Method Article
This protocol describes a system architecture for performing automated small volume (0.15–1.5 ml) particle separations using a microfluidic device, and discusses methods to optimize acoustofluidic device performance and operation.
Mikroakışkan cihazların en büyük avantajı, böylece reaktif atık azaltılması ve değerli örneği koruyarak, küçük bir örnek hacimleri işlemek için yeteneğidir. Bununla birlikte, dayanıklı örnek düzenlemesi elde etmek için bu makro ölçekli bir ortamda cihaz entegre gidermek için gereklidir. Mikroakışkan cihazlar ile tekrarlanabilir, hassas partikül ayrımı gerçekleştirmek için, bu protokol mikroakışkan cihazlar kullanarak 0,15-1,5 ml numune hassas işlenmesini sağlayan tam otomatik ve entegre bir platform mikroakışkan sunar. Bu sistemin önemli yönleri kapalı döngü örnek toplama, sistem temizliği ve tekrarlanabilir şekilde çalışmasını sağlamak için gerekli adımları emişli gerçekleştirir modüler cihaz düzeni ve bağlantıları çip, güvenilir ve esnek dünyada sonuçlanan sağlam fikstür ve tam otomasyonlu sıvı taşıma içerir. Farklı mikroakışkan cihazları bu mimari ile birbirlerinin yerine kullanılabilir. Burada bir acoustofluidic cihazı dahil, detay onun characteriztirme, performans optimizasyonu ve biyolojik numunelerin boyut ayrılması için kullanımını göstermektedir. Ayırma deneyler sırasında gerçek zamanlı geri bildirim kullanarak, numune toplama korumak ve örnek konsantre optimize edilmiştir. Ekipmanın çoklu parçalar entegrasyonu gerektiren rağmen, bu mimarinin avantajları hiçbir ek sistem optimizasyonu, cihaz değiştirme kolaylığı ve hassas, sağlam numune işleme ile bilinmeyen örnekleri işlemek için yeteneği vardır.
Örnek ayırma ve fraksiyonlara mikrosıvı teknolojiler için uygulamanın en umut verici alanlarından biridir. Böyle bir numune alma basamaklar etkili klinik teşhis, tedavi geliştirme, Biyodenetleme çabaları ve yaşam bilimleri araştırma ve teknolojinin ilerlemesi için ayrılmaz bir parçasıdır. Bir sayısız mikroakışkan ayırma stratejileri yanı sıra kimyasal ve biyolojik türler için sıvı askıya partikül ve kolloidler için ortaya konulmuştur; 9 - Birkaç yorum bu alanlarda 1 son ilerleme ve gelişmeler genel değerlendirme. (Bundan sonra "Çekirdek Cihazlar" olarak anılacaktır), bu mikroakışkan ayırma teknolojilerin çok yoğun, özelliği olmakla birlikte, çok az sayıda rapor bir sistem seviyesinde örneği ayırma problemi üzerinde durmuştur. Çekirdek Cihazları tipik bir deplasman veya basınç pompası tarafından teslim sıvıyla florpolimer boru arabirim bireysel santimetre ölçekli cips, vardır.Numune hacimlerindeki otomasyonu, güvenilirlik ve azalma artmış dahil - - Mikroakiskan vaadi varsa Ancak, en azından denk bir çaba Çekirdek Cihaz entegre edilmiş olan tam bir ayrılık sisteminin tasarımına adamış olmalıdır, gerçeklik olmaktır .
Buna ek olarak, biodetection için mikroakışkan yaklaşımlar için büyük bir sorun mikro arayüzü makro. Bu ~ macroscale bileşenleri bir mikroakışkan cihazın fiziksel "dünya-to-çip" bağlantıları ve tipik klinik veya analitik numune hacimleri (~ 0.1-10 ml) ve mikroakışkan cips iç hacmi arasındaki uyumsuzluğu (değil sadece anlamına gelir 0,01-10 ul), aynı zamanda bu büyüklük ölçekleri köprü kaynaklanan istatistiksel örnekleme sınırlamaları. Bu konular örnek ön-işleme ve hazırlama biodetection "zayıf halka" olduğu algısının katkıda bulunur. 10 Bu çalışmada ta açıklanan platformuBu zorlukların ele yönünde kes önemli adımlar.
Bir sistem düzeyinde görünümünü alarak, bu protokol ~ 10 dakika timescales üzerinde (0.15 ila 1.5 ml arasında değişen) hassas ölçülü analitik ölçekli hacimlerinin güvenilir işleme ayrıntıları. Bu "tek tuşla" operasyonu: fraksiyon koleksiyonu için örnek ve hedef şişeleri içeren kaynak flakon sistemi içine yerleştirilir kez "run" komutu işlemini başlatır ve tüm adımlar bilgisayar kontrollü vardır. Bir Uygulamanın sonunda, toplama şişeler ayrılan fraksiyonların alt analizi için sistemden çıkarılabilir.
Bu sistemde Çekirdek Cihaz örnekten memeli hücre büyüklüğünde (5-20 mikron) partikülleri ayıklayan bir acoustophoresis çip. Acoustophoretic ayrılması o yüksek verimli olmasından dolayı burada seçilir, etiket içermeyen ve temassız, böylece canlı Viru ayıran avantajları sunan (ul / dk 100'ler kadar)Birkaç diğer mikroakışkan teknikler maç hücrelerden ses. 13 ve bu protokolün odak değil, altında yatan kavramların kısa bir özetini mikroakışkan ayrılık uygulamayı anlamakta yardımcı olmak için aşağıda - akustik parçacığın fiziği yaygın, 11 tarif edilmiştir odaklama.
Sıvı dolu Mikrokanallarda rezonansa Ultrason duran dalgalar alçak basınç düğümler doğru parçacıkları sürücü kuvvetlerin doğuran basınç alanları üretmek. Kuvveti büyüklüğü odaklama akustik ideal ölçekli hücre (~ 7-15 ayrılması için uygundur, parçacığın hacmine bağlıdır ve bu gibi, göreli yoğunluklar ve parçacığın sıkıştınlabilme türetilen akustik kontrast faktörü ve süspansiyon sıvısı. 14 Virüs boyutlu (~ 50-200 nm) parçacıklardan um). Daha büyük parçacıklar bir basınç düğüm doğru göç; Ancak, kuvvet büyüklüğü beri için çok küçükdaha küçük 2-3 mikron, bu küçük parçacıklar veya çözünmüş türlerin neredeyse hiç hareket parçacıklar. Akustik ayırma Bizim özel uygulama, daha önce tarif edildiği gibi, 15 kanalının alt bölümlere ayırmak için sıvı ince bir duvar içerir ve ayarlanabilir, odaklama pozisyonda asimetrik yerleşimi sağlar. Bu cihaz tasarımında esneklik katar ve performans avantajları da dahil artmış ayırma kalitesi ve hızı-olan tam başka nitelendirdi. 16,17
Ancak, bu çalışmada açıklanan sistem düzeyindeki tasarım yaklaşımı önemli bir avantajı mikroakışkan Çekirdek Cihazları büyük bir çeşitliliği adapte olmasıdır. Uygun düzenlemeler giriş / çıkış konfigürasyonu değişiklikleri hesaba yapılan, örneğin, atalet, akış alanı ayırma, deterministik yanal olarak yer değiştirmesine (DLD) ve elektrokinetik cihazın farklı türleri dahil olmak üzere diğer pek çok sürekli akış ayırma modu, hali hazırda, dahil edilebilir , akış hızları,ve numune hacimleri. Çeşitli on-chip alanlarının türleri (elektrik, manyetik) veya degradeler (termal, kimyasal) olan cihazlar bu platform barındırmaktadır çip ya da ek donanım entegrasyonu, ek bağlantı gerektirebilir.
Bu protokol, mikroakışkan ayırma cihazı tasarımı ve gravür ve pasivasyon döngüleri alternatif derin ulaşmak için kullandığı birçok mikroimalat tesislerinde (derin reaktif iyon dağlama ulaşabilirsiniz Drie, plazma oyma işlemi silikon cam yongaları üretmek için gerekli adımları sağlar Dikey yan duvarları 18) ile özellik. Sonra, acoustofluidic cihazın karakterizasyonu ayrılması için optimum çalışma parametrelerini belirlemek için, ve nihayet detay tam entegre ayrıştırma sistemi ve biyolojik numunelerin işlenmesi için prosedürü açıklar. Tipik cihaz karakterizasyon sonuçları ve örnek işleme verileri daha sonra sunulmuş ve tartışılmıştır ve bu beğenme önemli avantajları vardırach modülerlik, sağlamlık, hassasiyet ve otomasyon dahil vurgulanır.
1. Acoustophoretic Cihaz Tasarımı ve photomask Düzen
NOT: Genel hususlar ve mikroimalat proses tasarımı ve maske düzeni için rehberlik photomask tasarım mikrofabrikasyon metinler ve öğreticiler bulunabilir 19 - 21.
Şekil 1. Acoustofluidic cihaz. Acoustophoretic cihaz mimarisinin şematik skeçler. (A) genel H-filtre konfigürasyonunu gösteren Üstten görünüm, (ölçeksiz). (B) siyah ile işaretlenmiş yerde kanal kesitinin şematik olarak kesikli çizgi (a), basınç alanı (mavi çizgiler noktalı), ve doğru parçacıkları sürücü akustik birincil radyasyon güçleri (PRF) duygusu gösteren düğüm düzlemleri (kırmızı oklar). Kanal kesitiYaklaşık 10 mikron kalınlığında ana (300 mikron genişliğinde) ve baypas kanalları ayıran bir duvar ile 900 × 200 mikron olduğunu. (C) partikül ayırma 3D gösterimi. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
Acoustophoresis için mikroakışkan Chips 2. Temiz oda imalatı
3. Final Cihaz Meclisi
Şekil 2. Akışkan Breadboard, Chip Montaj ve Dünya to-Chip Arayüz. (A) akustik mikroakışkan çip Fotoğraflar ekli piezo transdüser tel uçları ile (70 × 9 × 1 mm dış boyutları), ayrılığın üç geçer gösteren çip aşağı kanal, (b) çip-to-dünya arayüzü, (c) sıkma fikstür kullanarak akışkan breadboard alt monte çip, için özel akışkan vida parçaları ve işlenmiş boru parçaları breadboard bir açılış kapsayan izin Tubi arabirim soğutma fanı (d) bağlanmış boru bağlantılarının ve soğutma fanı ile breadboard üstten görünüşüdür, ve (e) vidalı bağlantı parçaları bir enine kesit şematikmonte mikroakışkan çip ile ng. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
Akustik Odaklama Performansının 4. Karakterizasyonu
NOT: Akustik odaklama karakterizasyonu için gerekli Sistem bileşenleri Malzeme Listesinde gruplandırılmıştır. 4.1 Adımları ve sonraki adımlar Burada tartışılan acoustofluidic cihaza özgü işlemleri tarif ise 4.2 aşağıda, bu platform ile kullanılan herhangi Çekirdek Aygıt için geçerlidir.
Iyi bağlanmış, (A) için frekans tarama verileri ve kötü bağlanmış (B) piezo ve yonga Şekil 3. Temsili Frekans Tarama. Örnek. Üst sıra: boncuk floresan yoğunluğu (kırmızı yüksek temsil ve mavi düşük yoğunluklu gösterir). Orta sıra: Her frekansta maksimum yoğunluğu. Alt satır: Maksimum yoğunluk tarafından belirlenen kırmızı kesik çizgi konumunu odaklanarak tahmin gösterir maksimum yoğunluk, yeri ve kırmızı elmas rezonans frekansı göstermektedir.g "target =" _ blank "> bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
5. Otomatik Ayırma
NOT: Otomatik ayırma deneyi nedeniyle mikroakışkan çip uygulanan boyut bağımlı akustik odaklama kuvvetleri küçük parçacıklardan büyük partiküllerin ayrılması için çalıştırılır. Gerekli sistem bileşenleri Malzeme Listesinde gruplandırılmıştır.
Otomatik Ayırma Deneyleri Şekil 4. Akustik Sistem Yapılandırması. Mavi çizgiler sistemi aracılığıyla ana akış yolu iz. Tüm yeşil ve siyah çizgiler 0.03 "iç çapı (ID) boru ve tüm mavi ve gri renkli çizgiler 0,01 olan" dir e, kimlik boruKimliği "0.006 olan kimlik ve akış kısıtlayıcılarla," 0.03 olduğunu tutma bobinleri, bir xception. Şırıngalar tamponu ile doldurulur ve tutma bobinleri şırınga içine herhangi bir numune veya temizlik reaktiflerin alımını önlemek için yeterli hacmi (550 ul) vardır. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
Akustik-mikroakışkan cihaz tasarımının temel özellikleri Şekil 1'de belirtilen ve başka bir yerde tam tarif edilmiştir. 15 Kısaca, iki sıvı akımının, akış yan yana bir ayrıştırma kanalına olarak, ince bir silikon duvarla paralel bir by-pass kanalı ayrılır. Primer ışın kuvveti büyüklüğü parçacık hacmi ile terazi yana küçük parçacıkların orijinal akışı (Şekil 1B, C) devam ederken, büyük partiküller, bitişik geri sıvı akımı bulunan akustik basınç düğüm doğru karma örnek girdi akımından göç ederler. Bölünmüş iki kanallı mimarisi parçacık ayrımı 17 artırır ve farklı baypas kanalı sıvıları kullanılarak düğüm pozisyonu ayarlanmasını sağlar. Dünya bağlantılarını çip için 16 akışkan breadboard ve demirbaşlar sağlam bir platform sağlar ve modüler tasarımı akışkan cips arasında hızlı değişen sağlar (Şekil 2). Bu cKULLANICI TARAFINDAN YAPILANDIRILABİLİR benzer şekilde kapatan 1000 psi'ye kadar, hızlı ve güvenilir bir (Şekil 2B, E) yapılacak, geri dönüşümlü akışkan bağlantılarını sağlar.
Bir çip rezonans frekansı f res basit 1D analitik hesaplamalar kullanılarak tahmin edilebilir (1.1.1 Adım bakınız). Bizim cihaz kesitinin, 16 daha tam 2B sonlu elemanlar modelinden 2 düğümlü rezonans beklenen odaklama pozisyon duvardan 225 mikron olan ve beklenen frekans 1.68 MHz olduğunu. Ancak, gerçek cihazların f res çalışma sıcaklığı ve uzunlamasına ve yanal rezonansların bağlantı bağlı ± 100 kHz göre değişebilir. Protokol Aşama 4'te tarif edildiği gibi Dolayısıyla bu cihaz, montajdan sonra, f res ampirik, ilgili akış hızlarına ve piezo tahrik gerilimlerinde doğrulanması gerekir. Şekil 3, 200 ul / dak alındığı temsili frekans taramaları Ana ve baypas kanalları su ve 20 V pp ile birlikte piezo verilen. Piezo ve mikroakışkan cihaz arasındaki bağlanması iyi olduğu zaman, parçacıkların beklenen odaklama konumuna (Şekil 3A) floresan yoğunluğu ve göç açık bir tepe ile sonuçlanan, rezonans frekansında sıkı odaklanacaktır. Düşük birleştirme olduğunda tersine, Partiküller odak olmaz ve frekans tarama sonuçları 3B Şekil benzer olacaktır. Bu tür cihazlarda, piezo dönüştürücü bir tersinir yapışkan kullanılmış ise, yeniden monte edilmesi gerekebilir; odaklama, yüksek kaliteli veya hızlı akış gerekli uygulama için kritik, aksi takdirde, bu cihaz için uygun değildir. Şekil 3'te veriler daha sonraki deneyler için çalışma frekansı seçimi ve gerilim bilgilendirmek ve verimli parçacıklar ayrılması için mevcut oran aralığını akış.
Dosyaları / ftp_upload / 53051 / 53051fig5.jpg "/>
Şekil 5. Örnek İşleme Otomatik. Numune bobin yüklenen numunenin (A) şematik. (B), başarılı bir ayırma deneyi Örnek akış profili. (C) DPT çıkış yaklaşık 220 sn tıkanmış sırasında çalışacak bir ayrılık profili akış. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
Etkili ayırıcılar olan fiş belirlendikten sonra, bunlar Şekil 4'te gösterilen sisteme dahil edilmiştir. Toplam sistem süpürme hacmi ana akış yolu boyunca 0,01 "iç çapı ile borunun kullanılarak en aza düşürülmektedir (mavi çizgi). Şekil 5A, makyaj görüntülemektedir sistem üzerinden infüzyon tipik bir örnek fiş. "Öncü tamponu" (~ 35 ul) bir miktar přece için gereklidirde örnek ayırma çip sayesinde hareket ederken akış dalgalanmaları ortadan kaldırmak için akışında örnek. Şekil 5B başarılı otomatik akustik ayırma deney kaynaklanan akış verileri gösterir. Başarılı bir çalışma temel özellikleri şunlardır: LPO ve DPT hem debi (1) geçici bir artış basınç oluşturur ve sıvının sistemi üzerinden akmaya başlar, (2) bir hava kabarcığı geçişini gösteren bir keskin başak ( ilave nedeniyle iki çıkıştan eşitsiz akışına LPO önce DPT ulaşması gereken tek kabarcık), genişletilmiş bir profilini gösterir, sistem üzerinden örnek hamle olarak iki hava kabarcıkları arasında her iki çıkışları aracılığıyla (3) stabil akım, ve (4) tam bir numune hacmi sonrasında çıkış akış oranında bir aşamalı bir düşüş sistemine iletilir. Problemli çalışır o DPT yaklaşık 220 saniye sonra tıkanır anlaşılmaktadır 5C, Şekil benzer akış profilleri hemen belirgindir. Thi içinde s durumda, Aşama 5.3 'de tarif edilene benzer bir temizleme prosedürü, kanal unclog çalıştırılmalıdır.
Şekil 6. Cihaz Ayarlanabilirliğin: Tane Boyutu ve Gerilim Etkileri. LPO çıkarılan polistiren mikroküreler Yüzde piezo seramiği verilen parçacık boyutu ve gerilimine bağlıdır. Her bir çizgi bir aygıt aracılığıyla Adım 4. Toplam akış hızı tarif edildiği gibi belirlenen rezonans frekansı farklı bir çalışma gerilimi, karşılık gelen 200 ul / dakika, 1.62 ve 1.64 MHz arasında uygulanan tahrik frekansları. Hata çubukları en az üç ayrı deneyde standart sapmasını temsil eder. Çoğaltılabilir ve http://pubs.rsc.org / tr / İçerik / ArticleLanding / 2014 / AN / c4an00034j Kimya Royal Society izniyle güncellenmiştir.target = "_ blank"> bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
Şekil 6, çeşitli polistiren partikül boyutlarını ve verimli ayrılması için gerekli çalışma parametrelerini gösteren Piezo sürüş voltajlar kullanılarak ayırma sonuçlarını derledi. Beklendiği gibi, genel olarak, daha yüksek gerilimler (yani, daha yüksek akustik güçler), daha küçük parçacıklar elde etmek için gereklidir. Sürücü gerilimleri süresiz nedeniyle yüksek ısı dağılımı ve akustik akışı artan etkileri, ancak artan edilemez. 13 arsa belirli bir sürücü geriliminde önemli ölçüde farklı iyileşme (örneğin, 10- gösteren partikül ayırma-partikül büyüklükleri için genel bir kılavuz olarak hizmet vermektedir ve 8.8 V pp 2 mikron partiküller) iyi ayıracak. Genel olarak, bu virüsler (~ 100 nm) ve hücreleri (~ 10 mm) fark hücreleri mümkün olduğunca hızlı bir şekilde ve etkili bir şekilde ayrılabilir olan büyük bir fark ile partikül popülasyonları,erent boyutları (örneğin, 6-8 mikron diskoid eritrosit ve 8-15 mikron lökositler). Diğer hücre türleri çalışmak için gerekli olan belirli koşullar hücre şekli, yoğunluğu ve sıkıştırılabilirlik gibi hücre boyutuna ek olarak, akustik bir kontrast etkiler, ampirik olarak tespit edilmelidir. Bu amaçla, Adım 4 prosedürler Herhangi bir yeni hücre veya parçacık türü için kullanılabilir ayırma koşullarını belirlemek için faydalı değil, sadece belirli bir acoustophoresis cihazının kalitesinin değerlendirilmesi için bulunmaktadır.
Hücre-Virus Spiked Numuneler Şekil 7. Ayırma verim. Altın Kapı Virüsü (GGV) ile tutturuldu Dengue virüsü (NV) ve (B) Raji hücreleri Boa böbrek hücreleri ile çivili (A) Raji hücreleri ayrılma sonuçları. Toplanan Yüzdeler, belirli bir çıkan virüs ya da hücreler fraksiyonu olarak tanımlandığı gibidirçip çıkan toplam miktara göre çıkış. (B) örnekleri sadece nedeniyle, mevcut düşük miktarlarda bir kez işlendi ise için hata çubukları (A), 3 deneme standart sapmadır. 1x PBS Tüm deneyler için bypass kanalındaki su ile, örnek tamponu ve geri sıvısı olarak kullanılmıştır. Chip çalışma frekansları 16 ve 20 V pp arası sürücü gerilimleri, 1.60 ve 1.64 MHz arasında değişmektedir. Bu rakamın büyük halini görmek için lütfen buraya tıklayınız.
İnsan Raji hücrelerini (10 5 hücre / ml, ortalama çapı 8-10 mikron 25) dang virüsü (DENV, 10 ile çivili: Biyolojik partikül ayrılması için bu platformun programı göstermek için, öncelikle iyi karakterize biyolojik örnekleri işlemek için kullanılan 5 pfu / ml, yaklaşık çapı 50 nm 26). Şekil 7A (çip toplanan her parçacığın toplam miktarı ile kıyaslandığında, her çıkışında toplanan her bir parçacık türü fraksiyonu olarak tanımlanır) DPT ve LPO hem de toplanan Raji hücreleri ve DENV yüzdesini gösterir. Deney üç kez tekrarlanmıştır ve NV, bir ters transkripsiyon kantitatif polimeraz zincir reaksiyonu (RT-qPCR) kullanılarak değerlendirilmiştir ise Raji hücreleri, bir Coulter sayacı kullanılarak sayıldı.
Daha sonra, sistem performansı parçacıkların tam olarak fiziksel özellikleri bilinmeyen olabilecek olan klinik numuneler, işleme için daha gerçekçi bir senaryo içinde test edilmiştir ve mevcut örnek miktarları daha düşüktür. Burada, biz henüz ölçülen olmamıştır yakın zamanda tanımlanmış golden gate virüsü (GGV), bir yılan patojen bulaşmasını boğa yılanı böbrek hücreleri. 27 GGV virüs parçacığın boyutu ayrılması değerlendirildi, ancak GGV Arenaviridae ailesine ait olduğundan, bu Bir olası olduğuBenzer büyüklük, 100 nm ile 150. 28 Biz GGV ile örnekler işlenmiş Raji insan hücrelerinden (değil virüs için bir enfeksiyon hedef) ve boa böbrek hücreleri (GGV için enfeksiyon hedefinin, yaklaşık büyüklüğü 10 içine (10 4 pfu / ml) çivili 10 4 hücre / ml her iki hücre tipleri ile um 27). Bu örnekler, düşük miktarlarda kullanılabilir olarak, tek bir deneysel çalışma ayrılma sonuçları Şekil 7B, Raji hücreleri, Boa hücrelerinin yüzdesini göstermektedir. Bu çalışmada rapor edilen ve GGV DPT ve LPO toplanır. Hücreler bir hemasitometre üzerinde sayılarak bu deneylerde ölçülmüştür ve virüsler RT-qPCR ölçüldü.
Bu protokol otomatik biyolojik numune işlem gerçekleştirmek için macroscale ekipman mikroakışkan cihazların sistem düzeyinde entegrasyonu sunuyor. Bu platformun modülerliği bir örnek olarak, sunulan protokol karakterize bir acoustofluidic partikül ayırma cihazın performansını optimize odaklanmaktadır, herhangi bir sürekli akış cihaza adapte olmasını sağlar ve. Bu protokolün üç önemli avantajları vurgulanır: (i) modülerlik ve chip-to-dünyanın cihaz performansında (ii) sağlam karakterizasyonu ve partikül ayrılması için hassas olarak ölçülmüş numune hacimleri (iii) otomatik işleme, arabirim.
ben. Modülerlik ve chip-için-dünya arabirim
Şekil 2 de gösterildiği gibi, mikroakışkan çip kolayca doğrudan gözlem için bir mikroskop sahneye uygun özel bir delikli tahta üzerine monte edilir. Breadboard 5 mm-pitch ızgara, ena üzerinde # 6-40 UNF dişli delikler içeriyorçip bling güvenli olması için, ve sıvı bağlantıları yapılacaktır. Sıvı bağlantıları işlenmiş uçları ile tüpler PEEK olan bir lastik yüz sızdırmazlık conta ve paslanmaz çelik bilezikli akışkan çip karşı hangi mühür. Bu arayüz düzeni kolay çip değişimi ve hızlı cihaz yeniden tasarımı, az gerektiren veya diğer sistem bileşenlerine hiçbir değişiklik sağlanan çip ayak izleri ızgara biçimine uygun hale getirir. Örneğin, sürekli akış elektroforezi, termal hücre erimesi, kimyasal sentezi için reaktif 29 hızlı karıştırma ve tek hücreli yakalama ve sorgulama için mikroakışkan çipleri ile bu platformu kullandık.
ii. Cihaz performansı Sağlam karakterizasyonu
Herhangi bir mikroakışkan ayırma cihazının performansını optimize etmek amacıyla, operasyon ilk olarak iyice karakterize edilmelidir. Burada anlatılan sistem bunu yapmak için hızlı ve otomatik protokollerin gelişimini destekler. Belirli examp içinakustik odaklama cihazları, odaklama kalite, çalışma frekansı ve mikroakışkan kanal odaklı partiküllerin pozisyon le, her bir cihaz için ölçülmelidir. Bu ölçümler, piezoseramik sürücü frekansları, gerilim ve akım oranları aralığı boyunca süpürme gerektiren yüksek kaliteli ayrılması için en uygun parametre kombinasyonları belirlemek için. Sunulan protokol otomatik olarak bu ayarlanabilir parametreleri değişir ve veri-alakalı yakalar, yani post-işlenmiş kalite, sıklığını ve pozisyon (Şekil 3) odaklama parçacığın gerekli ölçümleri oluşturmak için vardır kanalda akan parçacıkların floresan görüntüler.
Akustik cihaz performansı tam karakterizasyonu tekrarlayan Adımlar 4.4 ve farklı deneysel koşullar altında gerektiği gibi 4.5 gerektirir. Örneğin, bir çip mutlak odaklama pozisyonu nispeten düşük debiler ve yüksek gerilim frekans tarama çalıştırarak bulunurs düğümü yere tam göçü sağlamak. Ayrıca, bu tür frekans taramaları (bilinen boyutta polistiren boncuklar ile çalışacak) cihazı montaj kalitesini değerlendirmek, ya da (bir çip boncuklar ile karakterize edilmiştir sonra) önceden bilinmeyen parçacık tipi sisteminde nasıl davranacağını belirler. Kötü enerji transferi olanlar bile odak olmaz ise mikroakışkan kanala piezo seramiği iyi bir enerji transferi ile bir çip, dar yüksek debilerde (> 1 ml / dak) ve düşük gerilim (12-15 V pp) de odaklama neden olacaktır Düşük debilerde (<100 ul / dak) ve yüksek gerilim (> 20 V pp) de. Biz mikroakışkan yonga ve piezo seramiği arasında yakın temas sıvısı içine enerji transfer verimi için kritik olduğunu bulduk. Yüksek performanslı cihazların güvenilir üretim sağlayacak mikroakışkan çip ve Piezo seramik yapıştırma optimal yöntemi daha fazla araştırma.
Son olarak, tam birBir acoustophoretic aygıtın operasyon resmi mikro-küreleri ile yapılan ayırma deneyler, Aşama 4 (Şekil 3), ilgili çalışma parametrelerinin bir fonksiyonu olarak DPT ve LPO toplanan parçacık sayısı ile görüntü-bazlı frekans tarama ölçümlerinin bir araya getirilmesiyle elde edilebilir Şekil 6'da gösterildiği gibi, Aşama 5'de olduğu gibi, otomatik deney gibi bir dizi hızlı bir şekilde partikül ayrılması için bir cihazı çalıştırmak için uygun bir parametre alanı kullanıcıya bildiren tek bir aygıtın performansı ve ayarlanabilirliği, karakterize edilebilir.
iii. Parçacık ayrılması için otomatik küçük örnek işleme
Başarılı ve doğru mikroakışkan çipli örnek işleme için, güvenilir ve hassas ölçüm, yük, teslim ve onlar geçerken sıvı hacimleri toplamak için kritik öneme sahiptir. Örnek hacmi küçük olduğu zaman bu hassasiyet özellikle önemlidirKlinik veya araştırma laboratuvar ortamlarında yaygındır (~ 0.1-1 ml). 30 Hassas numune alma sırasında numunenin hiç geribildirim ile bir cihazın içine şırınga ve infüzyon içine numune elle çekilmesi istihdam geleneksel mikroakışkan deneylerde zorlu ayrılmış vardır ve toplanan edilmelidir zaman. Sunulan protokol örneği bobin yükleme otomatik bünyesinde bulundurmaktadır ve küçük örnek hacimlerinin tekrarlanabilir ayrımlarını sağlamak için akış sensörleri gerçek zamanlı geribildirim ile birleştiğinde dağıtma.
Şekil 5, tipik bir ayırma deneyi ile ilgili DPT ve LPO ölçülen akış profillerini göstermektedir. İlk olarak, en az 35 ul lider tampon numunesi akustik çip ulaşmadan önce istikrarlı akışını sağlamak için yüklenir. Nedeniyle önde gelen tampon örnek seyreltme aşırı olur çünkü 100 ul daha az örnek hacimleri, bu sistem yapılandırması için tavsiye edilmez. Bir hava fişi th başında kullanılanönde gelen tamponu önce e enjeksiyon karıştırma ve numune seyreltme ve akış sensörleri bir göstergesi olarak hizmet önlenmesi, aşağıda sıvıdan örnek fişi ayırmak için. Akışkan olarak ilk geçici sistemi ile hareket başlar sonra, her iki satış keskin başak sinyalleri ilk hava kabarcığı geçişini gösterir. Numune, sistem üzerinden ikinci hava kabarcığı geçer sonra başka başak ve şırınga pompası durduktan sonra sıfıra akış hızında nihayet nihai bir azalma akarken bu geçici kararlı akış uzun bir süre tarafından takip edilmektedir.
Akış sensörleri ile hava fişler geçişi dolayısıyla olmayan numune sıvı hacimleri ile kayıp numune ve seyreltme minimize başlangıç ve örnek toplama durdurmak için vanaları geçmek için tetik noktalar olarak kullanılır. Işlenmiş örnek hacimlerinin Kapalı döngü ölçüm öncesinde deney girdi örnek değiştiğinde her zaman başlamasından bu değerleri yeniden programı gereksinimini ortadan kaldırır. Bu özelliközellikle önemli numune hacmi çok klinik örnekleri için, örneğin, sınırlı olduğunda. Gerçek zamanlı akış izleme de sorun giderme yardımcı olur; (örneğin, bir yapışmasına neden çıkışları birinde oluşturan) fakir bir çalışma Şekil 5b gibi, elde edilen akım profillerinden derhal açıktır.
Esneklik ve acoustofluidic ayırma etkinliğini sunulan sistem mimarisi ile arıtılmış, NV ve GGV virüs stokları göstermek için mikroakışkan çip yoluyla hücre stokları çivili ve işleme ile ayrılmıştır. Şekil 7a, Raji hücreleri 97 gibi virüslerden iyi ayrılmış olduğunu göstermektedir çip çıkan Raji hücrelerin% 'si ve böylece DPT DENV bir zenginleştirilmiş örnek bırakarak LPO olduğu tespit edilmiştir. Buna karşılık, NV ayırma verimliliği DENV% 70 DPT bulunan çip çıkarken ile düşüktü. Bu separati sarım tarafından uyarılan küçük bir konvektif karıştırma atfedilebilirkanalda, ancak LPO içine Raji hücreleri ile birlikte göç bazı NV parçacıkların daha yatkın. Akıcılık arasında yanal göç Hücreler bile düşük Reynolds sayısı az, onlarla bazı sıvıyı sürükleyin. Bu mekanizma, aynı zamanda spesifik olmayan yüzey adsorpsiyonunun, viral partiküller LPO içine aktarın. Baştan sıralama tespit etmek ve virüsleri tanımlamak için kullanılır Bununla beraber, DPT DENV oldukça zenginleştirilmiş örneği, örneğin, önemli bir avantajdır.
Şekil 7b, bir deney vadede, çip çıkan Boa hücrelerin sadece yaklaşık% 70 Raji hücreleri için yaklaşık% 100 ayırma verimliliği ile karşılaştırıldığında, LPO bulundu göstermektedir. Bu nedenle daha küçük bir akustik kuvvetlerinde ortaya çıkan, Raji hücreleri ile karşılaştırıldığında, iki hücre tipleri arasında ayrım performans farkı daha küçük bir ortalama boyutu ya da boa hücre düşük yoğunluğuna atfedilebilir. Bu varsayımları, Boa büyüklüğü, yoğunluğu ve morfolojisi onaylamak veya reddedeceksüspansiyon halindeki hücreler (normal olarak yapışık büyüdüğü) Boa hücrelerinin doğru bir ileri araştırmalar için bir çaba ölçülmelidir. Aynı deneylerde, benzer DENV ile deneyler, kurtarıldı GGV toplu viral fraksiyonun bir zenginleşme gösteren DPT çıktı.
Sunulan veriler biyolojik örneklerin çeşitli işlemek için mühendislik geniş uygulanamaz platformların doğal zorlukları vurgulayın. Önemlisi, biyolojik etkileşimler, fiziksel ve mekanik etkilere gibi büyük bir rol oynamaya başlayabilirsiniz. Ancak, bu ön deneyler de güç ve klinik ve araştırma uygulamalarında örnek işleme için bu sistem mimarisini kullanan sözünü göstermektedir. Sağlam, iyi karakterize mühendislik sistemi olarak bu platform yeni bilimsel sorulara cevap aramaya yeteneği sağlar.
The authors have nothing to disclose.
This work was performed under the auspices of the U.S. Department of Energy by Lawrence Livermore National Laboratory under Contract DE-AC52-07NA27344, and partially supported by LLNL’s Laboratory Directed Research and Development (LDRD) program, 14-LW-077. The authors thank Michael Wilson, Mark Stenglein and Joe DeRisi at the Univeristy of California, San Francisco for generously providing GGV and Boa cell samples. EJF acknowledges support from the LLNL Lawrence Scholar Graduate Program. MS acknowledges support from the UC Office of the President Lab Fees Research Program. LLNL-JRNL-665235
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Materials required for Steps 1-3: Device Design, Fabrication and Assembly | |||
Double Sided Polished Silicon Wafer | Silicon Quest International, Inc. San Jose, CA, USA | 100 mm <100> prime wafer | 1-20 ohm-cm, 495 ± 25 µm Double-side polished |
Glass Wafer | Bullen Ultrasonics, Eaton, OH, USA | 100 mmx0.5 mm Boro | |
Photoresist, AZ 1518 | MicroChemicals GmbH, Ulm, Germany | AZ 1518 | Photoresist used to adhere wafer to blank wafer for DRIE etching |
Photoresist, AZ 4620 | MicroChemicals GmbH, Ulm, Germany | AZ 4620 | Photoresist to define fluidic and via mask patterns |
DRIE plasma etcher | STPS, Newport, NP, United Kingdom | Multiplex Advance Oxide Etch (AOE) ICP system | |
Wafer Bonder | Electronic Visions Group, St.Florian am Inn, Austria | EVG 501 | |
Dicing saw | Kulicke & Soffa Industries, Singapore | K&S 982 | |
Epoxy kit | Epoxy Technology, Billerica, MA, USA | EPO-TEK 301 | Epoxy used to couple piezo and microfluidic chip |
PZT piezoceramic | Piezo Systems, Woburn, MA, USA | PSI-5A4E | 37.5 × 10 × 0.5 mm |
28 AWG Kynar-insulated solid wire | Squires Electronics, Cornelius, OR, USA | UL1422 | |
2-part silver epoxy | MG Chemicals, Surrey, BC, Canada | 8331 | Conductive adhesive for attaching wire leads to PZT |
L-edit | Tanner EDA, Monrovia, CA, USA | Ledit v15.1 64-bit | CAD software for mask layout |
Materials required for Step 4: Characterizaiton of Acoustic Focusing Performance | |||
Dual Pump | Harvard Apparatus, Holliston, MA, USA | PHD ULTRA Series, 703007 | |
5 ml syringes | Becton-Dickinson, Franklin Lakes, NJ, USA | 309646 | |
Luer to Threaded port adapter | IDEX, Oak Harbor, WA, USA | P-659 | Connects syringe to tubing |
Union | IDEX, Oak Harbor, WA, USA | P-623 | Connects world to chip connections to fluoropolymer tubing. Can also use webbed |
Ferrule 1/4-28 flat bottom | IDEX, Oak Harbor, WA, USA | P-200 | Used with nut to make connections between tubing and syringe, flow sensors and world to chip hardware |
Nut 1/4-28 flat bottom | IDEX, Oak Harbor, WA, USA | P-202 | Used with ferrule to make connections between tubing and syringe, flow sesnsors and world to chip hardware |
1/16" OD Fluoropolymer tubing | IDEX, Oak Harbor, WA, USA | 1912L | Tubing to connect syringe pumps to world to chip connections. Tubing size is not critical during claibration steps (.01-.03" ID typically used, other suitable part numbers: 1907L, 1902L). |
Small ID fluoropolymer tubing | IDEX, Oak Harbor, WA, USA | 1476-20 | Used for Flow restrictors: 0.006" ID, 1/16" OD FEP |
PEEK tubing | Connects from chip to fluoropolymer tubing. | ||
Cooling fan | Multicomp, Leeds, England | MC19663 | |
Function Generator | Agilent, Santa Clara, CA, USA | 33220A | |
RF amplifier | ENI, Rochester, NY | 325 LA | Must be able to amplify signals from <1 V in the range of 1-2 MHz to 25 Vpp to the piezo. |
CCD Camera | Photometrics, Tucscon, AZ, USA | CoolSnap HQ | |
Inverted Microscope | Zeiss, Oberkochen, Germany | Axiovert S100 | |
FITC filter set | Chroma Tech, VT, USA | SP101 | |
Objective, 10X | Zeiss, Oberkochen, Germany | ACHROPLAN | |
Oscilloscope | Tektronix, Beaverton, OR, USA | TDS3014B | To monitor voltage output by RF amplifier |
MatLab | Mathworks, Natick, MA, USA | R2014a | |
Driver interface software to integrate Photometrics camera with LabVIEW | R Cubed Software, Lawrenceville, NJ, USA | SITK | |
Tween 20 | Sigma Aldrich, St. Lousi, MO, USA | P9416 | |
Dragon Green Fluorescent 5.76 or 7.32 µm Beads | Bangs Laboratory, IN, USA | FS06F | |
Additional materials required for Step 5: Automated Separation | |||
Multiport valves | VICI, Houston, TX, USA | C25Z-3180EUHA | In the current configuration 4 valves are needed |
Flow Sensors | Sensirion, Westlake Village, CA, USA | SLI-1000 | |
Fluoropolymer tubing, .01 and .03" ID | IDEX, Oak Harbor, WA, USA | 1902L and 1912L | High purity PFA preferred |
Nut | VICI, Houston, TX, USA | ZN1PK-10 | Used with ferrule to make connections between tubing and valves. Alternative part numbers: MZN1PK-10, LZN1PK-10 |
Ferrule | VICI, Houston, TX, USA | ZGF1PK-10 | Used with nut to make connections between tubing and valves. |
LabVIEW | National Instruments, Austin, TX, USA | LabVIEW Professional Development system | Laboratory Automation Software |
PBS | Teknova, Hollister, CA, USA | P0200 | |
Raji Cells | ATTC, Manassas, VA, USA | CCL86 | |
Boa Cells | Kindly provided by the DeRisi Laboratory at UCSF | ||
GGV | Kindly provided by the DeRisi Laboratory at UCSF | ||
DENV | Kindly provided by Jose Pena at LLNL | ||
Coulter Counter Z2 | Beckman Coulter, Brea, CA, USA | Z2 | |
Hemacytometer | Fisher Scientific, Waltman, MA, USA | 0267151B |
Bu JoVE makalesinin metnini veya resimlerini yeniden kullanma izni talebi
Izin talebiThis article has been published
Video Coming Soon
JoVE Hakkında
Telif Hakkı © 2020 MyJove Corporation. Tüm hakları saklıdır