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Este protocolo descreve a síntese de peptídeos cíclicos penetrantes em células com ligações cruzadas aromáticas e a avaliação de sua permeabilidade através de barreiras biológicas.
O câncer tem sido um grande desafio na saúde global. No entanto, o complexo microambiente tumoral geralmente limita o acesso da terapêutica a células tumorais mais profundas, levando à recorrência tumoral. Para vencer a penetração limitada de barreiras biológicas, peptídeos penetrantes de células (CPPs) foram descobertos com excelente capacidade de translocação de membrana e emergiram como transportadores moleculares úteis para entregar várias cargas nas células. No entanto, as PPCs lineares convencionais geralmente apresentam estabilidade proteolítica comprometida, o que limita sua permeabilidade através de barreiras biológicas. Assim, o desenvolvimento de novos transportadores moleculares que possam penetrar em barreiras biológicas e exibir maior estabilidade proteolítica é altamente desejado para promover a eficiência na liberação de fármacos em aplicações biomédicas. Nós sintetizamos previamente um painel de CPPs cíclicos curtos com ligações cruzadas aromáticas, que exibiram permeabilidade superior em células e tecidos cancerosos em comparação com seus homólogos lineares. Aqui, um protocolo conciso é descrito para a síntese do peptídeo R8 cíclico de poliarginina fluorescentemente marcado e sua contraparte linear, bem como os principais passos para investigar sua permeabilidade celular.
As últimas décadas testemunharam rápidos avanços no desenvolvimento de peptídeos penetrantes em células (CPPs) para liberação de fármacos. As PPCs têm sido amplamente utilizadas como transportadores moleculares para o tratamento de uma série de doenças potencialmente fatais, incluindo distúrbios neurológicos1,2, doenças cardíacas3, diabetes4, dermatoses5 e câncer 6,7. O câncer continua sendo um fardo de saúde global acompanhado por uma alta taxa de morbidade e mortalidade, apesar dos amplos esforços de pesquisa8. Um sério obstáculo ao tratamento do câncer é o acesso limitado da terapêutica a células tumorais mais profundas devido a barreiras fisiológicas, como matriz extracelular compacta (MEC), vasculatura tumoral anormal, múltiplas barreiras de membrana e alta pressão do fluido intersticial (IFP)9. Assim, o desenvolvimento de novas PPCs com capacidade superior de entregar cargas através de barreiras biológicas é considerado uma estratégia essencial para o tratamento do câncer10,11.
As PPCs podem ser classificadas em catiônicas, anfipáticas e hidrofóbicas em termos de suas propriedades físico-químicas12. Dentre estes, o peptídeo HIV-TAT carregado positivamente e a poliarginina sintética são de considerável importância na pesquisa biomédica e têm sido extensivamente estudados para facilitar a liberação intracelular de fármacos13. Tunnemann e col. relataram que um comprimento mínimo de oito argininas é essencial para a penetração celular eficiente dos peptídeos sintéticos de poliarginina, com base em um estudo de permeabilidade celular realizado usando peptídeos R3 aR12 14. No entanto, essas PPCs geralmente têm meias-vidas plasmáticas curtas devido à sua rápida hidrólise in vivo. Além disso, pouco se sabe sobre a otimização da estrutura química das PPCs para aumentar sua capacidade de transbarreira, uma vez que é um desafio penetrar em múltiplas membranas celulares15. Assim, o desenvolvimento de novos transportadores moleculares capazes de penetrar barreiras biológicas é fortemente desejado para aumentar a eficiência da liberação de fármacos. Em 2020, Komin et al.16 descobriram um CPP chamado peptídeo CL, que contém um motivo de hélice (RLLRLLR) e uma cauda de poliarginina (R7) para cruzar a monocamada epitelial. Um conjunto de variantes peptídicas CL também foram sintetizadas alterando o padrão helicoidal. Esta exploração pode ser um guia significativo para o desenvolvimento de novos CPPs para a entrega de cargas através de barreiras biológicas. Além disso, Dietrich e col. otimizaram a permeabilidade celular do peptídeo StAX, inibindo a via de sinalização Wnt/β-catenina por aumentar a hidrofobicidade global dos peptídeos17.
A restrição conformacional de peptídeos lineares não estruturados por ciclização é uma maneira eficaz de aumentar sua estabilidade proteolítica e permeablidade18,19,20. O reforço estrutural aumenta a resistência às proteases dos peptídeos cíclicos, tornando-os mais estáveis in vivo em comparação com seus equivalentes lineares. Além disso, a ciclização de peptídeos pode potencialmente mascarar a espinha dorsal do peptídeo polar por promover a ligação intramolecular de hidrogênio, aumentando assim a permeabilidade da membrana dos peptídeos21. Nas últimas duas décadas, métodos quimiosseletivos de ciclização tornaram-se estratégias eficazes para a construção de peptídeos cíclicos com diferentes arquiteturas, como hidrocarbonetos, lactâmicos, triazóis, m-xileno, perfluoroaril e outras ligações cruzadas22,23. A barreira biológica imposta pelo sofisticado microambiente tumoral poderia reduzir a penetração de fármacos em tumoressólidos24. Verificamos anteriormente que as PPCs cíclicas apresentaram resistência superior à digestão enzimática em relação às suas contrapartes lineares20. Além disso, a hidrofobicidade global dos peptídeos é crítica para sua maior permeabilidade celular22. Com base nos estudos discutidos acima, a combinação de um padrão carregado positivamente, hidrofobicidade global elevada e maior estabilidade da proteólise pode ser hipotetizada para aumentar a permeabilidade das PPCs através de barreiras biológicas. Em um estudo recente, identificamos duas CPPs cíclicas com ligações cruzadas aromáticas nas posições i e i+7 que exibem melhor permeabilidade em células e tecidos tumorais em comparação com suas contrapartes lineares15. Aqui, um protocolo sintético conciso para a síntese de CPPs cíclicas marcadas fluorescentemente e os principais passos para investigar sua permeabilidade são apresentados.
1. Preparação do equipamento
OBS: Realizar todos os procedimentos em exaustor de operação com equipamentos de proteção individual adequados.
2. Síntese do peptídeo R8 linear marcado com FITC (FITC-R8) e do peptídeo R8 grampeado marcado com FITC (FITC-sR8-4)
NOTA: Os peptídeos foram sintetizados de acordo com um protocolo padrão de síntese de peptídeos em fase sólida (SPPS) baseado em Fmoc25. A resina 4-(2',4'-Dimetoxifeil-Fmoc-aminometil)-fenoxiacetamido-norleucil-MBHA (resina de MBHA de amida de rinque, ver Tabela de Materiais) foi usada durante todo o estudo.
CUIDADO: N, N-dimetilformamida (DMF), N, N-diisopropiletilamina (DIPEA), morfolina e diclorometano (DCM) são todos incolores e são prejudiciais se inalados ou absorvidos através da pele. O éter é extremamente inflamável. O 1,2-etaniol (EDT) é uma substância particularmente odorífera. O ácido trifluoroacético (TFA) é altamente corrosivo, e sua acidez é de 10 a5 vezes a do ácido acético. Consequentemente, todos os reagentes e produtos químicos devem ser tratados com o uso de equipamentos de proteção em uma capela de fumaça.
