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Este protocolo describe la síntesis de péptidos cíclicos penetrantes de células con enlaces cruzados aromáticos y la evaluación de su permeabilidad a través de barreras biológicas.
El cáncer ha sido un gran desafío en la salud mundial. Sin embargo, el complejo microambiente tumoral generalmente limita el acceso de la terapéutica a las células tumorales más profundas, lo que lleva a la recurrencia del tumor. Para conquistar la penetración limitada de las barreras biológicas, se han descubierto péptidos de penetración celular (CPP) con excelente capacidad de translocación de membrana y han surgido como transportadores moleculares útiles para entregar diversas cargas a las células. Sin embargo, las CPP lineales convencionales generalmente muestran una estabilidad proteolítica comprometida, lo que limita su permeabilidad a través de las barreras biológicas. Por lo tanto, el desarrollo de nuevos transportadores moleculares que puedan penetrar las barreras biológicas y exhibir una mayor estabilidad proteolítica es muy deseado para promover la eficiencia de la administración de fármacos en aplicaciones biomédicas. Hemos sintetizado previamente un panel de CPP cíclicos cortos con enlaces cruzados aromáticos, que exhibieron una permeabilidad superior en células y tejidos cancerosos en comparación con sus contrapartes lineales. Aquí, se describe un protocolo conciso para la síntesis del péptido cíclico de poliarginina R8 marcado con fluorescencia y su contraparte lineal, así como los pasos clave para investigar su permeabilidad celular.
Las últimas décadas han sido testigos de rápidos avances en el desarrollo de péptidos de penetración celular (CPP) para la administración de fármacos. Los CPP se han utilizado ampliamente como transportadores moleculares para el tratamiento de una variedad de enfermedades potencialmente mortales, incluidos los trastornos neurológicos1,2, las enfermedades cardíacas3, la diabetes4, la dermatosis5 y el cáncer 6,7. El cáncer sigue siendo una carga sanitaria mundial acompañada de una alta tasa de morbilidad y mortalidad a pesar de los esfuerzos de investigación generalizados8. Un obstáculo serio para el tratamiento del cáncer es el acceso limitado de la terapéutica a las células tumorales más profundas debido a barreras fisiológicas como la matriz extracelular compacta (MEC), la vasculatura tumoral anormal, las barreras de membrana múltiple y la alta presión del líquido intersticial (IFP)9. Por lo tanto, el desarrollo de nuevos CPP con capacidad superior para entregar cargas a través de barreras biológicas se considera una estrategia esencial para el tratamiento del cáncer10,11.
Las CPP pueden clasificarse en CPP catiónicas, anfipáticas e hidrofóbicas en términos de sus propiedades fisicoquímicas12. Entre estos, el péptido VIH-TAT cargado positivamente y la poliarginina sintética son de considerable importancia en la investigación biomédica y han sido ampliamente estudiados para facilitar la administración intracelularde fármacos 13. Tunnemann et al. informaron que una longitud mínima de ocho argininas es esencial para la penetración celular eficiente de los péptidos sintéticos de poliarginina, basado en un estudio de permeabilidad celular realizado con péptidos R3 a R1214. Sin embargo, estos CPP generalmente tienen vidas medias plasmáticas cortas debido a su rápida hidrólisis in vivo. Además, se sabe poco sobre la optimización de la estructura química de los CPP para aumentar su capacidad de transbarrera, ya que es difícil penetrar múltiples membranas celulares15. Por lo tanto, el desarrollo de nuevos transportadores moleculares capaces de penetrar las barreras biológicas es muy deseado para mejorar la eficiencia de la administración de fármacos. En 2020, Komin et al.16 descubrieron un CPP llamado péptido CL, que contiene un motivo de hélice (RLLRLLR) y una cola de poliarginina (R7) para cruzar la monocapa epitelial. También se sintetizó un conjunto de variantes peptídicas CL alterando el patrón helicoidal. Esta exploración podría ser una guía importante para el desarrollo de nuevos CPP para la entrega de cargas a través de barreras biológicas. Además, Dietrich et al. optimizaron la permeabilidad celular del péptido StAX, inhibiendo la vía de señalización Wnt/β-catenina al aumentar la hidrofobicidad global de los péptidos17.
La restricción conformacional de péptidos lineales no estructurados por ciclación es una forma efectiva de mejorar su estabilidad proteolítica y permeabilidad18,19,20. El refuerzo estructural aumenta la resistencia a la proteasa de los péptidos cíclicos, haciéndolos más estables in vivo en comparación con sus contrapartes lineales. Además, la ciclación de péptidos puede potencialmente enmascarar la columna vertebral del péptido polar al promover el enlace de hidrógeno intramolecular, aumentando así la permeabilidad de la membrana de los péptidos21. En las últimas dos décadas, los métodos de ciclación quimioselectiva se han convertido en estrategias efectivas para la construcción de péptidos cíclicos con diferentes arquitecturas, como todo hidrocarburo, lactámico, triazol, m-xileno, perfluoroarilo y otros enlaces cruzados22,23. La barrera biológica impuesta por el sofisticado microambiente tumoral podría reducir la penetración de fármacos en tumores sólidos24. Hemos encontrado previamente que los CPP cíclicos mostraron una resistencia superior a la digestión enzimática sobre sus contrapartes lineales20. Además, la hidrofobicidad global de los péptidos es crítica para su mayor permeabilidad celular22. Sobre la base de los estudios discutidos anteriormente, se puede plantear la hipótesis de que la combinación de un patrón cargado positivamente, hidrofobicidad general elevada y estabilidad de proteólisis mejorada aumenta la permeabilidad de las CPP a través de las barreras biológicas. En un estudio reciente, identificamos dos CPP cíclicos con enlaces cruzados aromáticos en las posiciones i e i + 7 que exhiben una mejor permeabilidad en células y tejidos tumorales en comparación con sus contrapartes lineales15. Aquí, se presenta un protocolo sintético conciso para la síntesis de CPP cíclicos marcados con fluorescencia y los pasos clave para investigar su permeabilidad.
1. Preparación del equipo
NOTA: Realice todos los procedimientos en una campana extractora de humos de funcionamiento con el equipo de protección personal adecuado.
2. Síntesis del péptido R8 lineal marcado con FITC (FITC-R8) y el péptido R8 grapado marcado con FITC (FITC-sR8-4)
NOTA: Los péptidos se sintetizaron de acuerdo con un protocolo estándar de síntesis de péptidos en fase sólida (SPPS) basado en Fmoc25. La resina 4-(2',4'-Dimetoxipheyl-Fmoc-aminomethyl)-phenoxyacetamido-norleucyl-MBHA (resina MBHA de amida de pista, ver Tabla de materiales) se utilizó durante todo el estudio.
PRECAUCIÓN: N, N-dimetilformamida (DMF), N, N-diisopropiletilamina (DIPEA), morfolina y diclorometano (DCM) son incoloros y dañinos si se inhalan o absorben a través de la piel. El éter es extremadamente inflamable. El 1,2-Ethanedithiol (EDT) es una sustancia particularmente olorosa. El ácido trifluoroacético (TFA) es altamente corrosivo, y su acidez es 10a 5 veces mayor que la del ácido acético. En consecuencia, se supone que todos los reactivos y productos químicos deben tratarse utilizando equipos de protección en una campana extractora.
3. Cuantificación de los péptidos marcados con FITC
4. Estabilidad de péptidos en suero fetal bovino (FBS)
5. Captación celular de los péptidos
6. Exploración de la penetración de célula a célula de los péptidos utilizando modelos transwell
En este protocolo, se presentó un procedimiento sintético para restringir la poliarginina lineal R8 en su forma cíclica. El SPPS se realizó manualmente utilizando un aparato simple (Figura 1). El proceso sintético detallado de SPPS se muestra en la Figura 2. Brevemente, la resina estaba suficientemente hinchada, seguida de la desprotección del grupo protector de N α-Mmoc. Luego, el aminoácido protegido con N α-Fmoc se ancló en la resina hasta completar el ensamblaje del péptido (pasos 1-4 en la Figura 2). Luego, los péptidos crudos fueron escindidos de la resina por el cóctel de escisión (paso 5 en la Figura 2). FITC se utilizó para etiquetar los péptidos para sintetizar CPP cíclicos marcados con fluorescencia y rastrear su permeabilidad a través de las barreras biológicas. Posteriormente, los grupos protectores de tritilo de cisteínas se desprotegieron selectivamente en la resina, seguido de la ciclación peptídica con reticulación de 4,4'-bis(bromometil)bifenilo (Figura 3A). Los espectros HPLC y MS de FITC-R8 y FITC-sR8-4 se muestran en la Figura 3B. El tiempo de retención de FITC-sR8-4 fue sustancialmente más largo que el del análogo lineal, lo que indica una mayor hidrofobicidad general del péptido después de la ciclación con la reticulación hidrófoba. Además, como se muestra en la Figura 3C, el R8 cíclico permaneció intacto en un 77,3% después de la incubación con FBS al 25% durante 4 h, mientras que su contraparte lineal se degradó en su mayoría, lo que sugiere una mayor estabilidad proteolítica del péptido R8 cíclico. En los estudios posteriores basados en células, las células tratadas con R8 cíclico con reticulación aromática exhibieron una mayor fluorescencia intracelular que las tratadas con su contraparte lineal, como lo demuestran las imágenes de microscopía de fluorescencia de células vivas (Figura 4A). Se obtuvieron resultados similares con el análisis de citometría de flujo (Figura 4B). Para investigar más a fondo si el R8 cíclico confiere una mayor penetración de célula a célula, se utilizaron modelos transwell para simular la permeabilidad de barrera de los péptidos de una capa celular a otra. El R8 cíclico mostró claramente una mayor penetración transbarrera que el péptido lineal R8, como lo indica un aumento significativo en la fluorescencia intracelular (Figura 4C). En resumen, el péptido cíclico R8 exhibió una permeabilidad superior a través de las barreras biológicas sobre su contraparte lineal.
Figura 1: Configuración del equipo para el aparato manual de síntesis de péptidos. Se instala una columna de polipropileno de 10 ml en el colector de vacío mediante una válvula de cierre de tres vías. N2 se utiliza para la agitación. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Figura 2: Procedimiento general de síntesis de péptidos en fase sólida Fmoc (SPPS). Un aminoácido protegido con N α-Fmoc se ancla a la resina 4-(2',4'-Dimetoxipheyl-Fmoc-aminomethyl)-phenoxyacetamido-norleucyl-MBHA (resina MBHA de amida de pista) (paso 1), seguido de la desprotección de los grupos protectores de Nα-Fmoc de los aminoácidos (paso 2) y el acoplamiento posterior de aminoácidos (paso 3). El paso 2 y el paso 3 se repiten varias veces para sintetizar el péptido deseado (paso 4). Después de completar la síntesis, se agrega un cóctel de escisión para eliminar los grupos protectores de la cadena lateral y escindir el péptido deseado de la resina (paso 5). Abreviaturas: DMF = N, N-dimetilformamida; MCD = diclorometano; HATU = 2-(7-azobenzotriazol)-N, N, N', N'-tetrametiluronio hexafluorofosfato; DIPEA = N, N-diisopropiletilamina; TFA = ácido trifluoroacético. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Figura 3: Síntesis del péptido R8 lineal marcado con FITC (FITC-R8) y el péptido R8 grapado marcado con FITC (FITC-sR8-4) utilizando la síntesis de péptidos en fase sólida (SPPS). (A) Diagrama esquemático de la síntesis de FITC-R8 y FITC-sR8-4. (B) Espectros HPLC y MS (recuadro) de FITC-R8 y FITC-sR8-4. (C) Estabilidad de FITC-R8 y FITC-sR8-4 en presencia de 25% FBS. El péptido intacto (%) se refiere a la fracción de péptido no degradado. Esta figura ha sido modificada de Shi et al.15. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Figura 4: Penetración del péptido R8 lineal marcado con FITC (FITC-R8) y el péptido R8 grapado marcado con FITC (FITC-sR8-4). (A) Imágenes de microscopía de fluorescencia de células vivas de células HeLa y células 4T1 después de 1 h de incubación con 3 μM FITC-R8 y FITC-sR8-4. FITC (verde), Hoechst (azul). Barra de escala = 20 μm. (B) Fluorescencia media relativa (con respecto al péptido lineal R8), media ± s.d., y n = 3; (C) Penetración de célula a célula de FITC-R8 y FITC-sR8-4 en un modelo transwell utilizando células HeLa. Imágenes de microscopía de fluorescencia de células vivas (barra de escala = 20 μm) y fluorescencia media relativa (con respecto al péptido lineal R8), media ± s.d., y n = 3. ** P < 0,01, *** P < 0,001. Esta figura ha sido modificada de Shi et al.15. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
La estabilización química de péptidos mediante la incorporación de restricciones conformacionales ha demostrado ser una estrategia eficaz para mejorar la estabilidad y permeabilidad celular del péptido26. En este protocolo, se describe un procedimiento paso a paso para la síntesis de CPP cíclicos con enlaces cruzados aromáticos y la evaluación de su permeabilidad a través de barreras biológicas. En comparación con los enlaces cruzados hidrofílicos lactámicos o triazoles22,27, la incorporación de enlaces cruzados aromáticos (utilizados en este estudio) mejora la hidrofobicidad general de los CPP, aumentando significativamente su permeabilidad celular. Por otro lado, la ciclación peptídica se puede lograr fácilmente a través de reacciones de sustitución con cisteínas sin requerir ningún catalizador metálico. En este protocolo, la ciclación de los CPPs se realizó sobre resina; Sin embargo, la eficiencia de ciclación también depende de las secuencias y longitudes específicas de los péptidos debido a los efectos estéricos, que pueden resultar en la formación de un subproducto dimérico28. En tal caso, sería útil usar una resina con una capacidad de carga menor. Además, también se recomienda ciclar estos péptidos específicos bajo concentraciones diluidas en la fasede solución 29.
Hay algunos puntos críticos en este protocolo. En primer lugar, el cóctel de escisión TFA/TIS/EDT/H 2 O (92.5/2.5/2.5/2.5, v/v/v/v) se utiliza para la escisión de péptidos que contienen cisteína para prevenir la oxidación del grupo sulfhidrilo. En segundo lugar, se sugiere realizar un estudio preliminar a pequeña escala para obtener la condición de escisión adecuada. El tiempo óptimo requerido para escindir los péptidos de la resina es de 2-3 h, con un tiempo de escisión más largo (más de 5 h) que tiende a producir más subproductos no identificados. La síntesis de péptidos podría ser monitoreada por LC-MS para optimizar el tiempo de escisión. En tercer lugar, el etiquetado de FITC debe hacerse en la oscuridad para evitar el enfriamiento de la fluorescencia.
Además, el azul de tripano debe usarse para apagar la fluorescencia ligada a la superficie, ya que el análisis de citometría de flujo no puede distinguir la fluorescencia intracelular o ligada a la superficie. Esto ayudará a cuantificar específicamente el péptido internalizado por las células cancerosas27. Además, como los péptidos catiónicos también pueden causar lisis de membrana no específica30, la actividad hemolítica y la viabilidad celular también podrían llevarse a cabo para evaluar la toxicidad de los CPP cíclicos.
