Method Article
该方案提供了从细胞系和瞬时免疫抑制斑马鱼胚胎中的新鲜患者材料生成和排除人急性淋巴细胞白血病 (ALL) 异种移植物的分步说明,以及使用流式细胞术评估药物反应的指南。实验管道也可以适用于实体瘤。
斑马鱼异种移植是研究人类癌症发病机制和预测个体药物反应的关键技术。本文件介绍了一种简化的方案 (ZefiX),用于扩增原代 B 细胞前体急性淋巴细胞白血病 (BCP-ALL) 患者样本或瞬时免疫抑制斑马鱼胚胎中的永生化细胞系,利用流式细胞术对治疗反应进行高分辨率单细胞分析。与实体瘤植入相比,白血病细胞在测定过程中从基于吗啉反义寡核苷酸的巨噬细胞和中性粒细胞分化因子抑制中获益。解离的移植细胞的流式细胞术分析能够精确评估每个细胞处理后的细胞计数、增殖率和活力。这种方法已使用维奈托克和达沙替尼等靶向疗法进行了验证,治疗结果与相关患者样本和传统 2D 培养对照的临床记录进行了比较。值得注意的是,该方案在 7 天内完成,与临床决策时间表保持一致。该方法适用于测试各种癌症类型(包括实体瘤)中的选定药物,从而支持个性化的治疗策略。然而,应考虑可以评估的药物数量的限制,这可能是由于斑马鱼胚胎中的药代动力学限制。
斑马鱼异种移植已成为了解癌症发病机制和预测药物反应的重要体内模型 1,2,3,4,5。动物模型对于临床前药物测试仍然至关重要,斑马鱼模型与其他体内系统相比具有显著优势,包括高通量和成本效益 6,7,8。 该模型还可以帮助个性化治疗反应预测,包括分子靶向治疗和 CAR-T 细胞疗法 9,10,11,12。
BCP-ALL 特别受益于斑马鱼异种移植,因为在培养物中扩增原代患者细胞仍然具有挑战性13。不可否认,ALL 需要新的治疗方法。尽管 BCP-ALL 患儿的缓解率高达 80%-85%,但复发或难治性疾病患者的长期生存率仅在约 30%-60 %14,15,16 之间。在这种情况下,使用拟议管道的药物测试可以整合到临床环境中,以确定最佳的患者特异性疗法14,15。在处理多种耐药性时,这种个性化方法至关重要,通过避免使用具有严重副作用的无效或次优药物,显着减轻患者的治疗负担。
几个特点使斑马鱼胚胎异种移植成为合适的模型。人类和斑马鱼之间的遗传相似性——70% 的遗传同源性和 84% 共享的疾病相关基因——支持基因-药物相互作用研究17。因此,使用转基因宿主胚胎可以揭示影响药物敏感性的遗传易感性18。或者,可以移植具有特定基因修饰的细胞,以评估药物敏感性或耐药性是否与 体外 结果一致。斑马鱼胚胎异种移植物还有助于了解药物的潜在全身效应。尽管 2-3 天大胚胎的器官发育尚未完全成熟,但器官已正确定位,并部分与成年胚胎共享细胞组成19。
该模型的其他优点包括植入只需要少量癌细胞,维持宿主胚胎很简单,因为在出生后的前 5 天内不需要喂养,并且由于胚胎的透明度和大小,可以快速评估注射成功。一个独特的特点是,在这个发育阶段只有先天免疫是活跃的,促进了有效的植入20。在此处描述的 ZefiX 方案中(参见图 1 中的摘要),通过使用靶向 spi1 和 csf3r 的稳定吗啉反义寡核苷酸在出生后的前 4 天内抑制先天免疫系统来进一步增强免疫缺陷,从而阻断巨噬细胞和中性粒细胞分化 21,22,23。
该方案也不同于以前的斑马鱼异种移植方案,后者主要是为实体瘤移植物开发的,通常使用基于整体成像的药物反应评估方法。ZefiX 针对液体癌细胞(如 BCP-ALL 细胞)进行了优化,并已成功用于扩增新鲜或新鲜冷冻的患者材料21。ZefiX 还可以通过选择合适的酶进行组织解离来适应贴壁癌细胞。
另一个主要优势是使用流式细胞术进行下游分析,它具有以下几个好处:(i) 可以快速处理大量移植细胞,从而可以在单细胞水平上进行稳健的统计分析,(ii) 可以同时评估单个细胞的增殖速率和活力,以及 (iii) 流式细胞仪在临床研究环境中通常可用, 能够在几个小时内在单个细胞水平上对移植细胞进行药物反应评估。为确保可重复性,该方案提供了从制备到移植再到流式细胞术分析的标准化管道,允许在一周内预测 ALL 细胞的药物反应。
所有斑马鱼实验均符合柏林夏里特医学院实验医学研究所的指导方针和官方权威。所有研究都涉及受精后 6 天 (dpf) <斑马鱼胚胎,因此不受《动物保护法》的约束。斑马鱼 (Danio rerio) 根据标准方案在德国柏林柏林夏里特大学医学院的动物设施中饲养和饲养。将它们置于 28 °C 下,光照循环 14 小时,暗循环 10 小时。所有实验均使用 AB 或 TüLF 菌株的野生型鱼。
注:在应用 ZefiX 之前,为每种所需药物建立最佳治疗条件包括几个必要的步骤。首先,在常规 2D 培养系统中使用合适的细胞系确定每种药物的半数最大抑制浓度 (IC50)。根据以往的经验,ZefiX 治疗的有效药物浓度可能比在典型细胞培养条件下使用的药物浓度高 5 - 50 倍21,24。在处理移植胚胎之前,必须使用既定的浓度范围评估未移植宿主胚胎内的毒性。评估毒性后,将细胞系移植的胚胎暴露于各种药物浓度中,约为先前在 2D 培养中测定的 IC50 值的 50 倍。如果移植细胞对高达 100 倍 IC50 的剂量没有反应,则可能认为该药物对 ZefiX 无效。为了潜在地提高疗效,一种选择是在移植细胞移植到胚胎之前不久用药物预处理移植细胞25。有关此处使用的所有解决方案,请参见表 1。
1. 第 1 天:实验准备
2. 第 2 天:吗啉
3. 第 3 天:去绒毛
4. 第 4 天:异种移植和药物治疗
5. 移植
6. 第 7 天
有关 ZefiX 方案的详细科学评估,包括新鲜冷冻原代 BCP-ALL 细胞样品的异种移植和药物治疗,请参阅先前发表的手稿21。作为附加研究的一部分,当地医学研究伦理委员会批准了 ALL-REZ BFM 2002 试验 (NCT00114348) 和 ALL-REZ BFM 登记和生物样本库 (EA2/055/12) 以及国家当局的 IntReALL SR 2010 国际试验 (NCT01802814) 的附加研究。通过患者和/或其监护人参加的相应试验或登记处获得知情同意。
图 2 说明了注射前琼脂糖培养皿中胚胎对齐的示例,这有助于简化注射过程。注射应以所描绘的角度进行,以精确针对发育中的心脏周围的腔。此外, 图 2C 提供了成功注射 2 个含有人类移植细胞(蓝色)的 dpf 胚胎的参考,这些胚胎在注射前用 CTV 标记。注射结果与 图 2C 所示不同的胚胎被排除在外,特别注重避免卵黄囊穿孔,以确保在随后的三天孵育期间移植细胞活力。
在三天的孵育期之后,将宿主胚胎在 10 个的池中处理以进行流式细胞术分析。酶解离后,用抗人 CD19 抗体和两种活力标志物对细胞悬液进行染色:用于早期凋亡细胞的 Annexin V 和用于晚期凋亡和坏死细胞的 7AAD。
图 3 显示了 BCP-ALL 患者的 ZefiX 扩增 BCP-ALL 细胞的流式细胞术数据。图 A、A'、A'' 和 A''' 显示了移植当天在 0 dpi 下收集的数据。 图 3A 显示了总共 10,000 个细胞的 CTV 和 CD19 荧光值,作为在 3 dpi 下应用于宿主移植细胞悬液的门控策略的参考(图 3C)。在 图 3A' 中,通过使用前向散射区 (FSC-A) 和侧向散射区 (SSC-A) 对细胞进行定期门控来排除碎片。在 图 3A'' 中,使用 SSC 高度 (SSC-H) 与 SSC-A 的图表将单个细胞与双合体分离。该单细胞群用于 图 3A''' 中的活力评估,其中活细胞 (Q4) 与早期凋亡细胞(Q3,较高的膜联蛋白 V 值)和晚期凋亡或坏死细胞(Q2,较高的 7AAD 水平)区分开来。
为了进行比较,在常规 2D 条件下培养的患者细胞也在三天后通过流式细胞术进行分析(图 3B,B',B'',B''),遵循相同的门控策略。根据 图 2B' 中的 Q2 和 图 2B 中的 Q4 计算 2D 培养 72 小时后患者细胞的活力:(95.0%/100)*61.9% = 58.8%。
在 图 3C 中,起始材料是来自含有移植细胞的宿主胚胎的细胞悬液。与体外测量不同,试管中的所有细胞都通过流式细胞术进行分析。对 CD19 和 CTV 阳性移植细胞进行门控,以将它们与 CD19 和 CTV 阴性的鱼细胞分开。在 图 3C' 中进一步分析完整的移植细胞群,其中排除了碎片。然后使用与 图 3B 相同的门控策略评估单个移植细胞的活力。
结果表明,在胚胎中扩增的活单细胞的百分比为 95.2%,比培养皿中培养的细胞活力高 1.6 倍(图 3B''')。通过分析每个群体中 CTV 荧光强度从 0 dpi 到 3 dpi 的降低,计算体内和体外细胞分裂率(图 3D)。使用第 6.4.1 节中的公式和每条 CTV 曲线的几何平均值确定细胞分裂的数量(图 3D)。计算的分裂速率(体内 2.59 次分裂和体外 2.77 次分裂)表明,在两种条件下,活细胞在三天内以相似的分裂速率分裂。
最后,通过将完整移植细胞的数量(不包括碎片, 图 3C')除以管中汇集的胚胎数量来确定三天后每个胚胎的完整移植细胞的平均数量21.
总之,与培养皿中的常规培养物相比,植入斑马鱼胚胎中的新鲜 BCP-ALL 样品在三天后表现出更高的活力,并且活细胞在两种条件下以相当的速率分裂。
图 1.ALL-ZefiX 管道的工作流程。 创建于 https://BioRender.com。请单击此处查看此图的较大版本。
图 2:注射安排。 (A) 如图所示排列胚胎有助于注射。可以使用镊子或 20 μL 微量进样器移液器吸头(将吸头切割成 2.5 - 3 cm 长)来排列胚胎。(B) 将细胞移植到 2 个 dpf 胚胎心包的推荐注射角度的示意图。(C) 正确估计移植癌细胞数量的视觉辅助工具。这张图片显示了注射后 3 小时的 48 hpf 胚胎,之前用 CellTrace Violet 标记的人类癌细胞。创建于 https://BioRender.com。请单击此处查看此图的较大版本。
图 3:斑马鱼胚胎植入 2D 培养后,患者来源的分离 BCP-ALL 原始细胞新鲜冷冻样本的门控策略和流式细胞术分析。 (一、二)培养前用 CellTrace Violet (CTV) 标记患者细胞。在流式细胞术分析之前,将细胞在 37 °C 的组织培养塑料上培养 0 小时 (A) 或 72 小时 (B)。(C) 用 CTV 标记并在 35 °C 下作为移植物在宿主斑马鱼胚胎中生长 72 小时的患者细胞。在单细胞解离之前,将一组 10 个胚胎合并用于流式细胞术分析。应用 (B) 中的设门策略,鉴定和定量活的移植细胞组分。为此,将 CTV 阳性移植细胞 (Q2) 与自发荧光斑马鱼细胞 (Q1/4) 分离,以分选出移植细胞群进行分析。分析该移植细胞群中的 CTV 标记强度。(D) 仅来自活细胞选择的细胞计数和 CTV 标记的平均强度。注意 3 天后 CTV 强度的变化 (3 dpi)。 请单击此处查看此图的较大版本。
表 1:使用的解决方案表。请点击此处下载此表格。
表 2:通过流式细胞术测量的样品。请点击此处下载此表格。
斑马鱼胚胎由于其高通量和成本效益,已成为药物筛选和癌症研究中越来越受欢迎的异种移植模型。这些异种移植物有望成为转化医学的关键支柱,有助于临床前研究和决策 9,21。然而,与实体瘤移植物的广泛工作相比,用于人类白血病细胞扩增和治疗的斑马鱼异种移植模型仍然代表性不足。该方案为在白血病研究中利用斑马鱼异种移植物提供了详细的指导,同时保持对实体瘤的适应性。
实现一致的癌细胞移植可能具有挑战性,这凸显了标准化分析和更高统计可靠性的需求。该方案通过提供用于制备、移植和下游流式细胞术分析的综合管道以及故障排除建议来解决这些问题。
用于瞬时免疫抑制的吗啉代注射液
斑马鱼胚胎在发育的最初几天依赖于其先天免疫系统,这定义了这个实验管道的时间框架20。原始巨噬细胞出现在 12 hpf 左右,其中一些通过 33 hpf 20,31,32 分化为中性粒细胞。T 细胞在受精后约 8 天进入循环20,33。巨噬细胞和中性粒细胞作为先天免疫反应的一部分,与在先前的研究中观察到的移植后 3 天的 BCP-ALL 细胞存活率降低有关21。
吗啉代介导的颞免疫抑制,靶向 spi1 和 csf3r,有效抑制巨噬细胞和中性粒细胞分化,从而改善 BCP-ALL 细胞的植入,而不影响胚胎活力21。虽然这种方法不能实现永久耗竭,因为 spi1 和 csf3r 的完全敲除是致命的,但它仍然是该管道的最佳方法。
使用刻度校准注射体积,并在单细胞阶段精确输送到卵黄囊中,确保 Morpholino 注射的一致性和高存活率。用于巨噬细胞耗竭的脂质体氯膦酸盐注射 (Clodrosome) 等替代品已显示出前景,但需要进一步验证该管道34,35。
细胞制备
在该方案中,足够密集和有活力的细胞群对于成功扩增 BCP-ALL 至关重要。CellTrace Violet (CTV) 用于荧光标记,以评估 0 dpi 下的植入成功率,并在整个实验过程中跟踪增殖速率。与其他标记不同,CTV 不会改变细胞行为,因此可以进行精确的单细胞水平增殖分析。与 Ki-67 抗体染色相比,这具有优势,Ki-67 抗体染色仅捕获增殖过程中的细胞,而不捕获已经退出细胞周期的分裂细胞。
CTV 在反映细胞活力方面也优于 CellTracker CM-DiI (DiI)。DiI 及其衍生物是更稳定的荧光团,通常在细胞死亡后仍然存在,这可能会混淆实验结果2。此外,在流式细胞术中加入针对 CD19 的 BCP-ALL 特异性抗体能够精确识别移植细胞。人类特异性抗体(如抗 HLA)可以作为其他癌细胞类型的替代品36。
癌细胞移植
一致的植入需要细胞悬液的最佳稀释和浓度。悬浮液应保持足够的密度,同时避免影响注射的粘度。该方案优先注射到心包腔或卵黄周围间隙 (PVS) 而不是卵黄囊中,因为这些部位提供更好的血管形成和更少的缺氧条件37。卵黄囊移植虽然可及,但通常会导致高死亡率和较差的细胞活力21。
由于微粒引起的针头堵塞仍然是一个程序上的挑战。过滤细胞悬液并在修剪堵塞的针头后重新校准注射体积是必不可少的步骤。只有心包致密的胚胎才应用于后续药物治疗21,36。
建议的 35 °C 孵育温度平衡了人类癌细胞的自然温度 (37°C) 和斑马鱼的标准饲养温度 (28 °C)21。斑马鱼胚胎以最小的发育变形适应这种温度,并且环境增强了新鲜患者来源细胞的增殖和存活38。
药物治疗
开发斑马鱼异种移植模型以促进高通量药物筛选。然而,药物治疗仍然是 ZefiX 检测最具挑战性的方面之一。许多标准护理药物和靶向疗法在体内无法有效到达移植细胞。它可能还需要测试更大的药物浓度组。成功的例子,如维奈托克和达沙替尼,需要的浓度明显高于传统的 2D 培养测定21。
或者,在移植前对细胞进行体外预处理也可以研究某些全身和局部效应。例如,这种方法可能适用于胶质母细胞瘤39 中基于腺相关病毒 (AAV) 的治疗。
如果使用此管道在体外观察到药物治疗的效果,但在体内未观察到药物治疗的效果,则另一种方法是,例如,移植到 1k 细胞期 (3 hpf) 或囊胚期,并在 24 hpf40,41 开始药物治疗。这可能允许药物到达在 48 小时老胚胎中不成功的移植细胞或同时共同注射细胞和药物25。
解离和流式细胞术分析
组织解离对于分析移植物细胞总数和可靠地解释实验结果至关重要。机械解离和酶解离相结合,确保高质量的单细胞悬液,同时保持细胞表面蛋白质的完整性。对于不同的癌症类型,可能需要调整解离条件(例如,酶组成、移液或使用 Dounce 匀浆器)。
应过滤样品以防止流式细胞仪堵塞,并且在解离前可以通过 EDTA 或胚胎脱脂来减轻粘性蛋白质或脂质。
总结
ZefiX 方案为临床前癌症研究、耐药研究和个性化治疗评估提供了快速且经济高效的实验管道。虽然斑马鱼异种移植模型存在局限性并且无法适应所有药物类型,但这种标准化方案允许新鲜患者白血病细胞和细胞系的 体内 扩增。它适用于其他癌症类型,为在临床决策时间范围内快速、个性化地预测药物反应提供了一种有前途的工具。
所有作者均声明无利益冲突。
这项工作得到了 CRC1588 合作研究中心内德国研究基金会 (DFG,德国研究基金会) 的支持,项目编号为 493872418 和柏林 Kleist 博士基金会,以及德国 José Carreras Leukämie 基金会 (R03/2016)、柏林 Krebsgesellschaft (HEFF201633KK) 和德国癌症联盟 (DKTK,联合资助电话 2016)。我们感谢 Julia Köppke 和 Mareike Wolff 对手稿的批判性阅读。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Petri dish (10 cm) | Greiner | P7237 | |
7-AAD viability staining solution | Invitrogen | 00-6993-50 | |
Agarose (LE, analytic grade) | Biozym | 840004 | |
Air pressure injector | Narishige | IM400 | with external gas supply |
Alexa Fluor 488 anti-human CD19 antibody | Biolegend | 302219 | |
Annexin binding buffer | Biolegend | 422201 | Or see solutions for preparation |
APC annexin V | Biolegend | 640941 | |
Capillaries (10 cm, OD 1.0 mm, with filaments) | WPIINC | TW100F-4 | 1.0 OD; 0.75 ID |
Cell culture flask (T-175) | Sarstedt | 83,39,12,002 | |
CellTrace Violet | Invitrogen | C34557 | |
Dimethyl sulphoxide (DMSO) | Roth | A994.1 | |
Dispase II | Sigma Aldrich | D4693-1g | |
DNase I | AppliChem GmbH | A3778 | |
Eppendorf tubes (1.5 ml) | Eppendorf | 30120086 | |
FACS tube (Polystyrene round botton Tube with Cell strainer Cap, 5 ml) | Falcon | 352235 | |
Falcon tubes (50 ml) | Falcon | 352070 | |
Fetal calf serum (FCS) | Sigma Aldrich | C8056 | |
Fine mesh filter (10 µm) | PluriStrainer | 435001050 | |
Fine mesh filter (20 µm) | PluriStrainer | 431002040 | |
Flow cytometer | Becton Dickinson | BD LSRFortessa X-20 | |
Fluorescent stereomicroscope | Leica | ||
Fluorescent stereomicroscope with camera | Leica | M165 FC | Camera: DFC7000 T |
Hank’s Balanced Salt Solution (HBSS, Calcium and Magnesium free ) | Sigma Aldrich | 88284 | |
Injection mold (Zebrafish MI/Transplant KIT) | World Precision Instruments | Z-MOLDS | |
Injection needles (without filament) | Biomedical instruments | VZIPbl-20-10-55 | Zebrafish injection pipette, blunt, OD: 20μm ± 1, TL:~10mm, PL: 55mm, Glass: BM100T-10P |
Macro-centrifuge | Eppendorf | ||
Micro-centrifuge | |||
Morpholino (csf3r) | Gene Tools LLC | csf3r (GAAGCACAAGCGA GACGGATGCCA) | |
Morpholino (spi1) | Gene Tools LLC | spi1(GATATACTGATAC TCCATTGGTGGT) | |
Papain | Sigma Aldrich | P3125 | |
Penicillin-Streptomycin (Penstrep; 10.000 U/ml) | Gibco | 15140122 | |
Plates (4-well) | Greiner Bio one | 657160 | |
Plates (96-well) | Greiner Bio one | 657180 | |
Roswell Park Memorial Institute (RPMI) 1640 Medium | Gibco | 21875-034 | |
Tricaine (MS-222) | Sigma Aldrich | E10521-50G | Ethy-3 aminobenzoate methanesulfenate |
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