Drosophila melanogaster Göz Fenotiplerinin Ölçülmesi: ilastik ve Flynotyper'ı Entegre Eden Hesaplamalı Bir Yaklaşım

Moleküler patolojilerini anlamak için ALS, FTD ve multisistem proteinopati gibi hastalıklar için hastalık modelleri geliştirmekle ilgileniyoruz. Kullandığımız modellerden biri Drosophila göz sistemidir. Gözün düzenliliği ve simetrik paterni, ortaya çıkan mutasyonların ve gen ekspresyonu değişikliklerinin etkisini değerlendirmek için kullanılabilir.

Protokolümüz, kaba göz fenotiplerini ölçme yöntemlerindeki bir boşluğu, özellikle de manuel sıralamanın yarattığı boşluğu ele almaktadır. Manuel sıralama, füzyon, ommatidia kaybı ve kıl organizasyonuna dayanmaktadır. Ancak, önyargıya yol açabilir.

Bu nedenle, ilastik ve Flynotyper'ı birleştirmek, anormal göz fenotiplerini sıralamak için daha sağlam bir yöntem oluşturur. Protokolümüz, sağlamlığı nedeniyle manuel sıralamaya göre avantajlı olabilir. Eğitimsiz laboratuvar üyeleri bile başarılı bir niceleme yapabilirken, iki farklı araştırmacı arasındaki puan-puan farklılıklarını önlemek için manuel sıralama için muhtemelen daha eğitimli bir araştırmacıya ihtiyaç vardır.

Bu nedenle, bu protokol zamandan ve kaynaklardan tasarruf sağlayabilir. Bulgularımız araştırmayı ilerletmektedir, çünkü bu protokol kaba göz fenotiplerinin, özellikle göz morfolojisindeki zayıf değişikliklerin daha doğru bir şekilde ölçülmesine izin verir, Manuel olarak sıralarken yanlılık nedeniyle, ilastik ve Flynotyper'ı birleştirmek daha doğru puanlamaya yol açacak ve bu nedenle, daha doğru yayınlanmış sonuçlarla sonuçlanır.