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Wir präsentieren ein Protokoll zum Screening von Anti-Hepatitis-B-Virus-Verbindungen (HBV), die auf prä- und postvirale Eintrittsphasen abzielen, wobei die isotherme Titrationskalorimetrie verwendet wird, um die Bindungsaffinität (KD) mit dem Wirtsnatriumtaurocholat-Cotransport-Polypeptid zu messen. Die antivirale Wirksamkeit wurde durch die Unterdrückung viraler Lebenszyklusmarker (cccDNA-Bildung, Transkription und virale Assemblierung) bestimmt.
Die Infektion mit dem Hepatitis-B-Virus (HBV) gilt als entscheidender Risikofaktor für das hepatozelluläre Karzinom. Die derzeitige Behandlung kann nur die Viruslast verringern, aber nicht zu einer vollständigen Remission führen. Ein effizientes Hepatozytenmodell für HBV-Infektionen würde einen lebensechten viralen Lebenszyklus bieten, der für das Screening von Therapeutika entscheidend wäre. Die meisten verfügbaren Anti-HBV-Wirkstoffe zielen auf Lebenszyklusphasen nach dem viralen Eintritt ab, aber nicht vor dem Viruseintritt. Dieses Protokoll beschreibt die Generierung eines kompetenten Hepatozytenmodells, das in der Lage ist, nach Therapeutika zu suchen, die auf prävirale und postvirale Eintrittsphasen abzielen. Dies umfasst das Targeting der Natriumtaurocholat-Cotransport-Polypeptid-Bindung (NTCP), die cccDNA-Bildung, die Transkription und die virale Assemblierung basierend auf imHC oder HepaRG als Wirtszellen. Hier verwendete der HBV-Eintrittshemmungsassay Curcumin, um HBV-Bindungs- und Transportfunktionen über NTCP zu hemmen. Die Inhibitoren wurden auf Bindungsaffinität (KD) mit NTCP unter Verwendung der isothermen Titrationskalorimetrie (ITC) - einem universellen Werkzeug für das HBV-Arzneimittelscreening basierend auf thermodynamischen Parametern - untersucht.
Die Infektion mit dem Hepatitis-B-Virus (HBV) gilt weltweit als lebensbedrohliche Krankheit. Eine chronische HBV-Infektion birgt ein Risiko für Leberzirrhose und hepatozelluläres Karzinom1. Die derzeitige Anti-HBV-Behandlung konzentriert sich hauptsächlich auf den postviralen Eintritt unter Verwendung von Nukleos(t)ide-Analoga (NAs) und Interferon-alpha (IFN-α)2,3. Die Entdeckung eines HBV-Eintrittsinhibitors, Myrcludex B, hat ein neues Ziel für Anti-HBV-Wirkstoffe identifiziert4. Die Kombination von Eintrittsinhibitoren und NAs bei chronischem HBV hat die Viruslast im Vergleich zu denen, die nur auf die Virusreplikation abzielen, signifikant verringert 5,6. Das klassische Hepatozytenmodell für das Screening von HBV-Eintrittsinhibitoren ist jedoch durch niedrige virale Rezeptorspiegel (Natriumtaurocholat-Cotransporting-Polypeptid, NTCP) begrenzt. Die Überexpression von hNTCP in Hepatomzellen (d.h. HepG2 und Huh7) verbessert die HBV-Infektiosität 7,8. Dennoch exprimieren diese Zelllinien geringe Mengen an medikamentenmetabolisierenden Enzymen der Phasen I und II und weisen eine genetische Instabilität auf9. Hepatozytenmodelle, die helfen können, verschiedene Mechanismen von Anti-HBV-Kandidatenverbindungen wie präviralen Eintrag, NTCP-Bindung und viralen Eintritt anzusprechen, würden die Identifizierung und Entwicklung wirksamer Kombinationsschemata beschleunigen. Die Studie zur Anti-HBV-Aktivität von Curcumin hat die Hemmung des Viruseintritts als neuen Mechanismus zusätzlich zur postviralen Eintrittsunterbrechung aufgeklärt. Dieses Protokoll beschreibt ein Wirtsmodell für das Screening von Anti-HBV-Eintrittsmolekülen10.
Das Ziel dieser Methode ist es, mögliche Anti-HBV-Verbindungen für die Hemmung des Viruseintritts zu erforschen, insbesondere die Blockierung der NTCP-Bindung und des NTCP-Transports. Da die NTCP-Expression ein kritischer Faktor für den HBV-Eintritt und die Infektion ist, haben wir das Hepatozyten-Reifungsprotokoll optimiert, um die NTCP-Wertezu maximieren 11. Darüber hinaus kann dieses Protokoll die hemmende Wirkung auf den HBV-Eintritt als Hemmung der HBV-Bindung gegenüber Hemmung der Internalisierung unterscheiden. Der Aufnahmetest für Taurocholsäure (TCA) wurde ebenfalls unter Verwendung einer ELISA-basierten Methode anstelle eines Radioisotops modifiziert, um den NTCP-Transport12,13 darzustellen. Die Rezeptor- und Ligandeninteraktion wurde durch ihre 3D-Strukturenbestätigt 14,15. Die Hemmung der NTCP-Funktion kann durch Messung der TCA-Aufnahmeaktivität16 bewertet werden. Diese Technik lieferte jedoch keinen direkten Nachweis einer NTCP-Bindung an die Kandidaten-Inhibitoren. Daher kann die Bindung mit verschiedenen Techniken untersucht werden, wie z.B. Oberflächenplasmonresonanz 17, ELISA, fluoreszenzbasierter Thermoverschiebungsassay (FTSA)18, FRET19, AlphaScreen und verschiedenen anderen Methoden20. Unter diesen Techniken ist ITC ein Zielstandard in der Bindungsanalyse, da es Wärmeabsorption oder -emission in fast jeder Reaktion beobachten kann21. Die Bindungsaffinität (KD) von NTCP und Kandidatenverbindungen wurde direkt mittels ITC bewertet; Diese Affinitätswerte waren genauer als diejenigen, die mit dem In-silico-Vorhersagemodell 22 ermittelt wurden.
Dieses Protokoll behandelt Techniken zur Hepatozytenreifung, HBV-Infektion und zum Screening auf HBV-Eintrittshemmer. Kurz gesagt, ein Hepatozytenmodell wurde basierend auf imHC- und HepaRG-Zelllinien entwickelt. Die kultivierten Zellen wurden innerhalb von 2 Wochen zu reifen Hepatozyten differenziert. Die Hochregulierung der NTCP-Spiegel wurde mittels real-time PCR, Western Blot und Durchflusszytometrienachgewiesen 11. Hepatitis-B-Virion (HBVcc) wurde produziert und aus HepG2.2.15 gesammelt. Das differenzierte imHC bzw. HepaRG (d-imHC, d-HepaRG) wurde 2 h vor der Inokulation mit HBV-Virion prophylaktisch mit den Anti-HBV-Kandidaten behandelt. Das erwartete Ergebnis des Experiments war die Identifizierung der Wirkstoffe, die zelluläres HBV und Infektiosität verringern. Die Anti-NTCP-Aktivität wurde mit dem TCA-Aufnahmetest bewertet. Die NTCP-Aktivität konnte von den Agenten unterdrückt werden, die NTCP spezifisch gebunden haben. Die ITC-Technik wurde verwendet, um die Machbarkeit einer interaktiven Bindung zu untersuchen, die Inhibitoren und ihre Zielproteine vorhersagen kann, indem die Bindungsaffinität (KD) des Liganden für den Rezeptor über nicht-kovalente Wechselwirkungen des biomolekularen Komplexesbestimmt wird 23,24. Zum Beispiel steht K D ≥ 1 × 103 mM für schwache Bindung, K D ≥ 1 × 106 μM für moderate Bindung und K D ≤ 1 × 109 nM für starke Bindung. Das ΔG korreliert direkt mit Bindungswechselwirkungen. Insbesondere ist eine Reaktion mit negativem ΔG eine exergonische Reaktion, was darauf hinweist, dass die Bindung ein spontaner Prozess ist. Eine Reaktion mit einem negativen ΔH deutet darauf hin, dass die Bindungsprozesse von Wasserstoffbrückenbindungen und Van-der-Waals-Kräften abhängen. Sowohl TCA-Aufnahme als auch ITC-Daten könnten verwendet werden, um nach Anti-HBV-Eintragsagenten zu suchen. Die Ergebnisse dieser Protokolle können eine Grundlage nicht nur für das Anti-HBV-Screening bilden, sondern auch für die Interaktion mit NTCP, die durch Bindungsaffinität und Transportfunktion bewertet wird. Dieser Artikel beschreibt die Vorbereitung und Charakterisierung von Wirtszellen, das experimentelle Design und die Bewertung des Anti-HBV-Eintritts zusammen mit der NTCP-Bindungsaffinität.
HINWEIS: Die folgenden Verfahren müssen in einer Haube für biologische Gefahrenströme der Klasse II oder einer Laminar-Flow-Haube durchgeführt werden. Der Umgang mit HBV wurde vom IRB ethisch genehmigt (MURA2020/1545). Weitere Informationen zu allen Lösungen, Reagenzien, Geräten und Zelllinien, die in diesem Protokoll verwendet werden, finden Sie in der Materialtabelle .
1. Vorbereitung von Wirtszellen (reife Hepatozyten)
2. Quantifizierung des zellulären NTCP
3. Herstellung der aus Zellkultur gewonnenen HBV-Partikel (HBVcc)
4. Anti-HBV-Eintrittstest
5. HBV-Zellbindungsassay
6. Aufnahmetest für Taurocholsäure (TCA)
7. Bestimmung von Protein-Liganden-Wechselwirkungen mittels isothermer Titrationskalorimetrie
HINWEIS: Dieses Assay-System wurde auf Basis der MicroCal PEAQ-ITC (ITC-Software) entwickelt.
8. Statistische Auswertung
Es wurden hepatische Reifungsmerkmale beobachtet, einschließlich zweikerniger Zellen und polygonaler Morphologie (Abbildung 1), insbesondere im differenzierten Stadium von imHC (Abbildung 1A). Ein starker Anstieg der NTCP-Expression wurde in d-HepaRG und d-imHC um das 7-fache bzw. 40-fache gemessen (Abbildung 1B). Die stark glykosylierte Form von NTCP, die postuliert wurde, um die Anfälligkeit für den HBV-Eintritt zu verleihen, wurde in d-imHC häufiger nachgewiesen als in d-HepaRG (Abbildung 1C). Das differenzierte imHC enthielt 65,9% höhere NTCP-Spiegel als die undifferenzierten Zellen (Abbildung 1D).
Abbildung 2A zeigt eine Zusammenfassung der prophylaktischen Behandlung. Abbildung 2B zeigt die HBV-Immunfluoreszenzfärbung, die durchgeführt wurde, um die Anti-HBV-Eintrittsaktivitäten am Tag 7 nach der Infektion zu bewerten, während Abbildung 2C das HBV-Bindungsassay-Protokoll umreißt. Das Niveau der HBV-Bindung am Zelloberflächenrezeptor wurde mittels real-time PCR bewertet (Abbildung 2D). Um festzustellen, ob NTCP der Rezeptor für die HBV-Bindung war, wurde die TCA-Aufnahme für die Kandidatenbindungshemmer bestimmt (Abbildung 2E). Basierend auf diesem Modell verringerte die mutmaßliche inhibitorische Aktivität der Kandidatenverbindungen die HBV-Bindung durch NTCP.
Die kalorimetrische Veränderung wurde durch kontinuierliche Injektionen in die Probenzelle nachgewiesen (Abbildung 3). Eine standardmäßige nichtlineare Regression der kleinsten Quadrate wurde basierend auf einer Bindungsstelle aufgetragen, die gut an die Daten angepasst war. Die durchgezogene Linie zeigte die beste Anpassung an die experimentellen Werte an (Abbildung 3A,B). Tabelle 1 zeigt thermodynamische Parameter, die mit der Bindung von NTCP an Cyclosporin A (CsA) oder eine Kandidatenverbindung korrelieren.
Abbildung 1: Leberreifung von HepaRG und imHC mit NTCP-Charakterisierung. Beide Zelllinien wurden 2 Wochen lang in hepatischem Reifungsmedium kultiviert. (A) Hepatozyteneigenschaften wie zweikernige Zellen und polygonal geformte Morphologie wurden ausschließlich im Reifestadium von imHC beobachtet. Maßstabsbalken = 50 μm. (B) Die Expression von NTCP wurde sowohl in HepaRG als auch in imHC hochreguliert. NTCP normalisiert mit GAPDH war in imHC höher als in HepaRG. (C) Eine stark glykosylierte Form von NTCP wurde nach der Reifung beobachtet. (D) Der Prozentsatz der NTCP-Erhöhung in d-imHC wurde mittels Durchflusszytometrie bewertet. Die Daten werden als Mittelwert ± SD dargestellt. *, ** und *** stellen eine statistische Differenz mit p < 0,05, p < 0,01 bzw. p < 0,001 dar. Abkürzungen: NTCP = Natriumtaurocholat cotransporting polypeptide; GAPDH = Glycerinaldehyd-3-phosphat-Dehydrogenase; NTCP-FITC = fluorescein-isothiocyanat-markiertes NTCP. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.
Abbildung 2: Die prophylaktische CCM-Behandlung verringerte den Viruseintritt, die intrazelluläre HBV-DNA und die TCA-Aufnahmeaktivität . (A) d-imHC wurden vor der Impfung mit HBV 2 h lang mit CCM vorbehandelt. (B) Die Anti-HBV-Eintrittsaktivität wurde durch Immunfluoreszenzfärbung am Tag 7 nach der Infektion bestimmt. (C) Ein schematischer Zeitplan des HBV-Bindungsprotokolls wird vorgelegt. (D) Der Gehalt an gebundener HBV-DNA auf Hepatozyten wurde bewertet und mit 4 μM CsA und dem klassischen HBV-Eintrittshemmer 25 Einheiten/ml Heparin verglichen. (E) Die Wirkung des 10-30 μM CCM auf die TCA-Aufnahmehemmung wurde durch den NTCP-Rezeptor vermittelt. Abkürzungen: CCM = Curcumin; HBV = Hepatitis-B-Virus; TCA = Taurocholsäure; d-imHC = differenziertes imHC; CsA = Cyclosporin A; HP = Heparin. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.
Abbildung 3: Die Affinität von NTCP zu einzelnen Molekülen (CsA oder Kandidatenverbindung) wurde mittels ITC nachgewiesen. Das ITC-Profil für die Kombination von NTCP mit entweder (A) CsA oder (B) Curcumin wurde durch sequentielle Injektion einer Verbindung (150 μM CsA oder Kandidat) in die NTCP-Lösung (15 μM NTCP, pH 7,0, 25 °C) erzeugt. Die kalorimetrischen Rohdaten zwischen Differenzleistung (μcal/s) und Zeit (min) wurden aufgetragen. Die Daten wurden basierend auf einem Ein-Standort-Bindungsmodell analysiert, bei dem die durchgezogenen Linien die am besten geeigneten Ergebnisse anzeigten. Während der Injektion von Liganden (CSA oder Curcumin) in die NTCP-Lösung änderte sich die Enthalpie (ΔH) nach einer Erhöhung der Ligandenkonzentration in der Probenzelle. Diese Daten deuten darauf hin, dass die Bindungsreaktion stattgefunden hat. Abkürzungen: CsA = Cyclosporin A; NTCP = Natriumtaurocholat, das Polypeptid transportiert; ITC = isotherme Titrationskalorimetrie; DP = differentielle Leistung. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.
Protein | Ligand | Bindungskonstante (KD) | Enthalpieänderung (ΔH) | Entropieänderung (ΔTΔS) | Gibbs Free Energy Change (ΔG) | Art der Bindung |
(M-1) | (kcal/mol) | (kcal/mol) | (kcal/mol) | |||
Menschliches NTCP (SLA10A1) | CCM | 1,21 ×10-6 | -1 | 0.6 | -0.39 | Wasserstoffbrückenbindung |
Menschliches NTCP (SLA10A1) | TCA | 1 ×10-9 | 80 | -96 | -16 | Hydrophobe Wechselwirkung |
Tabelle 1: Thermodynamische Parameter, die sich aus der Wechselwirkung zwischen NTCP und einzelnen Verbindungen (CCM und TCA) mittels ITC ergeben. Abkürzungen: NTCP = Natriumtaurocholat cotransporting polypeptide; CCM = Curcumin; TCA = Taurocholsäure; ITC = isotherme Titrationskalorimetrie.
Die HBV-Infektion wird über eine niedrigaffine Bindung an Heparansulfat-Proteoglykane (HSPGs) an Hepatozyten25 initiiert, gefolgt von der Bindung an NTCP mit anschließender Internalisierung durch Endozytose26. Da NTCP ein entscheidender Rezeptor für den HBV-Eintritt ist, kann der gezielte HBV-Eintritt klinisch übersetzt werden, um die De-novo-Infektion, die Mutter-Kind-Übertragung (MTCT) und das Rezidiv nach Lebertransplantation zu verringern. Die Unterbrechung des Viruseintritts wäre eine praktikable alternative Heilung für chronische HBV-Infektionen.
Einige kritische Schritte im oben genannten Protokoll sind hier zusammengefasst. Stellen Sie bei der Vorbereitung der Wirtszellen sicher, dass die Hepatozyten 100% Konfluenz erreichen, bevor Sie das Reifungsmedium mit 2% DMSO hinzufügen. Die Kultivierung subkonfluenter Hepatozyten in 2% DMSO führt zum Zelltod und zur Zellablösung. Die Reifezeit kann auf bis zu 4 Wochen verlängert werden, um die NTCP-Expression27,28 zu maximieren, obwohl eine 2-wöchige Reifezeit empfohlen wird.
Drei Techniken wurden für die Quantifizierung der zellulären NTCP-Expression vorgeschlagen. Es wird empfohlen, dass Benutzer die Technik auswählen, mit der sie am besten vertraut sind. Hier haben wir die Durchflusszytometrie der Western-Blot-Analyse vorgezogen, weil sie bequem, schnell und einfach ist.
Für die Herstellung der Zellkultur-abgeleiteten HBV-Partikel (HBVcc) wurde HepG2.2.15 aus HepG2 durch transiente Transfektion mit HBV-Genom in voller Länge zusammen mit dem Geneticin (G418)-Resistenzgen29 gewonnen. Das Kulturmedium sollte 380-500 μg/ml Geneticin enthalten, da die Zellen sonst kein HBVcc produzieren. Der proteinarme 0,45 μm-Filter sollte zur Klärung des Überstands verwendet werden, um einen Verlust der HBV-Ausbeute zu vermeiden. Zur Konzentration von HBV wurde Polyethylenglykol (PEG) mit einer Standardzentrifuge verwendet. HBV-Partikel können auch durch einen Saccharosegradienten und Ultrazentrifugation konzentriert werden. Mehrfache Gefrier- und Auftauzyklen sollten vermieden werden, da die Infektiosität verringert wird.
Im Anti-HBV-Entry-Assay müssen die Hepatozyten vor der Reifungsinduktion eine 100%ige Konfluenz erreichen. Dieses Protokoll wurde auf der Grundlage einer prophylaktischen Behandlung entwickelt. Wirtszellen wurden vor der Infektion mit HBV12 2 h lang den Kandidatenverbindungen ausgesetzt. Nach 7 Tagen nach der Infektion wurde die HBV-Infektiosität mittels Immunfluoreszenz bewertet. Alle Komponenten, Konzentrationen der Blocklösung, primäre und sekundäre Antikörper und Waschschritte müssen optimiert werden, um das beste Ergebnis mit minimaler unspezifischer Färbung zu erzielen. Hier haben wir optimierte Konzentrationen und Techniken bereitgestellt.
Das TCA-Aufnahme-Assay-Protokoll beschreibt den Goldstandard für die Hemmung des NTCP-Transports. Wir haben das Protokoll geändert, um radioaktives TCA zu vermeiden. Die kritischen Schritte für den TCA-Aufnahmetest sind das Waschen und Harvesten von Zellen. Alle diese Verfahren müssen die ganze Zeit auf Eis durchgeführt werden, um eine weitere zelluläre Aktivität-Internalisierung der Verbindung zu verhindern. Nach der Homogenisierung der Zellen und der Pelletierung von Zellresten muss der Überstand schonend abgesaugt werden, ohne das Pellet zu stören. Wenn die Einrichtung des Benutzers die Verwendung der Flüssigszintillationstechnik zulässt, wird 3H-Taurocholsäure häufig in TCA-Transport- und Aufnahmestudien verwendet. Da wir die TCA-Aufnahme mit ELISA validiert haben, kann diese alternative Technik die Verwendung der radioaktiven Verbindung ersetzen.
ITC ist eine biophysikalische Methode, die häufig verwendet wird, um die thermodynamischen Parameter zu bestimmen, die mit den Wechselwirkungen zwischen löslichen Proteinen und niedermolekularen Liganden verbunden sind30,31. Mit dieser Technik kann die Wechselwirkung verschiedener Liganden mit einem kleinen Molekül oder Protein untersucht werden. ITC ist eine direkte und nichtinvasive Methode ohne zusätzliche Schritte zur Signalerkennung, ohne Molekulargewichtsbeschränkungen und ohne Markierung, Immobilisierung oder andere chemische Modifikationen. Die Begrenzung der ITC ist die Voraussetzung für hohe Konzentrationen der wechselwirkenden Materialien. Protein und Ligand müssen hochgereinigt und ausreichend löslich in Wasser (10-100 μM) bei 25 °C für 1 h unter Rühren sein. Die instabile Proteinlösung kann durch Wärmesignaländerung als Funktion der Zeit nachgewiesen werden.
Humane Enhanced-NTCP-Hepatozyten bieten ein alternatives Modell für die In-vitro-Studie der HBV-Infektion, ähneln jedoch HepaRG und primären menschlichen Hepatozyten. Diese Wirtsmodelle werden durch ihre begrenzte Zuverlässigkeit und Anfälligkeit behindert 8,33. Die ineffiziente HBV-Ausbreitung in HepG2-NTCP- oder Huh7-NTCP-Zellen wurde durch niedriges HBV-Inokulum nachgewiesen, das von HBVcc-produzierenden Zellen abgeleitet wurde. In mehreren Studien wurde HBV verwendet, um die Zielzellen bei einem MOI von 1.00033,34 zu infizieren. Die subviralen Partikel in HBVcc enthalten HBV-Hüllprotein (L/M/S) und binden kompetitiv NTCP, was zu einer verminderten Infektiosität führt35. Um diese Einschränkung zu überwinden, modifizierte dieses Protokoll die HepaRG- oder imHC-Kultur mit einem Reifungsprotokoll, um die NTCP-Spiegel zu maximieren. HBVcc abgeleitet von HepG2.2.15 wurde konzentriert, bevor es als Inokulum verwendet wurde. Die HBV-Infektiosität war höher als 80% in differenziertem imHC, basierend auf der Messung des HBV-Kernantigens11.
Wir haben die Identifizierung von Anti-HBV-Verbindungen beschrieben, die auf NTCP abzielen, um den Viruseintritt zu unterbrechen, und ein hepatisches Reifungsverfahren zur Erhöhung der NTCP-Spiegel eingeführt. Um Eintrittshemmer zu identifizieren, wurden Hepatozyten vor der Infektion mit HBV bei 4 °C 2 h lang mit Kandidatenverbindungen vorbehandelt, um eine virale Bindung, aber keinen Eintritt zu ermöglichen. Die Abnahme der HBV-Infektiosität wurde am Tag 7 nach der Infektion bewertet. Die repräsentativen Daten enthielten Cyclosporin A, einen klassischen NTCP-Inhibitor, als Positivkontrolle zur Validierung des Modells.
Da NTCP sowohl Transporter- als auch Rezeptor-vermittelte Endozytosefunktionen erleichtert, könnten HBV-Eintrittsinhibitoren auf mindestens einen dieser Mechanismen abzielen. Die Hemmung des NTCP-Transports kann unter Verwendung eines TCA-Aufnahmeassays auf der Grundlage von ELISA bewertet werden, wodurch die radioaktive TCA aus dem klassischen Protokoll36 eliminiert wird. Die Affinität zwischen NTCP und dem Eintrittsinhibitor wurde mittels ITC gemessen. Diese Technik lieferte wesentliche thermodynamische Parameter, einschließlich der Stöchiometrie (n), der Dissoziationskonstante (KD), der Änderung der freien Energie (ΔG), der Enthalpie (ΔH), der Entropie (ΔS) und der Wärmekapazität der Bindung (ΔCp). Verschiedene Anti-HBV-Wirkstoffe wurden durch molekulares Andocken identifiziert, wie Quercetin, Rutin, Hesperidin und Luperol, die spezifisch HBV-Reverse-Transkriptase binden könnten, vergleichbar mit Lamivudin, einem Nukleosidanalogon. Die Verbindungen wurden mittels ITC untersucht und wiesen mit HBV-Polymerase37 eine negative Gibb-Energie (−ΔG) im Bereich von −9,3 bis −5,2 kcal/mol und KD von 1 × 10-6 bis 1 × 10-3 M auf. Zusammengenommen werden die Daten aus diesen oben genannten Assays dazu beitragen, die antivirale Wirksamkeit von Kandidatenverbindungen zu überprüfen, die als HBV-Eintrittshemmer wirken. Das etablierte Protokoll wird nützlich sein, um neuartige NTCP-Antagonisten/-Inhibitoren zu entdecken. Die Unterdrückung des Viruseintrags könnte in der prophylaktischen und therapeutischen Behandlung nützlich sein.
Die Autoren erklären, dass die Forschung ohne kommerzielle oder finanzielle Beziehungen durchgeführt wurde, die als potenzieller Interessenkonflikt ausgelegt werden könnten.
Dieses Forschungsprojekt wird von der Mahidol University und der Thailand Science Research and Innovation (TSRI) unterstützt und separat an A. Wongkajornsilp und K. Sa-ngiamsuntorn vergeben. Diese Arbeit wurde vom Office of National Higher Education Science Research and Innovation Policy Council über die Program Management Unit for Competitiveness (Fördernummer C10F630093) finanziell unterstützt. A. Wongkajornsilp ist Empfänger eines Chalermprakiat-Stipendiums der Medizinischen Fakultät Siriraj Hospital, Mahidol University. Die Autoren danken Frau Sawinee Seemakhan (Excellent Center for Drug Discovery, Faculty of Science, Mahidol University) für ihre Unterstützung bei der ITC-Technik.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Cell lines | |||
HepaRG Cells, Cryopreserved | Thermo Fisher Scientific | HPRGC10 | |
Hep-G2/2.2.15 Human Hepatoblastoma Cell Line | Merck | SCC249 | |
Reagents | |||
4% Paraformadehyde Phosphate Buffer Solution | FUJIFLIM Wako chemical | 163-20145 | |
BD Perm/Wash buffer | BD Biosciences | 554723 | Perm/Wash buffer |
Cyclosporin A | abcam | 59865-13-3 | |
EDTA | Invitrogen | 15575-038 | 8 mM |
G 418 disulfate salt | Merck | 108321-42-2 | |
Halt Protease Inhibitor Cocktail EDTA-free (100x) | Thermo Scientific | 78425 | |
HEPES | Merck | 7365-45-9 | |
illustraTM RNAspin Mini RNA isolation kits | GE Healthcare | 25-0500-71 | |
illustra RNAspin Mini RNA Isolation Kit | GE Healthcare | 25-0500-71 | |
ImProm-II Reverse Transcription System | Promega | A3800 | |
KAPA SYBR FAST qPCR Kit | Kapa Biosystems | KK4600 | |
Lenti-X Concentrator | Takara bio | PT4421-2 | concentrator |
Luminata crescendo Western HRP substrate | Merck | WBLUR0100 | |
Master Mix (2x) Universal | Kapa Biosystems | KK4600 | |
Nucleospin DNA extraction kit | macherey-nagel | 1806/003 | |
Phosphate buffered saline | Merck | P3813 | |
Polyethylene glycol 8000 | Merck | 25322-68-3 | |
ProLong Gold Antifade Mountant | Thermo scientific | P36930 | |
Recombinant NTCP | Cloud-Clone | RPE421Hu02 | |
RIPA Lysis Buffer (10x) | Merck | 20-188 | |
TCA | Sigma | 345909-26-4 | |
TCA Elisa kit | Mybiosource | MB2033685 | |
Triton X-100 | Merck | 9036-19-5 | |
Trypsin-EDTA | Gibco | 25200072 | Dilute to 0.125% |
Antibodies | |||
Anti-NTCP1 antibody | Abcam | ab131084 | 1:100 dilution |
Anti-GAPDH antibody | Thermo Fisher Scientific | AM4300 | 1:200,000 dilution |
HRP-conjugated goat anti-rabbit antibody | Abcam | ab205718 | 1:10,000 dilution |
HRP goat anti-mouse secondary antibody | Abcam | ab97023 | 1:10,000 dilution |
Goat anti-Rabbit IgG Secondary Antibody, Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A-11008 | 1:500 dilution |
Reagent composition | |||
1° Antibody dilution buffer | |||
1x TBST | |||
3% BSA | Sigma | A7906-100G | Working concentration: 3% |
Sodium azide | Sigma | 199931 | Working concentration: 0.05% |
Hepatocyte Growth Medium | |||
DME/F12 | Gibco | 12400-024 | |
10% FBS | Sigma Aldrich | F7524 | |
1% Pen/Strep | HyClon | SV30010 | |
1% GlutaMAX | Gibco | 35050-061 | |
Hepatic maturation medium | |||
Williams’ E medium | Sigma Aldrich | W4125-1L | |
10% FBS | Sigma Aldrich | F7524 | |
1% Pen/Strep | HyClon | SV30010 | |
1% GlutaMAX | Gibco | 35050-061 | |
5 µg/mL Insulin | Sigma Aldrich | 91077C-100MG | |
50 µM hydrocotisone | Sigma Aldrich | H0888-1g | |
2% DMSO | PanReac AppliChem | A3672-250ml | |
IF Blocking solution | |||
1x PBS | Gibco | 21300-058 | |
3% BSA | Sigma | A7906-100G | Working concentration: 3% |
0.2% Triton X-100 | Sigma | T8787 | Working concentration: 0.2% |
RIPA Lysis Buffer Solution | Merck | 20-188 | Final concentration: 1X |
Protease Inhibitor Cocktail | Thermo Scientific | 78425 | Final concentration: 1X |
Na3VO4 | Final concentration: 1 mM | ||
PMSF | Final concentration: 1 mM | ||
NaF | Final concentration: 10 mM | ||
Western blot reagent | |||
10x Tris-buffered saline (TBS) | Bio-Rad | 170-6435 | Final concentration: 1X |
Tween 20 | Merck | 9005-64-5 | |
1x TBST | 0.1% Tween 20 | ||
1x PBS | Gibco | 21300-058 | |
Pierce BCA Protein Assay Kit | Thermo Fisher Scientific | A53225 | |
Polyacrylamide gel | Bio-Rad | 161-0183 | |
Ammonium Persulfate (APS) | Bio-Rad | 161-0700 | Final concentration: 0.05% |
TEMED | Bio-Rad | 161-0800 | Stacker gel: 0.1%, Resolver gel: 0.05% |
2x Laemmli Sample Buffer | Bio-Rad | 161-0737 | Final concentration: 1X |
Precision Plus Protein Dual Color Standards | Bio-Rad | 161-0374 | |
WB Blocking solution/ 2° Antibody dilution buffer | |||
1x TBST | |||
5% Skim milk (nonfat dry milk) | Bio-Rad | 170-6404 | Working concentration: 5% |
1x Running buffer 1 L | |||
10x Tris-buffered saline (TBS) | Bio-Rad | 170-6435 | Final concentration: 1X |
Glycine | Sigma | G8898 | 14.4 g |
SDS | Merck | 7910 | Working concentration: 0.1% |
Blot transfer buffer 500 mL | |||
10x Tris-buffered saline (TBS) | Bio-Rad | 170-6435 | Final concentration: 1X |
Glycine | Sigma | G8898 | 7.2 g |
Methanol | Merck | 106009 | 100 mL |
Mild stripping solution 1 L | Adjust pH to 2.2 | ||
Glycine | Sigma | G8898 | 15 g |
SDS | Merck | 7910 | 1 g |
Tween 20 | Merck | 9005-64-5 | 10 mL |
Equipments | |||
15 mL centrifuge tube | Corning | 430052 | |
50 mL centrifuge tube | Corning | 430291 | |
Airstream Class II | Esco | 2010621 | Biological safety cabinet |
CelCulture CO2 Incubator | Esco | 2170002 | Humidified tissue culture incubator |
CFX96 Touch Real-Time PCR Detector | Bio-Rad | 1855196 | |
FACSVerse Flow Cytometer | BD Biosciences | 651154 | |
Graduated pipettes (10 mL) | Jet Biofil | GSP010010 | |
Graduated pipettes (5 mL) | Jet Biofil | GSP010005 | |
MicroCal PEAQ-ITC | Malvern | Isothermal titration calorimeters | |
Mini PROTEAN Tetra Cell | Bio-Rad | 1658004 | Electrophoresis chamber |
Mini Trans-blot absorbent filter paper | Bio-Rad | 1703932 | |
Omega Lum G Imaging System | Aplegen | 8418-10-0005 | |
Pipette controller | Eppendorf | 4430000.018 | Easypet 3 |
PowerPac HC | Bio-Rad | 1645052 | Power supply |
PVDF membrane | Merck | IPVH00010 | |
T-75 cell culture flask | Corning | 431464U | |
Trans-Blot SD Semi-Dry Transfer Cell | Bio-Rad | 1703940 | Semi-dry transfer cell |
Ultrasonic processor (Vibra-Cell VCX 130) | Sonics & Materials | ||
Versati Tabletop Refrigerated Centrifuge | Esco | T1000R | Centrifuge with swinging bucket rotar |
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