Method Article
Milioni di persone soffrono di malattie degenerative della retina che provocano cecità irreversibile. Un elemento comune di molte di queste malattie è la perdita delle cellule del ganglio retinico (RGC). Questo protocollo dettagliato descrive l'isolamento di RGC murine primari mediante selezione positiva e negativa con citometria a flusso.
Le malattie neurodegenerative spesso hanno un impatto devastante su coloro che sono colpiti. La perdita di cellule della ganglioma retinica (RGC) è implicata in una serie di malattie, tra cui la retinopatia diabetica e il glaucoma, oltre al normale invecchiamento. Nonostante la loro importanza, i RGCs sono stati estremamente difficili da studiare finora, in parte a causa del fatto che essi comprendono solo una piccola percentuale della grande varietà di cellule della retina. Inoltre, i metodi di isolamento attuali utilizzano marcatori intracellulari per identificare RGC, che producono cellule non vitali. Queste tecniche coinvolgono anche lunghi protocolli di isolamento, per cui esiste una mancanza di metodi pratici, standardizzati e affidabili per ottenere e isolare i RGC. Questo lavoro descrive un metodo efficiente, completo e affidabile per isolare i RGC primari dalla retina dei topi usando un protocollo basato sui criteri di selezione sia positivi che negativi. I metodi presentati consentono il futuro studio dei RGC, con l'obiettivo di una migliore comprensione dei principaliDiminuzione dell'acuità visiva che risulta dalla perdita di RGC funzionali nelle malattie neurodegenerative.
I RGC sono terminali differenziati dai neuroni e pertanto sono necessarie le cellule primarie per la sperimentazione. Lo sviluppo di un protocollo per l'isolamento e l'arricchimento delle cellule primarie di ghiandole retiniche murine (RGCs) è fondamentale per rivelare i meccanismi di salute e degenerazione di RGC in vitro . Ciò è particolarmente importante per studi che cercano di generare potenziali terapie per promuovere la funzione RGC e per ridurre al minimo la loro morte. La degenerazione dei RGC è associata a malattie degenerative della retina, come il glaucoma, la retinopatia diabetica e l'invecchiamento normale. Anche se i meccanismi cellulari specifici alla base della perdita di RGC non sono chiari, sono stati individuati una serie di fattori di rischio. La mancanza di ossigenazione alla testa del nervo ottico 1 , 2 , 3 provoca la morte di RGC 4 e funge da disturbo dell'omeostasi tra l'attivazione di eccitatori e iRecettori nhibitory all'interno di singoli RGCs 5 , 6 . Una serie di sfide impediscono il progresso verso l'uso di queste cellule per studi approfonditi. In primo luogo, il numero di RGC presenti in una retina murina è piccolo. RGC rappresentano meno dell'1% delle cellule retiniche totali 7 , 8 , 9 . Secondo, la maggior parte dei marker RGC-specifici sono proteine intracellulari 10 , 11 , 12 . La selezione basata su questi marcatori lascia le cellule inattive, che esclude le analisi funzionali a valle. Infine, i protocolli attualmente disponibili sono lunghi e mancano la standardizzazione 13 , 14 . I primi protocolli di isolamento RGC sono stati basati su metodi di immunopanning. Barres et al. 15 Adattato il classico immunoplayAnnotando la tecnica e ha aggiunto un secondo passo, che escludeva monociti e cellule endoteliali dalla maggior parte delle cellule retiniche prima della selezione positiva basata sull'immunopositività all'antigene anti-timocitico (aka Thy1), un marker di superficie cellulare. Anni dopo, Hong et al. Tecniche di isolamento del tallone magnetico combinato con strategie di selezione delle cellule per isolare RGC con purezza superiore 16 . L'uso di perline magnetiche è ancora utilizzato in molte applicazioni scientifiche. Insieme, i branelli magnetici ei protocolli di citometria di flusso hanno migliorato la purezza delle cellule isolate. Tuttavia, questi sistemi di purificazione non sono ancora stati standardizzati per l'isolamento dei RGC murini da retina dissociata.
La citometria di flusso è un potente metodo analitico che misura le caratteristiche ottiche e fluorescenti delle sospensioni cellulari. Le cellule sono analizzate in modo quantitativo e qualitativo con un elevato livello di sensibilità, fornendo un'analisi multidimensionale del populino cellularezione. La discriminazione cellulare si basa su due principali proprietà fisiche: dimensione delle cellule o superficie e granularità o complessità interna 17 . È possibile eseguire un'analisi multidimensionale combinando anticorpi tagliati con fluorochromi che presentano lunghezze d'onda simili e diverse emissioni. La citometria del flusso è veloce, riproducibile e sensibile. I laser Multitpe permettono di analisi multidimensionali ancora più grandi di singole cellule mediante citometria a flusso. Quindi è una metodologia attraente per lo studio di campioni citologici. La classificazione delle cellule attivata con fluorescenza (FACS) utilizza le differenze fenotipiche multidimensionali identificate dalla citometria di flusso per ordinare singole cellule in sottopopolazioni distinte.
Nell'ultimo decennio, proteine multiple e proteine intracellulari sono state identificate come potenziali biomarcatori per la selezione delle cellule, compresi i neuroni. Gli studi iniziali che cercavano di isolare i RGC dai topi utilizzavano Thy1 come un ganglio celL marker. Purtroppo, Thy1, aka CD90, ha diverse isoforme in altre specie di roditore 18 , 19 e 20 ed è espresso da più tipi di cellule retiniche 19 , 20 , rendendolo un marker non specifico per i RGC. Un altro marcatore di superficie, CD48, si trova sulle popolazioni monocitiche nella retina, tra cui macrofagi e microglia. Usando questi due marcatori di superficie, una delle cellule negate di RGC firmate Thy1 + e CD48 è stata sviluppata 15 , 16 , 21 , 22 . Purtroppo, questi due criteri di selezione non sono sufficienti per selezionare una popolazione RGC altamente arricchita. Per affrontare questa necessità non soddisfatta, è stato sviluppato un protocollo di citometria di flusso 23 basato su criteri di selezione positivi e negativi multi-layer usiI marker di superficie delle cellule noti per arricchire e purificare RGC murine primarie.
Tutte le procedure descritte nel seguente protocollo sono state approvate dal comitato di revisione istituzionale per la cura e l'uso degli animali (IACUC) presso l'Università di Tennessee Health Science Center (UTHSC) e ha seguito l'Associazione per la ricerca in visione e oftalmologia (ARVO) Degli animali in ricerca oftalmica e visiva, in aggiunta alle linee guida per gli esperimenti sugli animali da laboratorio (Istituto di risorse animali da laboratorio, Politica sanitaria pubblica sulla cura umana e uso degli animali da laboratorio).
1. Preparazione di strumenti, soluzioni e supporti
Nota: Tutte le informazioni sui materiali, reagenti, strumenti e strumenti riportati nel protocollo sono specificati nella tabella dei materiali .
2. Enucleazione
Nota: In questo esperimento sono stati utilizzati complessivamente 10 giovani (5-7 settimane) C57BL / 6J topi per isolare RGC da 1,0 x 10 6 con il fenotipo CD90.2 + CD48 neg negativo CD15 neg negativo CD57 neg .
3. Preparazione della sospensione delle cellule retiniche
4. Immunolabelazione del ReCellule tinali
5. Strategia di ordinamento delle cellule
Nota: Istruzioni specifiche per l'impostazione dello strumento per FACS a 355 nm, UV; 405 nm, viola; 488 nm, blu; E 640 nm, laser rosso con distribuzione di canali di fluorescenza 2, 2, 5 e 3 rispettivamente. Il software operativo era DIVA versione 8.0.1. La selezione delle cellule è stata effettuata con un ugello di 70 μm, una pressione del tubo da 70 psi, una frequenza di 87,5, una ampiezza di 48,6 con la prima caduta a 333, il posizionamento di gap di 6, la precisione di ordinamento impostata su una purezza a quattro vie con la maschera di purezza (32) Ritardo regolato a 42,98 usando le perline.
7. Convalida della cella Sort by qPCR Analysis
Nota: vedere la Figura 4 .
Lo studio approfondito di RGC è ostacolato da molti fattori, tra cui la loro bassa frequenza e la mancanza di una metodologia robusta e standardizzata per il loro isolamento. La figura 1 mostra la metodologia utilizzata per l'isolamento della retina. Variazioni nella procedura di enucleazione esistono in base al tipo di analisi, come se l'enucleazione fa parte della sperimentazione in vivo 27 . L'enucleazione in questo protocollo è eseguita su topi eutanizzati. Come mostrato nella Figura 1A- B , le pinze sono poste sotto l'occhio e tirate su per causare un minimo sanguinamento e rimuovere un globo occhio con un nervo ottico intatto.
Differenze esistono nel numero di RGC in vari ceppi di topo, in particolare nei topi alterati geneticamente 23 , 28 ,La retina dei vecchi topi C57BL / 6J ha meno di cellule retiniche in vivo rispetto alle loro controparti più piccole 23. Pertanto, la dissezione della retina deve essere attentamente eseguita per determinare il numero di topi da utilizzare. Massima la resa delle cellule Una procedura step-by-step per la dissezione della retina è presentata in Figura 1C- J . Le cellule retiniche sono fragili, quindi le retina disciolte vengono collocate in filtri in nylon e macerate con l'estremità posteriore di una siringa Mostrato nella figura 2A o con un pestello per i filtri delle cellule La macerazione delle cellule direttamente nel filtro delle cellule è veloce e riduce i grumi di cellule È rappresentata un'immagine rappresentativa della sospensione cellulare nella figura 2B.Clicole multiple di retina interna possono essere visualizzate. A questo punto, i RGC hanno perso il loro morfolo di firmaGy dovuta all'assotomia durante l'isolamento cellulare e alla preparazione della sospensione cellulare.
Il passo più intenso di questa metodologia è l'impostazione della selezione delle celle. Questa fase è un passo fondamentale durante il FACS multicolore, in quanto massimizza la risoluzione del segnale-rumore. La Figura 3A mostra la strategia di gating utilizzata per l'isolamento di RGCs. Questa strategia ha mirato alla rimozione delle cellule contaminanti dalla sospensione cellulare, che comprendeva le cellule monocitarie, gliali, amacrine e fotorecettori. Come parte della metodologia, marcatori di superficie aggiuntivi sono stati confermati mediante analisi immunohistochemica prima di essere utilizzati come parte della strategia di esclusione. I dati precedenti hanno dimostrato che una piccola percentuale di CD90.2 + sono CD48 + . L'esclusione di queste cellule ha rimosso monociti ed eventualmente microglia dalla piscina delle cellule retiniche. È stato precedentemente dimostrato che il classico Thy1 + CD48 neg fenotipo di superficie non è sufficiente per identificare e isolare RGC murine 23 , poiché queste cellule esprimono geni associati a fotorecettori amacrine, Müller, bipolari, orizzontali e retinici epiteliali ( Figura 4A ). Ciò è ulteriormente affrontato indagando marcatori aggiuntivi per l'esclusione cellulare. CD15 è stato descritto come un marcatore delle cellule amacrine e bipolari 31 , che ha indotto il suo utilizzo come marcatore aggiuntivo per la selezione negativa. Lavoro da Uusitalo et al. 32 descrisse CD57 come marcatore di identificazione per le cellule gliali e fotorecettori. Pertanto, questo anticorpo è stato aggiunto alla strategia di classificazione delle cellule.
Successivamente, queste cellule sono state caratterizzate per convalidare la metodologia per l'isolamento di RGC murine. I fenotipi delle CD90.2 + CD48 neg negativo CD15 negative negativo CD57 cellule ordinate ( Figura 3B) sono stati valutati per l'espressione dei seguenti marcatori intracellulari associati a RGCs 10 , 11 , 12 , 33 : SNCG, BRN3A, TUJ1 e RBPMS. Come mostrato nella Figura 3C , le cellule ordinate hanno espresso tutte le quattro proteine intracellulari associate a RGC. Successivamente, la citometria a flusso di imaging è stata utilizzata in Figura 3D per mostrare la localizzazione intracellulare di RBPMS e l'espressione della superficie cellulare di CD90.2. Questi risultati sono stati testati in sistemi multipli di citometro, confermando la riproducibilità e la standardizzazione. Come mostrato nella figura 3E , alcune delle cellule ordinate hanno iniziato a mostrare la morfologia associata a RGC dopo la coltura cellulare in vitro .
Infine, un confronto delle cellule prima dell'arricchimento e del post-ceL'analisi è stata effettuata mediante analisi qPCR. Il confronto del fenotipo Thy1 + CD48 con il CD90 negativo negativo CD15 negativo CD15 negativo ha determinato che il fenotipo negativo Thy1 + CD48 esprime geni associati a RGC, ma anche con altre cellule retiniche. Tuttavia, la popolazione di cellule ordinate altamente arricchita ( Figura 4B ) ha mostrato un aumento moltiplicato nei geni che codificano i marker intracellulari specifici RGC Sncg (SNCG), Pouf4L (BRN3A), Tubb3 (TUJ1) e Rbpms (RBPMS). Complessivamente, le valutazioni di mRNA e proteine convalidarono la metodologia.
Figura 1 . Enucleazione e dissezione oculare per l'isolamento della retina. I topi giovani C57BL / 6J sono stati eutanizzati primaO rimozione del globo occhio con CO 2 e dislocazione cervicale. A) Posizionare la pinza sotto l'occhio e tirare l'occhio in un solo movimento. B) L'occhio viene rimosso, compreso il nervo ottico. CJ) Guida passo-passo per rimuovere la retina. C) Una puntura viene eseguita usando un ago 30G prima della rimozione corneale per consentire all'omorismo acquoso di uscire dall'occhio. D) La cornea è tenuta con pinze per eseguire una piccola incisione. EF) L'uso della pinza permette di sbucciare la cornea, l'epitelio del pigmento retinico, il coroide e la sclera. La retina è staccata dalla sclera, rotolata e rimossa. G) L'obiettivo viene rimosso e scartato. HJ) La retina raccolta viene posta in un piccolo piatto contenente PBS / 1% FBS per mantenerli umidi in ogni momento. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questofigura.
Figura 2 . Sospensione delle cellule retiniche dopo la macerazione della retina raccolta. La retina raccolta viene posta in un piccolo piatto per isolare le cellule. A) Le retine sono poste in un filtro in nylon da 70 μm e macerate utilizzando la parte posteriore di una siringa. B) Immagine rappresentativa della sospensione cellulare, in cui vengono osservate cellule retiniche distinte. La barra di scala è di 10 μm.
Figura 3 . Strategia di classificazione per l'isolamento delle celle con CD57.2 + CD48 neg negativo CD15 negativo CD57 neg Fenotipo e analisi post-sorting. La strategia di classificazione si basa sull'inclusione delle cellule CD90.2 e l'esclusione delle cellule CD48-, CD15- e CD57-positive, che sono cellule contaminanti. A) Come primo passo, dimensione della trama (FSC) e complessità interna (SSC) per ottenere una panoramica della popolazione cellulare. La popolazione di canali iniziali (P1) viene utilizzata per discriminare tra cellule singole e cellule o aggregati clumpati utilizzando l'altezza SSC (H) rispetto alla larghezza (W), P2. La selezione delle singole celle viene utilizzata per scegliere le celle negate CD90.2 + CD48. Per confermare la rimozione di tutti i dublets, viene eseguita una trama di FSC-H rispetto a FSC-W, P3 (pannello centrale ). Le cellule sono state etichettate con CD90.2 anti-mouse coniugato con AF700, CD48 anti-mouse coniugato con PE-Cyanine7, CD15 coniugato con PE e anti-mouse CD57. Come anticorpo secondario per contrassegnare il CD57 anti-mouse, è stato utilizzato anti-mouse BV421. La popolazione 3 (P3) è stata plottata nel quarto </ Em> per selezionare le celle negate CD90.2 + CD48, rimuovendo la maggior parte delle celle contaminanti. Successivamente, viene generata una trama CD57 rispetto a CD15 utilizzando le nozze selezionate CD90.2 + CD48. Viene selezionato il quadrante 4 (Q4), in quanto rappresenta le neg negative di CD90.2 + CD48 che sono negative per CD15 e CD57. Il fenotipo risultante della popolazione gated è CD90.2 + CD48 neg negativo CD15 neg negativo CD57. B) Analisi post-sorta dei marcatori superficiali utilizzati in A). Le celle ordinate sono di dimensioni omogenee, come mostrato nel primo pannello. Gli istogrammi successivi mostrano la percentuale di ciascun marker di superficie utilizzato nella strategia di ordinamento descritta in A). Un totale del 95% delle cellule sono CD90.2 + , come mostrato nella linea nera rispetto al controllo Ig, rappresentato dall'istogramma solido. Queste cellule sono state gated per valutare le percentuali di CD48, CD15 e CD57, rappresentate dal rosso, blu e greeN, rispettivamente. I risultati mostrano un'espressione minima di questi marker di superficie cellulare. C) Conferma del fenotipo RGC utilizzando gli indicatori intracellulari specifici RGC SNCG, BRN3A, TUJ1 e RBPMS. Le righe nere rappresentano la percentuale di cellule che esprimono ogni marcatore intracellulare. D) Immagini rappresentative prese in una sorta di cellule di imaging che mostra la localizzazione intracellulare di RBPMS, un marker intracellulare specifico RGC e il marker di superficie della cellula CD90.2. La barra di scala è di 20 μm. E) Immagine rappresentativa di RGC ordinati dopo 24 ore di coltura utilizzando un microscopio confocale. La barra di scala è di 20 μm. Le immagini BE sono adattate da lavori precedentemente pubblicati con permesso 23 . Le immagini DE sono state prese a 20X. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 4 . Analisi mRNA pre- e post-sorting. Le cellule negate e ordinate di Thy1 + CD48 con il fenotipo CD90.2 + CD48 Neg negativo CD15 Neg negativo sono state valutate mediante analisi qPCR usando un pannello di 25 geni espresso da cellule retiniche. I livelli di espressione genica target sono presentati come un cambiamento di Log 2- volte utilizzando Hprt come un gene di pulizia e l'acqua come controllo negativo. Il calcolo è stato effettuato sulla base del metodo ΔC T. Mean ± SEM; N = 3 repliche biologiche sono state eseguite in triplice copia. Figure ottenute da lavori precedentemente pubblicati con permesso 23 .
FACS è la tecnica di scelta per purificare le popolazioni cellulari. Altri metodi di isolamento includono immunopanning, perline magnetiche e depletionamento della fissazione del complemento. Il vantaggio di FACS rispetto a queste altre metodologie si basa sull'identificazione simultanea di marcatori a superficie cellulare con gradi di intensità variabili. L'intensità fluorescente della molecola è proporzionale alla quantità di espressione proteica. Fino ad ora l'isolamento dei RGC è basato esclusivamente sulla positività Thy1 (CD90) e sulla negatività CD48 15 , 16 , 22 , 34 , indipendentemente dal metodo di isolamento utilizzato. Recentemente è stato dimostrato che il fenotipo negativo Thy1 + CD48 non è sufficiente ad isolare una popolazione omogenea di cellule che esprimono marcatori intracellulari RGC 23 . L'identificazione della popolazione RGC è essenziale per il loro isolamento, in particolareY perché comprendono una piccola percentuale di cellule retiniche 7 , 8 , 9 . La maggior parte dei RGC si trovano nello strato più interno della retina, mentre un piccolo numero si trova negli strati plexiformi interni (RGC 35 spostati). Pertanto, la ricerca di RGC dai colliculi superiori da iniezioni stereotattiche e tracciamento con idrossistilbamidina (un tracciante retrogrado per delineare i neuroni) è diventato una scelta attraente per molti laboratori 36 , 37 e 38 . Questi sistemi richiedono l'iniezione di traccianti, che, se non correttamente eseguiti, possono portare ad alcune regioni retiniche lasciate inarrestabili. Inoltre, sono più tecnicamente esigenti e, come altre metodologie come l'immunopanning, sono lunghe. L'immunopanizzazione usando gli anticorpi anti-Thy1 e -CD48 richiede 48 ore per completare e non raggiungere più di 95Purezza%. Questo lavoro descrive una metodologia basata su FACS che offre un protocollo veloce e riproducibile per isolare una popolazione omogenea di RGC in vivo con il fenotipo negativo CD57 neg negativo CD15, CD90.2 + CD48, senza l'uso di traccianti, perline magnetiche o tecniche di immunopanizzazione .
I seguenti fattori sono necessari per l'isolamento efficace di RGC pura da FACS: 1) l'efficienza di ordinamento, che dipende in larga misura dall'apparecchiatura utilizzata; 2) combinazione ottimale di fluorochromi contrassegnati con anticorpi, per ridurre al minimo il rumore; E 3) l'impostazione della selezione delle celle. L'efficienza di ordinamento viene calcolata prendendo il numero di eventi target selezionati per l'ordinamento diviso per il numero di eventi target rilevati, espressi in percentuale. L'efficienza di ordinamento è un calcolo fornito dall'apparecchiatura. Questa efficienza dipende dalla configurazione del sistema di ordinamento e dalla modalità di selezione delle celle. La scelta di una combinazione ottimale dei fluorochromi è un processo complesso. Ogni influenzaL'orochrome ha proprietà distinte e si caratterizza per le sue lunghezze d'onda di eccitazione e emissione. Mentre l'eccitazione viene letto con un laser, l'emissione viene letta da tubi fotomoltiplicatori, limitati dai filtri ottici disponibili nell'apparecchiatura di ordinamento FACS. Qui viene fornita una combinazione di fluorochromi PE, PE-Cyanine7, AF700 e BV421 con anticorpo. Questo è stato determinato dopo aver considerato più combinazioni di fluorochrome che hanno fornito la migliore risoluzione riducendo contemporaneamente la sovrapposizione spettrale. Infine, l'impostazione del tipo è fondamentale. In generale, le cellule retiniche sono fragili. Pertanto, è meglio utilizzare una pressione più bassa per eseguire i campioni, per ridurre al minimo lo stress sulle cellule. È fondamentale mantenere il campione a 4 ° C, poiché mantenere i RGC murini per periodi più lunghi a temperatura ambiente può ridurre la resa cellulare, soprattutto quando ordinare un gran numero di cellule.
La classificazione basato su FACS è una metodologia ideale per l'isolamento delle cellule che compongono l'avPiccola percentuale della sospensione cellulare. Il processo, dalla dissezione della retina al completamento della selezione delle cellule, richiede circa 5 - 6 h, rispetto ai sistemi di immunopanning e traccianti, che richiedono giorni per completare. L'analisi multidimensionale di FACS e la capacità dell'apparecchiatura di raccogliere diverse popolazioni vitali consentono ulteriori analisi funzionali delle cellule. Il protocollo qui descritto è un potente strumento per l'isolamento dei RGC primari murini. Nonostante i suoi molteplici vantaggi, tra cui la sua sensibilità, la riproducibilità e l'immediata identificazione delle cellule vitali, esistono alcune limitazioni. In primo luogo, richiede costose strumentazioni e un operatore altamente qualificato. Di solito, l'operatore è un immunologo o un individuo altamente addestrato nel campo, con i quali è necessario incontrare al momento dell'assetto di esperimenti. Oggi le strutture accademiche hanno più strutture centrali, che possono facilitare l'esecuzione di questi tipi di esperimenti. In secondo luogo, i RGC perdono il loro lavoroMorfologia picale dovuta alla atoxomia, rendendole molto piccole. A questo punto, non è noto se alcuni dei loro geni possono essere modulati a causa di atoxomia.
La metodologia qui presentata consente l'analisi a valle della funzione RGC in vitro ed è uno strumento prezioso da utilizzare nei settori delle scienze visive e sanitarie. Il mantenimento della produzione di cellule gangliali al cervello è necessario per la percezione visiva e rischia di essere presentato in molteplici malattie. Queste cellule possono essere usate per la sperimentazione controllata in vitro , sia nei modelli sani che nelle malattie. Su queste cellule si possono eseguire studi elettrofisiologici, farmacologici, biochimici e molecolari, ideali per lo sviluppo di futuri target terapeutici.
Gli autori dichiarano di non avere interessi finanziari concorrenti.
Gli autori vorrebbero ringraziare il Sig. Tim Higgins, Senior Illustrator del Dipartimento di Microbiologia, Immunologia e Biochimica, per l'assistenza tecnica video; Il dottor Matthew W. Wilson per le discussioni ei membri dei laboratori Jablonski e Morales-Tirado per i loro commenti utili. Questo lavoro è stato sostenuto dall'Istituto di Ricerca Giovani Investigatori dell'Istituto di Ricerca di Alcon (VMM-T), dall'Università della Tennessee Research Foundation (VMM-T), dall'Istituto Nazionale di Occhi EY021200 (MMJ), dalla Gerwin Fellowship (VMM-T); La borsa di studio pre-dottorale di Gerwin (ZKG), la ricerca medica dell'esercito della difesa e il comando dei materiali (VMM-T) e la sovvenzione senza restrizioni dalla ricerca per prevenire la cecità.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Anti-mouse CD15 PE | BioLegend | 125606 | Clone MC-480 |
Anti-mouse CD48 PE-Cy7 | BioLegend | 103424 | Clone HM48-1 |
Anti-mouse CD57 | Sigma Aldrich | C6680-100TST | Clone VC1.1 |
Anti-mouse CD90.2 AF700 | BioLegend | 105320 | Clone 30-H12 |
Brilliant Violet 421 Goat Anti-mouse IgG | BioLegend | 405317 | Clone Poly4053 |
Purified Anti-mouse CD16/32 | BioLegend | 101302 | FcgRII/III block, Clone 93 |
Zombie Aqua | BioLegend | 423102 | Live cell/ Dead cell discrimination |
Fetal Bovine Serum | Hyclone | SH30071.03 | U.S. origin |
AbC Total Antibody Compensation Bead Kit | Thermo Fisher Scientific | A10497 | Multi-species Ig |
Neurobasal Medium | Thermo Fisher Scientific | 21103049 | Add serum to media prior to culture. |
Phosphate-Buffered Saline (PBS) | Thermo Fisher Scientific | 10010049 | Saline solution |
Dissection Microscope | Olympus | SZ-PT Model | Stereo Microscope |
Sorvall Centrifuge | Thermo Scientific | ST 16R | All centrifugation performed at RT |
Base Plate – Dissection Pan | Fisher Scientific | SB15233FIM | A wax plate can also be used |
Forceps | Aesculap | 5002-7 | 4 ½ inches |
Iris Scissors, Straight | Aesculap | 1360 | 5 ½ inches |
Falcon 15 mL conical tubes | Fisher Scientific | 352097 | Polypropylene tubes |
Falcon 50 mL conical tubes | Fisher Scientific | 352098 | Polypropylene tubes |
BD FACS Tubes | Fisher Scientific | 352003 | Polypropylene tubes |
40 mm dishes | MidSci | TP93040 | Tissue culture treated |
70 μm nylon strainer | MidSci | 70ICS | sterile |
40 μm nylon strainer | MidSci | 40ICS | sterile |
BD 10 mL syringe | Fisher Scientific | 301604 | Disposable Syringe without needle |
Pestles | MidSci | PEST | sterile |
Wheaton Vials | Fisher Scientific | 986734 | No Liner |
BD 30 G needle | Fisher Scientific | 305128 | 1 inch |
Hausser Scientific Bright-Line Glass Counting Chamber | Fisher Scientific | 0267151B | Hemocytometer |
Gibco Trypan blue 0.4% Solution | Fisher Scientific | 15250061 | Viability Dye |
Eppendorf tubes | Fisher Scientific | 05-402-25 | 1.5mL |
EVOS Floid Cell Imaging | Thermo Fisher Scientific | 447113 | Fluorescence Imaging with a 20X objective |
100% Ethanol | Fisher Scientific | 04-355-452 | Used to make 70% Ethanol |
Pipet-Lite LTS Pipette L-1000XLS+ | Rainin | 17014282 | LTS Pipette |
Pipet-Lite LTS Pipette L-200XLS+ | Rainin | 17014391 | LTS Pipette |
Pipet-Lite LTS Pipette L-20XLS+ | Rainin | 17014392 | LTS Pipette |
Rack LTS 1000 mL – GPS-L1000S | Rainin | 17005088 | Blue Rack Sterile Tips |
Rack LTS 250 mL – GPS-L250S | Rainin | 17005092 | Green Rack Sterile Tips |
Rack LTS 20 mL – GPS-L10S | Rainin | 17005090 | Red Rack Sterile Tips |
FACSAria II Cell Sorter | BD Biosciences | N/A | Custom order |
LSR II Cytometer | BD Biosciences | N/A | Custom order |
Abca8a | Thermo Fisher Scientific | Mm00462440_m1 | Müller cells |
Aldh1al | Thermo Fisher Scientific | Mm00657317_m1 | Müller cells |
Aqp4 | Thermo Fisher Scientific | Mm00802131_m1 | Astrocytes |
Calb2 | Thermo Fisher Scientific | Mm00801461_m1 | Amacrine, Horizontal |
Cd68 | Thermo Fisher Scientific | Mm03047340_m1 | Retinal Pigment Epithelial Cells |
Gad2 | Thermo Fisher Scientific | Mm00484623_m1 | Amacrine |
Hprt | Thermo Fisher Scientific | Mm01545399_m1 | House keeping gene |
Lhx1 | Thermo Fisher Scientific | Mm01297482_m1 | Horizontal |
Lim2 | Thermo Fisher Scientific | Mm00624623_m1 | Horizontal |
Nrl | Thermo Fisher Scientific | Mm00476550_m1 | Photoreceptors |
Ntrk1 | Thermo Fisher Scientific | Mm01219406_m1 | Horizontal |
Pcp4 | Thermo Fisher Scientific | Mm00500973_m1 | Bipolar, Amacrine |
Pou4f1 | Thermo Fisher Scientific | Mm02343791_m1 | Retinal Ganglion Cells |
Prdx6 | Thermo Fisher Scientific | Mm00725435_s1 | Astrocytes |
Prkca | Thermo Fisher Scientific | Mm00440858_m1 | Bipolar |
Prox1 | Thermo Fisher Scientific | Mm00435969_m1 | Horizontal |
Pvalb | Thermo Fisher Scientific | Mm00443100_m1 | Amacrine |
Rbpms | Thermo Fisher Scientific | Mm02343791_m1 | Retinal Ganglion Cells |
Rom1 | Thermo Fisher Scientific | Mm00436364_g1 | Photoreceptors |
Rpe65 | Thermo Fisher Scientific | Mm00504133_m1 | Retinal Pigment Epithelial cells |
Slc1a3 | Thermo Fisher Scientific | Mm00600697_m1 | Astrocytes |
Slc6a9 | Thermo Fisher Scientific | Mm00433662_m1 | Amacrine |
Sncg | Thermo Fisher Scientific | Mm00488345_m1 | Retinal Ganglion Cells |
Tubb3 | Thermo Fisher Scientific | Mm00727586_s1 | Retinal Ganglion Cells |
Vim | Thermo Fisher Scientific | Mm01333430_m1 | Müller cells |
Taqman Universal Master Mix | Thermo Fisher Scientific | 4440047 | qPCR Reagent |
miRNeasy Mini Kit | Qiagen | 217004 | RNA Isolation |
SuperScript VILO cDNA Synthesis Kit | Thermo Fisher Scientific | 11754250 | cDNA synthesis |
Taqman PreAmp Master Mix | Thermo Fisher Scientific | 4391128 | Pre-Amplification step |
BD Cytofix/ Cytoperm | BD Biosciences | 554714 | Fixation/ Permeabilization Buffer |
BD Perm/ Wash | BD Biosciences | 554723 | Permeabilization Solution |
RBPMS | Santa Cruz Biotechnology | sc-86815 | intracellular antibody |
SNCG | Gene Tex | GTX110483 | intracellular antibody |
BRN3A | Santa Cruz Biotechnology | sc-8429 | intracellular antibody |
TUJ1 | BioLegend | 801202 | intracellular antibody |
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