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Chez les reptiles, les lipides de la peau de leurs congénères sont cruciales pour signalisation sexuelle, avec une utilisation potentielle dans la gestion des espèces envahissantes. Nous décrivons ici les protocoles pour l’extraction des lipides de la peau de peau de hangar ou des animaux entiers, déterminer et analyser la masse de lipides totaux et séparant les lipides à l’aide de fractionnement par chromatographie sur colonne de.
Reptiles de signaux à leurs congénères à l’aide de lipides dans leur peau, principalement pour permettre la mate de suivi et évaluation. L’isolement de ces lipides a une utilité dans la recherche axée sur les tendances évolutives et les mécanismes de communication chimique, en plus de comprendre le rôle d’imperméabilisation des lipides dans l’évolution de la vie terrestre. Dans une approche appliquée, ces indices axés sur la peau ont une utilisation potentielle pour les gestionnaires de la faune portant sur les espèces envahissantes. Les principales étapes pour quantifier les lipides de la peau de reptile dans le protocole présenté ici comprennent l’extraction, dosage des lipides totaux et fractionnement par chromatographie sur colonne de, ce dernier procédé entraînant des éluats purifiées de composés qui peuvent ensuite soit d’être analysés pour attribuer des identifications composées (par exemple, chromatographie en phase gazeuse-spectrométrie de masse [GC-MS]) ou utilisés directement dans des essais biologiques plus raffinés. Les lipides de la peau peut être extraite de la peau vivante, hangar animaux peau ou morts ensemble, en utilisant des solvants organiques non polaires (p. ex., hexane, benzène, toluène). Extraction solubilise les lipides et, ensuite, le solvant peut s’évaporer pour obtenir un extrait lipidique uniquement mesurable. Le fractionnement consiste à séparer l’extrait de lipides totaux dans les éluats spécifiques via traditionnel chromatographie sur colonne. L’extrait lipidique total est d’abord lié à une colonne de substrat (par exemple, alumine) et, ensuite, les éluats individuels (« fractions ») de solvant à des volumes spécifiques sont passés séquentiellement par le biais de la colonne pour éluer les ensembles composés d’un mélange de lipides basée sur la polarité commune. Les progrès de fractions en polarité à une séquence normalisée en augmentant la quantité relative de solvant polaire (par exemple, l’éther diéthylique) dans un solvant non polaire. Dans ce manuscrit, nous décrire plusieurs méthodes d’extraction des lipides de la peau des reptiles et, ensuite, fournir un protocole standard utilisé pour isoler les différentes séries de composés basés sur la polarité, chromatographie sur colonne traditionnel. Extrait lipidique entier ou fractions spécifiques, puis, utilisable dans des essais biologiques pour déterminer toute activité biologique induite par les composés qui y sont.
Reptiles produisent des lipides dans l’épiderme, directement à partir de cellules de la peau ou des glandes discrètes qui sont utilisés dans la communication sociale, tels que mate évaluation et suivi, territorialité et intra - et interspécifique reconnaissance1,2 ,3,4. L’isolement de ces lipides de la peau a une utilité dans la recherche axée sur les tendances évolutives et les mécanismes de communication chimique, en plus de comprendre le rôle d’imperméabilisation des lipides dans l’évolution de la vie terrestre2,3 ,4. En outre, de nombreux reptiles, en particulier les squamates (lézards, serpents), sont des espèces envahissantes préoccupantes dans les écosystèmes sensibles, et le développement de leurres à base de phéromones afin d’améliorer le piégeage et la suppression est en cours de5,6. L’imperméabilité de la peau de reptile facilite l’extraction des lipides précisées afin d’obtenir des extractions relativement pures d’une source potentiellement robuste de signaux chimiques. Les étapes du principe de quantification des lipides de la peau de reptile dans le protocole décrit comprennent l’extraction, dosage des lipides totaux et fractionnement via la colonne chromatographie1,6,7. Les méthodes ont été utilisées systématiquement car elles donnent des isolats bioactifs qui expliquent beaucoup sur le choix d’un partenaire et de sélection, en particulier dans les serpents2.
Les lipides de la peau peuvent être extrait de peau vivante, peau de hangar, ou reptiles morts ensemble, en utilisant non polaires ou des solvants organiques polaires1,7,8,9. Il est à noter que les spécimens de musée conservés dans des solvants comme l’éthanol ne sont pas optimales pour l’extraction des lipides de la peau, et seulement fraîches ou congelées fraîchement carcasses devraient être considérés comme des sources possibles pour l’extraction. Les lipides de la peau sont inertes, ce qui les rend stables sur la surface de la peau et facile à extraire7. Dans leurs rôles de signalisation en écologie de reptile, peau lipides repères sont souvent déposés dans des environnements difficiles, mais en raison de leurs propriétés chimiques robustes, ces repères peuvent conserver leur valeur informative sur de longues périodes de temps10,11 , 12. le processus d’extraction solubilise les lipides, à l’aide d’un solvant non polaire (par exemple, hexane, benzène, toluène) sur un trempage de longue heures, suivi par l’évaporation du solvant, de quitter une masse mesurable de lipides extrait7 , 8. les lipides de la peau sont très miscibles dans les solvants non polaires, et un large éventail d’hydrocarbures peut être extraites de la même manière une grande diversité de sources.
Le fractionnement est plus laborieux que l’extraction mais sert à séparer l’extrait lipidique total en fractions spécifiques par chromatographie sur colonne, pour aider à l’identification possible et de purification des composés qui y1, 6 , 7 , 8. l’extrait lipidique total est lié à une colonne de substrat, et ensuite, éluats individuels (« fractions ») de solvant à des volumes spécifiques sont passés séquentiellement à travers la colonne pour éluer les ensembles composés d’un mélange de lipides disposant d’un commun polarité6,7,8. En chromatographie de lipide, les progrès de fractions en polarité à certains normalisé séquence en augmentant la quantité relative de solvant polaire (par exemple, l’éther diéthylique) dans un solvant non polaire (généralement exprimée en pourcentage : 0 %, 2 %, 4 % éther, etc.. )6,7,8. Bien que les méthodes comme la chromatographie sur couche mince (TLC) peut être utilisé pour séparer les lipides dans un mélange et sont plus simples, chromatographie sur colonne est préféré parce qu’il utilise un système fermé, est facile à contrôler, peut plus distinct mélanges de concentrés et est compatible avec multiplexage d’efficacité. Dans ce manuscrit, nous décrire plusieurs méthodes d’extraction des lipides de la peau des reptiles et, ensuite, fournir un protocole standard utilisé pour isoler les différentes séries de composés basés sur la polarité, chromatographie sur colonne traditionnel. Dans de nombreux projets de recherche impliquant l’isolement de signaux chimiques, le but ultime est d’apporter des changements dans les récepteurs exposés à ces indices. Extrait lipidique entier ou fractions spécifiques, puis, utilisable dans des essais biologiques pour déterminer que toute activité biologique induites par les composés qui y1,2,6,7. Dans la recherche fondamentale en biologie, par exemple, des essais sur des fractions spécifiques peuvent révéler aux chercheurs que source purifiée de phéromones a été isolée, et puis, les méthodes pour l’identification des composés cibles peuvent être engagées. Dans une perspective de gestion de la faune, d’identification ne peut pas être l’objectif, et au lieu de cela, la fraction active pourrait être utilisée dans le domaine pour attirer leurs congénères dans des pièges ou inhiber mate suivi dans l’habitat non indigènes13,14.
Toutes les procédures impliquant l’utilisation de vertébrés ont été approuvées par le Comité utiliser de James Madison University et d’institutionnels animalier.
1. extraction
2. détermination de la masse lipidique
Remarque : L’extrait lipidique masse peut être déterminé de deux manières : avec un flacon de verre ou avec un ballon à fond rond, à l’aide d’un évaporateur rotatif.
3. chromatographie sur colonne
NOTE : Pour séparer des composés inconnus basées sur la polarité en fractions spécifiques, extrait lipidique masse peut être des colonnes de chromatographie en phase liquide ajouté à préparé et fractionnés en utilisant le standard d’élution.
4. nettoyage
Extraction suivante, lipides totaux masse est le premier type de données qui peuvent être acquises via le protocole présenté ici. Toutefois, valeurs de masse lipidique total jamais il faudrait analyser sans quelque tentative de normaliser les valeurs obtenues. Plusieurs approches peuvent être utilisées, mais il est recommandé soit de normaliser la masse de l’extrait lipidique de l’animal SVL (en centimètres) ou à la masse de la peau de hangar qui a été extrait. Les anciens résultats dans une valeur de lipide-masse-par-longueur et ce dernier sera une proportion de source massive. La raison de la normalisation, c’est que les plus grands animaux produisent naturellement les lipides de la peau plus parce qu’ils ont une plus grande surface de peau totale. Figure 1 a illustre bien cette association, où les échelles masse de peau extrait lipidique linéairement avec la masse du hangar extraite de la peau. Une fois normalisé à la masse de peau remise totale, cette relation linéaire est complètement retiré (Figure 1 b).
Après fractionnement, la même approche de normalisation peut être utilisée avec les masses des fractions individuelles (Figure 2). Dans ce jeu de données d’exemple, chaque fraction pas contribue également à lipides extraits totaux masse : lipides neutres (fractions de 1-3) sont l’ensemble dominant des composés de masse proportion par rapport à chaque ensemble de lipides polaires plus (fractions 4-6, 7-9 et 10-12).
Figure 1 : relations entre extrait lipidique massive et d’entrée matériau. (A) chez les reptiles, la relation entre le hangar total peau de masse et les lipides de la peau extrait masse est corrélé positivement (P < 0,001). (B) lorsque les lipides de la peau extrait masse est standardisé pour le montant total versé en masse (lipide masse divisée par le hangar massive), cette relation n’est plus présente (P = 0,46). S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.
Figure 2 : normalisés des masses de fraction après élution. Chromatographie sur colonne, extraits de lipides de la peau peuvent être éluées en fractions, basées sur la polarité composée. La fraction de masse est, ensuite, exprimée en pourcentage de l’extrait de lipides totaux (fraction masse [en mg] divisée par la masse extrait lipidique total [en milligrammes) pour déterminer les différences entre les fractions ou expérimental regroupe8. Les barres représentent les moyens. L’erreur supérieure est SEM ; l’erreur de fond est IC à 95 %. Points de données individuels sont fournis par souci de clarté. S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.
Figure 3 : représentant chromatographes en phase gazeuse des fractions de méthyl cétone. (A) avec l’élution appropriée, méthyl cétones sont des composés les plus abondants dans la fraction 7 du tableau 2 et peut être considérées comme distiques de pics (temps de rétention = 24-34 min). (B) Fraction 6 du tableau 2, cependant, seulement donne des composés. Ce même résultat peut se produire lorsque le solvant polaire utilisé dans la phase mobile est expiré ou si la colonne est arrêtée pour de longues périodes (> 1 h) entre les fractions. Notez la différence en abondance moléculaire entre les deux traces. S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.
Fraction | Hexane (mL) | Éther diéthylique (mL) |
1,2,3 | 100 [30] | 0 [0] |
4,5,6 | 98 [29,4] | 2 [0,6] |
7,8,9 | 96 [28,8] | 4 [1.2] |
10,11,12 | 92 [27,6] | 8 [2.4] |
13,14,15 | 84 [25,2] | 16 [4.8] |
Tableau 1 : volume d’élution Standard pour fractionnement de lipides de la peau. Pourcentages et volumes de solvants sont donnés pour les gros volumes (par exemple, 250 mL) et les [petits] (p. ex., 100 mL) colonnes de chromatographie à l’aide d’alumine (activité III). Hexane est le solvant ; l’éther est la phase mobile.
Fraction | Hexane (mL) | Éther diéthylique (mL) | Notes |
1, 2, 3 | 30 | 0 | éluer ; ne pas prélever |
4, 5 | 28,8 | 1.2 | éluer ; ne pas prélever |
6, 7, 8 | 28,8 | 1.2 | collecter individuellement ; la majorité des méthylcétone masse sera en fraction 7 ; GC-MS de contrôles de qualité doivent être exécutés sur les 6 et 8 pour assurer la correcte d’élution des cétones |
Tableau 2 : régime d’élution mis à jour le thamnophis méthyl cétones. Ces volumes sont à utiliser avec une colonne de chromatographie de petit volume et avec la marque de l’alumine actuellement disponible. La fraction éluée positive pour les méthyl cétones a une bioactivité forte dans des essais de terrain avec wild, courtisant les couleuvres mâle1,7. Pour confirmer la présence de méthyl cétones dans les fractions de la cible, les échantillons peuvent être dilués à 1 mg/mL et analysés par GC-Mme Figure 3 fournit des chromatogrammes représentatifs pour les résultats positifs et négatifs après élution.
L’extraction des lipides de la peau chez les reptiles peut être appliquée à la peau vivante ou morte, en plus de la peau de hangar, qui offre la polyvalence dans l’expérience de l’application de cette technique. En outre, extraction des lipides de la peau peut être faite sur le terrain, pour permettre une application dynamique de la méthode à un large éventail de biologistes2,13. Extraction des lipides de la peau est simple ; par conséquent, il est facile intensifier les extractions selon les besoins par l’expérience ou de conception, et praticiens ne doivent pas avoir une expertise appréciable pour exécuter les méthodes. Les seuls facteurs limitants pour amplifier sont la disponibilité de l’espace de hotte des fumées, une abondance de verrerie propre et scellable et espace de stockage de solvants.
Peau lipides extrait de fractionnement peut être adapté aux besoins du chercheur et, a donc la même souplesse à l’extraction des lipides. Par exemple, les lipides neutres peuvent être éluées et ensuite rejetées, pour aboutir à des fractions de cible qui peuvent purifier les composés d’intérêt ou de simplifier les tests biologiques. Le fractionnement peut être effectué à plusieurs échelles au sein et entre les échantillons de lipides. Par exemple, plusieurs colonnes peuvent être exécutés en même temps pour rendre le processus plus efficace. Ou bien, une partie seulement d’un extrait lipidique total peut être fractionnée sur une petite colonne pour, ainsi, de rechange réactifs et temps. Le fractionnement est principalement limité par la masse de l’extrait de lipides totaux et la précision de l’équipement disponible au chercheur. Par exemple, si le chercheur a une balance avec une précision de 10,0 mg, la détermination de la fraction de masse et, par conséquent, la précision de la préparation des échantillons pour l’analyse par CPG-SM est significative, si ce n’est pas complètement, fait obstacle. Il en va de même pour la verrerie. Si le chercheur dispose d’une colonne de grand volume pour le fractionnement, mais a une masse de petites lipides totaux pour séparer l’élution ou la séparation des composés progressera mais nécessitera un gaspillage considérable de solvants, réactifs, temps et potentiellement, la cible les composés eux-mêmes.
Il est conseillé d’effectuer un contrôle de qualité avant de déterminer le régime de l’élution, comme on le voit dans le tableau 2et de décider quelles fractions peuvent être rejetées. Pour confirmer l’élution des lipides désirées, une colonne peut être exécuter où chaque fraction, 1-15, est recueillie individuellement et ensuite analysée en utilisant GC-MS. Dans la Figure 3, représentant chromatographe en phase gazeuse des traces montrent que les méthyl cétones de couleuvres éluer seulement de la colonne dans une fraction spécifique. En effectuant cette étape de contrôle de la qualité, un schéma d’élution modifiés peut être développé pour une espèce donnée afin d’assurer le rendement maximum des composés d’intérêt. Changements dans les matériaux, tels que le fournisseur ou le lot de l’alumine ou l’âge de l’éther diéthylique, entraînera absolument différences d’élution qui doit être contrôlé pour en effectuant un essai de contrôle de la qualité.
Les techniques décrites sont limités principalement par la nature chimique des signaux qui peuvent être obtenus. Principalement, ces méthodes n’autorisent que les chercheurs isoler et séparer la longue chaîne de lipides de la peau des reptiles. De nombreuses espèces de reptiles utilisent des signaux aéroportés ou protéiques comme des signaux chimiques, et les méthodes décrites sont incompatibles avec ladite indices d’isolement. Autres solvants non polaires extraira pas cues aqueux de la surface des reptiles ou sources de dépôts de repère (par exemple, eau de la cage, les matières fécales, substrat aquatique) qui peuvent en effet contenir abondante des signaux chimiques. Les méthodes appropriées pour la capture de ces types de signaux sont accessibles aux chercheurs (p. ex., solid-phase microextraction [SPME] pour repères volatils et la chromatographie liquide à haute performance [HPLC] pour signaux aqueux), bien que, comme les méthodes décrit ci-dessus, il y a une courbe d’apprentissage technique.
Plus important encore, l’utilité de la bouillie chimique finale au chercheur devrait guider les méthodes utilisées. Par exemple, si un chercheur veut savoir si un animal mâle focal peut distinguer entre les repères produites par mâle vs femelle congénères dans un bioessai ciblé, l’extraction est que la seule méthode nécessaires2,3. Si l’identification de composés présente un dimorphisme sexuel est le but, cependant, l’extrait devait être purifiés, afin de permettre une plus grande confiance dans l’attribution des identifications à des molécules spécifiques ou des groupes de molécules par analyse chimique1, 6,9,11. Cependant, pour la même conduite chromatographie avec une source de lipides, une masse importante de démarrage extrait est nécessaire pour que les masses de fraction mesurable peuvent être obtenus ; dans le cas contraire, la mise en commun des échantillons peut être poursuivi, mais n’est pas optimale14.
Les développements futurs de ce protocole comprennent des mesures pour utiliser et adapter la procédure pour les espèces plus reptiliens. Autres méthodes non invasives d’extraction des lipides de la peau sont également développées.
Les auteurs n’ont rien à divulguer.
Le développement de ces méthodes, surtout hangar de l’extraction de lipides peau, s’est produite lors des accords de coopération (14-7412-1061-CA, 15-7412-1155-CA et 16-7412-1269-CA) entre James Madison University (JMU) et l’US Department of Agriculture Animal et Plant Health Inspection Service (APHIS). M.R.P. reconnaît les contributions des élèves suivants pour le développement des méthodes hangar peau : S. Patel (Washington and Lee University [WLU]), J. Zachry (Université Wilfrid Laurier), R. Flores (JMU), J. Noll (JMU) et S. Ashton (JMU).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Powder-free Chloroprene Gloves | Microflex | NEC-288 | See "1.1 Shed Extraction set-up" (step 1.1.2 "gloves") |
Ohaus Adventurer Precision Balance | Ohaus | AX622 | See "1.1 Shed Extraction set-up" (step 1.1.3 "balance") |
Freund Container Ball 16oz Mason Jar & Lid | Ball | NC9661590 | See "1.1 Shed Extraction set-up" (step 1.1.5 "mason jar") |
Hexane, Mixtures of Isomers | Sigma-Aldrich | 650544 | See "1.1 Shed Extraction set-up" (step 1.1.6 "hexane") |
Hi/Lo Write-On Temperature Tape | Electron Microscopy Sciences | 5029927 | See "1.1 Shed Extraction set-up" (step 1.1.8 "tape") |
Single-Neck Round-Bottom Flask, capacity 500 mL | Sigma-Aldrich | Z414514 | See "2. Extraction" (step 2.1.2.4 "500 mL") |
Single-Neck Round-Bottom Flask, capacity 100 mL | Sigma-Aldrich | Z414492 | See "3.2 Fractionating" (step 3.2.4 "100 mL") |
Cork Flask Support Ring | Sigma-Aldrich | Z512419 | See "2. Extraction" (step 2.1.2.1 "cork support ring") |
Accu-jet Pro Pipette Controller | Sigma-Aldrich | Z671533 | See "2. Extraction" (step 2.1.1.3 "electric pipette controller") |
Disposable Individually Wrapped Glass Serological Pipets, 10 mL | Pyrex | 13-666-7E | See "2. Extraction" (step 2.1.1.3 "10 mL pipette") |
Rotavapor R II | Buchi | 2422A0 | See "2. Extraction" (step 2.1.2.1 "rotary evaporator") |
Elliptical Bump Trap | Chemglass Life Science | 501215241 | See "2. Extraction" (step 2.1.2.1 "bump trap") |
7 mL Vials, Screw Top, Clear Glass | Supelco | 27151 | See "1.1 Shed Extraction set-up" (step 1.1.11 "7 mL vial") |
7 mL Vial Screw Cap, Solid Top with PTFE Liner | Supelco | 27152 | See "1.1 Shed Extraction set-up" (step 1.1.11 "cap") |
22 mL Vials, Screw Top, Clear Glass | Supelco | 27173 | See "1.1 Shed Extraction set-up" (step 1.1.11 "22 mL vial") |
22 mL Vial Screw Cap, Solid Top with PTFE Liner | Supelco | 27174-U | See "1.1 Shed Extraction set-up" (step 1.1.11 "cap") |
Excellence XS Analytical Balance | Mettler-Toledo | XS205DU | See "2. Extraction" (step 2.1.2.1 "balance") |
5 3/4" Disposable Glass Pipette | Fisherbrand | NC0418555 | See "1.1 Shed Extraction set-up" (step 1.1.11 "pipette") |
Chromatography column with PTFE Stopcock Assembly | Kimble-Chase | 17810-19300 | See "3.1 Preparing the column" (step 3.1.1 "small glass column") |
Cast-Iron L-Shaped Base Support Stands | Fischerbrand | 11474207 | See "3.1 Preparing the column" (step 3.1.1 "support stand") |
3-Prong Dual Adjust Nickel-Plated Zinc Clamp | Troemner | 2300203 | See "3.1 Preparing the column" (step 3.1.1 "clamps") |
Clamp Regular Holder | Fischerbrand | 05754Q | See "3.1 Preparing the column" (step 3.1.1 "clamp holder") |
Sand,Washed and Dried | Macron Fine Chemical | MK-7062-212 | See "3.1 Preparing the column" (step 3.1.5 "sand") |
Alumina, Neutral | Sorbtech | 15740-5 | See "3.1 Preparing the column" (step 3.1.7 "alumina"); only known manufacturer in the US |
Narrow-Neck Heavy-Duty Glass Erlenmeyer Flask, 1000mL | Pyrex | 4980-1L | See "3.1 Preparing the column" (step 3.1.6 "Erlenmeyer flask") |
Single-Neck Round-Bottom Flask, capacity 250 mL | Sigma-Aldrich | Z100684 | See "3.1 Preparing the column" (step 3.2.4 "250 mL round bottom flask") |
Calibrated Chromatography Column with Solvent Reservoir | Sigma-Aldrich | Z560553 | See "3.2 Preparing the column" (step 3.2.1 "large glass column") |
Ethyl Ether Anhydrous | Fisher Chemical | E138500 | See "3.2 Fractionating" (step 3.2.5 "ether") |
Alconox Detergnet | Sigma-Aldrich | 242985 | See "4. Cleaning" (step 4.2 "Alconox") |
Acetone (Certified ACS) | Fisher Chemical | A18P-4 | See "4. Cleaning" (step 4.4 "acetone") |
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