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このプロトコルでは、芳香族架橋を有する環状細胞透過性ペプチドの合成と、生物学的障壁を越えたそれらの透過性の評価について説明します。
がんは、グローバルヘルスにおける大きな課題となっています。しかし、複雑な腫瘍微小環境は一般に、より深い腫瘍細胞への治療薬のアクセスを制限し、腫瘍の再発につながります。生物学的障壁の限られた浸透を克服するために、優れた膜移行能力を有する細胞透過性ペプチド(CPP)が発見され、様々な貨物を細胞内に送達するための有用な分子輸送体として浮上している。ただし、従来の線形CPPは一般にタンパク質分解安定性の低下を示し、生物学的障壁を越えた透過性が制限されます。したがって、生物学的障壁を貫通し、タンパク質分解安定性を高めることができる新規分子トランスポーターの開発は、生物医学的用途における薬物送達効率を促進するために強く望まれています。我々は以前、芳香族架橋を有する短い環状CPPのパネルを合成し、それらの線状対応物と比較して癌細胞および組織において優れた透過性を示した。ここでは、蛍光標識された環状ポリアルギニンR8ペプチドおよびその直鎖状対応物の合成、ならびにそれらの細胞透過性を調べるための重要なステップについて、簡潔なプロトコルについて説明します。
過去数十年の間に、薬物送達用の細胞透過性ペプチド(CPP)の開発が急速に進歩してきました。CPPは、神経疾患1,2、心臓病3、糖尿病4、皮膚病5、および癌6,7を含む、生命を脅かすさまざまな疾患の治療のための分子輸送体として広く使用されています。がんは、広範な研究努力にもかかわらず、高い罹患率と死亡率を伴う世界的な健康上の負担であり続けています8。がん治療の深刻な障害は、コンパクトな細胞外マトリックス(ECM)、異常な腫瘍血管系、複数の膜バリア、高い間質液圧(IFP)などの生理学的障壁のために、より深い腫瘍細胞への治療薬のアクセスが制限されていることです9。したがって、生物学的障壁を越えて貨物を輸送する優れた能力を備えた新しいCPPを開発することは、癌治療に不可欠な戦略と考えられています10,11。
CPPは、物理化学的特性の観点から、カチオン性、両親媒性、疎水性のCPPに分類できます12。これらの中で、正に帯電したHIV-TATペプチドおよび合成ポリアルギニンは、生物医学研究において非常に重要であり、細胞内薬物送達を促進するために広く研究されている13。Tunnemannらは、R3〜R12ペプチドを用いて実施された細胞透過性試験に基づいて、合成ポリアルギニンペプチドの効率的な細胞浸透には最小長8個のアルギニンが不可欠であると報告した14。しかしながら、これらのCPPは、 一般に、in vivoで急速に加水分解するため、血漿半減期が短い。さらに、複数の細胞膜を貫通することは困難であるため、CPPのトランスバリア能を高めるためのCPPの化学構造の最適化についてはほとんど知られていない15。従って、薬物送達効率を高めるために生物学的障壁を透過することができる新規分子トランスポーターの開発が強く望まれている。2020年、Kominら16 は、上皮単層を通過するためのらせんモチーフ(RLLRLLR)とポリアルギニンテール(R7)を含むCLペプチドと呼ばれるCPPを発見しました。CLペプチド変異体のセットも、らせんパターンを改変することによって合成した。この探査は、生物学的障壁を越えて貨物を輸送するための新しいCPPの開発のための重要なガイドとなる可能性があります。さらに、DietrichらはStAXペプチドの細胞透過性を最適化し、ペプチドの全体的な疎水性を高めることによってWnt/β-カテニンシグナル伝達経路を阻害した17。
環化による非構造化直鎖状ペプチドの立体構造制限は、それらのタンパク質分解安定性および透過性を増強する有効な方法である18、19、20。構造強化は、環状ペプチドのプロテアーゼ耐性を増加させ、それらの線状対応物と比較してそれらをin vivoでより安定にする。加えて、ペプチドの環化は、分子内水素結合を促進することによって極性ペプチド骨格を潜在的にマスクすることができ、したがってペプチド21の膜透過性を増加させる。過去20年間で、化学選択的環化法は、全炭化水素、ラクタム、トリアゾール、m-キシレン、パーフルオロアリール、およびその他の架橋など、異なる構造を持つ環状ペプチドを構築するための効果的な戦略になりました22,23。洗練された腫瘍微小環境によって課せられる生物学的障壁は、固形腫瘍への薬物の浸透を減少させる可能性がある24。我々は以前に、環状CPPがそれらの線形対応物よりも酵素消化に対して優れた耐性を示すことを発見した20。さらに、ペプチドの全体的な疎水性は、それらの増強された細胞透過性にとって重要である22。上記の研究に基づいて、正に荷電したパターン、全体的な疎水性の上昇、およびタンパク質分解安定性の向上の組み合わせは、生物学的障壁を越えたCPPの透過性を高めると仮定することができます。最近の研究では、位置iおよびi+7に芳香族架橋を有する2つの環状CPPが同定され、それらの線形対応物と比較して腫瘍細胞および組織における透過性が改善されている15。ここでは、蛍光標識された環状CPPを合成するための簡潔な合成プロトコルと、それらの透過性を調べるための重要なステップを示します。
1.機器の準備
注意: 適切な個人用保護具を備えた操作ヒュームフードですべての手順を実行してください。
2. FITC標識直鎖状R8ペプチド(FITC-R8)およびFITC標識ステープルR8ペプチド(FITC-sR8-4)の合成
注:ペプチドは、標準的なFmocベースの固相ペプチド合成(SPPS)プロトコル25に従って合成されました。4-(2',4'-ジメトキシフェニル-Fmoc-アミノメチル)-フェノキシアセトアミド-ノルロイシル-MBHA樹脂(リンクアミドMBHA樹脂、 材料表を参照)を研究全体を通して使用しました。
注意: N、N-ジメチルホルムアミド(DMF)、N、N-ジイソプロピルエチルアミン(DIPEA)、モルホリン、およびジクロロメタン(DCM)はすべて無色であり、吸入または皮膚から吸収すると損傷します。エーテルは非常に可燃性です。1,2-エタンジチオール(EDT)は特に臭い物質です。トリフルオロ酢酸(TFA)は非常に腐食性が高く、その酸性度は酢酸の105 倍です。その結果、すべての試薬と化学物質は、ヒュームフード内の保護具を使用して処理されることになっています。
3. FITC標識ペプチドの定量
4. ウシ胎児血清(FBS)中のペプチドの安定性
5. ペプチドの細胞内取り込み
6. トランスウェルモデルを用いたペプチドの細胞間浸透の探索
このプロトコルでは、直鎖状ポリアルギニンR8をその環状形態に拘束するための合成手順が提示された。SPPSは、簡単な装置を使用して手動で実施されました(図1)。SPPSの詳細な合成プロセスを図2に示します。簡単に説明すると、樹脂を十分に膨潤させ、続いてN α-Fmoc保護基を脱保護した。次いで、N個のα−Fmoc保護アミノ酸を、ペプチドアセンブリが完了するまで樹脂上に固着させた(図2のステップ1〜4)。次いで、切断カクテルによって粗ペプチドを樹脂から切断した(図2の工程5)。FITCを使用してペプチドを標識し、蛍光標識された環状CPPを合成し、生物学的障壁を越えた透過性を追跡しました。続いて、システインのトリチル保護基を樹脂上で選択的に脱保護し、続いて4,4'-ビス(ブロモメチル)ビフェニル架橋でペプチド環化を行いました(図3A)。FITC-R8およびFITC-sR8-4のHPLCおよびMSスペクトルを図3Bに示す。FITC-sR8-4の保持時間は、直鎖状アナログの保持時間よりも大幅に長く、疎水性架橋による環化後のペプチドの全体的な疎水性の向上を示しました。さらに、図3Cに示すように、環状R8は25%FBSで4時間インキュベートした後も77.3%の無傷のままでしたが、直鎖状R8はほとんど分解されており、環状R8ペプチドのタンパク質分解安定性が向上していることが示唆されています。その後の細胞ベースの研究では、芳香族架橋を有する環状R8で処理した細胞は、生細胞蛍光顕微鏡イメージングによって実証されるように、その線形対応物で処理された細胞よりも高い細胞内蛍光を示した(図4A)。同様の結果がフローサイトメトリー分析でも得られた(図4B)。環状R8が細胞間浸透の増強をもたらすかどうかをさらに調査するために、トランスウェルモデルを使用して、ある細胞層から別の細胞層へのペプチドのバリア透過性をシミュレートしました。環状R8は、細胞内蛍光の有意な増加によって示されるように、線状R8ペプチドよりも明らかに高いトランスバリア透過性を示した(図4C)。要約すると、環状R8ペプチドは、その線状対応物よりも生物学的障壁を越えて優れた透過性を示した。
図1:手動ペプチド合成装置の装置セットアップ。 10 mLのポリプロピレンカラムは、三方ストップバルブを使用して真空マニホールドに設置されます。N2 は攪拌に使用される。 この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
図2:Fmoc固相ペプチド合成(SPPS)の一般的な手順。 N個のα-Fmoc保護アミノ酸を4-(2',4'-ジメトキシフェニル-Fmoc-アミノメチル)-フェノキシアセトアミド-ノルロイシル-MBHA樹脂(リンクアミドMBHA樹脂)に固定し(ステップ1)、続いてアミノ酸のN α-Fmoc保護基を脱保護し(ステップ2)、続いてアミノ酸カップリング(ステップ3)を行います。工程2と工程3を数回繰り返して、目的のペプチドを合成する(工程4)。合成の完了後、切断カクテルを添加して側鎖保護基を除去し、樹脂から所望のペプチドを切断する(ステップ5)。略語:DMF = N,N-ジメチルホルムアミド;DCM = ジクロロメタン;HATU = 2-(7-アゾベンゾトリアゾール)-N,N,N',N'-テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート;DIPEA = N,N-ジイソプロピルエチルアミン;TFA = トリフルオロ酢酸。この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
