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선물이 thioether/비닐의 건설에 대 한 프로토콜 황화 닿는 헬리컬 펩 티 드 사진 유도 thiol-ene/thiol-yne hydrothiolation를 사용 하 여.
여기, 우리-수 지 intramolecular/intermolecular thiol-ene hydrothiolation를 사용 하 여 thioether-곁에 펩 티 드의 준비에 대 한 상세한 프로토콜을 설명 합니다. 또한,이 프로토콜 난, 난 + 4 개의 위치에 알 켄/alkyne 사이드 체인을 소유 하는 amino acids 및 시스테인 잔류물 사이 솔루션 intramolecular thiol-yne hydrothiolation를 사용 하 여 비닐 황화 닿는 펩 티 드의 준비를 설명 합니다. 선형 펩 티 드 표준 Fmoc 기반 단단한 단계 펩 티 드 합성 (SPPS)을 사용 하 여 합성 했다. Thiol 한 hydrothiolation는 intramolecular thio-ene 반응 또는 펩 티 드의 길이 따라 intermolecular thio-ene 반응 중 하나를 사용 하 여 실시 됩니다. 이 연구에서 intramolecular thio-ene 반응 수 지에 따라 선형 펩 티 드의 완전 한 합성 시스테인 잔류물의 trityl 그룹의 deprotection를 사용 하 여 짧은 펩 티 드의 경우 수행 됩니다. 수 지 photoinitiator 4 methoxyacetophenone (지도) 및 2-hydroxy-1-[4-(2-hydroxyethoxy)-phenyl]-2-methyl-1-propanone (MMP)를 사용 하 여 UV 방사선을 설정 합니다. Intermolecular thiol-ene 반응 Fmoc Cys 오 N, N-dimethylformamide (DMF) 용 매에 용 해 하 여 수행 됩니다. 이 다음 수 지를 켄 베어링 잔류물을 사용 하 여 펩 티 드와 함께 반응. 그 후에, macrolactamization는 활성화 시 약 지에로 benzotriazole-1-yl-oxytripyrrolidinophosphonium hexafluorophosphate (PyBop), 1-hydroxybenzotriazole (HoBt), 및 4-Methylmorpholine (NMM)를 사용 하 여 밖으로 수행 됩니다. Macrolactamization, 다음 펩 티 드 종합은 계속 표준 SPPS를 사용 하 여. Thio-yne hydrothiolation의 경우 선형 펩 티 드 수 지에서 죽 습, 건조, 이며 이후 degassed DMF에 녹아. 이것은 다음 photoinitiator 2, 2-dimethoxy-2-phenylacetophenone (DMPA)와 UV 빛을 사용 하 여 반구. 반응에 따라 DMF 증발 하 고 원유 찌 꺼 기 침전은 고성능 액체 크로마토그래피 (HPLC)를 사용 하 여 정화. 이러한 방법은 수 세대 thioether 곁 순환 펩 티 드의 우수한 기능 그룹 허용 및 좋은 수확량을가지고 thio-ene 또는 yne 클릭 화학의 사용을 단순화 하기 위해 작동 합니다. 펩 티 드로 thioether의 소개의 시스테인 잔류물 및 자연의를 이황화 채권 기준으로 redox 불활성 이다.
단백질 단백질 상호 작용 (PPIs)를 변조 하는 ligands의 개발 현대 약물 발견에 대 한 매력적인 접근을 제공 합니다. 따라서, 많은 노력은 PPIs1,2,3변조 효율적으로 수 공부 소설 화학 형식으로 투자 되었다. PPIs는 일반적으로 얕은 크거나 단종 상호 작용 표면, 구성 하 고 작은 분자 PPIs4,5의 변조에 대 한 부적 절 한 ligands로 일반적으로 간주 됩니다. 적당 한 노출 상호 작용 표면 면적, 짧은 펩 티 드 단백질 인터페이스의 구조 기능을 모방 하는이 문제가6,7를 해결 하기 위해 이상적인 후보자를 나타냅니다. 그러나, 짧은 펩 티 드 일반적으로 수성 솔루션에 구조화 된 되지 않습니다. 이 물 분자의 펩 티 드 등뼈 및 잘 정의 된 conformations intramolecular 수소 결합 네트워크와 경쟁 하는 물8entropically 유리한는 사실 때문입니다. 또한, 펩 티 드의 본질적으로 낮은 안정성 및 세포 침투성 속성 주로 생물 학적 응용9,10에 그들의 사용을 제한. 단백질 데이터 은행 (PDB) 분석 > 짧은 α-나선 상호 작용11를 포함 하는 PPIs의 50%. 따라서, 다른 화학 방법 나선 안정화에 관한 개발 되었습니다. 이들은 이황화/thioether 유대 형성12,,1314, 반지-닫는 metathesis15, 락탐 반지 형성16를 포함, 화학17의 추가 "클릭" perfluoroarenes18,19, 그리고 비닐 황화 대형20.
