Method Article
* Estes autores contribuíram igualmente
Os astrócitos ladrilho o córtex cerebral uniformemente, tornando a análise de sua morfologia complexa desafiadora a nível celular. O protocolo aqui fornecido usa rotulagem multicolorida baseada na eletroporação uterónica para destacar os astrócitos corticais e analisar seu volume e morfologia com um pipeline de análise de imagem fácil de usar.
Os astrócitos protoplasmáticos (ARP) localizados no córtex cerebral do rato são fortemente justtaposed, formando uma matriz tridimensional aparentemente contínua em estágios adultos. Até agora, nenhuma estratégia de imunossuagem pode desopara-los e segmentar sua morfologia em animais maduros e ao longo da corticogênese. A PrA cortical é originária de progenitores localizados no pálio dorsal e pode ser facilmente direcionada usando na eletroporação uterótica de vetores integrativos. Um protocolo é apresentado aqui para rotular essas células com a estratégia de marcadores de cor multiadaturar genomas (MAGIC), que conta com transposição piggyBac/Tol2 e recombinaçãocre/lox para expressar estochasticamente proteínas fluorescentes distintas (azul, ciano, amarelo e vermelho) dirigidas a compartimentos subcelulares específicos. Esta estratégia de mapeamento de destino multicolorido permite marcar em locais progenitores cortical próximos com combinações de marcadores de cor antes do início da gliogênese e rastrear seus descendentes, incluindo astrócitos, de estágios embrionários a adultos no nível celular individual. A rotulagem semi-esparsa obtida pelo ajuste da concentração de vetores eletroporados e contrastes de cores fornecidos pelos Marcadores de Cores Multiadutáveis (Marcadores MÁGICOs ou MM) permitem individualizar os astrócitos e destacar seu território e morfologia complexa, apesar de seu denso arranjo anatômico. Apresentado aqui está um fluxo de trabalho experimental abrangente, incluindo os detalhes do procedimento de eletroporação, aquisição de pilhas de imagens multicanais por microscopia confocal e segmentação tridimensional assistida por computador que permitirá ao experimentador avaliar o volume e a morfologia individuais da RPA. Em resumo, a eletroporação de Marcadores MÁGICOs fornece um método conveniente para rotular individualmente numerosos astrócitos e ter acesso às suas características anatômicas em diferentes estágios de desenvolvimento. Esta técnica será útil para analisar propriedades morfológicas de astrócito cortical em vários modelos de camundongos sem recorrer a cruzes complexas com linhas de repórter transgênicas.
Os astrócitos desempenham inúmeras funções vitais no desenvolvimento cerebral e fisiologia1. Além de seu papel na barreira hemencefálica onde regulam a absorção de nutrientes e o fluxo sanguíneo, eles contribuem ativamente para a formação e função da sinapse, produzindo neuromoduladores que podem alterar a atividade neuronal e o comportamento2. Além disso, a disfunção astrócito contribui para uma variedade de distúrbios neurológicos3. Astrócitos localizados no córtex cerebral exibem uma morfologia elaborada permitindo um contato extensivo com processos neuronais. Esses contatos, essenciais para a função do circuito, também controlam morfogênese de astrócito e sinápgeno através das proteínas de adesão celular4. Neurocientistas precisam de ferramentas convenientes e robustas para investigar o desenvolvimento de astrócitos e morfogênese em seus modelos neurológicos de interesse. No entanto, devido à aposição próxima de astrócitos aos seus vizinhos e seu uniforme azulejo tridimensional, é desafiador destacar os astrócitos corticais e avaliar integralmente sua morfologia usando imunomarcadores.
Atualmente, duas principais estratégias de engenharia genética permitem a rotulagem e individualização de astrócitos corticais in situ: ativação esparsa de repórteres em linhas de camundongos transgênicos ou transgênese somática usando eletroporação de plasmídeos repórteres. A primeira estratégia conta com a criação de uma linha de rato repórter floxed com camundongos expressando uma forma indutível de recombinase cre ativada especificamente em astrócitos após a entrega de tamoxifen (por exemplo, Aldh1l1-CreERT25). Várias desvantagens estão associadas a essa estratégia. Em primeiro lugar, a criação de camundongos transgênicos requer um grande número de animais e vários ensaios são tipicamente necessários para determinar a dose adequada de tamoxifen para fornecer rotulagem adequadamente escassa de astrócitos corticais. Analisar fenótipos de astrócitos cortical em um modelo genético de interesse do rato exigirá ainda mais reprodução e consumo de camundongos. Além disso, na injeção de tamoxifen uterina é conhecida por interferir na parturição, dificultando a aplicação dessa estratégia ao estudo dos estágios iniciais do desenvolvimento de astrócitos. A eletroporação in vivo de DNA é uma estratégia alternativa livre de tamoxifen que conta com um número mínimo de animais6. Realizada em estágios embrionários ou pós-natais, esta abordagem consiste em injetar plasmídeos repórteres nos ventrículos laterais de roedores seguidos por pulsos elétricos que criam poros na membrana celular, permitindo assim que o DNA entre células progenitoras que revestem o ventrículo. Posteriormente, os transgênicos repórteres transportados pelos plasmídeos eletroporados são processados pelo maquinário celular alvo e expressos7. Dois métodos de eletroporação foram descritos anteriormente para rotular os astrócitos cortical do rato: 1) Rotulagem de Astrocitos Pós-Natais por Eletroporação (PALE), que se baseia na eletroporação de plasmídeos epismídeos episômicos de 1 a 2 no estágio pós-natal4; 2) A estratégia StarTrack baseada na eletroporação utero (IUE) de múltiplos plasmídeos integrativos de cor única plasmids8,9,10. Embora essas duas técnicas rotulem eficientemente a A PR no córtex cerebral, elas também apresentam algumas limitações. Em sua versão inicial, ambos os métodos contam com um promotor de proteína ácida fibrilar gliarial (GFAP) para conduzir a expressão em astrócitos, o que pode influenciar a rotulagem em direção à glia radial, bem como astrócitos pial e reativos que expressam GFAP mais fortemente do que o repouso normal pra11,12. Em relação ao PALE, outras desvantagens são o estágio tardio da eletroporação, que impede a rotulagem de PrA (ou aqueles originários de progenitores delatórios precoces) e análise dos estágios iniciais do desenvolvimento da astroglia, e o uso de vetores episomais que se diluem através de sucessivas divisões durante a proliferação maciça que a A PR sofre durante a primeira semana pós-natal13,14. Em contraste com o PALE, StarTrack é baseado na eletroporação embrionária de plasmídeos integrativos repórteres que permitem rastrear a contribuição de progenitores embrionários e pós-natais para a PrA. Um esquema startrack atualizado que conta com o promotor ubiquitina C (UbC-StarTrack) alcança uma expressão mais ampla de repórteres fluorescentes tanto na descida neuronal quanto gliana (astrócitos incluídos) dos progenitores neurais15,16,17. No entanto, em sua versão atual, a implementação dessa abordagem é complexa, pois conta com uma mistura equimolar de 12 plasmídeos distintos expressando seis proteínas fluorescentes (FP) com excitação parcial e emissão de espectros sobrepostos.
