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Qui descriviamo un protocollo per generare organoidi renali da cellule staminali pluripotenti umane (hPSC). Questo protocollo genera organoidi renali entro due settimane. Gli organoidi renali risultanti possono essere coltivati in fiaschi spinner su larga scala o piastre magnetiche multi-pozzo per approcci paralleli di test antidroga.
Gli organoidi renali generati dalle hPSC hanno fornito una fonte illimitata di tessuto renale. Gli organoidi renali umani sono uno strumento inestimabile per studiare malattie e lesioni renali, sviluppare terapie cellulari e testare nuove terapie. Per tali applicazioni è necessario un gran numero di organoidi uniformi e saggi altamente riproducibili. Abbiamo costruito sul nostro protocollo organoide renale precedentemente pubblicato per migliorare la salute generale degli organoidi. Questo semplice e robusto protocollo 3D prevede la formazione di corpi embrioidi uniformi in un mezzo componente minimo contenente lipidi, integratore di insulina-transferrina-selenio-etanolammina e alcool polivinilico con inibitore GSK3 (CHIR99021) per 3 giorni, seguito da coltura in mezzo contenente siero sostitutivo knock-out (KOSR). Inoltre, i saggi di agitazione consentono di ridurre l'aggregazione dei corpi embrioidi e di mantenere una dimensione uniforme, che è importante per ridurre la variabilità tra gli organoidi. Nel complesso, il protocollo fornisce un metodo veloce, efficiente ed economico per generare grandi quantità di organoidi renali.
Negli ultimi anni, sono stati sviluppati una serie di protocolli per differenziare le cellule staminali pluripotenti umane in organoidi renali 1,2,3,4,5. Gli organoidi renali hanno fornito uno strumento importante per aiutare la ricerca su nuovi approcci di medicina rigenerativa, modellare malattie renali, eseguire studi di tossicità e sviluppo di farmaci terapeutici. Nonostante la loro ampia applicabilità, gli organoidi renali hanno limitazioni come la mancanza di maturazione, la limitata capacità di coltura a lungo termine in vitro e una scarsità di diversi tipi di cellule presenti nel rene umano 6,7,8. Recenti lavori si sono concentrati sul miglioramento del livello di maturazione organoide, estendendo i periodi di coltura ed espandendo la complessità delle popolazioni di cellule renali modificando i protocolli esistenti 9,10,11,12. In questa attuale iterazione del nostro protocollo stabilito 5,13, abbiamo modificato i componenti medi nella prima fase del protocollo in un mezzo base privo di siero integrato con insulina-transferrina-selenio-etanolammina (ITSE), lipidi, alcool polivinilico (E5-ILP) e CHIR99021 (Figura 1). Questi cambiamenti forniscono un mezzo completamente definito, privo di siero, a basso contenuto proteico, con meno componenti rispetto alla nostra precedente composizione media 5,13 e senza ulteriori fattori di crescita. Di conseguenza, il mezzo di prima fase è meno laborioso da preparare rispetto alla nostra versione pubblicata in precedenza e può ridurre la variabilità da lotto a lotto5. Studi precedenti hanno dimostrato che sia l'insulina che la transferrina sono importanti nella coltura priva di siero14,15, tuttavia, alti livelli di insulina possono essere inibitori della differenziazione del mesoderma16. Abbiamo mantenuto i bassi livelli di insulina come previsto nel protocollo originale e ulteriormente ridotto i livelli di KOSR (contenente insulina) nella seconda fase del test. In linea con altri protocolli per la formazione di organoidi renali, livelli più bassi di KOSR sono utili per mantenere un equilibrio tra proliferazione e differenziazione del tessuto renale17. Inoltre, abbiamo abbassato la concentrazione di glucosio nel nostro mezzo di stadio II13.
Il nostro metodo descrive una configurazione per il dosaggio in sospensione di organoidi renali, producendo fino a ~ 1.000 organoidi da una piastra di coltura iniziale di hPSC 100 mm confluente al ~ 60% come descritto nella pubblicazione originale 5,13. Questo protocollo può essere facilmente scalato fino a partire da più piastre da 100 mm o 150 mm per aumentare ulteriormente i numeri organoidi.
Tutti gli esperimenti che utilizzano hPSC sono stati eseguiti in conformità con le linee guida istituzionali e sono stati condotti in una cappa di biosicurezza di Classe II con adeguati dispositivi di protezione individuale. Tutti i reagenti sono di grado di coltura cellulare, salvo diversa indicazione. Tutte le colture vengono incubate a 37 °C, 5% CO2 atmosfera atmosferica. In tutte le fasi del test, i corpi embrioidi o gli organoidi renali possono essere raccolti e fissati o preparati per l'analisi. Le linee hPSC utilizzate per generare questi dati sono state completamente caratterizzate e pubblicate18.
1. Preparazione delle tavole di coltura
NOTA: Circa 1 ora prima della scissione delle hPSC, rivestire 2 piastre di coltura tissutale da 100 mm con un estratto di matrice di membrana basale qualificato (BME) di cellule staminali. Si possono pre-rivestire le piastre, sigillarle con un film di paraffina e conservare a 4 °C secondo le istruzioni del produttore.
2. Passaging hPSC
NOTA: per la coltura hPSC di routine, linee cellulari di passaggio con confluenza del 70-80%.
3. Giorno 0 - Impostazione del test organoide renale
4. Giorno 2 - Alimentazione con cambio mezzo-medio
NOTA: Entro le 48 ore, i cluster di colonie formeranno corpi embrioidi.
5. Giorno 3 - Trasferimento di corpi embrioidi al mezzo di stadio II
6. Trasferire al pallone spinner e l'alimentazione
NOTA: un pallone spinner può essere utilizzato in qualsiasi momento dal giorno 3 in poi per esperimenti che richiedono un gran numero di organoidi. Il trasferimento di routine degli organoidi avviene nel nostro laboratorio tra i giorni 6-8. Si prega di consultare la sezione Discussione per le alternative se l'attrezzatura non è disponibile.
7. Impostazione della piastra magnetica a 6 pozzetti (6MSP)
NOTA: il formato 6MSP può essere utilizzato al posto dei palloni spinner se è necessario testare più condizioni. Utilizzare il 6MSP per trattamenti composti o nefrotossina. Ciò consente di risparmiare la quantità di mezzo utilizzato nella seconda fase, pur mantenendo la disponibilità di nutrienti attraverso la diffusione.
In questa versione più recente del nostro protocollo, la differenziazione degli organoidi renali viene avviata in un mezzo definito a basso contenuto proteico. I saggi vengono eseguiti interamente in sospensione e si basano sulla capacità innata di differenziazione e organizzazione delle hPSC per l'inizio della tubulogenesi. Un singolo test proveniente da una piastra di coltura hPSC confluente da 100 mm ~ 60% produce abitualmente 500-1.000 organoidi renali, come mostrato nella nostra precedente pubblicazione5. A causa di un numero così elevato di organoidi generati, questo protocollo è adatto per i test dei composti. Utilizziamo abitualmente un formato a 6 pozzetti per i test dei composti, tuttavia, questo protocollo può essere facilmente scalato nella seconda fase (dal giorno 3 in poi) ad altri formati multi-pozzo per test composti a throughput più elevato. L'immunofluorescenza delle sezioni di paraffina mostra la presenza di segmenti di nefrone negli organoidi, cioè tubuli renali che esprimono Hepatocyte Nuclear Factor-1 beta (HNF1B) e Lotus Tetragonolobus Lectin (LTL) (Figura 3A - HNF1B, LTL), e cluster di podociti che esprimono V-maf Muscoloaponeurotic Fibrosarcoma oncogene omologo B (MAFB) e nefrina (NPHS1) (Figura 3A - MAFB, Figura 3B - NPHS1). Inoltre, le modifiche in questo protocollo possono supportare l'espansione delle cellule endoteliali come si vede nella Figura 3B che mostra la colorazione con piastrine e molecola di adesione delle cellule endoteliali 1 (PECAM1) al giorno 26 della coltura.
Reagente | Stock conc. | Lavoro conc. | Quantità per 250 ml |
TeSR-E5 · | n/d | n/d | 238,48 ml |
PVA | 10% | 0.25% | 6,25 ml |
Penna-Streptococco | 100x | 1x | 2,5 ml |
ITSE | 100x | 0,1x | 250 μL |
Lipidi chimicamente definiti | 100x | 1x | 2,5 ml |
Plasmocina | 25 mg/mL | 2,5 μg/mL | 25 μL |
Tabella 1: Composizione media E5-ILP. Pipettare tutti i reagenti ad eccezione dei lipidi chimicamente definiti e del reagente anti-micoplasma direttamente nella camera superiore di un'unità di filtrazione Stericup da 0,22 μm. Dopo la filtrazione, aggiungere i lipidi e il reagente anti-micoplasma. Conservare a 4 °C per un massimo di due settimane.
Reagente | Stock conc. | Lavoro conc. | Quantità per 500 ml |
DMEM (Basso glucosio) | n/d | n/d | 417,5 ml |
KOSR · | n/d | 10% | 50 ml |
PVA | 10% | 0.25% | 12,5 ml |
Penna-Streptococco | 100x | 1x | 5 ml |
MEM-NEAA | 100x | 1x | 5 ml |
GlutaMAX | 100x | 1x | 5 ml |
HEPES · | 100x | 1x | 5 ml |
Plasmocina | 25 mg/mL | 2,5 μg/mL | 50 μL |
Tabella 2: Fase II composizione media. Pipettare tutti i reagenti tranne il reagente anti-micoplasma direttamente nella camera superiore di un'unità di filtrazione Stericup da 0,22 μm. Una volta filtrato, aggiungere il reagente anti-micoplasma. Conservare a 4 °C per un massimo di due settimane.
Figura 1: Panoramica del protocollo. Panoramica schematica del protocollo che mostra la tempistica delle due fasi e l'uso di fiaschi spinner e 6MSP. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 2: Fasi del protocollo. (A) Immagine in campo luminoso della colonia di hPSC trattata con GCDR. (B) Confluenza ottimale e dimensioni della colonia per iniziare un test organoide renale. C) hPSC trattate con dispase per 6 minuti. Le frecce rosse indicano i bordi delle colonie che si raggomitolano. (D) Saggi organoidi su uno shaker orbitale. (E) Uso di un colino cellulare da 200 μm per setacciare grandi corpi embrioidi. (F) Corpi embrioidi al giorno 3 (D3) prima del trasferimento al mezzo di stadio II. (G) L'emergere della formazione di tubuli può essere osservato al giorno 8 (D8) e (H) punto temporale ottimale per la raccolta e il trattamento degli organoidi al giorno 14 (D14). I) Pallone spinner utilizzato per la coltura alla rinfusa su una piastra magnetica multiposizione. (J) Saggio su una piastra magnetica multi-pozzo. Barre di scala, 200 μm. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 3: Risultati attesi. (A) Immagini confocali rappresentative di sezioni di paraffina marcate immunofluorescente degli organoidi renali del giorno 14 che mostrano colorazione positiva per epiteli tubulari (HNF1B e LTL) e cluster di podociti (MAFB). (B) Giorno 26 sezioni organoidi renali etichettate per cluster di podociti (NPHS1) e cellule endoteliali (PECAM1). Barre di scala, 100 μm (A); 200 μm (B). Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Studi precedenti hanno dimostrato che le fasi iniziali del protocollo sono fondamentali per la differenziazione del mesoderma intermedio 5,19,20 e, pertanto, è essenziale implementare una composizione media rigorosa in questa fase. La rimozione di componenti indefiniti come siero, albumina, ibridoma medio II privo di proteine dal primo stadio del protocollo può aiutare a migliorare l'efficienza di differenziazione coerente tra i saggi21.
Lo stato metabolico delle cellule renali è fondamentale per la loro funzione e i cambiamenti del glucosio possono portare allo stato metabolico alterato22. Studi precedenti hanno descritto che alti livelli di glucosio (fino a 25 mM) possono indurre disfunzione delle cellule endoteliali e alterare la crescita e la capacità ossidante delle cellule renali 22,23,24. Sono stati anche descritti alti livelli di glucosio per alterare la funzione mitocondriale24, che può essere sfavorevole quando si indaga sulla malattia renale e la nefrotossicità o si esegue la scoperta di farmaci utilizzando organoidi renali. Abbiamo, quindi, ridotto il livello di glucosio nel nostro protocollo per promuovere uno stato metabolico più in vivo delle cellule renali organoidi. Di conseguenza, le modifiche al test organoide renale forniscono un protocollo coerente e robusto, pur mantenendo la sua semplicità.
Gli organoidi renali sono immaturi e la coltura prolungata (>20 giorni) può portare all'incidenza di tipi di cellule pro-fibrotiche e non renali come precedentemente descritto 5,25, lasciando gli organoidi meno rappresentativi del tessuto renale umano sano. Sulla base della nostra esperienza, la finestra di trattamento ottimale, in cui gli organoidi renali sono più sani è tra i giorni 14-18. L'uso di fiaschi spinner e agitatori magnetici multi-pozzo come descritto sopra migliorerà la disponibilità uniforme di nutrienti rispetto alla coltura statica21,26. Se le apparecchiature per la coltura delle sospensioni come lo shaker o gli agitatori magnetici non sono disponibili, questo protocollo può comunque essere eseguito completamente nelle piastre di attacco ultra-basse in coltura statica. Ci può tuttavia essere una maggiore incidenza di corpi embrioidi / fusione organoide, portando a grandi campioni con nuclei necrotici a causa dell'ipossia. Qualsiasi organoide di dimensioni superiori a 500 μm può essere rimosso utilizzando i filtri cellulari descritti. Per ridurre la possibilità di fusione degli organoidi in questi casi, suggeriamo di non seminare più di 100 organoidi per 6-pozzetti. Inoltre, dopo l'alimentazione, gli organoidi devono essere distribuiti uniformemente eseguendo la figura otto movimenti con la piastra.
Si può osservare una bassa efficienza (<50%) della formazione di organoidi. Questo di solito si verifica quando le colture hPSC hanno raggiunto un'elevata confluenza (>80%) durante il passaging standard. È fondamentale che la manutenzione dell'hPSC sia coerente e che le cellule non vengano lasciate diventare troppo confluenti. L'alta confluenza e la tecnica di passaggio incoerente possono anche portare a differenziazione spontanea e aumento della morte cellulare. Se la differenziazione è presente nella coltura hPSC, si consiglia di rimuovere le aree differenziate aspirando con una punta di pipetta fine se non supera il 5% della popolazione cellulare, prima di iniziare il test. Se le aree di differenziazione superano il 5%, si consiglia di scongelare e dividere un nuovo lotto di hPSC almeno una volta prima di iniziare un nuovo test.
Abbiamo osservato che alcune linee hPSC sono più inclini a formare tipi di cellule non renali, come il tessuto cardiaco o neurale. Se ciò si verifica, la filtrazione dimensionale utilizzando i filtri cellulari può aiutare a rimuovere quegli organoidi che contengono escrescenze non renali. In alternativa, la modifica del mezzo e/o della matrice hPSC può aiutare a ridurre le escrescenze non renali. Dalla nostra esperienza, i mezzi hPSC alternativi contenenti componenti minimi e BME come vitronectin, forniscono una nicchia pluripotente più rigorosa e quindi aiutano a generare colture hPSC più omogenee.
Gli autori non hanno nulla da rivelare.
Questa ricerca è stata finanziata dal National Institutes of Health R01 DK069403, UC2 DK126122 e P30-DK079307 e ASN Foundation for Kidney Research Ben J. Lipps Research Fellowship Program to AP.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
2-Mercaptoethanol | Thermo Fisher | 21-985-023 | |
Anti-adherence rinsing solution | STEMCELL Technologies | 7010 | |
CHIR99021 | STEMCELL Technologies | 72054 | 10 mM stock in DMSO |
Corning disposable spinner flasks | Fisher Scientific | 07-201-152 | |
Corning Ultra-Low Attachment 6-well plates | Fisher Scientific | 07-200-601 | |
Corning Slow-Speed Stirrers | Fisher Scientific | 11-495-03 | Multi plate magnetic stirrer for spinner flask culture |
Dispase | STEMCELL Technologies | 7923 | Aliquot and freeze |
DMEM, low glucose, pyruvate, no glutamine, no phenol red | Thermo Fisher | 11054020 | |
DPBS 1x, no calcium, no magnesium | Thermo Fisher | 14-190-250 | |
Egg / Oval Stirring Bars | 2mag | PI20106 | |
Excelta General-Purpose Tweezers | Fisher Scientific | 17-456-103 | Keep sterile in the cell culture hood |
EZBio Single Use Media Bottle, 250mL | Foxx Life Sciences | 138-3211-FLS | Used to make PVA 10% |
Falcon Standard Tissue Culture Dishes (100 mm) | Thermo Fisher | 08-772E | |
Fisherbrand Sterile Aspirating Pipet 2mL | Fisher Scientific | 14-955-135 | |
Fisherbrand Cell Lifters - Cell lifter | Fisher Scientific | 08-100-240 | |
Fisherbrand Multi Function 3D Rotators | Fisher Scientific | 88-861-047 | Orbital shaker |
Geltrex LDEV-Free Reduced Growth Factor Basement Membrane Matrix | Thermo Fisher | A1413302 | BME. Aliquot on ice and freeze. Another suitable matrix alternative is Matrigel or Cultrex. |
Gentle Cell Dissociation Reagent | STEMCELL Technologies | 7174 | GCDR |
GlutaMAX Supplement | Thermo Fisher | 35-050-061 | L-glutamine supplement. |
HEPES (1M) | Thermo Fisher | 15-630-080 | |
Insulin-Transferrin-Selenium-Ethanolamine | Thermo Fisher | 51-500-056 | ITSE |
KnockOut Serum Replacement - Multi-Species | Thermo Fisher | A3181502 | KOSR. Aliquot and freeze |
Lipid Mixture 1, Chemically Defined | Millipore-Sigma | L0288-100ML | |
MEM Non-Essential Amino Acids Solution | Thermo Fisher | 11140-050 | |
MilliporeSigma Stericup Quick Release-GP Sterile Vacuum Filtration System 500mL | Fisher Scientific | S2GPU05RE | |
MilliporeSigma Stericup Quick Release-GP Sterile Vacuum Filtration System 250mL | Fisher Scientific | S2GPU02RE | |
MIXcontrol MTP / Variomag TELEcontrol MTP Control Unit | 2mag | VMF 90250 U | |
MIXdrive 6 MTP / Variomag TELEdrive 6 MTP Microplate Stirring Drive | 2mag | VMF 40600 | 6MSP |
MP Biomedicals 7X Cleaning Solution | Fisher Scientific | MP0976670A4 | Tissue culture suitable detergent. Make a 5% solution in water |
mTeSR1 | STEMCELL Technologies | 85850 | hPSC medium.TeSR-E8, NutriStem XF, and mTeSR Plus medium have also been tested and are suitable alternatives. |
Nunc 50 mL Conical, Sterile Centrifuge Tubes | Fisher Scientific | 12-565-270 | |
Nunc 15mL Conical Sterile Centrifuge Tubes | Fisher Scientific | 12-565-268 | |
Penicillin-Streptomycin | Thermo Fisher | 15-140-122 | Aliquot and freeze |
Plasmocin | Invivogen | ant-mpt | Anti-mycoplasma reagent. Aliquot and freeze |
pluriStrainer® 200 µm | Fisher Scientific | NC0776417 | Cell strainer |
pluriStrainer® 500 µm | Fisher Scientific | NC0822591 | Cell strainer |
Poly(vinyl alcohol) 87-90% hydrolyzed (PVA) | Millipore-Sigma | P8136-250G | 10% in DPBS stirring at 98 degrees C until disolves, make in 138-3211-FLS |
ROCK inhibitor Y-27632 (ROCKi) | STEMCELL Technologies | 72304 | 10 mM stock in DPBS |
Sterile Disposable Serological Pipets - 10mL | Fisher Scientific | 13-678-11E | |
Sterile Disposable Serological Pipets - 25mL | Fisher Scientific | 13-678-11 | |
Sterile Disposable Serological pipette - 5 mL | Fisher Scientific | 13-678-12D | |
TeSR-E5 | STEMCELL Technologies | 5916 | Serum-free, low protein base medium for E5-ILP |
Variomag distriBOX 2 Distributor | 2mag | VMF 90512 | If you use more than one MIXdrive |
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