Method Article
* These authors contributed equally
פרוטוקול זה מציג שיטה ליצירת אורגנואידים וסקולריים באמצעות תאי גזע פלוריפוטנטיים אנושיים.
אורגנואידים וסקולריים שמקורם בתאי גזע פלוריפוטנטיים המושרים על ידי בני אדם (hiPSCs) משחזרים את מגוון סוגי התאים ואת הארכיטקטורה המורכבת של רשתות כלי הדם האנושיות. מודל תלת-ממדי (תלת-ממדי) זה טומן בחובו פוטנציאל משמעותי למידול פתולוגיה וסקולרית ולבדיקת תרופות חוץ גופיות . למרות ההתקדמות האחרונה, אתגר טכני מרכזי נותר בייצור אורגנואידים באיכות עקבית, שהיא חיונית עבור בדיקות ויישומים במורד הזרם. כאן מוצג פרוטוקול שונה המשפר הן את ההומוגניות והן את יכולת השחזור של יצירת אורגנואידים וסקולריים. הפרוטוקול המתוקן משלב שימוש במיקרו-בארות ובקוקטייל CEPT (כרומן 1, אמריקסן, פוליאמינים ומעכב תגובת הדחק המשולב, טרנס-ISRIB) לשיפור היווצרות הגוף העוברי והישרדות התא. אורגנואידים מובחנים ובוגרים של כלי דם שנוצרו באמצעות פרוטוקול זה מאופיינים במיקרוסקופ אימונופלואורסצנטי תלת-ממדי שלם כדי לנתח את המורפולוגיה וכלי הדם המורכבים שלהם. פרוטוקול זה מאפשר ייצור אורגנואידים וסקולריים באיכות גבוהה באופן מדרגי, מה שעשוי להקל על השימוש בהם במידול מחלות וביישומי סינון תרופות.
מודלים מיקרופיזיולוגיים במבחנה, כולל מערכות אורגנואיד ורקמות על שבב, התפתחו בעשור האחרון 1,2,3. מערכות תלת-ממדיות (תלת-ממדיות) אלה שמקורן בתאים אנושיים נותנות מענה למגבלות בתרביות תאים דו-ממדיות (2D) קונבנציונליות ובמודלים של בעלי חיים, כגון היעדר רכיבים רבים במיקרו-סביבה הפיזיולוגית והבדלים גנטיים בין מינים, בהתאמה. הם מספקים תובנות פיזיולוגיות רבות יותר ומתאימים יותר למידול מחלות ולבדיקת תרופות מאשר מודלים קונבנציונליים. בין המודלים המיקרופיזיולוגיים, אורגנואידים שמקורם בתאי גזע פלוריפוטנטיים המושרים על ידי בני אדם (hiPSCs) הוכחו כמשחזרים את התכונות האדריכליות של רקמות אנושיות מקומיות ביעילות ופותחו כדי לחקות איברים אנושיים שונים, כולל המוח 4,5, הכליה6, הכבד 7,8 והרשתית9. כאן, אנו מתמקדים במיוחד ביצירת אורגנואידים וסקולריים מ- hiPSCs ומתווים פרוטוקול יעיל שמטרתו למזער את השונות בין דגימות אורגנואידים ואצוות שונות, ובכך לשפר את יכולת השחזור הכוללת.
כלי הדם ממלאים תפקיד מכריע בשמירה על הומאוסטזיס פיזיולוגי בכל האיברים האנושיים. היווצרות כלי הדם כרוכה בתהליכים של וסקולוגנזה ואנגיוגנזה, המתוזמרים באמצעות יחסי הגומלין בין תאי אנדותל וציור קיר (למשל, פריציטים ותאי שריר חלק של כלי הדם) ומושפעים מגירויים שונים10. פנינגר, וימר ועמיתיו פיתחו את השיטה הראשונה לייצור אורגנואידים וסקולריים11,12 המחקה את שני התהליכים הללו. בעזרת האורגנואידים שנוצרו משיטה זו, הקבוצה שלהם12 ו-13,14 הדגימו את הפוטנציאל של אורגנואידים וסקולריים למידול תקלות בכלי הדם במחלות. לדוגמה, בעבודות האחרונות שלנו13,14, נצפו פנוטיפים שונים, כגון הנבטת כלי דם ושינויים בהרכב תאי קיר, בין אורגנואידים כלי דם המחקים מחלות לבין עמיתיהם מסוג פרא. דוגמאות אלה מדגישות כי מודל אורגנואיד כלי הדם יכול לשמש פלטפורמה לבדיקת תרופות על ידי חיקוי תקלות כלי דם הקשורות למחלה.
בהתבסס על עבודות הדור הראשוניות של אורגנואידים וסקולריים11,12, מוצג פרוטוקול מתוקן הכולל את השימוש במיקרווול כדי להקל על היווצרות גוף עוברי הומוגני (EB), גורם קריטי במזעור הווריאציות הנראות לעתים קרובות באותה אצווה של ייצור אורגנואידים. בנוסף, קוקטייל CEPT, שילוב של כרומן 1, אמריקסן, פוליאמינים ומעכב תגובת הלחץ המשולב (trans-ISRIB)15, משמש לשיפור הכדאיות של hiPSCs ותאים ממוינים במהלך תהליך היווצרות EB. שינוי זה נועד בעיקר להפחית את השונות בין דגימות אורגנואידים שונות ואצוות. אורגנואידים וסקולריים אחידים יכולים להיות מיוצרים עם פרוטוקול זה שנמשך כשבועיים, שבו מושרה וסקולוגנזה כדי לעזור לאנדותל להתארגן לרשתות צינוריות פרימיטיביות ביום 1, ואחריו השראת אנגיוגנזה ביום 5 כדי לפתח רשתות כלי דם מורכבות באורגנואידים. ביום 12-15, האורגנואידים שנוצרו צריכים להראות רשתות כלי דם בוגרות המורכבות הן מתאי אנדותל והן מתאי קיר.
איור 1 מציג סקירה כללית של השלבים המעורבים בפרוטוקול זה. מידע מפורט לגבי ריאגנטים וחומרים המשמשים בפרוטוקול זה ניתן בטבלת החומרים. מומלץ לחמם מראש את כל חומרי ההדפסה בטמפרטורה של 37°C לפני השימוש, אלא אם צוין אחרת. כל החומרים והאספקה של תרביות התאים צריכים להיות אוטוקלאביים או סטריליים, והטיפול בתאים צריך להיעשות בארון בטיחות ביולוגית. נוסף על כך, יש להתאים בזהירות את ערך ה-pH של תערובת קולגן I ל-pH 7.3 כדי למנוע בעיות התמצקות אפשריות.
1. תחזוקת iPSC אנושית
2. היווצרות EB (יום 0)
3. הבחנה וסקולרית (יום 1 - 5)
4. הטבעה הידרוג'ל (יום 5)
5. 3D בדיקת Immunofluorescent
איור 1A מציג את התוכנית של פרוטוקול זה, כולל מרכיבי המפתח שבהם נעשה שימוש בכל שלב. ההבחנה החלה עם היווצרות EB, ואחריה אינדוקציה מזודרם ומפרט שושלת כלי דם (איור 1B-D). האגרגטים גדלו והפכו פחות כדוריים עם הזמן. אורגנואידים החלו להראות קצוות מחוספסים ביום 5. לאחר שהוטמעו בתערובת מטריצת קרום הקולגן I-basement, תאי אנדותל של כלי דם ופריציטים נבטו ויצאו החוצה ליצירת רשתות כלי דם מורכבות כבר ביום השביעי (איור 1E). מאחר שהמטרה העיקרית של שיטה מותאמת זו היא למזער את השונות בין אצוות דור שונות, מדדנו את גודל EB משתי אצוות בלתי תלויות, וגם מדידות הגודל וגם הניתוח הסטטיסטי אישרו את העקביות והאחידות בשיטה זו (איור 1F).
כדי לאמת את התמיינות כלי הדם, אורגנואידים נאספו ביום 5 לפני הטבעה ומוכתמים בסמנים וסקולריים, כולל CD31, ERG1 ו- PDGFRβ. האורגנואידים ביטאו CD31, ERG1 ו-PDGFRβ (איור 2), מה שמצביע על נוכחות של תאי אנדותל וסקולריים ופריציטים.
לאחר ניקוי הרקמות, רשתות כלי הדם נותחו במיקרוסקופ אימונופלואורסצנטי בהרכבה שלמה (איור 3A). אורגנואידים בוגרים הוכתמו ב-CD31, ERG1 ו-PDGFRβ ביום ה-17 (איור 3B, דגימה בבלוק הג'ל) וביום ה-28 (איור 3C, הדגימה נלקחה מבלוק הג'ל והתרבית בנפרד בצלחת של 96 בארות; שימו לב שרשת כלי הדם בקצוות עטפה את הספרואידים במקום להתרחב רדיאלית לאחר שנלקחה מבלוק הג'ל).
איור 1: יצירת אורגנואידים וסקולריים. (A) סכימת השלבים וציר הזמן ליצירת אורגנואידים וסקולריים. (ב-ה) תמונות שדה בהירות מייצגות של אורגנואידים וסקולריים בשלבים שונים. פסי קנה מידה: 100 מיקרומטר. (F) ניתוח סטטיסטי בגודל EB משתי אצוות שונות מדור EB בשיטת microwell המוצגת בעבודה זו. עבור יצירת EB, 1,000 תאים לכל מיקרו-באר שימשו, ועבור אצוות 1 ו -2, n = 42 ו- n = 40, בהתאמה. המשמעות מוצגת כ-ns, לא משמעותית. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
איור 2: צביעה חיסונית של אורגנואידים וסקולריים לפני הטבעה בג'ל. תמונות פלואורסצנטיות מייצגות של אורגנואידים מוכתמים בסמני האנדותל (A) CD31 (ירוק) ו-(B) ERG1 (ירוק), כמו גם (C) סמן הפריציטים, PDGFRβ (ירוק), בהתאמה. גרעינים הוכתמו ב-DAPI (כחול). פסי קנה מידה: 50 מיקרומטר. לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
איור 3: אפיונים אימונופלואורסצנטיים של רשת כלי הדם באורגנואידים של כלי הדם. (A) תמונה מייצגת מראה אורגנואידים וסקולריים משובצים בג'ל בכלי הזכוכית לאחר ניקוי הרקמות. האורגנואידים היו שקופים אך נראו תחת אור UV של 385 ננומטר. (B) תמונה תלת-ממדית מייצגת של אורגנואיד כלי דם ביום ה-17. אורגנואיד כלי הדם הוכתם ב- DAPI (כחול), סמן תאי אנדותל כלי הדם, CD31 (ירוק) וסמן הפריציטים, PDGFRβ (מגנטה). (C) הדמיה תלת-ממדית מייצגת של אורגנואיד כלי דם שנלקח ביום ה-28, מוכתמת בסמני האנדותל CD31 (אדום) ו-ERG1 (ירוק). פסי קנה מידה: 150 מיקרומטר. לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
בינוני הרחבה hiPSC | 500 מ"ל |
mTeSR Plus בינוני בסיסי | 400 מ"ל |
תוספת mTeSR Plus | 100 מ"ל |
גנטמיצין (50 מ"ג/מ"ל) | 1 מ"ל |
טבלה 1: הרכב מדיום הרחבת hiPSC.
מדיום זריעה hiPSC | 20 מ"ל |
בינוני הרחבת PSC | 20 מ"ל |
כרומן 1 (100 מיקרומטר) | 10 מיקרוליטר |
אמריקסאן (1 מ"מ) | 30 מיקרוליטר |
תוסף פוליאמין (1000x) | 20 מיקרוליטר |
טרנס-איסריב (1 mM) | 14 מיקרוליטר |
טבלה 2: הרכב מדיום הזריעה hiPSC.
N2B27 בינוני | 100 מ"ל |
DMEM/F-12, תוסף GlutaMAX | 48.6 מ"ל |
מדיום נוירובזאלי | 48.6 מ"ל |
תוסף GlutaMAX (100x) | 0.5 מ"ל |
תמיסת חומצות אמינו לא חיוניות MEM (NEAA, 100x) | 0.5 מ"ל |
2-מרקפטואתנול (1000x) | 0.1 מ"ל |
גנטמיצין (50 מ"ג/מ"ל) | 0.1 מ"ל |
תוסף N2 (100x) | 0.5 מ"ל |
תוסף B27 פחות ויטמין A (50x) | 1 מ"ל |
הפרין, 4 kU/מ"ל | 0.1 מ"ל |
טבלה 3: הרכב מדיום N2B27.
מדיום אינדוקציה מזודרם (MIM) | 3 מ"ל |
N2B27 בינוני | 3 מ"ל |
BMP4 (100 נ"ג/מיקרוליטר) | 0.9 מיקרוליטר |
CHIR99021 (12 מ"מ) | 3 מיקרוליטר |
טבלה 4: הרכב מדיום אינדוקציה מזודרם (MIM).
התמיינות כלי דם בינונית 1 (VDM1) | 3 מ"ל |
N2B27 בינוני | 3 מ"ל |
פורסקלין (12 מ"מ) | 0.5 מיקרוליטר |
VEGFA (100 ננוגרם/מיקרוליטר) | 3 מיקרוליטר |
טבלה 5: הרכב מדיום התמיינות כלי דם 1 (VDM1).
תערובת קולגן I | 5 מ"ל |
קולגן I (3.61 גרם/מ"ל) | 2.77 מ"ל |
10x DMEM/F12 בינוני | 0.5 מ"ל |
סודיום ביקרבונט, 7.5% | 0.5 מ"ל |
HEPES, 1 מטר | 0.5 מ"ל |
H2O | 0.73 מ"ל |
נאו, 1 מ' | 75 מיקרוליטר |
טבלה 6: הרכב תערובת קולגן I.
קולגן I - תערובת מטריצת קרום מרתף | 6.5 מ"ל |
קולאז' I מערבב | 5 מ"ל |
מטריג'ל (10 מ"ג/מ"ל) | 1.5 מ"ל |
טבלה 7: הרכב תערובת מטריצת קרום קולגן I-מרתף.
התמיינות כלי דם בינונית 2 (VDM2) | 5 מ"ל |
DMEM/F-12, תוסף GlutaMAX™ | 3.67 מ"ל |
גנטמיצין (50 מ"ג/מ"ל) | 5 מיקרוליטר |
תמיסת חומצות אמינו לא חיוניות MEM (NEAA, 100X) | 50 מיקרוליטר |
2-מרקפטואתנול (1000x) | 5 מיקרוליטר |
הפרין, 4 kU/מ"ל | 5 מיקרוליטר |
תחליף סרום נוקאאוט | 0.75 מ"ל |
פ.ב.ס. | 0.5 מ"ל |
VEGFA (100 ננוגרם/מיקרוליטר) | 5 מיקרוליטר |
FGF2 (100 ננוגרם/מיקרוליטר) | 5 מיקרוליטר |
טבלה 8: הרכב מדיום התמיינות כלי דם 2 (VDM2).
מאגר חוסם | 50 מ"ל |
נסיוב חמורים | 2.5 מ"ל |
טווין 20 | 0.25 מ"ל |
טריטון X-100 | 0.25 מ"ל |
תמיסת נתרן דאוקסיכולאט (1%, wt/v) | 0.5 מ"ל |
PBS | 46.5 מ"ל |
טבלה 9: הרכב חיץ חוסם לצביעת חיסון.
הפרוטוקול המתואר כולל שני שינויים מרכזיים לייצור הומוגני וניתן לשחזור של אורגנואידים וסקולריים באיכות גבוהה. השינוי הראשון הוא השימוש בצלחת מיקרווול כדי לאפשר שליטה טובה יותר באחידות EB. כנקודת מוצא של התמיינות כלי דם, גודל EBs הוא קריטי מכיוון שהוא מווסת את גורל תאי הגזע ואת יעילות ההתמיינות כלפי שושלות שונות. שינויים בגודל EB מובילים בדרך כלל לאורגנואידים הטרוגניים עם מבנה וארגון לא עקביים16,17. שיטת ייצור EB קונבנציונלית על ידי הרמת מושבות hiPSC11,12 מקשה על שליטה במספר התאים עבור EBs בודדים ובדרך כלל גורמת להיווצרות EB הטרוגנית. בפרוטוקול זה, hiPSCs מנותקים לתרחיף חד-תאי ונצברים מחדש במיקרו-בארות16,18. על ידי התאמת מספרי תאי הזריעה, ניתן למטב את גודל EBs כדי להבטיח התמיינות מזודרמלית עקבית ויעילה. עבור זריעת microwell, 500-1,000 תאים משמשים, וזה יכול להניב EBs קטנים יחסית (עם קוטר של 100-200 מיקרומטר). שיטה זו יכולה ליצור EBs אחידים בגדלים הרצויים מאצווה לאצווה (איור 1F) ובין שורות תאים שונות13. מאז יום 0, המורפולוגיה של EB השתנתה עם הזמן במהלך ההתמיינות: הצורה נעשית פחות כדורית, והמשטח נעשה מחוספס יותר (איור 1), אולם הנפח אינו גדל באופן משמעותי. המורפולוגיה התלת-ממדית של כלי הדם תלויה בצפיפות ההטבעה ובגדלים של האורגנואידים המוטבעים. אורגנואידים גדולים מדי (>500 מיקרומטר) גורמים בדרך כלל להתמיינות לא מספקת של תאי כלי הדם, בעוד שאורגנואידים קטנים מדי נוטים להיות בעלי כלי דם לא מפותחים.
השינוי השני הוא שילוב קוקטייל CEPT כדי לשפר את הכדאיות hiPSC במהלך היווצרות EB. כדאיות התא חיונית בנוסף לאיכות מושבות hiPSC בתהליך זה. כאשר hiPSCs מנותקים לתרחיף חד-תאי, מעכב ROCK Y27632 מתווסף בדרך כלל כדי לשפר את יכולת הקיום של התא. עם זאת, Y27632 הוכח כלא אופטימלי עבור hiPSCs בצפיפות נמוכה ועלול לגרום ללחץ בלתי רצוי בממברנה, בעוד שקוקטייל CEPT (המורכב מכרומן 1, אמריקסן, פוליאמינים וטרנס-ISRIB) יכול להפחית באופן משמעותי את הלחץ התאי ולשפר את הכדאיות במהלך תהליך היווצרות EB זה עם hiPSCs בצפיפות נמוכה יותר15.
לפני הטמעת אורגנואידים בג'ל, האורגנואידים נשמרים בצלחת המיקרווול, והשינוי הבינוני צריך להיות עדין כדי למנוע הפרעה אפשרית. עדיף להשתמש פיפטה 200 μL כדי לשנות את המדיום במשך 5 הימים הראשונים. יש לחמם מראש את כל המדיה המשמשת לייצור אורגנואידים וסקולריים לפני השימוש. במיוחד לאחר הטבעה בג'ל, השימוש במדיה קרה יכול להנזיל חלקית את מטריצת קרום המרתף ולהשפיע על נישת הידרוג'ל תלת ממדית להיווצרות רשת כלי דם. צפיפות ההטבעה ואפילו הפיזור של האורגנואידים הם גם גורמים קריטיים להיווצרות רשת כלי הדם. הטבעה צפופה של אורגנואידים עלולה להוביל לאיחוי יתר של רשתות כלי הדם, בעוד שצפיפות הטבעה נמוכה עלולה להוביל להיווצרות רשת לא מספקת. זריעת 60-80 אורגנואידים לכל באר והזזת הצלחת בעדינות קדימה ואחורה מיד לאחר הוספתם לשכבה הראשונה של הג'ל התלת-ממדי יכולה להפיץ טוב יותר אורגנואידים אלה.
פרוטוקול זה ניתן לשינוי נוסף עבור יישומים שונים. לדוגמה, ניתן ליישם רמזי מחסום דם-מוח (BBB) כדי לרסן עוד יותר את תאי האנדותל של כלי הדם מהיווצרות ממשק BBB19,20,21,22,23,24,25. ניתן להתאים גם את הרכב ההידרוג'ל התלת-ממדי. לדוגמה, פיברין וויטרונקטין משמשים בדרך כלל ליצירת רשת כלי דם במבחנה 25,26,27,28,29,30,31,32. ניתן להשתמש במטריצת קרום המרתף ללא קולגן I להטמעה, מה שעשוי לפשט את תהליך ההטבעה ולספק גירויים מכניים שונים.
אף על פי שהאורגנואידים של כלי הדם הנוצרים מפרוטוקול זה יכולים לשמש באופן פוטנציאלי למידול מחלות או ליישומי סינון תרופות, מגבלה אחת היא שאורגנואידים אלה רק מחזירים בעיקר את כלי הדם הנימיים עם מעט כלי דם גדולים יותר. עבור מחקר המתמקד בכלי דם גדולים יותר, ייצור אורגנואידים עשוי לדרוש גירויים מכניים נוספים 24,31,32,33. חיבור אורגנואידים וסקולריים עם מחזור הדם, כגון השתלה לבעלי חיים34 או התקנים מיקרו-/ מאקרו-פלואידים עם משאבות זילוח33, עשוי לטפל בכך.
המחברים מצהירים כי אין אינטרס כלכלי מתחרה.
ברצוננו להכיר בתמיכה הטכנית של המשאב המשותף למיקרוסקופיה קונפוקלית ומיוחדת של מרכז הסרטן המקיף ע"ש הרברט אירווינג באוניברסיטת קולומביה, שמומן בחלקו באמצעות מענק מרכז NIH (P30CA013696). עבודה זו נתמכת על ידי NIH (R21NS133635, Y.-H.L.; UH3TR002151, ק. ו. ל.). איור 1A נוצר באמצעות BioRender.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
2-Mercaptoethanol (1000x) | Gibco | 21985023 | |
Accutase | Sigma-Aldrich | A6964 | |
Alexa Fluor 488 AffiniPure F(ab')2 Fragment Donkey Anti-Rabbit IgG (H+L) | Jackson Immuno Research Labs | 711-546-152 | reconstitute with 0.25 mL 50% glycerol, store at -20 °C for up to 1 year, dilution ratio for use: 1:1000 |
Alexa Fluor 647 AffiniPure F(ab')2 Fragment Donkey Anti-Goat IgG (H+L) | Jackson Immuno Research Labs | 705-606-147 | reconstitute with 0.25 mL 50% glycerol, store at -20°C for up to 1 year, dilution ratio for use: 1:1000 |
B27 supplement minus vitamin A (50x) | Gibco | 12587010 | thaw at 4 °C, aliquot and store at -20 °C, avoid freeze-thaw cycle |
BMP4 | ProSpec | CYT-081 | reconstitute with sterile ddH2O at a concentration of 100 ng/µL, aliquot and store at -20 °C |
CD31 antibody | abcam | ab28364 | dilution ratio: 1:400 |
Centrifuge | Eppendorf | 022626001 | |
CHIR99021 | Tocris Bioscience | 4423/10 | make the stock solution at 12 mM with DMSO, and store at -20 °C for up to 1 year. |
Chroman 1 | Tocris | 7163/10 | make the stock solution at 100 µM with DMSO, and store at -20 °C for up to 1 year. |
Collagen I | Corning | 40236 | |
Confocal Microscope | Nikon | AXRMP/Ti2 | |
Corning Elplasia Plates | Corning | 4441 | |
Countess II FL automated cell counter | Thermo Fisher | AMQAF1000 | |
DMEM/F-12, GlutaMAX supplement | Gibco | 10565018 | |
DMEM/F-12, powder | Gibco | 12500062 | make 10x stock solution with biograde ddH2O and sterilize it with a 0.2 µm filter. Store at 4 °C. |
Edi042A | Cedars Sinai | ||
Emricasan | Medchemexpress LLC | HY1039610MG | make the stock solution at 1 mM with DMSO, and store at -20 °C for up to 1 year. |
ERG antibody | Cell Singali Technology | 97249 | dilution ratio: 1:400 |
Fetal Bovine Serum - Premium | Atlanta Biologicals | S11150 | thaw at 4 °C and aliquot, store at -20 °C for up to five years, or store at 4 °C for up to a month |
FGF2 | ProSpec | CYT557 | reconstitute with sterile ddH2O at a concentration of 100 ng/µL, aliquot and store at -20 °C |
Fluorodish Cell Culture Dish | World Precision Instruments | FD35-100 | |
Forskolin | Tocris Bioscience | 1099 | reconstitute with DMSO at a concentration of 12 mM, aliquot and store at -20 °C |
Gentamicin (50 mg/mL) | Gibco | 15710064 | |
GlutaMAX supplement (100x) | Gibco | 35050061 | |
Heparin, 100 kU | MilliporeSigma | 375095100KU | reconstitute with sterile ddH2O at a concentration of 4 kU/mL |
HEPES (1 M) | Gibco | 15630080 | |
Incubator | Thermo Scientific | 13998123 | |
Knockout Serum Replacement | Gibco | 10828028 | thaw at 4 °C, aliquot and store at -20°C, avoid freeze-thaw cycle |
Matrigel, GFR Basement Membrane Matrix | Corning | 356230 | thaw at 4 °C, aliquot and store at -80°C, avoid freeze-thaw cycle |
MEM Non-Essential Amino Acids Solution (NEAA, 100x) | Gibco | 11140050 | |
Molecular Biology Grade Water | Corning | 46000CV | |
mTeSR plus kit | STEMCELL Technologies | 1001130 | thaw at 4 °C, aliquot and store at -20°C, avoid freeze-thaw cycle |
N2 supplement (100x) | Gibco | 17502048 | thaw at 4 °C, aliquot and store at -20°C, avoid freeze-thaw cycle |
NaOH solution (1 M) | Cytiva HyClone | SH31088.01 | |
NeuroBasal medium | Gibco | 21103049 | |
NIS-Elements, ver 5.42 | Nikon | ||
Normal Donkey Serum | Jackson Immuno Research Labs | 17000121 | reconstitute with 10 mL sterile ddH2O, store at 4 °C for up to two weeks |
paraformaldehyde, 20% | Electron Microscopy Sciences | 15713S | dilute with PBS |
PBST, 20x | Thermofisher | 28352 | |
PDGFRβ antibody | R&D | AF385 | dilution ratio: 1:400 |
polyamine supplement (1000x) | Sigma-Aldrich | P8483 | |
Rapiclear clearing reagent, 1.49 | SUNJIN LAB | RC149001 | |
Sodium Bicarbonate (7.5%) | Gibco | 25080094 | |
Sodium deoxycholate monohydrate | Thermofisher | J6228822 | dissolve with ddH2O for 1% (wt/v) stock solution |
TBST, 20x | Thermofisher | 28360 | |
trans-ISRIB | Tocris Bioscience | 5284/10 | make the stock solution at 1 mM with DMSO, and store at -20°C for up to 1 year. |
Tritin X-100 | Sigma-Aldrich | T8787-50ML | |
Trypan Blue Stain (0.4%) | Thermo Fisher | 15250061 | |
Tween 20 | Sigma-Aldrich | P7949-100ML | |
VEGF-A | ProSpec | CYT-116 | reconstitute with sterile ddH2O at a concentration of 100 ng/µL, aliquot and store at -20°C |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved