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* Questi autori hanno contribuito in egual misura
Presentiamo un protocollo ottimizzato per l'elaborazione di interi reni umani per isolare e coltivare cellule epiteliali del tubulo prossimale renale primario e l'applicazione di queste cellule in una piattaforma microfluidica tridimensionale, microfluidica e microfisiologica per ricapitolare il tubulo prossimale renale.
Le malattie renali colpiscono oltre 850 milioni di persone in tutto il mondo, tra cui 37 milioni di americani. I fattori di rischio per la malattia renale cronica includono influenze ambientali, predisposizioni genetiche, condizioni mediche coesistenti e una storia di danno renale acuto. Questi fattori spesso impiegano mesi o anni per svilupparsi, complicando gli studi longitudinali dell'eziologia e della fisiopatologia della malattia. Sono necessari modelli renali avanzati per migliorare la nostra comprensione dei meccanismi della malattia e migliorare la previsione della nefrotossicità nello sviluppo di farmaci. Le cellule epiteliali dei tubuli prossimali (PTEC) nel rene svolgono un ruolo fondamentale nella clearance degli xenobiotici e delle tossine, nonché nel riassorbimento dei nutrienti essenziali. Abbiamo precedentemente dimostrato che le piattaforme di sistemi microfisiologici (MPS) tridimensionali (3D), popolate con PTEC primari isolati, possono essere utilizzate per studiare le interazioni farmacologiche renali, valutare la nefrotossicità dei composti e prevedere la clearance dei farmaci. Qui presentiamo i protocolli per isolare e coltivare PTEC primari da reni umani interi e per seminarli in una piattaforma MPS 3D che imita la fisiologia renale in vivo . Questo protocollo consente studi a lungo termine a supporto della vitalità di PTEC, della morfologia fisiologica e della polarizzazione funzionale delle principali proteine trasportatrici nei dispositivi MPS per un massimo di 6 mesi.
Il rene svolge un ruolo fondamentale nell'eliminazione e nell'eliminazione di un'ampia gamma di xenobiotici, tossine e composti endogeni dal corpo. Ciò si ottiene filtrando il sangue per rimuovere i prodotti di scarto e regolando l'equilibrio elettrolitico, i livelli di liquidi e il pH. Ogni rene umano contiene circa un milione di nefroni, le unità strutturali e funzionali del rene1. All'interno di questi nefroni, le cellule epiteliali specializzate nei tubuli prossimali, note come cellule epiteliali dei tubuli prossimali (PTEC), sono responsabili del riassorbimento di molecole essenziali come glucosio, aminoacidi e ioni, nonché della secrezione di substrati farmacologici e sostanze potenzialmente tossiche nelle urine 2,3,4. In alcuni casi, i PTEC possono anche riassorbire i composti dall'urina nel flusso sanguigno4. A causa del loro ruolo critico nelle interazioni tra farmaci e tossine, i PTEC primari isolati da reni umani forniscono uno strumento prezioso per lo studio delle interazioni farmacologiche renali (DDI) e per la valutazione della nefrotossicità dei composti.
La nefrotossicità indotta da farmaci rappresenta una sfida clinica significativa, in quanto può portare a danno renale acuto e malattia renale cronica5. Pertanto, una comprensione più approfondita della fisiologia del tubulo prossimale renale è essenziale per prevedere e caratterizzare con precisione il potenziale nefrotossico di farmaci e tossine. I modelli tradizionali in vitro, comprese le linee cellulari renali immortalizzate (ad esempio, RPTEC-TERT1, HK-2), hanno limitazioni nell'imitare la complessa struttura e funzione dei tubuli prossimali umani6, che operano in presenza di un flusso laminare dinamico (con un basso numero di Reynolds) e di una matrice extracellulare uniforme (ECM) in vivo 7,8. Inoltre, i tradizionali modelli bidimensionali (2D) spesso non riescono ad esprimere funzionalmente i principali trasportatori renali (ad esempio, il trasportatore di anioni organici 1 e 3 (OAT1 e OAT3), il trasportatore di cationi organici 2 (OCT2)) a causa della rapida degradazione e internalizzazione di queste proteine 6,9,10,11 . I modelli animali, sebbene informativi, potrebbero non replicare completamente la fisiologia renale umana e spesso mancano di traducibilità a causa delle differenze di specie nell'espressione e nell'attività del trasportatore12. Ad esempio, mOct1 è espresso basolateralmente nei PTEC di topo, mentre nell'uomo, l'espressione proteica di membrana di OCT1 nel rene non è rilevabile13,14.
I progressi nei sistemi microfisiologici (MPS) e nelle tecnologie organ-on-a-chip hanno permesso ai ricercatori di sviluppare modelli in vitro che imitano da vicino l'architettura tridimensionale (3D) e le condizioni di flusso dinamico dei fluidi degli organi umani15. Il nostro gruppo ha precedentemente caratterizzato due modelli di MPS con PTEC16,17 e ha utilizzato questi modelli per condurre studi di tossicità 18,19,20 e prevedere con precisione la disposizione dei farmaci21. L'uso di PTEC primari in questi modelli offre vantaggi significativi grazie alla loro capacità di mantenere le caratteristiche funzionali osservate in vivo.
Qui, presentiamo i protocolli per l'isolamento dei PTEC umani da un rene umano intatto ottenuto da un donatore deceduto tramite un'organizzazione di approvvigionamento di organi approvata dalla United Network for Organ Sharing (UNOS) e l'applicazione di questi PTEC umani in coltura all'interno di una piattaforma MPS.
Tutto il lavoro è stato condotto in conformità con le linee guida per la manipolazione dei tessuti umani dell'Università di Washington. I donatori idonei soddisfano i seguenti requisiti: meno di 36 ore di tempo ischemico freddo (CIT), nessuna storia nota di malattie renali, dialisi o altre condizioni mediche (ad esempio, diabete mellito di tipo 1 o 2, epatite B, epatite C, virus dell'immunodeficienza umana (HIV), meningite virale/batterica, infezione da Staphylococcus aureus resistente alla meticillina, sifilide, sepsi o Covid-19). L'intero rene umano utilizzato in questo studio è stato acquistato attraverso un OPO approvato dall'UNOS.
1. Preparazione della cabina di biosicurezza
2. Preparazione alla pre-elaborazione del rene
3. Isolamento dei PTEC dall'intero rene
4. Modifiche ai media
5. Superamento dei PTEC
6. PTEC crioconservanti
7. Scongelamento dei PTEC
8. Rivestimento del dispositivo MPS con matrice di collagene di tipo I
9. Creazione di un lume tubulare con collagene di tipo IV come ECM in un dispositivo MPS
10. Seeding dei PTEC primari in un dispositivo MPS
Morfologia e confluenza di PTEC primari isolati nel tempo in coltura 2D
Dopo l'isolamento dalla corteccia renale, i PTEC sono stati lasciati crescere indisturbati per almeno 48 ore prima del primo cambio di media. Circa una settimana dopo la coltura delle cellule, piccoli lotti di PTEC dovrebbero apparire in tutto il pallone di coltura con una morfologia epiteliale uniforme, simile a un ciottolo (Figura 1A, B). A seconda dei tassi di crescita dei PTEC provenienti da diversi donatori, la confluenza cellulare dovrebbe raggiungere circa il 50%-60% dopo 10 giorni in coltura (in media) (Figura 1C). Dopo circa 14 giorni di coltura, le cellule dovrebbero raggiungere la piena confluenza (Figura 1D) e sono pronte per essere trasportate, crioconservate o seminate in un dispositivo MPS. In media, un intero rene umano è in grado di fornire 14 fiasche piene di PTEC. Per prevenire la contaminazione, è essenziale utilizzare tecniche sterili e includere antibiotici nei terreni durante il periodo di coltura.
Iniezione di PTEC in un dispositivo MPS
Dopo che i dispositivi MPS sono stati rivestiti con collagene di tipo I e IV, sono pronti per la coltura di PTEC in formato 3D. Come mostrato nel Video 1 e nella Figura 2, i PTEC possono essere visti fluire nel lume dalla porta di iniezione (Figura 3). Se non sono osservate cellule, ciò potrebbe indicare una perdita o un disallineamento dell'iniezione e dell'ago della siringa smussato. Come dimostrato negli studi17-28 pubblicati in precedenza, i tubuli PTEC si formano circa una settimana dopo l'iniezione in un dispositivo MPS.
Figura 1: Morfologia e confluenza delle cellule epiteliali del tubulo prossimale primario isolate (PTEC) nel tempo. I PTEC isolati da un singolo rene adulto sono tipicamente placcati in 14 fiasche di coltura cellulare T-75. (A) Per questo rene rappresentativo, dopo 6 giorni di coltura, è stato possibile osservare piccole chiazze di PTEC (inscatolate in rosso) con aspetto epiteliale e simile a ciottoli in tutto il pallone di coltura cellulare, con cellule del sangue ancora visivamente presenti. (B) Il giorno 8, sono comparsi patch PTEC definiti con cellule del sangue ridotte dopo il cambio del terreno. (C) La confluenza ha raggiunto in media il 50-60% entro il giorno 10 e (D) ha raggiunto circa il 100% circa 2 settimane dopo l'isolamento e sono pronti per essere trasportati, crioconservati o utilizzati in un dispositivo MPS. Le immagini sono state scattate con un ingrandimento 4x utilizzando un microscopio. Le barre della scala rappresentano 100 μm. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 2: Panoramica del flusso di lavoro per la creazione di un modello di tubulo prossimale utilizzando PTEC in una piattaforma MPS. Questo diagramma di flusso descrive il flusso di lavoro generale per l'utilizzo dei PTEC in un dispositivo MPS. In genere, sono necessarie circa 3 settimane per isolare i PTEC dai reni umani per creare un tubulo prossimale 3D in vitro maturo e stabile. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Figura 3: PTEC dopo essere stati iniettati in un dispositivo MPS. Dopo la formazione del lume nel dispositivo MPS con collagene I e IV, i PTEC possono essere iniettati. Come mostrato in questa figura e nel video, dopo aver iniettato correttamente i PTEC, si potevano vedere le cellule fluire attraverso il lume dalla porta di iniezione. Clicca qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Concentrazione stock di collagene di tipo I (mg/mL) | 10 | |
Volume finale approssimativo della miscela (mL) | 1 | |
Concentrazione finale di collagene richiesta (mg/mL) | 6 | |
Volume di terreno PTEC necessario (mL) | 0.328 | |
Volume di 10x M199 (mL) | 0.072 | |
Volume di 1 m NaOH (mL) | 0.010 | |
Volume di stock di collagene necessario (mL) | 0.600 |
Tabella 1: Esempi di calcolo per la preparazione di 1 mL della miscela di rivestimento MPS al collagene di tipo I. Il volume di stock di collagene necessario deve essere regolato in base alla concentrazione di stock. Il volume dei terreni PTEC può essere regolato per aumentare o diminuire il volume totale a circa 1 mL.
Video 1: PTEC che fluiscono nel lume dalla porta di iniezione. Clicca qui per scaricare questo video.
Le MPS, o tecnologie organ-on-a-chip, offrono una piattaforma in vitro altamente rilevante per ricapitolare aspetti chiave della fisiologia umana, riducendo così la dipendenza da modelli animali nello sviluppo di farmaci e nelle valutazioni tossicologiche. Recentemente, l'FDA Modernization Act 2.0 (2022) ha consentito l'inclusione delle MPS, tra le altre alternative, nelle domande di nuovi farmaci sperimentali29. Questo protocollo descrive in dettaglio una procedura operativa standard per la dissociazione dei PTEC dal tessuto corticale di un donatore umano e il loro successivo utilizzo in piattaforme MPS, con l'obiettivo di modellare la funzione del tubulo prossimale umano e valutare le risposte tossicologiche renali agli xenobiotici (Figura 2).
Un fattore importante per mantenere un'elevata vitalità del PTEC è la riduzione al minimo del tempo ischemico caldo (WIT). Si consiglia di utilizzare reni con meno di 1 ora di WIT. Mentre la CIT inferiore a 24 ore è l'ideale, fino a 36 ore possono essere tollerate quando la disponibilità di rene è limitata. Un altro passaggio critico è la corretta preparazione dei tessuti, che include la rimozione delle membrane esterne, del grasso viscerale e la separazione completa della corteccia dal midollo per massimizzare la purezza del PTEC. Abbiamo scoperto che digerire il tessuto con collagenasi IV e dispasi piuttosto che con la sola collagenasi I 10,11,30,31 offre una dissociazione più delicata che preserva l'integrità della membrana cellulare. Inoltre, altre miscele o l'inclusione di DNasi possono essere utili quando ci sono detriti cellulari significativi o aggregazione cellulare nella sospensione. È inoltre essenziale tritare i fazzoletti in pezzi di meno di 1cm3 e mantenerli freddi su ghiaccio o a 4 °C subito dopo la digestione per evitare eccessivi danni cellulari.
Per le applicazioni a breve termine dei PTEC in piattaforme di coltura statiche come i transwell, la rimozione della maggior parte dei globuli rossi durante la lavorazione dei tessuti è fondamentale per prevenire lo stress ossidativo causato dall'emoglobinalibera 32. Diversi tipi di cellule nella corteccia renale, comprese le cellule del sangue, possono essere separati utilizzando un gradiente di Percoll33. In alternativa, le cellule del sangue possono essere lisate selettivamente utilizzando un tampone a base di cloruro di ammonio34. D'altra parte, quando si utilizzano i PTEC nei dispositivi MPS, possono essere tollerati livelli moderati di cellule ematiche contaminanti, poiché questi PTEC devono essere coltivati in un formato di coltura standard fino alla confluenza. Inoltre, la digestione prolungata oltre un'ora dovrebbe essere evitata, in quanto può aumentare drasticamente il rischio di contaminazione che potrebbe non essere risolto con la semplice aggiunta di agenti antimicrobici. Una digestione di 30 minuti generalmente fornisce adeguate sospensioni di singole cellule e, se la resa è inferiore al previsto, il lavaggio del tessuto digerito una o due volte in più con tamponi isotonici come il PBS può spesso liberare PTEC che aderiscono al tessuto parzialmente digerito. Se la vitalità cellulare è bassa o l'aderenza è ritardata, è consigliabile riesaminare la digestione, garantire un WIT minimo e confermare che le condizioni del terreno di coltura (ormonalmente definito, privo di siero, 1 g/L di glucosio) siano corrette. Verificare che le fasi post-digestione vengano eseguite su ghiaccio o a 4 °C (fino alla placcatura) è anche essenziale per ridurre lo stress cellulare. Per la successiva semina cellulare nelle piattaforme MPS, è importante non introdurre bolle d'aria durante il rivestimento con soluzioni di collagene per mantenere una ECM uniforme affinché i PTEC formino tubuli strutturati. Le tecniche sterili sono particolarmente importanti durante l'installazione di MPS, poiché la natura multicompartimentale dei dispositivi MPS aumenta il rischio di contaminazione.
Uno dei principali limiti di questo protocollo è la dipendenza dai tessuti dei donatori, che possono variare in qualità e disponibilità. Un WIT prolungato o un CIT elevato possono ridurre la resa cellulare vitale e limitare la riproducibilità sperimentale. Un'altra limitazione è la durata finita dei PTEC primari, che in genere può essere mantenuta per 3 o 4 passaggi prima che si verifichi la senescenza cellulare. Infine, questo metodo produce inizialmente una popolazione mista di cellule, che contiene sia PTEC che cellule epiteliali dei tubuli distali (DTEC), dopo la digestione della corteccia renale. Anche se questo potrebbe non essere l'ideale per applicazioni a breve termine, lo scopo è quello di propagare i PTEC per un uso successivo nelle piattaforme MPS. Poiché impieghiamo un terreno di coltura definito senza siero, altri tipi di cellule con percentuali molto più basse, vale a dire le cellule mesangiali e i fibroblasti, non cresceranno a un ritmo significativo. Inoltre, utilizzando la citometria a flusso e la colorazione immunoistochimica (IHC), abbiamo precedentemente dimostrato che la maggior parte delle cellule primarie coltivate con questo metodo sono PTEC, con una minoranza di cellule che esprimono marcatori DTEC basati sui dati di colorazione dei marcatori delle cellule epiteliali renali. In particolare, i PTEC in coltura 3D formano tubuli polarizzati con fenotipo citometrico a flusso PTEC per neprilisina (CD10) e alanina aminopeptidasi (CD13)23. I dati di colorazione IHC hanno anche dimostrato che queste cellule, sia in formato 2D che 3D, esprimono marcatori PTEC lectina tetragonolobus loto (LTL), co-trasportatore sodio-glucosio 2 (SGLT2) e acquaporina-1 (AQP1), con un'espressione minima di marcatori nefroni distali, tra cui prominina-2 (PROM2), uromodulina (UMOD) e acquaporina 2 (AQP2)16. Ciò è previsto poiché è stato dimostrato che i DTEC si dedifferenziano e si transdifferenziano verso i PTEC nella coltura 2D30.
Sebbene le colture di cellule renali statiche e le linee cellulari immortalizzate siano ampiamente utilizzate, spesso non riescono a replicare i livelli fisiologici di stress da taglio e l'architettura tridimensionale presente nel rene. Al contrario, le piattaforme MPS 3D approssimano meglio l'ambiente del tubulo prossimale in vivo incorporando scaffold di flusso e ECM, migliorando così l'accuratezza predittiva per le valutazioni della nefrotossicità, come abbiamo dimostrato in precedenza 17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28. L'uso di PTEC primari piuttosto che di linee immortalizzate conferisce una maggiore rilevanza fisiologica, poiché queste cellule conservano trasportatori ed enzimi chiave essenziali per il metabolismo e la clearance degli xenobiotici. La combinazione di un'attenta manipolazione dei tessuti, di una digestione enzimatica ottimizzata e di condizioni di coltura adeguate garantisce che questo metodo MPS sia in linea con gli obiettivi generali di ridurre i test sugli animali, migliorando al contempo il valore traslazionale della ricerca renale preclinica29.
Questo protocollo consente la creazione di robusti modelli di tubuli prossimali umani in dispositivi microfisiologici, facilitando così lo screening dei farmaci, le previsioni di nefrotossicità e le indagini dettagliate sulla fisiopatologia renale, in particolare per i meccanismi di clearance renale, le interazioni farmaco-trasportatore e le vie di danno renale. Riducendo o sostituendo l'uso di modelli animali, questi approcci primari alle MPS basate sull'uomo promuovono il principio delle 3R (ridurre, perfezionare, sostituire) e possono accelerare le pipeline di sviluppo dei farmaci. Allo stesso tempo, le MPS specifiche per il paziente sono promettenti per le applicazioni della medicina di precisione, come lo screening personalizzato dei farmaci e la profilazione della tossicità. Nel complesso, questo metodo riproducibile per isolare e coltivare PTEC da tessuti di donatori umani fornisce passaggi critici per preservare la vitalità e la funzionalità cellulare e, se combinato con le piattaforme MPS 3D, migliora significativamente il potere predittivo dei modelli renali in vitro , facendo progredire la ricerca tossicologica e la scoperta di farmaci.
Gli autori dichiarano di non avere conflitti di interesse o divulgazioni finanziarie rilevanti per questo studio.
Parti di questo lavoro sono state supportate dal contratto 80ARC023CA001 della NASA, dal National Center for Advancing Translational Sciences (NCATS) (U2CTR004867, UH3TR000504, UG3TR002158), congiuntamente dal NCATS e dal Center for the Advancement of Science in Space (CASIS) (UG3TR002178), dal National Institute of Environmental Health Sciences (NIEHS) (P30ES00703), dal National Institute of General Medical Sciences (T32GM007750), da una donazione illimitata da parte dei Northwest Kidney Centers alla ricerca sui reni e la Scuola di Farmacia dell'Università di Washington (Ji-Ping Wang Award e Bradley Fellowship).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1 mL Luer-Lok Tip Syringes | Becton, Dickinson | 309628 | |
1.5 mL microcentrifuge tubes | CELLTREAT Scientific Products | 229442 | |
15 mL sterile conical polypropylene tube | Fisher Scientific | 14-959-53A | |
3D microphysiological Device | Nortis | TCC-001 | |
5 mL Luer-Lok Tip Syringes | Becton, Dickinson | 309646 | |
50 mL sterile conical polypropylene tube | Fisher Scientific | 12-565-271 | |
Antibiotic-Antimycotic (100x) | ThermoFisher Scientific | 15240062 | |
Collagenase, Type IV, powder | ThermoFisher Scientific | 17104019 | |
D-(+)-Glucose | MilliporeSigma | G8270 | |
Defined Trypsin Inhibitor | ThermoFisher Scientific | R007100 | |
Dimethyl sulfoxide, Bioreagent, Thermo Scientific Chemicals | ThermoFisher Scientific | J66650-AK | |
Dispase II, powder | ThermoFisher Scientific | 17105041 | |
Dulbecco’s MEM (DMEM)/F-12 w/o Glucose | US Biological Life Sciences | D9807-02 | |
Dulbecco's Phosphate Buffered Saline (DPBS), calcium, magnesium | ThermoFisher Scientific | 14040117 | |
Fetal Bovine Serum (FBS), Premium | ThermoFisher Scientific | A5670701 | |
Finnpipette F2 Good Laboratory Pipetting (GLP) Kits | ThermoFisher Scientific | 05-719-511 | Micropipettes |
Fisherbrand SureOne Micropoint Pipette Tips, Universal Fit, Non-Filtered | Fisher Scientific | 02707407, 02707410, 02707438 | |
Fresh whole human kidney | Novabiosis | https://www.novabiosis.com/research-organ-allocation-services/ | Human kidneys were obtained through Novabiosis, a UNOS-approved OPO |
Humidified incubator (37 °C and 5% CO2) | Fisher Scientific | 51033556 | |
Hydrocortisone | MilliporeSigma | H0888 | |
Incubating Orbital Shaker | Avantor | 12620-946 | |
Insulin-Transferrin-Selenium (100X) (ITS -G) | ThermoFisher Scientific | 41400045 | |
Internal Thread Cryogenic Vials | Corning | 430487 | |
Kimtech Science Kimwipes | Kimberly-Clark Professional | 34120 | |
Luer Stubs (Blunt needle), 22 G x 0.5 inches | Instech Laboratories, Inc. | LS22 | |
Medium 199, Earle's Salts (10x) | ThermoFisher Scientific | 21180021 | |
Megafuge 8 Small Benchtop Centrifuge | ThermoFisher Scientific | 75007210 | |
Metal Coupler (blunt) | Instech Laboratories, Inc. | SC 20/15 | |
Mr. Frosty Freezing Container | ThermoFisher Scientific | 5100-0036 | |
Nikon Eclipse Ti-S Microscope | Nikon Instruments | https://www.thelabworldgroup.com/product/nikon-eclipse-ti-fluorescent-microscope/ | Original model discontinued |
Nunc Non-treated Flasks, T-25 | ThermoFisher Scientific | 169900 | |
Nunc Non-treated Flasks, T-75 | ThermoFisher Scientific | 156800 | |
Pipette, 10 mL, Graduated, 1/10 mL, Sterile | Greiner Bio-One | 607180 | |
Silicon tubing, C-flex tubing, (ID: 0.020", OD: 0.083") | Cole-Parmer | 06422-00 | |
Single edge razor blade (sterile) | Bioseal | KI-205/50 | |
Sodium Bicarbonate | MilliporeSigma | S6297 | |
Sodium Hydroxide | MilliporeSigma | S8045 | |
Sterile Disposable Filter Units with PES Membranes | ThermoFisher Scientific | 567-0020 | |
Tissue Culture Treated Dishes, 150 mm x 20 mm Vented | Genesee Scientific | 25-203 | |
Trypsin-EDTA (0.05%), phenol red | ThermoFisher Scientific | 25300054 | |
Type I collagen, rat tail | Corning | 354236 | |
Type IV Collagen, Mouse | Corning | 354233 |
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