Method Article
这份手稿描述了从金头鲷头肾中提取的白细胞的分离和固定,以及通过流式细胞术评估它们的活力。这项工作有助于方案的标准化,并在不影响样品质量的情况下处理更多样品,促进鱼类免疫学知识的进步。
免疫力对于生物体的生理调节至关重要,是抵御病原体和环境压力源的主要防御措施。免疫细胞的分离和分析为免疫对外部压力的反应提供了关键见解。然而,对于研究较少的物种(如海洋鱼类),缺乏统一的方案,往往会导致技术和分析挑战,阻碍数据解释和对物种特异性免疫反应的透彻理解。本研究旨在建立一种基于流式细胞术的优化分析程序,以表征和确定幼年金头鲷 (Sparus aurata) 头肾(硬骨鱼的主要造血器官)白细胞的活力。该程序首先使用 Hanks 平衡盐溶液通过均质化过程分离白细胞,然后采用优化的 Percoll 密度梯度离心方法,以确保白细胞的高回收率,同时将高效后续流式细胞术分析所需的红细胞污染降至最低。此外,采用了一种使用细胞反应性染料的新技术 (LIVE/DEAD Fixable Dead Cell Stain Kit) 根据荧光染色模式区分活细胞和死细胞。用 3.7% 甲醛实现固定,保留细胞形态、活力和染色效率。流式细胞术分析成功鉴定了三个主要的白细胞群:淋巴细胞、单核细胞和粒细胞。这种方法不仅可以进行活力测试,还可以准确区分细胞类型。流式细胞术方案的改进通过提高免疫细胞分析的准确性和效率,代表了鱼类免疫学向前迈进了一步。此外,通过允许固定细胞以供以后分析,该方案显着减少了免疫评估所需的时间和精力,使其成为各个研究领域的研究和实际应用的宝贵工具。
免疫力在生物体的生理调节中起着核心作用,是抵御各种病原体和环境压力源的主要防御措施1。与其他脊椎动物一样,鱼类具有复杂、动态和协调的免疫系统,这对它们的整体健康和福祉至关重要1。
硬骨鱼具有先天免疫系统和适应性免疫系统,它们同时发挥作用以检测、响应和中和有害入侵者2。先天免疫系统充当第一道防线,对病原体提供即时和非特异性反应2,而适应性免疫系统随着时间的推移而发展,提供更专业的反应,使鱼类能够识别特定病原体并建立免疫记忆3。鱼类免疫系统依靠专门的原代淋巴器官(即胸腺和头肾)和次级淋巴器官(例如脾脏和粘膜相关淋巴组织 (MALT))来支持免疫防御并维持整体健康4。头肾是硬骨鱼的主要造血器官,在免疫细胞(包括白细胞)的发育和成熟中起着至关重要的作用5。
近年来,在研究几种鱼类的免疫反应方面取得了重大进展2。一个重点领域是了解白细胞群及其活性。白细胞,也称为白细胞,通常分为单核细胞、淋巴细胞和粒细胞,在鱼类的免疫防御中起着至关重要的作用。它们具有吞噬细胞,负责吞噬和破坏病原体并释放杀菌活性氧,有助于消除入侵的微生物6。白细胞还参与炎症过程,有助于隔离和根除感染,同时促进组织修复6。白细胞群的丰度和活性是动物健康和疾病中免疫状态的重要指标 7,8。
一些研究表明,应激因素(如不利的环境条件)可以改变红细胞的数量和形态以及循环白细胞的组成 9,10。例如,正如 Franke 等人(2024 年)所回顾的那样,在气候变化情景下研究鱼类的免疫系统至关重要,因为环境压力源会损害鱼类的免疫力,增加疾病易感性,并增强某些病原体的传染性,最终加速疾病进展11。此外,了解鱼类的免疫力不仅对于推进基础生物学研究至关重要,而且对于支持社会各个部门(例如水产养殖业)也至关重要。随着水产养殖在全球范围内的不断发展,确保养殖鱼类的健康和福利变得越来越重要。然而,鱼类福利仍然是一个相对较新的研究领域,养殖鱼类的免疫反应仍然需要彻底和标准化的评估。优先考虑免疫反应研究至关重要,因为获得的信息可以通过有效和量身定制的方法提高水产养殖的可持续性和生产力,从而提高养殖动物的福利和复原力。
白细胞定量和鉴定通常使用血液学方法进行,例如使用 Bürker、Neubauer 或 Thoma 血细胞计数器进行手动计数,以及染色的血涂片 7,10。为了帮助血细胞的可视化和分化,通常使用 Wright、May-Grünwald-Giemsa 和 Hemacolor 等染色试剂盒 7,12。然而,这些手动细胞计数技术繁琐、耗时且容易出现人为错误 8,10。常见的错误来源包括血液混合或稀释不足、染色问题以及血细胞计数器室加载不正确,所有这些都可能导致细胞计数不准确12。此外,手动血液学分析需要高水平的专业知识和经验,以确保结果的可靠性和可重复性7。随着对精确和高效诊断工具的需求增加,开发深入了解鱼类种群免疫状态的创新方法成为推进该领域越来越重要的一步。
在这种情况式细胞术已成为一种强大的工具,它提供了一种高通量、定量的方法来分析白细胞群和细胞活力8。这种现代诊断技术能够以极高的精度对混合细胞群中的单个细胞进行快速检测、计数和表征13。此外,流式细胞术允许同时进行表型和功能表征的多参数测量。尽管广泛用于人类临床环境和兽医学,但它在鱼白细胞研究中的应用仍然非常有限8。虽然已经对不同的鱼类物种进行了一些研究 1,6,8,13,14,15,16,17,但仍需要解决一些关键挑战。这些分析中的一个主要挑战是必须获得从外周血或淋巴组织(如头肾)中提取的活白细胞的悬浮液1。由于硬骨鱼的一个独特特征:有核红细胞的存在,白细胞的分离通常很困难。由于红细胞的大小、卵形和细胞核的存在,红细胞的意外污染会干扰白细胞分析1。因此,必须从白细胞悬液中去除红细胞以获得高白细胞纯度,并通过流式细胞术分析研究白细胞的表型和功能特征。在哺乳动物中,白细胞分离通常涉及红细胞渗透裂解或用 Ficoll 或 Percoll1 进行密度梯度分离。然而,渗透裂解对海水鱼和淡水鱼都是无效的,因为它们的有核红细胞不能被正确裂解1。相反,密度梯度分离是鱼类的首选,因为它可以有效地保持细胞随时间的稳定性1。尽管一些研究已经成功地从幼鱼中分离出白细胞,但许多研究仍然主要集中在成年鱼群上 17。尽管如此,早期阶段不仅更容易受到疾病爆发的影响,而且规模也较小,这使得采样过程更加复杂和具有挑战性。另一个限制是当前方法通常仅限于一次有限数量的样品或重复,因为评估白细胞活力需要立即处理。样品处理的延迟会对细胞活力产生不利影响,从而给样品过程带来进一步的复杂性,并可能危及整个工作。
据我们所知,已发表的方法均未成功固定白细胞以进行随后的流式细胞术活力分析。本研究具有开创性,因为它建立了一种有效的方法,用于使用 Percoll 密度梯度分离方法从南欧国家养殖的主要鱼类幼鱼金头鲷 (Sparus aurata) 的头肾中分离白细胞。我们还提出了一种改进的基于染色的技术,该技术可以区分活细胞和死细胞,同时通过流式细胞术识别主要的白细胞群(淋巴细胞、单核细胞和粒细胞)。改进的方案需要细胞固定,这使得术后长达 1 个月的活细胞分析成为可能。这种流式细胞术方案的实施有可能显着减少免疫评估通常需要的时间和精力,使其成为水产养殖部门研究和更实际应用的宝贵技术。该方法的应用为分析大量样品、保存细胞以及允许通过流式细胞术进行延迟分析提供了优势。因此,对鱼类免疫机制以及不同环境或实验条件如何影响细胞活力产生有价值的见解可能非常有帮助。此外,该活力测定可以与特定免疫细胞群的多参数表型和功能表征相结合。这种方法能够对几个免疫学参数进行更全面的分析,将它们直接与相应的细胞类型联系起来,并提供更清晰的免疫反应信息。这些发现可能有助于制定更有效的策略,包括改进水产养殖中疾病管理的方法。
该协议必须由获得动物实验认证的研究人员(欧盟功能 A 和 B)执行。与动物处理和样本采集相关的所有程序必须符合 ARRIVE 指南(动物研究: 体内 实验报告),并遵守根据欧洲实验动物科学协会联合会 (FELASA) 的建议照顾和使用动物的道德标准。本研究遵循所有这些标准以及葡萄牙实验动物科学立法(欧盟指令 2010/63;第 113/2013 号法令)。该研究获得了 IPMA 动物福利和伦理机构 (ORBEA, LABVIVOS-002-AquaClimAdapt) 的批准,该机构由国家活体动物使用管理局监督,即食品和兽医总局 (DGAV),伦理许可编号为 20596/25-S。
1. 研究模型和生物体的维护
注:本研究专为幼年金头鲷 (Sparus aurata) 设计,平均体重为 30.0 ± 5.0 g,总长度为 12.0 ± 2.0 cm。这种方法可能不直接适用于其他鱼类,因为不同的物种具有独特的生理和免疫学特征,可能会影响白细胞分离、细胞固定和活力评估。其他物种可能需要适应该方案,建议进行初步研究以优化每个目标物种的条件。
2. 鱼类取样、安乐死、解剖和头肾采集
图 1:头肾的位置: (A) 描绘头肾在鳃后面和体腔前背侧区域的典型位置的插图;(B) 鲷鱼头肾的代表性图像,强调与周围组织相比,其颜色较深。 请单击此处查看此图的较大版本。
3. 分离头部肾白细胞(图 2)
图 2: 从头肾分离白细胞的说明性描述。该方案涉及几个步骤:从组织匀浆开始,然后是密度梯度离心,收集白细胞环,洗涤白细胞环,最后以重悬和调整细胞浓度结束。 请单击此处查看此图的较大版本。
图 3: 白细胞在密度梯度培养基和细胞碎片沉淀之间的界面处环状。 请单击此处查看此图的较大版本。
4. 白细胞的染色和固定(图 4)
注:LIVE/DEAD 可固定死细胞染色试剂盒提供了一种使用流式细胞术评估固定细胞活力的改进方法。这些检测利用与细胞胺相互作用的荧光反应性染料。如果细胞膜受损,染料可以穿透细胞,与细胞内部和细胞表面的游离胺发生反应,导致强烈的荧光染色。相反,在活细胞中,只有细胞表面的胺可以与染料反应,导致染色相对较暗。用甲醛固定后,染色强度得以保持,甲醛还可以通过防止微生物生长来保护样品。LIVE/DEAD 可固定死细胞染色试剂盒除荧光染料外完全相同 - 有蓝色、紫色、浅绿色、黄色、绿色、红色、远红或近红外(红外)可供选择。在这项研究中,我们使用了 Near-IR 荧光反应性染料。此外,这种单色检测允许在多色实验中并行测试其他参数。
图 4: 白细胞染色和固定的说明性描述。 请单击此处查看此图的较大版本。
5. 流式细胞术
图 5:用于头肾细胞活力评估的流式细胞术门控策略: (A) 表示所有收集事件的 FSC-A/SSC-A 概况。(B) 表示基于前向散射 (FSC-A)/前向散射 (FSC-H) 图上线性的单峰区域定义的多重态排除。(C) 表示在排除多重后基于 FSC-A/SSC-A 定义的 3 个主要群体。(D) 表示显示 Live/Dead Viability 染料染色的直方图。为了设置允许区分活细胞和死细胞的阈值,将白细胞置于轻度热休克 (50 °C, 7 min) 中,然后用活力染料染色。高染色强度阳性细胞 (++) 是死细胞,低染色阳性细胞 (+-) 是活细胞。 请单击此处查看此图的较大版本。
图 6 显示了代表性流式细胞术数据,显示了使用本研究中描述的方案从幼鱼金头鲷 (Sparus aurata) 的头肾中分离的白细胞群及其细胞活力。该图比较了两个样品:一个具有高细胞活力,其中鱼暴露于最佳条件下(图 6A),另一个细胞活力低,细胞暴露于热应激(图 6B)。
在这两个样本中,该方法有效地鉴定了三个主要的白细胞群:淋巴细胞 (LY) 、单核细胞 (MO) 和粒细胞 (GR)。这些群体根据细胞大小和复杂性的差异进行区分,如前向散射 (FSC-A) 和侧向散射 (SSC-A) 图所示。前向散射 (FSC-A) 表示相对细胞大小,而侧向散射 (SSC-A) 反映细胞的内部复杂性或粒度,从而可以清楚地分离细胞群。在最佳条件下(图 6A),白细胞群分布如下:LY 为 31.0%,MO 为 38.0%,GR 为 31.0%。然而,在暴露于热应激的样品中(图 6B),观察到这些群体的分布发生了变化,LY 下降到 21.3%,MO 增加到 45.6%,GR 保持相对稳定在 33.1%。
图 6A1-A3 和图 6B1-B3 中详述的细胞活力进一步分析揭示了两个样品之间的显着差异。可以观察到,暴露于最佳条件的样品(图 6A)表现出更高的活力,在所有白细胞群中以活细胞(以蓝色表示)为主。相比之下,热应激样品(图 6B)显示细胞死亡显着增加(更强烈的染色以红色显示),LY 显示 50.7% 的细胞死亡,MO 显示 83.7% 和 GR 84.5%。
总体而言,结果清楚地证明了该方案在分离和分析白细胞群以及评估细胞活力方面的有效性。此外,这些数据为压力条件(如热暴露)如何影响白细胞群动态和细胞活力提供了有价值的见解。在应激下观察到的细胞分布和活力变化表明,热暴露不仅会破坏白细胞群的平衡,还会损害细胞健康。这些变化可能表明对压力的免疫反应,表明环境压力源触发了主动防御机制。
图 6:代表性流式细胞术图说明了金头鲷 (Sparus aurata) 头肾中不同白细胞群的鉴定和活力:(A) 暴露于最佳条件下的高细胞活力样品:左图显示了基于 FSC-A/SSC-A 的白细胞群设门,识别淋巴细胞 (LY)、单核细胞 (MO) 和粒细胞 (GR);LY (A.1)、MO (A.2) 和 GR (A.3) 的活力。(B) 受热应激的低细胞活力样品:左图显示了基于 FSC-A/SSC-A 的白细胞群门控,识别淋巴细胞 (LY)、单核细胞 (MO) 和粒细胞 (GR);LY (B.1)、MO (B.2) 和 GR (B.3) 的活力。请单击此处查看此图的较大版本。
补充图 1:总容量为 660 L 的检疫罐的代表性图像。 请点击此处下载此图表。
补充图 2:RAS 系统设置的图像。(1) Profilux;(2) 灯具;(3) 水族馆/水箱;(4) 冰箱;(5) 水族箱的进水口水龙头;(6) 用于水族箱出水口的蓝色虹吸管;(7) 集水坑;(8) 蛋白质分离器;(9) 机械过滤器(滤袋);(10) 机械过滤器(蓝色海绵 + 玻璃棉);(11) 生物过滤器(生物球);(12) 恒温器;(13) 主泵;(14) 紫外线消毒器;(15) 温度传感器;(A) 机械过滤器(蓝色海绵);(B) 机械过滤器(玻璃棉)。请点击此处下载此图表。
补充表 1:研究中使用的实验饮食的成分组成 (%) 和近似分析 (%DM)。 请点击此处下载此表格。
补充表 2:方案中使用的试剂:健康危害、危险声明、预防措施和急救措施。 请点击此处下载此表格。
补充表 3:与胺反应性 LIVE/DEAD 可固定死细胞染料一起使用的适当激发和检测通道。 请点击此处下载此表格。
补充文件 1:溶液制备的计算。 请点击此处下载此文件。
本研究开发的方法代表了鱼类免疫学研究的重大进步,有望提高对鱼类免疫反应和海洋资源可持续性的理解。 S. aurata 是 Sparidae 科的一种有价值的海洋鱼类,由于多种原因,包括其生态和经济相关性,以及它在生理学、免疫学、毒理学和水产养殖等多个研究领域的实验室研究中的广泛性20。 金链球菌 的主要优点之一是易于在实验室中处理和饲养,具有完善的饲养方案,可确保一致和可重复的实验条件21。此外,其环境适应性(即对各种环境条件(如温度和盐度波动)的高度耐受性)使其成为旨在改进养殖技术和评估环境对海洋生物影响的研究的理想选择22。 S. aurata 具有特征明确的免疫系统和基因组数据的可用性,可以解锁鱼类的免疫反应、病原体抵抗力、疫苗功效和整体健康状况20。鉴于它在水产养殖以及南欧人口饮食习惯中的重要性,对该物种的研究可以直接影响农业实践,提高其产量和可持续性,同时解决行业内的环境挑战20。
从这个意义上说,该方案在各个研究领域提供了多种优势和潜在应用,例如:(i) 鱼类免疫学:提供对金黄色葡萄球 菌头肾免疫细胞的精确和详细分析,允许识别和表征不同的白细胞群,以及通过流式细胞术对其细胞活力进行稳健评估;(ii) 水产养殖研究:对养殖技术、营养和疾病管理的研究至关重要,支持旨在减少对抗生素和化学处理的依赖的未来研究,从而促进更可持续的水产养殖做法;(iii) 生态毒理学:在评估污染物和其他环境压力因素对鱼类免疫健康的影响、为环境风险评估和制定水生生态系统保护条例方面具有重要价值;(iv) 比较生理学:使研究人员能够跟踪免疫系统对各种环境挑战的进化适应,从而更深入地了解免疫功能的遗传和生理基础;(v) 海洋生物学和生态学:提高对 金黄色葡萄球菌的生态作用和相互作用的理解,提供对物种分布、栖息地偏好和环境变化对海洋生物多样性影响的见解;(vi) 生物医学研究:鱼类越来越多地被用作生物医学研究的模式生物。免疫细胞分离和分析有助于了解对药物发现甚至医学至关重要的细胞和分子方面。
多年来,鱼类白细胞的定量和鉴定依赖于传统的血液学技术,例如使用 Bürker、Neubauer 或 Thoma 血细胞计数器进行手动计数,以及染色的血涂片10,12。还使用台盼蓝排除试验评估细胞活力,然后进行显微镜计数15、22、23、24、25、26、27、28。虽然这些方法有助于我们理解鱼类免疫学,但它们也有一些局限性。手动白细胞计数既耗时又费力,而且这些技术的准确性经常受到作员可变性和人为错误的影响,严重影响结果的一致性10。
1994 年,Esteban 等人引入了一种技术来评估鲈鱼 (Dicentrarchus labrax)23 的吞噬细胞防御机制,从而彻底改变了鱼类白细胞分析。在他们的研究中,使用 Percoll 密度梯度离心法从外周血、头肾和腹膜渗出物中分离白细胞23。这种方法的进步标志着一个重大的飞跃,提高了白细胞分析的准确性和可靠性。继 Esteban 等人的开创性工作之后,随后的研究旨在改进和优化用于白细胞分析的流式细胞术技术,重点关注各个方面,例如细胞群分析 6,15,16,28,29、细胞活力3、6、27、28 和吞噬活性 6,23, 24,27,28。分离程序的进步,包括使用不同梯度培养基(例如,Ficoll 与 Percoll)和优化的离心方案,提高了分离白细胞的纯度和产量 1,8,14,26。先进染色技术的发展和荧光染料的使用,如碘化丙啶 (PI) 和 3,3'-二己氧碳羰菁碘 (DiOC6(3)),能够更准确地区分活细胞和非活细胞,以及分别详细表征白细胞群16,30.该技术的主要优点之一是它能够同时区分不同的白细胞群(淋巴细胞、单核细胞和粒细胞)并评估每个细胞群的细胞活力。这使研究人员能够确定哪些人群在特定条件下受影响最大,从而更深入地了解免疫反应并揭示最脆弱的白细胞亚群。然而,尽管有这些改进,目前的方法仍然面临局限性。大多数研究都集中在成年鱼上,在幼鱼阶段的研究中留下了空白。幼鱼的体型较小,并且难以从其比例较小的免疫器官中获得高质量的样本,因此对白细胞提取提出了独特的挑战17。此处描述的研究通过优化幼鱼的方案、调整细胞悬液比例和 Percoll 溶液来提高白细胞提取的质量,专门解决了这些问题。此外,由于迫切需要进行白细胞活力评估,现有方法通常受到一次可处理的样品或重复数量的限制。样品处理的任何延迟都会对细胞活力产生不利影响,使采样过程复杂化,并可能影响结果。为了克服这一限制,本研究引入了一种新型染色技术,该技术允许在固定后长达 1 个月内进行细胞固定和分析。这项创新为采样计划提供了更大的灵活性,使研究人员能够方便地处理和分析样品,从而显著改善了流式细胞术评估的工作流程和可靠性。
该方案的成功取决于几个关键步骤,每个步骤都需要仔细执行以确保白细胞的完整性和活力,随后通过流式细胞术进行分析。正确制备安乐死溶液和 pH 值调节对于有效安乐死至关重要。准备不当的解决方案可能会导致安乐死不完全或对鱼造成额外压力18.准确、仔细地解剖头肾对于避免污染至关重要。保持无菌和组织完整性对于获得高质量的白细胞样品至关重要。必须正确调整 Percoll 溶液的密度、渗透压和 pH 值,以实现高效的白细胞分离。用无菌移液器轻轻吸出白细胞环对于避免污染和干扰梯度层至关重要。采集后有效洗涤细胞对于去除 Percoll 残基和其他杂质至关重要。重复洗涤过程可确保干净的细胞沉淀准备好固定。活性染料应在使用前立即制备以确保其有效性,因为处理不当会损害其稳定性。适当的染料添加和孵育时间对于准确区分活细胞和死细胞至关重要。用 3.7% 甲醛固定细胞是保持细胞形态和确保准确鉴定死细胞的关键步骤。甲醛浓度必须精确,并且必须严格遵守孵育时间,以避免结果不准确。固定后清洗细胞对于去除任何多余的染料和甲醛很重要,这可能会干扰后续分析。正确储存固定样品并及时分析对于保持数据准确性是必要的。调整激发和检测通道以匹配所使用的特定染料对于准确的流式细胞术结果至关重要。
尽管该方法具有许多优点,但必须考虑一些局限性。一个关键的限制是其物种特异性,因为该方案针对海鱼幼年金头鲷 (S. aurata) 进行了优化。这意味着当应用于其他鱼类,尤其是淡水鱼时,其有效性可能会有所不同。海洋和淡水物种之间渗透平衡的差异可能需要调整方案中使用的缓冲液,因为适用于盐水条件的解决方案可能不适用于淡水物种。此外,组织结构、细胞密度和生理反应的差异可能需要调整方案,这可能会影响不同物种的可重复性和一致性。
另一个重要因素是样本采集前的鱼类维护。每个物种都有特定的最佳水条件,这对于维持鱼类健康和确保实验结果的质量至关重要20.温度、盐度和 pH 值等参数的变化会影响细胞活力和数据质量,因为次优条件可能会诱发生理应激,从而损害细胞完整性。为确保实验结果的一致性,重要的是将所有重复保持在相同的受控条件下,无论是最佳还是有意次优(取决于研究目标)。
处理和解剖技术的可变性也会影响头部肾白细胞的质量和数量,使作者的技能和经验成为方案成功的关键因素。此外,在整个分离过程中保持细胞活力可能是一项挑战,因为安乐死和细胞固定之间的任何延迟都可能导致活力降低和结果偏倚。立即处理组织和细胞对于保持高细胞活力至关重要,但这一要求可能难以始终如一地实现,尤其是在处理大量样品时。
作者声明不存在可能影响研究、分析、数据解释、写作或提交手稿发表决定的财务、个人或专业利益冲突。
这项工作得到了 Fundação Portuguesa para a Ciência e Tecnologia (FCT I.P.) 的支持,在 Aqua-CLIMADAPT (PTDC/CTA-AMB/0592/2021, https://doi-org.remotexs.ntu.edu.sg/10.54499/PTDC/CTA-AMB/0592/2021) 项目的框架下。我们感谢由应用分子生物科学部门 (UCIBIO) 和绿色化学研究部门联合实验室 – LAQV 支持的生物实验室,这些实验室由 FCT/MCTES 的国家资金资助(分别为 UIDB/04378/2020 和 UIDB/50006/2020),以及健康与生物经济联合实验室研究所 – i4HB (LA/P/0140/2020)。这项工作还得到了欧盟委员会通过 GLYCOTwinning 项目(赠款协议第 101079417 号)和 FCT 通过 InnoGlyco (2022.04607.PTDC) 的支持。Isa Marmelo 还感谢 FCT I.P. 的博士资助(2020.04413.BD 年,https://doi-org.remotexs.ntu.edu.sg/10.54499/2020.04413.BD 年)。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Air Stones | N/A | N/A | |
Aquafeed | SPAROS, Lda., Portugal | N/A | High-quality diet |
Automatic Cell Counting Equipment | NanoEnteK, Korea | N/A | EVE automatic cell counter (NanoEnteK) |
Automatic Water Refrigeration Systems | Foshan Weinuo Refrigeration Equipment Co., Ltd, China | N/A | |
Bio balls 1.5" Aquarium Pond Filter | TMC Iberia, Portugal | N/A | |
Bovine Serum Albumin (BSA) | Sigma-Aldrich, Germany | A7906 | |
Bucket (3 L) | N/A | N/A | To prepare and carry out euthanasia |
Buckets (5 L) | N/A | N/A | To transport the animals |
Cell Strainers | Jetbiofil, China | CSS-013-100 | Cell Strainer, 100 μm nylon mesh, Sterile, Yellow |
Centrifugue | Fisher Scientific, Germany | N/A | accuSpin Micro 17 R |
Colorimetric Test Kit for Ammonia (NH4+/NH3) | Tropic Marin, USA | N/A | |
Colorimetric Test Kit for Nitrate (NO3-) | Tropic Marin, USA | N/A | |
Colorimetric Test Kit for Nitrite (NO2-) | Tropic Marin, USA | N/A | |
Computer | N/A | N/A | To acquire and analyse the data obtained from the flow cytometer |
Computerized Control System (Profilux) | GHL, Germany | N/A | ProfiLux 3 Outdoor |
Deionized water | N/A | N/A | To clean the Flow Cytometer |
Density Gradient Medium: Percoll | Cytiva, Sigma-Aldrich, Germany | 17-0891-01 | |
Digital scale | KERN & Sohn GmbH, Germany | N/A | KERN EMS 300-3 |
Ethanol 70% | Millipore, Supelco, Portugal | EX0281 | To keep the workspace clean |
EVE Cell Counting Slides | NanoEnteK, Korea | N/A | |
Falcon Tubes (15 mL) | pluriSelect Life Science, Germany | 05-00002-01 | Sterile |
Filter bag | TMC Iberia, Portugal | N/A | 400 micron |
Filter Sponge | N/A | N/A | |
Flow Cytometer | ThermoFisher Scientific, USA | N/A | Attune flow cytometer |
FlowJo v10.8.1 Software | BD Life Sciences | N/A | |
Formaldehyde 37% | Sigma-Aldrich, Germany | 8.18708 | |
Glass Wool | N/A | N/A | |
Hanks' Balanced Salt Solution | Merck Life Science S.L, Portugal | H6648 | Modified, with sodium bicarbonate, without phenol red, calcium chloride and magnesium sulfate, liquid, sterile-filtered, suitable for cell culture |
LIVE/DEAD Fixable Dead Cell Stain Kits | Life Technologies Europe, Netherlands | L10119 | Near-IR fluorescent reactive dye + DMSO |
Main Water Pumps | EHEIM, Germany | Universal 1200 | |
Microcentrifuge Tubes (2 mL) | BRAND, Merck, Germany | Z628034 | Sterile |
Micropipette Tips | Sartorius, Germany | 790010, 790200, 791000 | Compatible with Sartorius, 1-10 µL, 2-20 µL, 20-200 µL, 100-1000 µL |
Micropipettes | Sartorius, Germany | 728020, 728030, 728060, 728070 | Sartorius ProlinePlus 1-10 µL, 2-20 µL, 20-200 µL, 100-1000 µL |
Mini Cell Strainers | pluriSelect Life Science Global Headoffice, Germany | 43-10100-50 | PluriStrainer 100 µm nylon mesh, Sterile |
Multi-Parameter Measuring Instrument | WTW, Germany | Multi 3420 SET G + IDS digital conductivity cell (TetraCon 925) + Optical IDS DO sensor (FDO 925) + IDS pH-electrode (SenTix 940) | |
Pasteur Pipettes (1 mL, 5 mL) | Humeau Expert du laboratoire, France | 248295 | Sterile |
Petri dishes | Sarstedt, Germany | 82.1194.500 | 60 x 15 mm, Polystyrene, Sterile |
pH Meter | Hanna Instruments Inc., Romania | HANNA HI2211 | |
Polystyrene round-bottom Falcon tubes (5 mL) | Fisher Scientific, Germany | 14-959-2A | Sterile |
Portable Precision Thermometer | Ebro Electronic, Germany | N/A | TFX 430 |
Protein Skimmers | Mantis | N/A | Tornado 120 |
Quality control beads/Performance test beads | Thermofisher Scientific, USA | N/A | |
Quarantine Tanks | N/A | N/A | Tanks with 660 L total volume |
Rectangular Glass Tanks/Aquariums | N/A | N/A | Tanks with 200 L total volume |
Refrigerator | N/A | N/A | To store the samples at 4 °C |
Ruler 30 cm | N/A | N/A | To measure the fish's length |
Sodium bicarbonate | Honeywell Fluka, Germany | 31437 | Sodium hydrogen carbonate (NaHCO3) |
Sodium chloride | Sigma-Aldrich, Germany | S9888 | |
Sterile Dissection Tools | N/A | N/A | (e.g. scalpel, scissors, fine-tipped forceps, dissecting tray/board) |
Submerged Digital Heaters | TMC Iberia, Portugal | 300 W, V2Therm Digital Heaters | |
Syringes 1 mL | IVFSTORE, USA | 8300014579-MEA | Sterile, HSW Soft-Ject Syringes to macerate head-kidney |
Temperature Sensors | GHL, Germany | PT 1000 | |
Tricaine (MS-222) | ThermoFisher Scientific, Germany | 118000500 | Ethyl 3-aminobenzoate, methanesulfonic acid salt, 98% (C10H15NO5S) |
Ultraviolet Water Sterilizer | EHEIM, Germany | 5305010 | ClearUVC-36 |
Water Bath | Fisher Scientific, Germany | N/A | Fisherbrand IsotempTM (P/N U01318) |
Water-resistant Luminaires | N/A | N/A |
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