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Milhões de pessoas sofrem de doenças degenerativas da retina que resultam em cegueira irreversível. Um elemento comum de muitas dessas doenças é a perda de células ganglionares da retina (RGCs). Este protocolo detalhado descreve o isolamento de RGC murinos primários por seleção positiva e negativa com citometria de fluxo.
As doenças neurodegenerativas muitas vezes têm um impacto devastador sobre os afetados. A perda de células ganglionares retinianas (RGC) está implicada em uma série de doenças, incluindo retinopatia diabética e glaucoma, além do envelhecimento normal. Apesar da sua importância, os RGCs têm sido extremamente difíceis de estudar até agora devido em parte ao fato de que eles compreendem apenas uma pequena porcentagem da grande variedade de células na retina. Além disso, os métodos de isolamento atuais usam marcadores intracelulares para identificar RGCs, que produzem células não viáveis. Essas técnicas também envolvem longos protocolos de isolamento, portanto, há uma falta de métodos práticos, padronizados e confiáveis para obter e isolar RGCs. Este trabalho descreve um método eficiente, abrangente e confiável para isolar RGC primários de retinae de camundongos usando um protocolo baseado em critérios de seleção positivos e negativos. Os métodos apresentados permitem o estudo futuro de RGCs, com o objetivo de melhor compreender o maiorDeclínio na acuidade visual que resulta da perda de RGCs funcionais em doenças neurodegenerativas.
Os RGCs são neurônios terminalmente diferenciados e, portanto, células primárias são necessárias para a experimentação. O desenvolvimento de um protocolo para isolamento e enriquecimento de células de gânglios retinianos murinos primários (RGCs) é fundamental para revelar os mecanismos de saúde e degeneração de RGC in vitro . Isto é especialmente importante para estudos que buscam gerar terapias potenciais para promover a função RGC e para minimizar sua morte. A degeneração de RGCs está associada a doenças degenerativas da retina, como glaucoma, retinopatia diabética e envelhecimento normal. Embora os mecanismos celulares específicos subjacentes à perda de RGC não estejam claros, uma série de fatores de risco foram identificados. A falta de oxigenação na cabeça do nervo óptico 1 , 2 , 3 causa a morte RGC 4 e atua como o distúrbio da homeostase entre a ativação de excitatório e iReceptores nibitórios dentro de RGCs individuais 5 , 6 . Uma série de desafios impede o progresso no sentido do uso dessas células para estudos aprofundados. Primeiro, o número de RGCs presentes em uma retina murina é pequeno. Os RGCs representam menos de 1% das células da retina 7 , 8 , 9 . Em segundo lugar, a maioria dos marcadores específicos de RGC são proteínas intracelulares 10 , 11 , 12 . A seleção com base nesses marcadores deixa as células não viáveis, o que impede análises funcionais a jusante. Finalmente, os protocolos atualmente disponíveis são longos e falta padronização 13 , 14 . Os protocolos de isolamento RGC precoce basearam-se em métodos de imunoparingologia. Barres et al. 15 Adaptou o immunop clássicoE acrescentou um segundo passo, que excluiu os monócitos e as células endoteliais da maior parte das células da retina antes da seleção positiva com base na imunopositividade ao antígeno anti-timócito (também conhecido como Thy1), um marcador de superfície celular. Anos mais tarde, Hong et al. Técnicas combinadas de isolamento de grânulos magnéticos com estratégias de triagem celular para isolar RGC com maior pureza 16 . O uso de pérolas magnéticas ainda é usado em muitas aplicações científicas. Juntos, os grânulos magnéticos e os protocolos de citometria de fluxo melhoraram a pureza das células isoladas. No entanto, estes sistemas de purificação ainda não foram padronizados para o isolamento de RGC murinos a partir de retina dissociada.
A citometria de fluxo é um poderoso método analítico que mede as características ópticas e fluorescentes das suspensões celulares. As células são analisadas quantitativa e qualitativamente com um alto nível de sensibilidade, fornecendo uma análise multidimensional da população celularAtion. A discriminação celular baseia-se em duas propriedades físicas principais: tamanho da célula ou área de superfície e granularidade ou complexidade interna 17 . Uma análise multidimensional pode ser realizada combinando anticorpos marcados com fluorocromos que possuem comprimentos de onda de excitação semelhantes e diferentes emissões. A citometria de fluxo é rápida, reproduzível e sensível. Os laseras Multitpe permitem análises multidimensionais ainda maiores de células individuais por citometria de fluxo. Assim, é uma metodologia atraente para o estudo de espécimes citológicos. A classificação de células ativadas por fluorescência (FACS) usa as diferenças fenotípicas multidimensionais identificadas pela citometria de fluxo para classificar células individuais em subpopulações distintas.
Na última década, múltiplas proteínas superficiais e intracelulares foram identificadas como biomarcadores potenciais para a seleção de células, incluindo neurônios. Estudos iniciais que procuraram isolar RGCs de ratos usaram Thy1 como um ganglion celL marcador. Infelizmente, Thy1, também conhecido como CD90, tem múltiplas isoformas em outras espécies de roedores 18 , 19 , 20 e é expresso por vários tipos de células da retina 19 , 20 , tornando-se um marcador não específico para RGCs. Outro marcador de superfície, CD48, é encontrado em populações monocíticas na retina, incluindo macrófagos e microglia. Usando estes dois marcadores de superfície, uma assinatura RGC modificada - células Thy1 + e CD48 neg - foi desenvolvida 15 , 16 , 21 , 22 . Infelizmente, esses dois critérios de seleção não são suficientes para selecionar uma população RGC altamente enriquecida. Para resolver esta necessidade não atendida, foi desenvolvido um protocolo de citometria de fluxo 23 com base em critérios de seleção positiva e negativa de várias camadas usiNg conhecidos marcadores de superfície celular para enriquecer e purificar RGCs murinos primários.
Todos os procedimentos detalhados no seguinte protocolo foram aprovados pelo conselho de avaliação institucional do Comité de Consumo e Uso Animal (IACUC) do Centro de Ciências da Saúde da Universidade do Tennessee (UTHSC) e seguiram a Associação para Pesquisa em Visão e Oftalmologia (ARVO) Declarações para o Uso De Pesquisa de Animais em Oftálmica e Visão, além das diretrizes para experimentos em laboratório de animais (Instituto de Recursos de Laboratório de Animais, Política de Serviço de Saúde Pública sobre Cuidados Humanos e Uso de Animais de Laboratório).
1. Preparação de instrumentos, soluções e mídia
Nota: Todas as informações sobre materiais, reagentes, ferramentas e instrumentos relatados no protocolo estão especificadas na Tabela de Materiais .
2. Enucleação
Nota: Um número total de 10 ratos jovens (5-7 semanas de idade) C57BL / 6J foram utilizados nesta experiência para isolar 1,0 x 10 6 RGCs com o fenótipo CD90.2 + CD48 neg CD15 neg CD57 neg .
3. Preparação da Suspensão da Célula Retinal
4. Immunomarcando o ReCélulas tinal
5. Estratégia de classificação de células
Nota: Instruções específicas para a configuração do instrumento para FACS com 355 nm, UV; 405 nm, violeta; 488 nm, azul; E 640 nm, lasers vermelhos com distribuição de canal de fluorescência 2, 2, 5 e 3, respectivamente. O software operacional foi DIVA versão 8.0.1. A classificação das células foi realizada com um bocal de 70 μm, pressão de bainha de 70 psi, freqüência de 87,5, amplitude de 48,6 com queda de primeira queda em 333, vazamento de 6, classificação de precisão ajustada para a pureza de quatro vias com máscara de pureza padrão (32) e queda Atraso ajustado para 42,98 usando esferas.
7. Validação da classificação de células por análise de qPCR
Nota: veja a Figura 4 .
