي تم الحصول عليها باستخدام يوفر fBFP فرصة غير مسبوقة لتحليل العلاقات بينهما وفهم الآليات الجزيئية للوالميكانيكية تنبيغ. فمن المرجح أن fBFP سوف تجد المزيد من التطبيقات في أنظمة مستقبلات يجند الهامة الأخرى.
The authors have nothing to disclose.
Research related to this paper and the development of the fBFP technology in the Zhu lab were supported by NIH grants AI044902, AI077343, AI038282, HL093723, HL091020, GM096187, and TW008753. We thank Evan Evans for inventing this empowering experimental tool, and members of the Evans lab, Andrew Leung, Koji Kinoshita, Wesley Wong, and Ken Halvorsen, for helping us to build the BFP. We also thank other Zhu lab members, Fang Kong, Chenghao Ge and Kaitao Li, for their helps in the instrumentation development.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Sodium Phosphate Monobasic Monohydrate (NaH2PO4 • H2O) | Sigma-Aldrich | S9638 | Phosphate buffer preparation |
Anhy. Sodium Phosphate Dibasic (Na2HPO4) | Sigma-Aldrich | S7907 | Phosphate buffer preparation |
Sodium Carbonate (Na2CO3) | Sigma-Aldrich | S2127 | Carbonate/bicarbonate buffer preparation |
Sodium Bicarbonate (NaHCO3) | Sigma-Aldrich | S5761 | Carbonate/bicarbonate buffer preparation |
Sodium chloride (NaCl) | Sigma-Aldrich | S7653 | N2-5% buffer preparation |
Potassium chloride (KCl) | Sigma-Aldrich | P9541 | N2-5% buffer preparation |
Potassium phosphate monobasic (KH2PO4) | Sigma-Aldrich | P5655 | N2-5% buffer preparation |
Sucrose | Sigma-Aldrich | S0389 | N2-5% buffer preparation |
MAL-PEG3500-NHS | JenKem | A5002-1 | Bead functionalization |
Biotin-PEG3500-NHS | JenKem | A5026-1 | RBC biotinylation |
Nystatin | Sigma-Aldrich | N6261 | RBC osmolarity adjustment |
Ammonium Hydroxide (NH4OH) | Sigma-Aldrich | A-6899 | Glass bead silanization |
Methanol | BDH | 67-56-1 | Glass bead silanization |
30% Hydrogen Peroxide (H2O2) | J. T. Barker | Jan-86 | Glass bead silanization |
Acetic Acid (Glacial) | Sigma-Aldrich | ARK2183 | Glass bead silanization |
3-Mercaptopropyltrimethoxysilane (MPTMS) | Uct Specialties, llc | 4420-74-0 | Glass bead functionalization |
Borosilicate Glass beads | Distrilab Particle Technology | 9002 | Glass bead functionalization |
Streptavidin−Maleimide | Sigma-Aldrich | S9415 | Glass bead functionalization |
BSA | Sigma-Aldrich | A0336 | Ligand functionalizing |
Fura2-AM | Life Technologies | F-1201 | Intracellular calcium fluorescence dye loading |
Dimethyl sulfoxide (DMSO) | Sigma-Aldrich | D2650 | Intracellular calcium fluorescence dye loading |
Quantibrite PE Beads | BD Biosciences | 340495 | Density quantification |
Flow Cytometer | BD Biosciences | BD LSR II | Density quantification |
Capillary Tube 0.7-1.0 mm x 30 inches | Kimble Chase | 46485-1 | Micropipette making |
Flaming/Brown Micropipette Puller | sutter instrument | P-97 | Micropipette making |
Pipette microforce | Narishige | MF-900 | Micropipette making |
Mineral Oil | Fisher Scientific | BP2629-1 | Chamber assembly |
Microscope Cover Glass | Fisher Scientific | 12-544-G | Chamber assembly |
Micro-injector | World Precision Instruments | MF34G-5 | Chamber assembly |
1 ml syringe | BD | 309602 | chamber assembly |
Micropipette holder | Narishige | HI-7 | Chamber assembly |
Home-designed mechanical parts and adaptors fabrications using CNC machining. | Biophysics Instrument | All parts are customized according to the CAD designs. | BFP system |
Microscope (TiE inverted) | Nikon | MEA53100 | BFP system |
Objective CFI Plan Fluor 40x (NA 0.75, WD 0.72 mm, Spg) | Nikon | MRH00401 | BFP system |
Camera, GE680, 640 x 480, GigE, 1/3" CCD, mono | Graftek Imaging | 02-2020C | BFP system |
Prosilica GC1290 - ICX445, 1/3", C-Mount, 1280 x 960, Mono., CCD, 12 Bit ADC | Graftek Imaging | 02-2185A | BFP system |
Manual submicron probehead with high resolution remote control | Karl Suss | PH400 | BFP system |
Anti-vibration table (5’ x 3’) | TMC | 77049089 | BFP system |
3D manual translational stage | Newport | 462-XYZ-M | |
SolidWorks 3D CAD software | SOLIDWORKS Corp. | Version 2012 SP5 | BFP system |
LabVIEW software | National Instruments | Version 2009 | BFP system, BFP program |
3D piezo translational stage | Physik Instrumente | M-105.3P | BFP system |
Linear piezo accuator | Physik Instrumente | P-753.1CD | BFP system |
Micromanager software | Version 1.4 | fBFP system, fluorescence imaging program | |
Dual Cam (DC-2) | Photometrics | 77054724 | fBFP system |
Dual Cam emission filter (T565LPXR) | Photometrics | 77054725 | fBFP system |
Fluorescence Camera | Hamamatsu | ORCA-R2 C10600-10B | fBFP system |
Plastic paraffin film (Parafilm) | Bemis Company, Inc | PM996 | bottle sealing |
Carbonate/bicarbonate buffer (pH 8.5) | 8.4 g/L sodium carbonate (Na2CO3), 10.6 g/L sodium bicarbonate (NaHCO3) | ||
Phosphate buffer (pH 6.5-6.8) | 27.6 g/L NaPhosphate monobasic (NaH2PO4 • H2O), 28.4 g/L Anhy. NaPhosphate dibasic (Na2HPO4) | ||
N2-5% buffer (pH 7.2) | 20.77 g/L potassium chloride (KCl), 2.38 g/L sodium chloride (NaCl), 0.13 g/L potassium phosphate monobasic (KH2PO4), 0.71 g/L anhy. sodium phosphate dibasic (Na2HPO4), 9.70 g/L sucrose |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved