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嗅覚受容体活性化パターンは、臭気の同一性をコードするが、哺乳類の嗅覚受容体に対する臭気物質リガンドを同定公表されたデータの欠如は臭気符号化の総合的なモデルの開発を妨げる。このプロトコルは、嗅覚受容体リガンドおよび受容体活性化の定量化のハイスループット同定を容易にする方法が記載されている。
匂い物質は、約千マウスおよび400人の受容体ファミリーは、匂い物質の数千人を認識できるように、嗅覚受容体活性化のユニークで重複パターンを作成します。臭気物質リガンドは、ヒト受容体1から11未満の6%について公表されています。データの欠如は、機能的に異種系でこれらの受容体を発現する困難さに起因する。ここでは、ルシフェラーゼレポーターアッセイを使用して、嗅覚受容体活性化のハイスループット評価に続いHana3A細胞における嗅覚受容体ファミリーの大部分を発現させる方法を記載している。このアッセイは、嗅覚受容体のパネルに対する臭気物質の(1)スクリーンパネルに使用することができ; (2)用量反応曲線を経由して匂い物質/受容体相互作用を確認。および(3)受容体変異体のうち、受容体活性化のレベルを比較する。サンプル·データでは、328嗅覚受容体は、臭気物質26に対してスクリーニングした。様々な応答スコアが匂い物質/受容体ペアは選択範囲だったテッドと用量反応でテスト。これらのデータは、画面が用量反応実験に合格する匂い物質/受容体ペアを濃縮するための効果的な方法、匂い物質に対する善意の応答を持っているすなわち受容体であることを示している。したがって、このハイスループットルシフェラーゼアッセイは、哺乳類の嗅覚系における臭気符号化のモデルへ嗅覚受容体に必須な工程を特徴付けるための効果的な方法である。
哺乳類の嗅覚系は、匂い物質の何千もの検出および識別を可能にし、臭気刺激の膨大な数に応答する能力を持っています。嗅覚受容体(ORS)は、嗅上皮12内の嗅細胞によって発現される分子センサーである。哺乳類の匂い認識は匂い物質によるORの差動活性化を介して発生し、または遺伝子ファミリーは、およそ千マウスおよび400ヒト受容体12月16日に、広範囲に及ぶ。嗅覚ニューロンにおける異種細胞でのORの前の機能解析は、さまざまな匂い物質がユニークで認識されていることを示しますが、論理和10,17-20のアンサンブルを重ねてきた。論理和にリガンドを一致させることは嗅覚コードと嗅覚の生のモデルを構築するための不可欠なを理解するために重要です。により、異種システムでの論理和だけでなく、匂い物質と論理和の両方の多数を表現する難しさに、このデータは、Fからのほとんど存在しているield;確かに、人間の論理和未満の6%は、公表リガンド1月11日を持っている。このプロトコルは、付臭剤/ ORの相互作用を特徴づけるルシフェラーゼアッセイの使用が記載されている。このアッセイは、ORのハイスループット特性評価、匂い物質/ ORの相互作用を理解するだけでなく、臭い符号化のモデルを開発するために不可欠であるタスクを可能にします。
ORのハイスループット研究は、三つの主要な課題に直面している。まず、オッズ比は、ERに保持され、その後、プロテアソーム21,22で分解、アッセイ系23〜25内の臭気物質と相互作用するのORを防止し、異種細胞で発現。この問題は、論理和19,26,27の広範囲の安定な細胞表面発現を容易にするアクセサリータンパク質の発見によって対処した。受容体-トランスポータータンパク質1および2(RTP1および2)を促進OR刺激臭剤19に応答して細胞表面発現および活性化。この研究に基づいて、HEK293T細胞であった安定にHana3A細胞株19,27、その結果、長いRTP1(RTP1L)およびRTP2、受容体発現促進タンパク質1、およびGのαolfを発現するように改変された。また、タイプ3ムスカリン性アセチルコリン受容体(M3-R)は、細胞表面での論理和と相互作用し、臭気物質26に反応して活性化を増強する。堅牢でのHana3A細胞の結果にRTP1SとのORとM3-Rの同時トランスフェクション、一貫性があり、細胞表面27でのORの広い範囲の機能的発現。第二に、哺乳類又はレパートリーは非常に大きいです。ヒトでは、例えば、和レパートリーは味覚受容体のレパートリーを超える数々の桁であり、視覚的な受容体のレパートリーを超える数々の2桁。比較的簡単なプロトコルで、単一またはあるのクローンを作成するが、有意なアップフロントの努力は、包括的なライブラリを生成する必要がある。