Method Article
Cilt hücrelerinin fizyolojik ve patolojik özellikleri ile ilgili önemli bir parametredir. Biz tam alan ölçüm-in vitro nöron birim neurites ve dinamik yapıları nöronal artışa örtülü analizi için gerekli alt micrometric eksenel çözünürlük ile sağlayan bir floresan dışlama yöntemi açıklanmaktadır.
Birim nöronların farklı zaman ölçeklerde fizyolojik ve patolojik özellikleri ile ilgili önemli bir parametredir. Nöronlar oldukça benzersiz hücre ile ilgili onların genişletilmiş ramified türleri morfoloji ve sonuç olarak ses ölçüm için birkaç metodolojik sorunlar yükseltmek. Vitro nöron büyüme özel durumda seçilen metodoloji dakika zaman ölçekten saat veya gün için tam alanlı gözlem ile birlikte alt micrometric eksenel çözünürlük içermelidir. Confocal görüntüleme, elektrikle tabanlı ölçümleri veya Atomik kuvvet mikroskobu kullanarak hücre şekli yeniden yapılanma gibi diğer yöntemlerinden farklı olarak, son zamanlarda geliştirilen Floresans dışlama yöntemi (FXm) bu zorlukları karşılamak için potansiyele sahiptir. Ancak, onun ilke olarak basit olmasına rağmen birden fazla ayarlamaları ve adanmış bir metodoloji nöronlar için yüksek çözünürlüklü bir FXm uygulanması gerektirir. Burada Floresans dışlama, düşük-pürüzlülük çok bölmeleri mikrosıvısal aygıtlar ve nihayet yerel nöronal birim vitro ölçümleri elde etmek için micropatterning kombinasyonuna göre bir yöntem mevcut. Aygıt tarafından sağlanan yüksek çözünürlüklü nöronal işlemleri (neurites) yerel birim ve belirli bazı yapılar büyüme koniler (GCs) gibi nöronal büyüme dahil hacmi ölçmek izin verdi.
Hücresel biriminin kesin bilgi hücre boyutu homeostazı tek hücreli mikroorganizmalar 1 ve daha genel olarak Mitotik hücre 2' deki sayısında tarafından tahrik son yıllarda artış dikkat çekti. Ancak, hücre hacmi için nöronlar paradigmatik bir örnek teşkil da sonrası Mitotik hücreler için ilgili sorunu.
Gerçekten de farklı ölçekler ve zaman-Puan fizyolojik ve patolojik olayların önemli bir imza elektriksel aktivite (milisaniye ölçek) 3 ' e geri dönüşü ile ilişkili geçici aksonal deformasyon gelen nöronal hayatında birimdir nöronal nörodejeneratif hastalıklar (insanlarda yılda) 4, asemptomatik aşamasında meydana gelen şişlik. Ancak, gün veya hafta (bağlı olarak düşünülmüş organizma) nöronal büyüme sırasında bir ara zaman ölçeği içinde en büyük birim değişikliği oluşur. Nöronların uzun ve karmaşık morfolojisi arasında hangi katları sorunlara yol açtı hücre boyutu düzenlenmesi. Aksonal uzunluğu ve çapı gerçekten sıkı bir şekilde düzenlenmiş vivo içindeher nöronal tip 5,6için belirli değerleri vardır.
Vivo, adrese karmaşık bu sorunları da basitleştirilmiş bir şekilde ele alınması tüp bebek. Bu amaçla adanmış Birim ölçümü için hızlı bir yöntem yeterli büyüme dinamikleri (Yani bir zaman ölçeğinde dakika) ve uyumlu saatler veya günler içinde gözlem ile takip etmek gereklidir. Yılda bir hücresel birim içinde vitrodoğrudan veya dolaylı erişim sağlamak için çeşitli yöntemler geliştirilmiştir. Hücre imar confocal görüntüleme üzerinden onlardan biri, ama bu yöntem yaklaşık 500 nm 7sınırlı Aksiyel çözünürlüğe gösterilen süre etiketleme ve tekrarlanan pozlama ışık anlamına gelir. Bu iki son sakıncaları kısmen kafes ışık sayfalık mikroskobu 8isimli daha sofistike ve son yöntemi tarafından üstesinden vardır unutmayın. Atomik kuvvet mikroskobu kullanılan 9 oldu ama bu tarama yöntemi tarafından yavaş ve sıkıcı özüdür. Ayrıca, fiziksel temas ile hücre gerektirir nöronlar 10aşırı yumuşaklığını dikkate alınarak ölçüm ile etkileşebilir. Empedans veya rezonans kullanarak dolaylı yöntem istihdam için 11farklı hücre türleri ama yetersiz yapışkanlı hücrelerin nöronlar gibi genişletilir.
En umut verici yöntemlerden birini hücreleri floresan bir boya ile dolu bir yakın odasında dışlanan hacmi ölçüsü temel alır. Floresans dışlama yöntemi (FXm) hiçbir etiketleme gerektirdiğinden, prensip olarak basittir ve hücre popülasyonlarının potansiyel olarak alt optik Aksiyel çözünürlüğü ile hızlı, uzun vadeli optik görüntüleme için uygundur. Gürültü çeşitli kaynaklardan bu nihai çözüm sınırlamak daha doğrusu, z çözünürlükte maksimum floresan yoğunluğu odasında kameranın dinamik alanı tarafından bölünmüş kültür (Yani bölgedeki hücreleri yoksun) bağlıdır. Bu yöntem çok güçlü geçirme yapışık hücreleri 12 hacmi takip etmek veya birim değişikliği sırasında mitoz iyice 13açıklandığı gibi memeli hücrelerinin çalışma olmuştur. Ancak, nöronlar için onların geniş yaklaşım alt micrometric süreçlerini göz önünde bulundurarak FXm metodolojik bir meydan okuma teşkil.
Burada düzgün FXm odaları imalatı için yüksek hassasiyetli birim ve nöronal dalları ve dinamik yapılar büyüme koni gibi nöronal büyüme dahil yüksekliği ile erişmek için önde gelen bir yöntem mevcut.
Chambers Aksiyel çözünürlük iyileştirmek amacıyla ölçmek için nesne daha benzer boyutlara sahip olmalıdır. Bu nedenle, biz üç farklı yükseklikte Merkezi ölçüm Odaları tarafından karakterize farklı FXm cihazlar tasarlanmıştır. En ince (3 µm) yüksekliği neurite ölçüm için adanmış: hangi çevre 15 µm yüksek orta odası içinde kalmak soma, bu düşük yükseklik dışlar. Daha kalın Merkezi chambers (10 ve 12 µm) bütün hücre büyüme takip için yeterince yüksek. Cihazın Ayrıca Merkezi odasının her iki tarafında bulunan iki rezervuarlar içerir. Dört enjeksiyon delik (ıh) böylece uygulanır ve aşağıdaki gibi belirlenir: diğer iki rezervuarlar besleme ise hücresel süspansiyonlar çipin tanıtmak için giriş ve çıkış hizmet.
İlk fabrikasyon kalibrasyon coverslips bilinen geometri fotorezist yapıları kullanarak yükseklik ölçüleri için var. Biz-sonra yansıma ücretsiz büyüyen nöronlar, ama aynı zamanda morfolojik kısıtlanmış nöronlar yapışma micropatterns.
Çalışma bakım ve laboratuvar hayvanlarının kullanımı Avrupa toplum kuralları uyarınca gerçekleştirilmiştir: 86/609/EEC. Araştırma amaç ve protokol ERCadg etik ek proje kabul edildi ve ERCEA tarafından düzenli olarak gözden çello açıklanmıştır. 24/04/2012, Comité d'Ethique tr matière d için raporlama #C75-05-18, Institut hayvan tesisi aldı Curie ruhsat ' expérimentation animale Paris Merkezi et Sud (Ulusal kayıt numarası: #59).
1. kalıp imalatı
Not: Kalıp bir giriş ve bir çıkış, artı iki su depoları (alıcılar) Merkezi odasının her iki tarafında bulunan bağlı Merkez ve orta düzey odaları içerir.
2. PDMS çip imalatı
3. desenli coverslips (24 × 24 mm2) imalatı
Not: coverslips eğri cımbızla işlemek.
4. chip montaj ve son uygulama
5. nöron kültürü
6. Floresans dışlama gözlem
1 ve 2 bölümlerinde açıklandığı imalat sürecinin sonucu şekil 1Agörüntüleri tarafından resimli-1B ve şekil 1 ceğrisi. Şekil 1 d PDMS çip, Yani orta ve 20 µm yüksek sonraki orta odası iki farklı temsilcisi alanı pürüzlülük değerlerini görüntüler. Pürüzlülük yaklaşık 7 faktör tarafından bir düşüş yerine SU-8 fotorezist kazınmış Si gofret kullanarak elde edilmiştir. O zaman, FXm ilk 10 µm yüksek odası içinde bilinen geometri (şekil 2A) fotorezist şerit üzerinde uygulandı. Görüntü işleme ve yoğunluk yükseklik dönüşüm sonra (bkz. şekil 2Bgrafik) kesit bu Şerit (şekil 2C) boyunca üzerinde gerçekleştirilen FXm profilleri sağlar istenilen yükseklik profilleri (şekil 2B). Şekil 2B mekanik profilometrisi ve FXm yöntemleri kullanılarak elde profilleri arasında karşılaştırma gösterir. Kenar ve yayla değer, dahil olmak üzere bu profiller, doğrulama yöntemi çok benzer. Not FXm veri saçılma olarak daha fazla şekil 3 ve şekil 4, değerlendirildi yönteminin son çözünürlük temsilcisi değildir ama çok zayıf bir olası etkisini önlemek için düşük yoğunluklu sonuçlarından istihdam Auto-Floresan, GFP kanaldaki fotorezist.
O zaman, biz neurites 3 µm ve 10 µm yüksek chambers (şekil 3) gözlenen. Yaklaşık 18 arka plan gürültü standart sapmasıdır nm yoğunluğu için yükseklik dönüşüm ve arka plan düzeltme sonra. Bu değer biraz yüksek--dan fiziksel PDMS yüzeylerde döküm silikon yüzey pürüzlülüğü (12 nm, şekil 1 dtablo bkz:) ama SU-8 kalıpları PDMS üzerinde ölçülen pürüzlülüğü elde daha çok daha düşük. Bu sonuçlar ayağı oyuncular için SU-8 fotorezist delik açmak yerine silikon gofret kuyu sondaj, katma değer vurgulayın. Düşük bir değer şekil 3Aiçinde görüntülenen bir birimdeki bir yüksek sinyal-gürültü oranı ve çok net görüntüler sağlar. Böyle görüntüleri alınabilmesi için veri örneği, biz 1,6 µm (Yani 10 piksel) geniş neurite hacmi hesaplanan (bkz. şekil 3Bgrafik) dilim. Bu veri doğrusal bir uyum içinde bir ilk yaklaşım kullanarak verir ortalama neurite yükseklik değeri yaklaşık 400 nm 500 nm aksonal çapı bulundu 10 gün içinde eski pups içinde corpus callosum 5 örneğin ile karşılaştırılmak üzere,. Ayrıca micropatterns oluşan seri olarak abutted 2 µm ve uzunluğu 30 µm 6 µm geniş çizgili yapıştırılması ile FXm birlikte. Amacımız neurite genişliği etkisi 3D şeklini çalışma olmuştur. Şekil 3 c 10 µm yüksek odasında elde edilen bütün nöron görüntünün yanlış renkte bir 3D temsil gösterir. Soma en büyük şerit ekstremite üzerinde bulunan, ancak Neurites 2 µm ve 6 µm geniş çizgili, yayılıyor. Yükseklik profilleri içinde üç farklı kesit çizildi. Şekil 3Aiçinde görüntülenen grafik ile tutarlılık içinde yüzey neurite genişliği (3D şekil) ile kesit artışı üzerinde entegre.
Biz de büyüme Koni (GC) 3D yapılar üzerinde duruldu. Şekil 4 A-B hangi dallı alt yapılarını vurgulamak bir 3 µm yüksek odasında, elde edilen iki farklı GC profillerini görüntüler. Buna ek olarak, GCs bir 12 µm yüksek odasında hacmi dinamikleri takip etmek zaman hata deneyler yapılır. Şekil 4 c daralma bir döngüsü ve birkaç dakika onlarca zaman ölçeğini içinde belirli bir GC reaktivasyonu görüntüler. GFP-lifeact fare kullanımı sayesinde, büyüme koniler GFP emisyon dalga boyu içinde lokalize (510 nm)--dan onların yüksek aktin konsantrasyon. Dalga boyu belirlenen yüzey dextran emisyon dalga boyu, 647 üzerinde entegre etmek için kullanılan nm GC birim hesaplamak için. Şekil 4 d sonunda yaklaşık 6 µm3değerini üzerinde ortalanmış üç farklı nöronlar GC birim farklı zaman noktaları ve konumu itibariyle dağılımı gösterir.
Şekil 1: FXm PDMS chambers. (A) şemaları microfabrication son kalıp önde gelen dört farklı ana adımları. Giriş, çıkış ve su depoları konumunu belirtilir. Ölçek çubukları: 1 mm. (B) PDMS FXm odası bir optik profilometer kullanılarak elde görüntüsü. Bu görüntü 10 µm yüksek sütun ve 3 satır ve yüksekliği 20, 50 ve 90 µm ara odaları içeren orta odası gösterir. Ölçek çubuğu: 500 µm. (C) (B) çizilmiş iki kesik çizgiler boyunca çipin kesit görünümü. Sarı/altın: kesiti boyunca sütunlar, mavi: kesit sütunlar arasında. (D) PDMS pürüzlülük değerleri ölçülen üzerinde 50 × 50 µm2 alanları silikon ve 20 µm yüksek SU-8 orta odası kalıp demek (oklar bu alanların konum için bakınız). Ortalama değerleri üç farklı alanlarda ölçümleri elde edilmiştir. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.
Şekil 2: Kalibrasyon fotorezist şerit ilgi nesnesi kullanarak FXm yönteminin. (A) bir 10 µm yüksek odasında alınan GFP-floresan görüntü 10.000 MW dextran 488 emici dolu nm'de 1 mg/mL. (B: arka plan, P: ayağı). Gözlem kuru 40 X NA 0,8 amacı ile. Ölçek çubuğu: 50 µm. (B) doğrusal kalibrasyon hukuk fotorezist geçiş A. (C) floresan yoğunluğu profil (A), görüntülenen mavi Kesikli çizgi düzeyde elde gösterilen iki renkli dikdörtgenlerin ortalama yoğunluğu elde Şerit (0,45 µm yüksek pozitif fotorezist). (D) mekanik profilometer (siyah nokta) ve FXm Yükseklik (B) (mavi noktalar) veri dönüştürme sonra yoğunluğu elde profilleri karşılaştırılması. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.
Şekil 3: Neurite birim görüntüleme. (A) Neurite soma sonraki 15 µm ara odasında bulunan Merkez 3 µm yüksek odanın içine uzanan. 488 10.000 MW dextran emici kullanılarak gerçekleştirilen görüntüleme nm ve 40 X, NA 0,8 kuru amaç. İlave arka plan azaltma rutin olayları kullanımdan sonra iki neurites ve sağdaki grafik çizmek için seçilen elde. Ölçek çubukları: 30 µm. (B) Neurite dilim birim neurite genişliği bir fonksiyonu olarak elde edilen (A) gösterilen 22 profillerinden (ortalama 10 piksel, Yani 1.6 µm "neurite dilim" Tarih olarak). Düz çizgiyi başlangıç noktası geçen yamaç 0,4 µm lineer bir uyum gösterir. (C) bir yapıştırıcı şerit üzerinde desenli bir neuron yanlış renk imajı art arda 2 µm ve 6 µm geniş kütükleri (beyaz olarak temsil edilen) yaptı. Ölçümler 10.000 MW dextran 647 emici dolu bir 10 µm yüksek odasında yapılmıştır nm ve 40 x NA kullanarak 0,8 kuru amaç. (D) yükseklik profilleri aynı tutmak (C), gösterilen renkli kesik çizgiler için karşılık gelen renk kodu. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.
Şekil 4: statik ve dinamik büyüme koni görüntüleme. (A-B) 3 µm yüksek odasında yükseklik dönüşüm ilişkili Albümdeki görüntülenen sarı çizgiler boyunca yoğunluk sonra elde edilen büyüme koni yükseklik profilleri de içerir. 10.000 MW dextran 488 emici ile dolgu kullanılarak gerçekleştirilen gözlem nm ve 40 X, NA 0,8 kuru amaç. (C) bütün nöron görüntüleme 12 µm yüksek odasında 10.000 MW dextran 647 emici dolu nm. Gözlem iki floresan kanallarında yapılan: GFP büyüme koni yerelleştirme (Kesikli sarı çizgiler) ve floresan dışlama birimden GC hesaplamak için CY5 için. Kesikli sarı çizgilerle dahil yüzey GC birim hesaplamak için kullanıldı. Grafik, iki temsilcisi farklı zaman noktalarda GFP ve CY5 kanaldaki GC birim varyasyon zaman ve ilişkili türleri Morfoloji üzerinde gösterir. Tüm verileri bir 40 x NA kullanarak satın alınan 0.8 kuru amaç her 3 dk. ölçek çubukları: 10 µm. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.
Adım | 1:8 µm katman maskesi | 2:30 maske µm tabaka | 3:40 maske µm tabaka |
SU-8 tipi | 2007 | 2025 | 2050 |
Spincoating | 30 s @ 2000 rpm | 30 s @ 3050 rpm | 30 s @ 3250 devir/dakika |
Yumuşak kek | 3 dakikada 95 ° C | 2 dakikada 65 ° C + 6 dakikada 95 ° C | 3 dakikada 65 ° C + 7 dakikada 95 ° C |
Pozlama enerji | 110 mJ/cm2 | 155 mJ/cm2 | 170 mJ/cm2 |
Sonrası pozlama fırında | @ 95 ° C 4 dk | 1 dakikada 65 ° C + 6 dakikada 95 ° C | 2 dakikada 65 ° C + 7 dakikada 95 ° C |
Geliştirme | 2 dk 30 sn | 5 dk | 6 dk |
Sabit fırında (isteğe bağlı) | 3-5 dakikada 200 ° C | 3-5 dakikada 200 ° C | 3-5 dakikada 200 ° C |
Tablo 1: Merkez TMMOB yüksekliği 12 mikron içeren bir aygıtı oluşturmak için gerçekleştirilen fotolitografi adımlar. Ara chambers yükseklikleri: 20, 50 ve 90 µm.
Adım | Maske 1:10 µm tabaka | 2:30 maske µm tabaka | 3:40 maske µm tabaka |
SU-8 tipi | 2007 | 2025 | 2050 |
Spincoating | 30 s @ 1500 rpm | 30 s @ 3050 rpm | 30 s @ 3250 devir/dakika |
Yumuşak kek | 3 dakikada 95 ° C | 2 dakikada 65 ° C + 6 dakikada 95 ° C | 3 dakikada 65 ° C + 7 dakikada 95 ° C |
Pozlama enerji | 125 mJ/cm2 | 155 mJ/cm2 | 170 mJ/cm2 |
Sonrası pozlama fırında | @ 95 ° C 4 dk | 1 dakikada 65 ° C + 6 dakikada 95 ° C | 2 dakikada 65 ° C + 7 dakikada 95 ° C |
Geliştirme | 2 dk 30 sn | 5 dk | 6 dk |
Sabit fırında (isteğe bağlı) | 3-5 dakikada 200 ° C | 3-5 dakikada 200 ° C | 3-5 dakikada 200 ° C |
Tablo 2: yüksekliği 10 mikron merkezi bir odası içeren bir aygıtı oluşturmak için gerçekleştirilen fotolitografi adımlar. Ara chambers yükseklikleri: 20, 50 ve 90 µm.
Adım | 1:12 maske µm tabaka | 2:32 maske µm tabaka | 3:40 maske µm tabaka |
SU-8 tipi | 2015 | 2025 | 2050 |
Spincoating | 30 s @ 3250 devir/dakika | 30 s @ 2500 rpm | 30 s @ 3250 devir/dakika |
Yumuşak kek | 3 dakikada 95 ° C | 2 dakikada 65 ° C + 5 dakikada 95 ° C | 3 dakikada 65 ° C + 7 dakikada 95 ° C |
Çekim hızı | 140 mJ/cm2 | 157 mJ/cm2 | 170 mJ/cm2 |
Sonrası pozlama fırında | @ 95 ° C 4 dk | 1 dakikada 65 ° C + 5 dakikada 95 ° C | 2 dakikada 65 ° C + 7 dakikada 95 ° C |
Geliştirme | 3 dk. | 5 dk | 6 dk |
Sabit fırında (isteğe bağlı) | 3-5 dakikada 200 ° C | 3-5 dakikada 200 ° C | 3-5 dakikada 200 ° C |
Tablo 3: yüksekliği 3 μm kalınlığında bir orta odası içeren bir aygıtı oluşturmak için gerçekleştirilen fotolitografi adımlar. Ara chambers yükseklikleri: 18, 50 ile 90 µm.
Ek veri 1: masks_neuron_volume_chips.tiff. Şematik PDMS aygıt (DRIE maskesi ve maskeleri 1-3) imal için kullanılan maskeler. Bu dosyayı indirmek için buraya tıklayınız.
Ek veri 2: dosyasını "masks_neuron_volume_chips.dxf". DRIE maskesi ve maskeleri 1-3 imal etmek izin elektronik dosyaları. Bu dosyayı indirmek için buraya tıklayınız.
Ek veri 3: "Mask_Photoresist-stripes.dxf". Fotorezist çizgili fotolitografi için kullanılan maskeyi imal etmek izin elektronik dosyaları. Bu dosyayı indirmek için buraya tıklayınız.
Ek veri 4: conversion_mattotiff.m dosya Bu dosyayı indirmek için buraya tıklayınız.
Ek veri 5: importfilevol.m dosya Bu dosyayı indirmek için buraya tıklayınız.
Birim görüntüleme nöronların uzun ve ince uzantıları bu hücreler nedeniyle FXm tekniği için bir meydan okuma kabul ettiğiniz anlamına gelir. Bu iletişim kuralı aynı nöron görüntüleme için adanmış mikrosıvısal aygıt türü türevleri açıklar.
Mikrosıvısal tasarım yönleri, yanında objektif seçimi Floresans dışlama görüntüleme için esastır ve yanal çözünürlük ve görüntü netliği arasında bir denge anlamına gelir. 13 ' te odak derinliğe kadar Oda yüksekliği daha küçük önde gelen yüksek bir NA görüntüleme odak gerçekleştirdiyseniz ve ben nesnenin kontur arasında yeterli bir kenar boşluğu bırakıldığı takdirde birim ölçü duyarlık için zararlı olmadığını gösterilmiştir nterest ve entegrasyon yüzeyi sınırları. Ancak, odak derinliği yüksek bir odası kullanımı faiz nesnelerin kenarlarını foton difüzyon, hangi düzgünleştirir nedeniyle görüntü netliği bozar. 3 µm yüksek odası imalatı bu yanal bulanıklaştırma azaltılmış ve son derece iyi tanımlanmış floresan dışlama görüntüleri bile yüksek NA kullanarak sağlanan (0.8) 40 X hedefleri nöronal dalları yüksek yanal çözünürlük ile görselleştirmek için.
Montaj çip bir kritik adım, özellikle söz konusu olduğunda 3 µm yüksek chambers, ama dikkatli işleme 4.1.2 içinde açıklandığı gibi çatı çöküşü önler. Bu ince odalarına ilişkili hacim oranı yüksek yüzeye de zamanla Dextran konsantrasyon kararlılığını gündeme. Biz Dextran yüzey emilimini kuluçka bir geceden sonra önemsiz kontrol ettirin: PBS tarafından Dextran değiştirdikten sonra yoğunluk farkı ayağı ile arka plan arasında yaklaşık 1000 arasında ilk yoğunluğu kontrast başına 1 oldu Bu iki bölgenin Dextran huzurunda. Nöronların alt coverslip hem PDMS çatıda uygun unutmayın. Desenli coverslips (ne zaman PDMS odası içinde yapışkan molekülleri kuluçkaya değilYani ), kaplama olarak kullanarak bu nedenle kesinlikle odası dibinde yerelleştirildiğinde bu etkisi kaybolur.
Gerçeğini yöntemi, Yani dextran endositoz, büyük sınırlandırılması biridir çok sınırlı nedeniyle zorlu onların morfolojisi dışında nöronlar FXm için oldukça uygundur bu hücrelerde. Bir 10 seçtiğimiz kDa formülasyonu uzun bastırmak için aralığı (saat) herhangi görünür endositoz olayları.
Sonuç olarak, FXm kavramsal sadeliği bir dizi nanometric PDMS pürüzlülük ve micrometric odası yükseklik veya eşitsizlik için düzeltmek için arka plan düzeltme gibi mevcut protokolü tarafından çözüldüğünü deneysel sorununu tarafından dengelenir sütunlar arasında PDMS tavan. Ancak, floresan orta sınırlamak için yakın mikrosıvısal odası kullanımı birkaç belirli kısıtlamalar etkili yüzey hücre adezyon veya merkezden soma dışlamak için zorunluluk için kullanılabilir düşüren destek ayağı, ihtiyaç gibi verimleri odası nöronal uzantıları yüksek çözünürlüklü gözlem için erişilebilir hücre bölgelerinde kısıtlar en yüksek netlik ile gözlemlemek için. Bu yöntemin olası bir evrim optik bir tarafından değiştirilmesi bu fiziksel doğumdan kurtulmak olacaktır. Hafif levha mikroskobu yeni gelişme avantajlı FXm ile gelecekte birlikte.
Yazarlar hiçbir çıkar çatışması beyan ederim.
Yazarlar süreç geliştirme ve cihaz imalat değerli destek için ChiLab, malzeme ve Microsystems laboratuvar - Politecnico di Torino - DISAT, Prof. C F Pirri, Dr. M Cocuzza ve Dr. S L Marasso, bizzat kabul etmek istiyorum. Victor Racine Quantacell üzerinden tartışma ve görüntü işleme desteği için teşekkürler. GFP LifeAct fareler ile bize sağlamak için hayvan tesisin Institut Curie destekleri için fare ve Pablo Vargas ve Ana-Maria Lennon (Institut Curie) Isabelle Grandjean ve Manon Chartier için sana şükrediyoruz. Olivier Thouvenin Institut Langevin ve Clotilde Cadart, Larisa Venkova ve Matthieu Piels üzerinden Institut Curie - UMR 144, Floresans dışlama yöntemi anlamada yardım için minnettarız. Nihayet, Institut Pierre-Gilles de Gennes (CNRS UMS 3750) teknolojik platform desteklerinden dolayı microfabrication içinde teşekkür ederim. Bu eser Avrupa Araştırma Konseyi gelişmiş Grant No 321107 tarafından "Çello," kısmen desteklenen PSL Université (SwithNeuroTrails Projesi), ANR Investissement d'Avenir ve IPGG Labex ve Equipex.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Equipments | |||
Plasmalab System 100 | Oxford Instruments | To perform DRIE | |
MJB4 mask aligner | SUSS MicroTec | SU-8 photolithography | |
NXQ 4006 Mask aligner | Neutronix Quintel | Photolithography associated to DRIE | |
Plasma cleaner | Diener Electronic | Pico PCCE | |
Cell culture hood | ADS Laminaire | Optimale 12 | |
Centrifuge | Thermo Fisher Scientific | Heraeus Multifuge X1R | |
Incubator 37 °C 5% CO2 | Panasonic | MCO-170AICUVH-PE IncuSafe CO2 Incubator | |
Epifluorescence microscope | Leica | DMi8 | |
PDMS Oven between 65 and 80 °C | Memmert | ||
Mechanical profilometer | Veeco | Dektak 6M Stylus Profiler | |
Optical profilometer | Veeco | Wyko NT9100 | |
Vacuum desiccator | Verrerie Villeurbanaise (Kartel Labware) | 230KAR | Diameter 200 mm |
Ultrasonic bath sonicator | Labo Moderne | SHE1000 | Volume of the bath: 0.8 liter |
Hotplate | Stuart SD162 | SD162 | |
Masks | |||
DRIE | Supplementary data | ||
Su8 Mask 1 | Supplementary data | ||
Su8 Mask 2 | Supplementary data | ||
Su8 Mask 3 | Supplementary data | ||
S1805 calibration stripes | Supplementary data | ||
Small laboratory equipment | |||
1.5 mm hole puncher | Sigma-Aldrich | 29002519 (US reference) | |
Scalpel or razor blade | |||
9" Stainless Steel Flat Spatula with Spoon | VWR International | 82027-532 | To demold PDMS |
Top Lip Wafer Handling | VWR International | 63042-096 | |
Curved tweezer | FST | Dumont #7 Forceps - Standard / Dumoxel | To manipulate glass coverslips |
Substrates | |||
Silicon wafer | Prolog Semicor Ltd | ||
24x24 mm glass coverslips | VWR | 631-0127 | |
Photoresists and developpers | |||
AZ 1518 positive photoresist | Microchemicals GmbH | Before DRIE process, thicknes 1.8 µm | |
AZ 351B developer | Microchemicals GmbH | To develop positive AZ 1518 photoresist | |
SU-8 2007 | MicroChem | ||
SU-8 2025 | MicroChem | ||
SU-8 2050 | MicroChem | ||
PGMA developer | Technic | To develop SU-8 negative photoresist | |
Microposit S1805 resist | Chimie Tech Services | Positive photoresist used to obtain 0.5µm high structures | |
MF 26A developer | Chimie Tech Services | To develop positive S1805 photoresist | |
Laboratory consumables | |||
Disposable plastic pipette 3 mL | LifeTechnologies - ThermoFisher | ||
P100 Petri dishes | TPP | 93100 | |
20 mL syringe | Terumo | SS+20ES1 | |
Transparent scotch tape | |||
Square wipes | VWR | 115-2148 | |
Parafilm | DUTSCHER | 90260 | Plastic paraffin film |
Chemicals | |||
(3-Methacryloxypropyl)trichlorosilane | abcr | AB 109004 | |
PDMS and curing agent Sylgard 184 | Sigma-Aldrich | 761036 | |
isopropanol | W292907 | ||
poly-ornithine | Sigma-Aldrich | P4957 - 50 mL | |
Ethanol absolute | Sigma-aldrich | 02865 | 99.8% |
3-methacryloxypropyl-trimethoxysilane | Sigma-aldrich | M6514-25ML | (C4H5O2)-(CH2)3- Si(OCH3)3 |
acetic acid | Sigma-aldrich | 71251-5ML-F | |
Dextran 10kW conjugated with Alexa488 | LifeTechnologies - ThermoFisher | D22910 | Absoprtion at 488 nm |
Dextran 10kW conjugated with Alexa647 | LifeTechnologies - ThermoFisher | D22914 | Absoprtion at 647 nm |
Culture medium | |||
MEM | LifeTechnologies - ThermoFisher | 21090-022 | |
Horse Serum | LifeTechnologies - ThermoFisher | 26050088 | |
B27 | LifeTechnologies - ThermoFisher | 12587-010 | |
Glutamax 200 mM | LifeTechnologies - ThermoFisher | 35050-061 | |
Sodium Pyruvate GIBCO 100 mM | LifeTechnologies - ThermoFisher | 11360-070 | |
Gentamicin | LifeTechnologies - ThermoFisher | 15710-049 | |
PBS | Sigma-Aldrich | D8537-500ML | |
HBSS 10x | LifeTechnologies - ThermoFisher | 14180-046 | |
Hepes 1M | LifeTechnologies - ThermoFisher | 15630-056 | |
trypsin-EDTA | Sigma-Aldrich | 59418C-100ML | |
Neurobasal | LifeTechnologies - ThermoFisher | 21103-049 | |
Neurobasal without phenol red | LifeTechnologies - ThermoFisher | 12348-017 | |
Softwares | |||
Routine in Matlab for background normalization | Quantacell | Contact Victor Racine: victor.racine@quantacell.com | |
ImageJ | To select specific ROI for image analysis | ||
Routine | ImageJ | Supplementary data | |
Routine | Matlab | Supplementary data |
Bu JoVE makalesinin metnini veya resimlerini yeniden kullanma izni talebi
Izin talebiThis article has been published
Video Coming Soon
JoVE Hakkında
Telif Hakkı © 2020 MyJove Corporation. Tüm hakları saklıdır