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Este protocolo detalla un método para aislar células presentadoras de antígeno de timo humano a través de diferentes etapas de la digestión enzimática del tejido seguido por centrifugación de densidad de la suspensión de células individuales y la clasificación finalmente magnético y / o FACS de las poblaciones de células de interés.
En este protocolo se proporciona un método para aislar células dendríticas (DC) y células epiteliales (TEC) de la timo humano. DC y TEC son la principal célula presentadora de antígeno (APC) tipos que se encuentran en un timo normal y está bien establecido que desempeñan papeles distintos durante la selección tímica. Estas células se localizan en distintos microambientes en el timo y cada tipo de APC constituye sólo una población menor de células. Para entender mejor la biología de estos tipos de células, la caracterización de estas poblaciones de células es altamente deseable, pero debido a su baja frecuencia, el aislamiento de cualquiera de estos tipos de células requiere un procedimiento eficaz y reproducible. Este protocolo detalla un método para obtener células adecuadas para la caracterización de diversas propiedades celulares. Tejido tímico se interrumpe mecánicamente y después de diferentes pasos de la digestión enzimática, la suspensión de células resultante se enriquece usando una etapa de centrifugación de densidad de Percoll. Para el aislamiento de CC mieloide (CD11c <sup> +), las células de la fracción de baja densidad (LDF) se inmunoselecciona por clasificación celular magnética. Enriquecimiento de las poblaciones de TEC (MTEC, ctec) se logra por el agotamiento de las células hematopoyéticas (CD45 hi) de la fracción de células de Percoll de baja densidad que permite su posterior aislamiento a través de células activadas por fluorescencia (FACS) utilizando marcadores de células específicos. Las células aisladas se pueden utilizar para diferentes aplicaciones posteriores.
El timo es el órgano en el que se produce el desarrollo de células T. Su tamaño relativo y absoluto disminuye con la edad cuando se convierte sustituido sucesivamente por la grasa a pesar de la actividad del timo todavía se puede detectar en la vejez. Su importancia para la respuesta inmune se demostró a principios del decenio de 1960 1.
El repertorio de células T se forma a través de la interacción de receptores de células T con complejos de péptido-MHC en diferentes tipos de timo de APC, que proporcionan señales de supervivencia o muerte para el desarrollo de las células T, lo que resulta en un repertorio de células T funcionales y en gran medida auto-tolerante 2.
Aproximadamente el 98% de las células en el timo humano están desarrollando células T que se hace referencia como timocitos. El 2% restante consiste de un número de diferentes tipos de células, incluyendo una variedad de TEC (cortical, medular, subcapsular), mieloide y plasmocitoide DC (MDC, PDC), macrófagos, células B, células T re-circulantes maduras, granulocitos, Fibroblasts, células endoteliales y células epiteliales muy raras con un fenotipo de expresión se asemeja a la de las células de otros tejidos tales como músculo, neuronas y epitelio respiratorio (Figura 1). De éstos, TEC y DC son los principales tipos de APC se encuentran en un timo normal. En los últimos años, la purificación de estos tipos de APC para la cultura y el perfil molecular ha ganado cada vez más interés. Debido a su baja frecuencia, el aislamiento de cualquiera de estos tipos de células para el análisis detallado requiere un procedimiento eficaz, reproducible y rentable. El método que aquí se presenta es una modificación de los estudios publicados previamente 3,4.
Al igual que con cualquier otro tejido, la extracción de células del timo se puede lograr por enzimáticamente la desagregación de la célula-célula y las redes de interacción célula-matriz, con el fin de obtener una suspensión de células individuales. Hay ciertos parámetros como la buena eficiencia de disociación, rendimiento celular, la viabilidad celular y la retención de s célulasmarcadores urface que son cruciales y necesitan ser optimizado para el aislamiento con éxito de estas poblaciones celulares raras.
En este protocolo, el aislamiento de la CC y subconjuntos TEC se realiza haciendo una suspensión de una sola célula del tejido por rotura mecánica y digestión enzimática. Utilizamos colagenasa A de Clostridium histolyticum, que tiene una relación equilibrada de las diferentes actividades de la enzima, para romper el colágeno natural que mantiene el tejido juntos. DNasa I se incluye en la solución de la enzima para reducir la agregación celular debido a ADN libre de células muertas (timocitos son muy sensibles). Nosotros también ofrecemos un enfoque alternativo para la digestión enzimática del tejido típico que implica el tratamiento de tejidos mecánica y enzimática asistida por un disociador tejido. La suspensión de células individuales se somete entonces a una sola centrifugación de densidad de Percoll para el enriquecimiento de la fracción de baja densidad (LDF) de las células. A partir de esta fracción de células, DC puede ser aislado por tinción fo marcadores CC-superficie (es decir, CD11c +) y mediante separación magnética o células activadas por fluorescencia (FACS). A diferencia de las células linfoides que comprenden la gran mayoría de las células en el timo, TCE no expresan CD45 en niveles altos, pero son positivos para la molécula de adhesión celular epitelial EpCAM. ctec se puede distinguir de TCE medular por la expresión de un antígeno aún sin definir reconocido por el CDR-2 (dendrítica de reticulocitos-2 cortical) de anticuerpos 4,5 y algo menor expresión de EpCAM. El diferencial de la co-expresión de EpCAM y CDR2 permite el aislamiento eficiente de estos subconjuntos TEC a través de células de alta velocidad de clasificación 6.
El protocolo que se presenta aquí está optimizado para el tejido del timo humano. La duración del procedimiento depende de la cantidad de tejido y la capacidad del experimentador, así como la velocidad del clasificador de células, si se utiliza la separación FACS. Normalmente, el protocolo para el aislamiento de CC puede ser completado dentro de 5HR -6 y para el aislamiento de TCE en 8-10 horas. El aislamiento de la CC y subconjuntos TEC a partir de tejido del timo es sensible al tiempo. Cuanto más rápido el procedimiento de aislamiento, mejor la condición de las células. Por último, las células aisladas se pueden utilizar para investigaciones posteriores como estudios comparativos de ARNm y la expresión de proteínas, los experimentos de PCR, aislamiento de las proteínas, el perfil molecular (es decir, transcriptómica, análisis de micro ARN), así como el cultivo de células 6.
Declaración de Ética
Con el fin de ser capaz de trabajar con el tejido del timo humana que el investigador tiene que obtener la aprobación del comité de ética local o las autoridades responsables, así como un consentimiento informado por escrito del donante (o por lo general sus padres, ya que el tejido se obtiene generalmente de menor de edad los niños). Por otra parte, todos los tejidos humanos deben ser manejados como se deben tomar medidas potencialmente infecciosos y apropiadas, tales como trabajar con guantes, etc.
1. Preparación de herramientas, soluciones de enzimas y tampones
Lleve a cabo los siguientes pasos de preparación antes de comenzar el protocolo.
2. Preparación del tejido
El procesamiento del tejido se debe realizar utilizando reactivos estériles y trabajar en una cabina de flujo laminar. Antes de comenzar el procedimiento, se preparan los siguientes reactivos y equipos:
Nota: la duración de este paso depende de la condición y tamaño del tejido. Aproximadamente 20 a 30 min se necesita tiempo razonable para una pieza de tamaño medio de tincidencia en buen estado (~ 5 cm de ancho).
Nota: Para la reproducibilidad de los resultados, el tejido debe ser cortado en trozos de tamaño uniforme.
Consejo: Un raspador de cultivo celular estéril se puede utilizar para concentrar todos los trozos de tejido en un lado del plato y luego inclinar el plato (45 ° de ángulo) y aspirar el sobrenadante. Reemplazar con PBS fresco y repita este procedimiento hasta que el sobrenadante es relativamente transparente. Realice último lavado con RPMI sin formato.
3. Preparación de la suspensión de células individuales de tejido del timo
Aquí,se describen dos enfoques alternativos para este paso. El primer enfoque se describe una digestión enzimática de tejidos típicos (sección 3.1), mientras que el segundo consiste en el tratamiento de tejidos mecánica y enzimática asistida por un disociador de tejido (sección 3.2).
Este protocolo está optimizado para el procesamiento de muestras de tejido que pesan 5 g. Para muestras de tejido más grandes o más pequeñas, ajustar los volúmenes de la enzima en consecuencia.
3,1 Típica digestión enzimática de tejido para obtener una suspensión de células individuales
Nota: en un tubo de 50 ml de digerir hasta 10 g de tejido. Ajuste el volumen de la enzima en consecuencia.
Nota: los pasos de incubación se pueden realizar ya sea en un incubador térmica con una unidad de rotación, o en una incubadora bacteriana 37 ° C con un agitador.
Nota: los tejidos tímicos pueden variar en su composición, especialmente con la edad, que afecta a la eficiencia de la digestión y la generación de una suspensión de una sola célula.
Nota: El tejido no puede ser digerido por completo después de estas tres rondas de las digestiones. La edad y el estado general del tejido son dos parámetros que influyen en la eficiencia de disociación del tejido del timo.
Consejo: Los sedimentos celulares son bastante flojo, así que tenga cuidado cuando deseche / aspiración sobrenadante.
3.2 de tratamiento del tejido mecánico y enzimático asistido por un disociador tejido
Uso del tejido disociador aproximan los pasos de digestión del tejido se pueden reducir a la mitad el tiempo necesario con el enfoque descrito anteriormente (sección 3.1). El siguiente protocolo es una versión modificada de la utilizada para disociar tejido del timo de ratón para el aislamiento de TCE 7,8.
Nota: Utilizando este enfoque, después de esta última digestión paso el tejido es generalmente completamente disociado y no se observan fragmentos de tejido no digerido.
4. Enriquecimiento de LDF de las células con separación Percoll densidad
Después de la digestión enzimática del tejido, el total de suspensiones de células individuales tímicos se someten a un solo centrifugat densidad de Percollpaso de iones para enriquecer las células LDF. El LDF de las células es altamente enriquecido para APC. Tanto DC y TEC se detectan en esta fracción de las células.
Preparación de la solución de Percoll a una densidad final de 1,07 g / ml (ρ = 1,07) | ||||
Tubo Número | 1 | 2 | 3 | 4 |
Sin diluir Percoll (ρ = 1,130) (ml) | 2.96 | 5.92 | 8.88 | 11.84 |
NaCl 1,5 M (ml) | 0.6 | 1.20 | 1.8 | 2.4 |
H 2 O destilada (ml) | 2.44 | 4.88 | 7.32 | 9.76 |
Volumen de dilución final de trabajo | 6 ml | 12 ml | 18 ml | 24 ml |
Consejo: Percoll es sensible a la luz y, además, hay que tener frío. Preparar primero la mezcla que contiene el NaCl y H2O (RT) y añadir sin diluir de Percoll pasado, justo antes de resuspender las células en la solución de Percoll.
tienda "> Nota: la densidad de Percoll puede variar entre los diferentes proveedores y lotes Si la densidad de la solución de Percoll sin diluir no es igual a 1,130 g / ml, siga las instrucciones proporcionadas por el fabricante para calcular las cantidades exactas de Percoll y H 2 O requerida para conseguir una densidad final de 1,07 g / ml.Nota: En esta etapa, es posible observar que las células agregadas en la suspensión (especialmente con muestras de niños de mayor edad). Grupos de células son indicación de la muerte celular y el resultado de la liberación de ADN de las células que mueren que se pueden pegar las células juntas. En tal caso, añadir DNasa I en la muestra (50 g / ml) y se incuba durante un máximo de 20 min a TA (invertir suavemente cada 5 min) para digerir las moléculas de ADN libre.
5. Aislamiento de tímico mDC
Después del enriquecimiento de APC (a través de la separación de Percoll), MDC se puede aislar de manera eficiente desde el LDF después de la primera y segunda ronda de digestiones enzimáticas. El siguiente protocolo es una versión modificada de la separación celular magnética para el aislamiento de MDC (CD11c +).
Nota: Los experimentos de titulación se recomienda para obtener resultados óptimos.
Nota: CD11c + MDC también se puede aislar utilizando un clasificador FACS.
6. El enriquecimiento de las células CD45 altas / neg para la clasificación de células de TEC
Para el aislamiento de TCE, las células pueden ser pre-enriquecidos por agotamiento de las células CD45 hi utilizando microperlas CD45, con el fin de acelerar su aislamiento a través de la clasificación de células.
Utilice suspensión de células individuales obtenidos a partir de la etapa de digestión 3 ª (3.1.14) y posteriormente separados por centrifugación de Percoll.
Nota: Mediante el uso de una menor cantidadde las microperlas que pre-enriquecemos células tanto para CD45 lo y neg células CD45. Se recomienda titulación para obtener resultados óptimos.
7. Las células de la mancha para la clasificación de células de fluorescencia Activado
Muestra | Tipo de muestra | Anticuerpo | Número de la célula | Volumen total |
1. sin mancha | control | 1 x 10 6 | 50 l | |
2.scc *-Pacific Blue | control | CD45-Pacific Blue | 1 x 10 6 | 50 l |
3. scc-APC | control | CD3-APC | 1 x 10 6 | 50 l |
4.scc-Alexa 488 | control | CD8-Alexa 488 | 1 x 10 6 | 50 l |
5. Célula de clasificación | analito | CD45-Pacific Blue EpCAM-APC CDR2-Alexa 488 | 10 x 10 6 - 50 x 10 6 | 500 l 10 x 10 6 l células/100 |
* Scc, solo control de color
Notas:
8. Aislamiento de TCE por fluorescencia la clasificación de células Activado
Subconjuntos TEC pueden ser ordenadas por la fracción más altas / neg CD45 como hi EpCAM CDR2 - (MTEC) o EpCAM lo CDR2 + (CTEC).
Nota: Durante la clasificación con el fin de evitar que las células se adhieran a los lados del tubo de recogida, el tubo puede ser pre-recubierto por llenándolo con 50% de FCS en PBS y se incubó a TA durante 30 min. Deseche la solución de revestimiento antes de la adición de medios de cobro.
Como material de partida en este protocolo se utiliza tejido del timo retirado de los niños sometidos a cirugía cardiovascular correctiva (Departamento de Cirugía Torácica y Cardiovascular, Clínica Universitaria de Tubinga) obtenidas después de consentimiento informado y bajo las directrices del centro. Este material de desecho puede variar mucho en tamaño de 2 a 30 g o más. El número de MDC y subconjuntos TEC (ctec y MTEC) que se obtienen dependen del tamaño, así como la edad de la muestra de tejido de timo usada para el aislamiento.
La Figura 2 muestra una pieza bastante grande de tejido (~ 9 cm) obtenido a partir de un niño de seis años de edad. Una primera etapa preparativa importante en este protocolo es la limpieza del tejido de las partes no deseables (indicadas por las flechas blancas).
El tejido del timo fue tratado como se indica en las secciones 2 y 3.1 del protocolo para obtener una suspensión de células que se separó utilizando una sola densidad Percoll centrifugación sTEP mientras que la suspensión de una sola célula contiene aproximadamente el 3% de las células HLA-DR + (Figura 3A), después de la centrifugación de Percoll este porcentaje se incrementa en la fracción de baja densidad (LDF), que contiene células de gran tamaño, a 15-40%, mientras que el fracción de alta densidad (HDF) que se compone principalmente de uniformes de pequeño tamaño timocitos contiene prácticamente ningún tipo de células (Figura 3B). La fracción de interés (LDF), que contiene enriquecido de APC se recogió y se lavó para recoger las células para su uso en etapas de aislamiento posteriores posteriormente.
Mientras tímico MDC puede ser identificado por la expresión de un número de marcadores de superficie, incluyendo CD11c9, 10, PDC expresan marcadores tales como BDCA-2, BDCA-4, CD45RA y CD123 11,12. Después del enriquecimiento de las células LDF, ambos tipos de células constituyen 2-10% de esta fracción, lo que permite su aislamiento eficiente también en grandes cantidades, ya sea por separación celular magnética o el flujo de clasificación de CD11c + o BDCA-4 +células 6.
La figura 4 muestra el aislamiento eficiente de células CD11c + utilizando el protocolo de separación celular magnética modificado descrito en la sección 5. Después del aislamiento, la pureza de la CD11c + CC fue del 93% según lo establecido por la inmunotinción de las células aisladas. En promedio, la recuperación de los aislados CD11c + DC es de 5 x 10 5 x 10 -5 6 mDC por 10 9 células del timo total de datos. Tabla 1 muestra los obtenidos a partir de varias muestras de timo individuales de diferente edad y el peso del tejido con un rango de entrada única Las suspensiones de células, así como el número total de LDF y el CD11c + posterior rendimiento y pureza.
En la fracción enriquecida de APC, sólo aproximadamente el 0,5% de las células son CD45 Lo EpCAM + o CD45 + Neg EpCAM. CTEC y MTEC pueden ser ordenadas por los CD45 altas / neg células estromales enriquecidos tripsina digerido como EpCAM l O CDR2 + y EpCAM de alta CDR2 -, respectivamente, como se muestra en la Figura 5.
Figura 1. Un diagrama simplificado de la organización celular y la composición del timo humano. El timo consiste en timocitos, en las diferentes etapas de maduración, y una red celular heterogénea conoce como el estroma tímico que forman el medio ambiente tímico. Los principales tipos de células del estroma del timo, las células son MDC y PDC epiteliales (divididas en dos categorías principales en función de su localización dentro del lóbulo: cortical y medular) y macrófagos Abreviaturas: CC, células dendríticas, células dendríticas mieloides, MDC;. pDC, las células dendríticas plasmocitoides; Mφ, macrófagos; mono, monocitos; CTEC, las células epiteliales corticales; MTEC, las células epiteliales medulares.
Figura 3. La purificación de tímico análisis de APC. FACS de las diferentes etapas del procedimiento de purificación. Suspensiones celulares individuales de tejido del timo se obtuvieron mediante rotura mecánica y digestiones enzimáticas de serie y APC enriquecidos (células LDF) por separación de Percoll-densidad. Las células antes (A) y después (B) de la separación Percoll densidad se tiñeron con anticuerpos HLA-DR-PE para comprobar el enriquecimiento APC. Rango de porcentaje de células HLA-DR + observadas normalmente es mó ed.
Figura 4. Aislamiento de CD11c + MDC. Tejido del timo se digirió utilizando colagenasa A / DNasa I para crear una suspensión de células individuales. CD11c + mDC representan sólo una población menor de la suspensión de células individuales (0,6%). Después del enriquecimiento de las células LDF a través de la separación de Percoll densidad el porcentaje de células CD11c + aumenta a ~ 9%. Las células LDF se marcaron con anticuerpo CD11c-PE y posteriormente aislarse usando perlas magnéticas (anti-PE). El reanálisis del CD11c + población directamente después de la separación magnética de células por FACS indicó 93% de pureza. Haga clic aquí para ver más grande la figura .
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Figura 5. El enriquecimiento de las células más altas / neg CD45 y la posterior clasificación de los subconjuntos TEC. A) Representante gráficos de puntos que muestran porcentajes de CD45 negativa / células estromales tímicas bajos en el total de suspensiones de células individuales antes y después de la separación de Percoll densidad (9% y 16,2%, respectivamente). B) Las células LDF se agotan las células CD45 hi usando perlas magnéticas y los subconjuntos TEC ordenados de la fracción empobrecido como hi EpCAM CDR2 - (MTEC) o EpCAM lo CDR2 + (CTEC).
Frecuencias CD11c + MDC, los rendimientos celulares y purezas de diferentes donantes | |||||||
Donante | Edad | Peso de tejido | Células totales por muestra | LDF células por muestra | CD11c+% | CD11c + aislado por muestra | CD11c + pureza |
1 | 5 días | 7 g | 1.45 x 10 9 | 9,5 x10 7 | 12.6 | 2.4 x 10 6 | 89% |
2 | 3 años | 15 g | 2 x 10 9 | 6,5 x10 7 | 4.3 | 1,9 x 10 6 | 81% |
3 | 21 días | 9 g | 2,6 x 10 9 | 22 x10 7 | 10.3 | 3.6 x 10 6 | 93% |
4 | 6 años | 13 g | 1,4 x 10 9 | 25,4 x10 7 | 4.2 | 5.7 x 10 6 | 82% |
5 | 5 días | 6,5 g | 1,3 x 10 9 | 16,2 x10 7 | 6 | 2.9 x 10 6 | 91% |
6 | 39 días | 3 g | 0,6 x 10 9 | 8 x 10 7 | 3.4 | 1.3 x 10 6 | 80% |
Tabla 1. Números de células en suspensión de células individuales total liberado después de dos rondas de la digestión, así como los rendimientos de células LDF después de la separación de Percoll se muestran para aislamientos realizados en muestras de timo de seis individuos de diferente edad y el peso del tejido. Frecuencias de MDC se determinaron por citometría de flujo basada en la expresión de CD11c en células totales LDF (APC enriquecido). rendimiento y pureza de células CD11c + después de la separación de perlas magnéticas se muestran para cada donante individual.
El protocolo aquí descrito es una modificación del protocolo publicado por Gotter et al 4. Los pasos críticos en el protocolo son la condición y la preparación inicial del tejido, así como la separación por densidad de Percoll. Recomendamos para procesar el tejido tan pronto como sea posible después de su recolección. Es importante trabajar rápido pero bien al limpiar y cortar el tejido. Durante el lavado de timocitos se describe en el paso 2.3, es fundamental encontrar el equilibrio adecuado en la aplicación de presión con la parte posterior del émbolo de la jeringa en las piezas de tejido como una presión demasiado fuerte y prolongado puede dañar las células del estroma. Estratificación del medio en la parte superior de la solución / suspensión celular Percoll sin causar perturbaciones también puede requerir un poco de práctica. Después de la centrifugación, es importante recoger todas las células de la fracción de baja densidad lo más rápidamente posible a partir de la capa de Percoll con una cantidad mínima de solución de Percoll.
Lalos rendimientos celulares totales y cantidades relativas de APC pueden ser muy variables (véase la Tabla 1) y dependerá del donante (especialmente con respecto a la edad) y las habilidades preparativas del experimentador. Para una breve descripción, las suspensiones de células se pueden teñir con el HLA-DR y / u otros marcadores siguiendo diferentes etapas del protocolo, según se desee. Todos los anticuerpos utilizados para el análisis fenotípico se deben titular para lograr resultados óptimos.
Debido a la abundancia relativamente baja de los tipos de APC en el timo en comparación con thymoctyes, podrían ser necesarias grandes piezas de timo si se desean un mayor número de células aisladas.
Si un disociador tejido está disponible en el laboratorio, lo que acelerará considerablemente el procesamiento de tejidos, pero ambas variaciones descritas aquí funciona igual de bien. Un problema relativamente frecuente podría ser la aglutinación de las células, especialmente durante las etapas entre la separación de Percoll y MACS / FACS clasificación. En este caso, un corto DNasa I cavarestion como se describe en el protocolo suele resolver el problema. Dado que el tejido del timo se sustituye sucesivamente por el tejido graso durante el envejecimiento, los timos de donantes mayores puede contener un poco de grasa, que nadar en la parte superior del tubo después de la centrifugación de las suspensiones de células individuales obtenidos a partir de los diferentes pasos de digestión. En tal caso, la grasa debe eliminarse con una pipeta antes de continuar el protocolo. Para obtener resultados óptimos, así como razones de economía aconsejamos para valorar no sólo los anticuerpos, sino también a las microperlas anti-PE (secciones 5 y 6). Para el aislamiento de TEC de timo de ratón, mezclas alternativas de enzimas se han descrito para mejorar el rendimiento TEC 8,13, pero no las hemos probado con el tejido humano.
En principio, otras APC y células estromales tímicas como las células B y el PDC también se pueden aislar de las células (LDF siguientes digestión con colagenasa / DNasa y de Percoll) por FACS / MACS de clasificación si se conocen los respectivos marcadores. Por ejemplo, para el PDC, BDCA-2, BDCA-4 y CD123 se han descrito como marcadores 6,14. Si se desea un análisis o aislamiento de subconjuntos de timocitos, se recomienda utilizar las células liberadas apretando (paso 2.3), ya que son bastante pura y han sido sometidos a una manipulación mínima.
Ningún conflicto de interés declarado.
Estamos muy agradecidos a los cirujanos del Departamento de Cirugía Torácica y Cardiovascular, Clínica Universitaria de Tubinga por proporcionarnos las muestras de timo y Bruno Kyewski (DKFZ, Heidelberg, Alemania) para proporcionar el anticuerpo CDR2. También nos gustaría dar las gracias a Hans-Jörg Bühring y Sabrina Grimm de las instalaciones de clasificación (Universidad de Tubinga). Este trabajo fue apoyado por el SFB 685 y la Fundación Hertie.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Reagents and Materials | |||
RPMI 1640 | PAA | E15-842 | |
Dulbecco's PBS | PAA | H15-002 | |
Fetal Bovine Serum-Gold | PAA | A15-151 | |
Bovine Serum Albumin | PAA | K41-001 | |
Collagenase A | Roche | 10 103 586 001 | |
DNase I, grade II bovine pancreatic | Roche | 10 104 159 001 | |
Trypsin-EDTA 10x in PBS | PAA | L11-001 | stock conc. 20 mg/ml |
Alexa Fluor 488 Protein Labelling kit | Molecular Probes | A-10235 | |
anti-human CDR2 (purified) | Bruno Kyewski, DKFZ- Heidelberg, Germany | labeled with Alexa Fluor 488 | |
anti-human CD45 (Pacific Blue) | Biolegend | 304022 | |
anti-human EpCAM (APC) | Miltenyi Biotec | 130-091-254 | |
anti-human CD11c (PE) | Miltenyi Biotec | 130-092-411 | |
anti-PE Microbeads | Miltenyi Biotec | 130-048-801 | |
anti-CD45 Microbeads, human | Miltenyi Biotec | 130-045-801 | |
LS columns | Miltenyi Biotec | 130-042-401 | |
gentleMACS C Tubes | Miltenyi Biotec | 130-093-237 | for tissue dissociator |
Percoll (density 1.130 g/ml) | GE Healthcare, Life Sciences | 17-0891-01 | |
Sterile distilled Water (DNAse/ RNAse free) | GIBCO | 10977-035 | |
Gamunex 10% | Tajecris-Biotherapeutics | G120052 | 1:10 pre-dilution, use 20 μl/1 x 106cells |
0.22 μm filter | Millex GS | SLGS033SS | Syringe driven |
Stericup filter unit | Millipore | SCGPU05RE | Pump driven |
50 ml PC oak ridge centrifuge tubes | Nalgene | 3118-0050 | 50 ml |
50 ml PP conical tubes | Becton Dickinson | 352070 | |
12 mm x 75 mm 5 ml test tubes | Becton Dickinson | 352058 | FACS stainings |
Cell strainer 70 μm | Becton Dickinson | 352350 | |
INSTRUMENTS | |||
Flow Cytometer-Sorter (BD FACSAriaTMIIu) | Becton Dickinson | ||
Sorvall Evolution R6 (rotor) | Kendro | ||
Rotator REAX 2 | Heidolph | ||
gentleMACS Dissociator | Miltenyi Biotec | 130-093 235 | tissue dissociator |
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