Method Article
אנו מציגים פרוטוקול לסינון תרכובות נגד נגיף הפטיטיס B (HBV) המכוונות לשלבי מחזור החיים של הכניסה לפני ואחרי הנגיף, תוך שימוש בקלורימטריית טיטרציה איזותרמית למדידת זיקה קושרת (KD) עם פוליפפטיד קו-טרנספורטינג של נתרן טאורוכולאט מארח. היעילות האנטי-ויראלית נקבעה באמצעות דיכוי סמני מחזור חיים נגיפיים (היווצרות cccDNA, שעתוק והרכבה ויראלית).
זיהום בנגיף הפטיטיס B (HBV) נחשב לגורם סיכון מכריע לקרצינומה הפטוצלולרית. הטיפול הנוכחי יכול רק להפחית את העומס הנגיפי אך לא לגרום להפוגה מוחלטת. מודל הפטוציטים יעיל לזיהום HBV יציע מחזור חיים נגיפי נאמן לחיים שיהיה חיוני לסינון של חומרים טיפוליים. רוב הסוכנים הזמינים נגד HBV מתמקדים בשלבי מחזור החיים לאחר כניסה ויראלית אך לא לפני כניסה ויראלית. פרוטוקול זה מפרט את יצירתו של מודל הפטוציטים מוכשר המסוגל לבצע סינון לסוכנים טיפוליים המכוונים לשלבי מחזור החיים של כניסה טרום-ויראלית ופוסט-ויראלית. זה כולל את ההתמקדות של נתרן טאורוחולאט cotransporting פוליפפטיד (NTCP) קשירה, היווצרות cccDNA, שעתוק, והרכבה ויראלית המבוססת על imHC או HepaRG כמו תאים מארחים. כאן, בדיקת עיכוב הכניסה HBV השתמשה בכורכומין כדי לעכב פונקציות קשירה והובלה של HBV באמצעות NTCP. המעכבים הוערכו עבור זיקה מחייבת (KD) עם NTCP באמצעות קלורימטריית טיטרציה איזותרמית (ITC) - כלי אוניברסלי לבדיקת תרופות HBV המבוסס על פרמטרים תרמודינמיים.
זיהום בנגיף הפטיטיס B (HBV) נחשב למחלה מסכנת חיים ברחבי העולם. זיהום HBV כרוני עמוס בסיכון לשחמת הכבד וקרצינומה הפטוצלולרית1. הטיפול הנוכחי נגד HBV מתמקד בעיקר בכניסה לאחר הנגיף באמצעות אנלוגים גרעיניים(t)IDE (NAs) ואינטרפרון-אלפא (IFN-α)2,3. הגילוי של מעכב כניסה HBV, Myrcludex B, זיהה מטרה חדשה לחומרים נגד HBV4. השילוב של מעכבי כניסה ו-NAs ב-HBV כרוני הפחית משמעותית את העומס הנגיפי בהשוואה לאלה המכוונים לשכפול נגיפי בלבד 5,6. עם זאת, המודל הקלאסי של הפטוציטים להקרנה של מעכבי כניסה HBV מוגבל על ידי רמות נמוכות של קולטנים נגיפיים (נתרן טאורוחולאט cotransporting polypeptide, NTCP). ביטוי יתר של hNTCP בתאי הפטומה (כלומר, HepG2 ו- Huh7) משפר את זיהום HBV 7,8. אף על פי כן, קווי תאים אלה מבטאים רמות נמוכות של אנזימים מעכלים של תרופות בשלב I ו-II ומפגינים חוסר יציבות גנטית9. מודלים של הפטוציטים שיכולים לסייע במיקוד מנגנונים מובחנים של תרכובות אנטי-HBV מועמדות כגון כניסה טרום-ויראלית, קשירת NTCP וכניסה ויראלית יזרזו את הזיהוי והפיתוח של משטרי שילוב יעילים. המחקר על פעילות אנטי-HBV של כורכומין הבהיר את עיכוב כניסת הנגיף כמנגנון חדש בנוסף להפרעה לאחר כניסת הנגיף. פרוטוקול זה מפרט מודל מארח להקרנה של מולקולות כניסה נגד HBV10.
המטרה של שיטה זו היא לחקור תרכובות אנטי-HBV מועמדות לעיכוב כניסה נגיפית, במיוחד חסימת קשירת NTCP והובלתו. מכיוון שביטוי NTCP הוא גורם קריטי לכניסה וזיהום של HBV, ביצענו אופטימיזציה של פרוטוקול ההבשלה של הפטוציטים כדי למקסם את רמות NTCP11. בנוסף, פרוטוקול זה יכול להבדיל בין ההשפעה המעכבת על כניסת HBV כעיכוב של חיבור HBV לעומת עיכוב של הפנמה. בדיקת ספיגת החומצה הטאורוכולית (TCA) שונתה גם היא באמצעות שיטה מבוססת ELISA במקום רדיואיזוטופ כדי לייצג הובלת NTCP12,13. האינטראקציה בין הקולטן לליגנד אושרה על ידי המבנים התלת-ממדיים שלהם14,15. ניתן להעריך את העיכוב של פונקציית NTCP על ידי מדידת פעילות ספיגת TCA16. עם זאת, טכניקה זו לא סיפקה עדות ישירה לקשירת NTCP למעכבי המועמדים. לכן, ניתן לחקור את הקשירה באמצעות טכניקות שונות, כגון תהודת פלסמוןפני השטח 17, ELISA, בדיקת הסטה תרמית מבוססת פלואורסצנציה (FTSA)18, FRET 19, AlphaScreen, ושיטות שונות אחרות20. בין טכניקות אלה, ITC הוא תקן מטרה בניתוח מחייב מכיוון שהוא יכול לצפות בספיגת חום או פליטה כמעט בכל תגובה21. זיקת הקשירה (KD) של NTCP ותרכובות מועמדות הוערכה ישירות באמצעות ITC; ערכי זיקה אלה היו מדויקים יותר מאלו שהושגו באמצעות מודל החיזוי של סיליקו 22.
פרוטוקול זה מכסה טכניקות בהבשלת הפטוציטים, זיהום HBV והקרנה למעכבי כניסה HBV. בקצרה, פותח מודל הפטוציטים המבוסס על קווי תאים imHC ו- HepaRG. התאים בתרבית התמינו להפטוציטים בוגרים תוך שבועיים. העלייה ברמות NTCP זוהתה באמצעות PCR בזמן אמת, כתם מערבי וציטומטריה של זרימה11. הפטיטיס B virion (HBVcc) הופק ונאסף מ- HepG2.2.15. ה-imHC או ה-HepaRG המובחנים (d-imHC, d-HepaRG) טופלו באופן מניעתי עם המועמדים נגד HBV שעתיים לפני החיסון ב-HBV virion. התוצאה הצפויה של הניסוי הייתה זיהוי הסוכנים המפחיתים את ה-HBV התאי ואת ההדבקה. פעילות אנטי-NTCP הוערכה באמצעות בדיקת קליטת TCA. ניתן לדכא את פעילות NTCP על ידי הסוכנים שקשרו באופן ספציפי את NTCP. טכניקת ITC שימשה כדי לחקור את ההיתכנות של קשירה אינטראקטיבית שיכולה לחזות מעכבים וחלבוני המטרה שלהם, ולקבוע את זיקת הקשירה (KD) של הליגנד לקולטן באמצעות אינטראקציות לא קוולנטיות של הקומפלקס הביומולקולרי23,24. לדוגמה, K D ≥ 1 × 103 mM מייצג כריכה חלשה, K D ≥ 1 × 106 μM מייצג כריכה בינונית, ו- K D ≤ 1 × 109 nM מייצג כריכה חזקה. ה- ΔG נמצא בקורלציה ישירה עם אינטראקציות מחייבות. בפרט, תגובה עם ΔG שלילי היא תגובה אקסרגונית, המציינת כי מחייב הוא תהליך ספונטני. תגובה עם ΔH שלילי מצביעה על כך שתהליכי הקשירה תלויים בקשרי מימן ובכוחות ואן דר ואלס. ניתן להשתמש הן בקליטת TCA והן בנתוני ITC כדי לסנן סוכני כניסה נגד HBV. התוצאות של פרוטוקולים אלה יכולות לספק בסיס לא רק לסינון נגד HBV אלא גם לאינטראקציה עם NTCP כפי שהיא מוערכת באמצעות זיקה מחייבת ופונקציית תחבורה. מאמר זה מתאר הכנה ואפיון של תאי מארח, תכנון ניסויי והערכה של הערך נגד HBV יחד עם זיקת קשירת NTCP.
הערה: יש לבצע את ההליכים הבאים במכסה מנוע זרימת סיכון ביולוגי מדרגה II או במכסה מנוע זרימה למינרית. הטיפול ב-HBV אושר אתית על ידי ה-IRB (MURA2020/1545). עיין בטבלת החומרים לקבלת פרטים על כל הפתרונות, הריאגנטים, הציוד וקווי התאים המשמשים בפרוטוקול זה.
1. הכנת תאים מארחים (הפטוציטים בוגרים)
2. כימות של NTCP סלולרי
3. ייצור חלקיקי HBV שמקורם בתרבית תאים (HBVcc)
4. בדיקת כניסה נגד HBV
5. בדיקת קשירת תאי HBV
6. בדיקת ספיגת חומצה טאורוכולית (TCA)
7. קביעת אינטראקציות חלבון-ליגנד באמצעות קלורימטריה איזותרמית
הערה: מערכת בדיקה זו פותחה על בסיס MicroCal PEAQ-ITC (תוכנת ITC).
8. ניתוח סטטיסטי
נצפו תכונות של הבשלת הכבד, כולל תאים דו-צדדיים ומורפולוגיה בצורת מצולע (איור 1), במיוחד בשלב ההבחנה, imHC (איור 1A). עלייה גדולה בביטוי NTCP נמדדה ב-d-HepaRG וב-d-imHC פי 7 ופי 40, בהתאמה (איור 1B). הצורה המגולגנת מאוד של NTCP, שהונחה כמעניקה רגישות לכניסת HBV, זוהתה יותר ב-d-imHC מאשר ב-d-HepaRG (איור 1C). ה-imHC הממוין הכיל רמות NTCP גבוהות ב-65.9% בהשוואה לתאים הלא מובחנים (איור 1D).
איור 2A מציג סיכום של הטיפול המניעתי. איור 2B מראה צביעת אימונופלואורסצנציה של HBV שבוצעה כדי להעריך את פעילויות הכניסה נגד HBV ביום השביעי לאחר ההדבקה, ואילו איור 2C מתאר את פרוטוקול הבדיקה המחייבת של HBV. רמת קשירת ה-HBV על פני השטח של התא הוערכה על-ידי PCR בזמן אמת (איור 2D). כדי לקבוע אם NTCP היה הקולטן לחיבור HBV, נקבעה קליטת TCA עבור מעכבי הקשירה המועמדים (איור 2E). בהתבסס על מודל זה, הפעילות המעכבת של תרכובות מועמדות הפחיתה את קשירת HBV באמצעות NTCP.
השינוי הקלורימטרי זוהה באמצעות זריקות רצופות לתא הדגימה (איור 3). רגרסיה סטנדרטית של ריבועים לא ליניאריים לפחות שורטטה על סמך אתר כריכה אחד שהותאם היטב לנתונים. הקו המוצק הצביע על ההתאמה הטובה ביותר לערכי הניסוי (איור 3A,B). טבלה 1 מציגה פרמטרים תרמודינמיים בקורלציה עם קשירת NTCP עם ציקלוספורין A (CsA) או תרכובת מועמדת.
איור 1: התבגרות בכבד של HepaRG ו-imHC עם אפיון NTCP. שתי שורות התאים עברו תרבית במדיום התבגרות בכבד במשך שבועיים. (A) מאפייני הפטוציטים כגון תאים דו-צדדיים ומורפולוגיה בצורת מצולע נצפו באופן בלעדי בשלב ההבשלה של imHC. סרגלי קנה מידה = 50 מיקרומטר. (B) הביטוי של NTCP הוסדר הן ב- HepaRG והן ב- imHC. NTCP מנורמל עם GAPDH היה גבוה יותר ב- imHC מאשר ב- HepaRG. (C) צורה גליקוזילית מאוד של NTCP נצפתה לאחר ההבשלה. (D) אחוז הגובה של NTCP ב-d-imHC הוערך באמצעות ציטומטריה של זרימה. הנתונים מוצגים כממוצע ± SD. *, **, ו- *** מייצגים הבדל סטטיסטי עם p < 0.05, p < 0.01 ו- p < 0.001, בהתאמה. קיצורים: NTCP = נתרן טאורוחולאט cotransporting פוליפפטיד; GAPDH = גליצרלדהיד 3-פוספט דהידרוגנאז; NTCP-FITC = פלואורסצין איזותיוציאנט המסומן NTCP. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.
איור 2: טיפול מניעתי ב-CCM הפחית את כניסת הנגיף, את ה-DNA התוך-תאי של HBV ואת פעילות ספיגת ה-TCA . (A) d-imHC טופלו מראש ב-CCM במשך שעתיים לפני החיסון ב-HBV. (B) פעילות הכניסה נגד HBV נקבעה על ידי צביעת אימונופלואורסצנציה ביום 7 לאחר ההדבקה. (C) לוח זמנים סכמטי של פרוטוקול מחייב HBV מוצג. (D) רמת הדנ"א של HBV המאוגד על הפטוציטים הוערכה והושוותה ל-4 μM CsA ולמעכב הכניסה הקלאסי HBV 25 יחידות/מ"ל הפרין. (E) ההשפעה של CCM של 10-30 μM על עיכוב ספיגת TCA מתווכת באמצעות קולטן NTCP. קיצורים: CCM = כורכומין; HBV = וירוס הפטיטיס B; TCA = חומצה טאורוכולית; d-imHC = imHC מובחן; CsA = ציקלוספורין A; HP = הפרין. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.
איור 3: הזיקה של NTCP למולקולות בודדות (CsA או תרכובת מועמדת) הודגמה באמצעות ITC. פרופיל ה-ITC לשילוב של NTCP עם (A) CsA או (B) כורכומין נוצר מהזרקה רציפה של תרכובת (150 μM CsA או מועמד) לתמיסת NTCP (15 μM של NTCP, pH 7.0, 25 °C). הנתונים הגולמיים הקלורימטריים בין הספק דיפרנציאלי (μcal/s) לזמן (min) שורטטו. הנתונים נותחו על סמך מודל כריכה של אתר אחד שבו הקווים המוצקים הצביעו על התוצאות המתאימות ביותר. במהלך הזרקת ליגנדות (CSA או כורכומין) לתמיסת NTCP, האנתלפיה (ΔH) השתנתה לאחר עלייה בריכוז הליגנד בתא הדגימה. נתונים אלה מצביעים על כך שתגובת הכריכה התרחשה. קיצורים: CsA = ציקלוספורין A; NTCP = נתרן טאורוחולאט cotransporting פוליפפטיד; ITC = קלורימטריה איזותרמית טיטרציה; DP = הספק דיפרנציאלי. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של נתון זה.
חלבון | ליגנד | קבוע כריכה (KD) | שינוי אנתלפיה (ΔH) | שינוי אנטרופיה (ΔTΔS) | שינוי אנרגיה חופשית של גיבס (ΔG) | סוג הכריכה |
(ז-1) | (קק"ל/מול) | (קק"ל/מול) | (קק"ל/מול) | |||
NTCP אנושי (SLA10A1) | CCM | 1.21 ×10-6 | -1 | 0.6 | -0.39 | קשר מימן |
NTCP אנושי (SLA10A1) | TCA | 1 ×10-9 | 80 | -96 | -16 | אינטראקציה הידרופובית |
טבלה 1: פרמטרים תרמודינמיים הנובעים מהאינטראקציה בין NTCP לבין תרכובות בודדות (CCM ו- TCA) באמצעות ITC. קיצורים: NTCP = נתרן טאורוחולאט cotransporting פוליפפטיד; CCM = כורכומין; TCA = חומצה טאורוכולית; ITC = קלורימטריה של טיטרציה איזותרמית.
זיהום HBV מתחיל באמצעות זיקה נמוכה קשירה לפרוטאוגליקנים של הפראן סולפט (HSPGs) על הפטוציטים25, ולאחר מכן קשירה ל- NTCP עם הפנמה לאחר מכן באמצעות אנדוציטוזה26. מכיוון ש-NTCP הוא קולטן חיוני לכניסת HBV, ניתן לתרגם קלינית את הכניסה ל-HBV להפחתת זיהום דה נובו , העברה מאם לילד (MTCT) והישנות המחלה לאחר השתלת כבד. הפרעה לכניסת הנגיף תהיה תרופה חלופית אפשרית לזיהום כרוני ב-HBV.
כמה שלבים קריטיים בפרוטוקול הנ"ל מסוכמים כאן. בעת הכנת תאים מארחים, ודא כי הפטוציטים מגיעים למפגש של 100% לפני הוספת מדיום ההבשלה עם 2% DMSO. גידול הפטוציטים תת-קרקעיים ב-2% DMSO יוביל למוות ולניתוק של תאים. ניתן להאריך את תקופת ההבשלה עד 4 שבועות כדי למקסם את ביטוי NTCP27,28, אם כי מומלץ תקופת הבשלה של שבועיים.
שלוש טכניקות הוצעו לכימות ביטוי NTCP תאי. מומלץ למשתמשים לבחור את הטכניקה שהם מכירים היטב; כאן, העדפנו ציטומטריה של זרימה על פני ניתוח כתמים מערבי מכיוון שהיא נוחה, מהירה וקלה.
לצורך ייצור חלקיקי HBV שמקורם בתרבית תאים (HBVcc), HepG2.2.15 נגזר מ-HepG2 על ידי טרנספקציה חולפת עם גנום באורך מלא של HBV יחד עם גן העמידות לגנטיצין (G418)29. מדיום התרבית צריך להכיל גנטיצין של 380-500 מיקרוגרם/מ"ל, אחרת התאים לא ייצרו HBVcc. יש להשתמש במסנן 0.45 מיקרומטר בעל קשירת חלבון נמוכה כדי להבהיר את הסופר-נטנט כדי למנוע אובדן תפוקת HBV. לריכוז HBV, פוליאתילן גליקול (PEG) שימש עם צנטריפוגה סטנדרטית. חלקיקי HBV יכולים גם להיות מרוכזים באמצעות שיפוע סוכרוז ואולטרה-צנטריפוגציה. יש להימנע ממחזורי הקפאה והפשרה מרובים מכיוון שההדבקה תפחת.
בבדיקת הכניסה נגד HBV, ההפטוציטים חייבים להגיע למפגש של 100% לפני ההשראת ההבשלה. פרוטוקול זה פותח על בסיס טיפול מניעתי. תאים מארחים נחשפו לתרכובות המועמדות במשך שעתיים לפני ההדבקה ב-HBV12. לאחר 7 ימים לאחר ההדבקה, הוערכה הדבקה ב-HBV באמצעות אימונופלואורסצנציה. כל הרכיבים, הריכוזים של תמיסת החסימה, נוגדנים ראשוניים ומשניים ושלבי הכביסה חייבים להיות מותאמים כדי להשיג את התוצאה הטובה ביותר עם מינימום כתמים לא ספציפיים. כאן, סיפקנו ריכוזים וטכניקות אופטימליים.
פרוטוקול בדיקת קליטת TCA מתאר את תקן הזהב לעיכוב הובלת NTCP. שינינו את הפרוטוקול כדי להימנע מ-TCA רדיואקטיבי. השלבים הקריטיים לבדיקת קליטת TCA הם שטיפת תאים וקצירתם. כל ההליכים הללו חייבים להתבצע על קרח כל הזמן כדי למנוע פעילות תאית נוספת - הפנמה של התרכובת. לאחר הומוגניזציה של התאים וסילוק פסולת תאים, יש לשאוף בעדינות את הסופר-נאטנט מבלי להפריע לכדור. אם המתקן של המשתמש מאפשר שימוש בטכניקת ה-scintillation הנוזלית, 3חומצה H-taurocholic משמשת בדרך כלל במחקרי הובלה וספיגה של TCA. כפי שאימתנו קליטת TCA באמצעות ELISA, טכניקה חלופית זו יכולה להחליף את השימוש בתרכובת הרדיואקטיבית.
ITC היא שיטה ביופיזית הנמצאת בשימוש נרחב לקביעת הפרמטרים התרמודינמיים הקשורים לאינטראקציות בין חלבונים מסיסים לבין ליגנדות בעלות משקל מולקולרי קטן30,31. טכניקה זו יכולה לשמש כדי לחקור את האינטראקציה של ליגנדות שונות עם מולקולה קטנה או חלבון. ITC היא שיטה ישירה ולא פולשנית ללא שלבים נוספים לזיהוי אותות, ללא מגבלות משקל מולקולריות וללא תיוג, אימוביליזציה או כל שינוי כימי אחר. המגבלה של ITC היא התנאי המוקדם של ריכוזים גבוהים של החומרים המקיימים אינטראקציה. חלבון וליגנד צריכים להיות מטוהרים מאוד ומסיסים מספיק במים (10-100 מיקרומטר) בטמפרטורה של 25 מעלות צלזיוס למשך שעה אחת עם ערבוב. ניתן לזהות את תמיסת החלבון הלא יציבה באמצעות שינוי אות חום כפונקציה של זמן.
הפטוציטים משופרים-NTCP אנושיים מספקים מודל חלופי למחקר במבחנה של זיהום HBV, אך הם דומים ל- HepaRG ולהפטוציטים אנושיים ראשוניים. דגמים מארחים אלה נפגעים בשל האמינות המוגבלת והרגישותשלהם 8,33. התפשטות HBV לא יעילה בתאי HepG2-NTCP או Huh7-NTCP הוכחה על ידי אינוקולום HBV נמוך שמקורו בתאים המייצרים HBVcc. במספר מחקרים, HBV שימש להדבקת תאי המטרה ב-MOI של 1,00033,34. החלקיקים התת-ויראליים ב-HBVcc מכילים חלבון מעטפת HBV (L/M/S) וקושרים באופן תחרותי NTCP, וכתוצאה מכך ירידה בהדבקה35. כדי להתגבר על מגבלה זו, פרוטוקול זה שינה את תרבות HepaRG או imHC עם פרוטוקול הבשלה כדי למקסם את רמות NTCP. HBVcc שמקורו ב-HepG2.2.15 היה מרוכז לפני שנעשה בו שימוש כאינוקולום. ההדבקה ב-HBV הייתה גבוהה מ-80% ב-imHC מובחן בהתבסס על מדידת אנטיגן הליבה HBV11.
תיארנו את הזיהוי של תרכובות אנטי-HBV המכוונות ל-NTCP כדי להפריע לכניסת הנגיף, ואימצנו הליך הבשלה בכבד כדי להעלות את רמות ה-NTCP. כדי לזהות מעכבי כניסה, הפטוציטים טופלו מראש בתרכובות מועמדות במשך שעתיים לפני ההדבקה ב- HBV ב -4 מעלות צלזיוס כדי לאפשר קשירת נגיפי אך לא כניסה. הירידה בהדבקה ב-HBV נבדקה ביום השביעי לאחר ההדבקה. הנתונים המייצגים כללו ציקלוספורין A, מעכב NTCP קלאסי, כבקרה חיובית לאימות המודל.
מאחר ש-NTCP מקל על תפקודי אנדוציטוזה בתיווך טרנספורטר וקולטן, מעכבי כניסה של HBV יכולים להתמקד לפחות באחד מהמנגנונים הללו. ניתן להעריך את העיכוב של הובלת NTCP באמצעות בדיקת קליטת TCA המבוססת על ELISA, תוך ביטול ה- TCA הרדיואקטיבי מהפרוטוקול הקלאסי36. הזיקה בין NTCP לבין מעכב הכניסה נמדדה באמצעות ITC. טכניקה זו סיפקה פרמטרים תרמודינמיים חיוניים, כולל הסטויכיומטריה (n), קבוע הדיסוציאציה (KD), שינוי באנרגיה חופשית (ΔG), אנתלפיה (ΔH), אנטרופיה (ΔS) וקיבולת חום של קשירה (ΔCp). חומרים שונים נגד HBV זוהו על ידי עגינה מולקולרית, כגון קוורצטין, רוטין, הספרידין ולופרול, שיכולים לקשור באופן ספציפי HBV הפוך transcriptase דומה ללמיבודין, אנלוגי נוקלאוזיד. התרכובות נחקרו באמצעות ITC והפגינו אנרגיית גיב שלילית (−ΔG) שנעה בין −9.3 ל-−5.2 קק"ל/מול ו-KD של 1 × 10-6 עד 1 × 10-3 M עם HBV פולימראז37. יחד, הנתונים המתקבלים מהמבחנים הנ"ל יסייעו לסנן את היעילות האנטי-ויראלית של תרכובות מועמדות הפועלות כמעכבי כניסה של HBV. הפרוטוקול שנקבע יהיה שימושי לגילוי אנטגוניסטים / מעכבי NTCP חדשים. דיכוי הכניסה הנגיפית יכול להיות שימושי בטיפול מניעתי וטיפולי.
המחברים מצהירים כי המחקר נערך בהיעדר קשרים מסחריים או פיננסיים שיכולים להתפרש כניגוד עניינים פוטנציאלי.
פרויקט מחקר זה נתמך על ידי אוניברסיטת Mahidol והמחקר והחדשנות המדעית של תאילנד (TSRI) המוענקים בנפרד ל- A. Wongkajornsilp ו- K. Sa-ngiamsuntorn. עבודה זו נתמכה כספית על ידי המשרד הלאומי למחקר מדעי ומדיניות חדשנות באמצעות היחידה לניהול תוכניות לתחרותיות (מענק מספר C10F630093). A. Wongkajornsilp הוא זוכה במענק Chalermprakiat של הפקולטה לרפואה בית החולים סיריראג ', אוניברסיטת Mahidol. המחברים רוצים להודות למיס סאווין סימקאן (המרכז המצוין לגילוי תרופות, הפקולטה למדעים, אוניברסיטת מאהידול) על עזרתה בטכניקת ITC.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Cell lines | |||
HepaRG Cells, Cryopreserved | Thermo Fisher Scientific | HPRGC10 | |
Hep-G2/2.2.15 Human Hepatoblastoma Cell Line | Merck | SCC249 | |
Reagents | |||
4% Paraformadehyde Phosphate Buffer Solution | FUJIFLIM Wako chemical | 163-20145 | |
BD Perm/Wash buffer | BD Biosciences | 554723 | Perm/Wash buffer |
Cyclosporin A | abcam | 59865-13-3 | |
EDTA | Invitrogen | 15575-038 | 8 mM |
G 418 disulfate salt | Merck | 108321-42-2 | |
Halt Protease Inhibitor Cocktail EDTA-free (100x) | Thermo Scientific | 78425 | |
HEPES | Merck | 7365-45-9 | |
illustraTM RNAspin Mini RNA isolation kits | GE Healthcare | 25-0500-71 | |
illustra RNAspin Mini RNA Isolation Kit | GE Healthcare | 25-0500-71 | |
ImProm-II Reverse Transcription System | Promega | A3800 | |
KAPA SYBR FAST qPCR Kit | Kapa Biosystems | KK4600 | |
Lenti-X Concentrator | Takara bio | PT4421-2 | concentrator |
Luminata crescendo Western HRP substrate | Merck | WBLUR0100 | |
Master Mix (2x) Universal | Kapa Biosystems | KK4600 | |
Nucleospin DNA extraction kit | macherey-nagel | 1806/003 | |
Phosphate buffered saline | Merck | P3813 | |
Polyethylene glycol 8000 | Merck | 25322-68-3 | |
ProLong Gold Antifade Mountant | Thermo scientific | P36930 | |
Recombinant NTCP | Cloud-Clone | RPE421Hu02 | |
RIPA Lysis Buffer (10x) | Merck | 20-188 | |
TCA | Sigma | 345909-26-4 | |
TCA Elisa kit | Mybiosource | MB2033685 | |
Triton X-100 | Merck | 9036-19-5 | |
Trypsin-EDTA | Gibco | 25200072 | Dilute to 0.125% |
Antibodies | |||
Anti-NTCP1 antibody | Abcam | ab131084 | 1:100 dilution |
Anti-GAPDH antibody | Thermo Fisher Scientific | AM4300 | 1:200,000 dilution |
HRP-conjugated goat anti-rabbit antibody | Abcam | ab205718 | 1:10,000 dilution |
HRP goat anti-mouse secondary antibody | Abcam | ab97023 | 1:10,000 dilution |
Goat anti-Rabbit IgG Secondary Antibody, Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A-11008 | 1:500 dilution |
Reagent composition | |||
1° Antibody dilution buffer | |||
1x TBST | |||
3% BSA | Sigma | A7906-100G | Working concentration: 3% |
Sodium azide | Sigma | 199931 | Working concentration: 0.05% |
Hepatocyte Growth Medium | |||
DME/F12 | Gibco | 12400-024 | |
10% FBS | Sigma Aldrich | F7524 | |
1% Pen/Strep | HyClon | SV30010 | |
1% GlutaMAX | Gibco | 35050-061 | |
Hepatic maturation medium | |||
Williams’ E medium | Sigma Aldrich | W4125-1L | |
10% FBS | Sigma Aldrich | F7524 | |
1% Pen/Strep | HyClon | SV30010 | |
1% GlutaMAX | Gibco | 35050-061 | |
5 µg/mL Insulin | Sigma Aldrich | 91077C-100MG | |
50 µM hydrocotisone | Sigma Aldrich | H0888-1g | |
2% DMSO | PanReac AppliChem | A3672-250ml | |
IF Blocking solution | |||
1x PBS | Gibco | 21300-058 | |
3% BSA | Sigma | A7906-100G | Working concentration: 3% |
0.2% Triton X-100 | Sigma | T8787 | Working concentration: 0.2% |
RIPA Lysis Buffer Solution | Merck | 20-188 | Final concentration: 1X |
Protease Inhibitor Cocktail | Thermo Scientific | 78425 | Final concentration: 1X |
Na3VO4 | Final concentration: 1 mM | ||
PMSF | Final concentration: 1 mM | ||
NaF | Final concentration: 10 mM | ||
Western blot reagent | |||
10x Tris-buffered saline (TBS) | Bio-Rad | 170-6435 | Final concentration: 1X |
Tween 20 | Merck | 9005-64-5 | |
1x TBST | 0.1% Tween 20 | ||
1x PBS | Gibco | 21300-058 | |
Pierce BCA Protein Assay Kit | Thermo Fisher Scientific | A53225 | |
Polyacrylamide gel | Bio-Rad | 161-0183 | |
Ammonium Persulfate (APS) | Bio-Rad | 161-0700 | Final concentration: 0.05% |
TEMED | Bio-Rad | 161-0800 | Stacker gel: 0.1%, Resolver gel: 0.05% |
2x Laemmli Sample Buffer | Bio-Rad | 161-0737 | Final concentration: 1X |
Precision Plus Protein Dual Color Standards | Bio-Rad | 161-0374 | |
WB Blocking solution/ 2° Antibody dilution buffer | |||
1x TBST | |||
5% Skim milk (nonfat dry milk) | Bio-Rad | 170-6404 | Working concentration: 5% |
1x Running buffer 1 L | |||
10x Tris-buffered saline (TBS) | Bio-Rad | 170-6435 | Final concentration: 1X |
Glycine | Sigma | G8898 | 14.4 g |
SDS | Merck | 7910 | Working concentration: 0.1% |
Blot transfer buffer 500 mL | |||
10x Tris-buffered saline (TBS) | Bio-Rad | 170-6435 | Final concentration: 1X |
Glycine | Sigma | G8898 | 7.2 g |
Methanol | Merck | 106009 | 100 mL |
Mild stripping solution 1 L | Adjust pH to 2.2 | ||
Glycine | Sigma | G8898 | 15 g |
SDS | Merck | 7910 | 1 g |
Tween 20 | Merck | 9005-64-5 | 10 mL |
Equipments | |||
15 mL centrifuge tube | Corning | 430052 | |
50 mL centrifuge tube | Corning | 430291 | |
Airstream Class II | Esco | 2010621 | Biological safety cabinet |
CelCulture CO2 Incubator | Esco | 2170002 | Humidified tissue culture incubator |
CFX96 Touch Real-Time PCR Detector | Bio-Rad | 1855196 | |
FACSVerse Flow Cytometer | BD Biosciences | 651154 | |
Graduated pipettes (10 mL) | Jet Biofil | GSP010010 | |
Graduated pipettes (5 mL) | Jet Biofil | GSP010005 | |
MicroCal PEAQ-ITC | Malvern | Isothermal titration calorimeters | |
Mini PROTEAN Tetra Cell | Bio-Rad | 1658004 | Electrophoresis chamber |
Mini Trans-blot absorbent filter paper | Bio-Rad | 1703932 | |
Omega Lum G Imaging System | Aplegen | 8418-10-0005 | |
Pipette controller | Eppendorf | 4430000.018 | Easypet 3 |
PowerPac HC | Bio-Rad | 1645052 | Power supply |
PVDF membrane | Merck | IPVH00010 | |
T-75 cell culture flask | Corning | 431464U | |
Trans-Blot SD Semi-Dry Transfer Cell | Bio-Rad | 1703940 | Semi-dry transfer cell |
Ultrasonic processor (Vibra-Cell VCX 130) | Sonics & Materials | ||
Versati Tabletop Refrigerated Centrifuge | Esco | T1000R | Centrifuge with swinging bucket rotar |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved