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Modern high resolution X-ray powder diffraction (XRPD) in the laboratory is used as an efficient tool to determine crystal structures of long-known corrosion products on historic objects.
该晶体结构测定和使用实验室的高分辨率X射线粉末衍射(XRPD)历史悠久的艺术对象的腐蚀产物细化过程是通过两个案例呈现的细节。
被调查的第一材料是铜甲酸钠氢氧化物水合物,铜4娜4 O(HCOO)8(OH)2∙4H 2 O(样品1)构成的钠钙玻璃/铜合金复合历史性的对象( 例如 ,搪瓷)在博物馆藏品,暴露于甲醛和从木制储藏柜,粘合剂等这种退化现象最近被定性为"玻璃诱导金属腐蚀"发射甲酸。
对于第二个案例,thecotrichite,CA 3(CH 3 COO)3 CL(NO 3)2∙6H 2 O(示例2),被选中,这是一种风化盐形成在其上存储在木制橱柜和陈列柜瓷砖和石灰石对象针状微晶。在这种情况下,木充当源为乙酸与来自工件或其环境可溶性氯化物和硝酸盐的盐反应。
几何结构的知识有助于保护科学,以便更好地了解生产和衰变反应并允许以混合物的常见的情况充分定量分析。
保护科学应用于文物的保护科学(通常化学)方法。这包括制作器物的调查("技术艺术史"?这怎么在那个时候做的),它们的衰变途径为前提,以发展适当的保护治疗。通常情况下,这些研究处理像碳酸盐,甲和乙酸盐金属有机盐。其中一些已用合适的化合物( 例如,醋)被故意制造的,他人与大气(二氧化碳或从室内空气污染的羰基化合物)劣化反应得到1。作为事实上,许多这些腐蚀材料的晶体结构仍不清楚。这是不幸的事实,因为几何结构的知识有助于保护科学,以便更好地了解生产和衰变反应并允许在混合物的情况下充分定量分析。
根据所关注的材料形成足够的尺寸和质量的单晶的情况下,单晶衍射是选择用于晶体结构的测定方法。如果这些边界条件不满足,粉末衍射是最接近的替代产品。粉末衍射相比单晶衍射作为最大的缺点在于的倒数ð -矢量D *(散射矢量)的取向的信息丢失。换句话说,一个单一的衍射斑点强度被涂污的球体的表面上。这可被认为是三维衍射(=倒数)空间上的投影的粉末图案的一维2θ轴。因此,散射方向不同,但相同或相似的长度载体,系统地重叠或意外使得它很难甚至不可能对这些反射2个独立的 (Figure 1)。这也是最主要的原因,粉末衍射,尽管仅仅四年后的第一单晶实验3,4,主要用于相位识别和量化超过半世纪早期的发明。尽管如此,一个粉末图案的信息内容是巨大的,如从图2中可以很容易地推导出来。真正的挑战,但是,是揭示尽可能多的信息有可能在一个常规的方法。
实现这一目标的一个关键步骤,毫无疑问,来自特维德雨果于1969年5想法是谁发明从粉末衍射数据的晶体结构的细化局部优化技术。该方法不修改单强度而是针对日益复杂,因此采取的高峰重叠本质兼顾的典范整个粉末格局。从那个时候起,用粉末衍射技术,科学家们不再局限于数据分析bŸ方法单晶调查开发。 Rietveld方法的发明几年后,为从头计算结构测定粉末衍射法的功率被识别。如今,自然科学和工程用粉末衍射的几乎所有的分支,以确定更多,更复杂的晶体结构,尽管该方法仍不能视为常规。在过去的十年中,在实验室的新一代粉末衍射仪的设计提供高分辨率,高能量和高强度。更高的分辨率立即带来更好的峰的分离,而更高的能量吸收战斗。基于基本的物理参数更好的峰形说明( 图3),这样做的好处是布拉格反射从而提供更详细的结构调查更准确的强度。拥有现代化的设备和软件,甚至微观结构参数,如域的大小和microstra在例行的粉末衍射数据推断。
从粉末衍射数据为晶体结构测定所有算法使用单峰强度,整个粉末图案或两者的组合。传统的单晶倒易空间技术往往不能由于可用的观察和结构参数之间的不利比例。这种情况下,与引进的"充电翻转"技术6( 图4)和全局优化方法中的直接空间,其中模拟退火技术7( 图5)是最突出的代表发展的显着改变。特别是,引入化学知识到结构确定处理使用刚体或关于键长分子化合物的已知的连接和角度强烈减少必要的参数的数量。换言之,在为每一个原子三个位置参数代替,只有外部(和一些内部)度的原子团的自由的需要来确定。它是该还原结构复杂,这使得该粉末方法的真正替代单晶分析。
作者8,9的两个开创性案例研究证明,它可以解决使用粉末衍射数据的复杂的腐蚀产物复杂的晶体结构。相比于其它方法的晶体学研究的优越性是由以下事实,在这两种情况下,所报告的公式有考虑到解决晶体结构后待校正等等证明。
这两种材料的受调查在博物馆的发生有关,其存储在木制橱柜或暴露于羰基其它形式的污染源。被调查的第一材料是铜甲酸钠氢氧化物九头蛇德,铜4娜4 O(HCOO)8(OH)2∙4H 2 O(样品1),形成于博物馆藏品苏打玻璃/铜合金复合历史性的对象( 例如,搪瓷),暴露于甲醛和甲酸从木制的储存柜,胶粘剂等 。这种退化现象最近被定性为"玻璃引起的金属腐蚀"10。对于第二个案例,thecotrichite,CA 3(CH 3 COO)3 CL(NO 3)2∙6H 2 O(示例2),被选中。 Thecotrichite是一个经常出现风化形成盐瓷砖和石灰石博物馆的对象,它们存储在橡木柜和陈列柜针状结晶。在这种情况下,木充当源为乙酸与来自工件可溶性氯化物和硝酸盐的盐反应。
在文本中,结构D的各个步骤的以下部分从保护科学应用到腐蚀产物确定过程采用粉末衍射数据进行了详细的介绍。
1.样品制备
2,数据收集
3.晶体结构测定和细化
注意:对于样品1和2的晶体结构的测定和细化,一个复杂的计算机程序用于11。它用图形用户界面或通过基于文本的输入文件运行秒。后者化妆用一个复杂的脚本语言。使用样品1的结构分析的不同阶段的样品输入文件列在表S1,S2,S4-S8。的一般方法是对样品2相同。
高分辨率XRPD来测定的具有历史意义的对象的两个长知腐蚀产物先前未知的晶体结构。将样品从两个博物馆对象采取的,并仔细研磨它们在传输和毛细管样品架进行密封前( 图6,7)。用的传输和使用单色X射线德拜-谢乐几何本领域实验室高分辨率粉末衍射仪的状态测量标准进行( 图8)。
从粉末衍射数据结构测定的标准化过程,使用最近开发高效的算法开发顺序如下:峰值位置( 图10)测定,索引和空间群确定( 图11),全粉图案接头( 图12 ),结构测定( 图13-15),和Rietveld精修( 图16)。通过迭代地结合倒数(电荷翻转)( 图13)和直接空间(模拟退火)( 图14)与差分傅里叶分析方法( 图15)执行的两种化合物的晶体结构的测定。
这些化合物的晶体结构的测定( 图17,18)提高了我们的衰变机制的理解,并允许腐蚀产物充分定量相分析( 图19)。
倒易空间图1.粉末衍射 。的往复空间区域的插图即在粉末衍射访问测量。较小的圆表示Ewald球。在粉末测量的倒易晶格旋转以采样所有方向。一个等价的操作是在周围的倒易空间的原点所有可能的方向旋转Ewald球。体积扫出(图中的区域)是在实验中可访问的倒易空间的区域。2
图2.粉模式的信息内容 。背景,峰位,峰强度和峰形的四个主要贡献粉末衍射图案,信息内容的示意图图片。2 ,请点击此处查看该图的放大版本。
古尔3"SRC ="/文件/ ftp_upload / 54109 / 54109fig3.jpg"/>
图3. 波利契合 。波利全粉模式契合使用基本参数方法在德拜-谢乐几何戈(220)单色莫-Kα1辐射(λ= 0.7093埃)测量实验室6个标准的粉末格局。以下四个圈已应用:纯洛伦兹发射剖面,在赤道平面的接收狭缝的一个帽形函数,一轴向卷积服用filament-,样品 - 和接收狭缝的长度和次级索勒狭缝在内,和一个小高斯的贡献相关位置敏感探测器19 请点击此处查看该图的放大版本。
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图4. 充电翻转方案 。在翻转用于从粉末衍射数据结构的决心倒易空间电荷翻转过程的方案和流程图(如小图)。
图5. 模拟退火方案 。在用于从粉末衍射数据结构直接决定一个空间模拟退火过程的流程图。19
图6.产地样品1。携带历史悠久的艺术对象,铜4娜4 O(HCOO)8(OH)2∙4H 2 O(样品1)。历史扣,属于Rosgartenmuseum康斯坦茨(RMK-1964.79)的集合。TTPS://www-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/54109/54109fig6large.jpg"目标="_空白">点击此处查看该图的放大版本。
图7.产地的样品2。携带Thecotrichite(样品2)历史悠久的艺术对象。 Thecotrichite从国家博物馆符腾堡州(a)及其布满白色晶体thecotrichite背面( 二 )收集琉璃瓦。9 ,请点击此处查看该图的放大版本。
示出的Cu 4的Na的散射的X射线强度的样品1。屏幕快照的图8.粉末衍射图案4 O(HCOO)8(OH)2∙4H 2 O在室温条件下为衍射角的函数(样品1)。 请点击此处查看该图的放大版本。
显示thecotrichite的散射X射线强度样品2截屏图 9. 粉末衍射图案在环境条件(示例2),作为衍射角的函数。 请点击此处查看该图的放大版本。
图10. 峰值搜索样品1 荣>。屏幕截图显示铜4的X射线散射强度娜4 O(HCOO)8(OH)2∙4H 2 O和使用平滑滤波器Savitzky -格雷的第一和第二衍生物自动寻峰算法的结果。 请点击此处查看该图的放大版本。
图11.索引结果显示的索引和空间群测定结果样品1。屏幕截图铜4娜4 O(HCOO)8(OH)2∙4H 2 O. 请点击此处查看该图的放大版本。
期间结构测定过程样品1。屏幕截图图13.充电翻转铜钠4 4 O(HCOO)8(OH)2∙4H 2在空间群P O 4 2 / N使用费与直方图翻转方法匹配。与预先指定的原子类型的晶体结构的一部分,是人准备可见。 请点击此处查看该图的放大版本。
图14. 模拟的过程中为结构测定过程样品1。屏幕截图退火铜钠4 4 O(HCOO)8(OH)2∙4H 2在空间群P O 4 2 / N采用模拟退火的全局优化方法。晶体结构的一部分是已经显现。 请点击此处查看该图的放大版本。
图15。 差异傅里叶分析为期间铜4娜4 O(HCOO)8(OH)2∙4H 2在空间群P O 4 2 / N采用了结构测定过程中丢失原子搜索的样品1。屏幕截图差值Fourier方法。晶体结构是和额外的电子密度绘制。 请点击此处查看该图的放大版本。
图16. 特维德适合显示4铜的特维德情节娜4 O(HCOO)8(OH)2∙4H 2 O空间群P 4 2 / N 样品1。屏幕截图的 。所观察到的图案(蓝色),最好的Rietveld拟合轮廓(红色)和观测和计算的轮廓(下灰色)显示之间的差异曲线。 请点击此处查看该图的放大版本。
图17. 4铜的晶体结构的样品1。投影娜4 O(HCOO)8(OH)2∙4H 2 O沿晶体c轴的晶体结构 。含有铜和中央分子是钠多面体。 请点击此处查看该图的放大版本。
翁>图18. 晶体结构样品2。thecotrichite的晶体结构的突起,沿着(a)该c轴和沿着将b轴( 二 )提出。多面体颜色:Ca1的:品红,钙:青色的Ca3:绿色8 请点击此处查看该图的放大版本。
含样品1 图19. 定量分析 。含Cu 4娜4 O(HCOO)8(OH)2∙4H 2 O作为主相和Cu 2(OH)3腐蚀样品全定量相分析的情节特维德(HCOO)和Cu 2 O轻微阶段。/54109fig19large.jpg"目标="_空白">点击此处查看该图的放大版本。
分子式 | 铜4娜4 O(HCOO)8(OH)2·4(H 2 O) | CA 3(CH 3 COO)3 CL(NO 3)2∙6H 2 O |
求和公式 | 铜4娜4 O 23 C 8 H 26 | CA 3 CL 1 O 18 N 2 C 6 H 21 |
式量(克/摩尔) | 414.18 | |
晶系 | 四方 | 单斜 |
空间群 | P42 / N(86) | P21 / A |
ž | 8 | 4 |
A / A | 8.425109(97) | 23.5933(4) |
C / A | 17.47962(29) | 13.8459(3) |
C / A | 17.47962(29) | 6.8010(1) |
β[°] | - | 95.195(2) |
V / A 3 | 1240.747(35) | 2212.57(7) |
温度(K) | 298 | 303 |
R(计算值)/ g的厘米-3 | 2.255 | |
波长(埃) | 1.54059 | 1.54059 |
R-EXP(%) | 1.042 | 1.595 |
RP(%) | 1.259 | 3.581 |
R-可湿性粉剂(%) | 1.662 | 4.743 |
R-布拉格(%) | 0.549 | 3.226 |
开始角度(°2θ) | 五 | 5.5 |
最终角度(°2θ) | 75 | 59 |
梯级宽度(°2θ) | 0.015 | 0.015 |
时间/扫描(HR) | 20 | 6 |
变量号 | 70 | 112 |
铜4 表1.晶体和结构细节娜4 O(HCOO)8(OH)2∙4H 2 O和Ca 3(CH 3 COO)3 CL(NO 3)2∙6H 2 O(thecotrichite)。
补充表格
表S1。峰值搜索4铜娜4 O后输入文件(HCOO)8(OH)2∙4H 2 O(只有1个峰值显示在峰值列表)。 请点击此处下载此文件。
表S2。对Cu 4索引娜4 O(HCOO)8(OH)2∙4H 2 O.输入文件请点击这里下载此文件。
表三,对从结晶量A.国际四方的表空间群反射条件列表请点击这里下载此文件。
表S4。INP拟合根据铜4的帕利方法娜4粉末整体格局UT文件O(HCOO)8(OH)2∙4H 2 O(只有少数布拉格反射显示在高峰列表)。 请点击此处下载此文件。
表S5。对Cu 4充电翻转娜4 O(HCOO)8(OH)2∙4H 2 O.输入文件请点击这里下载此文件。
表S6。对Cu 4的模拟退火娜4 O(HCOO)8(OH)输入文件2∙4H 2 O. 请点击这里下载此文件。
表S7的输入文件的差异傅里叶分析铜钠4 4 O(HCOO)8(OH)2∙4H 2 O.。 请点击此处下载此文件。
表S8。对Cu 4的最终Rietveld精修娜4 O(HCOO)8(OH)2∙4H 2 O.输入文件请点击这里下载此文件。
XRPD is a suitable technique for conservation research as it is non-destructive, fast and easy-to-use. XRPD data can be used in routine qualitative analysis, owing to the fact that the powder pattern is a fingerprint signature to the corresponding crystal structure. The biggest advantage of XRPD over other analytic techniques is the ability of performing simultaneous qualitative and quantitative analysis of crystalline constituents in mixtures by using the Rietveld refinement method5. Moreover, the presence of amorphous content can be detected and its amount estimated. However, this procedure requires knowledge on every crystal structure present in the mixture that is a subject to investigation.
To apply the method of XRPD routinely for structure determination to conservation science, several critical boundary conditions for the laboratory powder diffractometer must be fulfilled: 1.) To avoid preferred orientation in powder samples, transmission or even better Debye-Scherrer geometry must be used. 2.) Laboratory powder diffractometers should be equipped with a primary beam monochromator to ensure strict monochromatization and a position sensitive strip detector for high intensity (= good counting statistics) and high resolution. This particular type of instrument leads to sharp peak profiles which can be adequately described by few fundamental parameters being of great benefit for the separation of overlapping reflections.
Indexing of the powder pattern which is often regarded as the bottleneck in the structure determination process should be done with exhaustive methods like "singular value decomposition", which is also insensitive to small amounts of impurities. Due to the strongly reduced information content of a powder pattern as compared to a single crystal data set, a sophisticated combination of direct and reciprocal space structure determination algorithms is needed for a high success rate. The combination of charge flipping, simulated annealing and difference-Fourier analysis has been proven to be among the most promising approaches. Providing that the material under investigation is reasonably crystalline, crystal structures with 20-25 structural parameters can nowadays been solved almost routinely from powder diffraction data if the procedure described above is used. It can be expected that this limit can be pushed to much more complex crystal structures with the advent of better instrumentation, the use of synchrotron radiation, and even more sophisticated structure determination algorithms.
Even after 250 (!) years of conservation research and 100 years of crystal structure analysis, there are still many crystalline corrosion products on artifacts of unknown exact composition and structure. This is mainly due to the unavailability of naturally or synthetically grown single crystals of suitable size. XRPD data analysis as described here can overcome this restriction since powder samples are amenable to investigation. A quantum leap forward in Conservation Science as well as in other fields!
The authors have nothing to disclose.
作者非常感谢克里斯蒂娜·史蒂芬尼女士进行XRPD测量。玛丽安·舒赫和雷秸卡Kuiter(艺术与设计斯图加特州立学院)被确认为瓷砖( 图7)的图片。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Stadi-P | Stoe & Cie GmbH | Powder Diffractometer | |
Mythen 1-K (450 μm) | Dectris Ltd. | Position Sensitive Detector | |
Mark tube borosilicate glass No. 50, 0.5 mm diameter | Hilgenberg GmbH | 4007605 | Low absorbing capillaries |
Topas 5.0 | Bruker AXS Advanced X-ray Solutions GmbH | Powder Diffraction Evaluation Software |
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