Method Article
* These authors contributed equally
פרוטוקול זה מתאר בידוד של תאי גזע שריריים ואבות פיברו-אדיפוגניים משרירי שלד בודדים בעכברים. הפרוטוקול כולל דיסקציה של שריר יחיד, בידוד תאי גזע על ידי מיון תאים מופעל פלואורסצנטי, הערכת טוהר על ידי צביעה אימונופלואורסצנטית, ומדידה כמותית של כניסה לשלב S על ידי בדיקת שילוב 5-ethynyl-2'-deoxyuridine.
שרירי השלד מכילים אוכלוסיות שונות של תאי גזע בוגרים התורמים להומאוסטזיס ולתיקון הרקמה. לתאי גזע של שרירי השלד (MuSCs) יש את היכולת לייצר שריר חדש, בעוד שאבות פיברו-אדיפוגניים (FAPs) תורמים לרקמות תומכות סטרומה ויש להם את היכולת לייצר פיברובלסטים ואדיפוציטים. גם MuSCs וגם FAPs חיים במצב של יציאה הפיכה ממושכת של מחזור התא, הנקרא שקט. המצב השקט הוא המפתח לתפקודם. תאי גזע שקטים מטוהרים בדרך כלל מרקמות שריר מרובות המאוגדות יחד בדגימה אחת. עם זאת, מחקרים אחרונים גילו הבדלים ברורים בפרופילים המולקולריים ובעומק השקט של MuSCs שבודדו משרירים שונים. הפרוטוקול הנוכחי מתאר את הבידוד והמחקר של MuSCs ו- FAPs משרירי שלד בודדים ומציג אסטרטגיות לביצוע ניתוח מולקולרי של הפעלת תאי גזע. הוא מפרט כיצד לבודד ולעכל שרירים ממוצא התפתחותי שונה, עוביים ותפקודים, כגון הסרעפת, תלת ראשי, gracilis, tibialis anterior (TA), gastrocnemius (GA), soleus, extensor digitorum longus (EDL), ואת שרירי Masseter. MuSCs ו- FAPs מטוהרים על ידי מיון תאים המופעלים על ידי פלואורסצנטיות (FACS) ומנותחים על ידי צביעת immunofluorescence ובדיקת שילוב 5-ethynyl-2'-deoxyuridine (EdU).
שרירי השלד הם בעלי יכולת התחדשות גבוהה בשל נוכחות תאי גזע שריריים (MuSCs). MuSCs ממוקמים על myofibers, מתחת למינה הבסיסית, ומתגוררים במצב שקט של מחזור תאים ממושך והפיך יציאה 1,2,3,4. עם פציעה, MuSCs מופעלים ונכנסים למחזור התא כדי ליצור אבות מגבירים שיכולים להתמיין ולהתמזג ליצירתמיופייבר 2,5 חדשים. עבודות קודמות הראו כי MuSCs חיוניים לחלוטין להתחדשות שרירים 6,7,8. יתר על כן, MuSC יחיד יכול להשתיל וליצור גם תאי גזע חדשים וגם מיוסיבים חדשים9. שרירי השלד מכילים גם אוכלוסייה של תאי סטרומה מזנכימליים הנקראים אבות פיברו-אדיפוגניים (FAPs), אשר ממלאים תפקיד מכריע בתמיכה בתפקוד MuSC במהלך התחדשות שרירים 6,10,11,12.
בשל הפוטנציאל שלהם לתאם התחדשות שרירים, היה עניין עצום בהבנת האופן שבו MuSCs ו- FAPs עובדים. MuSCs שקטים מסומנים על ידי ביטוי של גורמי השעתוק Pax7 ו- Sprouty1, וקולטן הקלציטונין של חלבון פני השטח של התא, בעוד ש- FAPs שקטים מסומנים על ידי קולטן גורם גדילה הנגזר מטסיות הדם של פני התא אלפא (PDGFRa)10,12,13,14,15 . מחקרים קודמים הראו כי MuSCs ו- FAPs יכולים להיות מטוהרים משרירי השלד באמצעות סמנים של פני השטח של התא ומיון תאים המופעלים על ידי פלואורסצנטיות (FACS) 9,15,16,17,18,19,20,21. בעוד פרוטוקולים אלה קידמו מאוד את היכולת לחקור MuSCs ו- FAPs, חסרון אחד הוא שרוב הפרוטוקולים הללו דורשים בידוד של MuSCs ממאגר של רקמות שריר שונות. עבודות אחרונות שלנו ושל אחרים חשפו הבדלים בפנוטיפ התא וברמות ביטוי הגנים בין MuSCs שבודדו מרקמות שונות22,23. MuSCs מהסרעפת, התלת ראשי והגרציליס מראים הפעלה מהירה יותר מאשר MuSCs משרירי הגפיים האחוריות התחתונות22, בעוד MuSCs משריר חוץ-עיני מראים התמיינות מהירה יותר מאשר MuSCs מהסרעפת ומשרירי הגפיים האחוריות התחתונות23.
פרוטוקול זה מתאר את הבידוד של MuSCs ו-FAPs משרירי שלד בודדים (איור 1). זה כולל את הדיסקציה של הסרעפת, triceps, gracilis, tibialis anterior (TA), soleus, extensor digitorum longus (EDL), gastrocnemius (GA), ואת שרירי masseter. שרירים מנותחים מנותקים לאחר מכן על ידי עיכול אנזימטי באמצעות collagenase II (פרוטאז המכוון באופן ספציפי לרצף האמינו Pro-X-Gly-Pro בקולגן, המאפשר פירוק של דיסוציאציה של רקמת חיבור ורקמות24) ו dispase (פרוטאז המבקע פיברונקטין וקולגן IV, המאפשר דיסוציאציה נוספת של תאים25). MuSCs ו- FAPs מבודדים מתרחיפים של תא יחיד על ידי FACS. כדוגמאות לבדיקות במורד הזרם לניתוח תאים, הפעלת תאי גזע נקבעת על ידי שילוב 5-ethynyl-2'-deoxyuridine (EdU), בעוד טוהר התא נקבע על ידי צביעת immunofluorescence עבור סמנים ספציפיים מסוג התא Pax7 ו- PDGFRa.
הפרוטוקול הנוכחי בוצע בהתאם להנחיות הטיפול בבעלי חיים באוניברסיטת ארהוס ולתקנות האתיקה המקומיות.
הערה: יש להקפיד לעמוד בתקנות הוועדה האתית המקומית לניסויים בבעלי חיים ולטיפול בדגימות מכרסמים לאחר המוות. עכברים הם מקור פוטנציאלי לאלרגנים; אם זמין, הפעל את אוורור הפליטה והנח אותו מעל סביבת העבודה כדי למנוע חשיפה מוגזמת לאלרגנים. לחלופין, חבשו מסכת פנים אם הניסוי מתבצע באופן קבוע. פרוטוקול זה כרוך בעבודה עם חדים, ומומלץ לחוקרים להכיר את הנהלים והלוגיסטיקה להגשת עזרה ראשונה במקרה של חתך.
1. הכנה (1-2 שעות; יום לפני נתיחה)
הערה: התמיסות, הלוחות והמדיה מוכנים בתנאים סטריליים ומסוננים (0.45 מיקרומטר) לפני השימוש אלא אם כן נאמר אחרת. הכינו תמיסות מלאי של dispase (11 U/mL ב-PBS) ו-collagenase II (1,000 U/mL ב-PBS) ואחסנו אותן בטמפרטורה של -20°C (טבלה 1). המלאים מופשרים ומשמשים לעיכול משני בשלב 4.2.6.
2. הכנה (0.5 שעות, יום הנתיחה):
3. דיסקציה של שרירים (20-30 דקות)
הערה: חלק זה של הפרוטוקול מתבצע בסביבה לא סטרילית. ההליך יכול להתבצע באמצעות עכבר אחד או יותר. עם זאת, עכבר אחד מספיק כדי להכין הן דוגמאות למיון והן בקרות להגדרת פיצוי ושערי FACS.
4. עיכול שרירים לתרחיף חד תאי (~ 1 שעות 35 דקות)
הערה: השלבים הבאים כוללים סביבות עבודה לא סטריליות (שלבים 4.1-4.2) וסטריליות (שלב 4.3).
5. צביעה ומיון (~ 40 דקות + 30 דקות מיון / דגימה)
הערה: עבוד בסביבה סטרילית על קרח עבור השלבים הבאים.
6. בדיקת התאגדות EdU
הערה: עבוד בתנאים סטריליים והשתמש במכסה האדים הכימי בעת טיפול בפרפורמאלדהיד (PFA) עבור השלבים הבאים. EdU הוא נוקלאוטיד אנלוגי המשולב בדנ"א כאשר התאים עוברים את שלב S של מחזור התא. הוא מוטגני בריכוזים גבוהים. יש ללבוש תמיד כפפות בעת הטיפול ב-EdU. בדוק את ההנחיות המקומיות לטיפול בפסולת EdU.
7. צביעה immunofluorescence
הערה: ניתן לבצע חלק זה של הפרוטוקול בנפרד מסעיף 6. בעת דילוג על סעיף 6, בצע את שלבים 6.3.1 ו- 6.3.2 כדי לאפשר חלחול תאים לפני שתמשיך לשלב 7.2 להלן.
בעקבות הפרוטוקול לבידוד שרירי שלד בודדים (איור 2), שרירי gracilis, TA, EDL, GA, soleus, triceps, Masseter ו-Diaphragm בודדו משלושה עכברים זכרים שוויצרים שהופסקו מתוכנית רבייה מקומית (איור 2). בעקבות דיסוציאציה של רקמות והכתמת נוגדנים, MuSCs ו-FAPs מהשרירים הבודדים טוהרו על-ידי FACS (איור 3). החיתוך הראשוני התקבל עם דגימה לא מוכתמת כדי לזהות את התאים ולהפריד את הסינגלטים מכפילים (איור 3A). השערים הבאים נקבעו באמצעות פקדי FMO לזיהוי ספי צביעה (איור 3B). הדגימה המוכתמת הייתה מגודרת עבור CD31/CD45-FITC ו-Sca1-PacBlue. אוכלוסיית SCA1+/CD31-/CD45- (FAPs) מויינה לשפופרת איסוף נפרדת, בעוד שאוכלוסיית הנגטיב הכפול הייתה מגודרת ושורטטה עבור VCAM1-PECy7 ופיזור קדימה (FSC). אוכלוסיית VCAM1+ (MuSCs) מויינה לשפופרת איסוף נפרדת. MuSCs ו-FAPs כומתו כאחוז הסינגלטים (טבלה 3) ומוינו לצינורות איסוף נפרדים המכילים 500 μL של מדיום השטיפה. למתלים החד-תאיים של שרירי הסרעפת והתלת ראשי יש שפע יחסי גבוה יותר של MuSCs מאשר ל-FAPs, בעוד שלמתלים החד-תאיים האחרים יש שפע יחסי גבוה יותר של FAPs מאשר ל-MuSCs (טבלה 3).
מתוך התאים שמוינו, 1,000-3,000 תאים נזרעו והודגרו במשך 24 שעות. לאחר 24 שעות של דגירה, המדיום הוסר והוחלף בתווך טרי המכיל EdU. התאים תוקנו ב-48 שעות, הוכתמו עבור EdU, ולאחר מכן עם נוגדנים נגד חלבון Pax7 או חלבון PDGFRa, וצולמו באמצעות מיקרוסקופ אפיפלואורסצנטי הפוך. התמונות כומתו באמצעות תוסף פיג'י ב-ImageJ. נצפתה צביעת EdU חזקה, אף על פי שחלק התאים החיוביים ל-EdU היה שונה עבור שני סוגי תאי הגזע והשרירים השונים (איור 4A-C). MuSCs שבודדו מה-EDL או מה-GA הראו שילוב EdU נמוך משמעותית בהשוואה ל-MuSCs שבודדו מה-TA, הסרעפת, הגרציליס או התלת ראשי, בעוד ש-MuSCs שבודדו מה-Masseter וה-Soleus נופלים ביניהם ואינם שונים באופן משמעותי מאף אחת מהקבוצות (איור 4A,B). זה עולה בקנה אחד עם התוצאות הקודמות שלנו22. יתר על כן, הרקמות שמהן ה- MuSCs מראים רמות שילוב EdU גבוהות הן אותן רקמות שמהן הודגם בעבר כי MuSCs מבטאים רמות גבוהות של חלבון Pax322. FAPs שבודדו מה-EDL הראו שילוב EdU נמוך משמעותית בהשוואה ל-FAPs שבודדו מה-GA וה-soleus, בעוד ש-FAPs שבודדו מה-TA הראו שילוב EdU נמוך משמעותית בהשוואה ל-FAPs שבודדו מה-soleus (איור 4A,C). זה מדגיש את החשיבות של ניתוח תאי גזע מרקמות בודדות במקום איגום שרירים מרקמות שונות לבידוד. עבור כל הרקמות, החלק הממוצע של MuSCs חיוביים ל- EdU היה גבוה יותר בהשוואה לחלק הממוצע של FAPs חיוביים ל- EdU, דבר המצביע על כך ש- MuSCs מופעלים מהר יותר בתנאים הנתונים.
לבסוף, טוהר התאים אושר באמצעות צביעה אימונופלואורסצנטית (איור 4D). בממוצע, 97.71% (± 1.38%) מה-MuSCs הוכתמו כחיוביים לחלבון Pax7, ו-88.16% (±6.35%) מה-FAPs הוכתמו כחיוביים לחלבון PDGFRa, מה שמאשר את הספציפיות של הליך בידוד תאי הגזע שלנו (איור 4D).
איור 1: תקציר סכמטי של הפרוטוקול. סכמטי המציג את שני המקטעים העיקריים של הפרוטוקול, בידוד MuSC (לוח עליון), בדיקת שקט (לוח תחתון), ואת שלבי המפתח של המתודולוגיה המשמשת בכל אחד מהם. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
איור 2: מיקום שרירים ובידוד. (A) סכימה שמראה את המיקום של כל שריר. (ב-ס) הדגמה של בידוד שרירים עבור (B-D) gracilis, (E-G) TA/EDL, (H-J) triceps, (K-M) GA/soleus, (N-P) masseter, ו (Q-S) שרירי הסרעפת. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
איור 3: אסטרטגיית Gating המשמשת לזיהוי ומיון MuSCs ו-FAPs בדגימת שריר הסרעפת. תאים מזוהים בהתבסס על גודל התא (פיזור קדימה (FSC)) וגרעיניות (פיזור צד (SSC)). סינגלים נבחרים על בסיס FSC-A ו- FSC-W. תאי שושלת מגודרים לזיהוי עוקב של MuSCs (Lineage-/VCAM1+), ותאי FAP (Lineage-/SCA1+) מגודרים לזיהוי FAPs. אותה אסטרטגיית gating יושמה על (A) פקד לא מוכתם, (B) פקדי FMO (FMO-SCA1PacBlue, FMO-CD31/45-FITC ו-FMO-VCAM1-PECy7), ו-(C) דגימה מוכתמת. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
איור 4: כימות הפעלת תאים על-ידי צביעת EdU. (A) תמונות מייצגות של צביעת EdU של MuSCs (לוחות עליונים) ו-FAPs (לוחות תחתונים) מדגימת דיאפרגמה. מוצגות תמונות ממוזגות של EdU ו- Hoechst (חלוניות שמאליות), והערוצים הבודדים בירוק (EdU, לוחות אמצעיים) וכחול (Hoechst, לוחות ימניים). (ב,ג) גרף עמודות המציג את אחוז ה- MuSCs (B) חיובי ל- EdU (B) או (C) FAPs עבור השרירים שצוינו. Plotted הוא הממוצע ± SEM. כל נקודה מייצגת עכבר. ניתוח סטטיסטי בוצע ב-GraphPad באמצעות מבחני t דו-זנביים של סטודנטים, כאשר מובהקותם נקבעה ל-*p <-0.05 ו-**p <-0.01. (D) צביעה אימונופלואורסצנטית של MuSCs (פאנלים עליונים) ו-FAPs (פאנלים תחתונים) עם נוגדנים כנגד סמן MuSC Pax7 (צד שמאל) וסמן FAP PDGFRa (צד ימין). מוצגות תמונות ממוזגות של Pax7 עם Hoechst, ואחריו הערוצים הבודדים, ותמונות ממוזגות של PDGFRa עם Hoechst, ואחריו הערוצים הבודדים. N = 3. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
פתרונות | ריאגנטים | כמות |
כביסה בינונית | F-10 תערובת חומרים מזינים (בשר חזיר) (1x), +L-גלוטמין | 445 מ"ל |
נסיוב סוסים | 50 מ"ל | |
עט/סטרפטוקוקוס | 5 מ"ל | |
חיץ דיסוציאציה (עיכול ראשון) | קולגנאז סוג II | 650 U/מ"ל |
כביסה בינונית | 100 מ"ל | |
ציר דיספז (עיכול שני) | Dispase ב PBS | 11 U/מ"ל |
ציר Collagenase (עיכול שני) | Collagenase סוג II ב PBS | 1000 U/מ"ל |
PBS 1x | PBS 10x תרכיז אבקה | 9.89 גרם/ליטר |
מים אוטוקלאביים/סטריליים | 1 ליטר | |
מים חומציים | חומצה אצטית קרחונית (100%) נטולת מים לניתוח | 5.15 מ"ל |
מים אוטוקלאביים/סטריליים | 895 מ"ל | |
תמיסת קולגן (0.002%) | קולגן מעור עגל | 20 מ"ל |
מים חומציים | 800 מ"ל | |
טריטון X-100 | טריטון X-100 | 0.5% (V/V) |
PBS 1x | 99.5% | |
מאגר חוסם | PBS 1x | 18 מ"ל |
נסיוב חמורים | 2 מ"ל |
טבלה 1: טבלת מתכונים.
מס' מדגם. | שם |
1 | לא מוכתם |
2 | פלואורסצנטיות מינוס VCAM1-PeCy7 |
3 | פלואורסצנטיות מינוס SCA1-PacificBlue |
4 | פלואורסצנטיות פחות CD31/45-FITC |
5 | כתם ניסיוני (כל ארבעת הנוגדנים) |
טבלה 2: סקירה כללית של צביעה, בקרות ודגימות שהוכנו לכל רקמה לפני המיון.
טישו | תערובת נוגדנים | תאים | סינגלטים | לין נג | FAPs | MuSCs |
דיאפרגמה | לא מוכתם | 100% | 82% | 55% | 0.5% | 0.0% |
FMO Sca1-PacBlue | 100% | 83% | 19% | 0.3% | 4.3% | |
FMO CD31/45-488 | 100% | 84% | 40% | 9.4% | 5.6% | |
FMO Vcam1-PeCy7 | 100% | 78% | 20% | 5.6% | 0.0% | |
מוכתם | 100% | 77% | 19% | 2.4% | 3.8% | |
גראציליס | מוכתם | 100% | 96% | 11% | 2.6% | 1.4% |
תודה | מוכתם | 100% | 88% | 16% | 2.8% | 2.2% |
EDL | מוכתם | 100% | 86% | 26% | 19.2% | 0.8% |
סולאוס | מוכתם | 100% | 91% | 41% | 13.3% | 1.1% |
GA | מוכתם | 100% | 94% | 51% | 6.1% | 1.5% |
תלת ראשי | מוכתם | 100% | 92% | 30% | 2.6% | 4.5% |
מסאטר | מוכתם | 100% | 85% | 27% | 19.3% | 2.6% |
טבלה 3: סקירה כללית של השפע היחסי של סוגי תאים בנתוני FACS.
מספר שלבים הם המפתח בביצוע פרוטוקול זה כדי להשיג תשואות טובות. לשרירים הבודדים יש נפח קטן בהשוואה לכמות השריר המשמשת בפרוטוקולי בידוד בתפזורת. התוצאה היא סיכון שהשריר יתייבש במהלך הדיסקציה, מה שמקטין את התפוקה. כדי למנוע זאת, חשוב להוסיף מדיום לשרירים מיד לאחר הדיסקציה. בנוסף, אם הדיסקציה נמשכת זמן רב יותר, ניתן להסיר את העור מגפה אחת בכל פעם כדי להפחית את זמן החשיפה של השרירים לאוויר. הנפח הקטן יותר גורם גם לסיכון מוגבר לעיכול יתר. כדי להתמודד עם זה, השיטה הנוכחית דורשת כמויות נמוכות יותר של אנזים collagenase II וזמני עיכול מופחתים בהשוואה לפרוטוקולי שרירים בתפזורת 9,16. עיכול אנזימטי תלוי גם בטוהר האנזימים, וטוהר נמוך יותר יכול להשפיע לרעה על התפוקה. בנוסף, עיכול מכני הוא קריטי. במקרה של חיתוך לא מספיק, שטח הפנים המופחת יפגע בעיכול אנזימטי ויוריד את תפוקת תאי הגזע. במקרה של חיתוך רב מדי, שטח הפנים המוגדל יגרום לעיכול יתר ויוריד את תפוקת תאי הגזע. אמבט המים המרעיד מונע משקעים של השריר המעוכל, משפר את פיזור האנזים ומסייע ביצירת טמפרטורה הומוגנית, המאפשרת לחלוטין זמני דגירה קצרים יותר. לכן, השיטה הנוכחית מאפשרת קיצור משמעותי של זמן הדגירה בהשוואה לשיטות אחרות.
פרוטוקול זה תלוי בדיסוציאציה וטיהור תאים. הליכים אלה מחקים פגיעה ברקמות, המפעילה את תאי הגזע. באופן עקבי, מחקרים אחרונים גילו כי MuSCs משנים את תוכניות ביטוי הגנים שלהם במהלך הליך הבידוד27,28,29,30. כתוצאה מכך, תאי הגזע המטוהרים שונים מתאי in vivo מבחינת דפוסי ביטוי גנים. גורם מגביל שני בפרוטוקול הוא התלות שלו ב- FACS, הדורשת גישה לציוד יקר. FACS הוא תקן הזהב לבידוד אוכלוסיות תאים מרובות בו זמנית עם טוהר גבוה20. ההתקדמות האחרונה באמצעות חרוזים מגנטיים ומיקרו-בועות מציעה הפחתה של31,32 בעלות, אך יש לקבוע אם הם מציעים תשואות דומות לעבודה על שרירים בודדים. לבסוף, התשואה של הפרוטוקול מוגבלת בשל גודלם הקטן של השרירים, ובכך מציבה מגבלות על בדיקות פוטנציאליות במורד הזרם.
מחקרים קודמים הסתמכו על איגום שרירים שונים בעת בידוד MuSCs ו / או FAPs כדי למקסם את תפוקת התאים. עם זאת, זה ממוצע של כל הבדלים ספציפיים לרקמות בהתנהגות תאי גזע ובתפקוד בין שרירים שונים. הפרוטוקול הנוכחי מאפשר בידוד של MuSCs ו- FAPs משרירים בודדים לצורך ניתוח במורד הזרם של תפקוד תאי גזע. כדוגמה לניסוי במורד הזרם, הפעלת תאי גזע נבדקה על ידי שילוב EdU, וגילתה כי תאי גזע מרקמות שונות מציגים קינטיקה של הפעלה שונה. בעבודות קודמות הוכחה ההיתכנות של שימוש במבדקים אחרים במורד הזרם; בדיקות אלה דורשות מספרי תאים קטנים יותר, כגון ריצוף RNA חד-תאי SmartSeq2, השתלת תאים, PCR מיקרופלואידי ומבחני הרחבת שבטים 22,33,34,35.
לסיכום, פרוטוקול זה מתאר שיטה לדיסקציה של שרירים בודדים כדי לבודד ולחקור MuSCs ו- FAPs. אסטרטגיה זו תאפשר לניסויים להשיג הבנה טובה יותר של תפקוד תאי גזע על פני שרירים שונים בבריאות ובחולי.
למחברים אין אינטרסים כלכליים מתחרים ואין ניגודי עניינים.
מיון התאים בוצע במתקן הליבה FACS, אוניברסיטת ארהוס, דנמרק. הדמויות נוצרו באמצעות Biorender.com. אנו מודים לד"ר ג'יי פארופ על שיתוף נוגדן הארנב נגד PDGFRa. עבודה זו נתמכה על ידי מענק התחלתי של AUFF ל- E.P. ו- Start Package מ- NovoNordiskFonden ל- E.P. (0071113) ול- A.D.M. (0071116).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1.5 mL tube( PCR performance tested, PP, 30,000 xg, DNA/DNase-/RNase-free, Low DNA binding, Sterile ) | Sarstedt AG & Co. KG, Hounisen Laboratorieudstyr A/S | 72.706.700 | 1.5 mL tube |
15 mL tube (PP/HD-PE, 20,000 xg, IVD/CE, IATA, DNA/DNase-/RNase-free, Non-cytotoxic, pyrogen free, Sterile) | Sarstedt AG & Co. KG, Hounisen Laboratorieudstyr A/S | 62.554.502 | 15 mL tube |
5 mL polystyrene round-bottom tube | Falcon, Fisher Scientific | 352054 | FACS tube without strainer cap |
5 mL polystyrene Round-bottom tube with cell-strainer cap | Falcon, Fisher Scientific | 352235 | FACS tube with strainer cap |
5 mL tube (PP, non sterile autoclavable) | VWR collection | 525.0946 | 5 mL tube |
50 mL tube( PP/HD-PE, 20,000 xg, IVD/CE, ADR, DNA/DNase-/RNase-free, non-cytotoxic, pyrogen free, Sterile) | Sarstedt AG & Co. KG, Hounisen Laboratorieudstyr A/S | 62.547.254 | 50 mL tube |
Alexa Fluor 555 Donkey anti-rabbit IgG (H+L) | Invitrogen, Thermo Fisher | Lot: 2387458 (Cat # A31572) | |
Alexa Fluor 647 donkey-anti mouse IgG (H+L) | Invitrogen, Thermo Fisher | Lot: 2420713 (Cat#A31571) | |
ARIA 3 | BD | FACS, Core facility Aarhus University | |
Centrifuge 5810 | eppendorf | EP022628188 | Centrifuge |
Click-iT EdU Cell Proliferation Kit for Imaging, Alexa Fluor 488 dye | Invitrogen, Thermo Fisher | Lot: 2387287 (Cat# C10337) | Cell Proliferation Kit |
Collagen from calf-skin | Bioreagent, Sigma Aldrich | Source: SLCK6209 (Cat# C8919) | |
Collagenase type II | Worthington, Fisher Scientific | Lot: 40H20248 (cat# L5004177 ) | Collagenase |
Dispase | Gibco, Fisher Scientific | Lot: 2309415 (cat# 17105-041 ) | Dispase |
Donkey serum (non-sterile) | Sigma Aldrich, Merck | Lot: 2826455 (Cat# S30-100mL) | |
Dumont nr. 5, 110 mm | Dumont, Hounisen Laboratorieudstyr A/S | 1606.327 | Straight forceps with fine tips |
Dumont nr. 7, 115 mm | Dumont, Hounisen Laboratorieudstyr A/S | 1606.335 | Curved forceps |
F-10 Nutrient mixture (Ham) (1x), +L-glutamine | Gibco, Fisher Scientific | Lot. 2453614 (cat# 31550-023) | |
FITC anti-mouse CD31 | BioLegend, NordicBioSite | MEC13.3 (Cat # 102506) | |
FITC Anti-mouse CD45 | BioLegend, NordicBioSite | 30-F11 (Cat# 103108) | |
Glacial acetic acid (100%) | EMSURE, Merck | K44104563 9Cat # 1000631000) | |
Head over head mini-tube rotator | Fisher Scientific | 15534080 (Model no. 88861052) | Head over head mini-tube rotator |
Horse serum | Gibco, Fisher Scientific | Lot. 2482639 (cat# 10368902 ) | |
Isotemp SWB 15 | FisherBrand, Fisher Scientific | 15325887 | Shaking water bath |
MS2 mini-shaker | IKA | Vortex unit | |
Needle 20 G (0.9 mm x 25 mm) | BD microlance, Fisher Scientific | 304827 | 20G needle |
Neutral formalin buffer 10% | CellPath, Hounisen Laboratorieudstyr A/S | Lot: 03822014 (Cat # HOU/1000.1002) | |
Non-pyrogenic cell strainer (40 µM) | Sarstedt AG & Co. KG, Hounisen Laboratorieudstyr A/S | 83.3945.040 | Cell strainer |
Pacific Blue anti-mouse Ly-6A/E (Sca-1) | BioLegend, NordicBioSite | D7 (Cat# 108120) | |
Pax7 primary antibody | DSHB | Lot: 2/3/22-282ug/mL (Cat# AB 528428) | |
PBS 10x powder concentrate | Fisher BioReagents, Fisher Scientific | BP665-1 | |
PE/Cy7 anti-mouse CD106 (VCAM1) | BioLegend, NordicBioSite | 429 (MVCAM.A) (Cat # 105720) | |
Pen/strep | Gibco, Fisher Scientific | Lot. 163589 (cat# 11548876 ) | |
Pipette tips p10 | Art tips, self sealing barrier, Thermo Scientific | 2140-05 | Low retention, pre-sterilized, filter tips |
Pipette tips p1000 | Art tips, self sealing barrier, Thermo Scientific | 2279-05 | Low retention, pre-sterilized, filter tips |
Pipette tips p20 | Art tips, self sealing barrier, Thermo Scientific | 2149P-05 | Low retention, pre-sterilized, filter tips |
Pipette tips p200 | Art tips, self sealing barrier, Thermo Scientific | 2069-05 | Low retention, pre-sterilized, filter tips |
Protective underpad | Abena | ACTC-7712 | 60 x 40cm, 8 layers |
Rainin, pipet-lite XLS | Mettler Toledo, Thermo Scientific | 2140-05, 2149P-05, 2279-05, 2069-05 | Pipettes (P10, P20, P200, P1000) |
Recombinant anti-PDGFR-alpha | RabMAb, abcam | AB134123 | |
Scalpel (shaft no. 3) | Hounisen, Hounisen Laboratorieudstyr A/S | 1902.502 | Scalpel |
Scalpel blade no. 11 | Heinz Herenz, Hounisen Laboratorieudstyr A/S | 1902.0911 | Scalpel |
Scanlaf mars | Labogene | class 2 cabinet: Mars | Flow bench |
ScanR | Olympus | Microscope, Core facility Aarhus University | |
Scissors | FST | 14568-09 | |
Series 8000 DH | Thermo Scientific | 3540-MAR | Incubator |
Serological pipette 10 mL | VWR | 612-3700 | Sterile, non-pyrogenic |
Serological pipette 5 mL | VWR, Avantor delivered by VWR | 612-3702 | Sterile, non-pyrogenic |
Syringe 5 mL, Luer tip (6%), sterile | BD Emerald, Fisher Scientific | 307731 | Syringe |
TC Dish 100, standard | Sarstedt AG & Co. KG, Hounisen Laboratorieudstyr A/S | 83.3902 | Petri dish |
Tissue Culture (TC)-treated surface, black polystyrene, flat bottom, sterile, lid, pack of 20 | Corning, Sigma Aldrich | 3764 | 96-well Half bottom plate |
Triton X-100 | Sigma Aldrich, Merck | Source: SLCJ6163 (Cat # T8787) |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved