Method Article
تصف هذه الورقة تصنيع وتشغيل رقائق التحلل الصوتي الموائع الدقيقة باستخدام تقنية الرحلان الأكوستوفوريزي الموائع الدقيقة والميكروبيدات المعدلة بواسطة aptamer والتي يمكن استخدامها للعزل السريع والفعال للبكتيريا سالبة الجرام من الوسط.
توضح هذه المقالة تصنيع وتشغيل رقائق الرحلان الأكوستوفورتيك الموائع الدقيقة باستخدام تقنية الرحلان الأجوستوفوريزي الموائع الدقيقة والميكروبيدات المعدلة بواسطة aptamer والتي يمكن استخدامها للعزل السريع والفعال للبكتيريا سالبة الجرام من الوسط. تعزز هذه الطريقة كفاءة الفصل باستخدام مزيج من القنوات الدقيقة الطويلة والمربعة. في هذا النظام، يتم حقن العينة والمخزن المؤقت في منفذ المدخل من خلال وحدة تحكم في التدفق. بالنسبة لتمركز الخرز وفصل العينات، يتم تطبيق طاقة التيار المتردد على محول الطاقة الكهرضغطية عبر مولد وظيفي مع مضخم طاقة لتوليد قوة إشعاع صوتي في القناة الدقيقة. هناك قناة متشعبة في كل من المدخل والمخرج ، مما يتيح الفصل والتنقية والتركيز في وقت واحد. يحتوي الجهاز على معدل استرداد يبلغ >98٪ ونقاء 97.8٪ حتى تركيز جرعة 10x. أظهرت هذه الدراسة معدل استرداد ونقاء أعلى من الطرق الحالية لفصل البكتيريا ، مما يشير إلى أن الجهاز يمكنه فصل البكتيريا بكفاءة.
ويجري تطوير منصات الموائع الدقيقة لعزل البكتيريا عن العينات الطبية والبيئية، بالإضافة إلى الطرق القائمة على النقل العازل للكهرباء، والرحلان المغناطيسي، واستخراج الخرز، والترشيح، والموائع الدقيقة بالطرد المركزي والتأثيرات بالقصور الذاتي، والموجات الصوتية السطحية 1,2. يستمر الكشف عن البكتيريا المسببة للأمراض باستخدام تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) ، ولكنه عادة ما يكون شاقا ومعقدا ومستهلكا للوقت 3,4. تعد أنظمة الرحلان الأيكولومبي الموائع الدقيقة بديلا لمعالجة ذلك من خلال الإنتاجية المعقولة وعزل الخلايا غير الملامسة5،6،7. الرحلان الصوتي هو تقنية تفصل أو تركز الخرز باستخدام ظاهرة حركة المواد من خلال موجة صوتية. عندما تدخل الموجات الصوتية إلى القناة الدقيقة ، يتم فرزها وفقا لحجم الخرز وكثافته وما إلى ذلك ، ويمكن فصل الخلايا وفقا للخصائص الكيميائية الحيوية والكهربائية لوسط التعليق 7,8. وفقا لذلك ، تم متابعة العديد من الدراسات الصوتية بنشاط9،10،11 ، ومؤخرا ، تم إدخال المحاكاة العددية ثلاثية الأبعاد للحركة الصوتية الناجمة عن التدفق الصوتي المدفوع بالحدود في الموائع الدقيقة للموجة الصوتية السطحية الدائمة12.
تدرس الدراسات في مختلف المجالات كيفية استبدال الأجسام المضادة 2,3. Aptamer هي مادة مستهدفة ذات انتقائية وخصوصية عالية ، ويتم إجراء العديد من الدراسات2،9،10،13. تتميز Aptamers بصغر حجمها ، والاستقرار البيولوجي الممتاز ، والتكلفة المنخفضة ، وقابلية التكاثر العالية مقارنة بالأجسام المضادة ويتم دراستها في التطبيقات التشخيصية والعلاجية2،3،14.
هنا ، تصف هذه المقالة بروتوكول تقنية الرحلان الأكوستوفوريزي الموائع الدقيقة التي يمكن استخدامها للفصل السريع والفعال للبكتيريا سالبة الجرام (GN) عن وسط باستخدام الميكروبيدات المعدلة بواسطة aptamer. يولد هذا النظام موجة صوتية دائمة ثنائية الأبعاد (2D) من خلال تشغيل كهرضغطي واحد عن طريق تحفيز رنين متعامدين في وقت واحد داخل قناة دقيقة مستطيلة طويلة لمحاذاة وتركيز الميكروبيدات المرتبطة ب aptamer في العقدة ونقاط مضادة للعقدة لكفاءة الفصل 2,11,15,16 . هناك قناة متشعبة في كل من المدخل والمخرج ، مما يتيح الفصل والتنقية والتركيز في وقت واحد.
يمكن أن يكون هذا البروتوكول مفيدا في مجال التشخيص المبكر للأمراض المعدية البكتيرية ، بالإضافة إلى استجابة سريعة وانتقائية وحساسة للعدوى البكتيرية المسببة للأمراض من خلال مراقبة المياه في الوقت الفعلي.
1. تصميم رقاقة الرحلان الفموائع الدقيقة
ملاحظة: يوضح الشكل 1 مخططا لفصل وجمع الميكروبيدات المستهدفة من القنوات الدقيقة بواسطة الرحلان الأوكوستوبيريس. تم تصميم رقاقة الرحلان الأيكولومبي الموائع الدقيقة باستخدام برنامج CAD.
2. تصنيع رقاقة الرحلان الأكوستوفوريزي ميكروفلويديك
ملاحظة: قم بتجميع أربع طبقات بالترتيب التالي: طبقة من زجاج البورسليكات والسيليكون، وطبقة من السيليكون، وطبقة من زجاج البورسليكات، وطبقة PZT، كما هو موضح في الشكل 3A، B.
3. السلالات البكتيرية والثقافة
ملاحظة: ارجع إلى الجدول 2 لاختيار واحتضان بكتيريا GN والبكتيريا إيجابية الجرام (GP) للتجارب. للحصول على طريقة الثقافة، راجع الخطوات 3.1-3.4. يجب احتضان جميع البكتيريا تحت الظروف الهوائية حتى يتم الحصول على امتصاص 0.4 عند 600 نانومتر (OD600).
4. الميكروبيدات وتجميد أبتامر على الميكروبيدات
5. إعداد وتشغيل الرحلان الصوتي
يوضح الشكل 5 صورة تدفق الخرز كدالة لجهد PZT (إيقاف التشغيل ، 0.1 فولت ، 0.5 فولت ، 5 فولت). في حالة الشريحة الصوتية التي تم إدخالها في هذه الدراسة ، تم التأكيد على أنه مع زيادة جهد PZT ، زاد التركيز المركزي للخرز بحجم 10 ميكرومتر. تركزت معظم الخرز بحجم 10 ميكرومتر في الوسط عند 5 فولت من جهد PZT. ومن خلال هذه النتيجة، تم توليد تردد رنين يبلغ 3.66 ميغاهيرتز في مولد دالة أحادي القناة، وتم تضخيم إشارة عامة بمقدار 16 ديسيبل (حوالي 9 مرات) باستخدام مضخم طاقة.
ويبين الجدول 3 أن خليط الميكروبيدات البالغ 1 ميكرومتر (حجم الخلية) و 10 ميكرومتر (حبة أبتامر المرفقة) قد تم حقنه في رقاقة السائل الصوتي المستخدمة في هذه الدراسة، وكان أداء فصل الرقاقة وفقا لمعدل تدفق المخرج (400 و 450 و 475 ميكرولتر/دقيقة) نتيجة للتقييم. معدل الاسترداد هو نسبة عدد الخرز الذي تم جمعه في المخرج إلى إجمالي عدد الخرز المحقون لخرز بحجم 10 ميكرومتر ، والتي كانت 98٪ ± 2.2٪ ، و 98٪ ± 2.5٪ ، و 90٪ ± 9.8٪ على التوالي. النقاء هو نسبة عدد الخرز بحجم 10 ميكرومتر إلى إجمالي عدد الخرز الذي تم جمعه ، والذي كان 97.1٪ ± 3.6٪ ، 97.6٪ ± 2.4٪ ، و 99.4٪ ± 0.6٪ على التوالي. هذا يدل على أن الجهاز لديه كفاءة فصل عالية للخرز بحجم 10-μm.
يوضح الشكل 6 صورا ورسما بيانيا للأعداد المرتبطة بالبكتيريا لكل خرزة. تم جمع البيانات المتعلقة بتشغيل رقاقة الرحلان الأكوستوفوريسيس فيما يتعلق بعينات الهدف والنفايات في المخرج والمدخل ، على التوالي. وتعرضت جميع العينات لأخذ عينات بسعة 10 ميكرولتر في أنابيب التجميع، ولوحظ عدد البكتيريا المرتبطة بالميكروبيدات تحت المجهر الفلوري. العديد من بكتيريا GN (على سبيل المثال ، E. القولونيه DH5α) مرتبطة بجميع الخرز ، في حين أن بعض بكتيريا GP (على سبيل المثال ، Listeria grayi) مرتبطة ببعض الخرز. تم قياس أعداد بكتيريا GN و GP المرتبطة بكل ميكروبة معدلة بواسطة aptamer (من 25 خرزة) باستخدام مجهر مزود بكاميرا عالية السرعة. كانت جميع بكتيريا GN الخمسة مرتبطة بالخرز (4.96 ± 0.77 لكل منهما) ، في حين أن عددا أقل بكثير من بكتيريا GP كانت مرتبطة بالمواد التي تم اختبارها (0.08 ± 0.08 لكل منها). اختلفت قوة الإشارة اختلافا كبيرا بين بكتيريا GN و GP. تؤكد هذه البيانات أن هذا الجهاز كان ناجحا في عزل بكتيريا GN.
الشكل 1: مخطط القنوات الدقيقة، والمحاذاة المركزية للميكروبيدات عبر الرحلان الصوتي، وجمع الأهداف.
الشكل 2: صورة CAD لرقاقة الرحلان الأكوستوفوريزي الموائع الدقيقة لفصل بكتيريا GN باستخدام حبات تقارب aptamer . (A) طبقة قناة السيليكون. (ب) الطبقة الزجاجية العليا. (للاطلاع على أبعاد من 1 إلى 4، انظر الجدول 1). يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الشكل 3: هيكل الجهاز المجهري للهروب الحيوي . (أ) مخطط الأرضية ، (ب) مخطط المقطع العرضي ، و (ج) صورة فوتوغرافية للجهاز. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الشكل 4: مخطط لنظام الموائع الصوتية المستخدم لفصل الخلايا وجمعها. يتم حقن العينة أو محلول المخزن المؤقت في منفذ المدخل من خلال وحدة التحكم في التدفق. لتمركز الخرز وفصل العينات، يتم تطبيق طاقة التيار المتردد على PZT عبر مولد وظيفي مع مضخم طاقة لتوليد قوة إشعاع صوتي في القناة الدقيقة. يتم جمع العينة المستهدفة المنفصلة من خلال أنبوب تجميع ، ويتم استرداد سائل النفايات المتبقي من خلال منفذ آخر. يتم استخدام وحدة كاميرا عالية السرعة لتصور الفصل. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
الشكل 5: صورة تدفق الخرز كدالة لجهد PZT. (A) PZT OFF ، (B) PZT 0.1 V ، (C) PZT 0.5 V ، (D) PZT 5 V. يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الشكل.
الشكل 6: أعداد بكتيريا GN (E. coli DH5α) و GP (Listeria grayi) المرتبطة بالميكروبيدات المعدلة بواسطة aptamer (n = 25 ، شريط الخطأ = الخطأ القياسي). يرجى النقر هنا لعرض نسخة أكبر من هذا الرقم.
رقم | جهاز | العرض (W) أو القطر (D) (μm) |
1 | منفذ مدخل ومخرج (سيليكون) | 1000 (د) |
2 | قناة الموائع الدقيقة | 200 (واط) |
3 | قناة المدخل والمخرج | 400 (واط) |
4 | منفذ مدخل ومخرج (زجاج) | 1500 (د) |
الجدول 1: أبعاد منصة الموائع الدقيقة الهوائية (1 إلى 4 في الشكل 2).
بكتيريا GN | بكتيريا GP |
الإشريكية القولونية (DH5α) | عصية ميغاتيريوم (KCTC 1021) |
Enterobacter cloacae | المكورات العنقودية البشرة |
سفينجوموناس انسولي | ليستيريا جراي |
الإشريكية القولونية KCTC 2571 | المكورات المعوية التايلاندية |
الزائفة بيكتوروم | المكورات العنقودية باستوري |
الجدول 2: دراسة بكتيريا GN و GP.
معدل التدفق عند مخرج wate (ميكرولتر / دقيقة) | معدل الاسترداد (٪) | النقاء (٪) |
400 (5x concetnration الحجمي) | 98 ± 2.2 | 97.1 ± 3.6 |
450 (10x concetnration الحجمي) | 98 ± 2.5 | 97.6 ± 2.4 |
475 (20x concetnration الحجمي) | 90 ± 9.8 | 99.4 ± 0.6 |
الجدول 3: معدل الاسترداد ونقاء الفصل.
قمنا بتطوير جهاز الموائع الدقيقة للرفع الصوتي لالتقاط ونقل بكتيريا GN من عينات المستنبتة بسرعة عالية استنادا إلى طريقة تشغيل مستمرة وفقا لحجمها ونوعها ، والميكروبيدات المعدلة بواسطة aptamer. تتيح القناة الدقيقة المربعة الطويلة تصميما أبسط وكفاءة أكبر من حيث التكلفة للهروب الحرقفي ثنائي الأبعاد مما تم الإبلاغ عنه سابقا20،21،22،23،24،25،26. يحتوي الجهاز على معدل استرداد يبلغ >98٪ يصل إلى تركيز جرعة 10x. تظهر هذه الدراسة معدل استرداد ونقاء أعلى من الطرق الحالية الخالية من الملصقات20،21،22،23،24 وطرق تقارب الخرز 25،26 لفصل البكتيريا. هذا يشير إلى أن الجهاز يمكنه فصل البكتيريا بكفاءة. ومع ذلك ، نظرا لأن الخرز 10-μm يمكن أن يتدفق إلى القنوات الجانبية ، يتم تقليل معدل الاسترداد إلى 90٪ عند تركيز جرعة 20x بسبب قوة السحب القوية الناشئة عن المخرج المغلق الذي يمنع الإشعاع الصوتي في اختبار الأداء. في حين أن معدل الاسترداد على الشريحة يمكن أن يصل إلى 98٪ ، فإن هناك عدة عوامل تقلل من معدل الاسترداد ، مثل هطول الخرز في جهاز الاستنشاق أو انسداد الأنبوب الذي يربط جهاز الاستنشاق بالشريحة.
هناك بعض النقاط الرئيسية اللازمة لجعل هذه الشريحة الصوتية وجعلها تعمل. يجب استخدام المادة اللاصقة المستخدمة لإرفاق PZT بأقل قدر ممكن من الدقة للتموج ويجب أن تكون PZT والقناة الدقيقة متوازية. تؤدي الأخطاء في هذه الخطوة إلى نقل أشكال موجية غير صحيحة من خلال PZT إلى الشريحة ، والتي تظهر على شكل اختلال في محاذاة الخرز. أيضا ، كن حذرا عند التشغيل ، حيث يمكن أن تؤدي عدة عوامل إلى تفاقم معدل الاسترداد ، مثل ترسيب الخرز من المحقنة أو انسداد أنبوب التوصيل برقائق من المحقنة.
لا يمكن استخدام هذا الجهاز للكشف عن البكتيريا الحية أو المؤشرات الحيوية المشتقة من البكتيريا في مجال التشخيص المبكر للأمراض المعدية البكتيرية فحسب ، بل يمكن أيضا توسيعه ليشمل مراقبة تلوث المياه ، مما سيساعد على تحديد الإرهاب البيولوجي والالتهابات البكتيرية المسببة للأمراض.
وليس لدى المؤلفين أي تضارب في المصالح للإفصاح عنه.
تم دعم هذا العمل من خلال منحة المؤسسة الوطنية للبحوث في كوريا (NRF) التي تمولها الحكومة الكورية (وزارة العلوم وتكنولوجيا المعلومات والاتصالات). (لا. NRF-2021R1A2C1011380)
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1 µm polystyrene microbeads | Bang Laboratories | PS04001 | Cell size beads |
10 µm Streptavidin-coated microbeads | Bang Laboratories | CP01007 | Aptamer affinity beads |
4-inch Silicon Wafer/SU-8 mold | 4science | 29-03573-01 | Components of chip |
Aptamer | Integrated DNA Technologies | GN3-6' | RNA for bacteria conjugation |
Borosilicate glass | Schott | BOROFLOAT 33 | Components of chip |
Centrifuge | Daihan | CF-10 | Wasing particles |
Cyanoacrylate glue | 3M | AD100 | Attach PZT to microchip |
Escherichia coli DH5α | KCTC | KCTC2571 | Target bacteria |
Functional generator | GW Instek | AFG-2225 | Generate frequency |
High-speed camera | Photron | FASTCAM Mini | Observation of separation |
Hot plate | As one | HI-1000 | Heating plate for curing of liquid PDMS |
KOVAX-SYRINGE 10 mL Syringe | Koreavaccine | 22G-10ML | Fill the microfluidic acoustophoresis channel with bubble-free demineralized water. |
Liquid polydimethylsiloxane, PDMS | Dow Corning Inc. | Sylgard 184 | Components of chip |
LB Broth Miller | BD Difco | 244620 | Cell culture (Luria-Bertani medium) |
Microscope | Olympus Corp. | IX-81 | Observation of separation |
PBS buffer | Capricorn scientific | PBS-1A | Wasing bacteria |
PEEK Tubes | Saint-Gobain Ppl Corp. | AAD04103 | Inject or collect particles |
Piezoelectric transducer | Fuji Ceramics | C-213 | Generate specific wave in channel |
Power amplifier | Amplifier Research | 75A250A | Amplify frequency |
Pressure controller/μflucon | AMED | AMED-μflucon | Control of air pressure/flow controller |
Tris-HCl buffer | invitrogen | 15567027 | Wasing particles |
Tube rotator | SeouLin Bioscience | SLRM-3 | Modifiying aptamer and bead |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved