Войдите в систему

В этой статье

  • Резюме
  • Аннотация
  • Введение
  • протокол
  • Результаты
  • Обсуждение
  • Раскрытие информации
  • Благодарности
  • Материалы
  • Ссылки
  • Перепечатки и разрешения

Резюме

В этом исследовании изучается иммунное состояние при сепсисе путем анализа количественных отношений между лейкоцитами, лимфоцитами и нейтрофилами у пациентов с сепсисом и здоровых контрольных групп с использованием анализа визуализации данных и трехмерной численной аппроксимации для создания математической модели.

Аннотация

При сепсисе понимание взаимодействия между лейкоцитами, лимфоцитами и нейтрофилами имеет решающее значение для оценки иммунного состояния и оптимизации стратегий лечения. Образцы крови были собраны у 512 пациентов с диагнозом сепсис и у 205 здоровых людей из контрольной группы, всего 717 образцов. Анализ визуализации данных и трехмерная численная аппроксимация были выполнены для создания математической модели, описывающей взаимоотношения между лейкоцитами, лимфоцитами и нейтрофилами. Самоорганизующаяся карта признаков (SOFM) была использована для автоматической кластеризации данных образца сепсиса в трехмерном пространстве, представленном моделью, что привело к различным иммунным состояниям.

Анализ показал, что количество лейкоцитов, лимфоцитов и нейтрофилов ограничено в трехмерной плоскости, как описано уравнением: WBC = 1,098 × нейтрофилов + 1,046 × лимфоцитов + 0,1645, что дает ошибку прогнозирования (RMSE) 1%. Это уравнение универсально применимо ко всем выборкам, несмотря на различия в их пространственном распределении. Кластеризация SOFM выявила девять различных иммунных состояний в популяции пациентов с сепсисом, представляющих различные уровни иммунного статуса, периоды колебаний и стадии восстановления.

Предложенная математическая модель, представленная приведенным выше уравнением, показывает базовую границу ограничения популяций иммунных клеток как у пациентов с сепсисом, так и у здоровых людей из контрольной группы. Кроме того, кластерный подход SOFM обеспечивает всесторонний обзор различных иммунных состояний, наблюдаемых в пределах этой границы ограничения у пациентов с сепсисом. Это исследование закладывает основу для будущей работы по количественной оценке и категоризации иммунного состояния при сепсисе, что в конечном итоге может способствовать разработке более объективных стратегий диагностики и лечения.

Введение

Сепсис, опасная для жизни дисфункция органов, вызванная нерегулируемой реакцией хозяина на инфекцию, остается серьезной проблемой в реанимации и интенсивной терапии1. Несмотря на успехи в понимании патофизиологии сепсиса, сложное взаимодействие между иммунной системой и патогенами продолжает создавать трудностив диагностике и эффективном лечении этого состояния. Современные клинические подходы часто сосредоточены на мониторинге показателей инфекции, функции органов, цитокинов, обнаружения микроорганизмов и микробиома кишечника3. Тем не менее, растет признание решающей роли, которую играют иммунные клетки, особенно белые кровяные тельца, лимфоциты и нейтрофилы, в прогрессировании и разрешении сепсиса4.

Во время сепсиса иммунная система претерпевает сложный ряд изменений, характеризующихся начальной гипервоспалительной фазой, за которой следует длительная иммуносупрессивная фаза5. Ранняя фаза характеризуется всплеском количества нейтрофилов и сопутствующим снижением популяций лимфоцитов, что отражает активацию врожденных иммунных реакций и подавление адаптивного иммунитета. По мере прогрессирования состояния уровни нейтрофилов могут колебаться или истощаться, в то время как количество лимфоцитов продолжает снижаться, что приводит к состоянию иммуносупрессии, которое делает пациентов уязвимыми к вторичным инфекциям7. Понимание динамического взаимодействия между этими популяциями иммунных клеток имеет решающее значение для точной оценки иммунного статуса пациентов с сепсисом и разработки целенаправленных вмешательств.

Традиционные подходы к анализу количества иммунных клеток при сепсисе основывались на одномерном или двумерном анализе, который не смог охватить сложные взаимосвязи между несколькими иммунными параметрами8. Последние достижения в области визуализации данных и методов машинного обучения открыли новые возможности для изучения многомерных иммунологических данных9. В частности, трехмерная визуализация диаграмм рассеяния и самоорганизующиеся карты признаков (SOFM)10 показали многообещающие результаты в выявлении скрытых закономерностей и идентификации различных иммунных состояний в различных контекстах заболевания.

Это исследование направлено на изучение иммунного состояния у пациентов с сепсисом путем анализа количественных отношений между лейкоцитами, лимфоцитами и нейтрофилами с использованием передовых методов визуализации данных и кластеризации. Гипотеза заключается в том, что эти популяции иммунных клеток ограничены трехмерным пространством, управляемым лежащими в основе математическими отношениями. Раскрывая эту взаимосвязь и определяя различные иммунные состояния с помощью SOFM, исследование стремится обеспечить основу для понимания иммунных динамических состояний при сепсисе и облегчить принятие клинических решений.

Подход включает в себя сбор образцов крови у 512 пациентов с сепсисом, госпитализированных в отделение интенсивной терапии (ОИТ), и 205 здоровых людей, всего 717 образцов. Исследуемая популяция включала как мужчин (54,3%), так и женщин (45,7%) в возрасте от 35 до 100 лет (средний возраст: 73,5 года). Трехмерная визуализация диаграммы рассеяния и численная аппроксимация применяются для создания математической модели, описывающей взаимодействие между лейкоцитами, лимфоцитами и нейтрофилами как у пациентов с сепсисом, так и у здоровых людей. Затем SOFM используется для автоматической кластеризации данных образца сепсиса в трехмерном пространстве, получая различные иммунные состояния. Сравнивая иммунные профили и пространственное распределение пациентов с сепсисом с таковыми у здоровых людей в пределах предельной границы, представленной математической моделью, исследование направлено на получение представления о патофизиологических механизмах, лежащих в основе сепсиса, и определение потенциальных мишеней для иммуномодулирующей терапии.

Предоставляя количественный метод оценки иммунного состояния пациентов с сепсисом, этот подход может позволить более точно определить стадию заболевания и помочь в выборе соответствующих вмешательств. Кроме того, идентификация различных иммунных состояний с помощью SOFM может заложить основу для будущих исследований персонализированных подходов к иммунотерапии, адаптированных к конкретным иммунным профилям отдельных пациентов.

Таким образом, в этом исследовании представлен подход к пониманию иммунного состояния при сепсисе с использованием передовых методов визуализации данных и машинного обучения. Раскрывая математическую взаимосвязь между ключевыми популяциями иммунных клеток у пациентов с сепсисом и здоровыми контрольными группами, а также выявляя различные иммунные состояния у пациентов с сепсисом, исследование дает новый взгляд на сложную иммунную динамику при сепсисе. Этот подход позволяет более точно оценить состояние заболевания (различные кластеры) и может помочь в выборе соответствующих вмешательств, что в конечном итоге способствует разработке более эффективных диагностических и терапевтических стратегий.

протокол

В этом исследовании изучается иммунное состояние у пациентов с сепсисом путем изучения взаимоотношений между лейкоцитами, лимфоцитами и нейтрофилами. Пациенты были зачислены в отделение интенсивной терапии (ОИТ) больницы Дунчжимэнь в Пекине, Китай, и сдали стандартные анализы крови после предоставления информированного согласия. Исследование проводилось в соответствии с руководящими принципами институционального комитета по этике исследований человека. Группировка данных и подробное содержание данных приведены в дополнительной таблице 1. Программные средства, использованные в данном исследовании, перечислены в Таблице материалов.

1. Сбор и подготовка данных

Лейкоциты, нейтрофилы и лимфоциты были выбраны в качестве ключевых индикаторов иммунного состояния у пациентов с сепсисом. Этот выбор основан на хорошо установленных клинических наблюдениях о том, что количество лимфоцитов имеет тенденцию к подавлению и постепенному снижению, в то время как количество нейтрофилов часто колеблется у пациентов с сепсисом. Эти два типа клеток были эмпирически признаны важными маркерами иммунного статуса в популяциях пациентов с сепсисом. Тем не менее, точная количественная связь между этими параметрами не была четко описана в литературе. Таким образом, лейкоциты, нейтрофилы и лимфоциты были выбраны в качестве отправной точки для количественной оценки иммунного состояния у пациентов с сепсисом.

  1. Установка надстройки MATLAB Spreadsheet Link для Excel.
    1. Откройте Microsoft Excel и перейдите на вкладку «Вставка» на ленте.
    2. Нажмите « Получить надстройки » в разделе « Надстройки ».
    3. В диалоговом окне « Надстройки Office» найдите в строке поиска ссылку на электронную таблицу MATLAB .
    4. Найдите надстройку MATLAB Spreadsheet Link для Excel в результатах поиска и нажмите кнопку « Добавить ».
    5. Прочтите и примите условия и положения, затем нажмите «Продолжить », чтобы продолжить установку.
    6. При появлении запроса войдите в систему с учетной записью MathWorks или создайте новую учетную запись для доступа к надстройке.
    7. После завершения установки на ленте Excel появится вкладка «Ссылка на таблицу MATLAB ».
    8. Перейдите на вкладку «Ссылка на электронную таблицу MATLAB », чтобы убедиться, что надстройка установлена и готова к использованию.
  2. Отправка данных в рабочее пространство MATLAB.
    1. Откройте таблицу, содержащую данные пациента с сепсисом, включая количество лейкоцитов, лимфоцитов и нейтрофилов.
    2. Убедитесь, что данные организованы в структурированном формате, где каждая переменная (количество лейкоцитов, лимфоцитов и нейтрофилов) находится в отдельном столбце, а каждый пациент — в отдельной строке.
    3. Выберите диапазон клеток, содержащих количество лейкоцитов, лимфоцитов и нейтрофилов.
    4. Перейдите на вкладку « Ссылка на таблицу MATLAB » на ленте Excel.
    5. На вкладке Ссылка на таблицу MATLAB нажмите кнопку Отправить данные в MATLAB .
    6. В диалоговом окне Отправить данные в MATLAB выберите соответствующий экземпляр MATLAB из раскрывающегося меню, если запущено несколько экземпляров.
    7. Укажите имя переменной для данных в поле Имя переменной . Например, sepsis_immune_data.
    8. Выберите нужный тип данных для импортируемых данных в MATLAB (например, числовая матрица).
    9. Нажмите OK , чтобы отправить данные в рабочую область MATLAB.
    10. Переключитесь на приложение MATLAB и убедитесь, что данные были успешно импортированы, проверив рабочее пространство на наличие указанного имени переменной (например, sepsis_immune_data).
  3. Проверка данных в MATLAB
    1. После отправки данных пациента с сепсисом (количество лейкоцитов, лимфоцитов и нейтрофилов) в MATLAB с помощью надстройки MATLAB Spreadsheet Link переключитесь на приложение MATLAB.
    2. Чтобы проверить содержимое импортируемых данных, введите имя переменной в командном окне MATLAB и нажмите клавишу Enter.

2. Трехмерная визуализация лейкоцитов, лимфоцитов и нейтрофилов

  1. Построение графика с помощью функции Immune_scatter3
    1. Переменная A хранит иммунные данные пациентов с сепсисом. Вызовите функцию Immune_scatter3(A) для получения графического интерфейса пользователя (GUI), отображающего трехмерную диаграмму рассеяния образцов, как показано на рисунке 1.
      ПРИМЕЧАНИЕ: Ошибка подгонки между трехмерной плоскостью и распределением образцов на графике очень мала. В разделе 3 будет приведена точная формула.
  2. Использование графического интерфейса пользователя
    1. Исследуйте и анализируйте трехмерную точечную диаграмму с помощью интерактивных функций, предоставляемых созданным графическим интерфейсом.
      1. Поворот: Щелкните и перетащите график, чтобы повернуть его в 3D-пространстве, что позволит рассмотреть распределение образцов под разными углами.
      2. Панорамирование: щелкните правой кнопкой мыши и перетащите график, чтобы переместить его по горизонтали или вертикали, регулируя видимую область графика.
      3. Масштабирование: используйте колесико мыши или элементы управления масштабированием на панели инструментов для увеличения или уменьшения масштаба графика, фокусируясь на определенных областях или образцах.
      4. Курсор данных: Нажмите на отдельные образцы, чтобы отобразить их соответствующие значения для лейкоцитов, лимфоцитов и нейтрофилов.
        ПРИМЕЧАНИЕ: Используя эти интерактивные функции, клиницисты могут получить представление о взаимосвязи и закономерностях между лейкоцитами, лимфоцитами и нейтрофилами у пациентов с сепсисом, облегчая изучение и анализ иммунных данных.

3. Формула

  1. В рабочем пространстве MATLAB назначьте количество нейтрофилов, количество лимфоцитов и количество лейкоцитов переменным X, Y и Z соответственно.
  2. Для получения точного математического выражения (формула 1; WBC = 1,098 × нейтрофилов + 1,046 × лимфоцитов + 0,1645 (RMSE: 1%)) трехмерной плоскости на рисунке 1 вызовите следующую команду:
    [fitresult, gof, output] = fit ([X, Y], Z, 'poly11')
    Примечание: Эта формула количественно описывает взаимосвязь между лейкоцитами, нейтрофилами и лимфоцитами у пациентов с сепсисом, обеспечивая краткое и точное представление иммунных данных.
  3. Чтобы оценить правильность аппроксимации, вычислите нормализованную среднеквадратическую ошибку (NRMSE) с помощью следующей команды:
    gof.rmse / (max(Z) - min(Z))
    ПРИМЕЧАНИЕ: Результирующее значение NRMSE 1% указывает на то, что подогнанная плоскость (формула 1) близко аппроксимируется к фактическому распределению образцов в трехмерном пространстве. Этот низкий уровень погрешностей подчеркивает надежность и валидность полученного математического выражения для выявления сложных взаимосвязей между иммунными параметрами у пациентов с сепсисом.

4. Иммунное состояние при сепсисе

ПРИМЕЧАНИЕ: Самоорганизующиеся карты признаков (SOFM) были использованы для неконтролируемой кластеризации с целью выявления иммунных состояний у пациентов с сепсисом.

  1. Вызывая функцию Immune_Condition , сгенерируйте кластеры опорных точек на трехмерной плоскости, представленной формулой 1, как показано на рисунке 2.
  2. Используйте функции интерактивной визуализации, показанные на рисунке 2 , как описано в шаге 2.2.
    ПРИМЕЧАНИЕ: На рисунке 2 показаны девять автоматизированных кластеров, обозначенных как Cluster1 - Cluster9, полученных на основе неконтролируемого подхода машинного обучения SOFM. Этот метод кластеризации учитывает как пространственную топологию, так и плотность образцов, что позволяет идентифицировать различные иммунные условия в популяции пациентов с сепсисом.

5. Типичные траектории иммунных колебаний при сепсисе

  1. Как показано на рисунке 2, используйте команду hold on , чтобы сохранить рисунок в накладываемом состоянии, а затем используйте следующие команды для создания трехмерного графика типичных данных траектории пациента.
    Подождать
    для i=1: размер(p,1)-1
    пауза (3); plot3(p (i: i+1,2), p (i: i+1,3), p (i: i+1,1),'k','Linewidth',3);
    конец

Результаты

Прогрессирование сепсиса включает в себя сложное взаимодействие между иммунной системой человека и вторгшимися патогенами. В клинической диагностике и лечении большое внимание уделяется показателям инфекции, маркерам функции органов, цитокинам, обнаружению микроорганизмов и даже микробиому кишечника. Тем не менее, это исследование подчеркивает важность трех общих иммунных показателей: лейкоцитов, нейтрофилов и лимфоцитов, которые не лишены оснований. Исследования показали, что патологический процесс сепсиса сопровождается подавлением и истощением популяций лимфоцитов, при этом уровни нейтрофилов либо истощаются, либо одолевают возбудителей послеповторных колебаний5. Тем не менее, математические ограничения и динамика, лежащие в основе этого процесса, еще предстоит количественно оценить и прояснить.

При изучении распределения 512 образцов (обозначенных синими точками) и 205 здоровых образцов (обозначенных зелеными знаками плюса) в трехмерном пространстве (рис. 1) становится очевидным, что точки отбора образцов лейкоцитов, нейтрофилов и лимфоцитов лежат на плоскости с очень малой погрешностью. Отличительные цвета и маркеры, используемые на диаграмме рассеяния, ясно демонстрируют значительные различия между контрольной группой сепсиса и здоровой группой в пределах границы ограничения. Это наблюдение позволяет предположить, что эти популяции иммунных клеток подчиняются объективному закону или ограничению, независимо от состояния здоровья. Дальнейший анализ показывает следующую формулу: лейкоциты = 1,098 × нейтрофилы + 1,046 × лимфоциты + 0,1645 (формула 1), с среднеквадратичной ошибкой (RMSE) 1%. Это уравнение указывает на то, что наклон нейтрофилов на плоскости больше, чем у лимфоцитов, что означает, что изменения в количестве нейтрофилов оказывают более выраженное влияние на количество лейкоцитов по сравнению с изменениями в количестве лимфоцитов. Несмотря на свою простоту, эта формула представляет собой новое открытие, которое раскрывает объективно существующий механизм или ограничение, управляющее взаимодействием между лейкоцитами, нейтрофилами и лимфоцитами, независимо от их индивидуальных вариаций. Важно отметить, что эта граница ограничения применима как к пациентам с сепсисом, так и к здоровым людям, предполагая, что она отражает фундаментальное свойство иммунной системы, в то время как четкое пространственное распределение в пределах этой границы раскрывает иммунологические различия между сепсисом и здоровьем.

Чтобы еще больше различить различные иммунные состояния, на рисунке 2 используется SOFM для автоматической кластеризации точек выборки. SOFM был специально выбран для этого анализа, потому что это хорошо зарекомендовавший себя алгоритм кластеризации без учителя, который отлично справляется с сохранением топологических отношений при учете как расстояния между образцами, так и их распределения плотности. Параметр управления окрестностями алгоритма был установлен в 1, что обеспечивает минимальное перекрытие между соседними кластерами при сохранении четких определений границ. Выбор девяти категорий был определен путем тщательной оптимизации параметров, уравновешивающей необходимость детального деления состояний с практическим рассмотрением сохранения клинически значимых различий. Такой подход позволяет проводить как тонкую дискриминацию иммунных состояний, так и возможность слияния смежных состояний, когда это биологически целесообразно, тем самым избегая как чрезмерной сегментации, так и пропусков состояний.

На рисунке 2 кластеризация SOFM была использована для автоматической идентификации различных иммунных состояний у пациентов с сепсисом с целью обеспечения всесторонней характеристики иммунного ландшафта и минимизации риска пропуска каких-либо важных категорий. Кластеры 1, 2 и 4 представляют более высокие уровни иммунной активности, характеризующиеся относительно высоким количеством как лимфоцитов, так и нейтрофилов. Кластеры 3, 5, 6 и 9 отображают период иммунных колебаний, в течение которого популяции лимфоцитов уже подверглись подавлению, в то время как уровни нейтрофилов могут колебаться. Кластер 8 представляет собой состояние сниженной иммунной активности, которое может отражать либо иммуносупрессию, либо период восстановления иммунитета после разрешения инфекции. Кластер 7, вероятно, представляет собой небольшую долю пациентов, которые постепенно выздоравливают и демонстрируют признаки улучшения своего иммунного статуса.

Стоит отметить, что использование нескольких кластеров SOFM позволяет более детально представить различные иммунные состояния, наблюдаемые у пациентов с сепсисом. Этот подход направлен на охват всего спектра иммунных профилей и минимизацию вероятности пропуска каких-либо критических категорий. Тем не менее, благодаря практической валидации и дальнейшему анализу можно объединить кластеры, представляющие сходные иммунные состояния, оптимизируя схему классификации при сохранении ее полноты. Этот процесс уточнения гарантирует, что идентифицированные иммунные состояния являются как биологически значимыми, так и клинически значимыми, обеспечивая надежную основу для понимания сложной иммунной динамики при сепсисе.

На рисунке 3 показана траектория иммунных состояний типичного пациента с сепсисом, который испытал сложное течение иммунной дисрегуляции, прежде чем его состояние в конечном итоге улучшилось. Путешествие пациента началось в кластере 2, который представляет состояние повышенной иммунной активности, а затем прогрессировал через различные иммунные состояния, включая кластеры 5, 7, 9 и 8. Эти переходы отражают динамическое взаимодействие между иммунной системой пациента и вторгшимися патогенами с периодами колебаний и выраженной иммуносупрессии.

Примечательно, что оценка последовательной органной недостаточности (SOFA) пациента уже начала улучшаться, снизившись с исходного значения 7 до 2 до того, как пациент попал в кластер 7. Это говорит о том, что иммунная система пациента добилась значительного прогресса в избавлении от инфекции, и последующий переход к кластеру 7 может представлять собой период восстановления иммунитета, а не полного иммунного истощения.

После прохождения через кластер 8 иммунное состояние пациента постепенно прогрессировало в сторону кластера 7, что связано с более здоровым иммунным профилем. Эта фаза восстановления характеризовалась увеличением количества нейтрофилов и лимфоцитов, при этом значения приближались к тем, которые наблюдались у здоровых людей.

В клинической практике у пациентов обычно наблюдаются траектории иммунных колебаний, аналогичные типичной красной линии, показанной на рисунке 3. Когда траектория колеблется в кластерах 3, 5, 6 и 9, которые находятся далеко от центра здоровых образцов, состояние пациента ухудшается. Когда траектория пациента возвращается к кластерам 7 и 8, которые находятся ближе к центру здоровых образцов, состояние улучшается, а некоторые пациенты даже возвращаются к здоровому статусу. Кластеры 1, 2 и 4 обычно наблюдаются на ранних стадиях заболевания, характеризуются повышенной иммунной активностью. Эти модели переходов между состояниями обеспечивают иммунную перспективу для раннего распознавания и ведения течения заболевания при сепсисе. С точки зрения управления состоянием пациента очевидно, что по мере того, как пациенты имеют тенденцию к кластеру 6, их состояние ухудшается, в то время как прогрессирование к здоровому состоянию указывает на клиническое улучшение.

Этот протокол обеспечивает количественный подход к оценке иммунных состояний у пациентов с сепсисом с помощью математической модели и кластерного анализа, что позволяет как раннее распознавание сепсиса с помощью визуализации отчетливого иммунного состояния, так и точный мониторинг прогрессирования заболевания с помощью отслеживания иммунной траектории, что может служить руководством для принятия клинических решений и персонализированных стратегий лечения.

figure-results-8736
Рисунок 1: Трехмерная диаграмма рассеяния белых кровяных телец, лимфоцитов и нейтрофилов в образцах пациентов с сепсисом. На рисунке представлено пространственное распределение основных иммунных показателей у пациентов с сепсисом. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.

figure-results-9329
Рисунок 2: Различные иммунные состояния при сепсисе. Этот рисунок обеспечивает точную количественную оценку иммунных состояний при сепсисе в трехмерной плоскости, представленной формулой 1. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.

figure-results-9881
Рисунок 3: Визуализация траектории иммунного состояния пациента с сепсисом, проходящего клиническое улучшение. На рисунке показана траектория иммунных состояний типичного пациента с сепсисом, который испытал сложный ход иммунной дисрегуляции, прежде чем его состояние в конечном итоге улучшилось. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы просмотреть увеличенную версию этой цифры.

Обсуждение

В этом исследовании представлен подход к пониманию иммунного состояния при сепсисе с использованием передовых методов визуализации данных и машинного обучения. Раскрывая математическую взаимосвязь между ключевыми популяциями иммунных клеток и выявляя различные иммунные состояния, исследование дает новый взгляд на сложную иммунную динамику при сепсисе и способствует разработке более эффективных диагностических и терапевтическихстратегий. Основные результаты включают в себя открытие математической зависимости (раздел 3), ограничивающей эти популяции иммунных клеток в трехмерном пространстве (WBC = 1,098 × нейтрофилов + 1,046 × лимфоцитов + 0,1645) и идентификацию девяти различных иммунных состояний (раздел 4) с использованием карт самоорганизующихся признаков (SOFM). Эти результаты обеспечивают количественную основу для оценки иммунного статуса пациентов с сепсисом и предлагают потенциальный метод сортировки пациентов с ранним сепсисом13.

Это исследование, представленное здесь, сочетает в себе методы визуализации данных и машинного обучения для выявления скрытых закономерностей и взаимосвязей в многомерных иммунологических данных при сепсисе. Выходя за рамки традиционного одномерного и двумерного анализа, это исследование охватывает сложное взаимодействие между несколькими иммунными параметрами и обеспечивает более полное понимание иммунного ответа (различные кластеры на рисунке 2) при сепсисе. Идентификация различных иммунных состояний с помощью SOFM10 может заложить основу для будущих исследований персонализированных подходов к иммунотерапии, адаптированных к конкретным иммунным профилям отдельных пациентов.

Будущие исследования с еще более крупными и разнообразными когортами потребуются для дальнейшей проверки и уточнения представленных здесь результатов. Кроме того, взаимосвязь между идентифицированными иммунными состояниями и другими клинически значимыми биохимическими маркерами, такими как прокальцитонин (ПКТ), С-реактивный белок (СРБ) и интерлейкин-6 (ИЛ-6), еще предстоит глубоко изучить 14,15. Интеграция этих маркеров в анализ может обеспечить более полное понимание иммуновоспалительной реакции при сепсисе и ее связи с клиническими исходами, потенциально повышая прогностическую силу и клиническую полезность предложенного подхода. Кроме того, лонгитюдные исследования, которые отслеживают динамику иммунных состояний с течением времени у отдельных пациентов, могут дать ценную информацию о траектории сепсиса и помочь в разработке персонализированных стратегий лечения.

С одной стороны, метод трехмерной визуализации, представленный на рисунке 1 , демонстрирует поразительное различие между иммунными состояниями пациентов с сепсисом и здоровыми контрольными группами, обеспечивая новую количественную иммунологическую перспективу для быстрого раннего распознавания сепсиса. С другой стороны, обсуждение типичных иммунных траекторий пациента, показанное на рисунке 3 , представляет собой новый подход к управлению состоянием пациента, предлагая количественный метод мониторинга и управления прогрессированием заболевания.

Важность и потенциальное применение метода, предложенного в этом исследовании, выходят далеко за рамки конкретного контекста сепсиса. Возможность точной количественной оценки болезненных состояний с использованием подходов, основанных на данных, может стать сменой парадигмы в клинических исследованиях с глубокими последствиями дляперсонализированной медицины. Например, отслеживание иммунных состояний пациентов с сепсисом может обеспечить четкую оценку этапов борьбы пациента с инфекцией, что имеет решающее значение для оценки прогноза и улучшения планов лечения. Используя возможности визуализации данных и машинного обучения, исследователи могут открыть для себя новые идеи в области патофизиологии сложных заболеваний и разработать более целенаправленные диагностические и терапевтические стратегии17.

Основываясь на выводах этого исследования, можно предусмотреть несколько будущих направлений. Во-первых, увеличение размера выборки и разнообразия популяции пациентов с сепсисом будет иметь решающее значение для проверки и уточнения математической взаимосвязи и выявленных здесь иммунных состояний. Это потребует сотрудничества между несколькими центрами и создания стандартизированных протоколов для сбора и анализа данных. Во-вторых, изучение взаимосвязи между идентифицированными иммунными состояниями и другими биохимическими маркерами, такими как ПКТ, СРБ и IL-6, может обеспечить более полное понимание иммуновоспалительной реакции при сепсисе18. Кроме того, исследование сложных, нелинейных взаимосвязей между иммунными состояниями, дисфункцией органов (измеряемой по шкале SOFA) и маркерами тяжести инфекции может помочь пролить свет на различные пути, по которым разные пациенты прогрессируют от инфекции к органной недостаточности. Интегрируя эти показатели тяжести инфекции с нашим подходом к количественной оценке иммунного состояния, будущие исследования могут улучшить наше понимание моделей прогрессирования заболевания, что потенциально может привести к более точным и персонализированным стратегиям лечения, учитывающим как тяжесть инфекции, так и иммунный статус отдельных пациентов. Наконец, исследовательский подход, предложенный в этом исследовании, может быть распространен на другие медицинские сценарии, такие как аутоиммунные заболевания, рак и трансплантация, где точная количественная оценка болезненных состояний может иметь значительные клинические последствия.

В заключение, в этом исследовании представлен подход к пониманию иммунного состояния при сепсисе с использованием передовых методов визуализации данных и машинного обучения. Раскрывая математическую взаимосвязь между ключевыми популяциями иммунных клеток и определяя различные иммунные состояния, это исследование дает новый взгляд на сложное иммунное состояние при сепсисе. Ограничения исследования, такие как размер выборки и необходимость дальнейшего изучения взаимосвязи между иммунными состояниями и другими биохимическими маркерами, должны быть учтены в будущих исследованиях. Потенциальное применение метода в конкретных областях исследований, таких как персонализированная медицина, и будущие направления, включая увеличение размера выборки и распространение подхода на другие медицинские сценарии, подчеркивают важность и перспективность этого направления исследований.

Раскрытие информации

Программное обеспечение для вероятностных диаграмм рассеяния для иммунных состояний V1.0 разработано и принадлежит компании Beijing Intelligent Entropy Science & Technology Co., Ltd. Все права интеллектуальной собственности на это программное обеспечение принадлежат компании. Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.

Благодарности

Это исследование получило поддержку из двух источников: седьмого пакета проекта наследования мастера-ученика, организованного Национальным управлением традиционной китайской медицины Китая (номер проекта: [2021] No 272) и проекта по повышению исследовательского потенциала китайской медицины в области китайской медицины на 2024 год Больницы китайской медицины муниципального уровня (SZY-NLTL-2024-003) от Управления традиционной китайской медицины провинции Шэньси.

Материалы

NameCompanyCatalog NumberComments
MATLABMathWorks 2022BComputing and visualization 
Probabilistic Scatter Plots for Immune States Intelligent
 Entropy
Immune States V1.0Beijing Intelligent Entropy Science & Technology Co Ltd.
Modeling for CT/MRI fusion

Ссылки

  1. Jarczak, D., Kluge, S., Nierhaus, A. Sepsis-pathophysiology and therapeutic concepts. Front Med (Lausanne). 8, 628302 (2021).
  2. Cheung, G. Y. C., Bae, J. S., Otto, M. Pathogenicity and virulence of Staphylococcus aureus. Virulence. 12 (1), 547-569 (2021).
  3. Adelman, M. W., et al. The gut microbiome's role in the development, maintenance, and outcomes of sepsis. Crit Care. 24 (1), 278 (2020).
  4. Kumar, V. Pulmonary innate immune response determines the outcome of inflammation during pneumonia and sepsis-associated acute lung injury. Front Immunol. 11, 1722 (2020).
  5. Nakamori, Y., Park, E. J., Shimaoka, M. Immune deregulation in sepsis and septic shock: Reversing immune paralysis by targeting PD-1/PD-L1 pathway. Front Immunol. 11, 624279 (2021).
  6. Van der Poll, T., Shankar-Hari, M., Wiersinga, W. J. The immunology of sepsis. Immunity. 54 (11), 2450-2464 (2021).
  7. Chaturvedi, V., et al. T-cell activation profiles distinguish hemophagocytic lymphohistiocytosis and early sepsis. Blood. 137 (17), 2337-2346 (2021).
  8. Reyes, M., et al. An immune-cell signature of bacterial sepsis. Nat Med. 26 (3), 333-340 (2020).
  9. Pant, A., Mackraj, I., Govender, T. Advances in sepsis diagnosis and management: a paradigm shift towards nanotechnology. J Biomed Sci. 28 (1), 6 (2021).
  10. Kohonen, T. Essentials of the self-organizing map. Neural Netw. 37, 52-65 (2013).
  11. Yang, X., et al. The role of type 1 interferons in coagulation induced by gram-negative bacteria. Blood. 135 (14), 1087-1100 (2020).
  12. Zhang, Y. Y., Ning, B. T. Signaling pathways and intervention therapies in sepsis. Signal Transduct Target Ther. 6 (1), 407 (2021).
  13. Baghela, A., et al. Predicting sepsis severity at first clinical presentation: The role of endotypes and mechanistic signatures. EBioMedicine. 75, 103776 (2022).
  14. Yao, R. Q., et al. Publication trends of research on sepsis and host immune response during 1999-2019: A 20-year bibliometric analysis. Int J Biol Sci. 16 (1), 27-37 (2020).
  15. Owen, A. M., et al. TLR agonists as mediators of trained immunity: Mechanistic insight and immunotherapeutic potential to combat infection. Front Immunol. 11, 622614 (2021).
  16. Jung, E., et al. The fetal inflammatory response syndrome: the origins of a concept, pathophysiology, diagnosis, and obstetrical implications. Semin Fetal Neonatal Med. 25 (4), 101146 (2020).
  17. Bruno, M., et al. Transcriptional and functional insights into the host immune response against the emerging fungal pathogen Candida auris. Nat Microbiol. 5 (12), 1516-1531 (2020).
  18. Barichello, T., et al. Biomarkers for sepsis: more than just fever and leukocytosis-a narrative review. Crit Care. 26 (1), 14 (2022).

Перепечатки и разрешения

Запросить разрешение на использование текста или рисунков этого JoVE статьи

Запросить разрешение

Смотреть дополнительные статьи

216SOFMRMSE

This article has been published

Video Coming Soon

JoVE Logo

Исследования

Образование

О JoVE

Авторские права © 2025 MyJoVE Corporation. Все права защищены