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* Estos autores han contribuido por igual
Este protocolo presenta un método para generar organoides vasculares utilizando células madre pluripotentes humanas.
Los organoides vasculares derivados de células madre pluripotentes inducidas humanas (hiPSC) recapitulan la diversidad de tipos celulares y la compleja arquitectura de las redes vasculares humanas. Este modelo tridimensional (3D) tiene un potencial sustancial para el modelado de patologías vasculares y el cribado de fármacos in vitro . A pesar de los avances recientes, sigue existiendo un desafío técnico clave en la generación reproducible de organoides con una calidad constante, que es crucial para los ensayos y aplicaciones posteriores. Aquí, se presenta un protocolo modificado que mejora tanto la homogeneidad como la reproducibilidad de la generación de organoides vasculares. El protocolo modificado incorpora el uso de micropocillos y el cóctel CEPT (croma 1, emricasan, poliaminas y el inhibidor integrado de la respuesta al estrés, trans-ISRIB) para mejorar la formación de cuerpos embrioides y la supervivencia celular. Los organoides vasculares maduros y diferenciados generados mediante este protocolo se caracterizan mediante microscopía de inmunofluorescencia 3D de montaje completo para analizar su morfología y vasculatura compleja. Este protocolo permite la producción de organoides vasculares de alta calidad de forma escalable, lo que podría facilitar su uso en aplicaciones de modelado de enfermedades y cribado de fármacos.
En la última década han surgido modelos microfisiológicos in vitro, incluidos los sistemas de organoides y tejidos en un chip 1,2,3. Estos sistemas tridimensionales (3D) derivados de células humanas abordan las limitaciones del cultivo celular bidimensional (2D) convencional y de los modelos animales, como la falta de muchos componentes en el microambiente fisiológico y las diferencias genéticas entre especies, respectivamente. Proporcionan más información fisiológica y son más adecuados para el modelado de enfermedades y el cribado de fármacos que los modelos convencionales. Entre los modelos microfisiológicos, se ha demostrado que los organoides derivados de células madre pluripotentes inducidas humanas (hiPSC) recapitulan eficazmente las características arquitectónicas de los tejidos humanos nativos y se han desarrollado para imitar diferentes órganos humanos, incluyendo el cerebro 4,5, el riñón6, el hígado 7,8 y la retina9. Aquí, nos centramos especialmente en la generación de organoides vasculares a partir de hiPSCs y esbozamos un protocolo simplificado que tiene como objetivo minimizar las variaciones entre diferentes muestras y lotes de organoides, mejorando así la reproducibilidad general.
La vasculatura desempeña un papel crucial en el mantenimiento de la homeostasis fisiológica en todos los órganos humanos. La formación de la vasculatura involucra los procesos de vasculogénesis y angiogénesis, orquestados a través de las interacciones entre las células endoteliales y murales (por ejemplo, pericitos y células del músculo liso vascular) e influenciados por diversos estímulos10. Penninger, Wimmer y sus colegas desarrollaron el primer método de generación de organoides vasculares11,12 que imita estos dos procesos. Con los organoides generados a partir de este método, su grupo12 y nosotros13,14 han demostrado el potencial de los organoides vasculares para modelar las disfunciones vasculares en las enfermedades. Por ejemplo, en nuestros trabajos recientes 13,14, se observaron fenotipos distintos, como la brotación de vasos y las variaciones en la composición de las células murales, entre los organoides vasculares que imitan la enfermedad y sus contrapartes de tipo salvaje. Estos ejemplos ponen de manifiesto que el modelo de organoide vascular podría servir como plataforma para el cribado de fármacos al imitar las disfunciones vasculares relacionadas con la enfermedad.
A partir de los trabajos iniciales de generación de organoides vasculares11,12, se presenta un protocolo revisado que incluye el uso de micropocillos para facilitar la formación homogénea de cuerpos embrioides (EB), un factor crítico para minimizar las variaciones que a menudo se observan dentro del mismo lote de generación de organoides. Además, el cóctel CEPT, una combinación de cromán 1, emicasano, poliaminas y el inhibidor integrado de la respuesta al estrés (trans-ISRIB)15, se emplea para mejorar la viabilidad de las hiPSC y las células diferenciadas durante el proceso de formación de EB. Esta modificación es principalmente para reducir las variaciones entre diferentes muestras y lotes de organoides. Se pueden producir organoides vasculares uniformes con este protocolo de aproximadamente dos semanas de duración, donde se induce la vasculogénesis para ayudar al endotelio a organizarse en redes tubulares primitivas el día 1, seguido de la inducción de la angiogénesis el día 5 para desarrollar redes vasculares complejas en los organoides. En el día 12-15, los organoides generados deben mostrar redes vasculares maduras compuestas por endotelio y células murales.
La Figura 1 presenta una descripción general de los pasos involucrados en este protocolo. La información detallada sobre los reactivos y materiales utilizados en este protocolo se proporciona en la Tabla de Materiales. Se recomienda que todos los medios se precalienten a 37 °C antes de su uso, a menos que se especifique lo contrario. Todos los materiales y suministros de cultivo celular deben ser esterilizados en autoclave, y el manejo de las células debe realizarse en un gabinete de bioseguridad. Además, el valor de pH de la mezcla de colágeno I debe ajustarse cuidadosamente a un pH de 7,3 para evitar posibles problemas de solidificación.
1. Mantenimiento de iPSC humano
2. Formación EB (Día 0)
3. Diferenciación vascular (Día 1 - 5)
4. Inclusión de hidrogel (Día 5)
5. 3D Ensayo inmunofluorescente
La Figura 1A presenta el esquema de este protocolo, incluidos los componentes clave utilizados en cada etapa. La diferenciación comenzó con la formación de EB, seguida de la inducción del mesodermo y la especificación del linaje vascular (Figura 1B-D). Los agregados se hicieron más grandes y menos esféricos con el tiempo. Los organoides comenzaron a mostrar bordes ásperos el día 5. Después de incrustarse en la mezcla de colágeno I-membrana basal, las células endoteliales vasculares y los pericitos brotaron y crecieron para formar redes vasculares complejas ya en el día 7 (Figura 1E). Como el objetivo principal de este método modificado es minimizar las variaciones entre los diferentes lotes de generación, medimos el tamaño de EB de dos lotes independientes, y tanto las mediciones de tamaño como el análisis estadístico confirmaron la consistencia y uniformidad con este método (Figura 1F).
Para validar la diferenciación vascular, los organoides se recolectaron el día 5 antes de la inclusión y se tiñeron con marcadores vasculares, incluidos CD31, ERG1 y PDGFRβ. Los organoides expresaron CD31, ERG1 y PDGFRβ (Figura 2), lo que indica la presencia de células endoteliales vasculares y pericitos.
Después del aclaramiento del tejido, las redes vasculares se analizaron con microscopía de inmunofluorescencia de montaje completo (Figura 3A). Los organoides maduros se tiñeron con CD31, ERG1 y PDGFRβ el día 17 (Figura 3B, muestra en el bloque de gel) y el día 28 (Figura 3C, la muestra se extrajo del bloque de gel y se cultivó individualmente en una placa de 96 pocillos; nótese que la red vascular en los bordes envolvía los esferoides en lugar de expandirse radialmente después de recuperarse del bloque de gel).
Figura 1: Generación de organoides vasculares. (A) Esquema de los pasos y cronograma para la generación de organoides vasculares. (B-E) Imágenes representativas de campo claro de organoides vasculares en diferentes etapas. Barras de escala: 100 μm. (F) Análisis estadístico en tamaño EB de dos lotes diferentes de generación de EB utilizando el método de micropocillos presentado en este trabajo. Para la generación de EB se utilizaron 1.000 celdas por micropocillo, y para los lotes 1 y 2, n = 42 y n = 40, respectivamente. La significación se presenta como ns, no significativa. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Figura 2: Inmunotinción de organoides vasculares antes de la inclusión en gel. Imágenes fluorescentes representativas de organoides teñidos con los marcadores endoteliales (A) CD31 (verde) y (B) ERG1 (verde), así como con (C) el marcador de pericitos, PDGFRβ (verde), respectivamente. Los núcleos se contratiñeron con DAPI (azul). Barras de escala: 50 μm. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Figura 3: Caracterizaciones inmunofluorescentes de la red vascular en organoides vasculares. (A) Una imagen representativa muestra organoides vasculares incrustados en gel en la placa de vidrio después de la limpieza del tejido. Los organoides eran transparentes pero visibles bajo una luz ultravioleta de 385 nm. (B) Una imagen representativa en 3D de montaje completo del organoide vascular en el día 17. El organoide vascular se tiñó con DAPI (azul), el marcador de células endoteliales vasculares, CD31 (verde) y el marcador de pericitos, PDGFRβ (magenta). (C) Una imagen 3D representativa de montaje completo de un organoide vascular recuperado en el día 28, teñida con los marcadores endoteliales CD31 (rojo) y ERG1 (verde). Barras de escala: 150 μm. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
medio de expansión hiPSC | 500 mL |
Medio basal mTeSR Plus | 400 mL |
Suplemento mTeSR Plus | 100 mL |
Gentamicina (50 mg/mL) | 1 mL |
Tabla 1: Composición del medio de expansión hiPSC.
Medio de siembra hiPSC | 20 mL |
Medio de expansión PSC | 20 mL |
Cromán 1 (100 μM) | 10 μL |
Emricasan (1 mM) | 30 μL |
Suplemento de poliamina (1000x) | 20 μL |
trans-ISRIB (1 mM) | 14 μL |
Tabla 2: Composición del medio de siembra hiPSC.
N2B27 medio | 100 mL |
DMEM/F-12, suplemento GlutaMAX | 48.6 mL |
Medio NeuroBasal | 48.6 mL |
Suplemento GlutaMAX (100x) | 0,5 ml |
Solución de aminoácidos no esenciales MEM (NEAA, 100x) | 0,5 ml |
2-Mercaptoetanol (1000x) | 0,1 mL |
Gentamicina (50 mg/mL) | 0,1 mL |
Suplemento de N2 (100x) | 0,5 ml |
Suplemento de B27 menos vitamina A (50x) | 1 mL |
Heparina, 4 kU/mL | 0,1 mL |
Tabla 3: Composición del medio N2B27.
Medio de inducción de mesodermo (MIM) | 3 mL |
N2B27 medio | 3 mL |
BMP4 (100 ng/μL) | 0,9 μL |
CHIR99021 (12 mM) | 3 μL |
Tabla 4: Composición del medio de inducción del mesodermo (MIM).
Medio de diferenciación vascular 1 (VDM1) | 3 mL |
N2B27 medio | 3 mL |
Forsklin (12 mM) | 0,5 μL |
VEGFA (100 ng/μL) | 3 μL |
Tabla 5: Composición del medio de diferenciación vascular 1 (VDM1).
Mezcla de colágeno I | 5 mL |
Colágeno I (3,61 g/mL) | 2.77 mL |
10x DMEM/F12 medio | 0,5 ml |
Bicarbonato de sodio, 7,5% | 0,5 ml |
HEPES, 1 M | 0,5 ml |
H2O | 0,73 ml |
NaOH, 1M | 75 μL |
Tabla 6: Composición de la mezcla de colágeno I.
Colágeno I - mezcla de matriz de membrana basal | 6,5 mL |
Mezcla Collage I | 5 mL |
Matrigel (10 mg/mL) | 1,5 ml |
Tabla 7: Composición de la mezcla de matriz de colágeno I-membrana basal.
Medio de diferenciación vascular 2 (VDM2) | 5 mL |
DMEM/F-12, suplemento GlutaMAX™ | 3.67 mL |
Gentamicina (50 mg/mL) | 5 μL |
Solución de aminoácidos no esenciales MEM (NEAA, 100X) | 50 μL |
2-Mercaptoetanol (1000x) | 5 μL |
Heparina, 4 kU/mL | 5 μL |
Reemplazo de suero knockout | 0,75 ml |
FBS | 0,5 ml |
VEGFA (100 ng/μL) | 5 μL |
FGF2 (100 ng/μL) | 5 μL |
Tabla 8: Composición del medio de diferenciación vascular 2 (VDM2).
Búfer de bloqueo | 50 mL |
Suero de burro | 2.5 mL |
Preadolescente 20 | 0,25 ml |
Tritón X-100 | 0,25 ml |
Solución de desoxicolato de sodio (1%, peso por v) | 0,5 ml |
PBS | 46.5 mL |
Tabla 9: Composición del tampón bloqueante para inmunotinción.
El protocolo descrito incluye dos modificaciones clave para la generación homogénea y reproducible de organoides vasculares de alta calidad. La primera modificación es el uso de una placa de micropocillos para permitir un mejor control de la uniformidad del EB. Como punto de partida de la diferenciación vascular, el tamaño de las EB es crítico, ya que regula el destino de las células madre y la eficacia de la diferenciación hacia diferentes linajes. Las variaciones en el tamaño de la EB suelen dar lugar a organoides heterogéneos con estructura y organización inconsistentes16,17. El método convencional de generación de EB mediante el levantamiento de colonias de hiPSC11,12 dificulta el control del número de células para EB individuales y, por lo general, resulta en la formación heterogénea de EB. En este protocolo, las hiPSCs se disocian en suspensión unicelular y se reagregan en micropocillos16,18. Al ajustar el número de células de siembra, se puede optimizar el tamaño de las EB para garantizar una diferenciación mesodérmica consistente y efectiva. Para la siembra de micropocillos, se utilizan 500-1.000 celdas, y esto puede producir EB relativamente pequeños (con un diámetro de 100-200 μm). Este método podría generar EBs uniformes con los tamaños deseados de un lote a otro (Figura 1F) y entre varias líneas celulares13. Desde el día 0, la morfología del EB ha cambiado con el tiempo durante la diferenciación: la forma se vuelve menos esférica y la superficie se vuelve más rugosa (Figura 1), pero el volumen no aumenta significativamente. La morfología de la vasculatura 3D depende de la densidad de inclusión y del tamaño de los organoides incrustados. Los organoides demasiado grandes (>500 μm) suelen dar lugar a una diferenciación insuficiente de las células vasculares, mientras que los organoides demasiado pequeños tienden a tener una vasculatura poco desarrollada.
La segunda modificación es la incorporación del cóctel CEPT para mejorar la viabilidad de la hiPSC durante la formación de EB. La viabilidad celular es crucial, además de la calidad de las colonias de hiPSC durante este proceso. Cuando las hiPSC se disocian en una suspensión de una sola célula, generalmente se agrega el inhibidor de ROCK Y27632 para mejorar la viabilidad celular. Sin embargo, se ha demostrado que Y27632 no es óptimo para las hiPSCs de baja densidad y puede causar estrés no deseado en la membrana, mientras que el cóctel CEPT (compuesto por cromán 1, emricasan, poliaminas y trans-ISRIB) podría reducir significativamente el estrés celular y mejorar la viabilidad durante este proceso de formación de EB con hiPSCs en una densidad más baja15.
Antes de la inclusión del organoide en el gel, los organoides se mantienen en la placa de micropocillos, y el cambio de medio debe ser suave para evitar posibles interrupciones. Sería mejor utilizar una pipeta de 200 μL para cambiar el medio durante los primeros 5 días. Todos los medios utilizados para la generación de organoides vasculares deben precalentarse antes de su uso. Especialmente después de la inclusión en gel, el uso de medios fríos podría licuar parcialmente la matriz de la membrana basal y afectar el nicho de hidrogel 3D para la formación de redes vasculares. La densidad de inclusión y la distribución uniforme de los organoides también son factores críticos para la formación de la red vascular. La inclusión densa de organoides podría conducir a una fusión excesiva de redes vasculares, mientras que la baja densidad de inclusión podría conducir a una formación de redes insuficiente. Sembrar entre 60 y 80 organoides por pocillo y mover suavemente la placa hacia adelante y hacia atrás inmediatamente después de agregarlos a la primera capa del gel 3D puede distribuir mejor estos organoides.
Este protocolo se puede modificar aún más para diferentes aplicaciones. Por ejemplo, las señales de la barrera hematoencefálica (BBB) se pueden aplicar para restringir aún más las células endoteliales vasculares de la formación de la interfaz BBB 19,20,21,22,23,24,25. La composición del hidrogel 3D también se puede ajustar. Por ejemplo, la fibrina y la vitronectina se utilizan comúnmente para la formación de redes vasculares in vitro 25,26,27,28,29,30,31,32. La matriz de membrana basal sin colágeno I puede utilizarse para la incrustación, lo que puede simplificar el proceso de inclusión y proporcionar diferentes estímulos mecánicos.
Aunque los organoides vasculares generados a partir de este protocolo podrían usarse potencialmente para aplicaciones de modelado de enfermedades o detección de fármacos, una limitación es que estos organoides solo recapitulan principalmente la vasculatura capilar con pocos vasos más grandes. Para la investigación centrada en vasos más grandes, la generación de organoides puede requerir estímulos mecánicos adicionales 24,31,32,33. La conexión de los organoides vasculares con la recirculación, como el trasplante a animales34 o los dispositivos micro/macrofluídicos con bombas de perfusión33, podría abordar este problema.
Los autores declaran no tener ningún interés financiero contrapuesto.
Nos gustaría agradecer el apoyo técnico del Recurso Compartido de Microscopía Confocal y Especializada del Centro Oncológico Integral Herbert Irving de la Universidad de Columbia, financiado en parte a través de la Subvención del Centro de los NIH (P30CA013696). Este trabajo cuenta con el apoyo de los NIH (R21NS133635, Y.-H.L.; UH3TR002151, K. W. L.). La Figura 1A se creó utilizando BioRender.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
2-Mercaptoethanol (1000x) | Gibco | 21985023 | |
Accutase | Sigma-Aldrich | A6964 | |
Alexa Fluor 488 AffiniPure F(ab')2 Fragment Donkey Anti-Rabbit IgG (H+L) | Jackson Immuno Research Labs | 711-546-152 | reconstitute with 0.25 mL 50% glycerol, store at -20 °C for up to 1 year, dilution ratio for use: 1:1000 |
Alexa Fluor 647 AffiniPure F(ab')2 Fragment Donkey Anti-Goat IgG (H+L) | Jackson Immuno Research Labs | 705-606-147 | reconstitute with 0.25 mL 50% glycerol, store at -20°C for up to 1 year, dilution ratio for use: 1:1000 |
B27 supplement minus vitamin A (50x) | Gibco | 12587010 | thaw at 4 °C, aliquot and store at -20 °C, avoid freeze-thaw cycle |
BMP4 | ProSpec | CYT-081 | reconstitute with sterile ddH2O at a concentration of 100 ng/µL, aliquot and store at -20 °C |
CD31 antibody | abcam | ab28364 | dilution ratio: 1:400 |
Centrifuge | Eppendorf | 022626001 | |
CHIR99021 | Tocris Bioscience | 4423/10 | make the stock solution at 12 mM with DMSO, and store at -20 °C for up to 1 year. |
Chroman 1 | Tocris | 7163/10 | make the stock solution at 100 µM with DMSO, and store at -20 °C for up to 1 year. |
Collagen I | Corning | 40236 | |
Confocal Microscope | Nikon | AXRMP/Ti2 | |
Corning Elplasia Plates | Corning | 4441 | |
Countess II FL automated cell counter | Thermo Fisher | AMQAF1000 | |
DMEM/F-12, GlutaMAX supplement | Gibco | 10565018 | |
DMEM/F-12, powder | Gibco | 12500062 | make 10x stock solution with biograde ddH2O and sterilize it with a 0.2 µm filter. Store at 4 °C. |
Edi042A | Cedars Sinai | ||
Emricasan | Medchemexpress LLC | HY1039610MG | make the stock solution at 1 mM with DMSO, and store at -20 °C for up to 1 year. |
ERG antibody | Cell Singali Technology | 97249 | dilution ratio: 1:400 |
Fetal Bovine Serum - Premium | Atlanta Biologicals | S11150 | thaw at 4 °C and aliquot, store at -20 °C for up to five years, or store at 4 °C for up to a month |
FGF2 | ProSpec | CYT557 | reconstitute with sterile ddH2O at a concentration of 100 ng/µL, aliquot and store at -20 °C |
Fluorodish Cell Culture Dish | World Precision Instruments | FD35-100 | |
Forskolin | Tocris Bioscience | 1099 | reconstitute with DMSO at a concentration of 12 mM, aliquot and store at -20 °C |
Gentamicin (50 mg/mL) | Gibco | 15710064 | |
GlutaMAX supplement (100x) | Gibco | 35050061 | |
Heparin, 100 kU | MilliporeSigma | 375095100KU | reconstitute with sterile ddH2O at a concentration of 4 kU/mL |
HEPES (1 M) | Gibco | 15630080 | |
Incubator | Thermo Scientific | 13998123 | |
Knockout Serum Replacement | Gibco | 10828028 | thaw at 4 °C, aliquot and store at -20°C, avoid freeze-thaw cycle |
Matrigel, GFR Basement Membrane Matrix | Corning | 356230 | thaw at 4 °C, aliquot and store at -80°C, avoid freeze-thaw cycle |
MEM Non-Essential Amino Acids Solution (NEAA, 100x) | Gibco | 11140050 | |
Molecular Biology Grade Water | Corning | 46000CV | |
mTeSR plus kit | STEMCELL Technologies | 1001130 | thaw at 4 °C, aliquot and store at -20°C, avoid freeze-thaw cycle |
N2 supplement (100x) | Gibco | 17502048 | thaw at 4 °C, aliquot and store at -20°C, avoid freeze-thaw cycle |
NaOH solution (1 M) | Cytiva HyClone | SH31088.01 | |
NeuroBasal medium | Gibco | 21103049 | |
NIS-Elements, ver 5.42 | Nikon | ||
Normal Donkey Serum | Jackson Immuno Research Labs | 17000121 | reconstitute with 10 mL sterile ddH2O, store at 4 °C for up to two weeks |
paraformaldehyde, 20% | Electron Microscopy Sciences | 15713S | dilute with PBS |
PBST, 20x | Thermofisher | 28352 | |
PDGFRβ antibody | R&D | AF385 | dilution ratio: 1:400 |
polyamine supplement (1000x) | Sigma-Aldrich | P8483 | |
Rapiclear clearing reagent, 1.49 | SUNJIN LAB | RC149001 | |
Sodium Bicarbonate (7.5%) | Gibco | 25080094 | |
Sodium deoxycholate monohydrate | Thermofisher | J6228822 | dissolve with ddH2O for 1% (wt/v) stock solution |
TBST, 20x | Thermofisher | 28360 | |
trans-ISRIB | Tocris Bioscience | 5284/10 | make the stock solution at 1 mM with DMSO, and store at -20°C for up to 1 year. |
Tritin X-100 | Sigma-Aldrich | T8787-50ML | |
Trypan Blue Stain (0.4%) | Thermo Fisher | 15250061 | |
Tween 20 | Sigma-Aldrich | P7949-100ML | |
VEGF-A | ProSpec | CYT-116 | reconstitute with sterile ddH2O at a concentration of 100 ng/µL, aliquot and store at -20°C |
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