我々は幻の中で、波長は色に変換されることを知っているが、第3、第オーディション周波数がピッチに変換で、臭気の組織はあまりそれが困難な研究者が、臭気物質の代表的なサンプルから補間できるようにすること、理解されている。いくつかの進歩がこのフロント10,28について説明したが、嗅覚風景のマップが不完全なままになります。 ORの数百万の分子に対して、数千の物をスクリーニングすることは困難な作業です。このドメイン内のハイスループットスクリーニングは、慎重に定義のキャンペーンを必要とする。主要な残された課題は、物流とコストではなく、技術に固有の問題点のものです。異種スクリーニングが広く学術基によってリガンドを同定するために使用されていないが、民間企業が100ヒト論理和29に対するリガンドを同定するために同じ技術を使用した。残念ながら、これらのデータは、独自のまま。
ここで概説するハイスループットルシフェラーゼアッセイは、評価OR活性化するために使用される代替方法を超えるいくつかの利点を有する。責任もののネイティブ嗅細胞のSESは電気生理学およびカルシウムイメージングを用いて測定された、これらの技術は、困難なため、嗅覚ニューロンの応答特性の重複にニューロンの応答につながるまたは離れてからかっています。 、GFP標識受容体タイプ30,31にノック32,33嗅覚ニューロンをネズミアデノ経由で特定の受容体を提供するか、17,24,33は単一の受容体の種類に録音をリンクすることができます録音した後、RT-PCRを行うこと、これらの方法ではあるが低スループットと大規模スクリーニングには適していません。異種スクリーニングシステムは、よりスケーラブルであり、2つの主要な形態は、文献で発見されています。cAMP経路の記者やイノシトール三リン酸(IP3)経路の記者。匂い刺激すると、オッズ比は、サイクリックAMP(cAMP)の12の産生をもたらすシグナル伝達カスケードのGαolf伝達を活性化する。交流の制御下にホタルルシフェラーゼレポーター遺伝子を共トランスフェクトすることによりAMP応答エレメント(CRE)、ルシフェラーゼ産生の定量化は、OR活性化を可能にする、匂い応答の関数として測定することができる。または活性化はまた、Gα15/16またはGのα15-OLFキメラ24,25,34などのGタンパク質を共発現によりIP3経路にリンクすることができます。我々は3つの要因に基づいてここで紹介するアッセイを選択している:(1)Rhoのタグを付けた嗅覚受容体とRTP1の共発現は、細胞表面19,27の嗅覚受容体の発現が向上します。 (2)のcAMP応答性レポーター遺伝子の使用は、測定OR標準的なセカンドメッセンジャー経路を介した活性化を可能にする;および(3)アッセイは、ハイスループットスクリーニングに適している。
このハイスループットルシフェラーゼアッセイは、嗅覚の分野に貴重な様々な研究にも適用可能である。まず、論理和をとり、多数の種のための受容体活性化パターンを決定するために、単一臭気物質に対してスクリーニングすることができるecific匂い物質。このタイプの研究は、またはステロイド嗅覚アンドロステ8への対応を担当するようにOR7D4を同定した。逆に、あるORは、受容体応答プロファイル10を決定するために、臭気物質のパネルに対してスクリーニングすることができる。候補嗅覚着臭剤/ OR対は、これらの画面を介して確認された場合、相互作用は、臭気物質の濃度の増加にORの応答を検査する用量反応実験を行うことによって確認することができる。用量応答曲線はまた、進化の種および因果的突然変異を横切る受容体の進化の検査を可能にする、ORの変動は、インビトロ臭剤応答8,9,11,35 に影響し、これらの研究は種間OR変動に拡張することができる方法を評価することができる遺伝36,37は 、最終的に、このアッセイは、既知の着臭剤/受容体対38,39のために拮抗OR特定の臭気物質に応答することができる匂いのアンタゴニストをスクリーニングするために使用することができる。要約すると、これは、高スループットルシフェラーゼアッセイを特徴付ける助けるOR活性化パターン及び嗅覚系における臭気符号化のより良い理解を提供する研究の範囲に適用可能である。
1。Hana3A細胞の培養に
2。トランスフェクションのために細胞をプレーティング
嗅覚受容体の3。トランスフェクション
プラスミドミックス | ||
ウェルあたり | 96ウェルプレート当たり | |
MEM | - | 500μL |
RTP1S-PCI | 5 NG | 480 NG |
M3-R-PCI | 2.5 ngの | 240 NG |
のpCRE-LUC | 10 NG | 960 NG |
たpSV40-RL | 5 NG | 480 NG |
複雑な | ||
ウェルあたり | ウェルあたり+10% | |
プラスミドミックス | 4.2μL | 4.58μL |
ρ-OR-PCI | 0.05 NG | 0.06 NG |
脂質トランスフェクションミックス | 4.2μL | 4.58μL |
M10 | 41.7μL | 45.83μL |
4。臭気刺激
ルシフェラーゼアッセイを経由して5。測定又は活動
6。データ解析
一次スクリーニングでは、100μMの濃度で26悪臭に対して328 ORをテストしました。この臭気濃度を効果的に既知のリガンド10との論理和の大部分を活性化することが実証されている。まず、正規化されたルシフェラーゼ活性はウミシイタケルシフェラーゼ読み取りによってホタルルシフェラーゼ読み取りを割ることによって計算した。次に、ベースライン値は、各ウェル( 図1)の正規化されたルシフェラーゼの読み取り値から無臭気制御のための正規化されたルシフェラーゼの読み取り値を差し引くことによって計算した。用量応答曲線は48臭剤に対して行わ/ OR対がランダムにベースライン値の範囲にわたって分布した、 図1の有色の棒で示すように論理和が1 mMの1nMのスパニング臭剤の7つの濃度で処理し、得られた応答は、適合させた非線形回帰を使用して、S字曲線に。それは3つの基準を満たした場合に、付臭剤/ ORは、アゴニストと考えられた。(1)標準エラーのlogEC 50未満の1対数単位であった; (2)曲線の上部および下部のパラメーターの95%信頼区間はオーバーラップしなかった;および(3)余分な加算 - の二乗検定は、付臭剤は、空のベクターでトランスフェクトした対照細胞よりも有意OR含有細胞を活性化することを確認した。用量反応結果を表3にまとめる。
これらのデータは、その後、一次スクリーニングアッセイにおける測定値は用量反応曲線からの結果を予測するか決定するために使用した。 図1の青いバーは、赤いバーが上に概説たちの3つの基準を満たしていなかったが、完全な用量反応実験ではアゴニストとして分類されたペアに対応しています。一次スクリーニングからの値は、我々の一次スクリーニングは有用な方法であることを示す完全な用量応答実験(受信者動作特性曲線下面積(AUC)= 0.68、p <0.01、マン·ホイットニーU検定)の結果を予測完全な用量応答実験( 図2)にアゴニストとして分類される臭気物質/ ORペアを富化する。
図1。嗅覚受容体と匂い物質のパネルで画面のためのベースラインのルシフェラーゼ値の頻度。頻度のヒストグラム(COUNT)一次スクリーニングでは、各臭気物質/ ORペアに対して計算されたベースラインのルシフェラーゼ値の。臭気物質/受容体活性化の対が疎であるように、値の大部分はゼロを中心としており、大きな中央の分布は、このアッセイのための雑音分布を推定する。カラーバーは、用量応答分析のために選択された臭気物質/受容体ペアを示し;青いバーは、完全な用量反応に基づいて作動薬、および赤いバーが作動薬として分類されていなかったペアであると分類されたペアです。F = "https://www-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/51640/51640fig1highres.jpg"ターゲット= "_blank">拡大画像を表示するにはここをクリックしてください。
図2。匂い物質/受容体スクリーンのためのROC曲線を図48匂い物質/受容体ペアはアゴニストであること、またはアゴニストではないと分類された。真陽性率(感度)は、R統計パッケージ40を使用して偽陽性率(1 -特異度)に対してプロットした。曲線下面積(AUC)は、より高いルシフェラーゼスクリーン値と匂い物質/受容体ペアは低い値と比べて用量反応に合格する可能性が高いことを示し、0.68である。 拡大画像を表示するにはここをクリックしてください。
ベースライン値 | 用量反応 |
0.051793067 | 失敗する |
0.006376956 | 失敗する |
0.331936398 | パス |
0.591006519 | パス |
0.049093369 | パス |
0.396788976 | パス |
-0.013655743 | パス |
0.011080217 | パス |
0.004203349 | 失敗する |
0.003975049 | 失敗する |
-0.077935718 | パス |
-0.084488317 | パス |
0.030236078 | 失敗する |
-0.042963576 | 失敗する |
0.031466406 | 失敗する |
0.025897747 | 失敗する |
-0.030434651 | 失敗する |
-0.004122795 | 失敗する |
-0.010075533 | 失敗する |
0.028883452 | 失敗する |
0.019402373 | 失敗する |
0.047508749 | 失敗する |
0.00255344 | 失敗する |
0.017221449 | 失敗する |
0.340216655 | パス |
-0.026912181 | 失敗する |
0.037140428 | 失敗する |
0.467763017 | パス |
0.097665337 | 失敗する |
0.080657267 | パス |
0.172819211 | パス |
0.05568393 | パス |
-0.106721064 | パス |
0.136614849 | パス |
0.457839849 | 失敗する |
0.211751741 | 失敗する |
0.1581464 | パス |
-0.62099155 | パス |
-0.066949491 | パス |
-0.78712035 | パス |
0.752503007 | パス |
1.433407558 | パス |
0.475431098 | パス |
1.457936815 | パス |
0.048652537 | 失敗する |
0.027196782 | 失敗する |
0.129599842 | 失敗する |
-0.069781272 | 失敗する |
0.016450039 | 失敗する |
-0.025639207 | 失敗する |
0.158152141 | 失敗する |
-0.032570055 | 失敗する |
0.140139926 | 失敗する |
-0.052030276 | 失敗する |
0.657140133 | パス |
1.040410297 | パス |
パス | |
0.399588712 | パス |
0.188094387 | パス |
0.039371424 | パス |
0.016784352 | パス |
0.229959571 | パス |
0.238381997 | 失敗する |
0.074118909 | 失敗する |
0.423901128 | パス |
0.152621022 | パス |
パス | |
0.075301806 | パス |
0.395233972 | パス |
0.261892958 | パス |
0.156693306 | 失敗する |
2.163418147 | パス |
3.649862104 | パス |
0.025716169 | パス |
-0.033258008 | パス |
-0.026984127 | 失敗する |
-0.338441868 | パス |
0.37398618 | パス |
用量反応において試験され、表3。嗅覚受容体/臭気のペア。ベースラインのルシフェラーゼ値と画面から選択48 OR /匂いのペアのための用量反応の結果(合格または不合格)。二回スクリーニングで試験30ペアの場合、両方のベースラインのルシフェラーゼの値が含まれています。
同一性は、付臭剤の嗅覚受容体活性化パターンによって符号化されるが、受容体は活性化され、どの程度にしているなどの受容体の活性化パターンは、ヒト嗅覚受容体1-11未満の6%のために知られている。嗅覚受容体を特徴づけるための努力は、嗅覚受容体ファミリー17,23,24,33,34のサブセットだけに彼らの労働集約的な方法や適用性によって制限されています。 Hana3A異種発現系は、試験された嗅覚受容体の大多数の強い発現を支持し、嗅覚受容体活性化19,26,27を監視するためのcAMP応答性ルシフェラーゼレポーターシステムと組み合わせて使用することができる。 96ウェルフォーマットにおけるこのアッセイの性能は、相互作用を確認するために、臭気物質/嗅覚受容体対および用量反応曲線のための有望な候補を決定し、受容体活性化レベルは、AFであるかを評価するための画面を含むハイスループット実験計画の数をサポート内および種間変動によってフェクト。画面内のより高い活性値を有する臭気物質/受容体対は、有意な用量応答を実証する可能性が高い。これらのデータは、このスクリーニング方法、それにより臭気物質リガンドおよび嗅覚受容体活性化のパターンの識別を容易にする、用量応答を通過する臭気物質/受容体ペアを富化することができることを示唆している。
嗅覚受容器を分析するために最適化このアッセイの成功は、いくつかの要因に依存する。全てのプラスミドDNAを、エンドトキシンを含まないプロトコルを介して準備する必要があります。細胞表面での一貫性の嗅覚受容体の発現は非常に重要です。 Hana3A細胞株は安定にするのを助けるOR発現が、RTP1S及びM3-Rの同時トランスフェクションは、それぞれ27、受容体発現および活性を増強すること。いくつかのアクセサリータンパク質を発現するアクセサリータンパク質発現のこの組み合わせは可能ほとんどの嗅覚受容体の確実な発現をもたらすcompariso実験と受容体の間のNまたは活性化。さらに、細胞集密度のモニタリングは一貫した結果を得るために重要である。オリジナルの10cm 2の皿に細胞を仮定すると、本明細書に記載されているプロトコルは、実験を通じて信頼性の高い細胞集密度になるように、次の、およそ100%のコンフルエントである。重要なのは、十分な細胞は、測定可能なルシフェラーゼの読みを得るために、メッキされますが、細胞は、過剰成長した嗅覚刺激後の受容体の活性化に影響を与える可能性があり、条件ではありません。細胞密度のためではなく、トランスフェクション効率のためだけでなく、構成的ウミシイタケ発現をさらに制御するために正規化する。平均より2.5以上の標準偏差を読んで、ウミシイタケルシフェラーゼは細胞損失を示すことがあります。細胞はまばら細胞よりも板表面からより容易に取り外す緻密斑を回避するために均一にメッキされるべきであり、トランスフェクションおよび臭剤溶液が着脱セルを避けるために、ウェルの側面に緩やかに添加されるべきであるLS。細胞の損失はまた、付臭剤の毒性によって引き起こされる細胞死は0.5%未満DMSO濃度を維持することによって回避することができる臭剤濃度、または過度のDMSOを低下させることによって回避することができる問題に起因する可能性がある。最後に、1μMフォルスコリン、cAMPの応答性プロモーターからのルシフェラーゼレポーター発現を引き起こすアデニリルシクラーゼアクチベーターで各受容体を発現する細胞集団を治療、アッセイの陽性対照としての役割を果たすことができる。
本明細書に記載のアッセイは、哺乳類の嗅覚受容体ファミリーにハイスループット形式と、より一般的な適用を含む代替方法を上回る改善を示していますが、それには限界がある。まず、私たちのin vitroアッセイは、匂い物質結合タンパク質を含むin vivoでの嗅覚系、粘膜層、細胞内分子およびスニッフィング行動の多くのコンポーネントが不足しています。第二に、この方法は、嗅覚受容体を測定するために、ルシフェラーゼレポーター系に依存しているカルシウムイメージングを利用する一般的な代替方法とは対照的に活性化。最近の研究は、これらの2つの方法は、矛盾する結果を生じ得ることを示唆している。カルシウムイメージングではなく、ルシフェラーゼアッセイ41を経由して検査したとき、実際に、いくつかの嗅覚受容体は、特定の匂い物質に応答します。つのアッセイ型は、ヒト嗅覚の研究に対してより適切であるかどうかは依然として不明であるが、両方の方法は、コンテキストおよび受容体のタイプに応じて有用であり得る。この機能的な発現系は正常にテスト哺乳類の嗅覚受容体の大部分を発現するために使用されているが第三に、いくつかのオッズ比は、このシステムを用いた発現に適しないかもしれない。以前に特徴付けられていない受容体は、臭気に応答しない場合、それは細胞表面での発現の欠如ではなく、臭気物質と受容体との間の相互作用の欠如に起因し得る。受容体細胞表面発現が負の検定から結論を引き出す前に、免疫蛍光を経由して検査することができる27,42結果 。最後に起因無臭気条件における低バックグラウンドのルシフェラーゼ活性を、我々のアッセイは、阻害応答を検出するように設計されていない。嗅覚受容体38,39のための臭気拮抗薬を決定するために、ほとんどの受容体は、第1のルシフェラーゼ活性の低下を観察するために臭気で刺激されなければならない。
