Bu eser NERC parlak nokta hibe (NE/N016777/1) tarafından desteklenmiştir. Sis Ltd, çevre bilimsel Hizmetleri, çevre değişikliği Araştırma Merkezi, University College London'dan örneklenmiş ve tortu çekirdek tarihli.

Aşağıdaki SOP Daphnia magna diriltmek için kullanılan iletişim kuralı, adım adım açıklamasını uyuyan yumurta, örnekleme, yalıtım ephippia tortu ve klonal kültürler ( kurulması, ayrıntılı bir açıklama da dahil olmak üzere sağlar. Şekil 1).
<img alt="Figure 1" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56637/56637fig1.jpg"> Şekil 1: adım adım kılavuzu diriliş Daphnia magna. Tortu doğal tatlı su ortamına(a)üzerinden bir piston corer (B) ile örneklenir. Tortu çekirdek (C) 1 veya 0.5 cm (D) artımlı katmanlar halinde dilimlenmiş. Tortu her katman bir örnek zip kilit torba (E) içinde karanlık ve soğuk koşullarda (4 ° C) depolanır. Tortu her tabakası ağırlığında ve jeolojik elekler (1 mm ve 125 µm kafes boyutları, F) kullanarak elenmiş. Beyaz arka plan tepsiler Daphnia magna ephippia (G) izole etmek için kullanılır. Decapsulated uyuyan yumurta (H) Petri yemekler için transfer ve damızlık ikna etmek için ışık ve sıcaklık uyaranlara maruz. Yavru isoclonal satırları oluşturmak üzere kavanozlar (Ben) ayırmak için transfer edilir. <a href="//cloudflare-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/56637/56637fig1large.jpg" target="_blank">Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.</a>
1. örnekleme tortu çekirdek
<ol><li>Göl ve göletler piston corer kullanarak üzerinden örnek tortu. Big Ben27bu protokolü kullanılan, yaklaşık 1.5 m uzunluğunda bir iç boru çapları, 14 cm. Big Ben ile bir çekirdek tüp bir piston bir ip ve çubuklar tüp tortu sürücüye bağlı bir corer kafa oluşur. Bir çekirdek alıcı çekirdek tüp zaman tam destek yardımları, tortu. Tortu Yükselt için bir çerçeve çekirdek tüp dik ve sabit tutar ve değiştirilmiş şişe jack pistonu yukarı ekstrüzyon sürecinde (ek Video 1) itmek için kullanılır.<ol>
<li>İçin sığ gölet az 1 m derinlemesine bir pleksiglas yerçekimi corer en fazla 6 cm çapında el ile tortu itti kullanın.</li>
		<li>Derin göl için (> 6 m Derinlik), Livingston piston soyucular28 veya tek sürücülü Griffith tortu soyucular bir bağlantılı duba tekne AIDS ile kullanın. Livingstone tipi sürücü çubuk piston corer yaklaşık 30 m kadar su derin birbirini izleyen bir metrelik götürmek-in yumuşak konsolide Gölü tortu toplamak için kullanılabilir. Livingstone sürücü çubuklar için standart polikarbonat borular bağlayan bir basit ama güçlü çekirdek kafa, tek sürücülü Griffith corer oluşur. Soyucular tortu çubuklar ile içine itilir ve bir piston tortu (Şekil 2) kurtarma için gerekli emiş gücü sağlar.</li>
		<li>Rahatsız edilmeden çekirdek, sürekli almak için vibracoring kullanın. Bu soyucular su derinlikleri çeşitli üzerinde çalışmak ve çekirdek örnekleri, tortu lithology bağlı olarak farklı uzunlukta alabilirsiniz. Vibracore baş aşağı ekli varil veya çekirdek tüp yoluyla aktarıldığı düşük genlik titreşim çökeller, sıvılaştırılmış çökeller nüfuz vibracore birimine bağlı çekirdek namlu etkinleştirme liquefies. Bazı vibracorers küçük, hafif ve taşınabilir, diğerleri yalnızca büyük gemilerin dağıtılabilir büyük ağır birimleri vardır. Soyucular seçim tortu lithology üzerinde bağlıdır.</li>
	</ol>
</li>
	<li>Çekirdek yatay olarak 1 cm veya daha az düz metal yüzeylere (ek Video 1) kullanarak artımlı katmanlarında dilim. Burada kullanılan bir tortu soyucular ekstrüzyon, rahatsızlık sediman katmanların azaltılması, hidrostatik basıncı azaltmak için tasarlanmıştır. Diğer soyucular kullanıldığında, dış kabuğu her tortu katmanın katmanlar arasında kirlenme sınırlamak için bıçak bir çerez kesici tür kaldırılmış olabilir.</li>
	<li>Her bir ayrı örnekleme çanta (ek Video 1) tortu katmanda toplar ve karanlık ve soğuk (4 ° C) koşulları saklarız.</li>
	<li>Radyometrik tarihleme için tüm katmanlardan en az 5 g tortu toplamak. Radyometrik çıkıyor uzanan tahlil ayrıntılı bir açıklaması için oluşturulmuş protokol için varolan yayınlar12,13bakın.</li>
</ol><img alt="Figure 2" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56637/56637fig2.jpg"> Şekil 2: yordam Asitleme piston karikatür. Piston corer, zayıf bir vakum oluşturur bir iç sürgülü mühür (piston) ile içi boş bir tüp. Piston tortu-su arabirimi dokunduğunda, ağırlığı iter ve çekirdek namlu tortu ve vakum girin ve sediman katmanların bozmadan tüp taşımak için özlü tortu neden olur. <a href="//cloudflare-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/56637/56637fig2large.jpg" target="_blank">Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.</a>
2. eleme sediman katmanların
<ol><li>Bir duyarlılık ölçeği kullanarak, her bir tortu katman ileride başvurmak için tartmak. Yüzey alanı ve ağırlık göl türler dansitesi hesaplamak için kullanın.</li>
	<li>Birbiri üstüne yığılmış iki jeolojik elekler kullanarak her tortu katman elek. İlk elek bir kafes boyutu 1 mm ve kil, büyük omurgasızlar ve Partiküler madde, örneğin tohumlar, bitkiler ve böcekler, tortu kalan ayırır. İkinci elek 125 µm örgü vardır ve D. manga ephippia ve küçük partikül tortu (ek Video 2) kalan ayırır.</li>
	<li>
Küçük aliquots 125 µm mesh elek toplanan tortu fraksiyonunun bir beyaz arka plan tepsiye aktarın. Tortu türüne bağlı olarak, tortu, küçük veya büyük aliquots her zaman transfer edilebilir.
	<ol>
<li>Küçük birimleri ekleyin (ilâ 200 mL) orta transfer edilen tortu kesir yeniden askıya almak ve göz ephippia (şekil 3) lekelenme kolaylaştırmak için örnekleme beyaz tepsi için. Tortu resuspend için kullanılan orta dechlorinated musluk suyu, sondaj su, açılan29veya ADaM orta (Aachener Daphnien)30olabilir. Bundan sonra terim 'orta' ya da tüm listelenen çözümleri için başvurmak için kullanılır.</li>
	</ol>
</li>
</ol><img alt="Figure 3" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56637/56637fig3.jpg"> Şekil 3: Daphnia magna ephippium. Uyuyan Daphnia magna yumurta hemen sonra kapsülden çıkarma. Ephippium(a), (B) iç yumurta membran ve uyuyan yumurta (C). gösterilir Ölçek çubuğu 500 µm =.
3. Ephippia ve damızlık kapsülden çıkarma
<ol><li>Bir tek kullanımlık Pasteur pipet veya mikrodiseksiyon forseps kullanarak transfer bireysel ephippia Petri yemekler için orta 10 mL ile dolu. En az bir petri çökelti tabakası başına kullanın.</li>
	<li>Stereo mikroskop, decapsulate altında mikrodiseksiyon forseps açık zorlayarak kitin durum (ek Video 3) kullanarak her ephippia. Dinlenme yumurta iç zarı ince kaldırmak için değil yumurta bozabilir ve Petri kabına aktarmak için dikkat ile Pasteur pipet kullanarak ortam dolu. Kapsülden çıkarma D. magna; tarama başarı ancak artırır, bu gerekli olmayabilir veya daha küçük ephippia üreten diğer Daphnia türler için zor olabilir.</li>
	<li>Decapsulated yumurta tam spektrum uzun gün photoperiod ışık (16:8 ışık: karanlık) ve damızlık ikna etmek için yüksek sıcaklık (20 ± 1 ° C) için bir ısı kontrollü aygıt (kuluçka) veya oda içinde maruz. 48 h ve (en fazla dört; birkaç hafta arasında damızlık olur Takıma giren Video 4). Kapsülden çıkarma yokluğunda, doğrudan uyaranlara (uzun gün photoperiod ışık (16:8 ışık: karanlık) ve yüksek sıcaklık (20 ± 1 ° C)) çıkım için ephippia ortaya çıkarmak.</li>
</ol>4. Daphnia magna Isoclonal satırları oluşturma
<ol><li>Tek yavru satırlarından isoclonal adım 3.3 200 mL tek kullanımlık Pasteur pipet kullanarak orta ile dolu kavanoz ayırmak için bireysel D. magna aktararak kurmak. Her bireyin genetik olarak cinsel rekombinasyon sonucu olarak farklıdır.</li>
	<li>İsoclonal satırları süresiz olarak hisse senedi koşullarında oluşan 10 ± 1 ° C, 16:8 ışık: karanlık rejimi, haftalık 0.2 mg C/M Chlorella vulgaris veya diğer yeşil algler (örneğin, Scenedesmus obliquus) ile beslenen korumak. Orta üçüncü haftada yenilemek. Hisse senedi koşullarında beslenme rejimleri ve türler sıcaklık ile değişebilir.</li>
</ol>5. anahtar çalışmalar
Not: Hangi dirilen D.magna içinde (alt) tortul Arşiv veri gruplarından Gölü halka (Danimarka) ısınma için evrimsel yanıtı değerlendirmek için kullanılan iki temel çalışmalar için bir açıklama sağlanmıştır. Üç (alt) nüfus aşağıdaki süreler yeniden canlandırmak: 1960-1970, 1970-1985, ve > 1999. 11 ile %58 (şekil 4) arasında değişmekteydi tortul Arşivi'nden başarı kuluçkalık D. magna . Her timeperiod elde edilen yavru rastgele bir alt burada açıklanan iki anahtar çalışmalar için seçildi. Bu çalışmalar (alt) nüfus dönemleri boyunca sıcaklık değişimi üzerinden yeniden canlandırmak fitness bağlı yaşam öyküsü özellikleri (5.1) farklılıkları gösterdi ve onlar farklı rekabetçi yetenek (5.2) vardı değerlendirmek için tasarlanmıştır ısınmaya maruz kaldıktan sonra.
<img alt="Figure 4" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56637/56637fig4.jpg"> Şekil 4: başarı Gölü yüzüğünden örneklenmiş bir tortul arşivindeki kuluçkalık. Göl anahtar çalışmalarda kullanılan yüzük tortul Arşiv boyunca başarılı yavru oranı. <a href="//cloudflare-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/56637/56637fig4large.jpg" target="_blank">Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.</a>
<ol><li>
Ortak Bahçe deneyler
	<ol>
<li>On yavru (alt) nüfus başına hisse senedi kültürleri ortak Bahçe koşulları için transfer: 16 ° C; uzun photoperiod (16:8 ışık: karanlık rejimi); Her gün 0,8 mg C/L Chlorella vulgarisile besleme ve orta iki günde yenilemek. En az iki kuşak (ca. 45 gün) için ortak Bahçe koşullarında yavru korumak. Ortak Bahçe koşulları anne etkisi müdahalelerden azaltmak ve üreme yavru arasında eşitleyin.</li>
		<li>İkinci damızlık damızlık odasına serbest bırakılmasıyla yetişkin kadın gençlere ikinci damızlık bırakana orta ile dolu 500 mL kavanoz için ikinci nesilden aktarın.</li>
		<li>Rastgele 24-48 h, orta ile dolu ve aşağıdaki deneysel koşullar için maruz 100 mL kavanoz ikinci nesil kuluçka ikinci dünyaya bireysel gençlere aktarım: 18 ° C (göl geçerli sıcaklık) ve (ısınma, sıcaklığı 24 ° C IPCC 26 tarafından yaklaşan 100 yıldır tahmini), 16:8 ışık: karanlık rejimi ve besleme günlük 0,8 mg C/L Chlorellavulgaris.</li>
		<li>Her deneysel hayvan üzerinde baş ve omurganın kuyruk (şekil 5) arasındaki mesafe olarak bir stereomicroscope ile Vadesinde boyutunu ölçmek. Her hayvan fotoğraf ve daha sonra boyutuna uygun görüntü yazılımı kullanarak çözümleyebilirsiniz.</li>
		<li>Olgunluk yaşta ölçmek: içinde yumurta ilk defa kuluçka odasında günü kutlanan.</li>
		<li>Ölüm ölçmek: deney sırasında soyu tükenmiş sayisi.</li>
		<li>Verimlilik ölçmek: birinci ve ikinci klonal üreme yayımlanan yavru toplam sayısı.</li>
		<li>Euler denklem (1) kullanarak tahmini nüfus artış hızı tedbir: <img alt="Equation" src="/files/ftp_upload/56637/56637eq1.jpg">(1) Lx yaş xhayatta kalma oranı, bx Yenidoğan Bebeklerin sayısı yaş xhayatta kalan tek tek başına üretilen ve r iç doğal artış oranıdır nerede.</li>
		<li>Piyasada bulunan yazılım kullanarak istatistiksel çözümleme gerçekleştirme. Burada, R31 tepki normları (ortamlar arasında tek bir genotip fenotipik ifade) ggplot2 paketi kullanarak her hayat Tarih özelliği için çizmek için kullanın. Mortalite oranları Sağkalım analizi (R paket rms; https://cran.r-project.org/web/packages/rms/rms.pdf) üzerinden başına hesaplayın. Son olarak, sıcaklık etkisi özellikleri (nüfus arasında farklılıklar), evrim tarafından açıklanabilir olup olmadığını değerlendirmek için R31 yılında bir Varyans analizi (ANOVA, Tablo 2) gerçekleştirmek plastisite (tedaviye yanıt) veya evrimi plastisite (nüfus tedavi x).</li>
	</ol>
</li>
	<li>
Yarışma deneme
	<ol>
<li>Nüfus başına on yavru hisse senedi kültürleri ortak Bahçe koşulları için transfer: 20 ° C, uzun photoperiod (16:8 ışık: karanlık rejimi), günlük 0,8 mg C/L Chlorella vulgaris, yem ve orta iki günde yenilemek. Ortak Bahçe koşulları müdahalelerden anne etkileri azaltmak en az iki kuşak (ca. 45 gün) için korumak.</li>
		<li>Rastgele beş gençlere 24-48 h 10 hayvanlar/L. yoğunluğu, triplicates içinde deneysel mesocosms 20 L (plastik aquaria), orta ile dolu her yavru ikinci nesil ikinci damızlık atama</li>
		<li>24 ° c, 16:8 L:D rejimi, mesocosms ortaya çıkarmak ve günlük 0,8 mg C/L Chlorellavulgaris ısı kontrollü odası veya en az dört hafta için kuluçka makinesi ile besleme (> 3 klonal nesiller).</li>
		<li>Her mesocosm haftalık, Daphnia Doğal ortamında karşılaşabileceğiniz bir nüfus dinamik benzetimi yapmak için orta yüzde 10'u yenileme itlaf. Bilinen hacmi orta ve her akvaryum (Bu durumda 1.2 L) hayvanlardan kaldırma ve toplandılar birim ile taze orta yerine itlaf empoze. Deneysel hayvan olgunluğa (10 gün) sonra culling rejimi başlatın.</li>
		<li>Dördüncü haftanın sonunda, vardiya ile karşılaştırıldığında ilk inoculum genotypic bileşiminde değerlendirmek için her mesocosm 32 hayvanlardan örnek.<ol>
<li>Bireysel Daphnia microcentrifuge tüplerde yerleştirin ve aşırı sıvı Pasteur pipet yardımıyla kaldırın.</li>
			<li>Flaş dondurma bireysel tüpler sıvı azot ve-80 ° C'de store</li>
			<li>Genomik DNA kullanılabilir iletişim kurallarını kullanarak ve üreticinin yönergeleri izleyerek tek bireylerin ayıklayın.</li>
			<li>Ayıklanan DNA genetik işaretler civciv başına benzersiz bir multilocus genotip sağlamak için yeterli sayıda kullanarak yükseltmek. Burada, tek bir multiplex (M01, Tablo 1) düzenlenmiş 8 mikrosatelit kurulan iletişim kuralları32,33takip kullanılmıştır.</li>
			<li>Genotip bir parçası analyzer parçaları güçlendirilmiş.</li>
			<li>Parça analizi uygun boyutu standart kullanarak ticari veya serbestçe elde edilebilir ile a bilgisayar yazılımı yapmak.</li>
			<li>Genotypic düzenleme microsatellite loci bir dizi deney Genotipleme 32 bireyler tarafından sonunda açıklanan33ve deney ile karşılaştırıldığında ilk inoculum sonunda her genotip sıklığı hesaplama olarak değerlendirmek.</li>
		</ol>
</li>
	</ol>
</li>
</ol><img alt="Figure 5" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56637/56637fig5.jpg"> Şekil 5: yetişkin kadın Daphnia magna. Yetişkin kadın Daphnia magna parthenogenetic yumurta kuluçka odasında. Baş ve kuyruk omurganın arasındaki mesafe hayvan boyutunu ölçmek için kullanılır. Kırmızı çizgiler, boyut ölçümleri gösteriyor. Ölçek çubuğu 500 µm =.

Yazarlar ifşa yoktur

Nedeniyle yüksek ısı iletkenliği su, temiz su ekosistemleri küresel karşısında karasal ekosistemler daha biyolojik çeşitlilik kaybı daha yüksek risk altındadır34ısınma. Bu, bu nedenle, bu ekosistemleri içinde kilit taşı tür yanıt anlamak ve termal stres hayatta kalmak için başa çıkma mekanizmaları belirlemek için önemlidir. Bu mekanizmalar, türler ve topluluk düzeyde anlayış nasıl tür küresel ısınma tarafından etkilenen ve nasıl bireysel türler üzerinde etkisi diğer trophic seviyelere basamaklandırır tahmin yardımcı olabilir. Sonuçta, küresel ısınma yanıt-e doğru mekanizmaları anlama yok olma azaltmak için düzeltme stratejilerini tanımlamasını sağlar.
Burada sunulan örnek çalışmalar D. magna cevaben sıcaklık artışı pervasively plastisite'hayat Tarih özellikleri tarafından aracılık ettiği ve yanıt-e doğru sıcaklık artışı yalnız açık fitness maliyeti, empoze etmez göstermek en az olarak nüfus burada okudu. ' Hayat Tarih özellikleri yüksek plastisite ısınma varlığında (alt) örneğin alınma olasılığını rakip yeteneklerine önemli olmayan farklılıklar tarafından desteklenmektedir. Ancak, birden fazla nüfus üzerinde uzun vadeli rekabet deneyler bu bulgular genelleştirmek gerekli olabilir.
Uyuyan aşamaları dirilişi adaptasyon mekanizmaları ve yörüngeleri ile saat10bir tür evrim çalışmaya benzeri görülmemiş bir kaynak sağlar. Plankton tür bir hızlı oluşturma süresi (yaklaşık 2 hafta) ve bir üst headtohead kendi alt öğelerin karşı rekabet etmek veya çeşitli geçmiş Amerika'dan başlar evrim ' yeniden ' sağlayan uyuyan aşamaları, canlılığı yararlanın. Diriliş ekoloji aslında belirli bir evrimsel sonuca bazı önceki olayda şarta olup araştırma sağlar. Evrim genetik unsurları kimlik laboratuvar deneyleri için 'atalarının lines' donmuş ve resüsite mikroorganizmaların onların Gelişmiş alt6ile karşılaştırmalı analizi için kullanma içinde şu anda mümkün değildir. Ancak, bir laboratuvar organizmalar ile çalışmanın ana sınırlamaları 'atalarının devlet' zaten değiştirdi bir temel olmasıdır. Uyuyan aşamaları çalışma örneklerin zaman herhangi bir stres olay (örneğin, bozulmamış çevre koşulları) öncesine ve çeşitli son durumları için bozulmamış çevre koşullarından evrimsel yörüngeleri ölçmek için örnekleme sağlar Modern zamanlara kadar. Son yıllarda, bugünkü nüfusu14 genetik katkıda bulunmuştur son demografik ve edinilmiş süreçleri önemli anlayışlar dirilen veya hala atıl plankton aşamaları DNA polimorfizmi çalışmanın sağlamıştır , 16 , 25 , 33 , 35 , 36. yüksek işlem hacmi sıralama teknolojileri daha yüksek erişilebilirlik ile genom ve dirilen veya hala atıl etap transcriptome sıralı ve genetik değişiklik sayısını ve türünü birikmiş nüfus üzerinde gelişen süre ölçülür.
Diriliş burada sunulan SOP iki düzeyde multi-omics alanında önemli uygulamaları vardır. Multi-omics teknolojileri dirilen numuneler, moleküler öğeleri ayrıntılı bir analizini çevresel seçim basınç adaptif yanıt katılan izin uygulanabilir. Buna ek olarak, omics teknolojileri decapsulated ama hala atıl aşamaları için uygulanabilir. Şimdiye kadar yüksek işlem hacmi sıralama teknolojilerinin uygulanması aşamalarında istirahat için giriş malzeme büyük miktarda ihtiyaç tarafından sınırlıdır. Bu sınırlamalar kaldırdı37davranıyorsun. Giriş malzeme ve nanofluidics devam eden düşürücü gereksinimleri ile tüm genom sıralama (WGS) Şimdi mümkün olduğunca az 1 ng veya malzeme38başlayan bir kaç pg. Tüm genom amplifikasyon (WGA) ve tüm transcriptome güçlendirme (WTA) teknikleri, DNA ve RNA doku, çok küçük tutarlar üzerinden zenginleştirme sağlayan kullanımı metagenomics39,40 ve tıp devrim yarattı 41araştırma. Decapsulated uyuyan yumurta için uygulanan bu teknolojiler uyuyan aşamaları canlılığı ve Genişletilmiş zaman dönemleri (örneğin, yüzyıllar) soruşturma ile ilgili sınırlamaları aşan etkinleştirin.
Omurgasız topluluklar dinlenme aşamaları üreten dirilişi topluluk geçmişleri bilinen doğal manzara değişimler ya da çevresel değişiklikler çökeller orsoils2analizleri anlaşılmaktadır hizalamasını sağlar. Topluluk değişiklikleri yanıt olarak çevresel değişimin analizi bize yeteneği önemli sonuçlara yol nüfus sebat43at, trofik etkileşimleri44 Eko-evrimsel yorumlarından42 ölçmek için sağlar , toplum derleme45ve ekosistem işlevleri ve Hizmetleri46değişimler. Son olarak, çevresel değişimin biyolojik yanıt hakkında doğru Öngörüler biyolojik çeşitlilik47korunması rehberlik olağanüstü vardır. Geçerli tahmin modelleri bu açıdan yanlış olduklarından onlar hesap önemli biyolojik mekanizmaları demografi, dağılma, evrim ve tür etkileşimleri gibi içine almayın. Nasıl bu işlemlerin zaman içinde değişim anlama ve tahmin modelleme içinde bir rahip olarak bu bilgileri kullanarak tür tahmin yeteneğimizi artıracak ve topluluk sebat karşısında çevre değiştirmek2.
Burada sunulan SOP uygulama zorlukları değildir. Uyuyan aşamaları resurrecting birincil sınırlaması örnekleme için özel ekipman ihtiyacı var. Ayrıca, tortu klonal kültürlerin kurulması için eleme üzerinden tüm süreci önemli bir uygulamalı zaman gerektirir.
Burada sunulan SOP adımlardan bazıları diğer Daphnia türler için kolayca transfer edilebilir. Bunlar: örnekleme, klonal hatları ve deneysel tasarım kurulması. Ancak, SOP diğer adımları daha fazla en iyi duruma getirme türü altında eğitim için özel olarak tasarlanmış gereken. Kapsülden çıkarma kez tarama başarı geliştirmek için D. magna numuneler için uygulanır. Ancak, bu yaklaşım küçük örnekler için uygun olmayabilir. Uyaranlara yumurtadan da türler48 ve conspecific numune49arasında değişebilir. Bu nedenle, SOP çıkım adımlardan geçici bir optimizasyon uygulamaları diğer kabuklular için önce gerekli olabilir. Önceki sonuçları49doğrultusunda tarama başarıdır Gölü yüzük (tortul Arşiv genelinde %30,5) üzerinden yeniden canlandırmak D. magna nüfusunun iken başarı kuluçkalık tortu, türler koruma durumu ile değişir 50,51ve tortu48coğrafi kökeni. Giriş ve ilerleme diapause aşamalarında düzenleyen mekanizmalar gelecekteki çalışmaları farklı türler için özel olarak tasarlanmış en iyi damızlık uyaranlara tanımlamak için gereklidir.
Son olarak, bilgi eğitim sisteminin arka plan, özellikle ilgi zamanla, türlerin varlığı tavsiye. Bu tarihi yazmak yolu ile elde edilebilir. Tarihsel kayıtlar mevcut değilse, yalnızca en son tarih bilgileri sağlayabilir, ancak örnekleme ve göl tortu çekirdek örnekleme önce yüzey kat eleme, önerilir.

Uzun vadeli çalışmalar doğada ve ne tür yanıt ve çevresel değişimin1sırasında kalıcı değerlendirirken ekolojik ve evrimsel süreçleri anlamak için kritik öneme sahiptir. Eko-evrimsel süreçleri nesiller boyunca oldu ve uzun zaman açıklıklı üzerinde ortamındaki değişiklikler meydana olmasıdır. Ayrıca, uzun vadeli çalışmalar evrimsel doğal ekosistemlerin yanıt-e doğru çevre değişiklikleri2tahmin etmek için akıllı modelleme doğruluğunun geliştirilmesine önemli ampirik veriler sağlar. Bu modeller doğruluğunu biyolojik çeşitlilik ve ekosistem hizmetleri korumak için yönetimi ve koruma stratejileri uygulamak için çok önemlidir.
Birkaç istisnai durumlar (örneğin, Galapagos Darwin ispinozları3 ve yosun4), uzun vadeli çalışmalar büyük ölçüde türe laboratuvar5,6 ' türetilebilecek kısa oluşturma süresi ile sınırlıdır , 7 , 8. bu nedenle, evrimsel dynamics destek süreçleri zor kalır. Zamansal örnekleri erişme ile ilgili lojistik zorluklar nedeniyle ampirik veri daha sık olarak bir uzamsal-zamansal bir bağlamda incelendiği ve zamansal Eko-evrimsel süreçleri anlaşılmaktadır veya uzamsal verilerden modellenmiştir. Bu yaklaşım 'uzay-için-zaman' ikame9sayede alanı zamansal evrimsel dynamics eğitim için bir vekil olarak kabul edilen, olarak bilinir. 'Uzay-için-zaman' ikame ana sınırlandırılması kayma farklı ölçeklerde uyum oranları aynı nüfus zamansal değişim farklı olduğunu; Bu nedenle, yedek zaman alanı olan temel çıkarımlar önyargılı10vardır.
Zaman içinde doğal ekosistemler evrimsel dinamiklerini eğitim sağlayan güçlü bir alternatif uyuyan aşamaları11üreten türlerin ekolojik ve genetik değişimler analizidir. Uyuyan bu aşamaların doğru tarihli olabilir tabakalı form biyolojik arşive birikir ve12,13paleolimnologically ile karakterizedir. Önemlisi, bu uyuyan aşamaları resüsite ve nerede çevre değişim evrimsel onların yanıt doğrudan ölçülebilir laboratuvar deneylerinde kullanılan. Tarihsel nüfus fitness değişiklikleri ve adım çevresel değişimin14,15,16ile gelişen genlerin fonksiyonun çalışmaya modern gelişmiş torunları karşı yarıştı.
Uyuyan aşamaları dahil tohumları, kistler, sporlar ve bankalar yumurta. Her ne kadar geç 1980'lerde17ve çalışmalar bir avuç geri yaşama uyuyan yumurta tarihleri üzerinde ilk çalışmalar erken 1990'larda18,19Bu teknikte uygulamış, diriliş ekoloji alanında resmen olmuştur Kerfoot ve iş arkadaşları 199920seminal kağıt tarafından kuruldu. Bu uygulama içinde ağırlıklı olarak rekonstrüksiyonlar paleolimnological tatlı türler17,21,22uygulanmıştır. Ancak, bir SOP henüz kullanılabilir değil. Burada, plankton türlerinin Daphnia magna uyuyan yumurta uygulanan diriliş protokolü, adım adım açıklamasını, yavru üzerinden klonal kültürler kurulması için tortu örnekleme üzerinden sağlanır. Daphniadiğer türler için kolayca transfer edilebilir SOP adımlardan yanı sıra ek optimizasyon, gerektirebilir adımları ele alınmıştır.
Daphnia tatlı su zooplankters lotic habitatları23 çoğunda mevcut vardır. Daphnia türü ya da zorunlu aseksüel veya döngüsel parthenogens bulunmaktadır. D. magna clonally uygun çevre koşulları24altında üretir döngüsel bir parthenogen var. Çevre koşullarının bozulmasına, erkek üretim oluşur ve cinsel rekombinasyon uyuşukluk çevreden ephippium denilen bir kitin durumunda tarafından korunan bir devlet girin döllenmiş yumurta oluşumu yol açar. Bir kısmı atıl bu yumurta yumurtadan uygun çevre koşulları döndüğünüzde. Ancak, uyuyan yumurta banka büyük bir kısmı hiç yumurtadan ve böylece biyolojik Arşivler kurmak zaman içinde oluşturmak için bir şansı var. Uyuyan aşamaları göller ve göletler tortu gömülü kalır ve evrimsel dinamikler çalışma için uzun süreler içinde yeniden canlandırmak. D. magna uyuyan yumurta cinsel rekombinasyon sonucudur çünkü türler25doğal genetik çeşitliliğin iyi bir temsil vardır. Ayrıca, laboratuvarda klonal üreme yoluyla korunabilir. Bu özellikleri doğal genetik çeşitlilik koruyarak isogenic canlılar, benzersiz avantaj sağlarlar.
İki önemli çalışmalar çevre seçimi basınç zaman içinde yaşıyor doğrudan karşılaştırma D. magna aynı nüfus tarihi ve modern torunları avantajları göstermek için sunulmaktadır. D. magna numuneler Gölü yüzüğünden (Danimarka), sığ bir yeniden canlandırmak (5 m Derinlik; yüzey 22 ha) Zaman içinde ortalama sıcaklık ve ısı dalgaları oluşumu bir artış yaşanmıştır karışık gölet. D. magna (alt) nüfus 60 yıl (1960-2005) kapsayan bu zamansal degrade yeniden canlandırmak ve evrimsel yanıt-e doğru sıcaklık ısınma araştırmak için okudu. Ortak bir bahçe deneyi ilk çalışmada,'hayat Tarih fitness bağlantılı özellikleri değişiklikleri yanıt predictions Hükümetlerarası Panel iklim değişikliği için yaklaşan 100 yıl doğrultusunda 6 ° c sıcaklık artışı olarak ölçüldü 26. ikinci çalışmada, mesocosm deney üç rekabetçi yeteneklerini ölçmek için kullanılan ısınma altında (alt) nüfus. Kombine bu deneyler huzurunda, sadece stres ısınma tüm yaşam öyküsü özellikleri ve nüfus plastisite yüksek düzeyde göstermek ve eşit rekabet yetenekleri olduğunu göstermektedir. Bu bulgular tavsiye ederim tek bir stres önemli fitness maliyeti, en azından kalabalıkta empoze etmez gibi ısınma burada okudu.

<table border="0" cellpadding="0" cellspacing="0" width="791">
	<tbody>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:131px;">sampling bags</td>
			<td style="width:145px;">Fisher Scientific</td>
			<td style="width:145px;">11542783</td>
			<td style="width:371px;">Sampling bag revolve round wires closure system and safety tabs sterile polyethylene with writing area clear 89&#181;m thickness 140mm x 229mm, 720mL Fisherbrand</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:131px;">piston corer</td>
			<td style="width:145px;">ENSIS ltd</td>
			<td style="width:145px;">na</td>
			<td>Long, heavy tube plunged into the sea, lake, pond floor to extract samples of mud sediment. Piston corers have a viariable diameter and are generally in PVC</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:131px;">precision scale&#160;</td>
			<td style="width:145px;">Veritas-M124A</td>
			<td>TLP-50</td>
			<td>Analytical Balance</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:131px;">geological sieve</td>
			<td>UKGE limited</td>
			<td>SV7521</td>
			<td>200 mm diameter geological sieve - 1 mm mesh</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:131px;">geological sieve</td>
			<td>UKGE limited</td>
			<td>SV7525</td>
			<td>200 mm diameter geological sieve - 0.125 mm mesh</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:131px;">white sampling tray</td>
			<td style="width:145px;">nhbs</td>
			<td>http://www.nhbs.com/title/view/159614?ad_id=1509</td>
			<td>Standard mulipurpose lab trays&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:131px;">pasteur pipette</td>
			<td style="width:145px;">Globe Scientific inc.</td>
			<td>138020B</td>
			<td>Transfer Pipet, 1.7mL, General Purpose, 87mm, Bulb Draw - 0.9mL</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:131px;">stereo microscope</td>
			<td style="width:145px;">nikon&#160;</td>
			<td style="width:145px;">smz800</td>
			<td>Microscope with magnification range 1x -8x linked to a camera control unit</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:131px;">petri dish</td>
			<td>EduLab</td>
			<td>153-533</td>
			<td>Sterile 90mm diameter plastic petri dish</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:131px;">glass jars&#160;</td>
			<td style="width:145px;">compak</td>
			<td style="width:145px;">Round Jam Jars 4oz</td>
			<td>100 mL jars&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:131px;">glass jars&#160;</td>
			<td style="width:145px;">compak</td>
			<td style="width:145px;">Atum Jars/ Bonta Jar 10oz</td>
			<td>200 mL jars</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:131px;">glass jars&#160;</td>
			<td style="width:145px;">bottlecompanysouth</td>
			<td style="width:145px;">500ml Food Jam Jar With Twist Off Lid</td>
			<td>500 mL jars&#160;</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:131px;">statistical software R</td>
			<td style="width:145px;">https://cran.r-project.org/</td>
			<td style="width:145px;">na</td>
			<td>Free online GNU&#160; language and environment for statistical computing and graphics</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:131px;">microdissection forceps</td>
			<td style="width:145px;">Fisher Scientific</td>
			<td>41122405</td>
			<td>Fine point stainless steel forceps for microdissections</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:131px;">image software</td>
			<td>https://imagej.nih.gov/ij/index.html</td>
			<td style="width:145px;">na</td>
			<td>Open source ImageJ image processing toolkit&#160; written in Java</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:131px;">mesocosm</td>
			<td style="width:145px;">amazon</td>
			<td style="width:145px;">na</td>
			<td>Nobby Fauna-Box III, 41 x 23 x 29 cm, 20.0 Liter</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;">mirocentrifuge tubes&#160;</td>
			<td style="width:145px;">Sigma_Aldrick - Merck</td>
			<td style="width:145px;">Z606340</td>
			<td>premium microcentrifuge tubes 1.5 mL</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;width:131px;">AGENCOURT DNAdvance&#160;&#160;</td>
			<td style="width:145px;">Beckman Coulter</td>
			<td style="width:145px;">A48705</td>
			<td>DNA extraction kit</td>
		</tr>
		<tr height="40">
			<td height="40" style="height:40px;">size standard</td>
			<td style="width:145px;">Thermo Fisher Scientific</td>
			<td>4322682</td>
			<td>LIZ500 - Size standard compatible with ABI sequencers</td>
		</tr>
		<tr height="20">
			<td height="20" style="height:20px;width:131px;">ABI3032 sequencer</td>
			<td style="width:145px;">ABI</td>
			<td style="width:145px;">na</td>
			<td>Sequencer used to perform fragment analysis or sanger sequencing</td>
		</tr>
	</tbody>
</table>

resurrection of dormant daphnia magna: protocol and applications

Uzun vadeli çalışmalar uzun süreler içinde oluşan Eko-evrimsel süreçleri tanımlaması etkinleştirin. Buna ek olarak, onlar akıllı modelleme evrimsel doğal ekosistemlerin yanıt-e doğru gelecekteki çevresel değişiklikler tahmin etmek için kullanılan önemli ampirik veri sağlar. Ancak, birkaç istisnai durumlar, uzun vadeli çalışmalar zamansal örnekleri erişme ile ilgili lojistik zorluklar nedeniyle azdır. Zamansal dinamiği sık vahşi doğal nüfus evrimi yeniden olağanüstü çalışmaları ile laboratuvar veya kontrollü mesocosm deneyler incelenmektedir.
Burada, Standart prosedür (SOP) canlandırmak veya önemli ölçüde state-of--art boyuna veri koleksiyonunda ilerlemek için uyuyan Daphnia magna, sucul ekosistemler, bir yaygın plankton kilittaşı türler diriltmek için sağlanmıştır. doğal sistemlerin. İlk diapausing plankton yumurta tarihe geri 1980'lerin kuluçkalık çalışır halde diriliş ekoloji alanında Kerfoot ve iş arkadaşları tarafından 1999 yılında tanımlanmıştır. Kerfoot'ın seminal gazeteden beri plankton türler resurrecting metodoloji giderek daha sık, doğrudan bilgi transferi yoluyla sadece laboratuvarlar arasında yayılır rağmen uygulanmıştır. Burada, bir SOP uyuyan Daphnia magna resurrecting uygulaması üzerinde adım adım bir protokol sağlayan anlatılan yumurta.
Hangi fitness tepki Daphnia magna nüfus için yeniden canlandırmak olarak ısınma ölçülür, iki anahtar çalışma tarihi ve modern nüfus aynı ayarları çalışma yeteneği üzerinde sermaye sağlanmaktadır. Son olarak, sonraki nesil sıralama teknolojileri uygulamaya canlandı veya hala atıl aşamaları ele alınmıştır. Bu teknolojiler süreçleri ve seçim basınç değişiklikleri zaman içinde yaşamış nüfus uyguladıysanız evrim mekanizmaları dissekan benzeri görülmemiş güç sağlar.

Uzun vadeli ampirik veri anlama evrimsel dinamikler ve sebat doğal nüfus için kritik öneme sahiptir. Bu gibi veriler geçici örnekleri ve veri toplama için uzun vadeli taahhütte bulunmadan şartı erişme ile ilgili lojistik zorluklar nedeniyle elde etmek için genellikle zor. Burada sunulan iki önemli çalışmalarda temiz su ekosistemleri içinde merkezi bir zooplankter sıcaklığını yanıt ampirik kanıtlar üzerinde evrimsel kez sağlanır. Bu tarihsel nüfus ve modern torunları cevaben ortak deneysel ayarlarında çevresel stres çalışma fırsatı sağlar katmanlı uyuyan yumurta bankalar kullanılarak etkinleştirilir.
Ortak Bahçe deney Tüm yaşam öyküsü özellikleri sıcaklık için yanıt ortak Bahçe deneme gösterdi (şekil 6 ve Şekil 7). ANOVA çözümleme tüm (alt) örneğin alınma olasılığını yanıt vermeyen ölüm dışında yanıt sıcaklığa plastisite (Tablo 2), üzerinden ortaya. Evrimsel değişiklikler ((alt) nüfus arasındaki farklar) kanıtı iki üç önemli ölçüde artış sadece nüfus artış hızı (Tablo 2), içinde gözlenen (alt) nüfus 24 ° c (şekil 6).
<img alt="Figure 6" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56637/56637fig6.jpg"> Şekil 6: ortak Bahçe deney. Reaksiyon normları yaşam öyküsü özellikleri (verimlilik, boyutu ve yaş Vadesinde) ve nüfus artış hızı (r) için ortak Bahçe ve geçerli sıcaklık rejimi (18 ° C) ile karşılaştırıldığında (24 ° C) ısınma sıcaklık altında her (alt) nüfus için gösterilir. Nüfus artış hızı 'r' (1) Eulerian Denklem kullanılarak hesaplanır. Güven aralıkları gösterilmiştir. (Sub) nüfus are renk kodlu: (i) mavi: 1960-1970; (ii) yeşil: 1970-1985; (iii) kırmızı: > 1999. <a href="//cloudflare-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/56637/56637fig6large.jpg" target="_blank">Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.</a>
<img alt="Figure 7" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56637/56637fig7.jpg"> Şekil 7: ölüm. Mortalite oranları (alt) nüfus başına (1960-1970; 1970-1985; > 1999) ısınma (24 ° C altında) modern sıcaklık rejimleri (18 ° C) ile karşılaştırıldığında gösterilir. <a href="//cloudflare-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/56637/56637fig7large.jpg" target="_blank">Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.</a>
Mesocosm deneyi Seçimin dört hafta sonra temsil 24 ° C, frekans üç ısınma tarafından (alt) nüfus değişmedi (χ2 0,55, P = 0,76 =) ile karşılaştırıldığında ilk inoculum (şekil 8). Mesocosm deneyde aşısını 30 genotip arasında çoğunluk seçim (Şekil 9) dört hafta sonra tespit edilmiştir. Özellikle, %70 inoculated genotip kurtarılan, her bir örnek 32 bireylerin genotip en az bir temsilcisi kurtarma Poissonian beklenti ile uyumlu idi.
<img alt="Figure 8" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56637/56637fig8.jpg"> Şekil 8: yarışma deneme - nüfus sıklığı. Nüfus ortalama medyan ve Dörttebirlikler (25inci ve 75inci), üç için gösterilen D. magna (alt) nüfus mesocosm rekabet deneyler (24 ° C), bir başlangıç eşit frekansta (karşılaştırıldığında seçimde dört hafta sonra başlangıç). (Sub) nüfus renk şekil 6' da gösterildiği gibi kodlarına sahiptir. <a href="//cloudflare-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/56637/56637fig8large.jpg" target="_blank">Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.</a>
<img alt="Figure 9" class="xfigimg" src="/files/ftp_upload/56637/56637fig9.jpg"> Şekil 9: yarışma deneme - genotip sıklığı. Genotip Frekanslar — ortalama medyan ve Dörttebirlikler (25inci ve 75inci), ısınma (24 ° C) ile karşılaştırıldığında genotip (noktalı çizgi) bir başlangıç eşit sıklığını maruz dört hafta sonra gösterilir. X ekseni üzerinde isimleri (alt) nüfus gruplandırılmış aşısını genotip kimliği (mavi, 1960-1970; yeşil, 1970-1985; kırmızı, > 1999). <a href="//cloudflare-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/56637/56637fig9large.jpg" target="_blank">Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.</a>
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody>
<tr>
<td>Odağı</td>
			<td>BİR</td>
			<td>Boyut aralığı (bp)</td>
			<td colspan="2">Astar (5' - 3')</td>
			<td>Boya etiket</td>
			<td>Tekrar motifi</td>
			<td>TM</td>
		</tr>
<tr>
<td rowspan="2">B008</td>
			<td rowspan="2">HQ234154</td>
			<td rowspan="2">150-170</td>
			<td colspan="2">F: TGGGATCACAACGTTACACAA</td>
			<td rowspan="2">VIC</td>
			<td rowspan="2">(TC) 9
</td>
			<td rowspan="2">56</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">BİLGİ: GCTGCTCGAGTCCTGAAATC</td>
		</tr>
<tr>
<td rowspan="2">B030</td>
			<td rowspan="2">HQ234160</td>
			<td rowspan="2">154-172</td>
			<td colspan="2">F: CCAGCACACAAAGACGAA</td>
			<td rowspan="2">EVDE BESLENEN HAYVAN</td>
			<td rowspan="2">(GA) 11
</td>
			<td rowspan="2">56</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">BİLGİ: ACCATTTCTCTCCCCCAACT</td>
		</tr>
<tr>
<td rowspan="2">B045</td>
			<td rowspan="2">HQ234168</td>
			<td rowspan="2">118-126</td>
			<td colspan="2">F: GCTCATCATCCCTCTGCTTC</td>
			<td rowspan="2">NED</td>
			<td rowspan="2">(TG) 8
</td>
			<td rowspan="2">56</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">BİLGİ: ATAGTTTCAGCAACGCGTCA</td>
		</tr>
<tr>
<td rowspan="2">B050</td>
			<td rowspan="2">HQ234170</td>
			<td rowspan="2">234-248</td>
			<td colspan="2">F: TTTCAAAAATCGCTCCCATC</td>
			<td rowspan="2">6FAM</td>
			<td rowspan="2">(GAA) 6
</td>
			<td rowspan="2">56</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">BİLGİ: TATGGCGTGGAATGTTTCAG</td>
		</tr>
<tr>
<td rowspan="2">B064</td>
			<td rowspan="2">HQ234172</td>
			<td rowspan="2">135-151</td>
			<td colspan="2">F: CTCCTTAGCAACCGAATCCA</td>
			<td rowspan="2">6FAM</td>
			<td rowspan="2">(TC) 8
</td>
			<td rowspan="2">56</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">BİLGİ: CAAACGCGTTCGATTAAAGA</td>
		</tr>
<tr>
<td rowspan="2">B074</td>
			<td rowspan="2">HQ234174</td>
			<td rowspan="2">196-204</td>
			<td colspan="2">F: TCTTTCAGCGCACAATGAAT</td>
			<td rowspan="2">NED</td>
			<td rowspan="2">(GT) 9
</td>
			<td rowspan="2">56</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">BİLGİ: TGTGTTCCTTGTCAACTGTCG</td>
		</tr>
<tr>
<td rowspan="2">B096</td>
			<td rowspan="2">HQ234181</td>
			<td rowspan="2">234-240</td>
			<td colspan="2">F: GGATCTGGCAGGAAGTGGTA</td>
			<td rowspan="2">VIC</td>
			<td rowspan="2">(AC) 15
</td>
			<td rowspan="2">56</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">BİLGİ: TTGAACCACGTCGAGGATTT</td>
		</tr>
<tr>
<td rowspan="2">B107</td>
			<td rowspan="2">HQ234184</td>
			<td rowspan="2">250-274</td>
			<td colspan="2">F: GGGGTGAAGCATCAAAGAAA</td>
			<td rowspan="2">EVDE BESLENEN HAYVAN</td>
			<td rowspan="2">(CT) 8
</td>
			<td rowspan="2">56</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">BİLGİ: TGTGACCAGGATAAGAGAAGAGG</td>
		</tr>
</tbody></table>Tablo 1: Microsatellite multiplex. NCBI katılım numarası (AN), çok katmanlı bilgi, PCR astar dizileri, PCR boyutu aralığı, tekrar motifi, ileri astar ve tavlama sıcaklığı (Tm) gösterilen etiket için kullanılan boya.
<table border="1" fo:keep-together.within-page="1" fo:keep-with-next.within-page="always"><tbody>
<tr>
<td colspan="2">Pop büyüme oranı (r)</td>
			<td>DF</td>
			<td>F</td>
			<td>P</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">Evrim (Pop)</td>
			<td>2</td>
			<td>30.309</td>
			<td>< 0,001</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">Plastisite (Temp)</td>
			<td>1</td>
			<td>531.546</td>
			<td>< 0,001</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">Evol. Plastisite (Pop x Temp)</td>
			<td>2</td>
			<td>65.137</td>
			<td>< 0,001</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">Mortalite</td>
			<td>DF</td>
			<td>F</td>
			<td>P</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">Evrim (Pop)</td>
			<td>2</td>
			<td>2.234</td>
			<td>0.1162</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">Plastisite (Temp)</td>
			<td>1</td>
			<td>2.679</td>
			<td>0.1071</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">Evol. Plastisite (Pop x Temp)</td>
			<td>2</td>
			<td>1.8657</td>
			<td>0.164</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">Verimlilik</td>
			<td>DF</td>
			<td>F</td>
			<td>P</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">Evrim (Pop)</td>
			<td>2</td>
			<td>1.8852</td>
			<td>0.1633</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">Plastisite (Temp)</td>
			<td>1</td>
			<td>6.8934</td>
			<td>0.0117</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">Evol. Plastisite (Pop x Temp)</td>
			<td>2</td>
			<td>1.6511</td>
			<td>0,203</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">Vadesinde boyutu</td>
			<td>DF</td>
			<td>F</td>
			<td>P</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">Evrim (Pop)</td>
			<td>2</td>
			<td>0,211</td>
			<td>0.8106</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">Plastisite (Temp)</td>
			<td>1</td>
			<td>11.1361</td>
			<td>0.0017</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">Evol. Plastisite (Pop x Temp)</td>
			<td>2</td>
			<td>0.6586</td>
			<td>0.5225</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">Vade sonunda yaş</td>
			<td>DF</td>
			<td>F</td>
			<td>P</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">Evrim (Pop)</td>
			<td>2</td>
			<td>0.7811</td>
			<td>0.4637</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">Plastisite (Temp)</td>
			<td>1</td>
			<td>8.0764</td>
			<td>0.0066</td>
		</tr>
<tr>
<td colspan="2">Evol. Plastisite (Pop x Temp)</td>
			<td>2</td>
			<td>0.088</td>
			<td>0.9159</td>
		</tr>
</tbody></table>Tablo 2: Varyans analizi (ANOVA). Hayat Tarih özellikleri ve nüfus artış hızı ısınmaya maruz dirilen (alt) örneğin alınma olasılığını değişiklikler evrimsel adaptasyon (nüfus), plastisite (sıcaklık tedavi), tarafından açıklanmıştır mi test Varyans analizi ve onların etkileşim dönem (plastisite evrimi). Önemli p-değerleri (p< 0,05) kalın olarak gösterilir.
Ek Video 1: tortu çekirdek örnekleme. Big Ben corer kullanımı gösterilmiştir. Big Ben 14 cm bir iç tüp çapı yaklaşık 1,5 m uzunluğunda bir çekirdek boru var. Bir ip ve çubuklar tüp tortu sürücüye bağlı bir corer kafa, bir piston oluşur. Bir çekirdek alıcı küçük bir gemi dağıtılan çekirdek tüp desteklemek için kullanılır. Piston yerçekimi basıncı ile tortu aşağı itti. Bir çerçeve çekirdek tüp pistonu yukarı doğru iter bir değiştirilmiş şişe jack kullanarak yapılan ekstrüzyon işlemi sırasında desteklemek için kullanılır. Her tortu katmanı düz metal bir yüzeye dokunarak toplanan ve uzun süreli depolama için şeffaf örnekleme çanta transfer [karanlık ve soğuk (4 ° C) koşulları]. <a href="https://cloudflare-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/56637/Supplementary_video1_Sampling.mp4">Bu dosyayı indirmek için buraya tıklayınız.</a>
Ek Video 2: Sediment eleme. Sediment eleme için gerekli duyarlılık ölçeği, beyaz örnekleme tepsiler ve jeolojik elekler cihazıdır. Her tortu katmandan en az 5 g radyometrik flört için korunur. Tortu kalan ephippia izole etmek için kullanılır. Tortu ile iki jeolojik elekler, 1 mm ile bir ve ikinci birbiri üstüne yığılmış 125 µm Kafes boyutu ile elenmiş. Orta kil, büyük omurgasızlar ve Partiküler madde ayırmak için 1 mm mesh elek dökülür. 125 µm fileli ikinci elek üzerine döküp orta D. magna ephippia ve küçük partikül madde ayırır. Tortu aliquots sonra bir beyaz örnekleme tepsiye aktarılır. D. magna ephippia göz beyaz arka plan tepsisinde tarafından farkedildi. Ephippia her katmandan ayrı Petri yemeklerinde toplanır. <a href="https://cloudflare-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/56637/Supplementary_video2_Sieving_sediment.mp4">Bu dosyayı indirmek için buraya tıklayınız.</a>
Ek Video 3: kapsülden çıkarma. Bir stereomicroscope altında D. magna ephippia açılan mikrodiseksiyon Forseps ile kitin durumda omurga üzerinde basınç uygulayarak. İç yumurta membran ince kaldırılır ve yumurta hafifçe dinlenme Pasteur pipet ile orta 10 mL içeren bir Petri kabına aktarılır. <a href="https://cloudflare-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/56637/Supplementary_video3_Decapsulation.mp4">Bu dosyayı indirmek için buraya tıklayınız.</a>
Ek Video 4: çıkım. Uzun photoperiod ve 20 ° C maruz kaldıktan sonra embriyo gelişimi 48 h ile birkaç hafta arasında devam eder. Geliştirme tamamlandığında, embriyo yumurta kabuğu'arın ve serbestçe ortamda yüz. <a href="https://cloudflare-jove-com.remotexs.ntu.edu.sg/files/ftp_upload/56637/Supplementary_video4_Hatching.mp4">Bu dosyayı indirmek için buraya tıklayınız.</a>

Watch this Scientific Journal Video about Resurrection of Dormant Daphnia magna: Protocol and Applications at JoVE.com

Resurrection of Dormant Daphnia magna: Protocol and Applications

Uzun vadeli çalışmalar evrim süreci ve adaptasyon mekanizmaları anlamak için gerekli. Genel olarak, bu çalışmalar araştırmacıların ömür boyu ötesinde taahhütleri gerektirir. Burada, güçlü bir yöntem büyük ölçüde doğal sistemlerinde boyuna verileri oluşturmak için state-of--art veri toplama gelişmeler açıklanmıştır.

Diriliş uyuyan Daphnia magna: Protokolü ve uygulamaları

Long-term studies enable the identification of eco-evolutionary processes that occur over extended time periods. In addition, they provide key empirical ...

resurrection-of-dormant-daphnia-magna-protocol-and-applications

Nanyang Technological University

Research

JoVE Journal

Environment

Resurrection of Dormant Daphnia magna: Protocol and Applications

18.2K Görüntüleme.  University of Birmingham. Uzun vadeli çalışmalar evrim süreci ve adaptasyon mekanizmaları anlamak için gerekli. Genel olarak, bu çalışmalar araştırmacıların ömür boyu ötesinde taahhütleri gerektirir. Burada, güçlü bir yöntem büyük ölçüde doğal sistemlerinde boyuna verileri oluşturmak için state-of--art veri toplama gelişmeler açıklanmıştır.

Video: Resurrection of Dormant Daphnia magna: Protocol and Applications

A Protocol for Conducting Rainfall Simulation to Study Soil Runoff

Rainfall is a driving force for the transport of environmental contaminants from agricultural soils to surficial water bodies via surface runoff. The objective of this study was to characterize the effects of antecedent soil moisture content on the fate and transport of surface applied commercial urea, a common form of nitrogen (N) fertilizer, following a rainfall event that occurs within 24&#160;hr&#160;after fertilizer application. Although urea is assumed to be readily hydrolyzed to ammonium and therefore not often available for transport, recent studies suggest that urea can be transported from agricultural soils to coastal waters where it is implicated in harmful algal blooms. A rainfall simulator was used to apply a consistent rate of uniform rainfall across packed soil boxes that had been prewetted to different soil moisture contents. By controlling rainfall and soil physical characteristics, the effects of antecedent soil moisture on urea loss were isolated. Wetter soils exhibited shorter time from rainfall initiation to runoff initiation, greater total volume of runoff, higher urea concentrations in runoff, and greater mass loadings of urea in runoff. These results also demonstrate the importance of controlling for antecedent soil moisture content in studies designed to isolate other variables, such as soil physical or chemical characteristics, slope, soil cover, management, or rainfall characteristics. Because rainfall simulators are designed to deliver raindrops of similar size and velocity as natural rainfall, studies conducted under a standardized protocol can yield valuable data that, in turn, can be used to develop models for predicting the fate and transport of pollutants in runoff.

A rainfall simulator was used to apply a consistent rate of uniform rainfall to packed soil boxes in a study of the fate and transport of urea, a nonpoint source environmental contaminant. Under uniform soil and rainfall conditions, antecedent soil moisture content exerted strong control over urea loss in surface runoff.

Toprak Debinin Eğitim için Yağmur Simülasyon yürütülmesi için protokol

Rainfall is a driving force for the transport of environmental contaminants from agricultural soils to surficial water bodies via surface runoff. The ...

Çevre

A Push-pull Protocol to Reduce Colonization of Bird Nest Boxes by Honey Bees

Introduction of the invasive Africanized honey bee (AHB) into the Neotropics is a serious problem for many cavity nesting birds, specifically parrots. These bees select cavities that are suitable nest sites for birds, resulting in competition. The difficulty of removing bees and their defensive behavior makes a prevention protocol necessary. Here, we describe a push-pull integrated pest management protocol to deter bees from inhabiting bird boxes by applying a bird safe insecticide, permethrin, to repel bees from nest boxes, while simultaneously attracting them to pheromone-baited swarm traps. Shown here is an example experiment using Barn Owl nest boxes. This protocol successfully reduced colonization of Barn Owl nest boxes by Africanized honey bees. This protocol is flexible, allowing adjustments to accommodate a wide range of bird species and habitats. This protocol could benefit conservation efforts where AHB are located.

Preventing colonization of bird nest boxes by invasive Africanized honey bees is important for conservation efforts of nest-site limited birds. We provide an integrated pest management approach to &#34;push&#34; bees away from nest boxes with a repellant insecticide, permethrin, and &#34;pull&#34; them toward pheromone baited swarm traps.

Bir Push-pull Protokolü Bal Arısı ile kolonizasyon Bird Nest Kutular azaltmak için

Introduction of the invasive Africanized honey bee (AHB) into the Neotropics is a serious problem for many cavity nesting birds, specifically parrots. ...

A Protocol for Collecting and Constructing Soil Core Lysimeters

Leaching of nutrients from land applied fertilizers and manure used in agriculture can lead to accelerated eutrophication of surface water. Because the landscape has complex and varied soil morphology, an accompanying disparity in flow paths for leachate through the soil macropore and matrix structure is present. The rate of flow through these paths is further affected by antecedent soil moisture. Lysimeters are used to quantify flow rate, volume of water and concentration of nutrients leaching downward through soils. While many lysimeter designs exist, accurately determining the volume of water and mass balance of nutrients is best accomplished with bounded lysimeters that leave the natural soil structure intact. 
Here we present a detailed method for the extraction and construction of soil core lysimeters equipped with soil moisture sensors at 5 cm and 25 cm depths. Lysimeters from four different Coastal Plain soils (Bojac, Evesboro, Quindocqua and Sassafras) were collected on the Delmarva Peninsula and moved to an indoor climate controlled facility. Soils were irrigated once weekly with the equivalent of 2 cm of rainfall to draw down soil nitrate-N concentrations. At the end of the draw down period, poultry litter was applied (162 kg TN ha-1) and leaching was resumed for an additional five weeks. Total recovery of applied irrigation water varied from 71% to 85%. Nitrate-N concentration varied over the course of the study from an average of 27.1 mg L-1 before litter application to 40.3 mg L-1 following litter application. While greatest flux of nutrients was measured in soils dominated by coarse sand (Sassafras) the greatest immediate flux occurred from the finest textured soil with pronounced macropore development (Quindocqua).

A detailed method for extraction and assembly of intact soil core lysimeters and their use for study of leachate and associated loss of nutrients from surface applied poultry litter is demonstrated.

Toprak Çekirdek lizimetereleri Toplama ve oluşturulması için bir protokol

Leaching of nutrients from land applied fertilizers and manure used in agriculture can lead to accelerated eutrophication of surface water. Because the ...

Experimental Protocol for Detecting Cyanobacteria in Liquid and Solid Samples with an Antibody Microarray Chip

Global warming and eutrophication make some aquatic ecosystems behave as true bioreactors that trigger rapid and massive cyanobacterial growth; this has relevant health and economic consequences. Many cyanobacterial strains are toxin producers, and only a few cells are necessary to induce irreparable damage to the environment. Therefore, water-body authorities and administrations require rapid and efficient early-warning systems providing reliable data to support their preventive or curative decisions. This manuscript reports an experimental protocol for the in-field detection of toxin-producing cyanobacterial strains by using an antibody microarray chip with 17 antibodies (Abs) with taxonomic resolution (CYANOCHIP). Here, a multiplex fluorescent sandwich microarray immunoassay (FSMI) for the simultaneous monitoring of 17 cyanobacterial strains frequently found blooming in freshwater ecosystems, some of them toxin producers, is described. A microarray with multiple identical replicates (up to 24) of the CYANOCHIP was printed onto a single microscope slide to simultaneously test a similar number of samples. Liquid samples can be tested either by direct incubation with the antibodies (Abs) or after cell concentration by filtration through a 1- to 3-&#956;m filter. Solid samples, such as sediments and ground rocks, are first homogenized and dispersed by a hand-held ultrasonicator in an incubation buffer. They are then filtered (5 - 20 &#956;m) to remove the coarse material, and the filtrate is incubated with Abs. Immunoreactions are revealed by a final incubation with a mixture of the 17 fluorescence-labeled Abs and are read by a portable fluorescence detector. The whole process takes around 3 h, most of it corresponding to two 1-h periods of incubation. The output is an image, where bright spots correspond to the positive detection of cyanobacterial markers.

Experimental Protocol for Detecting Cyanobacteria in Liquid and Solid Samples with an Antibody Microarray Chip

The presence of cyanobacterial toxins in fresh water reservoirs for human consumption is a major concern for water management authorities. To evaluate the risk of water contamination, this article describes an protocol for the in-field detection of cyanobacterial strains in liquid and solid samples by using an antibody microarray chip.

Saptamak için deneysel protokol<em&gt; Siyanobakteri</em&gt; Bir Antikor Mikroarray Chip ile Sıvı ve Katı Örneklerinde

Global warming and eutrophication make some aquatic ecosystems behave as true bioreactors that trigger rapid and massive cyanobacterial growth; this has ...

Protocol for Microplastics Sampling on the Sea Surface and Sample Analysis

Microplastic pollution in the marine environment is a scientific topic that has received increasing attention over the last decade. The majority of scientific publications address microplastic pollution of the sea surface. The protocol below describes the methodology for sampling, sample preparation, separation and chemical identification of microplastic particles. A manta net fixed on an &#187;A frame&#171; attached to the side of the vessel was used for sampling. Microplastic particles caught in the cod end of the net were separated from samples by visual identification and use of stereomicroscopes. Particles were analyzed for their size using an image analysis program and for their chemical structure using ATR-FTIR and micro FTIR spectroscopy. The described protocol is in line with recommendations for microplastics monitoring published by the Marine Strategy Framework Directive (MSFD) Technical Subgroup on Marine Litter. This written protocol with video guide will support the work of researchers that deal with microplastics monitoring all over the world.

The protocol below describes the methodology for: microplastics sampling on the sea surface, separation of microplastic and chemical identification of particles. This protocol is in line with the recommendations for microplastics monitoring published by the MSFD Technical Subgroup on Marine Litter.

Deniz Yüzey ve Numune Analizi Microplastics Örnekleme Protokolü

Microplastic pollution in the marine environment is a scientific topic that has received increasing attention over the last decade. The majority of ...

Data Processing Methods for 3D Seismic Imaging of Subsurface Volcanoes: Applications to the Tarim Flood Basalt

The morphology and structure of plumbing systems can provide key information on the eruption rate and style of basalt lava fields. The most powerful way to study subsurface geo-bodies is to use industrial 3D&#160;reflection seismological imaging. However, strategies to image subsurface volcanoes are very different from that of oil and gas reservoirs. In this study, we process seismic data cubes from the Northern Tarim Basin, China, to illustrate how to visualize sills through opacity rendering techniques and how to image the conduits by time-slicing. In the first case, we isolated probes by the seismic horizons marking the contacts between sills and encasing strata, applying opacity rendering techniques to extract sills from the seismic cube. The resulting detailed sill morphology shows that the flow direction is from the dome center to the rim. In the second seismic cube, we use time-slices to image the conduits, which corresponds to marked discontinuities within the encasing rocks. A set of time-slices obtained at different depths show that the Tarim flood basalts erupted from central volcanoes, fed by separate pipe-like conduits.

Three-dimensional (3D) reflection seismology is a powerful method for imaging subsurface volcanoes. By using industrial 3D seismological data from the Tarim Basin, we illustrate how to extract the sills and the conduits of subsurface volcanoes from seismic data cubes.

Yeraltı volkanlar 3D sismik görüntüleme için veri işleme yöntemleri: Tarım sel bazalt uygulamaları

The morphology and structure of plumbing systems can provide key information on the eruption rate and style of basalt lava fields. The most powerful way ...

Dispersion of Nanomaterials in Aqueous Media: Towards Protocol Optimization

The sonication process is commonly used for de-agglomerating and dispersing nanomaterials in aqueous based media, necessary to improve homogeneity and stability of the suspension. In this study, a systematic step-wise approach is carried out to identify optimal sonication conditions in order to achieve a stable dispersion. This approach has been adopted and shown to be suitable for several nanomaterials (cerium oxide, zinc oxide, and carbon nanotubes) dispersed in deionized (DI) water. However, with any change in either the nanomaterial type or dispersing medium, there needs to be optimization of the basic protocol by adjusting various factors such as sonication time, power, and sonicator type as well as temperature rise during the process. The approach records the dispersion process in detail. This is necessary to identify the time points as well as other above-mentioned conditions during the sonication process in which there may be undesirable changes, such as damage to the particle surface thus affecting surface properties. Our goal is to offer a harmonized approach that can control the quality of the final, produced dispersion. Such a guideline is instrumental in ensuring dispersion quality repeatability in the nanoscience community, particularly in the field of nanotoxicology.

Here, we present a step-wise protocol for the dispersion of nanomaterials in aqueous media with real-time characterization to identify the optimal sonication conditions, intensity, and duration for improved stability and uniformity of nanoparticle dispersions without impacting the sample integrity.

Nanomalzemeler sulu ortamda dağılımı: doğru iletişim kuralı en iyi duruma getirme

The sonication process is commonly used for de-agglomerating and dispersing nanomaterials in aqueous based media, necessary to improve homogeneity and ...

Microfluidic Devices for Characterizing Pore-scale Event Processes in Porous Media for Oil Recovery Applications

Microfluidic devices are versatile tools for studying transport processes at a microscopic scale. A demand exists for microfluidic devices that are resistant to low molecular-weight oil components, unlike traditional polydimethylsiloxane (PDMS) devices. Here, we demonstrate a facile method for making a device with this property, and we use the product of this protocol for examining the pore-scale mechanisms by which foam recovers crude oil. A pattern is first designed using computer-aided design (CAD) software and printed on a transparency with a high-resolution printer. This pattern is then transferred to a photoresist via a lithography procedure. PDMS is cast on the pattern, cured in an oven, and removed to obtain a mold. A thiol-ene crosslinking polymer, commonly used as an optical adhesive (OA), is then poured onto the mold and cured under UV light. The PDMS mold is peeled away from the optical adhesive cast. A glass substrate is then prepared, and the two halves of the device are bonded together. Optical adhesive-based devices are more robust than traditional PDMS microfluidic devices. The epoxy structure is resistant to swelling by many organic solvents, which opens new possibilities for experiments involving light organic liquids. Additionally, the surface wettability behavior of these devices is more stable than that of PDMS. The construction of optical adhesive microfluidic devices is simple, yet requires incrementally more effort than the making of PDMS-based devices. Also, though optical adhesive devices are stable in organic liquids, they may exhibit reduced bond-strength after a long time. Optical adhesive microfluidic devices can be made in geometries that act as 2-D micromodels for porous media. These devices are applied in the study of oil displacement to improve our understanding of the pore-scale mechanisms involved in enhanced oil recovery and aquifer remediation.

The goal of this procedure is to easily and rapidly produce a microfluidic device with customizable geometry and resistance to swelling by organic fluids for oil recovery studies. A polydimethylsiloxane mold is first generated, and then used to cast the epoxy-based device. A representative displacement study is reported.

Gözenek çaplı olay süreçleri gözenekli ortamda petrol kurtarma uygulamaları için karakterize için mikrosıvısal aygıtlar

Microfluidic devices are versatile tools for studying transport processes at a microscopic scale. A demand exists for microfluidic devices that are ...

Preparation of DMMTAV and DMDTAV Using DMAV for Environmental Applications: Synthesis, Purification, and Confirmation

Dimethylated thioarsenicals such as dimethylmonothioarsinic acid (DMMTAV) and dimethyldithioarsinic acid (DMDTAV), which are produced by the metabolic pathway of dimethylarsinic acid (DMAV) thiolation, have been recently found in the environment as well as human organs. DMMTAV and DMDTAV can be quantified to determine the ecological effects of dimethylated thioarsenicals and their stability in environmental media. The synthesis method for these compounds is unstandardized, making replicating previous studies challenging. Furthermore, there is a lack of information about storage techniques, including storage of compounds without species transformation. Moreover, because only limited information about synthesis methods is available, there may be experimental difficulties in synthesizing standard chemicals and performing quantitative analysis. The protocol presented herein provides a practically modified synthesis method for the dimethylated thioarsenicals, DMMTAV and DMDTAV, and will help in the quantification of species separation analysis using high performance liquid chromatography in conjunction with inductively coupled plasma mass spectrometry (HPLC-ICP-MS). The experimental steps of this procedure were modified by focusing on the preparation of chemical reagents, filtration methods, and storage.

Preparation of DMMTAV and DMDTAV Using DMAV for Environmental Applications: Synthesis, Purification, and Confirmation

This article presents modified experimental protocols for dimethylmonothioarsinic acid (DMMTAV) and dimethyldithioarsinic acid (DMDTAV) synthesis, inducing dimethylarsinic acid (DMAV) thiolation through mixing of DMAV, Na2S, and H2SO4. The modified protocol provides an experimental guideline, thereby overcoming limitations of the synthesis steps that could have caused experimental failures in quantitative analysis.

DMMTAV ve çevresel uygulamaları için DMAV kullanarak DMDTAV hazırlanması: sentez, arıtma ve onay

Dimethylated thioarsenicals such as dimethylmonothioarsinic acid (DMMTAV) and dimethyldithioarsinic acid (DMDTAV), which are produced by the metabolic ...

Protocol for Acute and Chronic Ecotoxicity Testing of the Turquoise Killifish Nothobranchius furzeri

The killifish Nothobranchius furzeri is an emerging model organism in the field of ecotoxicology and its applicability in acute and chronic ecotoxicity testing has been demonstrated. Overall, the sensitivity of the species to toxic compounds is in the range with, or higher than, that of other model species.
This work describes protocols for acute, chronic, and multigenerational bioassays of single and combined stressor effects on N. furzeri. Due to its short maturation time and life-cycle, this vertebrate model allows the study of endpoints such as maturation time and fecundity within four months. Transgenerational full life-cycle exposure trials can be performed in as little as 8 months. Since this species produces eggs that are drought-resistant and remain viable for years, the on-site culture of the species is not needed but individuals can be recruited when required. The protocols are designed to measure life-history traits (mortality, growth, fecundity, weight) and critical thermal maximum.

Protocol for Acute and Chronic Ecotoxicity Testing of the Turquoise Killifish Nothobranchius furzeri

In this work, we describe an acute, chronic and multigenerational bioassay to study the effects of single and combined stressors on the Turquoise killifish Nothobranchius furzeri. This protocol is designed to study life-history traits (mortality, growth, fecundity, weight) and critical thermal maximum.

Akut ve kronik Ecotoxicity test turkuaz Killifish Nothobranchius furzeri için iletişim kuralı

The killifish Nothobranchius furzeri is an emerging model organism in the field of ecotoxicology and its applicability in acute and chronic ecotoxicity ...