3. Quantificação dos peptídeos marcados com FITC
4. Estabilidade de peptídeos no soro fetal bovino (SFB)
5. Captação celular dos peptídeos
6. Exploração da penetração célula-célula dos peptídeos utilizando modelos transwell
Neste protocolo, um procedimento sintético para restringir a poliarginina linear R8 em sua forma cíclica foi apresentado. A SPPS foi realizada manualmente, utilizando-se aparelho simples (Figura 1). O processo sintético detalhado da SPPS é mostrado na Figura 2. Resumidamente, a resina estava suficientemente inchada, seguida pela desproteção do grupo protetor N α-Fmoc. Em seguida, o aminoácido N α-Fmoc protegido foi ancorado na resina até a conclusão da montagem do peptídeo (passos 1-4 na Figura 2). Em seguida, os peptídeos brutos foram clivados da resina pelo coquetel de clivagem (passo 5 na Figura 2). O FITC foi usado para marcar os peptídeos para sintetizar CPPs cíclicos marcados fluorescentemente e rastrear sua permeabilidade através de barreiras biológicas. Posteriormente, os grupos tritilprotetores das cisteínas foram seletivamente desprotegidos na resina, seguindo-se a ciclização peptídica com ligação cruzada de 4,4'-bis(bromometil)bifenil (Figura 3A). Os espectros de HPLC e MS do FITC-R8 e FITC-sR8-4 são mostrados na Figura 3B. O tempo de retenção do FITC-sR8-4 foi substancialmente maior do que o do análogo linear, indicando maior hidrofobicidade global do peptídeo após a ciclização com a reticulação hidrofóbica. Além disso, como mostrado na Figura 3C, o R8 cíclico permaneceu 77,3% intacto após a incubação com 25% de SFB por 4 h, enquanto sua contraparte linear foi degradada em sua maioria, sugerindo maior estabilidade proteolítica do peptídeo R8 cíclico. Nos estudos subsequentes baseados em células, as células tratadas com R8 cíclico com ligações cruzadas aromáticas exibiram maior fluorescência intracelular do que aquelas tratadas com sua contraparte linear, como demonstrado por imagens de microscopia de fluorescência de células vivas (Figura 4A). Resultados semelhantes foram obtidos com a análise por citometria de fluxo (Figura 4B). Para investigar melhor se o R8 cíclico confere maior penetração célula-a-célula, modelos transwell foram usados para simular a permeabilidade de barreira dos peptídeos de uma camada celular para outra. O R8 cíclico exibiu claramente maior penetração transbarreira do que o peptídeo linear R8, como indicado por um aumento significativo na fluorescência intracelular (Figura 4C). Em resumo, o peptídeo R8 cíclico exibiu permeabilidade superior através de barreiras biológicas sobre sua contraparte linear.
Figura 1: Configuração do equipamento para o aparelho manual de síntese de peptídeos. Uma coluna de polipropileno de 10 mL é montada no coletor de vácuo usando uma válvula de parada de três vias. N2 é usado para agitação. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Figura 2: Procedimento geral da síntese de peptídeos de fase sólida (SPPS) Fmoc. Um aminoácido protegido por N α-Fmoc é ancorado à resina 4-(2',4'-Dimetoxifoil-Fmoc-aminometil)-fenoxiacetamido-norleucil-MBHA (resina de amida de rinque MBHA) (etapa 1), seguida de desproteção dos grupos protetores Nα-Fmoc dos aminoácidos (etapa 2) e subsequente acoplamento de aminoácidos (etapa 3). O passo 2 e o passo 3 são repetidos várias vezes para sintetizar o peptídeo desejado (passo 4). Após a conclusão da síntese, um coquetel de clivagem é adicionado para remover os grupos protetores da cadeia lateral e clivar o peptídeo desejado da resina (passo 5). Abreviações: DMF = N, N-dimetilformamida; DCM = diclorometano; HATU = 2-(7-azobenzotriazol)-N, N, N', N'-tetrametilurônio hexafluorofosfato; DIPEA = N, N-diisopropiletilamina; TFA = ácido trifluoroacético. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Figura 3: Síntese do peptídeo R8 linear marcado com FITC (FITC-R8) e do peptídeo R8 grampeado marcado com FITC (FITC-sR8-4) usando síntese de peptídeo de fase sólida (SPPS). (A) Diagrama esquemático da síntese de FITC-R8 e FITC-sR8-4. (B) Espectros de HPLC e MS (inset) do FITC-R8 e do FITC-sR8-4. (C) Estabilidade do FITC-R8 e do FITC-sR8-4 na presença de SFB a 25%. Peptídeo intacto (%) refere-se à fração de peptídeo não degradado. Esse valor foi modificado de Shi et al.15. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Figura 4: Penetração do peptídeo R8 linear marcado com FITC (FITC-R8) e do peptídeo R8 grampeado marcado com FITC (FITC-sR8-4). (A) Imagens de microscopia de fluorescência de células vivas de células HeLa e células 4T1 após 1 h de incubação com 3 μM de FITC-R8 e FITC-sR8-4. FITC (verde), Hoechst (azul). Barra de escala = 20 μm. (B) Fluorescência média relativa (em relação ao peptídeo linear R8), média ± d.p. e n = 3; (C) Penetração célula-célula de FITC-R8 e FITC-sR8-4 em um modelo transwell usando células HeLa. Imagens de microscopia de fluorescência de células vivas (barra de escala = 20 μm) e fluorescência média relativa (em relação ao peptídeo linear R8), média ± d.s. e n = 3. ** P < 0,01, *** P < 0,001. Esse valor foi modificado de Shi et al.15. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
A estabilização química de peptídeos pela incorporação de restrições conformacionais tem se mostrado uma estratégia eficaz para melhorar a estabilidade e a permeabilidade celular do peptídeo26. Neste protocolo, um procedimento passo-a-passo é descrito para a síntese de CPPs cíclicas com ligações cruzadas aromáticas e a avaliação de sua permeabilidade através de barreiras biológicas. Comparada às ligações cruzadas hidrofílicas lactâmicas ou triazólicas22,27, a incorporação de ligações cruzadas aromáticas (utilizadas neste estudo) melhora a hidrofobicidade global das PPCs, aumentando significativamente sua permeabilidade celular. Por outro lado, a ciclização de peptídeos pode ser facilmente obtida através de reações de substituição por cisteínas sem a necessidade de catalisadores metálicos. Nesse protocolo, a ciclização dos PPCs foi realizada em resina; entretanto, a eficiência da ciclização também depende das sequências e comprimentos específicos dos peptídeos devido aos efeitos estéricos, que podem resultar na formação de um subprodutodimérico28. Nesse caso, o uso de uma resina com menor capacidade de carga seria útil. Além disso, recomenda-se também a ciclização desses peptídeos específicos em concentrações diluídas na fase29 da solução.
Há alguns pontos críticos nesse protocolo. Primeiro, o coquetel de clivagem TFA/TIS/EDT/H 2 O (92,5/2,5/2,5/2,5, v/v/v/v) é usado para a clivagem de peptídeos contendo cisteína para prevenir a oxidação do grupo sulfidrila. Em segundo lugar, sugere-se a realização de um estudo preliminar em pequena escala para obter a condição de clivagem apropriada. O tempo ideal necessário para clivar os peptídeos da resina é de 2-3 h, com um tempo de clivagem mais longo (mais de 5 h) tendendo a produzir mais subprodutos não identificados. A síntese peptídica pode ser monitorada por LC-MS para otimizar o tempo de clivagem. Em terceiro lugar, a marcação FITC deve ser feita no escuro para evitar a extinção da fluorescência.
Além disso, o azul de tripano deve ser usado para extinguir a fluorescência ligada à superfície, pois a análise por citometria de fluxo não pode distinguir fluorescência intracelular ou superficial. Isso ajudará a quantificar especificamente o peptídeo internalizado pelas células cancerosas27. Além disso, como peptídeos catiônicos também podem causar lise inespecífica de membrana30, a atividade hemolítica e a viabilidade celular também poderiam ser conduzidas para avaliar a toxicidade das PPCs cíclicas.
Os CPPs cíclicos constituem um dos veículos eficazes de liberação de fármacos para vencer barreiras biológicas. No entanto, a interação da membrana e a perturbação das PPCs catiônicas geralmente levam a potencial citotoxicidade inespecífica31. Esforços adicionais serão dedicados à compreensão do mecanismo detalhado de penetração, o que deve ajudar a descoberta da próxima geração de CPPs cíclicos para penetrar barreiras biológicas com o mínimo de citotoxicidade. Essas PPCs altamente ativas e estáveis são uma grande promessa para melhorar o tratamento de doenças importantes que ameaçam a vida.
Os autores não têm nada a revelar.
Este trabalho é apoiado pela Natural Science Foundation of China (21708031), China Postdoctoral Science Foundation (BX20180264, 2018M643519) e pelos Fundos de Pesquisa Fundamental para as Universidades Centrais (2682021ZTPY075).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1,2-ethanedithiol | Aladdin | K1722093 | stench |
2-(7-Azobenzotriazole)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate (HATU) | HEOWNS | A-0443697 | |
4,4'-bis(bromomethyl)biphenyl | TCI | B1921 | |
4T1 cells | ATCC | 4T1 cells were cultured in DMEM medium supplemented with 10% FBS (Hyclone) in a 37 °C humidified incubator containing 5% CO2. | |
Acetonitrile | Adamas | 1484971 | toxicity |
Dichloromethane | Energy | W330229 | skin harmful |
Diethyl ether | Aldrich | 673811 | flammable |
Dimethyl sulfoxide | Beyotime | ST038 | skin harmful |
Dulbecco’s Modified Eagle Medium (DMEM) | Gibco | ||
Electrospray Ionization Mass Spectrometer | Waters | G2-S Tof | |
Ethylene Diamine Tetraacetic Acid (EDTA) | BioFroxx | 1340 | |
Fetal bovine serum (FBS) | HyClone | ||
Flow cytometer | Beckman Coulter | CytoFLEX | |
Fluorescein isothiocyanate isomer (FITC) | Energy | E0801812500 | |
Fluorescent microscope | Carl Zeiss | Axio Observer 7 | |
Fmoc-Arg(Pbf)-OH | HEOWNS | F-81070 | |
Fmoc-Cys(Trt)-OH | GL Biochem | GLS201115-35202 | |
Fmoc-βAla-OH | Adamas | 51341C | |
HeLa cells | ATCC | HeLa cells were cultured in DMEM supplemented with 10% FBS (Hyclone) in a 37 °C humidified incubator containing 5% CO2. | |
High-Performance Liquid Chromatography | Agilent | Agilent 1260 | |
High-Performance Liquid Chromatography column | Agilent | Poroshell EC-C18 120, 4.6 × 150 mm (pore size 120 Å, particle size 4 μm) | |
Lyophilizer | SP Scientific | Vir Tis | |
Methanol | Aldrich | 9758 | toxicity |
Microtiter plate | Thermo μdrop plate | N12391 | |
Morpholine | HEOWNS | M99040 | irritant |
Multi-technology microplate reader | Thermo | VARIOSKAN LUX | |
N,N-Diisopropylethylamine | HEOWNS | E-81416 | irritant |
N,N-Dimethyl formamide | Energy | B020051 | harmful to skin |
Poly-Prep column | Bio-Rad | 7321010 | polypropylene chromatography columns |
Rink Amide MBHA resin (0.572 mmol/g) | GL Biochem | GLS180301-49101 | |
Three-way stopcocks | Bio-Rad | 7328107 | |
Tissue culture plate insert | LABSELECT | 14211 | |
Trifluoroacetic acid | HEOWNS | T63278 | corrosive |
Triisopropylsilane | HEOWNS | T-0284475 | |
Trypsin | BioFroxx | 1004 | |
Vacuum manifold | Promega | A7231 |
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