これらの制限にもかかわらず、このアッセイ系は大幅に嗅覚の分野でデータ収集を増加させる能力を有する。まず、高スループットの96ウェルフォーマットは、大規模受容体および/または臭気の画面が可能となる。第二に、その異種発現系は、哺乳類の嗅覚受容体の様々に適用可能である。第三に、ルシフェラーゼ活性は、特定の臭気物質のための受容体活性化パターンを記述するのに有益である嗅覚受容体活性化を測定するために使用することができる。第四に、 インビトロアッセイ系において同様の以前の結果は、ヒト嗅覚8,11,35を予測する。これらの特性はparticですularly重要な哺乳類の嗅覚受容体ファミリーの大きなサイズおよび特定の匂いによって誘発された又は活性化パターンに関する当社の限られた知識与えられた。嗅覚受容体の分析のために最適化され、このアッセイ系の広範なアプリケーションは、嗅覚受容体/匂い物質の相互作用、臭気符号化の分子基盤をより包括的に絵に貢献していきます。
著者らは、開示することは何もありません。
この作品はR01 DC013339、R03 DC011373、ルースL.キルシュシュタイン国立研究サービス賞T32 DC000014によってサポートされていました。作品の一部は、NIH-NIDCDコアグラントをP30 DC011735からの資金によって部分的にサポートされていモネル化学感覚受容体シグナルコアを用いて行った。著者は、データ収集のヘルプのために-80 Sezilleに感謝します。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Hana3A cells | Avaiable from the Matsunami Laboratory upon request | ||
RTP1S-pCI | Avaiable from the Matsunami Laboratory upon request | ||
M3-R-pCI | Avaiable from the Matsunami Laboratory upon request | ||
pCRE-luc | Agilent | 219076 | LUC |
pSV40-RL | Promega | E2231 | RL |
Minimum Essential Media, Eagle | Sigma Aldrich | M4655 | MEM |
FBS | Life Technologies | 16000-044 | FBS |
PBS (without Ca2+ and Mg2+) | Cellgro | 21-040-CV | PBS |
Trypsin (0.05% Trypsin EDTA) | Life Technologies | 25300 | Trypsin |
CD293 | Life Technologies | 11913-019 | CD293 |
96-well PDL white/clear plate | BD BioCoat | 356693 | plates |
Lipid transfection reagent: Lipofectamine 2000 | Life Technologies | 11668-019 | Lipofectamine |
Firefly luciferase substrate, firefly luciferase quencher/Renilla luciferase substrate: Dual-Glo Assay | Promega | E2980 | dual glo |
Synergy S2 | BioTek | SLAD | BioTek S2 |
Microplate reader software: Gen5 Data Analysis Software | BioTek | Gen5 | Gen5 |
BIOSTACK | BioTek | BIOSTACK2WR | BioStack |
Multiflo | BioTek | MFP | MultiFlo |
300 μl GripTips | Integra | 4433 | GripTips |
12.5 μl GripTips | Integra | 4414 | GripTips |
300 μl GripTips ViaFlo96 | Integra | 6433 | XYZ tips |
12.5 μl GripTips 384 XYZ | Integra | 6403 | XYZ tips |
384ViaFlo | Integra | 6030 | 384ViaFlo |
TE buffer | Macherey Nagel | 740797.1 | |
DMSO | Sigma Aldrich | D2650-100ML | DMSO |
Forskolin | Enzo Life Sciences | BML-CN100-0010 | FOR |
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