図3:固相ペプチド合成(SPPS)を用いたFITC標識直鎖状R8ペプチド(FITC-R8)およびFITC標識ステープルR8ペプチド(FITC-sR8-4)の合成。 (a)FITC-R8およびFITC-sR8-4の合成の模式図。(B)FITC-R8およびFITC-sR8-4のHPLCおよびMSスペクトル(挿入図)。(C)25%FBSの存在下でのFITC-R8およびFITC-sR8-4の安定性。インタクトペプチド(%)は、未分解ペプチドの画分を指す。この図はShiら15から修正されています。この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
図4:FITC標識直鎖状R8ペプチド(FITC-R8)およびFITC標識ステープルR8ペプチド(FITC-sR8-4)の浸透。 (A)3 μM FITC-R8およびFITC-sR8-4との1時間インキュベーション後のHeLa細胞および4T1細胞の生細胞蛍光顕微鏡画像。FITC(緑)、ヘキスト(青)。スケールバー= 20μm。 (B)相対平均蛍光(直鎖状R8ペプチドに関して)、平均±s.d.、およびn = 3;(C)HeLa細胞を用いたトランスウェルモデルにおけるFITC-R8およびFITC-sR8-4の細胞間浸透。生細胞蛍光顕微鏡画像(スケールバー= 20 μm)、および相対平均蛍光(直鎖状R8ペプチドに関して)、平均± s.d.、およびn = 3。** P < 0.01, *** P < 0.001.この図はShiら15から修正されています。この図の拡大版を表示するには、ここをクリックしてください。
立体配座制約を組み込むことによるペプチドの化学的安定化は、ペプチド26の安定性および細胞透過性を改善するための有効な戦略であることが証明されている。このプロトコルでは、芳香族架橋を有する環状CPPの合成および生物学的障壁を越えたそれらの透過性の評価のための段階的な手順が説明されている。親水性ラクタムまたはトリアゾール架橋22,27と比較して、芳香族架橋(この研究で使用される)の組み込みは、CPPの全体的な疎水性を改善し、それによってそれらの細胞透過性を有意に増加させる。一方、ペプチド環化は、金属触媒を必要とせずにシステインとの置換反応によって容易に達成することができる。このプロトコルでは、CPPの環化は樹脂上で行われました。しかしながら、環化効率は、立体効果のためにペプチドの特定の配列および長さにも依存し、これは二量体副産物28の形成をもたらし得る。このような場合は、積載量の少ない樹脂を使用すると便利です。さらに、溶液相29でこれらの特定のペプチドを希薄濃度で環化することも推奨される。
このプロトコルにはいくつかの重要なポイントがあります。まず、切断カクテルTFA/TIS/EDT/H 2 O(92.5/2.5/2.5/2.5, v/v/v/v)をシステイン含有ペプチドの切断に使用し、スルフヒドリル基の酸化を防止する。第二に、適切な切断条件を得るために小規模な予備調査を行うことが提案されています。樹脂からペプチドを切断するのに必要な最適時間は2〜3時間であり、より長い切断時間(5時間以上)は、より多くの未同定副産物を生成する傾向があります。ペプチド合成をLC-MSでモニターして、切断時間を最適化することができます。第三に、FITC標識は、蛍光消光を避けるために暗闇の中で行う必要があります。
さらに、フローサイトメトリー分析では細胞内蛍光と表面結合蛍光を区別できないため、表面結合蛍光を消光するためにトリパンブルーを使用する必要があります。これは、癌細胞27によってインターナライズされたペプチドを特異的に定量するのに役立つであろう。さらに、カチオン性ペプチドも非特異的膜溶解30を引き起こす可能性があるため、溶血活性および細胞生存率も実施して、環状CPPの毒性を評価することができます。
サイクリックCPPは、生物学的障壁を克服するための効果的な薬物送達手段の1つを構成します。しかしながら、カチオン性CPPの膜相互作用および摂動は、一般に、潜在的な非特異的細胞毒性をもたらす31。さらなる努力は、細胞毒性を最小限に抑えて生物学的障壁を貫通する次世代の環状CPPの発見に役立つはずの詳細な浸透メカニズムの理解に費やされる予定です。これらの非常に活性が高く安定したCPPは、生命を脅かす重要な疾患の治療を改善するための大きな期待を寄せています。
著者は開示するものは何もありません。
この研究は、中国自然科学基金会(21708031)、中国ポスドク科学基金会(BX20180264、2018M643519)、および中央大学の基礎研究基金(2682021ZTPY075)の支援を受けています。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1,2-ethanedithiol | Aladdin | K1722093 | stench |
2-(7-Azobenzotriazole)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate (HATU) | HEOWNS | A-0443697 | |
4,4'-bis(bromomethyl)biphenyl | TCI | B1921 | |
4T1 cells | ATCC | 4T1 cells were cultured in DMEM medium supplemented with 10% FBS (Hyclone) in a 37 °C humidified incubator containing 5% CO2. | |
Acetonitrile | Adamas | 1484971 | toxicity |
Dichloromethane | Energy | W330229 | skin harmful |
Diethyl ether | Aldrich | 673811 | flammable |
Dimethyl sulfoxide | Beyotime | ST038 | skin harmful |
Dulbecco’s Modified Eagle Medium (DMEM) | Gibco | ||
Electrospray Ionization Mass Spectrometer | Waters | G2-S Tof | |
Ethylene Diamine Tetraacetic Acid (EDTA) | BioFroxx | 1340 | |
Fetal bovine serum (FBS) | HyClone | ||
Flow cytometer | Beckman Coulter | CytoFLEX | |
Fluorescein isothiocyanate isomer (FITC) | Energy | E0801812500 | |
Fluorescent microscope | Carl Zeiss | Axio Observer 7 | |
Fmoc-Arg(Pbf)-OH | HEOWNS | F-81070 | |
Fmoc-Cys(Trt)-OH | GL Biochem | GLS201115-35202 | |
Fmoc-βAla-OH | Adamas | 51341C | |
HeLa cells | ATCC | HeLa cells were cultured in DMEM supplemented with 10% FBS (Hyclone) in a 37 °C humidified incubator containing 5% CO2. | |
High-Performance Liquid Chromatography | Agilent | Agilent 1260 | |
High-Performance Liquid Chromatography column | Agilent | Poroshell EC-C18 120, 4.6 × 150 mm (pore size 120 Å, particle size 4 μm) | |
Lyophilizer | SP Scientific | Vir Tis | |
Methanol | Aldrich | 9758 | toxicity |
Microtiter plate | Thermo μdrop plate | N12391 | |
Morpholine | HEOWNS | M99040 | irritant |
Multi-technology microplate reader | Thermo | VARIOSKAN LUX | |
N,N-Diisopropylethylamine | HEOWNS | E-81416 | irritant |
N,N-Dimethyl formamide | Energy | B020051 | harmful to skin |
Poly-Prep column | Bio-Rad | 7321010 | polypropylene chromatography columns |
Rink Amide MBHA resin (0.572 mmol/g) | GL Biochem | GLS180301-49101 | |
Three-way stopcocks | Bio-Rad | 7328107 | |
Tissue culture plate insert | LABSELECT | 14211 | |
Trifluoroacetic acid | HEOWNS | T63278 | corrosive |
Triisopropylsilane | HEOWNS | T-0284475 | |
Trypsin | BioFroxx | 1004 | |
Vacuum manifold | Promega | A7231 |
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