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Millones de personas sufren de enfermedades degenerativas retinianas que resultan en ceguera irreversible. Un elemento común de muchas de estas enfermedades es la pérdida de células ganglionares de la retina (RGCs). Este protocolo detallado describe el aislamiento de los RGC murinos primarios mediante selección positiva y negativa con citometría de flujo.
Las enfermedades neurodegenerativas a menudo tienen un impacto devastador en los afectados. La pérdida de células ganglionares de la retina (RGC) está implicada en una serie de enfermedades, incluyendo retinopatía diabética y glaucoma, además del envejecimiento normal. A pesar de su importancia, RGCs han sido extremadamente difíciles de estudiar hasta ahora debido en parte al hecho de que comprenden sólo un pequeño porcentaje de la gran variedad de células en la retina. Además, los métodos actuales de aislamiento utilizan marcadores intracelulares para identificar RGC, que producen células no viables. Estas técnicas también implican largos protocolos de aislamiento, por lo que hay una falta de métodos prácticos, estandarizados y confiables para obtener y aislar los RGC. Este trabajo describe un método eficiente, completo y confiable para aislar RGC primaria de ratones retinae utilizando un protocolo basado en ambos criterios de selección positivos y negativos. Los métodos presentados permiten el estudio futuro de los CGR, con el objetivo de comprender mejor lasDisminución de la agudeza visual que resulta de la pérdida de RGC funcional en las enfermedades neurodegenerativas.
Los RGC son neuronas diferenciadas terminalmente, y por lo tanto, las células primarias son necesarias para la experimentación. El desarrollo de un protocolo para el aislamiento y enriquecimiento de las células ganglionares primarias de la retina murina (RGCs) es fundamental para revelar los mecanismos de la salud y la degeneración de RGC in vitro . Esto es especialmente importante para los estudios que buscan generar terapias potenciales para promover la función de RGC y para minimizar su muerte. La degeneración de RGC se asocia con enfermedades degenerativas de la retina, como el glaucoma, la retinopatía diabética y el envejecimiento normal. Aunque los mecanismos celulares específicos subyacentes a la pérdida de RGC no están claros, se han identificado una serie de factores de riesgo. La falta de oxigenación en la cabeza 1 , 2 , 3 del nervio óptico causa la muerte 4 de RGC y actúa como la alteración de la homeostasis entre la activación de la excitación e iNhibitory receptores dentro de RGCs individuales 5 , 6 . Una serie de desafíos impiden el progreso hacia el uso de estas células para estudios en profundidad. En primer lugar, el número de RGC presentes en una retina murina es pequeño. RGCs representan menos del 1% de las células retinianas totales 7 , 8 , 9 . En segundo lugar, la mayoría de los marcadores específicos de RGC son proteínas intracelulares 10 , 11 , 12 . La selección basada en estos marcadores deja las células no viables, lo que impide el análisis funcional posterior. Finalmente, los protocolos actualmente disponibles son largos y carecen de estandarización 13 , 14 . Los primeros protocolos de aislamiento de RGC se basaron en métodos de inmunopanning. Barres et al. 15 Adaptado el clásico immunopY añadió un segundo paso, que excluyó monocitos y células endoteliales de la mayor parte de las células de la retina antes de la selección positiva basada en la inmunopositividad al antígeno anti-timocito (aka Thy1), un marcador de la superficie celular. Años después, Hong et al. Combinado técnicas de aislamiento magnético de grano con estrategias de clasificación celular para aislar RGCs con mayor pureza [ 16] . El uso de cuentas magnéticas todavía se utiliza en muchas aplicaciones científicas. Juntos, las perlas magnéticas y los protocolos de citometría de flujo mejoraron la pureza de las células aisladas. Sin embargo, estos sistemas de purificación aún no han sido estandarizados para el aislamiento de RGC murinos a partir de retina disociada.
La citometría de flujo es un poderoso método analítico que mide las características ópticas y de fluorescencia de las suspensiones celulares. Las células son analizadas tanto cuantitativa como cualitativamente con un alto nivel de sensibilidad, proporcionando un análisis multidimensional de la población celularCión. La discriminación celular se basa en dos propiedades físicas principales: tamaño o superficie de las células y granularidad o complejidad interna 17 . Se puede realizar un análisis multidimensional combinando anticuerpos marcados con fluorocromos que tienen longitudes de onda de excitación similares y diferentes emisiones. La citometría de flujo es rápida, reproducible y sensible. Los láseres multipunto permiten un análisis multidimensional aún mayor de células individuales mediante citometría de flujo. Por lo tanto, es una metodología atractiva para el estudio de especímenes citológicos. Selección de células activadas por fluorescencia (FACS) utiliza las diferencias fenotípicas multidimensionales identificadas por citometría de flujo para clasificar las células individuales en distintas subpoblaciones.
En la última década, se han identificado múltiples proteínas superficiales e intracelulares como biomarcadores potenciales para la selección de células, incluidas las neuronas. Los estudios iniciales que buscaban aislar RGC de ratas utilizaron Thy1 como un ganglio celL marcador. Desafortunadamente, Thy1, también conocido como CD90, tiene múltiples isoformas en otras especies de roedores 18 , 19 , 20 y se expresa por múltiples tipos de células de retina 19 , 20 , lo que lo convierte en un marcador no específico para RGCs. Otro marcador de superficie, CD48, se encuentra en poblaciones monocíticas en la retina, incluyendo macrófagos y microglia. Usando estos dos marcadores de superficie, se desarrolló una firma RGC modificada-Thy1 + y células CD48 neg - 15 , 16 , 21 , 22 . Lamentablemente, estos dos criterios de selección no son suficientes para seleccionar una población RGC altamente enriquecida. Para abordar esta necesidad insatisfecha, se desarrolló un protocolo de citometría de flujo 23 basado en criterios de selección positiva y negativa multicapa usiNg marcadores de superficie celular conocidos para enriquecer y purificar RGCs murinos primarios.
Todos los procedimientos detallados en el siguiente protocolo fueron aprobados por la Junta de Revisión del Comité Institucional de Cuidado y Uso de Animales (IACUC) en el Centro de Ciencias de la Salud de la Universidad de Tennessee (UTHSC) y siguieron las Declaraciones de la Asociación de Investigación en Visión y Oftalmología (ARVO) De Animales en la Investigación Oftálmica y de la Visión, además de las directrices para experimentos con animales de laboratorio (Instituto de Recursos de Animales de Laboratorio, Política de Servicios de Salud Pública sobre Cuidado Humano y Uso de Animales de Laboratorio).
1. Preparación de instrumentos, soluciones y medios
Nota: Toda la información sobre materiales, reactivos, herramientas e instrumentos reportados en el protocolo se especifican en la Tabla de Materiales .
2. Enucleación
Nota: En este experimento se utilizaron un total de 10 ratones C57BL / 6J jóvenes (de 5 a 7 semanas de edad) para aislar 1,0 x 106 RGC con el fenotipo CD90.2 + CD48 neg CD15 neg CD57 neg .
3. Preparación de la suspensión de células retinianas
4. Immunomarcación del ReCélulas Tinal
5. Estrategia de Clasificación de Células
Nota: Instrucciones específicas para la configuración del instrumento para FACS con 355 nm, UV; 405 nm, violeta; 488 nm, azul; Y 640 nm, láseres rojos con 2, 2, 5 y 3 canales de fluorescencia, respectivamente. El software operativo era DIVA versión 8.0.1. La clasificación de las células se realizó con una boquilla de 70 μm, una presión de la vaina de 70 psi, una frecuencia de 87,5, una amplitud de 48,6 con una primera rotura de la gota a 333, un ajuste de la separación de 6, una precisión de orden ajustada a una pureza de cuatro vías con una máscara de pureza predeterminada Retardo ajustado a 42,98 utilizando perlas.
7. Validación de la Clasificación de Células por Análisis de qPCR
Nota: Consulte la Figura 4 .
El estudio en profundidad de los CGR se ve obstaculizado por muchos factores, entre ellos su baja frecuencia y la falta de una metodología robusta y estandarizada para su aislamiento. La Figura 1 muestra la metodología utilizada para el aislamiento de las retina. Existen variaciones en el procedimiento de enucleación basado en el tipo de análisis, como si la enucleación es parte de la experimentación in vivo [ 27] . La enucleación en este protocolo se realiza en ratones eutanasiados. Como se muestra en la Figura 1A- B , los fórceps se colocan debajo del ojo y se tiran hacia arriba para causar sangrado mínimo y para retirar un globo ocular con un nervio óptico intacto.
Existen diferencias en el número de RGCs en diferentes cepas de ratón, especialmente en ratones genéticamente alterados 23 , 28 ,Los autores consideran que estas últimas son importantes cuando se determina el número de ratones que se van a utilizar.Las retinas de ratones C57BL / 6J viejos tienen menos células retinales vivas que sus homólogas más jóvenes 23. Por lo tanto, la disección de la retina debe realizarse cuidadosamente para Maximizando el rendimiento celular.Un procedimiento paso a paso para la disección de la retina se presenta en la Figura 1C- J . Las células retinianas son frágiles, por lo que las retina disecadas se colocan en filtros de nylon y se maceran con el extremo posterior de una jeringa, Mostrada en la Figura 2A o con un mazo para filtros de células.La maceración de células directamente en el filtro de células es rápida y reduce grupos de células.Una imagen representativa de la suspensión de células se ilustra en la Figura 2.B Se pueden visualizar múltiples células de retina interna. En este punto, los RGC han perdido su morfología de firmaGy debido a axotomía durante el aislamiento celular y la preparación de la suspensión celular.
El paso más intensivo en mano de obra de esta metodología es la configuración de clasificación de células. Esta fase es un paso crítico durante FACS multicolor, ya que maximiza la resolución de señal a ruido. La Figura 3A muestra la estrategia de bloqueo usada para el aislamiento de RGC. Esta estrategia se dirigió a la eliminación de las células contaminantes de la suspensión celular, que incluía monocitos, glial, amacrina y células fotorreceptoras. Como parte de la metodología, los marcadores de superficie adicionales se confirmaron mediante análisis inmunohistoquímico antes de ser utilizados como parte de la estrategia de exclusión. Los datos anteriores demostraron que un pequeño porcentaje de células CD90.2 + son CD48 + . La exclusión de estas células eliminó monocitos y posiblemente microglia de la piscina de células de retina. Se ha demostrado previamente que el clásico Thy1 + CD48 neg fenotipo de superficie no es suficiente para identificar y aislar RGCs murino 23 , ya que estas células expresan genes asociados con amacrina, Müller, bipolar, fotorreceptor horizontal, y las células epiteliales del pigmento retiniano ( Figura 4A ). Esto se aborda adicionalmente investigando marcadores adicionales para la exclusión celular. CD15 ha sido descrito como un marcador de amacrina y las células bipolares [ 31] , lo que indica su uso como marcador adicional para la selección negativa. Trabajo de Uusitalo et al. 32 describieron CD57 como un marcador de identificación para células gliales y fotorreceptores. Por lo tanto, este anticuerpo se añadió a la estrategia de clasificación celular.
A continuación, se caracterizaron estas células para validar la metodología para el aislamiento de RGC murinos. Los fenotipos de CD90.2 + CD48 neg CD15 negativo CD57 neg ordenados células (10 , 11 , 12 , 33 : SNCG, BRN3A, TUJ1 y RBPMS. Como se muestra en la Figura 3C , las células clasificadas expresaron las cuatro proteínas intracelulares asociadas a RGC. A continuación, se usó citometría de flujo de imagen en la Figura 3D para mostrar la localización intracelular de RBPMS y la expresión de CD90.2 en la superficie celular. Estos resultados fueron probados en sistemas de citometría múltiple, lo que confirma la reproducibilidad y estandarización. Como se muestra en la Figura 3E , algunas de las células clasificadas comenzaron a mostrar la morfología asociada a RGC después de cultivo celular in vitro .
Por último, una comparación de las células antes del enriquecimiento y post-ceEl análisis se realizó mediante análisis de qPCR. Comparación del fenotipo Thy1 + CD48 neg a CD90.2 + CD48 negativo CD15 Neg CD57 neg clasificado células reveló que el Thy1 + CD48 neg fenotipo expresa genes asociados con RGCs, sino también con otras células de la retina. Sin embargo, la población de células altamente enriquecida ( Figura 4B ) mostró un aumento de muchos veces en los genes que codifican los marcadores intracelulares específicos de RGC Sncg (SNCG), Pouf4l (BRN3A), Tubb3 (TUJ1) y Rbpms (RBPMS). Colectivamente, las evaluaciones de ARNm y proteína validaron la metodología.
Figura 1 . Enucleación y Disección Ocular para Aislamiento Retinal. Los ratones C57BL / 6J jóvenes fueron eutanasiados antes de tO eliminación del globo ocular con CO 2 y dislocación cervical. A) Coloque la pinza debajo del ojo y levante el ojo en un solo movimiento. B) Se retira el ojo, incluyendo el nervio óptico. CJ) Guía paso a paso para eliminar la retina. C) Se realiza una punción usando una aguja 30G antes de la eliminación corneal para permitir que el humor acuoso salga del ojo. D) La córnea se sostiene con fórceps para realizar una pequeña incisión. EF) El uso de fórceps permite pelar la córnea, el epitelio pigmentario de la retina, la coroides y la esclerótica. La retina se separa de la esclerótica, se enrolla y se elimina. G) La lente se retira y se desecha. HJ) Las retina recogidas se colocan en un plato pequeño que contiene PBS / 1% FBS para mantenerlos húmedos en todo momento. Haga clic aquí para ver una versión más grande de estafigura.
Figura 2 . Suspensión de la célula retiniana después de la maceración de las retinas recogidas. Las retina recogidas se colocan en un plato pequeño para aislar las células. A) Las retinas se colocan en un colador de nylon de 70 μm y se maceran usando el extremo posterior de una jeringa. B) Imagen representativa de la suspensión celular, donde se observan distintas células retinianas. La barra de escala es de 10 μm.
Figura 3 . Estrategia de clasificación para el aislamiento de células con CD90.2 + CD48 neg CD15 neg CD57 neg Análisis de fenotipos y post-clasificación. La estrategia de clasificación se basa en la inclusión de células CD90.2 y la exclusión de células CD48, CD15 y CD57 positivas, que son células contaminantes. A) Como primer paso, el tamaño de la parcela (FSC) y la complejidad interna (SSC) para obtener una visión general de la población celular. La población cerrada inicial (P1) se utiliza para discriminar entre células individuales y células agrupadas o agregados usando la altura SSC (H) frente a la anchura (W), P2. La selección de las células individuales se utiliza para elegir las células CD90.2 + CD48 neg . Para confirmar la eliminación de todos los dobletes, se realiza un gráfico de FSC-H frente a FSC-W, P3 (panel del medio ). Las células fueron marcadas con AF700 conjugado anti-ratón CD90.2, PE-Cyanine7 conjugado anti-ratón CD48, PE-conjugado CD15, y anti-ratón CD57. Como anticuerpo secundario para marcar el CD57 anti-ratón, se utilizó BV421 anti-ratón. Población 3 (P3) se representó en el cuarto </ Em> para seleccionar las células CD90.2 + CD48 neg , eliminando la mayoría de las células contaminantes. A continuación, se genera un gráfico CD57 frente a CD15 usando las células negativas CD90.2 + CD48 seleccionadas. Se selecciona el Cuadrante 4 (Q4), ya que representa las células negativas CD90.2 + CD48 negativo para CD15 y CD57. El fenotipo resultante de la población cerrada es CD90.2 + CD48 neg CD15 neg CD57 neg . B) Análisis posterior a la clasificación de los marcadores de superficie utilizados en A). Las células clasificadas son homogéneas en tamaño, como se muestra en el primer panel. Los histogramas posteriores muestran el porcentaje de cada marcador de superficie utilizado en la estrategia de clasificación detallada en A). Un total de 95% de las células son CD90.2 + , como se muestra en la línea negra comparado con el control de Ig, representado por el histograma sólido. Estas células se cerraron para evaluar los porcentajes de CD48, CD15 y CD57, representados por el rojo, el azul y el grN líneas, respectivamente. Los resultados muestran una expresión mínima de estos marcadores de superficie celular. C) Confirmación del fenotipo RGC usando los marcadores intracelulares específicos de RGC SNCG, BRN3A, TUJ1 y RBPMS. Las líneas negras representan el porcentaje de células que expresan cada marcador intracelular. D) Imágenes representativas tomadas en un clasificador de células de imagen que muestra la localización intracelular de RBPMS, un marcador intracelular específico de RGC y el marcador de superficie celular CD90.2. La barra de escala es de 20 μm. E) Imagen representativa de RGCs clasificadas después de 24 h en cultivo usando un microscopio confocal. La barra de escala es de 20 μm. Las imágenes BE se adaptan de trabajos previamente publicados con permiso 23 . Las imágenes DE se tomaron a 20X. Haga clic aquí para ver una versión más grande de esta figura.
Figura 4 . Análisis de mRNA pre y post-clasificación. Thy1 + CD48 neg y clasificado células con el fenotipo CD90.2 + CD48 neg CD15 neg CD57 neg fueron evaluados por qPCR análisis utilizando un panel de 25 genes expresados por las células de la retina. Los niveles de expresión génica diana se presentan como un cambio Log 2- fold usando Hprt como un gen doméstico y el agua como control negativo. El cálculo se realizó con base en el método ΔC T. Media ± SEM; N = 3 repeticiones biológicas se realizaron por triplicado. Cifras obtenidas de trabajos previamente publicados con permiso 23 .
FACS es la técnica de elección para purificar poblaciones celulares. Otros métodos de aislamiento incluyen el inmunopanning, las perlas magnéticas y el agotamiento de la fijación del complemento. La ventaja de FACS sobre estas otras metodologías se basa en la identificación simultánea de marcadores de superficie celular con diferentes grados de intensidad. La intensidad fluorescente de la molécula es proporcional a la cantidad de expresión de la proteína. Hasta ahora, el aislamiento de RGCs se basó únicamente en la positividad de Thy1 (CD90) y negatividad de CD48 15 , 16 , 22 , 34 , independientemente del método de aislamiento utilizado. Recientemente se ha demostrado que el fenotipo Thy1 + CD48 neg no es suficiente para aislar una población homogénea de células que expresan marcadores intracelulares RGC [ 23] . La identificación de la población RGC es esencial para su aislamiento,Y porque comprenden un pequeño porcentaje de células retinianas 7 , 8 , 9 . La mayoría de los RGC están localizados en la capa más interna de la retina, mientras que un pequeño número se localiza en las capas plexiformes internas (RGCs 35 desplazados). Por lo tanto, el rastreo de RGCs de los colliculi superior por inyecciones estereotácticas y el rastreo con hidroxiestillbamidina (un trazador retrógrado para contornear las neuronas) se convirtió en opciones atractivas para muchos laboratorios [ 36 , 37 , 38] . Estos sistemas requieren la inyección de trazador, que, si no se lleva a cabo correctamente, puede conducir a algunas regiones de la retina dejó sin rastrear. Además, son técnicamente más exigentes y, al igual que otras metodologías como el inmunopanning, son largas. El inmunopanning usando los anticuerpos anti-Thy1 y -CD48 tarda 48 h en completarse y no logra más de 95% pureza. Este trabajo describe una metodología basada en FACS que ofrece un protocolo rápido y reproducible para aislar una población homogénea de RGCs vivas con el fenotipo Neg CD57 neg CD57 neg CD90.2 + CD48, sin el uso de trazadores, bolas magnéticas o técnicas de inmunopanning .
Los factores siguientes son necesarios para el aislamiento exitoso de RGC puros por FACS: 1) eficiencia de clasificación, que depende en gran medida del equipo utilizado; 2) combinación óptima de fluorocromos marcados con anticuerpos, para minimizar el ruido; Y 3) configuración de clasificación de células. La eficiencia de clasificación se calcula tomando el número de eventos objetivo seleccionados para la clasificación dividido por el número de eventos objetivo detectados, expresado como un porcentaje. La eficiencia de clasificación es un cálculo proporcionado por el equipo. Esta eficiencia depende de la configuración del sistema de clasificación y del modo de clasificación de células. La elección de una combinación óptima de fluorocromos es un proceso complejo. Cada gripeOrochrome tiene propiedades distintas y se caracteriza por sus longitudes de onda de excitación y emisión. Mientras la excitación se lee con un láser, la emisión se lee mediante tubos fotomultiplicadores, que están limitados por los filtros ópticos disponibles en el equipo de clasificación FACS. Aquí, se proporciona una combinación de fluorocromos marcados con anticuerpos PE, PE-Cyanine7, AF700 y BV421. Esto se determinó después de considerar múltiples combinaciones de fluorocromo que proporcionaron la mejor resolución al tiempo que reducían la superposición espectral. Por último, la configuración de clasificación es crítica. En general, las células retinianas son frágiles. Por lo tanto, es mejor utilizar una presión más baja para ejecutar las muestras, para minimizar la tensión sobre las células. Es crítico mantener la muestra a 4 ° C, porque mantener los RGC murinos durante períodos más largos de tiempo a temperatura ambiente puede reducir el rendimiento celular, especialmente cuando se clasifican grandes cantidades de células.
La clasificación basada en FACS es una metodología ideal para el aislamiento de células que componen avPequeño porcentaje de la suspensión celular. El proceso, desde la disección de la retina hasta la finalización de la clasificación celular, toma aproximadamente de 5 a 6 h, en comparación con los sistemas de inmunopanación y trazador, que tardan días en completarse. El análisis multidimensional de FACS y la capacidad del equipo para recolectar varias poblaciones viables permite análisis funcionales adicionales de las células. El protocolo descrito aquí es una poderosa herramienta para el aislamiento de RGC murinos primarios. A pesar de sus múltiples ventajas, incluyendo su sensibilidad, reproducibilidad y la identificación inmediata de células viables, existen algunas limitaciones. En primer lugar, requiere una instrumentación costosa y un operador altamente capacitado. Por lo general, el operador es un inmunólogo o un individuo altamente capacitado en el campo, con quien es necesario reunirse en el momento de la configuración del experimento. Hoy en día, las instalaciones académicas tienen múltiples instalaciones básicas, lo que puede facilitar la realización de este tipo de experimentos. En segundo lugar, los CGR pierden suDebido a la atoxomía, haciéndolos muy pequeños en tamaño. En este momento, no se sabe si algunos de sus genes pueden ser modulados debido a la atoxomía.
La metodología presentada aquí permite el análisis en sentido descendente de la función RGC in vitro y es una herramienta valiosa para ser utilizada en los campos de las ciencias visuales y de la salud. El mantenimiento de la producción de células ganglionares en el cerebro es necesario para la percepción visual y está en riesgo en múltiples enfermedades. Estas células pueden utilizarse para la experimentación controlada in vitro , tanto en modelos sanos como en los de enfermedad. Es posible realizar estudios electrofisiológicos, farmacológicos, bioquímicos y moleculares sobre estas células, lo cual es ideal para el desarrollo de futuras dianas terapéuticas.
Los autores declaran que no tienen intereses financieros en competencia.
Los autores desean agradecer al Sr. Tim Higgins, Illustrator Senior del Departamento de Microbiología, Inmunología y Bioquímica, por la asistencia técnica de video; Dr. Matthew W. Wilson para las discusiones y los miembros de los laboratorios Jablonski y Morales-Tirado por sus útiles comentarios. Este trabajo fue apoyado por el Premio al Investigador Joven del Instituto de Investigación Alcon (VMM-T), la Fundación de Investigación de la Universidad de Tennessee (VMM-T), el Instituto Nacional del Ojo EY021200 (MMJ), el Gerwin Fellowship (VMM-T); La Beca de Pre-doctorado Gerwin (ZKG), el Departamento de Defensa del Ejército de Investigación Médica y el Comando de Materiales (VMM-T), y la subvención no restringida de la investigación para prevenir la ceguera.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Anti-mouse CD15 PE | BioLegend | 125606 | Clone MC-480 |
Anti-mouse CD48 PE-Cy7 | BioLegend | 103424 | Clone HM48-1 |
Anti-mouse CD57 | Sigma Aldrich | C6680-100TST | Clone VC1.1 |
Anti-mouse CD90.2 AF700 | BioLegend | 105320 | Clone 30-H12 |
Brilliant Violet 421 Goat Anti-mouse IgG | BioLegend | 405317 | Clone Poly4053 |
Purified Anti-mouse CD16/32 | BioLegend | 101302 | FcgRII/III block, Clone 93 |
Zombie Aqua | BioLegend | 423102 | Live cell/ Dead cell discrimination |
Fetal Bovine Serum | Hyclone | SH30071.03 | U.S. origin |
AbC Total Antibody Compensation Bead Kit | Thermo Fisher Scientific | A10497 | Multi-species Ig |
Neurobasal Medium | Thermo Fisher Scientific | 21103049 | Add serum to media prior to culture. |
Phosphate-Buffered Saline (PBS) | Thermo Fisher Scientific | 10010049 | Saline solution |
Dissection Microscope | Olympus | SZ-PT Model | Stereo Microscope |
Sorvall Centrifuge | Thermo Scientific | ST 16R | All centrifugation performed at RT |
Base Plate – Dissection Pan | Fisher Scientific | SB15233FIM | A wax plate can also be used |
Forceps | Aesculap | 5002-7 | 4 ½ inches |
Iris Scissors, Straight | Aesculap | 1360 | 5 ½ inches |
Falcon 15 mL conical tubes | Fisher Scientific | 352097 | Polypropylene tubes |
Falcon 50 mL conical tubes | Fisher Scientific | 352098 | Polypropylene tubes |
BD FACS Tubes | Fisher Scientific | 352003 | Polypropylene tubes |
40 mm dishes | MidSci | TP93040 | Tissue culture treated |
70 μm nylon strainer | MidSci | 70ICS | sterile |
40 μm nylon strainer | MidSci | 40ICS | sterile |
BD 10 mL syringe | Fisher Scientific | 301604 | Disposable Syringe without needle |
Pestles | MidSci | PEST | sterile |
Wheaton Vials | Fisher Scientific | 986734 | No Liner |
BD 30 G needle | Fisher Scientific | 305128 | 1 inch |
Hausser Scientific Bright-Line Glass Counting Chamber | Fisher Scientific | 0267151B | Hemocytometer |
Gibco Trypan blue 0.4% Solution | Fisher Scientific | 15250061 | Viability Dye |
Eppendorf tubes | Fisher Scientific | 05-402-25 | 1.5mL |
EVOS Floid Cell Imaging | Thermo Fisher Scientific | 447113 | Fluorescence Imaging with a 20X objective |
100% Ethanol | Fisher Scientific | 04-355-452 | Used to make 70% Ethanol |
Pipet-Lite LTS Pipette L-1000XLS+ | Rainin | 17014282 | LTS Pipette |
Pipet-Lite LTS Pipette L-200XLS+ | Rainin | 17014391 | LTS Pipette |
Pipet-Lite LTS Pipette L-20XLS+ | Rainin | 17014392 | LTS Pipette |
Rack LTS 1000 mL – GPS-L1000S | Rainin | 17005088 | Blue Rack Sterile Tips |
Rack LTS 250 mL – GPS-L250S | Rainin | 17005092 | Green Rack Sterile Tips |
Rack LTS 20 mL – GPS-L10S | Rainin | 17005090 | Red Rack Sterile Tips |
FACSAria II Cell Sorter | BD Biosciences | N/A | Custom order |
LSR II Cytometer | BD Biosciences | N/A | Custom order |
Abca8a | Thermo Fisher Scientific | Mm00462440_m1 | Müller cells |
Aldh1al | Thermo Fisher Scientific | Mm00657317_m1 | Müller cells |
Aqp4 | Thermo Fisher Scientific | Mm00802131_m1 | Astrocytes |
Calb2 | Thermo Fisher Scientific | Mm00801461_m1 | Amacrine, Horizontal |
Cd68 | Thermo Fisher Scientific | Mm03047340_m1 | Retinal Pigment Epithelial Cells |
Gad2 | Thermo Fisher Scientific | Mm00484623_m1 | Amacrine |
Hprt | Thermo Fisher Scientific | Mm01545399_m1 | House keeping gene |
Lhx1 | Thermo Fisher Scientific | Mm01297482_m1 | Horizontal |
Lim2 | Thermo Fisher Scientific | Mm00624623_m1 | Horizontal |
Nrl | Thermo Fisher Scientific | Mm00476550_m1 | Photoreceptors |
Ntrk1 | Thermo Fisher Scientific | Mm01219406_m1 | Horizontal |
Pcp4 | Thermo Fisher Scientific | Mm00500973_m1 | Bipolar, Amacrine |
Pou4f1 | Thermo Fisher Scientific | Mm02343791_m1 | Retinal Ganglion Cells |
Prdx6 | Thermo Fisher Scientific | Mm00725435_s1 | Astrocytes |
Prkca | Thermo Fisher Scientific | Mm00440858_m1 | Bipolar |
Prox1 | Thermo Fisher Scientific | Mm00435969_m1 | Horizontal |
Pvalb | Thermo Fisher Scientific | Mm00443100_m1 | Amacrine |
Rbpms | Thermo Fisher Scientific | Mm02343791_m1 | Retinal Ganglion Cells |
Rom1 | Thermo Fisher Scientific | Mm00436364_g1 | Photoreceptors |
Rpe65 | Thermo Fisher Scientific | Mm00504133_m1 | Retinal Pigment Epithelial cells |
Slc1a3 | Thermo Fisher Scientific | Mm00600697_m1 | Astrocytes |
Slc6a9 | Thermo Fisher Scientific | Mm00433662_m1 | Amacrine |
Sncg | Thermo Fisher Scientific | Mm00488345_m1 | Retinal Ganglion Cells |
Tubb3 | Thermo Fisher Scientific | Mm00727586_s1 | Retinal Ganglion Cells |
Vim | Thermo Fisher Scientific | Mm01333430_m1 | Müller cells |
Taqman Universal Master Mix | Thermo Fisher Scientific | 4440047 | qPCR Reagent |
miRNeasy Mini Kit | Qiagen | 217004 | RNA Isolation |
SuperScript VILO cDNA Synthesis Kit | Thermo Fisher Scientific | 11754250 | cDNA synthesis |
Taqman PreAmp Master Mix | Thermo Fisher Scientific | 4391128 | Pre-Amplification step |
BD Cytofix/ Cytoperm | BD Biosciences | 554714 | Fixation/ Permeabilization Buffer |
BD Perm/ Wash | BD Biosciences | 554723 | Permeabilization Solution |
RBPMS | Santa Cruz Biotechnology | sc-86815 | intracellular antibody |
SNCG | Gene Tex | GTX110483 | intracellular antibody |
BRN3A | Santa Cruz Biotechnology | sc-8429 | intracellular antibody |
TUJ1 | BioLegend | 801202 | intracellular antibody |
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