Method Article
* 이 저자들은 동등하게 기여했습니다
이 프로토콜은 히스톤 샤페론 올리고머화 및 안정성을 연구하기 위한 분석 크기 배제 크로마토그래피, 히스톤 샤페론-히스톤 상호작용을 밝히기 위한 풀다운 분석, 단백질 복합체의 화학량론을 분석하기 위한 AUC, 추정 히스톤 샤페론을 시험 관 내에서 기능적으로 특성화하기 위한 히스톤 샤페로닝 분석을 포함하는 일련의 방법을 설명합니다.
히스톤 단백질은 DNA와 결합하여 진핵 염색질을 형성합니다. 염색질의 기본 단위는 DNA로 둘러싸인 핵심 히스톤 H2A, H2B, H3 및 H4의 두 사본으로 구성된 히스톤 옥타머로 구성된 뉴 클레오 솜입니다. 옥타머는 H2A/H2B 이량체의 두 사본과 H3/H4 사량체의 단일 사본으로 구성됩니다. 고도로 충전 된 코어 히스톤은 세포질 및 핵의 여러 단백질과 비특이적 상호 작용을하는 경향이 있습니다. 히스톤 샤페론은 다양한 종류의 단백질을 형성하여 히스톤을 세포질에서 핵으로 셔틀하고 DNA로의 침착을 도와 뉴 클레오 솜 조립 과정을 돕습니다. 일부 히스톤 샤페론은 H2A/H2B 또는 H3/H4에 특이적이며 일부는 둘 다에 대한 샤페론으로 기능합니다. 이 프로토콜은 풀다운 분석, 분석 크기 배제 크로마토그래피, 분석 초원심분리 및 히스톤 샤프롱 분석과 같은 시험관 내 실험실 기술을 함께 사용하여 주어진 단백질이 히스톤 샤페론으로 기능하는지 여부를 확인하는 방법을 설명합니다.
DNA와 히스톤 단백질로 구성된 뉴 클레오 솜은 염색질의 구조 단위를 형성하고 몇 가지 중요한 세포 사건을 조절합니다. 뉴클레오솜은 복제, 전사 및 번역 1,2와 같은 다양한 프로세스에 DNA에 접근할 수 있도록 동적으로 재배치되고 리모델링됩니다. 매우 염기성인 히스톤은 세포 환경에서 산성 단백질과 상호 작용하거나 응집되는 경향이 있어 다양한세포 결함을 유발합니다3,4,5. 히스톤 샤페론이라고 하는 전용 단백질 그룹은 세포질에서 핵으로의 히스톤 수송을 돕고 비정상적인 히스톤-DNA응집 사건을 방지합니다6,7. 근본적으로, 대부분의 히스톤 샤페론은 생리적 이온 강도로 히스톤을 저장하고 DNA에 전달하여 뉴 클레오 솜 8,9의 형성을 돕습니다. 일부 히스톤 샤페론은 히스톤 올리고머 H2A/H2B 또는 H3/H410에 대해 확실한 선호도를 갖는다.
히스톤 샤페론은 DNA 합성11에 의존적이거나 독립적 인 뉴 클레오 솜을 조립하는 능력에 따라 특징 지어집니다. 예를 들어, 염색질 조립 인자 -1 (CAF-1)은 의존적 인 반면 히스톤 조절자 A (HIRA)는 DNA 합성12,13과 독립적입니다. 유사하게, 히스톤 샤페론의 뉴 클레오 플라스 민 패밀리는 정자 염색질 축합 및 뉴 클레오 솜 어셈블리14에 관여합니다. 뉴 클레오 솜 어셈블리 단백질 (NAP) 패밀리 구성원은 시험관 내에서 뉴 클레오 솜 유사 구조의 형성을 촉진하고 세포질과 핵15 사이의 히스톤 왕복에 관여합니다. 뉴클레오플라스민과 NAP 계열 단백질은 모두 기능성 히스톤 샤페론이지만 구조적 특징을 공유하지 않습니다. 본질적으로, 단백질을 히스톤 샤페론(16)으로 분류할 수 있는 단일 구조적 특징은 없다. 구조 연구와 함께 기능적 및 생물 물리학 적 분석의 사용은 히스톤 샤페론을 특성화하는 데 가장 효과적입니다.
이 연구는 단백질을 뉴 클레오 솜 조립을 돕는 히스톤 샤페론으로 특성화하는 생화학 적 및 생물 물리학 적 방법을 설명합니다. 먼저, 히스톤 샤페론의 올리고머 상태 및 안정성을 분석하기 위해 분석 크기 배제 크로마토 그래피를 수행하였다. 다음으로, 히스톤 샤페론-히스톤 상호작용의 원동력과 경쟁적 특성을 결정하기 위해 풀다운 분석을 수행하였다. 그러나 이러한 상호 작용의 유체역학적 파라미터는 단백질의 모양과 컬럼을 통한 이동에 영향을 미치는 복합체 때문에 분석 크기 배제 크로마토그래피를 사용하여 정확하게 계산할 수 없었습니다. 따라서 정확한 분자량, 상호 작용의 화학량론 및 생물학적 분자의 모양을 포함하는 용액 내 거대분자 특성을 제공하는 분석적 초원심분리가 사용되었습니다. 과거 연구는 yScS11617, DmACF 18, ScRTT106p19, HsNPM120과 같은 히스톤 샤페론을 기능적으로 특성화하기 위해 시험관 내 히스톤 샤페론 분석을 광범위하게 사용했습니다. 히스톤 샤페론 분석은 또한 단백질을 히스톤 샤페론으로 기능적으로 특성화하기 위해 사용되었습니다.
1. 히스톤 샤페론의 올리고머 상태 및 안정성을 설명하기 위한 분석 크기 배제 크로마토그래피
2. 히스톤 올리고머와 히스톤 샤페론 사이의 복잡한 형성에 기여하는 상호 작용의 유형을 이해하기 위한 염 구배 기반 풀다운 분석
3. H2A/H2B 또는 H3/H4에 대한 히스톤 샤페론의 선호도를 식별하기 위한 경쟁력 있는 풀다운 분석
4. 히스톤 샤페론과 히스톤 사이의 결합 화학량론을 분석하기 위한 분석적 초원심분리 - 침강 속도(AUC-SV) 실험
5. 히스톤 보호자 기능을 확인하기 위한 플라스미드 슈퍼코일링 분석
애기장대 탈리아나로부터의 단백질 FKBP53의 재조합 N-말단 뉴클레오플라스민 도메인을 SEC에 분석하였다. 용리 피크 부피는 표준 곡선에 대해 플롯팅되어 올리고머 상태를 식별했습니다. 분석 SEC 결과는 도메인이 용액에서 펜타머로 존재하며 대략 분자량이 58kDa임을 보여주었습니다(그림 1A,B). 또한, 뉴클레오플라스민 도메인은 분석 SEC와 함께 열적 및 화학적 안정성에 대해 분석되었다. 90 ° C까지 열처리 된 뉴 클레오 플라스 민 샘플은 20 ° C에서 유지 된 샘플과 비교하여 용리 부피와 피크 높이의 명백한 변화를 나타내지 않았으며, 이는 도메인이 매우 열 안정성임을 시사합니다 (그림 1C). 마찬가지로, 뉴 클레오 플라스 민 도메인은 최대 2M의 NaCl (그림 1D)의 염 안정성과 최대 4M의 요소 안정성 (그림 1E)을 나타 냈습니다. 그러나 뉴 클레오 플라스 민 펜타 머는 더 높은 요소 농도에서 해리되기 시작했습니다.
그래디언트 염 세척을 사용하여 히스톤 샤페론(AtFKBP53의 뉴클레오플라스민 도메인)과 히스톤 올리고머 H2A/H2B 이량체 및 H3/H4 사량체 사이의 복합체 형성에 기여하는 상호 작용의 유형을 결정하기 위해 풀다운 분석을 수행했습니다. 뉴 클레오 플라스 민 도메인과 H2A / H2B 이량 체의 상호 작용은 0.4M NaCl의 염 농도까지 안정적이었습니다 (그림 2A). 이에 비해 H3/H4와의 연관성은 0.7M NaCl까지 상당히 안정적이었습니다(그림 2B). 높은 염 농도를 견딜 수있는 샤페론-히스톤 복합체의 능력은 복합체를 안정화시키는 소수성 상호 작용의 역할을 시사합니다. H3 / H4가 높은 염 농도에서도 안정한 샤페론 복합체는 복합체 형성에서 소수성 상호 작용의 주된 역할을 시사합니다. 높은 염 농도에서 H2A / H2B- 샤페론 복합체의 낮은 안정성은 복합체 형성에서 정전기 상호 작용에 중요한 역할을한다는 것을 나타냅니다. 다른 실험에서, 풀다운 분석은 샤페론이 H2A/H2B 이량체 또는 H3/H4 사량체를 선호하는지 여부를 조사하기 위해 사용되었다. 결과는 샤페론이 샤페론에 첨가되는 순서에 관계없이 H2A / H2B 이량 체와 H3 / H4 사량 체에 동시에 결합하는 것으로 나타났습니다 (그림 2C, D). 이것은 샤페론이 히스톤 올리고머와의 상호 작용을 위해 별도의 부위를 가지고 있음을 나타냅니다.
AUC-SV 실험 (그림 3)은 히스톤 올리고머와 샤페론 사이의 상호 작용의 화학 양 론을 연구하기 위해 수행되었습니다. AUC-SV 데이터 분석은 104kDa의 분자량에 해당하는 H2A/H2B와 복합체의 AtFKBP53 뉴클레오플라스민 도메인에 대해 5.40S의 침강 계수(들) 값을 제공했습니다. 뉴 클레오 플라스 민 도메인과 H3 / H4의 복합체는 129kDa에 해당하는 7.35S의 침강 계수 값을 주었다. 복합체의 추정된 분자량은 펜타머 뉴클레오플라스민이 1:1 화학량론에서 H2A/H2B 이량체 및 H3/H4 사량체 모두와 복합체를 형성한다는 것을 보여줍니다.
단백질이 히스톤 올리고머를 DNA에 침착시켜 히스톤 샤페론임을 확인할 수 있음을 보여주는 것이 중요합니다. 이를 위해 플라스미드 슈퍼코일링 분석법이 채택되었습니다(그림 4). 이완된 원형 플라스미드를 히스톤 올리고머 H2A/H2B 및 H3/H4와 함께 NAP 패밀리의 재조합 식물 히스톤 샤페론인 AtNRP1 및 AtNRP228과 함께 인큐베이션하였다. 샤페론의 존재는 슈퍼코일 플라스미드의 양을 증가시켜 DNA에 히스톤을 침착시켜 뉴클레오솜을 형성하여 DNA 슈퍼코일링을 유발할 수 있음을 시사합니다.
그림 1: AtFBP53의 뉴클레오플라스민 도메인의 올리고머 상태 및 안정성. (A) AtFKBP53 뉴클레오플라스민 도메인의 분석 크기-배제 크로마토그래피 프로파일. (B) 알려진 분자량의 구형 단백질을 사용하여 얻은 검량선. 파란색 점은 알려진 단백질의 분자량을 나타내고 빨간색 점은 AtFKBP53 뉴 클레오 플라스 민 도메인을 나타냅니다. (440 kDa - 페리틴, 158 kDa- 알 돌라 제, 75 kDa- 콘 알부민, 44 kDa- 오브 알부민, 6.5 kDa- 아프로 티닌). (C) 20 ° C (녹색), 40 ° C (주황색), 60 ° C (검은 색), 90 ° C (하늘색)의 다른 온도에서 열처리 된 0.5 mg / mL AtFKBP53 뉴 클레오 플라스 민 도메인의 500 μL의 분석 크기 배제 크로마토 그램. (D) 상이한 NaCl 농도를 함유하는 완충액에서 0.5 mg / mL AtFKBP53 뉴 클레오 플라스 민 도메인의 500 μL의 분석 크기 배제 크로마토 그램 : 0.3 M (보라색), 0.6 M (빨간색), 1.0 M (하늘색), 1.5 M (녹색), 2.0 M (검은 색). (E) 요소 농도가 다른 완충액에서 AtFKBP53 뉴 클레오 플라스 민 도메인의 분석 크기 배제 크로마토 그램 : 0M (대조군, 하늘색), 1.0M (분홍색), 2.0M (검은 색), 3.0M (진한 파란색), 4.0M (녹색), 5.0M (갈색). 뉴 클레오 플라스 민 펜타 머는 열 및 화학적 스트레스 조건에 대해 높은 안정성을 나타냅니다. 이 그림은 참고자료21에서 발췌한 것입니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 2: AtFKBP53의 뉴클레오플라스민 도메인과 히스톤 올리고머의 상호작용에 대한 풀다운 분석. 분석으로부터의 용리 분획의 18% SDS-PAGE 이미지가 여기에 제시된다. 0.3 M, 0.5 M, 0.6 M, 0.7 M, 0.8 M, 0.9 M 및 1.0 M 범위의 NaCl 농도 증가에서 5 μM AtFKBP53 뉴 클레오 플라스 민 도메인을 갖는 (A) 20 μM H2A / H2B 이량 체 및 (B) 20 μM H3 / H4 사량 체에 대한 풀다운 분석. 5 μM AtFKBP53 FKBD를 여기에서 음성 대조군으로 사용하였다. 경쟁적 결합 실험을 위해, ( C ) 20-60 μM H2A/H2B 이량체 범위와 함께 배양된 5 μM AtFKBP53 뉴클레오플라스민 도메인 및 20 μM H3/H4 사량체의 혼합물 및 (D) 20-60 μM H3/H4 사량체 범위로 인큐베이션된 5 μM AtFKBP53 뉴클레오플라스민 도메인 및 20 μM H2A/H2B 이량체의 혼합물이 사용되었습니다. 표지 AtFKBP53은 AtFKBP53의 뉴클레오플라스민 도메인에 상응한다. 용리 분획은 두 히스톤 올리고머가 뉴클레오플라스민에 동시에 결합하는 것을 보여줍니다. 이 그림은 참고자료21에서 발췌한 것입니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 3: 히스톤 올리고머, AtFKBP53의 뉴클레오플라스민 도메인 및 그 복합체의 분석적 초원심분리 - 침강 속도(AUC-SV) 실험. AUC 거리 분포 대 침강 계수 (S) 플롯. 수득된 침강 계수(들) 값 및 분자 질량이 또한 제공된다. 표지 AtFKBP53은 AtFKBP53의 뉴클레오플라스민 도메인에 상응한다. 추정된 분자 질량은 히스톤 올리고머 H2A/H2B 이량체 및 H3/H4 사량체를 갖는 AtFKBP53 뉴클레오플라스민 도메인에 대한 1:1 화학량론을 나타냅니다. 0.3-0.5의OD280 을 갖는 모든 단백질 샘플 450 μL를 AUC-SV 실험에 사용하였다. 이 그림은 참고자료21에서 발췌한 것입니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
그림 4: 플라스미드 슈퍼코일링 분석. 히스톤 샤페론 AtNRP1 및 AtNRP2에 대한 플라스미드 슈퍼코일링 분석. 500ng의 pUC19 플라스미드 DNA를 실험을 위해 1μg의 토포이소머라제 I로 전처리하였다. 4 μM AtNRP1, 4 μM AtNRP2, 및 4 μM H2A/H2B 이량체 및 2 μM H3/H4 사량체의 혼합물은 전처리된 pUC19 DNA와 함께 인큐베이션했을 때 슈퍼코일링 활성을 나타내지 않는 대조군이었다. 4μM H2A/H2B의 이량체와 2μM H3/H4의 사량체 및 각각 4μM의 AtNRP1 및 AtNRP2의 혼합물이 있는 레인은 전처리된 pUC19 DNA와의 배양 시 슈퍼코일 DNA의 형성을 보여줍니다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭하십시오.
이 작업은 추정되는 히스톤 샤페론의 생화학적 및 생물물리학적 특성화를 위한 포괄적인 프로토콜 세트를 보여주고 검증합니다. 본원에서, 재조합 발현 및 정제된 NAP 패밀리 단백질, AtNRP1 및 AtNRP2, 및 AtFKBP53의 N-말단 뉴클레오플라스민 도메인을 사용하여 프로토콜을 입증하였다. 동일한 실험 세트가 이전에 특성화되지 않은 히스톤 샤페론의 기능적 특성을 모든 유기체에서 설명하는 데 매우 잘 사용될 수 있습니다.
프로토콜 섹션의 첫 번째 부분은 히스톤 샤페론의 올리고머 상태와 안정성을 조사하는 것입니다. 여러 보고서에 따르면 히스톤 샤페론은 올리고머 상태에서 상당한 다양성을 나타냅니다. 예를 들어, 인간 CAF-1은 단량체29로서 존재한다. NAP 패밀리 구성원은 이량 체 또는 사량 체 29,30,31로 존재합니다. 뉴 클레오 플라스 민은 펜타 머 및 종종 데카 메라 올리고머 상태32,33을 나타냅니다. 분석 SEC 실험은 히스톤 샤페론의 올리고머 상태를 결정할 수 있으며 AUC-SV 실험은 이를 확인할 수 있습니다. 히스톤 샤페론의 몇몇은 다양한 열 및 화학적 스트레스 조건 (33,34) 하에서 매우 안정한 것으로 알려져 있다. 히스톤 샤페론의 열 및 화학적 안정성 특성은 분석 SEC와 함께 조사 할 수도 있습니다. 또한, 원형 이색성 분광법은 화학 물질의 온도 상승 또는 더 높은 농도에 노출 될 때 샤페론의 2 차 구조의 변화에 대한 심층 분석에 효과적으로 사용될 수 있습니다.
프로토콜 섹션의 두 번째 부분에서는 샤페론의 히스톤 올리고머 선호도를 식별하기 위해 염 구배 접근법과 경쟁적 풀다운 분석을 사용하여 히스톤 올리고머와 샤페론의 연관성을 돕는 기본적인 상호 작용을 조사할 수 있는 풀다운 분석을 다룹니다. 복합체가 염 농도의 약간의 증가로 분해되면 복합체를 안정화시키는 데 정전기 상호 작용이 크게 기여할 수 있음을 시사합니다. 고염에서의 온전한 복합체는 복합체35를 안정화시키는데 있어서 소수성에 대해 중요한 역할을 할 것임을 시사한다. 경쟁적 풀다운 분석은 특정 히스톤 올리고머 클래스에 대한 히스톤 샤페론의 특이성 또는 선호도를 결정하기 위해 쉽게 사용될 수 있습니다. 히스톤 올리고머에 대한 선호도에 따라 히스톤 샤페론은 H2A/H2B 샤페론, H3/H4 샤페론 및 H2A/H2B-H3/H4 샤페론10,36과 같은 세 가지 범주로 분류할 수 있습니다. 또한 필요한 경우 등온 적정 열량계 (ITC)를 사용하여 주어진 샤페론의 히스톤 올리고머 특이성과 상호 작용의 열역학적 특성을 이해할 수 있습니다.
프로토콜 섹션의 세 번째 부분은 히스톤 샤페론과 히스톤 올리고머 사이의 상호 작용 화학량론에 대한 조사를 다룹니다. 일반적으로, 히스톤 샤페론의 상이한 패밀리는 H2A/H2B 또는/및 H3/H4 21,28,37,38과의 연관성의 화학량론에 대해 상당히 다르다. AUC-SV 실험은 단백질 또는 그 복합체의 침강 계수 및 분자량을 얻는 데 도움이되며, 이는 복합체 형성에서 화학 양 론을 정확하게 추정하는 데 매우 유용합니다. 또는 ITC를 사용하여 화학량론을 검사할 수도 있습니다.
프로토콜 섹션의 네 번째 부분은 히스톤 샤페론의 뉴 클레오 솜 조립 기능을 조사하는 데 중점을 둡니다. 히스톤 샤페론은 복제, 전사 및 DNA 복구와 같은 중요한 세포 과정을 조절하는 뉴 클레오 솜 조립에 중요한 역할을합니다39. 히스톤 샤페론의 히스톤 샤페로닝 활성의 시험관내 평가에 전형적으로 사용되는 플라스미드 슈퍼코일링 분석이 이 섹션에서 자세히 설명됩니다.
모든 히스톤 보호자가 완전히 구조화 된 것은 아닙니다. 본질적으로 무질서한 영역40,41을 가진 것으로 알려진 사람은 거의 없습니다. 따라서, 열 및 화학적 안정성 분석은 이러한 단백질에 적합하지 않을 수 있다. 또한, 다른 유기체의 히스톤 샤페론은 다른 올리고머 상태와 히스톤에 결합하는 차별적 인 능력을 가지고 있습니다. 따라서 이 프로토콜은 좋은 출발점이 될 수 있지만 필요에 따라 수정해야 합니다.
이해 상충이 선언되지 않았습니다.
인도 정부 과학 및 공학 연구 위원회[CRG/2018/000695/PS]와 인도 정부 과학기술부 생명공학부[BT/INF/22/SP33046/2019]의 Dileep Vasudevan에 대한 교외 보조금과 부바네스와르 생명 과학 연구소의 교내 지원은 크게 인정받고 있습니다. 히스톤 준비에 도움을 주신 Sudeshna Sen 씨와 Annapurna Sahoo 씨에게 감사드립니다. 동료 Chinmayee Mohapatra 박사, Manas Kumar Jagdev 및 Shaikh Nausad Hossain 박사와의 토론도 인정됩니다.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Acetic acid (glacial) | Sigma | A6283 | |
Acrylamide | MP Biomedicals | 814326 | |
Agarose | MP Biomedicals | 193983 | |
AKTA Pure 25M FPLC | Cytiva | 29018226 | Instrument for protein purification |
Ammonium persulfate (APS) | Sigma | A3678 | |
An-60Ti rotor | Beckman Coulter | 361964 | Rotor for analytical ultracentrifugation |
Bovine serum albumin (BSA) | Sigma | A7030 | |
Chloroform | Sigma | C2432 | |
Coomassie brilliant blue R 250 | Sigma | 1.15444 | |
Dialysis tubing (7 kDa cut-off) | Thermo Fisher | 68700 | For dialysing protein samples |
Dithiothreitol (DTT) | MP Biomedicals | 100597 | |
DNA Loading Dye | New England Biolabs | B7025S | |
EDTA disodium salt | MP Biomedicals | 194822 | |
Electronic balance | Shimadzu | ATX224R | |
Ethanol | Sigma | E7023 | |
Ethidium bromide (EtBr) | Sigma | E8751 | |
Gel Doc System | Bio-Rad | 12009077 | For imaging gels after staining |
Horizontal gel electrophoresis apparatus | Bio-Rad | 1704405 | Instrument for agarose gel electrophoresis |
Hydrochloric acid (HCl) | Sigma | 320331 | |
Imidazole | MP Biomedicals | 102033 | |
Magnesium chloride (MgCl2) | Sigma | M8266 | |
Micropipettes | Eppendorf | Z683779 | For pipetting of micro-volumes |
Mini-PROTEAN electrophoresis system | Bio-Rad | 1658000 | Instrument for SDS-PAGE |
N,N-methylene-bis-acrylamide | MP Biomedicals | 800172 | |
Nano drop | Thermo Fisher | ND-2000 | For measurement of protein and DNA concentrations |
Ni-NTA agarose | Invitrogen | R901-15 | Resin beads for pull-down assay |
Optima AUC analytical ultracentrifuge | Beckman Coulter | B86437 | Instrument for analytical ultracentrifugation |
pH Meter | Mettler Toledo | MT30130863 | |
Phenol | Sigma | P4557 | |
Plasmid isolation kit | Qiagen | 27104 | |
Proteinase K | Sigma-Aldrich | 1.07393 | |
pUC19 | Thermo Fisher | SD0061 | Plasmid for supercoiling assay |
Refrigerated high-speed centrifuge | Thermo Fisher | 75002402 | |
SDS-PAGE protein marker | Bio-Rad | 1610317 | |
SEDFIT | Free software program for analytical ultracentrifugation data analysis | ||
SEDNTERP | Free software program to estimate viscosity and density of buffer and partial specific volume of a protein | ||
SigmaPrep Spin Columns | Sigma | SC1000 | For pull-down assay |
Sodium acetate | Sigma | S2889 | |
Sodium chloride (NaCl) | Merck | S9888 | |
Sodium dodecyl sulfate (SDS) | MP Biomedicals | 102918 | |
Superdex 200 Increase 10/300 GL | Cytiva | 28990944 | Column for analytical size-exclusion chromatography |
Superdex 75 Increase 10/300 GL | Cytiva | 29148721 | Column for analytical size-exclusion chromatography |
TEMED | Sigma | 1.10732 | |
Topoisomerase I | Inspiralis | WGT102 | Enzyme used in plasmid supercoiling assay |
Tris base | Merck | T1503 | |
Tween-20 | Sigma | P1379 | |
Urea | MP Biomedicals | 191450 | |
Water bath | Nüve | NB 5 | For heat treatment of protein samples |
β-mercaptoethanol (β-ME) | Sigma | M6250 |
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