Method Article
* Эти авторы внесли равный вклад
В этом протоколе представлен метод получения сосудистых органоидов с использованием плюрипотентных стволовых клеток человека.
Сосудистые органоиды, полученные из индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека (ИПСК), повторяют разнообразие типов клеток и сложную архитектуру сосудистых сетей человека. Эта трехмерная (3D) модель обладает значительным потенциалом для моделирования сосудистой патологии и скрининга лекарственных препаратов in vitro . Несмотря на последние достижения, ключевой технической проблемой остается воспроизводимое получение органоидов стабильного качества, что имеет решающее значение для последующих анализов и приложений. Здесь представлен модифицированный протокол, который улучшает как однородность, так и воспроизводимость генерации сосудистых органоидов. Модифицированный протокол включает в себя использование микролунок и коктейля CEPT (хроман 1, эмриказан, полиамины и интегрированный ингибитор реакции на стресс, транс-ISRIB) для улучшения формирования эмбриоидных тел и выживаемости клеток. Дифференцированные, зрелые сосудистые органоиды, полученные с использованием этого протокола, характеризуются 3D-иммунофлуоресцентной микроскопией для анализа их морфологии и сложной сосудистой системы. Этот протокол позволяет производить высококачественные сосудистые органоиды масштабируемым образом, потенциально облегчая их использование в моделировании заболеваний и скрининге лекарств.
Микрофизиологические модели in vitro, включая органоидные системы и системы «ткань на чипе», появились за последнее десятилетие 1,2,3. Эти трехмерные (3D) системы, полученные из человеческих клеток, устраняют ограничения обычных двумерных (2D) клеточных культур и животных моделей, такие как отсутствие многих компонентов в физиологическом микроокружении и генетические различия между видами, соответственно. Они дают больше физиологических знаний и больше подходят для моделирования заболеваний и скрининга лекарств, чем обычные модели. Среди микрофизиологических моделей было доказано, что органоиды, полученные из индуцированных плюрипотентных стволовых клеток человека (ИПСК), эффективно повторяют архитектурные особенности нативных тканей человека и были разработаны для имитации различных органов человека, включая мозг 4,5, почку6, печень 7,8 и сетчатку 9. В этой статье мы уделяем особое внимание получению сосудистых органоидов из ИПСК и описываем оптимизированный протокол, направленный на минимизацию различий между различными образцами органоидов и партиями, тем самым улучшая общую воспроизводимость.
Сосудистая сеть играет решающую роль в поддержании физиологического гомеостаза во всех органах человека. Формирование сосудистой сети включает в себя процессы васкулогенеза и ангиогенеза, которые организуются посредством взаимодействия между эндотелиальными и пристеночными клетками (например, перицитами и гладкомышечными клетками сосудов) и под воздействием различныхстимулов. Пеннингер, Виммер и их коллеги разработали первый метод генерации сосудистых органоидов 11,12, который имитирует эти два процесса. С помощью органоидов, полученных с помощью этого метода, их группа12 и группа13,14 продемонстрировали потенциал сосудистых органоидов для моделирования сосудистых нарушений при заболеваниях. Например, в наших последних работах13,14 наблюдались различные фенотипы, такие как прорастание сосудов и вариации состава клеток стенки, между сосудистыми органоидами, имитирующими болезнь, и их аналогами дикого типа. Эти примеры показывают, что модель сосудистого органоида может служить платформой для скрининга лекарств, имитируя сосудистые сбои, связанные с заболеванием.
На основе первоначальных работ по генерации сосудистых органоидов11,12 представлен пересмотренный протокол, который включает использование микролунки для облегчения формирования гомогенных эмбриоидных тел (БЭ), что является критическим фактором для минимизации вариаций, часто наблюдаемых в одной и той же партии генерации органоидов. Кроме того, коктейль CEPT, комбинация хромана 1, эмриказана, полиаминов и интегрированного ингибитора реакции на стресс (trans-ISRIB)15, используется для улучшения жизнеспособности ИПСК и дифференцированных клеток в процессе образования БЭ. Эта модификация в основном предназначена для уменьшения различий между различными образцами органоидов и партиями. Однородные сосудистые органоиды могут быть получены с помощью этого примерно двухнедельного протокола, в котором васкулогенез индуцируется, чтобы помочь эндотелию организоваться в примитивные канальцевые сети в 1-й день, а затем индукция ангиогенеза в 5-й день для развития сложных сосудистых сетей в органоидах. На 12-15-й день сгенерированные органоиды должны показать зрелые сосудистые сети, состоящие как из эндотелия, так и из мочковых клеток.
На рисунке 1 представлен обзор шагов, связанных с этим протоколом. Подробная информация о реагентах и материалах, используемых в этом протоколе, приведена в Таблице материалов. Рекомендуется предварительно нагреть все носители до 37 °C перед использованием, если не указано иное. Все материалы и принадлежности для клеточных культур должны быть либо автоклавными, либо стерильными, а работа с клетками должна производиться в шкафу биобезопасности. Кроме того, значение pH смеси коллагена I должно быть тщательно отрегулировано до pH 7,3, чтобы избежать возможных проблем с затвердеванием.
1. Обслуживание ИПСК человека
2. Формирование EB (день 0)
3. Сосудистая дифференцировка (день 1 - 5)
4. Заделка гидрогеля (день 5)
5. 3D Иммунофлуоресцентный анализ
На рисунке 1А представлена схема этого протокола, включая ключевые компоненты, используемые на каждом этапе. Дифференцировка началась с формирования БЭ, за которой последовала индукция мезодермы и уточнение сосудистой линии (Рисунок 1B-D). Со временем агрегаты становились больше и менее сферическими. Органоиды начали показывать шероховатости на 5-й день. После встраивания в матричную смесь коллагеновых I-базальных мембран клетки эндотелия сосудов и перициты прорастали и перерастали, образуя сложные сосудистые сети уже на 7-й день (рис. 1E). Поскольку основной целью этого модифицированного метода является минимизация различий между партиями разных поколений, мы измерили размер EB из двух независимых партий, и как измерения размера, так и статистический анализ подтвердили согласованность и однородность с этим методом (рис. 1F).
Для подтверждения сосудистой дифференцировки органоиды собирали на 5-й день перед встраиванием и окрашивали сосудистыми маркерами, включая CD31, ERG1 и PDGFRβ. Органоиды экспрессировали CD31, ERG1 и PDGFRβ (рис. 2), что указывает на присутствие сосудистых эндотелиальных клеток и перицитов.
После очищения тканей сосудистые сетки были проанализированы с помощью иммунофлуоресцентной микроскопии полного монта (рис. 3A). Зрелые органоиды окрашивали CD31, ERG1 и PDGFRβ на 17-й день (рис. 3B, образец в гелевом блоке) и 28-й день (рис. 3C, образец был извлечен из гелевого блока и культуре по отдельности в 96-луночном планшете; обратите внимание, что сосудистая сетка по краям оборачивала сфероиды, а не расширялась радиально после извлечения из гелевого блока).
Рисунок 1: Генерация сосудистых органоидов. (A) Схема этапов и временная шкала генерации сосудистых органоидов. (В-Е) Репрезентативные яркопольные изображения сосудистых органоидов на разных стадиях. Масштабные линейки: 100 мкм. (F) Статистический анализ размера ЭБ из двух различных партий генерации ЭБ с использованием метода микролунок, представленного в данной работе. Для генерации EB использовали 1000 клеток на микролунку, а для партий 1 и 2 n = 42 и n = 40 соответственно. Значимость представлена в виде ns, а не значима. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.
Рисунок 2: Иммуноокрашивание сосудистых органоидов перед заделкой геля. Репрезентативные флуоресцентные изображения органоидов, окрашенных эндотелиальными маркерами (A) CD31 (зеленый) и (B) ERG1 (зеленый), а также (C) маркером перицитов, PDGFRβ (зеленый) соответственно. Ядра были компенсированы DAPI (синий). Масштабные линейки: 50 μм. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Рисунок 3: Иммунофлуоресцентная характеристика сосудистой сети в сосудистых органоидах. (А) Репрезентативное изображение показывает сосудистые органоиды, встроенные в гель, в стеклянной чашке после очищения тканей. Органоиды были прозрачными, но видимыми под ультрафиолетовым светом с длиной волны 385 нм. (B) Репрезентативное 3D-изображение сосудистого органоида на 17-й день. Сосудистый органоид окрашивали DAPI (синий), маркер эндотелиальных клеток сосудов CD31 (зеленый цвет) и маркер перицитов PDGFRβ (пурпурный). (C) Репрезентативная 3D-визуализация полученного сосудистого органоида на 28-й день, окрашенного эндотелиальными маркерами CD31 (красный) и ERG1 (зеленый). Масштабные линейки: 150 μм. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этого рисунка.
Расширяющая среда hiPSC | 500 мл |
mTeSR Plus базальная среда | 400 мл |
Добавка mTeSR Plus | 100 мл |
Гентамицин (50 мг/мл) | 1 мл |
Таблица 1: Состав расширяющей среды hiPSC.
Среда для посева hiPSC | 20 мл |
Расширительная среда PSC | 20 мл |
Хроман 1 (100 мкМ) | 10 μл |
Эмрикасан (1 мМ) | 30 μл |
Полиаминовая добавка (1000x) | 20 μл |
транс-ИСРИБ (1 мМ) | 14 μЛ |
Таблица 2: Состав посевной среды hiPSC.
Н2В27 средний | 100 мл |
DMEM/F-12, добавка GlutaMAX | 48,6 мл |
Нейробазальная среда | 48,6 мл |
Добавка GlutaMAX (100x) | 0,5 мл |
Раствор заменимых аминокислот MEM (NEAA, 100x) | 0,5 мл |
2-Меркаптоэтанол (1000x) | 0,1 мл |
Гентамицин (50 мг/мл) | 0,1 мл |
Доплата N2 (100x) | 0,5 мл |
Добавка B27 минус витамин А (50x) | 1 мл |
Гепарин, 4 кЕд/мл | 0,1 мл |
Таблица 3: Состав среды N2B27.
Мезодерма индукционная среда (MIM) | 3 мл |
Н2В27 средний | 3 мл |
BMP4 (100 нг/мкл) | 0,9 мкл |
CHIR99021 (12 мМ) | 3 мкл |
Таблица 4: Состав мезодермовой индукционной среды (MIM).
Среда для сосудистой дифференцировки 1 (VDM1) | 3 мл |
Н2В27 средний | 3 мл |
Форсклин (12 мМ) | 0,5 мкл |
VEGFA (100 нг/мкл) | 3 мкл |
Таблица 5: Состав среды для сосудистой дифференцировки 1 (VDM1).
Смесь коллагена I | 5 мл |
Коллаген I (3,61 г/мл) | 2,77 мл |
10x DMEM/F12 средний | 0,5 мл |
Гидрокарбонат натрия, 7,5% | 0,5 мл |
ХЕПЕС, 1 М | 0,5 мл |
H2O | 0,73 мл |
NaOH, 1М | 75 μл |
Таблица 6: Состав коллагена I смеси.
Коллаген I - матриксная смесь базальной мембраны | 6,5 мл |
Коллаж I смесь | 5 мл |
Матригель (10 мг/мл) | 1,5 мл |
Таблица 7: Состав коллагеновой I-базальной мембранной матричной смеси.
Среда для дифференцировки сосудов 2 (VDM2) | 5 мл |
DMEM/F-12, добавка GlutaMAX™ | 3,67 мл |
Гентамицин (50 мг/мл) | 5 μл |
Раствор заменимых аминокислот MEM (NEAA, 100X) | 50 μл |
2-Меркаптоэтанол (1000x) | 5 μл |
Гепарин, 4 кЕд/мл | 5 μл |
Замена нокаутирующей сыворотки | 0,75 мл |
ФБС | 0,5 мл |
VEGFA (100 нг/мкл) | 5 μл |
FGF2 (100 нг/мкл) | 5 μл |
Таблица 8: Состав среды для сосудистой дифференцировки 2 (VDM2).
Блокирующий буфер | 50 мл |
Ослиная сыворотка | 2,5 мл |
Подросток 20 | 0,25 мл |
Тритон Х-100 | 0,25 мл |
Раствор дезоксихолата натрия (1%, мас./об.) | 0,5 мл |
ПБС | 46,5 мл |
Таблица 9: Состав блокирующего буфера для иммуноокрашивания.
Описанный протокол включает в себя две ключевые модификации для гомогенной и воспроизводимой генерации высококачественных сосудистых органоидов. Первая модификация заключается в использовании микролуночного планшета для лучшего контроля однородности EB. В качестве отправной точки для сосудистой дифференцировки размер БЭ имеет решающее значение, поскольку он регулирует судьбу стволовых клеток и эффективность дифференцировки в отношении различных линий. Вариации в размерах БЭ обычно приводят к образованию гетерогенных органоидов с непоследовательной структурой и организацией16,17. Традиционный метод генерации БЭ путем поднятия колоний ИПСК11,12 затрудняет контроль количества клеток для отдельных БЭ и обычно приводит к образованию гетерогенных БЭ. В этом протоколе ИПСК диссоциируют в суспензию одиночных клеток и реагрегируют в микролунках16,18. Регулируя количество посевных клеток, можно оптимизировать размер БЭ для обеспечения последовательной и эффективной мезодермальной дифференцировки. Для засева микролунок используется 500-1000 ячеек, и это позволяет получить относительно небольшие БЭ (диаметром 100-200 мкм). Этот метод может воспроизводимо генерировать однородные EB с желаемыми размерами от партии к партии (рисунок 1F) и среди различных клеточных линий13. Начиная с 0-го дня, морфология БЭ со временем меняется в ходе дифференцировки: форма становится менее сферической, а поверхность – более шероховатой (рис. 1), но объем существенно не увеличивается. Морфология 3D-сосудистой сети зависит от плотности встраивания и размеров встраиваемых органоидов. Слишком крупные (>500 мкм) органоиды обычно приводят к недостаточной дифференцировке сосудистых клеток, в то время как слишком мелкие органоиды, как правило, имеют недоразвитую сосудистую сеть.
Вторая модификация включает в себя коктейль CEPT для повышения жизнеспособности hiPSC во время формирования EB. Жизнеспособность клеток имеет решающее значение в дополнение к качеству колоний hiPSC во время этого процесса. Когда ИПСК диссоциируют в одноклеточную суспензию, обычно добавляют ингибитор ROCK Y27632 для улучшения жизнеспособности клеток. Тем не менее, было показано, что Y27632 неоптимален для ИПСК при низкой плотности и может вызывать нежелательное напряжение мембраны, в то время как коктейль CEPT (состоящий из хромана 1, эмриказана, полиаминов и транс-ISRIB) может значительно снизить клеточный стресс и улучшить жизнеспособность во время этого процесса образования БЭ с ИПСК в более низкой плотности15.
Перед внедрением органоидов в гель органоиды поддерживаются в микролуночном планшете, и смена среды должна быть осторожной, чтобы избежать возможного разрушения. Для смены среды в течение первых 5 дней лучше использовать пипетку объемом 200 μл. Все среды, используемые для генерации сосудистых органоидов, должны быть предварительно подогреты перед использованием. Особенно после встраивания геля, использование холодных сред может частично разжижать матрицу базальной мембраны и влиять на 3D-гидрогелевую нишу для формирования сосудистой сети. Плотность встраивания и равномерное распределение органоидов также являются критическими факторами для формирования сосудистой сети. Плотное встраивание органоидов потенциально может привести к чрезмерному слиянию сосудистых сетей, в то время как низкая плотность встраивания может привести к недостаточному образованию сети. Посев 60-80 органоидов в лунку и осторожное перемещение пластины вперед и назад сразу после добавления их в первый слой 3D геля может лучше распределить эти органоиды.
Этот протокол может быть дополнительно модифицирован для различных приложений. Например, сигналы гематоэнцефалического барьера (ГЭБ) могут быть применены для дальнейшего сдерживания эндотелиальных клеток сосудов от образования интерфейса ГЭБ 19,20,21,22,23,24,25. Состав 3D гидрогеля также можно регулировать. Например, фибрин и витронектин обычно используются для формирования сосудистой сети in vitro 25,26,27,28,29,30,31,32. Матрица базальной мембраны без коллагена I может быть использована для встраивания, что может упростить процесс встраивания и обеспечить различные механические стимулы.
Хотя сосудистые органоиды, полученные с помощью этого протокола, потенциально могут быть использованы для моделирования заболеваний или скрининга лекарств, одним из ограничений является то, что эти органоиды в основном повторяют только капиллярную сосудистую сеть с несколькими более крупными сосудами. Для исследований, сосредоточенных на более крупных сосудах, для генерации органоидов могут потребоваться дополнительные механические стимулы 24,31,32,33. Соединение сосудистых органоидов с рециркуляцией, такое как трансплантация животным34 или микро-/макрофлюидные устройства с перфузионными насосами33, потенциально может решить эту проблему.
Авторы заявляют об отсутствии конкурирующих финансовых интересов.
Мы хотели бы выразить признательность за техническую поддержку со стороны совместного ресурса по конфокальной и специализированной микроскопии Комплексного онкологического центра Герберта Ирвинга при Колумбийском университете, частично финансируемой за счет гранта Центра NIH (P30CA013696). Эта работа поддержана NIH (R21NS133635, Y.-H.L.; UH3TR002151, K. W. L.). Рисунок 1А был создан с помощью BioRender.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
2-Mercaptoethanol (1000x) | Gibco | 21985023 | |
Accutase | Sigma-Aldrich | A6964 | |
Alexa Fluor 488 AffiniPure F(ab')2 Fragment Donkey Anti-Rabbit IgG (H+L) | Jackson Immuno Research Labs | 711-546-152 | reconstitute with 0.25 mL 50% glycerol, store at -20 °C for up to 1 year, dilution ratio for use: 1:1000 |
Alexa Fluor 647 AffiniPure F(ab')2 Fragment Donkey Anti-Goat IgG (H+L) | Jackson Immuno Research Labs | 705-606-147 | reconstitute with 0.25 mL 50% glycerol, store at -20°C for up to 1 year, dilution ratio for use: 1:1000 |
B27 supplement minus vitamin A (50x) | Gibco | 12587010 | thaw at 4 °C, aliquot and store at -20 °C, avoid freeze-thaw cycle |
BMP4 | ProSpec | CYT-081 | reconstitute with sterile ddH2O at a concentration of 100 ng/µL, aliquot and store at -20 °C |
CD31 antibody | abcam | ab28364 | dilution ratio: 1:400 |
Centrifuge | Eppendorf | 022626001 | |
CHIR99021 | Tocris Bioscience | 4423/10 | make the stock solution at 12 mM with DMSO, and store at -20 °C for up to 1 year. |
Chroman 1 | Tocris | 7163/10 | make the stock solution at 100 µM with DMSO, and store at -20 °C for up to 1 year. |
Collagen I | Corning | 40236 | |
Confocal Microscope | Nikon | AXRMP/Ti2 | |
Corning Elplasia Plates | Corning | 4441 | |
Countess II FL automated cell counter | Thermo Fisher | AMQAF1000 | |
DMEM/F-12, GlutaMAX supplement | Gibco | 10565018 | |
DMEM/F-12, powder | Gibco | 12500062 | make 10x stock solution with biograde ddH2O and sterilize it with a 0.2 µm filter. Store at 4 °C. |
Edi042A | Cedars Sinai | ||
Emricasan | Medchemexpress LLC | HY1039610MG | make the stock solution at 1 mM with DMSO, and store at -20 °C for up to 1 year. |
ERG antibody | Cell Singali Technology | 97249 | dilution ratio: 1:400 |
Fetal Bovine Serum - Premium | Atlanta Biologicals | S11150 | thaw at 4 °C and aliquot, store at -20 °C for up to five years, or store at 4 °C for up to a month |
FGF2 | ProSpec | CYT557 | reconstitute with sterile ddH2O at a concentration of 100 ng/µL, aliquot and store at -20 °C |
Fluorodish Cell Culture Dish | World Precision Instruments | FD35-100 | |
Forskolin | Tocris Bioscience | 1099 | reconstitute with DMSO at a concentration of 12 mM, aliquot and store at -20 °C |
Gentamicin (50 mg/mL) | Gibco | 15710064 | |
GlutaMAX supplement (100x) | Gibco | 35050061 | |
Heparin, 100 kU | MilliporeSigma | 375095100KU | reconstitute with sterile ddH2O at a concentration of 4 kU/mL |
HEPES (1 M) | Gibco | 15630080 | |
Incubator | Thermo Scientific | 13998123 | |
Knockout Serum Replacement | Gibco | 10828028 | thaw at 4 °C, aliquot and store at -20°C, avoid freeze-thaw cycle |
Matrigel, GFR Basement Membrane Matrix | Corning | 356230 | thaw at 4 °C, aliquot and store at -80°C, avoid freeze-thaw cycle |
MEM Non-Essential Amino Acids Solution (NEAA, 100x) | Gibco | 11140050 | |
Molecular Biology Grade Water | Corning | 46000CV | |
mTeSR plus kit | STEMCELL Technologies | 1001130 | thaw at 4 °C, aliquot and store at -20°C, avoid freeze-thaw cycle |
N2 supplement (100x) | Gibco | 17502048 | thaw at 4 °C, aliquot and store at -20°C, avoid freeze-thaw cycle |
NaOH solution (1 M) | Cytiva HyClone | SH31088.01 | |
NeuroBasal medium | Gibco | 21103049 | |
NIS-Elements, ver 5.42 | Nikon | ||
Normal Donkey Serum | Jackson Immuno Research Labs | 17000121 | reconstitute with 10 mL sterile ddH2O, store at 4 °C for up to two weeks |
paraformaldehyde, 20% | Electron Microscopy Sciences | 15713S | dilute with PBS |
PBST, 20x | Thermofisher | 28352 | |
PDGFRβ antibody | R&D | AF385 | dilution ratio: 1:400 |
polyamine supplement (1000x) | Sigma-Aldrich | P8483 | |
Rapiclear clearing reagent, 1.49 | SUNJIN LAB | RC149001 | |
Sodium Bicarbonate (7.5%) | Gibco | 25080094 | |
Sodium deoxycholate monohydrate | Thermofisher | J6228822 | dissolve with ddH2O for 1% (wt/v) stock solution |
TBST, 20x | Thermofisher | 28360 | |
trans-ISRIB | Tocris Bioscience | 5284/10 | make the stock solution at 1 mM with DMSO, and store at -20°C for up to 1 year. |
Tritin X-100 | Sigma-Aldrich | T8787-50ML | |
Trypan Blue Stain (0.4%) | Thermo Fisher | 15250061 | |
Tween 20 | Sigma-Aldrich | P7949-100ML | |
VEGF-A | ProSpec | CYT-116 | reconstitute with sterile ddH2O at a concentration of 100 ng/µL, aliquot and store at -20°C |
Запросить разрешение на использование текста или рисунков этого JoVE статьи
Запросить разрешениеThis article has been published
Video Coming Soon
Авторские права © 2025 MyJoVE Corporation. Все права защищены