안정된 헬리컬 펩 티 드 널리 p53, 등 다양 한 세포내 목표에 대 한 활용은 에스트로겐 수용 체, Ras, bcl-2 가족 단백질, 그리고 다른 사람21,22,,2324. ALRN-6924, 모든 탄화수소 MDM2 및 MDMX의 펩 티 드 이중 억제제를 붙인, 임상 조사25현재 사용 되 고. 지난 몇 년 동안, 우리의 그룹은 thiol ene와 thiol-yne 반응26,,2728를 사용 하 여 새로운 펩 티 드 안정화 방법의 개발에 집중 했다. 일반적으로, 우리는 자연스럽 게 풍부한 시스테인 사용 되 면 이러한 사진 시작 반응 온화한 조건 하에서 효율적인는 증명 하고있다. 또한, 우리가 이러한 반응 우수한 기능 그룹 허용 바이오 직교 고 펩 티 드 및 단백질 수정29적용할 수 입증 되었습니다 나타났습니다. 결과 thioether/비닐 황화 곁에 펩 티 드 크게 제약 펩 티 드의 화학 공간을 개선 정한 밧줄에 수정 센터를 제공 하 고 수많은 생물 학적 응용 프로그램30 사용에 대 한 적용할 수 입증 ,3132. 날짜 하려면, 제한 된 보고서만 thiol-ene/thiol-yne 펩 티 드 cyclization에 관한 설명 했습니다. 2009 년 Anseth 그 외 여러분 에 의해 출판, 연구에는 수 지에 intramolecular thiol-ene 시스테인과 활성화 된 알 켄 사이 펩 티 드 cyclization에 대 한 반응은 시연된33. 2015 년에 chou의 외. 2 구성 요소 급진 시작된 thiol-ene 반응34 와 후속, 순차 thiol-yne/한 커플링 반응35스테이플링 펩 티 드에 대 한 설명. 최근에, 우리는 thioether/비닐 황화 곁에 펩 티 드20,,2627에 따라 작품의 시리즈 설명. 이 프로토콜에는 광범위 한 연구 공동체에 대 한 도움이 될 것입니다 희망에서 위에서 언급 한 thioether/비닐 황화 곁에 펩 티 드의 상세한 종합을 설명 합니다.
1. 장비 준비
2. 수 지 준비
참고: 일반적으로, 펩 티 드 기판의 건설 수행 됩니다 Fmoc 기반 단단한 단계 펩 티 드 합성 프로토콜을 사용 하 여. 이 C 터미널 아 미드 나머지 다음 펩 티 드 분열을 그대로 링크 아 미드 수 지를 사용 하 여 실시 됩니다. 이 프로토콜은 종이 걸쳐 사용 됩니다.
주의: N, N-dimethylformamide (DMF), dichloromethane (DCM), 4-methylmorpholine (NMM), 및 N, N-diisoproylethylamine (DIPEA)은 유독 하 고 유해한 흡입, 섭취, 또는 피부 접촉에 의해. Diethyl 에테르 가연성 이다입니다. Trifluoroacetic 산 (TFA) 부식성입니다. 1, 2-ethanedithiol (EDT)는 매우 악취를 풍기. 따라서, 모든 유기 용 제, 화학 물질, 적절 한 개인 보호 장비 (니트 릴 장갑, 실험실 외 투, 및 보호 안경) 처리와 있어야 화학 증기 두건 내부 처리 합니다.
3. N-터미널 Fmoc Deprotection 및 세척
4. Fmoc 보호 아미노산 커플링
5. thiol-ene Hydrothiolation 및 Thiol-yne Cyclization
펩 티 드 Ac YmS5AAAC NH2 와 그 cyclized 제품 Ac-Y-(쿠-1, 5)-[mS5AAAC]-의 HPLC 및 MS 스펙트럼 NH2 수 지에 intramolecular thiol-ene photoreaction를 사용 하 여 생성 된 그림에에서 묘사 6B. 주기적인 펩 티 드의 선형 전조를 기준으로 동일한 분자량을 발견. 그러나, HPLC 보존 시간이 약 2 분 같은 분리 조건 하에서 그것의 선구자 보다 이전 수 관찰 되었다. 서로 다른 시퀀스와 짧은 펩 티 드 모두 관찰 되었다 좋은 변환 해야 그림 6 c에서처럼.
그림 7B, thio-yne photoreaction 조건에 대 한 심사 과정은 묘사 그리고 이성질체 변환 및 비율 역 상 HPLC의 통합을 사용 하 여 결정 했다. 펩 티 드 2 c의 추적 수준만 UV 조사에 따라 관찰 했다. 이것은 가능성이 20 조화로 macrocycle에 계약 단계 동안 thiyl N-말단에 급진적인의 트래핑에 대 한 구조적 환경 때문 이다. 펩 티 드 1a 및 1b는 8 회원 비닐 황화 crosslink와 2 개의 성체 생성을 발견 했다. 펩 티 드 1a에서 생성 된 펩 티 드 2a-A와 2a-B, 전시 뿐만 아니라 다른 비율 (0-30 분) 시간 다른 UV 방사선에 대 한 뚜렷한 보존 시간 (그림 ℃). 이 때문에 1H NMR 분광학 (그림 7D)에 이중 결합 양성자 신호 E/Z이 성체로 할당 되었다. 펩 티 드 2d-2 층의 경우 Z 이성질체는 지배적인 제품 발견 됐다. 이것은 8-회원 비닐 황화 crosslink 상대적인 조밀한 구조의 건설 기간 동안 구조적 기본 설정으로 인해. 펩 티 드 2a-A/B 및 2b-A/B는 8 회원 비닐 황화 crosslink 펩 티 드 하는 동안 무작위 코일 전시 그림 7E, 원형이 색 성 (CD) 스펙트럼에 따라 같이 7-회원 비닐을가지고 2d 황화 crosslink 전시는 나선형 구조입니다. 요약, 비닐 황화 본드의 Z 이성질체 우선적으로 형성을 발견 하 고 더 나은 나선 유도 표시 합니다.
그림 1: 단단한 단계 펩 티 드 종합을 위한 수동 펩 티 드 합성 장치. 열 3 방향 stopcocks 통해 진공 매니폴드에 배치 했다 그리고 기구는 버블링에 대 한 질소 또는 아르곤 가스 라인에 연결 되었다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
그림 2: 사용 하는 photoreactions 대 photoreactor 장치. 장치는 photoreactor 이전에 photoreactions 동안 아르곤 가스로 가득 차 있었다 되도록 UV 방사선 및 아르곤 가스 탱크 10 350 nm 램프 (테이블의 재료)로 갖춰 졌다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
그림 3: 수 지 짧은 펩 티 드의 경우 intramolecular thiol-ene 반응. 이 반응 시스테인 잔류물 선형 펩 티 드의 완전 한 합성에 따라 trityl 그룹의 수 지에 deprotection를 사용 하 여 실행 하 고 지도 및 MMP photoinitiators를 사용 하 여 UV 방사선을 수 지를 설정 했다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
그림 4: 수 지 intermolecular thio-ene 반응. 이 반응은 Fmoc Cys 오 DMF 용 매에 용 해 하 여 실시 되었고 수 지, macrolactamization PyBop, 이지만, 그리고 NMM 활성화 시 약으로 사용 하 여 뒤에 켄 베어링 펩 티 드 잔류물과 반구. 펩 티 드 합성 계속 되었다 다음 표준 SPPS를 사용 하 여. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
그림 5: 솔루션 단계에서 Intramolecular thiol-yne 반응. 이 반응은 다음 선형 펩 티 드, 후 선형 펩타이드 degassed DMF에 녹 았다와 UV 빛을 사용 하 여 photoinitiator DMPA와 반구의 완전 한 합성 솔루션 단계에서 실행 되었다. 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
그림 6: Thioether 곁에 사용 하는 수 지에 intramolecular thiol-ene 반응 생성 주기적인 펩 티 드. A.이 패널 수 지에 intramolecular thio-ene 반응의 체계를 보여줍니다. mS5: "m" 모노 대체 olenic 아미노산, "S" S 구성 아미노산 나타냅니다 나타내고 "5" 사이드 체인 원자38의 수를 나타냅니다. B.이 패널 펩타이드 Ac YmS5AAAC NH2 이전 및 그것의 cyclization 다음의 HPLC 및 MS 스펙트럼을 보여줍니다. C.이 패널 표시 다른 시퀀스와 주기적인 펩 티 드의 변환. 이 그림에서 자오, B. 외.28 수정 되었습니다 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
그림 7: 펩 티 드 사진 유도 thiol-yne hydrothiolation 통해 스테이플링. A.이 intramolecular thiol-yne hydrothiolation의 도식 적인 그림 이다. B.이 패널이이 연구에서 평가 된 펩 티 드 순서를 보여 줍니다. 초기자: (I) 0.5 식 DMPA, 1 h; (II) 초기자, 1 h; (III) 0.5 식 DMPA, 0.5 식 지도, 1 h; (IV) 0.5 식 MMP, 0.5 h. C. 이 패널 다른 UV 조사 시간으로 펩 티 드 1a의 반응 혼합물의 HPLC 흔적을 보여줍니다 그리고 220에서 모니터링 nm. D.이 패널 표시 1H NMR 스펙트럼의 1a, 2a-A와 2a-B (DMSO-d6 400mhz에서 측정). 별표는 UV 조사에 따라 비닐 황 이중 결합의 형성을 나타냅니다. E.이 패널 비닐 황화 상호 링크와 펩 티 드의 원형이 색 성 스펙트럼을 보여줍니다. 이 천, 영 외 에서 수정 되었습니다. 44 이 그림의 더 큰 버전을 보려면 여기를 클릭 하십시오.
재료 | MW | N(0.5mmol / g 수 지 × 0. 0 5 g × 5eq.) | M(아미노산) (mg) |
(다) | (mmol) | ||
Fmoc-Gly-오 | 297 | 0.125 | 37.1 |
Fmoc-크 람-오 | 331 | 0.125 | 41.4 |
Fmoc-발-오 | 339 | 0.125 | 42.4 |
Fmoc 레이 오 | 353 | 0.125 | 44.1 |
Fmoc-일-오 | 353 | 0.125 | 44.1 |
Fmoc-프로-오 | 337 | 0.125 | 42.1 |
Fmoc 페 오 | 387 | 0.125 | 48.4 |
Fmoc Tyr (tBu)-오 | 460 | 0.125 | 57.5 |
Fmoc Trp (Boc)-오 | 527 | 0.125 | 65.9 |
Fmoc Ser (tBu)-오 | 384 | 0.125 | 48 |
Fmoc-목 (tBu)-오 | 398 | 0.125 | 49.8 |
Fmoc Cys (Trt)-오 | 586 | 0.125 | 73.3 |
Fmoc 만났다 오 | 372 | 0.125 | 46.5 |
Fmoc Asn (Trt)-오 | 597 | 0.125 | 74.6 |
Fmoc Gln (Trt)-오 | 611 | 0.125 | 76.4 |
Fmoc-Asp (OtBu)-오 | 412 | 0.125 | 51.5 |
Fmoc Glu (OtBu)-오 | 426 | 0.125 | 53.3 |
Fmoc 리스 (Boc)-오 | 469 | 0.125 | 58.6 |
Fmoc Arg (Pbf)-오 | 617 | 0.125 | 77.1 |
Fmoc-그의 (Trt)-오 | 620 | 0.125 | 77.5 |
HCTU | 414 | 0.122 | 50.5 |
DIPEA | 129 | 0.25 | 43.5(ΜL) |
DMF | 0.5 mL |
표 1: 커플링 조건의 금액.
열 | Zorbax SB-Aq 열, 4.6 × 250 mm (기 공 크기 80 Å, 입자 크기 5 μ m) |
용 매 | A: 물, 0.1% (vol/vol) TFA; B: 이기 |
흐름 율 | 1 mL/min |
그라데이션 | 20-70% (vol/vol) B 25 분 이상; 70%-98% 이상 5 분; 98% 이상 5 분; |
사출 볼륨 | 30-500 Μ |
파장 (nm) | 280 (Fmoc-, Trp-또는 Tyr-포함 펩 티 드)에 대 한 또는 494 (FITC 표시 된 펩 티 드) 또는 220 (다른 사람)에 대 한 |
표 2: 고성능 액체 크로마토그래피 조건.
그림 3에 설명 된 수 지에 intramolecular thio-ene cyclization trityl 그룹의 시스테인 잔류물의 제거 이후 photoreaction에 대 한 중요 한 단계가 될 발견 되었습니다. 또한, 이전에 펩 티 드 분자 무게와 반응으로 동일한 것으로 밝혀졌다 다음 그림 6B에 그려져 있습니다. 따라서, HPLC id 또는 DTNB 분석 결과 사용 하 여 반응을 모니터 하기 위해 필요 합니다. Intermolecular thio-ene 반응 그림 4에 설명 된 경우 MS 모니터링은 필요 합니다. 락탐 커플링의 추가 단계 thioether 밧줄의 건설에 대 한 필요를 발견 하는 동안이 프로토콜 긴 펩 티 드에 대 한 전반적으로 높은 효율성을 달성 하기 위하여 사용 될 것 이라고 하는 것이 좋습니다.
비닐 황화 본드 thio-yne photoreaction에 의해 생성 된 수 지 절단에 사용 되는 강산 TFA 솔루션에서 안정 됐다. 따라서, 솔루션 단계에서 thio-yne photoreaction 사용 하 여 채택 되었다. 이 반응은 잠재적인 intermolecular 의해-반응을 방지 하기 위해 낮은 농도 (0.5 m m)에 희석 되었다. 그것은 또한 용 매는 photoreactions 동안 제품 산화를 피하기 위하여 드도 중요입니다. 다음 반응, 유기 용 제 DMF의 진공 증발 한다 또한 신중 하 게 실시 펩 티 드 산화/저하 또는 기계 감가 방지 하기 위하여. 그림 5 에 묘사 된 thio-yne cyclization 반응 후 펩타이드 합성 수정35에 대 한 메커니즘을 제공 합니다.
Intramolecular thiol-ene 반응 좋은 변환 thioether 곁에 펩 티 드를 성공적으로 생성 하는 동안 원하는 나선형 구조에는 펩 티 드를 제한 하는 간단한 thioether 상호 연결 하지 못했습니다. 이 밧줄에 수정 전략을 바탕으로, 밧줄에 카이 랄 센터 유도 펩타이드 helicity 개념 개발 되었다, γ는 펩 티 드에 R 구성 그룹 대체 어디 C 터미널 펩 티 드의 나선형 구조 ( 유도 수 그림 4)39,40. 이 이렇게와 관련 된 제한 (α (S), γ(R)),41422 개의 카이 랄 센터와 enantiomerically 순수 부자연 스러운 아미노산의 합성입니다.
이 연구 에서처럼 그림 7Ethio-yne 반응 좋은 변환, 나선형 구조에 펩 티 드를 제한할 수 있습니다 설명 했다. 헬리컬 펩 티 드의 건설에서 thio-yne photoreaction을 헬리컬 펩 티 드의 건설 하는 것이 좋습니다. 수 지에 intramolecular thio-ene cyclization 긴 펩 티 드 너무 효과적인 cyclization를 위해 유연한 경우에 짧은 thioether 밧줄 펩 티 드 (이 하 15)의 건설에 적합 하도록 시연 했다. 또한, 수 지에 intermolecular thio-ene cyclization는 긴 펩 티 드 cyclization 권장 하 고 있습니다.
요약 하자면, 우리는 photoinduced thio-ene/thio-yne 클릭 화학의 사용을 통해 thioether/비닐 황화 곁에 펩 티 드의 건설에 대 한 화학 프로토콜의 시리즈를 개발 했습니다. 반응이 효율적 금속 촉매 무료, 편리한 조작, 그리고 우수한 기능 그룹 허용 오차를가지고 시연 및 바이오 직교 되었습니다. 또한,이 메서드는 β-머리 핀43,44같은 다른 펩 티 드 2 차 구조를 안정화 하기 위해 개발 되었다. 이 종이 thioether 밧줄 traceless 수정 사이트를 제공 합니다 보여줍니다. 이 주로 펩 티 드 합성 수정 다음 화학 공간을 확장 합니다. 또한,는 지방 족 thioether/비닐 황화 곁에 펩 티 드 탄화수소 주식 펩 티 드에 상대적인 감소 막 독성을 전시 하 고 시연된 좋은 bioactivity와 다양 한 생물 학적 응용 프로그램에 적용 되 고 bioavailability45,46
저자는 공개 없다.
저자 인정 (제 21372023, 21778009 및 81701818); 중국 보조금의 자연 과학 재단에서 재정 지원 과학과 기술 (No. 2015DFA31590); 중화 인민 공화국의 심천 과학 및 기술 혁신 위원회 (제 JCYJ20170412150719814, JCYJ20170412150609690, JCYJ20150403101146313, JCYJ20160301111338144, JCYJ20160331115853521, JSGG20160301095829250, 및 GJHS20170310093122365); 그리고 중국 박사 후 과학 재단 (No. 2017 M 610704).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Rink Amide MBHA resin(0.53 mmol/g) | HECHENG | GRM50407 | |
Standard Fmoc-protected amino acids | GL Biochem (Shanghai) Ltd. | ||
N-Methyl-2-pyrrolidinone | Shenzhen endi Biotechnology Co.Ltd. | 3230 | skin harmful |
N,N-Dimethyl formamide | Energy | B020051 | skin harmful |
Dichloromethane | Energy | W330229 | skin harmful |
N,N-Diisoproylethylamine | Aldrich | 9578 | irritant |
Trifluoroacetic acid | J&K | 101398 | corrosive |
Triisopropylsilane | J&K | 973821 | |
1,2-Ethanedithiol | J&K | 248897 | Stench |
2-(6-Chloro-1H-benzotriazole-1-yl)-1,1,3,3-tetramethylaminium hexafluorophosphate | GL Biochem (Shanghai) Ltd. | 851012 | |
Morpholine | Aldrich | M109062 | irritant |
Diethyl ether | Aldrich | 673811 | flammable |
Acetonitrile | Aldrich | 9758 | toxicity |
Methanol | Aldrich | 9758 | toxicity |
2-hydroxy-1-[4-(2-hydroxyethoxy)-phenyl]-2-methyl-1-propanone | Energy | A050035 | |
4-methoxyacetophenone | Energy | A050098 | |
2,2-dimethoxy-2-phenylacetophenone | Energy | D070132 | |
5,5'-Dithiobis-(2-nitrobenzoic acid) | J&K | 281281 | |
Benzotriazole-1-yl-oxytripyrrolidinophosphonium hexafluorophosphate | Energy | E020172 | |
1-Hydroxybenzotriazole | Energy | D050256 | |
4-Methylmorpholine | Energy | W320038 | |
High Performance Liquid Chromatography | SHIMADZU | LC-30AD | |
Electrospray Ionization Mass | SHIMADZU | LCMS-8030 | |
Lyophilizer | Labconco | FreeZone | |
SpeedVac concentration system | Thermo | Savant | |
vacuum manifold | promega | A7231 | |
three-way stopcocks | Bio-Rad | 7328107 | |
poly-prep chromatography columns | Bio-Rad | 7311550 |
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