Los CPP cíclicos constituyen uno de los vehículos eficaces de administración de fármacos para conquistar las barreras biológicas. Sin embargo, la interacción de la membrana y la perturbación de las CPP catiónicas generalmente conducen a una posible citotoxicidad no específica31. Se dedicarán más esfuerzos a comprender el mecanismo de penetración detallado, que debería ayudar al descubrimiento de la próxima generación de CPP cíclicos para penetrar las barreras biológicas con una citotoxicidad mínima. Estos CPP altamente activos y estables son muy prometedores para mejorar el tratamiento de enfermedades importantes que amenazan la vida.
Los autores no tienen nada que revelar.
Este trabajo cuenta con el apoyo de la Fundación de Ciencias Naturales de China (21708031), la Fundación de Ciencias Postdoctorales de China (BX20180264, 2018M643519) y los Fondos de Investigación Fundamental para las Universidades Centrales (2682021ZTPY075).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1,2-ethanedithiol | Aladdin | K1722093 | stench |
2-(7-Azobenzotriazole)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate (HATU) | HEOWNS | A-0443697 | |
4,4'-bis(bromomethyl)biphenyl | TCI | B1921 | |
4T1 cells | ATCC | 4T1 cells were cultured in DMEM medium supplemented with 10% FBS (Hyclone) in a 37 °C humidified incubator containing 5% CO2. | |
Acetonitrile | Adamas | 1484971 | toxicity |
Dichloromethane | Energy | W330229 | skin harmful |
Diethyl ether | Aldrich | 673811 | flammable |
Dimethyl sulfoxide | Beyotime | ST038 | skin harmful |
Dulbecco’s Modified Eagle Medium (DMEM) | Gibco | ||
Electrospray Ionization Mass Spectrometer | Waters | G2-S Tof | |
Ethylene Diamine Tetraacetic Acid (EDTA) | BioFroxx | 1340 | |
Fetal bovine serum (FBS) | HyClone | ||
Flow cytometer | Beckman Coulter | CytoFLEX | |
Fluorescein isothiocyanate isomer (FITC) | Energy | E0801812500 | |
Fluorescent microscope | Carl Zeiss | Axio Observer 7 | |
Fmoc-Arg(Pbf)-OH | HEOWNS | F-81070 | |
Fmoc-Cys(Trt)-OH | GL Biochem | GLS201115-35202 | |
Fmoc-βAla-OH | Adamas | 51341C | |
HeLa cells | ATCC | HeLa cells were cultured in DMEM supplemented with 10% FBS (Hyclone) in a 37 °C humidified incubator containing 5% CO2. | |
High-Performance Liquid Chromatography | Agilent | Agilent 1260 | |
High-Performance Liquid Chromatography column | Agilent | Poroshell EC-C18 120, 4.6 × 150 mm (pore size 120 Å, particle size 4 μm) | |
Lyophilizer | SP Scientific | Vir Tis | |
Methanol | Aldrich | 9758 | toxicity |
Microtiter plate | Thermo μdrop plate | N12391 | |
Morpholine | HEOWNS | M99040 | irritant |
Multi-technology microplate reader | Thermo | VARIOSKAN LUX | |
N,N-Diisopropylethylamine | HEOWNS | E-81416 | irritant |
N,N-Dimethyl formamide | Energy | B020051 | harmful to skin |
Poly-Prep column | Bio-Rad | 7321010 | polypropylene chromatography columns |
Rink Amide MBHA resin (0.572 mmol/g) | GL Biochem | GLS180301-49101 | |
Three-way stopcocks | Bio-Rad | 7328107 | |
Tissue culture plate insert | LABSELECT | 14211 | |
Trifluoroacetic acid | HEOWNS | T63278 | corrosive |
Triisopropylsilane | HEOWNS | T-0284475 | |
Trypsin | BioFroxx | 1004 | |
Vacuum manifold | Promega | A7231 |
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