Apresentado aqui é um método simples de rotulagem multicolorida baseada em eletroporação utero usando construções integrativas de repórteres impulsionadas por um promotor forte e amplamente ativo para destacar osstrócitos cortical14. Além disso, um fácil pipeline de análise de imagem utilizando tanto o software de análise de imagens licenciado (por exemplo, Imaris) quanto o acesso aberto (Vaa3D18,19,20) software de análise de imagens é fornecido para segmentar volume territorial de astrócito e arborização, respectivamente. Em comparação com os métodos descritos anteriormente, esta estratégia se baseia unicamente em transgênicos integrativos multicoloridos Marcadores de cores multiaddressáveis (Marcadores MÁGICOs ou MM21) direcionados ao compartimento celular citoplasmável e (opcionalmente) cuja expressão é impulsionada por um promotor de CAG sintético composto por um intensificador de cytomegalovirus, promotor de β-actina de coelho e β-globina-globinadecoelho Isso permite rotular e rastrear os astrócitos corticais, desde estágios embrionários até estágios pós-natais tardios, independente da expressão GFAP14,23. Cada um desses transgenes possui os seguintes quatro FP distintos: eBFP, mTurquoise2/mCerulean, EYFP e tdTomato/mCherry, que exibem sobreposição espectral mínima que pode ser facilmente contornada com 1) Aquisição de canais sequenciais; 2) Poder de excitação otimizado e ganho de arrecadação; e 3) Filtrosdicróicos específicos para coletar janelas estreitas de emissão de FP. A estratégia MM usa a recombinaçãocre/lox com uma recombinase Cre auto-excisível (seCre) para conduzir a expressão estocástica de FP em uma população celular. Uma única cópia de MM transgene expressa FP de forma mutuamente exclusiva, enquanto vários transgenes dão origem a combinações fp, criando dezenas de matizes distintos. A integração genômica dos transgênicos é impulsionada pelo sistema de transposição piggyBac (PB) ou Tol224,25,26. Portanto, através da eletroporação utero, o kit de ferramentas MM e o 'mosaico' multicolorido que ele gera permitem a marcação simultânea de múltiplos progenitores cortical adjacentes e o rastreamento de sua descida gliana, incluindo astrócitos corticais, por longos períodos. Contrastes de cor resultantes da expressão de delineamento distinto da licença FP do contorno da Af e, posteriormente, extraem informações-chave sobre seu volume territorial (usando IMARIS) e morfologia complexa (usando Vaa3D). A estratégia multicolorida apresentada em detalhes aqui é um método conveniente e robusto que dá acesso rápido e fácil à superfície do astrócito cortical e à morfologia em camundongos do tipo selvagem em vários estágios de desenvolvimento, e é facilmente adaptável para investigar características anatômicas de astrócitos em modelos de camundongos de doenças neurológicas sem o uso de linhas de repórter transgênicas.
Todos os procedimentos animais descritos aqui foram realizados de acordo com as diretrizes institucionais. Os protocolos animais foram aprovados pelo conselho ético de experimentação animal de Charles Darwin (CEEACD/N°5).
1. Preparação de plasmídeos livres de endotoxinas para marcadores MÁGICOS na eletroporação uteral
2. Preparação para marcadores MÁGICOS na eletroporação uteral (MM IUE)
3. Na eletroporação uterótera (IUE)
4. Colheita e secção de tecidos
5. Imagem confocícal multicanal
6. Segmentação de volume territorial de Astrócito
NOTA: Isso é realizado por meio de um programa de software comercial (por exemplo, IMARIS).
7. Traçando arborização de astrócitos
NOTA: Isso é feito usando o programa de software de acesso aberto Vaa3D.
Eletroporação de marcadores MÁGICOS em progenitores cortical embrionários permite a rotulagem de astrócitos desde estágios iniciais até os estágios finais do desenvolvimento do córtex cerebral(Figura 1). Estes astrócitos foram encontrados em todas as camadas corticais em vários estágios pós-natais (P4, P7, P21) enquanto se dispersavam amplamente em todo o córtex cerebral. Foram avaliadas com imagens confocal adquiridas com um objetivo 20x 0.8 NA (ou superior NA) e montadas como reconstruções de pilha de Z(Figura 2). Mágica Marcadores de rotulagem combinatória permitiram a individualização de astrócitos cortical e a extração de informações sobre seu volume e morfologia. Utilizando o software de análise de imagens comerciais, o contorno dos astrócitos individuais foi delineado em cada seção óptica individual das pilhas de imagens confocal para segmentar e reconstruir o domínio territorial ocupado por cada astrócito(Figura 3). A partir das mesmas pilhas de imagem Z, a morfologia ramificada dos astrócitos cortical escolhidos foi segmentada utilizando-se o software de acesso aberto que permite a extração do esqueleto dos principais processos de astrócitos(Figura 4). Essas ferramentas de segmentação e rastreamento forneceram uma avaliação semiquantitativa do aumento do volume territorial (Figura 3) e da complexidade morfológica(Figura 4) que ocorreu para os astrócitos cortical individuais dos estágios pós-natal14. Essas abordagens também revelaram a heterogeneidade do volume e da morfologia exibida por distintos astrócitos cortical no mesmo estágio de desenvolvimento, como ilustrado na Figura 2, Figura 3e Figura 4.
Figura 1: Representação esquemática de Marcadores MÁGICOS (MM) na eletroporação uteral (IUE) para rotular progenitores corticais e sua descida durante o desenvolvimento cerebral. (A) O kit de ferramentas MM compreende vários plasmídeos codificando PB-Cytbow, Tol2-Nucbow, PB e Tol2 transposases, e auto-excisável Cre recombinase (seCre). Em construções MM, três pares de sites lox incompatíveis (loxN, lox2272e loxP) flanqueiam quatro sequências distintas de codificação FP (EBFP2, mTurquoise2/mCerulean, EYFP, tdTomato/mCherry) e criam possibilidades mutuamente exclusivas de excisão sobre a recombinação da Cre. Antes da ação da Cre, apenas o primeiro gene (EBFP2) é expresso. Após a excisão mediada por Cre induzida pelo seCre, é expressado tdTomato/mCherry (FP vermelho), EYFP (FP verde) ou mTurquoise2/mCerulean (cyan FP). A co-expressão de FP a partir de várias cópias de marcadores MÁGICOs produz combinações de cores no citoplasma (PB-CAG-Cytbow) ou núcleo (Tol2-CAG-Nucbow) de células rotuladas. Pb e Tol2 transposição endfeet enquadrando as fitas MM permitem sua integração no genoma de progenitores corticais quando construções MM são coeletrizadas juntamente com pb e tol2 transposas codificadores plasmídeos de codificação. (B-G) Ilustração gráfica da IUE sucessivos passos, incluindo a laparotomia de camundongos gestantes anestesiados(B),injeção da mistura de plasmídeos MM(C)nos ventrículos laterais dos embriões(D),entrega de pulsos elétricos através de pinças cuidadosamente posicionadas(E)para atingir progenitores corticais em um dos dois hemisférios cerebrais(F),e suturação de abdômen de rato gestante(G). Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Figura 2: Seguindo na eletroporação uteral do kit de ferramentas magic markers, astrócitos multicoloridos foram encontrados espalhados em todo o córtex cerebral em estágios pós-natais. IUE de plasmídeos dirigindo mm, seCre, PB e tol2 transposas expressão em progenitores cortical de mouse E15.5 resultou na rotulagem de neurônios e astrócitos de camada 2-3 em P4, P7 e P21. O nível de expressão e a paleta de cores dependiam do número de transgênicos MM integrados no genoma dos progenitores corticais. Montagem de projeções de intensidade máxima de pilhas de imagens confocal de ladrilhos adquiridas em seções cerebrais sagitas de 80 μm. Barra de escala: 200 μm. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Figura 3: Segmentação do domínio territorial de astrócito cortical em diferentes estágios de desenvolvimento. Projeções de intensidade máxima de z-stack confocal cropped enquadrando astrócitos individuais(A-F) e seu domínio territorial associado segmentados com o software comercial (A'-F)em três estágios distintos de desenvolvimento: P4 (A-B, A'-B'), P7(C-D, C'-D)) e P21(E-F, E'-F),respectivamente. Barra de escala: 20 μm. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Figura 4: Rastreamento da arborização de astrócito cortical. Exemplos de dois astrócitos distintos cortados de pilhas Z confocal(A-D) e reconstrução de sua arborização grosseiramente segmentada com Vaa3D(A'-D)coletados em dois estágios distintos de desenvolvimento: P7 (A-B, A'-B)e P21(C-D, C'-D),respectivamente. Barra de escala: 20 μm. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
No ute eletroporation (IUE) de marcadores MÁGICOS em progenitores corticais(Figura 1) permitiram a rotulagem de astrócitos em todo o córtex cerebral pós-natal em diferentes estágios pós-natais (P4-P7-P21, Figura 2). Curiosamente, o estágio da IUE não é crítico, pois a eletroporação realizada de E13,5 a E15,5 produz padrões de rotulagem semelhantes em relação aos astrócitos cortical14. No entanto, a localização de neurônios piramidais rotulados no parenchyma cortical varia com o estágio de eletroporação. De fato, a IUE realizada em E15 marca a camada 2-3 neurônios, enquanto a IUE realizada no E13 rotula neurônios piramiptários em todas as camadas corticais, da camada 5 à camada 2-36,27. Esta rotulagem articular de neurônios cortical piramifetal após a IUE MM é a principal limitação deste método, pois impede a segmentação semiautomada da morfologia de astrócito em camadas onde a rotulagem neuronal densa interfere no reconhecimento de processos astrócitos. Se isso for um problema, o MM pode ser eletroporado em estágios pós-natal como em PALE. Na P4, a rotulagem de fibras radiais glia ainda presentes nessa fase também pode interferir na segmentação de arborização Vaa3D. Embora complicado, uma solução se quiser prosseguir com a reconstrução da árvore de astrócito nesta fase é remover manualmente fibras gliais radiais, substituindo progressivamente o sinal de fibra radial por pixels pretos ao redor do astrócito de interesse usando o Adobe Photoshop.
Apesar dessa limitação, a IUE MM é uma técnica poderosa quando adequadamente realizada. Algumas etapas críticas precisam ser tratadas com cuidado: 1) os embriões devem ser mantidos úmidos durante todo o procedimento cirúrgico e cuidadosamente manipulados para aumentar sua sobrevivência; 2) o uso de capilares de vidro com um diâmetro grande ou sacos embrionários muito apertados pode levar à ruptura do saco e, portanto, à morte dos embriões; 3) durante a injeção de DNA, os vasos sanguíneos devem ser evitados para evitar sangramento; 4) todo o procedimento não deve durar mais de 40 minutos da anestesia à sutura, a fim de maximizar a sobrevivência dos embriões; 5) o estresse desempenha um papel crítico no sucesso da IUE e, portanto, fontes extras de estresse, como mudança de gaiola, transporte, ruídos e vibração devem ser evitadas de 5 dias antes da cirurgia até 7 dias após o nascimento, a fim de prevenir o aborto e o canibalismo.
Note-se que os experimentadores que desejam segmentar especificamente células nascidas em um determinado estágio podem usar o kit de ferramentas MM sem adicionar os transposases de piggyBac e Tol2, de tal forma que apenas as células nascidas no momento da eletroporação expressam os rótulos combinatórios. Outra vantagem do método é a flexibilidade que confere em termos da densidade de células rotuladas e sua localização em várias regiões cerebrais. De fato, a rotulagem mais densa de astrócitos cortical pode ser alcançada aumentando a concentração total de transgênicos MM, mantendo a proporção de plasmídeos constante (proporção de 1:10 para construtos de recombinase/MM de Cre e proporção de 1:2 para construtos transposases/MM). Ao contrário de abordagens monocromáticas, como a eletroporação de transposons de cor única ou eletroporação de Cre em camundongos Ai9, onde a capacidade de destacar astrócitos individuais requer rotulagem esparsa, contrastes de cores oferecidos pela estratégia MAGIC Markers permitem a individualização de astrócitos sobre uma ampla gama de densidades de rótulos. Além disso, o posicionamento das sondas de eletrodos em orientações distintas permite atingir regiões cerebrais distintas, como o estriado prospectivo (ânodo na posição ventral, oposto à posição dorsal necessária para alcançar eletroporação no córtex cerebral), ou hipocampo (ânodo em posição medial)28. Finalmente, a IUE pode ser realizada em diferentes cepas de camundongos, como os camundongos de raça outbred (OF1, suíço) e inbred (C57BL/6J ou N), o que abre caminho para o uso do kit de ferramentas MM em modelos de doenças animais transgênicas. No entanto, para alcançar com sucesso iUE em camundongos de raça, deve-se adaptar o número de pulsos (três pulsos para C57BL/6 camundongos versus cinco pulsos em suíço), tensão (30 V em vez de 35 V) e dose analgésico (0,15 mg/mL buprenorphine stock solução e um volume injetado de 0,8 μL/g BW).
Em comparação com a criação de animais transgênicos ou as abordagens PALE e StarTrack, este método oferece várias vantagens. Para começar, ao contrário da estratégia de reprodução, utiliza poucos animais. Também permite a rotulagem de astrócitos corticais desde os estágios iniciais de seu desenvolvimento, incluindo estágios embrionários, ao contrário do PALE4, que conta com a eletroporação pós-natal. Além disso, em comparação com as doze construções de repórteres utilizadas na abordagem StarTrack 8 , essa estratégia conta comapenasdois transgênicos multicoloridos, tornando a preparação e a imagem da mistura de DNA mais simples. Além disso, o equilíbrio entre as diferentes cores estochasticamente expressas pelo MM é intrinsecamente determinado pela estrutura dos transgenes e não depende da mistura de diferentes componentes pelo experimentador. Além disso, essa estratégia pode ir além da simples consideração anatômica e pode ser aplicada com sucesso para análise multiclonal do desenvolvimento de astrócitos, como demonstrado no trabalho publicado anteriormente14. Este trabalho, utilizando raras combinações de cores de marcadores citoplasmáticos e nucleares para definir clones de astrócitos corticais, demonstrou que eles exibem ampla variabilidade em termos de distribuição espacial, organização estrutural, número e subtipo de células geradas.
Os astrócitos cortical nascidos de progenitores cortical rotulados por MM apresentaram contraste de cor significativo e se dispersaram amplamente por todo o córtex cerebral(Figura 2). Aquisições simples de pilha Z multicanal usando microscopia confocal foram utilizadas para acessar características-chave de astrócito, como seu volume territorial (Figura 3) e sua complexidade morfológica(Figura 4) em vários estágios pós-natais. Além dos astrócitos, essa metodologia pode ser adaptada para estudar a morfologia de outras células gliais, como os oligodendrócitos. No entanto, deve-se ter em mente que a resolução limitada oferecida pela microscopia confocal só pode fornecer uma renderização parcial da complexidade morfológica de astrócito. Enquanto imagens obtidas com maior resolução (por exemplo, 63x 1.4 NA oil objective) e algoritmos de desconvolução podem ser usados para reconstruir detalhes mais finos das arbordas de astrócitos14, os melhores processos não podem ser resolvidos com imagens ópticas convencionais. No entanto, a estratégia aqui apresentada será de interesse para a triagem eficiente para um potencial fenótipo que afeta o volume de astrócito cortical ou morfologia em modelos de camundongos de doenças neurológicas.
Os autores não têm nada a revelar.
Agradecemos a S. Fouquet e as instalações de imagem e núcleo animal do Institut de la Vision e Institut des Neurosciences de Montpellier (RM e RAM) pela assistência técnica. Este trabalho foi apoiado por bolsas de Estudos de Région Ile-de-France e Fondation ARC pour la Recherche sur le Cancer to S.C, e da Université Paris-Saclay (Iniciativas Doutores Interdisciplinares) a L.A., por meio de financiamento do European Research Council (ERC-SG 336331, PI J. Valette) para E.H., pela Agence Nationale de la Recherche sob contratos ANR-10-LABX-65 (LabEx LifeSenses), ANR-11-EQPX-0029 (Equipex Morphoscope2), ANR-10-INBS-04 (France BioImaging) , por Fondation pour la Recherche Médicale (Ref. DBI20141231328), pelo Conselho Europeu de Pesquisa (ERC-CoG 649117, PI J. Livet) e pelo programa ATIP-Avenir (PI K. Loulier).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1.1 Bacteria transformation | |||
Ampicillin | Euromedex | EU0400-C | |
DH5 alpha competent cells | Fisher Scientitic | 11563117 | |
Ice box | Dutscher | 139959 | |
Kanamycin | Sigma | 60615 | |
LB Agar | Sigma | L2897 | |
SOC medium | Fisher Scientitic | 11563117 | |
Sterile petri dish- 10 cm | Thermo Fisher | 150350 | |
Water bath | VWR | 462-0556H | |
1.2 Plasmid culture | |||
14 ml culture tube | Dutscher | 187262 | |
Glass erlenmeyer- 2L | Fisher Scientitic | 11383454 | |
LB medium | Sigma | L3522 | |
1.3 Plasmid DNA preparation | |||
NucleoBond Xtra Maxi Plus EF | Macherey-Nagel | 740426.10 | |
2.1 Preparation of the solutions | |||
26 G x 1/2 needle | Terumo | 8AN2613R1 | |
30 G x 1/2 needle | Terumo | 8AN3013R1 | |
Fast Green | Sigma Aldrich | F7272 | |
NaCl | VWR | 27810.295 | |
Single-use polypropylene syringe, 1 mL | Dutscher | 50002 | |
2.2 Preparation of the surgery material | |||
Adson Forceps - DeBakey Pattern- 12.5 cm | FST | 11617-12 | |
Arched tip Forceps- 10 cm | FST | 11071-10 | |
Glass bead sterilizer Steri 250 | Sigma | Z378569 | |
Glass micropipette 1 mm diameter | FHC | 10-10-L | |
Graefe Forceps - Titanium 1 mm Tips Slight Curve- 10 cm | FST | 11651-10 | |
Graefe Forceps - Titanium 1 mm Tips Straight- 10 cm | FST | 11650-10 | |
Iris Scissors - Delicate Straight- 9 cm | FST | 14060-09 | |
Laboratory tape | Fisher Scientitic | 11730454 | |
Microinjector | INJECT+MATIC | No catalog number | |
Olsen-Hegar Needle Holder - 12 cm | FST | 12002-12 | |
Optical fiber | VWR | 631-1806 | |
Plastic-coated white paper | Distrimed | 700103 | |
Signagel electrode gel | Free-Med | 15-60 | |
Sterile Petri dish- 35 mm | Dutscher | 056714 | |
Sterilizer, glass dry bead, Steri 250 | Sigma | Z378569 | |
2.3 Preparation of the pregnant female mouse | |||
Alcohol pad | Alcomed | 1731000 | |
Buprecare | Axience | 0.3 mg/ml | |
Compress | tRAFFIN | 70189 | |
Ketamine | Merial | Imalgene 1000 | |
Ocular gel | tvm lab | Ocry-gel | |
RjOrl:SWISS mice | Janvier Labs | ||
Vetadine, 10% solution | Vetoquinol | 4337400113B | |
Warming pad | Harvard Apparatus | 72-0493 | |
Xylazine | Bayer | Rompun 2% | |
3.2 Electroporation | |||
Absorbable suture Size 4-0 45 cm Suture 1-Needle 19 mm Length 3/8 Circle Reverse | Novosyn | C0068220 | |
Electroporateur Sonidel | Sonidel | NEPA 21 | |
Sterile transfer pipets (individually wrapped) | Dutscher | 043202S | |
Tweezers with 3 mm platinium disk electrodes | Sonidel | CUY650P3 | |
4.1 Tissue harvesting and sectioning | |||
24-well plate | Falcon | 353047 | |
Agarose | Lonza | 50004 | |
Antigenfix | Microm Microtech | U/P0014 | |
Coverslip | Dutscher | 100266 | |
Dolethal | Vetoquinol | DOL202 | |
DPBS (10X), no calcium, no magnesium | Fisher Scientific | 11540486 | |
Nail polish | EMS | 72180 | |
Slide | Dutscher | 100001 | |
Vectashield | Vectorlabs | H-1000 | |
Vibratome | Leica | VT1000S | |
5. Multichannel confocal imaging | |||
20X oil NA 0.85 | Olympus | ||
Confocal Laser Scanning Microscope | Carl Zeiss | LSM880 | |
Confocal Laser Scanning Microscope | Olympus | FV1000 | |
Plan Apochromat 20x/0.8 M27 | Carl Zeiss | ||
6. Astrocyte territorial volume segmentation | |||
IMARIS 8.3 and later versions | Bitplane | ||
7. Astrocyte arborization tracing | |||
3D Visualization-Assisted Analysis software suite (Vaa3D) | HHMI - Janelia Research Campus /Allen Institute for Brain Science |
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