QFSM gelişimi, Ulusal Sağlık Enstitüsü, hibe u01 GM06230 tarafından finanse edilmektedir.

Bölüm 1: FSM için floresan etiketli aktin Alınması Gerekli malzemeler: aktin, fluorofor (Alexa, X-rodamin önerilir) saflaştırılmış. G-tampon, ultrasantrifüjdeki <ol><li> , Iyi FSM filmleri satın bir temel bileşeni seçtiğiniz fluorofor aktin uygun etiketleme (ya da diğer hücre iskeleti proteinleri) gerektirir. Biz Alexa fluorophores (488, 568 dalga boylarında) ve aktin yüzeyinde lizin kalıntılarının maruz hedef X-rodamin succinimidyl ester türevleri kullanmanızı öneririz. </li><li> Fluorofor ve uygun dalga boyu seçerken, floresan etiketi yerleştirmek için (cıva ark lambası ve / veya lazerler) mikroskop kurulum uygun filtreler (eksitasyon ve emisyon) ve aydınlatıcı olduğundan emin olun. Biz oto-floresans ve foto-hasarı etkilerini en aza indirmek ve GFP-konjugatları ile uyumluluğu sağlamak için turuncu, kırmızı dalga boyları (560-630 nm) dalga boylarında seçilmesi tavsiye ederiz. </li><li> Saf aktin Sıçan veya Tavuk ait kas dokusu çıkarılan, ancak kas aseton tozu uzun bir ekstraksiyon prosedürü gerektirir. Kas aseton tozu Invitrogen satın alınabilir. Bu protokol etiketleme prosedürü tartışılan, ama burada [1] bulunabilir </li><li> Alternatif olarak, etiketli aktin proteinler Sitoiskelet Inc ve Invitrogen dahil olmak üzere çeşitli satıcılardan satın alabilirsiniz. Özel etiketleme hizmetleri Invitrogen üzerinden de mevcuttur. Saflaştırılmış, non-etiketli aktin (kas ve kasa invaze olmamış aktin) Sitoiskelet Inc satın alınabilir </li><li> Kendi etiketli aktin satın alma ya da hazırlanmak için karar olsun, etiketleme oranı aktinin monomer başına 0,3 ila 0,7 boyalar etrafında bir yerde olduğundan emin olmak istiyorum. Etiketleme oranı çok yüksek, çok düşük bir etiketleme oranı yoksul görünümlü benekler (gürültü düşük sinyal) yol ise, aktin filament ciro kinetiği (ve ilişkili proteinler bağlanarak) etkileyebilir ve mikroenjeksiyon sorunları (aşağıya bakın) neden olabilir. Bu iyi görüntü speckle almak için kritik bir faktör. </li><li> Uzun süreli depolama önce, etiketli aktin çözüm 75.000 az iplik tarafından açıklığa kavuşturulmalıdır - 4 santigrat derece 20 dakika 80.000 xg. Etiketli aktin G-tampon çözelti depolanır ve -80 santigrat derece tutulmalıdır. 2 uL alikotları hazırlanması çok tekrarlanan (çözünmez agregatların yol açar) donma-çözülme zararlı etkilerini azaltmak için tavsiye edilir. (Fluorophores, photobleaching olacak), doğrudan ışığa etiketli aktin çözüm maruz kaçının. Biz uzun süreli depolama için opak mikrosantrifüj tüpleri kullanmanızı öneririz. </li></ol> Bölüm 2: Hücreler ve Mikroenjeksiyon etiketli aktin hazırlanması Gerekli malzemeler: mikroenjeksiyon iğneler, mikroenjektör, microloaders, prewarmed hücre medya, enjeksiyon tampon, buz kovası, mikroskobu (faz halka, 40X faz kontrast hedefi, transjector, iğne çektirmesi, mikromanipülatör) <ol><li> Birçok hücre tipleri için uygun FSM, ancak iyi görüntü speckle almak mikroenjeksiyon işlemi başarısını doğrudan bağlıdır. FSM hücreleri seçerken, hücreler (&gt; 50 um çapında büyük olmalı), yaymak gerekir, kaplama, ve yüzeylerde (veya plastik doku kültürü yemekleri) doğal yapışık. Aynı zamanda hücrenin sitoplazmada çekirdeğinde daha büyük bir alanı kaplar yardımcı olur. Söz konusu kriterlere hücreler mikroenjeksiyon için uygun olduğundan emin olun. Başarılı aday hücre hatları (ancak bunlarla sınırlı değildir) PtK1 [2,3], newt akciğer hücreleri [4] ve Aplysia nöronlar [3]. </li><li> Asitle yıkanmış; Hücreler kare cam lamelleri (hayır 1-1/2 22 x 22 mm) kaplama olmalıdır. Standart substrat kaplama lamel uygulanabilir ve mikroenjeksiyon etkilemez. </li><li> Mikroenjeksiyon iğneler doğru seçimi ucu açılış büyüklüğüne bağlıdır. Genellikle, delik boyutları boyutu çok büyük 3 0.5 um um. Ancak, biz bu aktin enjeksiyon 0,5 ila 1 um arasında optimal bir açılış boyutu gerektirir tavsiye ederiz. Tıkanma sorunları sürekli karşılaşılan, büyük delik boyutları monomerik teslim yanı sıra istenmeyen polimerize aktin filamentler barındırabilir. Mikroenjeksiyon iğneler femtotip mikroenjeksiyon iğne yapmak Eppendorf sistemleri de dahil olmak üzere çeşitli satıcılar aracılığıyla satın alınabilir. Alternatif olarak eğer ticari bir iğne çektirmenin, cam mikroenjeksiyon tüplerin Sutter satın alınan ve şartnameye çekilir. Yeni başlayanlar için, biz 10-20 çekti iğne enjeksiyon işlemine başlamadan önce taraftan olmasını öneriyoruz. </li><li> Aktin ideal enjeksiyon konsantrasyon &#39;(iğne yüklü aktin final konsantrasyon) ug / ul 1,0 - 0,5 arasında aktin monomeri boya,% 40 etiketleme oranı dayalı. Aktinin Alt etiketleme oranı daha yüksek konsantrasyonlarda (1-3 ug / ul) enjekte edilerek telafi edilebilir. Ancak, iğne tıkanma frekansarttırılabilir. Bu, kısmen daha büyük delikleri olan iğneler kullanılarak hafifletilebilir olabilir. Aktin stok konsantrasyonu buz enjeksiyon tampon ekleyerek sulandırılmış olabilir. Buz gibi soğuk ddH2O da hızlı enjeksiyon için sulandırmak için kullanılabilir. Bu noktada tüm çalışma çözümleri buz üzerinde tutulmalıdır. </li><li> Yük 0.5 - 1.0 uL mikroenjektör (dar göstergesi - Hamilton) kullanarak aktin çözüm, ya da alternatif bir Microloader pipet kullanarak. </li><li> Dikkatli bir şekilde, yavaşça çözüm serbest bırakarak, aktin çözüm dağıtmak. Kabarcıklar kaçınılmalıdır, ancak kabarcık çevresindeki aşırı sıvı alarak kolayca silinebilir. </li><li> Aktin çözüm iğne ucu tamamen dinlenme olduğundan emin olun. Her yerde iğne kılcal birlikte aşırı çözüm enjeksiyon akışını bozabilir. </li><li> Şimdi dikkatli bir şekilde enjektör sahibine, iğne ucu ile temas kaçınarak, iğne takmak. Iğne mikroskop sahne tabanına 35-50 derecelik bir açı yapar, böylece tutucu yerleştirin. Alt açıları tercih edilmektedir. </li><li> Ancak yüzey hücreleri banyo medya tatili kadar iğne ucu indirin. </li><li> Şimdi iğne ucu (düşürmeden) doğrudan hedefi merkezi üzerinde duracak şekilde yerleştirin. Iğne ucu hedefi ile uyumlu ise, göz merceği ile parlak bir hale göreceksiniz. Bu iğne ucu sonu. Yavaş yavaş (manipülatör kullanarak) iğne yan tarafında hareketli hale bulmak daha iyi yardımcı olabilir. </li><li> Mikroskop z odak hücreleri net görüntü kadar ayarlayın. Şimdi, nihayet içine yakınsak iğne ucu kadar hale yavaş yavaş daraltır kadar yavaş yavaş ucu alt odaklama (z konum) aynı anda kontrol etmek gerekecektir. Aramak için bir ek özellik iğne mili, doğrusal gölge. Iğne düşürülmesi yavaş yavaş iğne mili tanımlayabilirsiniz. İğne ve hücrelerin sonuna doğru yapıldığı zaman hem de net bir görüntü olmalıdır. Faz halka hafif ayarı, kontrastı artırmak için gerekli olabilir. </li><li> Gezinirken, iğne ucu ve iğne ucunun kırılmasını önleyen hücreleri yukarıda olduğundan emin olun. </li><li> Enjekte hücreleri seçerken, hücreleri serbest kenarları iğne ucu dönük olmalıdır. Bu paralel çalışan daha iğne ucu yerine, bir araya gelecek (çekirdeğin en ince noktasına öncü bulunduğu kalın noktası) hücre azalan eğim sağlayacaktır. </li><li> Iğne basıncı 0,3 ila 0,8 psi ayarlanmış olmalıdır. Aktin çözüm sürekli bir akış içinde sabit bir basınç uygulanan neden olacaktır. </li><li> Ucu çekirdeği (perinükleer bölge, hücre çekirdeği doğrudan aşağıda kalın bir kısmı) bu yüzden bir hücre enjekte etmeye karar verdikten sonra, iğne pozisyonu. </li><li> Yavaş yavaş daha düşük, ve iğne ucu, iğne ucu zarı delinir kadar, aşamalı olarak daha düşük membran karartıcı kadar pozisyonunu yeniden ayarlamak. Iğne tam zarı delinir varsa, bu fark, artık hücre dokunuyor kadar iğne yükseltmek gördüğünüz gibi, hücrenin en kısa sürede, daha parlak görünecektir. Gerçek piercing ve enjekte süreci 0,5-2 saniye sürecektir. </li><li> Doğru yapıldığı zaman çok enjeksiyon hücre kenar hızlı retraksiyonu sonucu ise, hücre şekli değişmeden görünecektir ve bazı durumlarda aslında hücre patlayabilir göreceksiniz. </li><li> (Parlak olmaz) microinjecting zaman hücre değişiklikleri göremiyorsanız, iğne ucu kapalı olabilir. &#39;Temiz&#39; düğmesine transjector üzerinde varsa basarak test edebilirsiniz. Açarsanız, bu göz mercekleri ile görülebilir sabit basınç akış önemli ölçüde artacak - dalgalanmalar ve yakındaki enkaz dispersiyon görülebileceği gibi görünecektir. </li><li> Eğer iğne ucu kapalı, böylece ucunun sonuna neden, yeni bir mikroenjeksiyon iğne veya iğne ucu, iğne presler cam lamel karşı ucu kadar iğne hafifçe düşürerek kırmaya teşebbüs eklemek için seçebilirsiniz kırılmasına neden olabilir. Kırılması alan iğne ucu (iğne bir noktaya yakınsama başlar bölümü) alanında 1 / 5 inci daha fazla olmalıdır. </li><li> Her mikroenjeksiyon oturumu (hücre tipine göre değişir) 45 dakika - 20 daha fazla harcama, enjeksiyon ile devam edin. Genel bir kural olarak, kısa oturumları hücreleri üzerindeki stresi en aza indirmek için tavsiye edilir. </li><li> Mikroenjeksiyon bitirdikten sonra, taze prewarmed medya ekleyerek çanak hücre ortamı değiştirmek. Daha sonra hücreler 30 dakika önce bir kuluçka görüntüleme kurtarmak için izin verir. Bu aktin mevcut hücre iskeletinin ağ içine entegre etmek için ayrıca izin verecektir. </li></ol> Bölüm 3: Görüntüleme Odası Montajı Gerekli Malzeme: coverglass, çift taraflı bant, q-ipuçları, forseps, valap, kim, oxyrase, görüntüleme medya, jilet, P200 pi silin.pette, saf etanol <ol><li> Görüntüleme medya prewarming ve Oxyrase 15 uL kısım çözülme başlar. Işıktan ışığa oxyrase korumak için emin olun. Ayrıca, oxyrase photobleaching, etkileri büyük ölçüde azaltacaktır. </li><li> Sıcak plaka düşük sıcaklık ayarı, valap Prewarm. Bir dolgu olarak etkinliğini kaybedecektir valap ısınmasına / yanık bırakmayın. </li><li> Bir coverglass aşağı, temiz ve küçük bir enkaz kaldırmak için saf etanol ile doused bir kimwipe silin. </li><li> Temiz, düz bir yüzey bir platform olarak kullanarak, birbirlerinin üstüne çift taraflı bant iki eşit büyüklükte uzunlukları (2.5 cm uzunluğunda), Stack. Tamamen düz bir düzlem oluşturmak için herhangi bir hava kabarcığı basın. </li><li> Bir jilet kullanarak, her bir şerit genişliği 0.5 cm, böylece uzun ekseni boyunca iki düz şeritler kesti. </li><li> Forseps kullanarak, iki bant şeritler sizin coverglass merkezinde bir boşluk oluşturur, böylece sizin coverglass uzun kenarına her şerit yerleştirin. Cam ile güzel bir mühür bandı üzerine hafifçe bastırın. Bant şeritler coverglass ve lamel arasında yer tutucular olarak hareket edecektir. </li><li> Bir sonraki adıma başlamadan önce valap tamamen sıvılaştırılmış emin olun. </li><li> Medya her 500 uL oxyrase 15 ul ekleyerek, prewarmed görüntüleme medya al. </li><li> Katlama Kimwipes üçgen içine 3 sert kenarları oluşturmak için. Bu sopa bandı için kuru bir yüzey oluşturmak için kullanılır. </li><li> Inkübatör hücreler al. Kullanarak, forseps lamel bir köşe kapmak. Hızla bir kimwipe lamel (hücre yan dokuya dokunmadan, yukarı bakacak şekilde) yerleştirin ve yarı kuru bir yüzey oluşturmak için lamel iki karşıt taraf silmek için katlanmış kimwipe kullanmak (yüzey hücreleri geri kalanı). </li><li> Forseps kullanarak, kuru yüzeylerde iki bant şeritler hizalanmış olduğunu bu nedenle bir köşeye lamel kapmak ve coverglass üzerine yerleştirin. Kapalı iki taraf ve iki açık yarıklar var şimdi dikkat edin. Yakın bir açılış görüntüleme-medya-oxyrase çözüm Yavaşça pipet 200 uL. Önemlisi, herhangi bir hava kabarcıkları getirilmelidir. Böylece tam çözüm hücreleri çeker, çözüm kılcal güçleri tarafından yeni oluşturulan odasına kadar emdi olmalıdır. </li><li> Q-tip dab hızlı yapıştırmayın erimiş valap ile lamel dört köşe kullanma ve lamel stabilize. Farkedeceğiniz anında valap kurur (oda sıcaklığında saniye içinde). </li><li> Şimdi açık taraf (non-teyp tarafı) ile başlayan, bir Q-tip ve fırçalama inme taklit valap ince bir şerit yatıyordu. Kapalı taraf için de tekrarlayın. Böylece kaplama adımları tekrarlayarak mühür takviye valap ceket, yavaş yavaş oluşturmak. Valap lamel merkezinde açık bırakarak, kenarları kapalı olmalıdır. </li><li> Hücrelerin ezmek için değil, dikkatli olmak, herhangi bir kalıntı ortamı çıkarmak için ddH2O Q-ucu kullanarak lamel merkez kısmına hafifçe temizleyin. Saf etanol ile temizlik adımı tekrarlayın. </li><li> Artık tamamen kapalı görüntüleme odası, görüntüleme speckle için optimize olacaktır. Tamamen kapalı bir muhafaza hızlı photobleaching fluorophores önleyecektir. </li></ol> Bölüm 4: Görüntüleme hücreleri Gerekli malzemeler: 6.7 mikron piksel, Yüksek sayısal diyafram, yağ daldırma planı Apochromatic hedefleri (60X 100X, faz ya da DIC) ile ters widefield mikroskop, mecury lamba, uygun filtreler, soğutmalı CCD kamera. Titreşim tablosu. Görüntüleme yazılımı. <ol><li> 37 derece için mikroskop sahne Prewarm. Yeni tamamlanan görüntüleme odasına yerleştirin ve görüntüleme önce stabilize etmek için sıcaklık 10-15 dakika bekleyin. </li><li> Parlak alan hücrelerin odaklanarak başlatın ve sonra doğru floresan ayarlarını değiştirir enjekte hücreleri bulmak. Photobleaching azaltmak için floresan maruz kalma süresini en aza indirmek için deneyin. </li><li> Enjekte edilen hücrelerin sağlıklı önde gelen kıvrımlı kenarları bakın. Aşırı enjekte edilen hücrelerin (patladı hücreleri) geri çekilir ve pürüzlü kenarlar ile karakterize, çok sayıda filopodia benzer olacak - bu hücrelerin görüntüleme önlemek. </li><li> Toplama ayarları etiketli aktin hücre tipi, kalitesi ve mikroskop bileşenleri bağlıdır. Ancak, pozlama ayarları 2 saniye daha fazla olması gerektiğini ve kareler arasındaki zaman aralığı 5 ile 10 saniye arasında ayarlanabilir olmalıdır. Tipik bir zaman serisi için boyları (görüntülü hücre başına) herhangi bir yerde 10 ila 30 dakika arasında değişebilir ve photobleaching etkileri sınırlıdır. Kamera ayarları Kazanç gürültü sinyali artırmak için açılabilir. </li><li> Ideal özellikleri bir sonraki komşu speckle çapları speckle her ~ 2 aralıklı speckle olmalıdır speckle. Bu aktin yapısının optimal mekansal ve zamansal örnekleme garanti. Epitel hücreleri için, benekli aktin ağ benek eşit dışında yayılmış, homojen görünecektir. Yoğun stres lifleri veya lamellipodia özelliği hücre hatlarıayırt edilebilir, ancak bir noktalı / benekli görünüme sahip. Pozlama ayarları benekli en iyi görüntü almak için ayarlanabilir olmalıdır. </li><li> Aşırı microinjected hücrelerin ayrık olarak görünmüyor sık ​​donatılı benekler var. Stres elyaf ve lamellipodia noktalı görünümünü kaybedersiniz. </li><li> Altı microinjected hücreleri uzak (&gt; 10 benekler dışında) ve dağınık rastgele görünen benekler içeren, mercek ile çok loş görünecektir. Stres elyaf ve lamellipodia bu hücrelerin ayırt edilemez. </li><li> &#39;Iyi&#39; elde etmek için Anahtar filmleri odaklanmayı sürdürürken speckle. Bu akışı ve ciro ölçümleri speckle içeren sonrası analizi için özellikle önemlidir. Bu nedenle kantitatif analiz kalitesini geçen zaman süresi için odak kilitleme bağlıdır. Görüntü düzlemi oldukça ince ise özellikle zor olabilir. Diğer faktörler mikroskop sistemi istikrar, özellikle sahne konut ve görüntüleme odası bağlıdır. Kontrast-tabanlı odaklama, görüntü aralığı uzunlukları bu özelliği karşılamak için yeterli olup olmadığı kullanılabilir. Diğer seçenekler, güvenilir ve gerçek zamanlı odak ayarlamaları sağlar bir yakın-kızılötesi tabanlı odaklama sistemi satın içerir. Nikon, Olympus ve ASI bu teklifleri bulabilirsiniz. </li></ol> Bölüm 5: qFSM analizi Bu bölümde ayrıntılı olarak ele değil, ancak analiz yazılımı bilgi burada [5] bulunabilir. Yazılım yükleme isteklerini web sitemizi (lccb.scripps.edu) yapılabilir. Konu Başlıkları: <ul><li> Gürültü kalibrasyon </li><li> Algılama speckle </li><li> Kaba hareket görüntü korelasyonu tabanlı izleme melez bir yaklaşım kullanarak Takip, bireysel benekler ayrıntılı hareket alanları ve tek bir parçacık izleme speckle. </li><li> Hesaplama sırasında yoğunluk dalgalanmaları polimer montaj ve demontaj oranları görünüm ve ortadan kaybolma olayları speckle. </li></ul>