O estudo aprofundado de RGCs é impedido por muitos fatores, incluindo sua baixa freqüência e a falta de uma metodologia robusta e padronizada para seu isolamento. A Figura 1 mostra a metodologia utilizada para isolamento de retina. As variações no procedimento de enucleação existem com base no tipo de análise, como se a enucleação faz parte da experimentação in vivo 27 . A enucleação neste protocolo é realizada em ratinhos eutanizados. Conforme mostrado na Figura 1A- B , a pinça é colocada sob o olho e puxada para causar sangramento mínimo e para remover um globo ocular com um nervo óptico intacto.
Existem diferenças no número de RGCs em diferentes cepas de mouse, especialmente em camundongos geneticamente alterados 23 , 28 ,A consciência dessas diferenças é importante ao determinar o número de camundongos a serem utilizados. Retinae de ratos C57BL / 6J antigos tem menos células retinianas vivas do que as contrapartes mais jovens 23. Portanto, a dissecção da retina deve ser cuidadosamente realizada para Maximizar o rendimento das células. Um procedimento passo-a-passo para a dissecção da retina é apresentado na Figura 1C- J . As células da retina são frágeis. Assim, as retina dissecadas são colocadas em filtros de nylon e são maceradas com a extremidade traseira de uma seringa, como Mostrado na Figura 2A , ou com um pilão para filtros celulares. A maceração de células diretamente no filtro celular é rápida e reduz os aglomerados celulares. Uma imagem representativa da suspensão celular é ilustrada na Figura 2B . Podem visualizar-se várias células retinais internas. Neste ponto, os RGC perderam seu morfo de assinaturaDevido à axotomia durante o isolamento celular e à preparação da suspensão celular.
O passo mais intensivo em mão-de-obra desta metodologia é a configuração de classificação de células. Esta fase é um passo crítico durante os FACS multicoloridos, pois maximiza a resolução de sinal para ruído. A Figura 3A mostra a estratégia de gating utilizada para o isolamento de RGCs. Esta estratégia visou a remoção de células contaminantes da suspensão celular, que incluía células monocitárias, gliais, amacrinas e fotorreceptoras. Como parte da metodologia, os marcadores de superfície adicionais foram confirmados por análise imuno-histoquímica antes de serem utilizados como parte da estratégia de exclusão. Os dados anteriores demonstraram que uma pequena porcentagem de células CD90.2 + são CD48 + . A exclusão dessas células removeu monócitos e possivelmente microglia do grupo de células retinae. Foi mostrado anteriormente que o clássico Thy1 + CD48 neg o fenótipo superficial não é suficiente para identificar e isolar RGCs murinos 23 , uma vez que estas células expressam genes associados com amitrina, Müller, fotorreceptor bipolar, fotoreceptor horizontal e células epiteliais de pigmento da retina ( Figura 4A ). Isso também é abordado pela investigação de marcadores adicionais para exclusão celular. CD15 foi descrito como um marcador de células amacrinas e bipolares 31 , levando seu uso como marcador adicional para seleção negativa. Trabalho de Uusitalo et al. 32 descreveram CD57 como um marcador de identificação para células gliais e fotorreceptores. Portanto, este anticorpo foi adicionado à estratégia de triagem celular.
Em seguida, essas células foram caracterizadas para validar a metodologia para o isolamento de RGC murinos. Os fenótipos do CD90.2 + CD48 neg CD15 neg células CD57 neg classificadas ( Figura 3B) foram avaliados quanto à expressão dos seguintes marcadores intracelulares associados a RGCs 10 , 11 , 12 , 33 : SNCG, BRN3A, TUJ1 e RBPMS. Conforme mostrado na Figura 3C , as células classificadas expressaram as quatro proteínas intracelulares associadas ao RGC. Em seguida, a citometria de fluxo de imagem foi usada na Figura 3D para mostrar a localização intracelular de RBPMS e a expressão da superfície celular de CD90.2. Estes resultados foram testados em múltiplos sistemas de citómetro, confirmando a reprodutibilidade e a padronização. Conforme mostrado na Figura 3E , algumas das células ordenadas começaram a mostrar a morfologia associada aos RGC após a cultura celular in vitro .
