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Nous décrivons une méthode d’utilisation de la cyclodextrine pour médier l’échange entre les lipides de la membrane plasmique et les lipides exogènes. Cette technique peut être associée à des expériences étudiant les protéines transmembranaires, qui se comportent différemment dans des environnements de type radeau lipidique que dans des environnements non semblables à un radeau.
Les radeaux lipidiques sont des domaines dynamiques et ordonnés de la membrane plasmique souvent formés lors de l’agrégation et de la signalisation des protéines membranaires. L’identité lipidique de la foliole externe détermine la propension de la membrane à former des radeaux lipidiques. La nature transitoire des radeaux lipidiques rend difficile leur étude dans les cellules vivantes. Par conséquent, les méthodes qui ajoutent ou éliminent des lipides formant des radeaux au niveau du feuillet externe des cellules vivantes facilitent l’étude des caractéristiques des radeaux, telles que leurs effets sur les protéines membranaires. Les expériences d’échange de lipides développées dans notre laboratoire utilisent des cyclodextrines chargées de lipides pour éliminer et ajouter des phospholipides exogènes afin de modifier la constitution lipidique de la membrane plasmique. Le remplacement de la membrane par un radeau ou un lipide non formant un radeau peut aider à étudier les effets sur l’activité des protéines transmembranaires. Ici, nous décrivons une méthode d’échange de lipides sur le feuillet externe de la membrane plasmique à l’aide de cyclodextrine chargée de lipides. Nous démontrons la préparation du milieu d’échange et le traitement ultérieur des cellules de mammifères attachées. Nous montrons également comment mesurer l’efficacité des échanges à l’aide de HP-TLC. Ce protocole permet de remplacer presque complètement le feuillet externe par des lipides exogènes sans altérer la viabilité cellulaire, ce qui permet de poursuivre les expériences sur des membranes plasmiques intactes modifiées.
La membrane plasmique est composée d’une bicouche lipidique enrichie de diverses protéines membranaires, notamment des récepteurs transmembranaires et des canaux ioniques. Les domaines lipidiques à l’intérieur de la membrane ont été élucidés à l’aide de régions solubles et insolubles au détergent identifiées dans des expériences de fractionnement de membranes résistantes aux détergents (DRM)1. Les fractions insolubles ont été caractérisées par leur enrichissement en cholestérol, en sphingomyélines serrées et en phospholipides saturés, présentant des points de fusion plus élevés, contrairement aux fractions solubles qui consistent principalement en une température de fusion plus basse et en phospholipides insaturés faiblement emballés. Les régions étroitement tassées sont appelées domaines lipidiques ordonnés en liquide (Lo), ou radeaux lipidiques, tandis que les domaines lipidiques en désordre liquide (Ld) plus lâches sont les régions non en radeau de la membrane plasmique 2,3. Les régions des radeaux lipidiques sont connues pour faciliter les processus de signalisation, avec des preuves indiquant que le récepteur actif de l’insuline s’associe à ces radeaux 4,5. Cependant, en raison de la nature dynamique de la membrane cellulaire et de la taille généralement petite des domaines, la visualisation directe de la présence de radeaux dans les cellules vivantes présente des défis importants. Dans ce contexte, nous présentons une méthode pour étudier l’impact des radeaux lipidiques sur le récepteur de l’insuline par des techniques d’échange de lipides.
Les cyclodextrines (CD) sont formées de monomères de glucose liés qui créent une structure en forme d’anneau avec une cavité centrale. La taille de cette cavité est déterminée par le nombre d’unités de glucose : six unités forment de l’alpha-cyclodextrine (α-CD), tandis que sept unités créent des bêta-cyclodextrines (β-CD). Les CD sont des molécules très solubles dans l’eau capables d’encapsuler les lipides dans leur cavité, facilitant ainsi leur transport vers la membrane cellulaire6. Les bêta-cyclodextrines ont été largement utilisées pour ajouter et éliminer des lipides des membranes7 ; Cependant, sa cavité plus grande manque de spécificité pour le cholestérol ou les phospholipides8. En revanche, les alpha-cyclodextrines, avec leur cavité plus petite, présentent une plus grande sélectivité dans la liaison des molécules lipidiques par rapport aux stérols. Plus précisément, la méthyl-α-cyclodextrine (méthyl-α-CD) n’interagit pas avec les stérols et a été utilisée efficacement pour échanger des phospholipides et des sphingomyélines sans modifier la composition du cholestérol de la membrane cellulaire 8,9.
Dans ce manuscrit, nous fournissons un protocole détaillé pour l’utilisation des méthyl-α-CD (MαCD) pour échanger des lipides dans la foliole externe de la membrane cellulaire avec des lipides exogènes qui ont des propriétés favorisant ou perturbant la formation de radeaux lipidiques. Cet échange est utilisé pour étudier l’impact des radeaux lipidiques sur l’activité des récepteurs de l’insuline. La démonstration se concentrera sur l’introduction d’un phospholipide et d’une sphingomyéline affectant la formation de domaines ordonnés par un liquide (Lo) dans la membrane plasmique de lignées cellulaires d’ovaire de hamster chinois (CHO) surexprimant de manière stable le récepteur de l’insuline (IR)10. L’étendue de l’échange lipidique dans les cellules IR CHO sera évaluée par chromatographie sur couche mince à haute performance (HP-TLC), tandis que les changements dans l’activité des récepteurs de l’insuline seront quantifiés par analyse par transfert Western après une stimulation insulinique post-échange lipidique.
1. Préparation de la solution de méthyle-α-CD
2. Préparation des vésicules multilamellaires (MLV)
3. Préparation des milieux d’échange de lipides
4. Traitement d’échange lipidique des cellules
5. Extraction des lipides sur plaque de culture cellulaire
6. Vérification de l’efficacité de l’échange avec HP-TLC
7. Vérification de l’activation du récepteur à l’aide d’un test d’autophosphorylation et d’un western blot
Pour démontrer le changement observable de la composition cellulaire des lipides après l’échange, nous avons effectué HP-TLC sur des cellules IR CHO après un échange cérébral SM (bSM) et 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (DOPC) (Figure 1). Dans les cas où des sphingomyélines comme bSM sont utilisées pour l’échange, une augmentation de l’intensité de la bande SM est apparente, ainsi qu’une diminution de l’intensité de la bande PC par rapport au témoin non traité. À l’inverse, lors de l’échange de phosphatidylcholines comme le DOPC, la bande PC devient plus intense tandis que la bande SM devient moins intense. L’efficacité d’échange peut être déterminée en mesurant les intensités de la classe lipidique échangée à l’aide du logiciel ImageJ et en prenant le rapport entre les échantillons non traités et traités. L’étalon de charge, fabriqué à partir de plusieurs dilutions d’un lipide disponible dans le commerce, permet d’estimer la quantité d’une classe de lipides avant et après l’échange. En mesurant l’intensité des bandes d’étalon SM et en générant une courbe standard, les intensités MS de tous les échantillons peuvent être ajustées sur la courbe pour la quantification des lipides.
Ensuite, nous montrons comment l’autophosphorylation du récepteur peut être dosée après l’échange de lipides par western blot (Figure 2). Dans le cas du récepteur de l’insuline, les niveaux d’autophosphorylation insulino-dépendants peuvent être comparés entre les cellules non traitées et les cellules échangées avec des lipides formant des radeaux (bSM) ou des lipides non formant des radeaux (DOPC). L’échange de DOPC a un impact négatif sur la phosphorylation des IR, tout comme d’autres lipides, tels que la 1-palmitoyl-2-oléoyl-sn-glycérol-3-phosphocholine (POPC)4. Les sphingomamyélines maintiennent ou augmentent modérément la phosphorylation des IR, tout comme le fait la 1,2-distéaroyl-sn-glycéro-3-phosphocholine (DSPC)4. En atténuant les niveaux totaux des récepteurs avec l’anticorps IR-β, les niveaux de phosphorylation de l’anticorps IR pYpY peuvent être normalisés aux niveaux totaux des récepteurs. Les valeurs d’intensité ImageJ pour l’IR pYpY divisées par l’IR-β donnent des valeurs normalisées (Tableau 2). Cela tient compte de toute différence de niveau d’expression ou de quantités de protéines de charge inégales, comme on peut le voir dans la première voie.
Figure 1 : HP-TLC de l’échange de bSM et DOPC dans des cellules IR CHO. Les cellules CHO IR ont été affamées et incubées avec des milieux échangeurs de lipides (bSM ou DOPC) ou des milieux sans sérum comme contrôle. Des volumes égaux d’extraits lipidiques ont été chargés sur une plaque HP-TLC avec des quantités croissantes de bSM. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Figure 2 : Image par Western blot de l’autophosphorylation IR après échange de bSM et de DOPC. Les plaques de contrôle ont été incubées avec (contrôle positif) ou sans insuline (contrôle négatif) de 100 nM. Des plaques d’échange de lipides (bSM ou DOPC) ont été incubées avec de l’insuline 100 nM après l’échange. Des quantités égales de protéines totales ont été analysées sur SDS-PAGE et tamponnées pour pYpY IR et IR-β. Le transfert IR-β sert de contrôle de charge. Veuillez cliquer ici pour voir une version agrandie de cette figure.
Lipide | Température de préparation du milieu de remplacement (°C) | Concentration d’échange (mM) | Caractère de saturation |
DOPC | 37 | 4 | Insaturé |
POPC | 37 | 4 | Insaturé |
DLPC | 37 | 4 | Saturé |
DMPC | 37 | 2 | Saturé |
DPPC | 55 | 1 | Saturé |
DSPC | 55 | 0.5 | Saturé |
Bsm | 37 | 1 | Saturé# |
Esm | 37 | 1 | Saturé |
#bSM est un mélange d’espèces de sphingomyéline. La plupart de ces espèces sont de caractère saturé, à l’exception de la sphingomyéline 24:1. On ne sait pas dans quelle mesure la sphingomyéline 24:1 peut être chargée sur MαCD par rapport aux espèces saturées. |
Tableau 1 : Lipides utilisés dans les milieux échangeurs.
pYpY | IR-β | pYpY/IR-β | pYpY/IR-β (normalisé) | |
Contrôle négatif | 142.6 | 1229 | 0.12 | 0.09 |
Contrôle positif | 5844 | 4446 | 1.31 | 1.00 |
Bsm | 5886 | 5173 | 1.14 | 0.87 |
DOPC | 2031 | 2740 | 0.74 | 0.56 |
Tableau 2 : Valeurs d’intensité du western blot d’autophosphorylation IR.
Depuis la conceptualisation de l’existence de radeaux lipidiques dans la membrane cellulaire, il y a eu de nombreuses tentatives pour les visualiser dans les cellules et étudier l’association des lipides et des récepteurs. Des expériences impliquant la microscopie11 dans des cellules ont utilisé des biomarqueurs marqués par fluorescence, généralement des protéines et des lipides connus pour s’associer à des radeaux, pour étudier visuellement la localisation des domaines lipidiques ordonnés dans la cellule12. Cependant, la membrane cellulaire est pleine de plis13,14, d’invaginations de cavéoles 1,13 et de regroupement de protéines2, qui entravent la visualisation de la dynamique des biomarqueurs de radeau. Une autre approche a été utilisée pour étudier les radeaux dans des membranes modèles en préparant les vésicules à l’aide des lipides appropriés15. Bien qu’elles soient faciles à synthétiser et à utiliser, ces vésicules ne sont pas une représentation précise de la membrane cellulaire en termes de propriétés biophysiques et de composition chimique de la bicouche cellulaire. Les vésicules géantes à membrane plasmique (GPMV) constituent un système membranaire naturel. Les GPMV sont des vésicules de membrane plasmique avec une composition chimiquement précise des membranes cellulaires. Ceux-ci sont produits en incubant des cellules avec des réactifs qui forment des vésicules en bourgeonnant de la membrane cellulaire des cellules vivantes16. Cependant, les solutions conventionnelles pour la formation du GPMV sont connues pour modifier chimiquement et/ou réticuler les lipides et les protéines au cours du processus de vésiculation et activer constitutivement les récepteurs dans les vésicules. Le protocole développé dans notre laboratoire influence la capacité de la membrane à former des radeaux lipidiques en échangeant des lipides exogènes avec des propensions variables à soutenir ou à détruire les régions ordonnées de la membrane cellulaire dans les cellules intactes et sans modifier chimiquement les protéines 4,8.
Les expériences d’échange de lipides peuvent être immédiatement suivies de tests qui mesurent les propriétés de la membrane plasmique. HP-TLC fournit la confirmation qu’un échange a eu lieu et qu’il a été maintenu après une expérience, ce qui ajoute de la confiance aux résultats de toutes les expériences biochimiques réalisées après les essais d’échange. En visualisant la composition en sphingomyéline et en phospholipides de la cellule avant et après l’échange, on peut également déterminer l’efficacité de l’échange dans un nouvel ensemble de conditions, telles que de nouvelles lignées cellulaires ou des cyclodextrines. Les étapes menant à la partie d’échange du protocole jouent un rôle important pour garantir la précision des réplicats et l’efficacité de l’échange de lipides dans les cellules. L’étalonnage, le pipetage et le séchage des lipides doivent être considérés comme des étapes critiques en raison des petits volumes de solvant organique utilisés et des exigences de concentration délicates pour un chargement correct de MαCD. Le stockage et l’étalonnage appropriés des solutions mères de lipides sont des étapes préliminaires essentielles du protocole. Les solutions mères sont généralement préparées sous forme de chloroforme et peuvent s’évaporer avec le temps, même lorsqu’elles sont stockées à -20 °C, ce qui entraîne des changements progressifs de concentration. Le séchage du volume spécifié de lipides pour atteindre la concentration souhaitée est essentiel pour garantir que la quantité correcte de lipides est chargée sur la cyclodextrine pour le processus d’échange. Pour éviter une erreur de pipetage, il est conseillé de calibrer la concentration des solutions mères sur une base mensuelle.
Après avoir calibré les solutions mères, le volume de lipides requis est pipeté dans des tubes en borosilicate propres, par exemple, avec une pipette Drummond à déplacement positif, qui utilise des alésages en verre. Des concentrations élevées de stocks de lipides pourraient nécessiter le pipetage de volumes extrêmement faibles, entraînant inévitablement des erreurs et une variabilité des conditions d’échange finales. Pour éviter cela, il est conseillé de pipeter un volume correspondant à une concentration intermédiaire entre celle du stock et celle de la solution d’échange finale. Cette approche garantit une précision de pipetage optimale pour former les vésicules multilamellaires (MLV) dans la solution d’échange de travail. Les lipides sont généralement séchés sur un bloc chauffant sous un flux constant d’azote gazeux maintenu à environ 10 psi pendant 10 à 20 min. Une pression de gaz excessive ou le fait de placer la buse de gaz près du fond du tube peut provoquer des éclaboussures du liquide de séchage contre les parois, entraînant une perte de volume lipidique et potentiellement une modification de la concentration des MLV. Pour éviter la contamination croisée, tous les composants de l’équipement de séchage sont lavés avec de l’éthanol à 100 % avant et après le processus de séchage. Pour assurer un séchage complet, le tube est placé sous vide poussé pendant 1 h puis scellé avec un film transparent pour maintenir la pureté du lipide séché.
Les limites de l’expérience peuvent être attribuées au rôle des flippases et des scramblases dans le maintien de l’asymétrie membranaire. Les enzymes responsables du mouvement des lipides entre les feuillets interne et externe de la bicouche préservent le caractère asymétrique de la membrane cellulaire17. Au cours de l’expérience, la vitesse à laquelle les flippases et les scramblases redistribuent les lipides ajoutés de manière exogène entre les folioles est inconnue. Cela pourrait établir la nature de la membrane cellulaire et constitue un facteur externe qui n’a pas été ignoré.
De plus, cette action de bascule pourrait, dans certaines conditions, exposer des lipides prématurément présents dans la membrane interne des cellules, comme la phosphatidylsérine (PS), un lipide intrinsèquement responsable de la signalisation de l’apoptose cellulaire18. Nos expériences utilisent des échanges lipidiques de sphingomyléine (SM) et de phosatidylcholine (PC). Ces lipides sont présents dans le feuillet externe de la membrane plasmique et mettent de longues durées à se retourner vers le feuillet cytosolique, ce qui permet de réaliser le test principalement vers le feuillet externe 9,19,20. Un autre problème est que tous les lipides exogènes ajoutés aux cellules ne peuvent pas soutenir pleinement l’intégrité et la structure de la membrane cellulaire 9,19. L’utilisation de tels lipides endommagera par inadvertance la membrane cellulaire après l’échange, limitant ainsi les lipides utilisés dans le protocole d’échange. En effectuant des tests de viabilité cellulaire, les tests peuvent aider à évaluer l’étendue des dommages subis par les cellules après l’incubation avec le milieu d’échange4. L’analyse par cytométrie en flux de cellules trypsinisées et traitées à l’iodure de propidium est une méthode permettant d’analyser la viabilité des cellules échangées de lipides. Les lésions membranaires pourraient également entraîner l’internalisation des récepteurs. De grandes quantités d’internalisation des récepteurs de l’insuline modifieront les données d’autophosphorylation des récepteurs. La cytométrie en flux effectuée sur des anticorps marqués à la phycoérythrine et liés aux ectodomaines du récepteur de l’insuline dans les cellules traitées avec des milieux d’échange peut expliquer tout changement dans l’expression des récepteurs de surface 4,20.
Dans ce manuscrit, nous avons rapporté les concentrations d’une variété de lipides chargés sur des concentrations spécifiques de MαCD pour un échange lipidique efficace dans les cellules IR CHO. Pour effectuer des expériences d’échange dans d’autres lignées cellulaires, la première étape consiste à déterminer les concentrations lipidiques efficaces dans le milieu d’échange tolérées par les cellules sans compromettre l’intégrité de la membrane ni affecter la viabilité cellulaire 8,9,21. Une large gamme de rapports CD/lipides exogènes doit être testée avec des cellules non traitées. De cette manière, un rapport optimal entre CD et lipides sera identifié lorsqu’il n’y a pas d’arrondi visible des cellules ou de détachement de la plaque (dans le cas des cellules adhérentes), et que la morphologie des cellules traitées est similaire à celle des cellules non traitées. D’un point de vue biochimique, les cellules traitées avec des milieux lipidiques CD doivent être vérifiées pour détecter des perturbations dans la membrane après les échanges lipidiques à l’aide d’un traitement au bleu de trypan et d’une fuite d’iodure de propidium ou d’une liaison à l’annexine V pour tester l’exposition à la PSde surface 21. Les conditions optimales de température et la durée des périodes d’échange varient selon les vésicules lipidiques et doivent être déterminées pour les nouvelles lignées cellulaires. Notre expérience d’échange de lipides a été réalisée exclusivement dans des membranes de cellules vivantes. À notre connaissance, il n’existe aucune preuve d’un échange de lipides réussi dans le lysat cellulaire. Cette technique d’échange lipidique peut être étendue pour modifier la membrane des organites à l’intérieur de la cellule s’ils peuvent être isolés du lysat cellulaire.
Les auteurs ne déclarent aucun conflit d’intérêts.
Le financement a été fourni par GM 122493, subvention des NIH. Les cellules CHO IR ont été offertes par le Dr Jonathan Whittaker (Case Western Reserve University).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1,2-dilauroyl-sn-glycero-3-phosphocholine (DLPC) | Avanti Polar Lipids | 850335 | |
1,2-dimyristoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (DMPC) | Avanti Polar Lipids | 850345 | |
1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (DOPC) | Avanti Polar Lipids | 850375 | |
1,2-dipalmitoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (DPPC) | Avanti Polar Lipids | 850355 | |
1,2-distearoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (DSPC) | Avanti Polar Lipids | 850365 | |
1-palmitoyl-2-oleoyl-sn-glycerol-3-phosphocholine (POPC) | Avanti Polar Lipids | 850457 | |
Anti-insulin receptor β antibody | Cell Signaling Technology | CST3025 | |
Anti-pYpY1162/1163 Insulin receptor antibody | R&D Systems Inc. | AF2507 | |
Anti-rabbit IgG, HRP-linked Antibody | Cell Signaling Technology | 7074 | |
Borosilicate glass test tubes (12 x 75 mm) | Thermo Fisher Scientific | 14-961-26 | |
Brain sphingomyelin (bSM) | Avanti Polar Lipids | 860062 | |
Egg sphingomyelin (eSM) | Avanti Polar Lipids | 860061 | |
Fetal bovine serum (FBS) | Corning | 35-016-CV | |
G418 disulfate salt | Sigma Aldrich | A1720 | |
Gibco Antibiotic-antimycotic solution (100x) | Thermo Fisher Scientific | 15240062 | |
Gibco Dulbecco’s modified eagle medium (DMEM, 4.5 g/L glucose, L-glutamine, sodium pyruvate) | Thermo Fisher Scientific | 11965092 | |
Gibco ham’s F12 media | Thermo Fisher Scientific | 11765054 | |
Gibco L-glutamine | Thermo Fisher Scientific | 25030032 | |
Gibco MEM Non-Essential Amino Acids Solution (100X) | Thermo Fisher Scientific | 11140050 | |
Gibco phosphate buffered saline (PBS) without calcium and magnesium (0.144 g/L KH2PO4, 9 g/L NaCl, 0.795 g/L Na2- HPO4 (anhydrous)) | Thermo Fisher Scientific | 10010023 | |
Gibco Trypsin-EDTA (0.05%), phenol red | Thermo Fisher Scientific | 25300054 | |
High performance thin layer chromatography (HP-TLC) | Merck | HP-TLC Silica Gel 60 plates | |
Immobilon-P PVDF Membrane | Millipore | IPVH00010 | |
Methotrexate | Sigma Aldrich | 454126 | |
Methyl-α-cyclodextrin (MαCD) | AraChem | CDexA076/BR | |
Pierce ECL Western Blotting Substrate | Thermo Fisher Scientific | 32106 | |
Sodium orthovanadate, Activated | Sigma Aldrich | 5.08605 |
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