Method Article
* Bu yazarlar eşit katkıda bulunmuştur
Bu çalışma, CRISPR-Cas9 genom düzenleme teknolojisinin nakavt endojen gen OsABCG15'e ve ardından pirinçte istikrarlı bir erkek steril çizgi üretmek için modifiye edilmiş Agrobacteriumaracılı dönüşüm protokolüne kullanımını açıklamaktadır.
Erkek kısırlığı genellikle erkek üreme organları / gametfonksiyonel kusurları ile karakterize melez tohum üretimi için önemli bir tarımsal özelliktir. CRISPR-Cas9 genom düzenleme teknolojisindeki son gelişmeler, belirli bölgelerde ki endojen aday genlerin yüksek düzenleme etkinliği ve zaman kazandıran nakavt mutasyonlarına olanak sağlar. Ayrıca, Pirinç Agrobacteriumaracılı genetik dönüşüm de yaygın birçok kamu ve özel laboratuvarlar tarafından kabul edilmiştir gen modifikasyonu için önemli bir yöntemdir. Bu çalışmada CRISPR-Cas9 genom düzenleme araçlarını uyguladık ve OsABCG15'in japonica çeşitlerinde hedeflenen genom düzenlemesi ile üç erkek steril mutant hattını başarıyla oluşturduk. Biz pirinç hibrid tohum üretimi için genetik emasculation mükemmel bir araç sağlayabilir değiştirilmiş Bir Agrobacteriumaracılı pirinç dönüşüm yöntemi kullanılır. Transgenik bitkiler 2-3 ay içinde elde edilebilir ve homozigot transformantlar PCR amplifikasyon ve Sanger dizilimi kullanılarak genotipleme ile tarandı. Erkek steril homozigot çizginin temel henotik karakterizasyonu pirinç erkek üreme organlarının mikroskobik gözlemi, polen canlılık analizi iyot potasyum iyodür (I2-KI) ile yapıldı.
Pirinç, özellikle gelişmekte olan ülkelerde en önemli gıda mahsulüdür ve dünya nüfusunun yarısından fazlası için bir temel gıda temsil eder. Genel olarak, pirinç tanesi için talep büyüyor ve 2030 yılına kadar% 50 ve 205011,2%100 artırmak için tahmin edilmektedir. Pirinç veriminde gelecekteki iyileştirmeler, pirinci monocotyledonous bitki araştırmaları için mükemmel bir model haline getiren çeşitli moleküler ve genetik kaynaklardan yararlanmak zorunda kalacaktır. Bunlar arasında etkin bir dönüşüm sistemi, gelişmiş moleküler harita ve uzun yıllar boyunca oluşturulmuş olan ifade edilmiş sıra etiketleri3,,4'üngenel olarak erişilebilir veritabanı bulunmaktadır. Bir strateji ürün verimi artırmak için hibrid tohum üretimi5, hangi erkek doğurganlık işlemek için yeteneği olan merkezi bir unsurdur. Tahıl bitkileri erkek doğurganlık moleküler kontrol anlamak hibrid tohum üretimini artırmak ve bitki verimliliğini artırmak için pratik teknikler içine anahtar bilgi çevirmek için yardımcı olabilir6,7.
Genetik dönüşüm, yabancı genlerin tanıtılmasına veya ekin bitkilerinde endojen genlerin manipülasyonuna olanak sağladığı ve genetiği değiştirilmiş çizgilerin üretilmesiyle sonuçlandığından temel araştırma ve ticari tarım için önemli bir araçtır. Uygun bir dönüşüm protokolü gen regülasyonu nun temel anlaşılması için genetik ve moleküler biyoloji çalışmalarının hızlandırılmasına yardımcı olabilir8. Bakterilerde genetik dönüşüm doğal olarak gerçekleşir; ancak, bitkilerde, yapay moleküler biyoloji teknikleri kullanılarak yapılır9,10. Agrobacterium tumefaciens t-DNA aktararak bitkilerde taç safra hastalığına neden olan bir toprak kaynaklı, Gram-negatif bakteri, onun Ti plazmid bir bölge, bir tip IV salgı sistemi ile bitki hücresine11,12. Bitkilerde, A. tumefaciens-aracılı dönüşüm gen modifikasyonu için yaygın bir yöntem olarak kabul edilir çünkü konak genom13içine T-DNA kararlı ve düşük kopya sayısı entegrasyonu yol açar. Transgenik pirinç ilk olarak 1990'ların ortalarında japonica çeşitleri14'te Agrobacteriumaracılı gen dönüşümü ile üretildi. Bu protokol kullanılarak 4 aylık bir süre içinde %10-30 oranında dönüşüm verimi ile çeşitli transgenik hatlar elde edilmiştir. Çalışma, başarılı dönüşüm için iki kritik adım olduğunu göstermiştir: biri olgun tohumlardan embriyojenik nasır indüksiyonu ve diğeri de bitkilerde daha yüksek dönüşüm verimliliği sağlayan birlikte ekimi sırasında bakteri kültürüne fenolik bir bileşik olan asetozipon eklenmesidir14,15. Bu protokol yaygın japonica16,17,,18,19 yanı sıra indica20,21,,22,,23 ve tropikal japonica24,25gibi diğer çeşitleri küçük değişiklikler ile kullanılmıştır. Nitekim, pirinç dönüşümünü açıklayan makalelerin% 80'den fazla bir araç olarak Agrobacteriumaracılı gen dönüşümü13kullanın. Bugüne kadar, birkaç genetik dönüşüm protokolleri nasır indüksiyon16,17,,18,19için bir başlangıç malzemesi olarak pirinç tohumu kullanılarak geliştirilmiştir. Ancak, çok az nasır üretimi için eksplandan olarak genç çiçeklenme hakkında bilinmektedir. Genel olarak, fonksiyonel genomik ve mahsul geliştirme çalışmaları için hızlı, tekrarlanabilir ve verimli bir gen dönüşümü ve rejenerasyon protokolü oluşturmak önemlidir.
Son yıllarda, CRISPR-Cas9 teknolojisinin ilerlemesi gen fonksiyonunu anlamak ve bitki ıslahı için tarımsal olarak önemli iyileştirmeler sunmak için hassas bir genom düzenleme mekanizması sonuçlandı26,27. CRISPR aynı zamanda erkek üreme gelişimi ve hibrid üretimin manipülasyon için önemli bir umut vaat ediyor. Bu çalışmada CRISPR-Cas9 teknolojisini kullanarak bir gen nakavt sistemi kullandık ve verimli bir pirinç geni dönüşüm protokolüile birleştirerek genç çiçeklenmeleri eksektif olarak kullandık ve böylece üreme gelişimi için istikrarlı erkek steril çizgileri oluşturduk.
1. sgRNA-CAS9 bitki ekspresyonu vektör konstrüksiyonu ve Agrobacterium-aracılıdönüşüm
2. Pirinç genetik dönüşümü ve bitki doku kültürü
3. Genotip tanımlama
4. Mutantın temel fenotipini gözlemleyin
Burada gösterilmiştir pirinç Agrobacteriumtarafından gelecekteki araştırmalar için bir erkek steril çizgi oluşturmak için gen düzenleme teknolojisinin kullanımıdır-pirinç genetik dönüşüm aracılı. İkili vektör konstrüksiyonu için CRISPR-CAS9 aracılı mutagenez osabg15erkek steril hattını oluşturmak için kullanılmıştır. SgRNA OsU3 organizatörü tarafından tahrik edildi, hSpCas9 ifade kaseti çift 35S organizatörü tarafından tahrik edildi ise, ve orta vektör agrobacteriumiçin tasarlanmış tek bir ikili vektör pCAMBIA1300 monte edildi -pirinç aracılı kararlı dönüşüm. Pirinç CRISPR/Cas9 aracılı mutagenez için kullanılan yapının grafiksel gösterimi Şekil 1A'daverilmiştir.
Şekil 2 ve Şekil 3 pirinç transgen üretiminin tüm prosedürünü temsil ediyor. Genç çiçeklenmeler ekseksiyon olarak seçilmiştir (Şekil 2) ve NBD2 ortamına aşılamadan sonraki 14 gün içinde friable embriyojenik nasır (FEC) indüklenmiştir(Şekil 3A). Embriyojenik calli doğrudan Agrobacteriumaracılı dönüşüm için kullanılmıştır(Şekil 3C) veya daha fazla enfeksiyon için daha fazla calli elde etmek için proliferasyon alt kültür(Şekil 3B). Karanlık koşullarda NBD2-AS ortamüzerinde 48 saat birlikte işlendikten sonra(Şekil 3D),calli ikinci tur seçim ortamına kaydırıldı. 10-14 gün sonra, dönüştürülmüş calli anne calli çevresinde bazı küçük yeni oluşan microcalli gösterdi, dönüştürülmemiş calli rengi kahverengi dönüştü ve sonunda öldü iken(Şekil 3E,F). Daha sonra, sağlıklı ve kremsi renkli calli iki kez rejenerasyon ortamına aktarıldı. Bu aşamada, dönüştürülmüş calli yavaş yavaş yeşil noktalar gösterdi (ateş tomurcukları) (Şekil 3G,H). Bu yeni üretilen yeşil lekeler, sürgün büyümesine izin vermek için rejenerasyon ortamı içeren steril bir plastik şişede kültürlendi(Şekil 3I),ve daha sonra kökleri indüklemek için 1/2 MS ortamına (taze sürgünler olarak) kaydırıldı. Daha sonra, iyi gelişmiş kökleri ile sağlıklı ve güçlü büyüyen sürgünler hasat edildi(Şekil 3J).
Toplamda 21 rejenere fide elde edildi. Higromisin bölgesi için PCR amplifikasyon, 21 kişiden 18'inin ilgili bandı yükseltebileceğini göstererek bu çizgilerin transgenik olduğunu göstermiştir(Şekil 4),ve karşılık gelen dönüşüm sıklığı yaklaşık %85,71 'dir(Tablo 2). Transformantlar, 18 T0 transgenik bitkiler, sekiz heterozigot hat ve üç homozigot çizgi arasında CRISPR-Cas9 pozitif, karşılık gelen mutasyon frekansları ile %61,11(Şekil 1B, Tablo 2)ile hedef bölgeye yayılan astarlar kullanılarak sgRNA hedef sahasındaki mutasyonları tanımlamak için genotiplenmiştir .
Homozigot nakavt mutantları temel erkek üreme organı gözlemi ile doğrulandı (Şekil 5). Osabcg15 anthers yabani tip(Şekil 5A,D)daha küçük ve soluk ve olgun polen taneleri yoktu(Şekil 5B,E). Osabcg15'teki anther morfolojik defektlerini araştırmak için yabani tipe göre enine kesitmikroskopisi yapıldı. Evre 10'da, yabani tip mikrosporlar yuvarlak şekilli hale geldi ve koyu mavi lekeli exine(Şekil 5C)ile aşılandı. Buna karşılık, osabcg15 mikrosporlar çöktü ve bozulmuş, sadece dejenere mikrospor enkaz anther lokül(Şekil 5F)bulunmaktadır.
Şekil 1: CRISPR/Cas9 sistemi ve OsABCG15'inhedefli mutagenezi için bilgi oluşturma . (A) SgRNA OsU3 organizatörü tarafından tahrik edildi, hSpCas9 ifade kaseti çift 35S organizatörü tarafından tahrik edildi; orta vektör, pilavın Agrobacteriumaracılı kararlı dönüşümü için tasarlanmış tek bir ikili vektörde bir araya getirilmiştir. (B) OsABCG15 geninin ikinci eksonda yer alan dizi (5'-AAGCACATCCTCACAAGGGGAT-3') sgRNA'nın hedef bölgesi olarak seçilmiştir. Japonica cultivar 9522 arka planında CRISPR-Cas9 tarafından üç tip homozigot mutasyon olayı üretildi ve CRISPR-Cas9 indüklenen mutasyon bölgelerinin Sanger sekanslama kromatisleri gösterilmiştir. Hat 9522osabcg15-1 tek nükleotit (1-nt) 'A' ekleme vardır; hat 9522osabcg15-2 tek nükleotit (1-nt) 'G' ekleme vardır; ve 9522osabcg15-3 satırında tek nükleotit (1-nt) 'G' silme vardır. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 2: Nasır ı indükleyen malzemeler. (A) Genç pirinç çiçeklenmeleri, meyozis evresinde. (B) NBD2 ortamında yetişen genç çiçeklenmeler kesilir. Çubuk = 2 cm içinde (A). Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 3: Agrobacteriumaracılı dönüşüm ile transgenik çizgilerin üretilmesi prosedürü. (A) Pirinç calli genç çiçeklenme oluşturulan. (B) Calli alt kültürü. (C) A. tumefaciens ile calli kuluçka. (D) A. tumefaciens ile calli birlikte ekimi. (E) Hygromycin varlığında dönüştürülmüş calli ilk seçim döngüsü (40 mg /L). (F) Hygromycin (40 mg/L) varlığında dönüştürülmüş calli'nin ikinci seçim döngüsü. (G) Dönüştürülmüş calli'nin ilk yenilenmesi. (H) Dönüştürülmüş calli ikinci rejenerasyon, kültür plakayeşil çekim noktası dikkat çekti. (I) İndüksiyon kültürünü vur. (J) Kök indüksiyonu. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 4: Yenilenen pirinç fidelerinin dönüşüm frekanslarının analizi. %1.5 agarose jel elektroforezi sonrası 604 bp parça (1-8, 10-14, 16-20) gösteren amplifiye edilmiş PCR ürünleri transgenik pozitif çizgileri gösterir. Parçadan yoksun çizgiler dönüştürülür (9, 15, 21), vahşi tip (WT) denetimine benzer. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 5: Yabani tip (9522) ve mutant 9522osabcg15-1temel fenotik gözlem . (A) Yabani tip (9522) çiçek ve (D) 9522osabcg15-1 mutant çiçek lemma ve palea kaldırıldıktan sonra. gl, glume; fi, filament; lo, lodicule; pi, pistil; st, stamen. (B) I2-YABANI tip (9522) ve (E) 9522osabcg15-1 hattından olgun polen tanelerinin ki boyama. (C) Yabani tip (9522) ve (F) 9522osabcg15-1 mutant'ta anther gelişiminin enine kesit gözlemi ile analizi. DMsp, Dejenere mikrosporlar; E, epidermis; En, endotel; Msp, mikrospor; T, tapetum. Çubuklar = 2 mm in (A) ve (D), 100 μm in (B) ve (E), 50 μm in (C) ve (F). Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Tablo 1: Pirinç dönüşümü için medya kompozisyonları. Bu tabloyu indirmek için lütfen buraya tıklayınız.
Tablo 2: Crispr-Cas9 tarafından T0 neslinde üretilen OsABCG15 mutantlarının dönüşüm ve gen düzenleme verimliliği. Bu tabloyu indirmek için lütfen buraya tıklayınız.
Yapay gen erkek steril mutantlar geleneksel rasgele fiziksel, kimyasal veya biyolojik mutagenez tarafından oluşturulur. Bu güçlü teknikler olmasına rağmen, onların rasgele doğa moleküler ıslah ıslahı32özel iyileştirmeler sunmak için potansiyele sahip modern genomik bilginin büyük miktarda yararlanmak için başarısız olur. CRISPR-Cas9 sistemi,DNA'yımanipüle etmek ve düzenlemek için basit ve uygun fiyatlı araçları sayesinde bitkilerde yaygın olarak kullanılmaktadır 29,33; geleneksel mutagenez yöntemlerine göre zaman kazanma potansiyeline sahiptir.
Burada, nasır indüksiyonu için eksplorasyon olarak genç çiçeklenmeleri kullanarak uygun bir Agrobacteriumaracılı dönüşüm sistemi geliştirdik. Transgen yordamında zaman kazanmak için atlanabilecek bazı adımlar vardır. Başlangıç malzemesi olarak genç çiçeklenmelerin kullanılması, tohumlarıekbitkiler olarak kullanmakla karşılaştırıldığında nasır indüksiyonunun genel süresini en aza indirmek için iyi bir seçimdir. Buna ek olarak, hücre farklılaşma ve rejenerasyon kapasitesi genç çiçeklenme elde calli çok güçlüdür. Bu süreçte pirinç calli alt kültürü önlenebilir, hangi sonunda zaman kazandırır yanı sıra bakteriyel ve mantar kontaminasyon riskini azaltır. Ayrıca, timentin karsinin yerine antibiyotik olarak kullanılmıştır, hangi bakterileri inhibe daha etkilidir.
Çalışma ve pirinç erkek üreme gelişimi temel fenotipik gözlem için getirilen protokol bitki üreme biyolojisi ilgilenen lisans ve lisansüstü öğrenciler için yararlıdır. Bu uygun protokol, sonraki araştırma çalışmalarında kullanılmak üzere hızlı ve tekrarlanabilir olmalıdır.
Hiçbiri.
Yazarlar genç pirinç çiçeklenme ve pirinç dokusu kültürü orta yapımında yardım sağlamak için Xiaofei Chen kabul etmek istiyorum. Bu çalışma Çin Ulusal Doğa Bilimleri Vakfı (31900611) tarafından desteklenmiştir.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
1-Naphthaleneacetic acid | Sigma-Aldrich | N0640 | |
2, 4-Dichlorophenoxyacetic Acid | Sigma-Aldrich | D7299 | |
6-Benzylaminopurine (6-BA) | Sigma-Aldrich | B3408 | |
Acetosyringone | Sigma-Aldrich | D134406 | |
Agar | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10000561 | |
Ammonium sulfate | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10002918 | |
Aneurine hydrochloride | Sigma-Aldrich | T4625 | |
Anhydrous ethanol | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10009218 | |
Bacteriological peptone | Sangon Biotech | A100636 | |
Beef extract | Sangon Biotech | A600114 | |
Boric acid | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10004808 | |
Calcium chloride dihydrate | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 20011160 | |
Casein acid hydrolysate | Beijing XMJ Scientific Co., Ltd | C184 | |
Cobalt(II) chloride hexahydrate | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10007216 | |
Copper(II) sulfate pentahydrate | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10008218 | |
D(+)-Glucose anhydrous | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 63005518 | |
D-sorbitol | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 63011037 | |
EDTA, Disodium Salt, Dihydrate | Sigma-Aldrich | E5134 | |
EOS Digital SLR and Compact System Cameras | Canon | EOS 700D | |
Formaldehyde | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10010018 | |
Fully Automated Rotary Microtome | Leica Biosystems | Leica RM 2265 | |
Glacial acetic acid | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10000208 | |
Glycine | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 62011516 | |
Hygromycin | Beijing XMJ Scientific Co., Ltd | H370 | |
Inositol | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 63007738 | |
Iodine | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10011517 | |
Iron(II) sulfate heptahydrate | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10012116 | |
Kanamycine | Beijing XMJ Scientific Co., Ltd | K378 | |
Kinetin | Sigma-Aldrich | K0753 | |
L-Arginine | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 62004034 | |
L-Aspartic acid | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 62004736 | |
L-Glutamine | Beijing XMJ Scientific Co., Ltd | G229 | |
L-proline | Beijing XMJ Scientific Co., Ltd | P698 | |
Magnesium sulfate heptahydrate | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10013018 | |
Manganese sulfate monohydrate | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10013418 | |
Microscopes | NIKON | Eclipse 80i | |
MS | Phytotech | M519 | |
Nicotinic acid | Sigma-Aldrich | N0765 | |
Phytagel | Sigma-Aldrich | P8169 | |
Potassium chloride | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10016308 | |
Potassium dihydrogen phosphate | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10017608 | |
Potassium iodide | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10017160 | |
Potassium nitrate | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 1001721933 | |
Pyridoxine Hydrochloride (B6) | Sigma-Aldrich | 47862 | |
Rifampicin | Beijing XMJ Scientific Co., Ltd | R501 | |
Sodium hydroxide | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10019718 | |
Sodium molybdate dihydrate | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10019816 | |
Stereo microscopes | Leica Microsystems | Leica M205 A | |
Sucrose | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10021418 | |
Technovit embedding Kits 7100 | Heraeus Teknovi, Germany | 14653 | |
Timentin | Beijing XMJ Scientific Co., Ltd | T869 | |
Toluidine Blue O | Sigma-Aldrich | T3260 | |
Water bath for paraffin sections | Leica Biosystems | Leica HI1210 | |
Yeast extract | Sangon Biotech | A515245 | |
Zinc sulfate heptahydrate | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd | 10024018 |
Bu JoVE makalesinin metnini veya resimlerini yeniden kullanma izni talebi
Izin talebiThis article has been published
Video Coming Soon
JoVE Hakkında
Telif Hakkı © 2020 MyJove Corporation. Tüm hakları saklıdır