Por fim, uma comparação de células antes do enriquecimento e pós-ceA análise foi realizada pela análise qPCR. Comparação do fenótipo Thy1 + CD48 neg ao CD90.2 + CD48 neg O CD15 neg CD57 neg classificou células revelou que o Thy1 + CD48 neg fenótipo expressa genes associados com RGCs, mas também com outras células da retina. No entanto, a população de células triadas altamente enriquecidas ( Figura 4B ) mostrou um aumento muito frequente nos genes que codificam os marcadores intracelulares específicos de RGC Sncg (SNCG), Pouf4l (BRN3A), Tubb3 (TUJ1) e Rbpms (RBPMS). Coletivamente, as avaliações de mRNA e proteína validadaram a metodologia.
Figura 1 . Enucleação e dissecção ocular para isolamento da retina. Os jovens ratinhos C57BL / 6J foram eutanizados antes de tO remoção do globo ocular com CO 2 e deslocamento cervical. A) Coloque a pinça sob o olho e puxe o olho em um movimento. B) O olho é removido, incluindo o nervo óptico. CJ) Guia passo a passo para remover a retina. C) Uma punção é realizada usando uma agulha 30G antes da remoção da córnea para permitir que o humor aquoso saia do olho. D) A córnea é mantida com fórceps para fazer uma pequena incisão. EF) O uso de fórceps permite a descolagem da córnea, epitélio pigmentar da retina, coróide e esclerótica. A retina é separada da esclerótica, enrolada e removida. G) A lente é removida e descartada. HJ) As retina recolhidas são colocadas em um pequeno prato contendo PBS / 1% FBS para mantê-los úmidos em todos os momentos. Clique aqui para ver uma versão maior destefigura.
Figura 2 . Suspensão da célula retiniana após a maceração das retina recolhidas. As retina recolhidas são colocadas em um pequeno prato para isolar as células. A) Retinae são colocados em um filtro de nylon de 70 μm e são macerados usando o back-end de uma seringa. B) Imagem representativa da suspensão celular, onde são observadas células retinianas distintas. A barra de escala é de 10 μm.
Figura 3 . Estratégia de classificação para o isolamento de células com CD90.2 + CD48 neg CD15 neg CD57 neg Phenotype e análise pós-triagem. A estratégia de classificação baseia-se na inclusão de células CD90.2 e na exclusão de células positivas para CD48, CD15 e CD57, que são células contaminantes. A) Como um primeiro passo, tamanho da parcela (FSC) e complexidade interna (SSC) para obter uma visão geral da população de células. A população inicial fechada (P1) é usada para discriminar entre células únicas e células ou agregados agrupados usando o SSC-height (H) versus a largura (W), P2. A seleção das células individuais é usada para escolher as células negativas CD90.2 + CD48. Para confirmar a remoção de todos os dupletos, um traçado de FSC-H versus FSC-W é executado, P3 (painel do meio ). As células foram marcadas com CD90.2 conjugado anti-rato conjugado com AF700, CD15 conjugado anti-rato conjugado com PE-Cyanine7, CD15 conjugado com PE e CD57 anti-rato. Como um anticorpo secundário para marcar o CD57 anti-rato, foi utilizado o BV421 anti-rato. A população 3 (P3) foi plotada no quarto </ Em> para selecionar as células negativas CD90.2 + CD48, removendo a maioria das células contaminantes. Em seguida, um gráfico CD57 versus CD15 é gerado usando as células negativas CD90.2 + CD48 selecionadas. Quadrante 4 (Q4) é selecionado, pois representa as células negativas CD90.2 + CD48 negativas para CD15 e CD57. O fenótipo resultante da população fechada é CD90.2 + CD48 neg CD15 neg CD57 neg . B) Análise pós-ordenação dos marcadores de superfície usados em A). As células classificadas são de tamanho homogêneo, como mostrado no primeiro painel. Os histogramas subsequentes mostram a porcentagem de cada marcador de superfície usado na estratégia de classificação detalhada em A). Um total de 95% das células são CD90.2 + , como mostrado na linha preta em comparação com o controle de Ig, representado pelo histograma sólido. Essas células foram fechadas para avaliar as porcentagens de CD48, CD15 e CD57, representadas pelo vermelho, o azul e o greeN linhas, respectivamente. Os resultados mostram a expressão mínima desses marcadores de superfície celular. C) Confirmação do fenótipo RGC usando os marcadores intracelulares específicos de RGC SNCG, BRN3A, TUJ1 e RBPMS. As linhas negras representam a porcentagem de células que expressam cada marcador intracelular. D) Imagens representativas tiradas em um classificador de células de imagem mostrando a localização intracelular de RBPMS, um marcador intracelular específico de RGC e o marcador de superfície celular CD90.2. A barra de escala é de 20 μm. E) Imagem representativa de RGCs ordenados após 24 h em cultura usando um microscópio confocal. A barra de escala é de 20 μm. As imagens BE são adaptadas do trabalho previamente publicado com permissão 23 . As imagens DE foram tomadas em 20X. Clique aqui para ver uma versão maior dessa figura.
Figura 4 . Análise de mRNA pré e pós-classificação. As células Thy1 + CD48 neg e triadas com o fenótipo CD90.2 + CD48 neg CD15 neg CD57 neg foram avaliadas por análise de qPCR usando um painel de 25 genes expressos pelas células da retina. Os níveis de expressão de genes alvo são apresentados como uma mudança de Log 2 usando Hprt como um gene de limpeza e água como um controle negativo. O cálculo foi feito com base no método ΔC T. Média ± SEM; N = 3 repetições biológicas foram realizadas em triplicado. Figuras obtidas do trabalho anteriormente publicado com permissão 23 .
FACS é a técnica de escolha para purificar populações celulares. Outros métodos de isolamento incluem imunopanning, esferas magnéticas e depleção de fixação do complemento. A vantagem do FACS sobre essas outras metodologias baseia-se na identificação simultânea de marcadores de superfície celular com diferentes graus de intensidade. A intensidade fluorescente da molécula é proporcional à quantidade de expressão da proteína. Até agora, o isolamento de RGCs baseava-se unicamente na positividade Thy1 (CD90) e na negatividade CD48 15 , 16 , 22 , 34 , independentemente do método de isolamento utilizado. Foi recentemente demonstrado que o fenótipo Thy1 + CD48 neg não é suficiente para isolar uma população homogénea de células que expressam marcadores intracelulares RGC 23 . A identificação da população RGC é essencial para o seu isolamento, em particularE porque eles compreendem uma pequena porcentagem de células da retina 7 , 8 , 9 . A maioria dos RGCs está localizada na camada mais interna da retina, enquanto um pequeno número está localizado nas camadas plexiformes internas (RGCs 35 deslocadas). Assim, o rastreamento de RGCs da collicina superior por injeções estereotáxicas e rastreamento com hidroxistilbamidina (um rastreador retrógrado para descrever neurônios) tornou-se opções atraentes para muitos laboratórios 36 , 37 , 38 . Esses sistemas exigem a injeção do traçador, o que, se não for realizado corretamente, pode levar a algumas regiões retinianas deixadas sem cicatrização. Além disso, são mais exigentes tecnicamente e, como outras metodologias, como a imunoparingologia, são longas. A imunopanagem usando os anticorpos anti-Thy1 e -CD48 leva 48 h para completar e não atinge mais de 95% De pureza. Este trabalho descreve uma metodologia baseada em FACS que oferece um protocolo rápido e reprodutível para isolar uma população homogênea de RGCs vivos com CD90.2 + CD48 neg CD15 neg CD57 neg fenótipo, sem o uso de traçadores, esferas magnéticas ou técnicas de imunopanagem .
Os seguintes fatores são necessários para o isolamento bem sucedido de RGCs puros por FACS: 1) eficiência de classificação, que depende muito do equipamento utilizado; 2) combinação ótima de fluorocromos marcados com anticorpos, para minimizar o ruído; E 3) configuração de classificação de células. A eficiência de classificação é calculada tomando o número de eventos alvo selecionados para classificação dividido pelo número de eventos alvo detectados, expressos em porcentagem. A eficiência de classificação é um cálculo fornecido pelo equipamento. Essa eficiência depende da configuração do sistema de classificação e do modo de classificação celular. Escolher uma combinação ótima de fluoroquromes é um processo complexo. Cada gripeO orochrome tem propriedades distintas e é caracterizado por seus comprimentos de onda de excitação e emissão. Enquanto a excitação é lida com um laser, a emissão é lida por tubos fotomultiplicadores, que são limitados pelos filtros ópticos disponíveis no equipamento de classificação FACS. Aqui, é fornecida uma combinação de fluoroquromos marcados com anticorpos PE, PE-Cyanine7, AF700 e BV421. Isto foi determinado depois de considerar múltiplas combinações de fluorochrome que proporcionaram a melhor resolução ao mesmo tempo em que reduzem a sobreposição espectral. Por fim, a configuração do tipo é crítica. Em geral, as células da retina são frágeis. Assim, é melhor usar uma pressão menor para executar as amostras, para minimizar o estresse nas células. É fundamental manter a amostra a 4 ° C, porque manter RGC murinos por longos períodos de tempo à temperatura ambiente pode reduzir o rendimento celular, especialmente quando se classificam grandes quantidades de células.
A classificação baseada em FACS é uma metodologia ideal para o isolamento de células que compõem avPequena porcentagem da suspensão celular. O processo, desde a dissecção da retina até a conclusão da triagem celular, leva aproximadamente 5 a 6 h, em comparação com os sistemas de imunopantes e traçadores, que levam dias para serem concluídos. A análise multidimensional de FACS ea capacidade do equipamento para coletar várias populações viáveis permitem análises funcionais adicionais de células. O protocolo descrito aqui é uma ferramenta poderosa para o isolamento de RGC murinos primários. Apesar de suas múltiplas vantagens, incluindo sua sensibilidade, reprodutibilidade e a identificação imediata de células viáveis, existem algumas limitações. Em primeiro lugar, requer uma instrumentação cara e um operador altamente treinado. Normalmente, o operador é um imunologista ou um indivíduo altamente treinado no campo, com quem é necessário atender no momento da instalação da experiência. Hoje em dia, as instalações acadêmicas possuem múltiplas instalações essenciais, o que pode facilitar a realização desses tipos de experiências. Em segundo lugar, os RGC perdem a sua forçaMorfologia pical devido à atoxomia, tornando-os muito pequenos em tamanho. Neste momento, não se sabe se alguns de seus genes podem ser modulados devido a atoxomia.
A metodologia apresentada aqui permite a análise a jusante da função RGC in vitro e é uma ferramenta valiosa para ser utilizada nos campos das ciências visuais e da saúde. A manutenção da produção de células ganglionares no cérebro é necessária para a percepção visual e está em risco em múltiplas doenças. Essas células podem ser usadas para experimentação in vitro controlada, tanto em modelos saudáveis como em modelos de doenças. Estudos eletrofisiológicos, farmacológicos, bioquímicos e moleculares podem ser realizados nessas células, o que é ideal para o desenvolvimento de futuros alvos terapêuticos.
Os autores declaram que não têm interesses financeiros concorrentes.
Os autores agradecem ao Sr. Tim Higgins, Ilustrador Sénior do Departamento de Microbiologia, Imunologia e Bioquímica, para assistência técnica em vídeo; Dr. Matthew W. Wilson para discussões e os membros dos laboratórios Jablonski e Morales-Tirado por seus comentários úteis. Este trabalho foi apoiado pelo Alcon Research Institute Young Investigator Award (VMM-T), a Fundação de Pesquisa da Universidade do Tennessee (VMM-T), o National Eye Institute EY021200 (MMJ), o Gerwin Fellowship (VMM-T); A Gerwin Pre-doctoral Fellowship (ZKG), o Departamento de Defesa Army Medical Research and Materiel Command (VMM-T), e a concessão irrestrita da pesquisa para prevenir a cegueira.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Anti-mouse CD15 PE | BioLegend | 125606 | Clone MC-480 |
Anti-mouse CD48 PE-Cy7 | BioLegend | 103424 | Clone HM48-1 |
Anti-mouse CD57 | Sigma Aldrich | C6680-100TST | Clone VC1.1 |
Anti-mouse CD90.2 AF700 | BioLegend | 105320 | Clone 30-H12 |
Brilliant Violet 421 Goat Anti-mouse IgG | BioLegend | 405317 | Clone Poly4053 |
Purified Anti-mouse CD16/32 | BioLegend | 101302 | FcgRII/III block, Clone 93 |
Zombie Aqua | BioLegend | 423102 | Live cell/ Dead cell discrimination |
Fetal Bovine Serum | Hyclone | SH30071.03 | U.S. origin |
AbC Total Antibody Compensation Bead Kit | Thermo Fisher Scientific | A10497 | Multi-species Ig |
Neurobasal Medium | Thermo Fisher Scientific | 21103049 | Add serum to media prior to culture. |
Phosphate-Buffered Saline (PBS) | Thermo Fisher Scientific | 10010049 | Saline solution |
Dissection Microscope | Olympus | SZ-PT Model | Stereo Microscope |
Sorvall Centrifuge | Thermo Scientific | ST 16R | All centrifugation performed at RT |
Base Plate – Dissection Pan | Fisher Scientific | SB15233FIM | A wax plate can also be used |
Forceps | Aesculap | 5002-7 | 4 ½ inches |
Iris Scissors, Straight | Aesculap | 1360 | 5 ½ inches |
Falcon 15 mL conical tubes | Fisher Scientific | 352097 | Polypropylene tubes |
Falcon 50 mL conical tubes | Fisher Scientific | 352098 | Polypropylene tubes |
BD FACS Tubes | Fisher Scientific | 352003 | Polypropylene tubes |
40 mm dishes | MidSci | TP93040 | Tissue culture treated |
70 μm nylon strainer | MidSci | 70ICS | sterile |
40 μm nylon strainer | MidSci | 40ICS | sterile |
BD 10 mL syringe | Fisher Scientific | 301604 | Disposable Syringe without needle |
Pestles | MidSci | PEST | sterile |
Wheaton Vials | Fisher Scientific | 986734 | No Liner |
BD 30 G needle | Fisher Scientific | 305128 | 1 inch |
Hausser Scientific Bright-Line Glass Counting Chamber | Fisher Scientific | 0267151B | Hemocytometer |
Gibco Trypan blue 0.4% Solution | Fisher Scientific | 15250061 | Viability Dye |
Eppendorf tubes | Fisher Scientific | 05-402-25 | 1.5mL |
EVOS Floid Cell Imaging | Thermo Fisher Scientific | 447113 | Fluorescence Imaging with a 20X objective |
100% Ethanol | Fisher Scientific | 04-355-452 | Used to make 70% Ethanol |
Pipet-Lite LTS Pipette L-1000XLS+ | Rainin | 17014282 | LTS Pipette |
Pipet-Lite LTS Pipette L-200XLS+ | Rainin | 17014391 | LTS Pipette |
Pipet-Lite LTS Pipette L-20XLS+ | Rainin | 17014392 | LTS Pipette |
Rack LTS 1000 mL – GPS-L1000S | Rainin | 17005088 | Blue Rack Sterile Tips |
Rack LTS 250 mL – GPS-L250S | Rainin | 17005092 | Green Rack Sterile Tips |
Rack LTS 20 mL – GPS-L10S | Rainin | 17005090 | Red Rack Sterile Tips |
FACSAria II Cell Sorter | BD Biosciences | N/A | Custom order |
LSR II Cytometer | BD Biosciences | N/A | Custom order |
Abca8a | Thermo Fisher Scientific | Mm00462440_m1 | Müller cells |
Aldh1al | Thermo Fisher Scientific | Mm00657317_m1 | Müller cells |
Aqp4 | Thermo Fisher Scientific | Mm00802131_m1 | Astrocytes |
Calb2 | Thermo Fisher Scientific | Mm00801461_m1 | Amacrine, Horizontal |
Cd68 | Thermo Fisher Scientific | Mm03047340_m1 | Retinal Pigment Epithelial Cells |
Gad2 | Thermo Fisher Scientific | Mm00484623_m1 | Amacrine |
Hprt | Thermo Fisher Scientific | Mm01545399_m1 | House keeping gene |
Lhx1 | Thermo Fisher Scientific | Mm01297482_m1 | Horizontal |
Lim2 | Thermo Fisher Scientific | Mm00624623_m1 | Horizontal |
Nrl | Thermo Fisher Scientific | Mm00476550_m1 | Photoreceptors |
Ntrk1 | Thermo Fisher Scientific | Mm01219406_m1 | Horizontal |
Pcp4 | Thermo Fisher Scientific | Mm00500973_m1 | Bipolar, Amacrine |
Pou4f1 | Thermo Fisher Scientific | Mm02343791_m1 | Retinal Ganglion Cells |
Prdx6 | Thermo Fisher Scientific | Mm00725435_s1 | Astrocytes |
Prkca | Thermo Fisher Scientific | Mm00440858_m1 | Bipolar |
Prox1 | Thermo Fisher Scientific | Mm00435969_m1 | Horizontal |
Pvalb | Thermo Fisher Scientific | Mm00443100_m1 | Amacrine |
Rbpms | Thermo Fisher Scientific | Mm02343791_m1 | Retinal Ganglion Cells |
Rom1 | Thermo Fisher Scientific | Mm00436364_g1 | Photoreceptors |
Rpe65 | Thermo Fisher Scientific | Mm00504133_m1 | Retinal Pigment Epithelial cells |
Slc1a3 | Thermo Fisher Scientific | Mm00600697_m1 | Astrocytes |
Slc6a9 | Thermo Fisher Scientific | Mm00433662_m1 | Amacrine |
Sncg | Thermo Fisher Scientific | Mm00488345_m1 | Retinal Ganglion Cells |
Tubb3 | Thermo Fisher Scientific | Mm00727586_s1 | Retinal Ganglion Cells |
Vim | Thermo Fisher Scientific | Mm01333430_m1 | Müller cells |
Taqman Universal Master Mix | Thermo Fisher Scientific | 4440047 | qPCR Reagent |
miRNeasy Mini Kit | Qiagen | 217004 | RNA Isolation |
SuperScript VILO cDNA Synthesis Kit | Thermo Fisher Scientific | 11754250 | cDNA synthesis |
Taqman PreAmp Master Mix | Thermo Fisher Scientific | 4391128 | Pre-Amplification step |
BD Cytofix/ Cytoperm | BD Biosciences | 554714 | Fixation/ Permeabilization Buffer |
BD Perm/ Wash | BD Biosciences | 554723 | Permeabilization Solution |
RBPMS | Santa Cruz Biotechnology | sc-86815 | intracellular antibody |
SNCG | Gene Tex | GTX110483 | intracellular antibody |
BRN3A | Santa Cruz Biotechnology | sc-8429 | intracellular antibody |
TUJ1 | BioLegend | 801202 | intracellular antibody |
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