<ol>
	<li>Waterman-Storer, C. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Fluorescent+speckle+microscopy+(FSM)+of+microtubules+and+actin+in+living+cells.">Fluorescent speckle microscopy (FSM) of microtubules and actin in living cells.</a> Curr Protoc Cell Biol. Chapter 4, Unit 4.10-Unit 4.10 (2002).</li><li>Ponti, A., Machacek, M., Gupton, S. L., Waterman-Storer, C. M., Danuser, G. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Two+distinct+actin+networks+drive+the+protrusion+of+migrating+cells.">Two distinct actin networks drive the protrusion of migrating cells.</a> Science. 305, 1782-1786 (2004).</li><li>Zhang, X. F., Schaefer, A. W., Burnette, D. T., Schoonderwoert, V. T., Forscher, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Rho-dependent+contractile+responses+in+the+neuronal+growth+cone+are+independent+of+classical+peripheral+retrograde+actin+flow.">Rho-dependent contractile responses in the neuronal growth cone are independent of classical peripheral retrograde actin flow.</a> Neuron. 40, 931-944 (2003).</li><li>Salmon, W. C., Adams, M. C., Waterman-Storer, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Dual-wavelength+fluorescent+speckle+microscopy+reveals+coupling+of+microtubule+and+actin+movements+in+migrating+cells.">Dual-wavelength fluorescent speckle microscopy reveals coupling of microtubule and actin movements in migrating cells.</a> J Cell Biol. 158, 31-37 (2002).</li><li>Danuser, G., Waterman-Storer, C. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Quantitative+fluorescent+speckle+microscopy+of+cytoskeleton+dynamics.">Quantitative fluorescent speckle microscopy of cytoskeleton dynamics.</a> Annu Rev Biophys Biomol Struct. 35, 361-387 (2006).</li></ol>

The authors have nothing to disclose.

Başarıyla speckle görüntüler elde etmek için birkaç anahtar faktör çok önemlidir, ancak iyi benekler floresan etiketli aktin kalitesi ile başlar ve biter. Etiketli protein kendisi çözünür ve agrega ücretsiz olmalıdır 0,7 0,4 çevresinde aktin monomeri, boya, yüksek bir etiketleme oranı, benekler ve ayrık parlak görünmesini sağlayacaktır. Aynı derecede önemli olan mikroenjeksiyon işlemi. Normal hücre homeostazının sağlamak için (ve hayatta kalma), hücreler tanıtan etiketli protein konsantrasyonu düşük, düşük akış basıncı ile enjekte edilir. Bu mikroenjeksiyon sisteminin kullanımı ile ilgili bazı teknik uzmanlık / deneyim derecesi gerektirir. Genel bir kural olarak, kısa enjeksiyon süreleri (&lt;1sn) uzun enjeksiyon defadan fazla tercih edilmektedir. En son önemli bir bileşeni mikroskop. En temel tesislerinde bulunan cıva lambası epi-ışığı, eşleştirilmiş bir inverted mikroskop, görüntüleme speckle için uygun bir platform olarak hizmet verecek. Uygun floresan filtreleri yerine varsayarak kombinasyonu yüksek NA objektif ve soğutmalı bir CCD kamera, yüksek çözünürlüklü görüntüler parlak benek üretecektir. Biz, üstün çözünürlük ve parlaklık sağlayacaktır yüksek büyütme (100X), yüksek NA (&gt; 1.3), plan-apochromat hedefleri kullanmanızı öneririz. Ideal bir enjeksiyon koşullar altında, büyütme piksel başına parlaklık ve SNR artan, 60X için düşürülmüştür olabilir. ~ 6.5 mikron piksel boyutları ile düşük gürültü, yüksek kuantum verimli, soğutmalı CCD kamera, ideal dedektörleri ve bazı durumlarda düşük kaliteli floresan problar için telafi edebilir. Ayrıca, floresan etiketli protein probları aynı hücre içinde ifade GFP / RFP konjuge proteinler cDNA yapıları (nucleoinjection) ile birlikte enjekte edilir. Bu, ikinci bir enjeksiyon yoluyla çevreleyen sitoplazma hücre çekirdekleri içine cDNA nucleoinjection gerektirir. Özetle, FSM sitoskeleton dinamikleri benzeri görülmemiş anlayışlar sağlar. Iyi benekler elde edilmesi uygun probları, ekipman ve biraz sabır (eğitim) gerektirir.

Enjeksiyon tampon (IB) 50 mM potasyum glutamat 0.5 M MgCl2 (EK 2A) -20 ° C&#39;de 2 yıla kadar saklama kapasitesi &nbsp; G-buffer 2 mM Tris ⋅ Cl, pH 8.0 (EK-2A) 0.2 mM CaCl2 (EK 2A) Kullanmadan hemen önce ekleyin: 0.2 mM ATP (100 mM tarifi görmek) 2-mercaptoethanol 0.5 mM 1 gün öncesine kadar 4 Mağaza ° C

live cell imaging of f-actin dynamics via fluorescent speckle microscopy (fsm)

Bu protokolde Floresan kullanımı PtK1 hücreleri aktin dinamiklerinin yüksek çözünürlüklü görüntü yakalamak için Mikroskopi (FSM) speckle açıklar. FSM eşsiz bir avantajı canlı hücrelerin içinde F-aktin ağ hareketini ve ciro kinetiği (montaj / demontaj) yakalamak için yeteneğidir. Bu teknik, bilgisayar vizyonu yazılım (qFSM) ile eşleştirilmiş, F-aktin dinamiklerinin kantitatif ölçümler çıkarmada yararlıdır. Biz seçimi, mikroenjeksiyon ve canlı hücrelerin floresan aktin probları görselleştirme açıklar. Daha da önemlisi, benzer işlemler, diğer macomolecular meclisleri görselleştirmek için geçerli. FSM mikrotübül, ara filamentler, ve yapışma kompleksleri için kanıtlanmıştır.

Watch this Scientific Journal Video about Live Cell Imaging of F-actin Dynamics via Fluorescent Speckle Microscopy FSM at JoVE.com

Live Cell Imaging of F-actin Dynamics via Fluorescent Speckle Microscopy FSM

Seçimi, mikroenjeksiyon ve görüntüleme floresan ile F-aktin floresan etiketli (FSM) mikroskopi speckle.

Floresan üzerinden F-aktin Dynamics Canlı Hücre Görüntüleme speckle Mikroskopi (FSM)

In this protocol we describe the use of Fluorescent Speckle Microscopy (FSM) to capture high-resolution images of actin dynamics in PtK1 cells. A unique ...

live-cell-imaging-f-actin-dynamics-via-fluorescent-speckle-microscopy

Nanyang Technological University

Research

JoVE Journal

Biology

Live Cell Imaging of F-actin Dynamics via Fluorescent Speckle Microscopy (FSM)

15.9K Görüntüleme.  Scripps Institute. Seçimi, mikroenjeksiyon ve görüntüleme floresan ile F-aktin floresan etiketli (FSM) mikroskopi speckle.

Video: Live Cell Imaging of F-actin Dynamics via Fluorescent Speckle Microscopy FSM

Actin Co-Sedimentation Assay; for the Analysis of Protein Binding to F-Actin

The actin cytoskeleton within the cell is a network of actin filaments that allows the movement of cells and cellular processes, and that generates tension and helps maintains cellular shape.  Although the actin cytoskeleton is a rigid structure, it is a dynamic structure that is constantly remodeling.  A number of proteins can bind to the actin cytoskeleton.  The binding of a particular protein to F-actin is often desired to support cell biological observations or to further understand dynamic processes due to remodeling of the actin cytoskeleton. The actin co-sedimentation assay is an in vitro assay routinely used to analyze the binding of specific proteins or protein domains with F-actin.  The basic principles of the assay involve an incubation of the protein of interest (full length or domain of) with F-actin, ultracentrifugation step to pellet F-actin and analysis of the protein co-sedimenting with F-actin.  Actin co-sedimentation assays can be designed accordingly to measure actin binding affinities and in competition assays.

Proteins bind to filamentous actin (F-actin) through distinct actin binding modules. In this video we demonstrate the procedure of actin co-sedimentation, which is an in vitro assay routinely used to analyze proteins or specific domains that bind F-actin.

Aktin Co-Sedimantasyon Testi; F-Aktin Bağlayıcı Protein Analizi

The actin cytoskeleton within the cell is a network of actin filaments that allows the movement of cells and cellular processes, and that generates ...

Biyoloji

Live Imaging of the Zebrafish Embryonic Brain by Confocal Microscopy

In this video, we demonstrate the method our lab has developed to analyze the cell shape changes and rearrangements required to bend and fold the developing zebrafish brain (Gutzman et al, 2008). Such analysis affords a new understanding of the underlying cell biology required for development of the 3D structure of the vertebrate brain, and significantly increases our ability to study neural tube morphogenesis. The embryonic zebrafish brain is shaped beginning at 18 hours post fertilization (hpf) as the ventricles within the neuroepithelium inflate. By 24 hpf, the initial steps of neural tube morphogenesis are complete. Using the method described here, embryos at the one cell stage are injected with mRNA encoding membrane-targeted green fluorescent protein (memGFP). After injection and incubation, the embryo, now between 18 and 24 hpf, is mounted, inverted, in agarose and imaged by confocal microscopy. Notably, the zebrafish embryo is transparent making it an ideal system for fluorescent imaging. While our analyses have focused on the midbrain-hindbrain boundary and the hindbrain, this method could be extended for analysis of any region in the zebrafish to a depth of 
80-100 &mu;m.

In this video, we demonstrate a method by which to analyze the developing vertebrate brain in live zebrafish embryos at single cell resolution by confocal microscopy. This includes the method by which we inject the single-cell zebrafish embryo and subsequently mount and image the developing brain.

Konfokal Mikroskop Zebra balığı Embriyonik Beyin Görüntüleme Canlı

In this video, we demonstrate the method our lab has developed to analyze the cell shape changes and rearrangements required to bend and fold the ...

Assembly, Loading, and Alignment of an Analytical Ultracentrifuge Sample Cell

The analytical ultracentrifuge (AUC) is a powerful biophysical tool that allows us to record macromolecular sedimentation profiles during high speed centrifugation. When properly planned and executed, an AUC sedimentation velocity or sedimentation equilibrium experiment can reveal a great deal about a protein in regards to size and shape, sample purity, sedimentation coefficient, oligomerization states and protein-protein interactions.
This technique, however, requires a rigorous level of technical attention. Sample cells hold a sectored center piece sandwiched between two window assemblies. They are sealed with a torque pressure of around 120-140 in/lbs. Reference buffer and sample are loaded into the centerpiece sectors and then after sealing, the cells are precisely aligned into a titanium rotor so that the optical detection systems scan both sample and reference buffer in the same radial path midline through each centerpiece sector while rotating at speeds of up to 60, 000 rpm and under very high vacuum
Not only is proper sample cell assembly critical, sample cell components are very expensive and must be properly cared for to ensure they are in optimum working condition in order to avoid leaks and breakage during experiments. Handle windows carefully, for even the slightest crack or scratch can lead to breakage in the centrifuge. The contact between centerpiece and windows must be as tight as possible; i.e. no Newton s rings should be visible after torque pressure is applied. Dust, lint, scratches and oils on either the windows or the centerpiece all compromise this contact and can very easily lead to leaking of solutions from one sector to another or leaking out of the centerpiece all together. Not only are precious samples lost, leaking of solutions during an experiment will cause an imbalance of pressure in the cell that often leads to broken windows and centerpieces. In addition, plug gaskets and housing plugs must be securely in place to avoid solutions being pulled out of the centerpiece sector through the loading holes by the high vacuum in the centrifuge chamber. Window liners and gaskets must be free of breaks and cracks that could cause movement resulting in broken windows.
This video will demonstrate our procedures of sample cell assembly, torque, loading and rotor alignment to help minimize component damage, solution leaking and breakage during the perfect AUC experiment.

The analytical ultracentrifuge (AUC) sample cell holds sample and reference buffer and during experiments and is exposed to high vacuum and rotor speeds up to 60,000 rpm. This video will demonstrate the rigorous attention to detail necessary for assembly, loading and alignment of this very important component of an AUC experiment.

Kurul, Yükleme ve Analitik ultrasantrifüjdeki Örnek Hücre Hizalama

The analytical ultracentrifuge (AUC) is a powerful biophysical tool that allows us to record macromolecular sedimentation profiles during high speed ...

Fluorescent Labeling of COS-7 Expressing SNAP-tag Fusion Proteins for Live Cell Imaging

SNAP-tag and CLIP-tag protein labeling systems enable the specific, covalent attachment of molecules, including fluorescent dyes, to a protein of interest in live cells. These systems offer a broad selection of fluorescent substrates optimized for a range of imaging instrumentation. Once cloned and expressed, the tagged protein can be used with a variety of substrates for numerous downstream applications without having to clone again. There are two steps to using this system: cloning and expression of the protein of interest as a SNAP-tag fusion, and labeling of the fusion with the SNAP-tag substrate of choice. The SNAP-tag is a small protein based on human O6-alkylguanine-DNA-alkyltransferase (hAGT), a DNA repair protein. SNAP-tag labels are dyes conjugated to guanine or chloropyrimidine leaving groups via a benzyl linker. In the labeling reaction, the substituted benzyl group of the substrate is covalently attached to the SNAP-tag. CLIP-tag is a modified version of SNAP-tag, engineered to react with benzylcytosine rather than benzylguanine derivatives. When used in conjunction with SNAP-tag, CLIP-tag enables the orthogonal and complementary labeling of two proteins simultaneously in the same cells.

SNAP-tag and CLIP-tag protein labeling systems enable the specific, covalent attachment of molecules, including fluorescent dyes, to a protein of interest in live cells. Once cloned and expressed, the tagged protein can be used with a variety of substrates for numerous downstream applications without having to clone again.

Canlı Hücre Görüntüleme için SNAP-tag Fusion Proteinler ifade COS-7 Floresan Etiketleme

SNAP-tag and CLIP-tag protein labeling systems enable the specific, covalent attachment of molecules, including fluorescent dyes, to a protein of interest ...

Fluorescence-based Measurement of Store-operated Calcium Entry in Live Cells: from Cultured Cancer Cell to Skeletal Muscle Fiber

Store operated Ca2+ entry (SOCE), earlier termed capacitative Ca2+ entry, is a tightly regulated mechanism for influx of extracellular Ca2+ into cells to replenish depleted endoplasmic reticulum (ER) or sarcoplasmic reticulum (SR) Ca2+ stores1,2. Since Ca2+ is a ubiquitous second messenger, it is not surprising to see that SOCE plays important roles in a variety of cellular processes, including proliferation, apoptosis, gene transcription and motility. Due to its wide occurrence in nearly all cell types, including epithelial cells and skeletal muscles, this pathway has received great interest3,4. However, the heterogeneity of SOCE characteristics in different cell types and the physiological function are still not clear5-7.
The functional channel properties of SOCE can be revealed by patch-clamp studies, whereas a large body of knowledge about this pathway has been gained by fluorescence-based intracellular Ca2+ measurements because of its convenience and feasibility for high-throughput screening. The objective of this report is to summarize a few fluorescence-based methods to measure the activation of SOCE in monolayer cells, suspended cells and muscle fibers5,8-10. The most commonly used of these fluorescence methods is to directly monitor the dynamics of intracellular Ca2+ using the ratio of F340nm and F380nm (510 nm for emission wavelength) of the ratiometric Ca2+ indicator Fura-2. To isolate the activity of unidirectional SOCE from intracellular Ca2+ release and Ca2+ extrusion, a Mn2+ quenching assay is frequently used. Mn2+ is known to be able to permeate into cells via SOCE while it is impervious to the surface membrane extrusion processes or to ER uptake by Ca2+ pumps due to its very high affinity with Fura-2. As a result, the quenching of Fura-2 fluorescence induced by the entry of extracellular Mn2+ into the cells represents a measurement of activity of SOCE9. Ratiometric measurement and the Mn+2 quenching assays can be performed on a cuvette-based spectrofluorometer in a cell population mode or in a microscope-based system to visualize single cells. The advantage of single cell measurements is that individual cells subjected to gene manipulations can be selected using GFP or RFP reporters, allowing studies in genetically modified or mutated cells. The spatiotemporal characteristics of SOCE in structurally specialized skeletal muscle can be achieved in skinned muscle fibers by simultaneously monitoring the fluorescence of two low affinity Ca2+ indicators targeted to specific compartments of the muscle fiber, such as Fluo-5N in the SR and Rhod-5N in the transverse tubules9,11,12.

The extent of store-operated Ca2+ entry (SOCE) can be monitored using fluorescent Ca2+ indicators. Mn2+ quenching of such indicators assays SOCE in cultured cells and skeletal muscle fibers. A technique allowing spatial and temporal resolution of SOCE by confocal imaging of mechanically skinned muscle fibers is also described.

Canlı hücreler Mağaza çalışan Kalsiyum Giriş Floresans tabanlı Ölçümü: Kültür Kanseri Hücre gelen İskelet Kası Fiber

Store operated Ca2+ entry (SOCE), earlier termed capacitative Ca2+ entry, is a tightly regulated mechanism for influx of extracellular Ca2+ into cells to ...

Intravital Microscopy for Imaging Subcellular Structures in Live Mice Expressing Fluorescent Proteins

Here we describe a procedure to image subcellular structures in live rodents that is based on the use of confocal intravital microscopy. As a model organ, we use the salivary glands of live mice since they provide several advantages. First, they can be easily exposed to enable access to the optics, and stabilized to facilitate the reduction of the motion artifacts due to heartbeat and respiration. This significantly facilitates imaging and tracking small subcellular structures. Second, most of the cell populations of the salivary glands are accessible from the surface of the organ. This permits the use of confocal microscopy that has a higher spatial resolution than other techniques that have been used for in vivo imaging, such as two-photon microscopy. Finally, salivary glands can be easily manipulated pharmacologically and genetically, thus providing a robust system to investigate biological processes at a molecular level.
In this study we focus on a protocol designed to follow the kinetics of the exocytosis of secretory granules in acinar cells and the dynamics of the apical plasma membrane where the secretory granules fuse upon stimulation of the beta-adrenergic receptors. Specifically, we used a transgenic mouse that co-expresses cytosolic GFP and a membrane-targeted peptide fused with the fluorescent protein tandem-Tomato. However, the procedures that we used to stabilize and image the salivary glands can be extended to other mouse models and coupled to other approaches to label in vivo cellular components, enabling the visualization of various subcellular structures, such as endosomes, lysosomes, mitochondria, and the actin cytoskeleton.

Intravital microscopy is a powerful tool that enables imaging various biological processes in live animals. In this article, we present a detailed method for imaging the dynamics of subcellular structures, such as the secretory granules, in the salivary glands of live mice.

Floresan Proteinler ifade Canlı Farelerde Görüntüleme hücrealtı Yapıların Intravital Mikroskopi

Here we describe a procedure to image subcellular structures in live rodents that is based on the use of confocal intravital microscopy. As a model organ, ...

Real-time Imaging of Plant Cell Surface Dynamics with Variable-angle Epifluorescence Microscopy

A plant&#8217;s cell surface is its interface for perceiving environmental cues; it responds with cell biological changes such as membrane trafficking and cytoskeletal rearrangement. Real-time and high-resolution image analysis of such intracellular events will increase the understanding of plant cell biology at the molecular level. Variable angle epifluorescence microscopy (VAEM) is an emerging technique that provides high-quality, time-lapse images of fluorescently-labeled proteins on the plant cell surface. In this article, practical procedures are described for VAEM specimen preparation, adjustment of the VAEM optical system, movie capturing and image analysis. As an example of VAEM observation, representative results are presented on the dynamics of PATROL1. This is a protein essential for stomatal movement, thought to be involved in proton pump delivery to plasma membranes in the stomatal complex of Arabidopsis thaliana. VAEM real-time observation of guard cells and subsidiary cells in A. thaliana cotyledons showed that fluorescently-tagged PATROL1 appeared as dot-like structures on plasma membranes for several seconds and then disappeared. Kymograph analysis of VAEM movie data determined the time distribution of the presence (termed &#8216;residence time&#8217;) of the dot-like structures. The use of VAEM is discussed in the context of this example.

The goal of this protocol is to demonstrate how to monitor fluorescently-tagged protein dynamics on plant cell surfaces with variable-angle epifluorescence microscopy, showing blinking dots of GFP-tagged PATROL1, a membrane trafficking protein, in the cell cortex of the stomatal complex in Arabidopsis thaliana.

Değişken açılı Epifloresans Mikroskopi ile Bitki Hücre Yüzey Dynamics Gerçek zamanlı Görüntüleme

A plant&#8217;s cell surface is its interface for perceiving environmental cues; it responds with cell biological changes such as membrane trafficking and ...

Three-dimensional Super Resolution Microscopy of F-actin Filaments by Interferometric PhotoActivated Localization Microscopy (iPALM)

Fluorescence microscopy enables direct visualization of specific biomolecules within cells. However, for conventional fluorescence microscopy, the spatial resolution is restricted by diffraction to ~ 200 nm within the image plane and &#62; 500 nm along the optical axis. As a result, fluorescence microscopy has long been severely limited in the observation of ultrastructural features within cells. The recent development of super resolution microscopy methods has overcome this limitation. In particular, the advent of photoswitchable fluorophores enables localization-based super resolution microscopy, which provides resolving power approaching the molecular-length scale. Here, we describe the application of a three-dimensional super resolution microscopy method based on single-molecule localization microscopy and multiphase interferometry, called interferometric PhotoActivated Localization Microscopy (iPALM). This method provides nearly isotropic resolution on the order of 20 nm in all three dimensions. Protocols for visualizing the filamentous actin cytoskeleton, including specimen preparation and operation of the iPALM instrument, are described here. These protocols are also readily adaptable and instructive for the study of other ultrastructural features in cells.

Three-dimensional Super Resolution Microscopy of F-actin Filaments by Interferometric PhotoActivated Localization Microscopy iPALM

We present a protocol for the application of interferometric PhotoActivated Localization Microscopy (iPALM), a 3-dimensional single-molecule localization super resolution microscopy method, to the imaging of the actin cytoskeleton in adherent mammalian cells. This approach allows light-based visualization of nanoscale structural features that would otherwise remain unresolved by conventional diffraction-limited optical microscopy.

Üç boyutlu Süper İnterferometrik photoactivated Yerelleştirme Mikroskopi F-aktin Filament Çözünürlük Mikroskobu (iPALM)

Fluorescence microscopy enables direct visualization of specific biomolecules within cells. However, for conventional fluorescence microscopy, the spatial ...

Exploiting Live Imaging to Track Nuclei During Myoblast Differentiation and Fusion

Nuclear positioning within cells is important for multiple cellular processes in development and regeneration. The most intriguing example of nuclear positioning occurs during skeletal muscle differentiation. Muscle fibers (myofibers) are multinucleated cells formed by the fusion of muscle precursor cells (myoblasts) derived from muscle stem cells (satellite cells) that undergo proliferation and differentiation. Correct nuclear positioning within myofibers is required for the proper muscle regeneration and function. The common procedure to assess myoblast differentiation and myofiber formation relies on fixed cells analyzed by immunofluorescence, which impedes the study of nuclear movement and cell behavior over time. Here, we describe a method for the analysis of myoblast differentiation and myofiber formation by live cell imaging. We provide a software for automated nuclear tracking to obtain a high-throughput quantitative characterization of nuclear dynamics and myoblast behavior (i.e., the trajectory) during differentiation and fusion.

Skeletal muscle differentiation is a highly dynamic process, which particularly relies on nuclear positioning. Here, we describe a method to track nuclei movements by live cell imaging during myoblast differentiation and myotube formation and to perform a quantitative characterization of nuclei dynamics by extracting information from automatic tracking.

Parça çekirdeği canlı görüntüleme sırasında Myoblast farklılaşma ve füzyon istismar

Nuclear positioning within cells is important for multiple cellular processes in development and regeneration. The most intriguing example of nuclear ...

Examination of Mitotic and Meiotic Fission Yeast Nuclear Dynamics by Fluorescence Live-cell Microscopy

Live-cell imaging is a microscopy technique used to examine cell and protein dynamics in living cells. This imaging method is not toxic, generally does not interfere with cell physiology, and requires minimal experimental handling. The low levels of technical interference enable researchers to study cells across multiple cycles of mitosis and to observe meiosis from beginning to end. Using fluorescent tags such as Green Fluorescent Protein (GFP) and Red Fluorescent Protein (RFP), researchers can analyze different factors whose functions are important for processes like transcription, DNA replication, cohesion, and segregation. Coupled with data analysis using Fiji (a free, optimized ImageJ version), live-cell imaging offers various ways of assessing protein movement, localization, stability, and timing, as well as nuclear dynamics and chromosome segregation. However, as is the case with other microscopy methods, live-cell imaging is limited by the intrinsic properties of light, which put a limit to the resolution power at high magnifications, and is also sensitive to photobleaching or phototoxicity at high wavelength frequencies. However, with some care, investigators can bypass these physical limitations by carefully choosing the right conditions, strains, and fluorescent markers to allow for the appropriate visualization of mitotic and meiotic events.

Here, we present live-cell imaging which is a non-toxic microscopy method that allows researchers to study protein behavior and nuclear dynamics in living fission yeast cells during mitosis and meiosis.

Floresans canlı hücre mikroskobu ile mitotik ve meiotic Fission Maya nükleer dinamiklerinin incelenmesi

Live-cell imaging is a microscopy technique used to examine cell and protein dynamics in living cells. This imaging method is not toxic, generally does ...