Method Article
Here we describe a procedure for studying freeze-fractured plant tissues. High-pressure frozen leaf samples are freeze-fractured and double-layer coated, yielding well preserved frozen-hydrated samples that are imaged using the cryo-scanning electron microscope at high magnifications with minimal beam damage.
Крио-сканирующей электронной микроскопии (СЭМ) замораживанием образцы, разрушенные позволяет исследовать биологические структуры на близких нативных условиях. Здесь мы опишем метод для изучения надмолекулярной организации фотосинтезирующих (тилакоидов) мембран внутри образцов листьев. Это достигается за счет замораживания высокого давления тканей листьев, сублимационной разрыва пласта, двухслойного покрытия и, наконец, крио-SEM визуализации. Применение метода покрытия двойного слоя позволяет приобретать большое увеличение (>) 100000 изображений с минимальным повреждением пучка к замороженным увлажненной образцов, а также минимальным воздействием зарядки. С помощью описанных процедур , мы исследовали изменения в распределении супрамолекулярного фотосистемы и светособирающей антенны белковых комплексов , которые имеют место в процессе обезвоживания Воскрешение растений Craterostigma pumilum, на месте.
Кислородный фотосинтез, происходящих в древней цианобактерии, был унаследован водорослей и наземных растений эндосимбиотических событий, которые привели к развитию хлоропластов органелл. Во всех современных кислородных фототрофов, фотосинтетический перенос электронов и генерация протон-движущей силы и уменьшение мощности осуществляется в пределах уплощенными мешка типа везикул, называемых '' тилакоидов мембраны. Эти мембраны разместятся белковые комплексы, которые выполняют легкие управляемые реакции фотосинтеза и обеспечивают среду для энергетической трансдукции. Тилакоидную мембраны растений и (некоторые) водоросли дифференцируются на два различных морфологических доменов: плотно прижатыми мембранные области , называемые "грана" и штабеля мембраны , которые связывают Грана, называемые 'стромы ламели' 1. Различные исследования сублимационной разрушения растений и водорослей тилакоидного мембран проводились, начиная с начала 1970-х. При замораживанием ломаются, мембраныраскалывается по их гидрофобной сердцевины 2, генерируя exoplasmic лица (EF) и протоплазматическим лица (ПФ), в зависимости от клеточного отсека , который Половинки мембраны границы, как это первоначально придуман Брэнтон и соавт. . в 1975 году 3 растений и водорослей тилакоиды имеют четыре различных поверхностей разрыва: Efs, EFU, ФД и ОРП, с 'S' и 'U' , обозначающих "уложенных" и "разобран" мембранных областей соответственно. Белковые комплексы мембран, которые не расщепленная или сломанные, имеют тенденцию оставаться с или Е или Р стороне мембраны. Первоначальные наблюдения , что разные грани перелома тилакоидами содержат частицы различных размеров и плотности 4 и многочисленные исследования , которые следовали, привели к идентификации и корреляции между наблюдаемыми частицами и мембранных белковых комплексов , которые осуществляют легкие реакции 5-13 (см также обзоры 14,15).
FreЭз-Перелом опыты тилакоидного мембран , как правило , проводят на препаратах хлоропластов или изолированных мембранах тилакоидов (но смотри 16,17), на риск каких - либо изменений в структурной и / или надмолекулярной организации , которые могут возникнуть во время процедуры изоляции. После перелома, точные копии получают путем выпаривания платины / углерода (Pt / C), затем толстым слоем углерода (C), и , наконец , переваривание биологического материала 18. Реплики визуализируются с помощью просвечивающей электронной микроскопии (ПЭМ). Традиционная технология сублимационной перелом-реплики продолжает служить в качестве важного инструмента для изучения надмолекулярной организации фотосинтетических мембран и их адаптацию к различным, например., Свет, условия 19-23.
В нашем недавнем исследовании homoiochlorophyllous Воскрешение растений Craterostigma pumilum 24, мы стремились исследовать изменения в надмолекулярной организации OF тилакоидов мембраны, а также в целом клеточной организации, в процессе обезвоживания и регидратации. Уникальность homoiochlorophyllous видов воскресения в том, что они способны выжить условия высыханию в своих вегетативных тканях (листья), сохраняя при этом их фотосинтетического аппарата. После того, как вода доступна, эти растения восстановить и возобновить фотосинтетическую активность в течение нескольких часов до нескольких дней 25. Для этого исследования, крио-сканирование ЭМ (СЭМ) визуализация сублимационной сломана образцов листьев, сочеталось с замораживанием под высоким давлением для образца крио-иммобилизации. Эти процедуры обеспечивают средства для визуализации замороженных гидратированных биологических образцов в состоянии , близком к их родному государству 26. Один Основное преимущество состоит в том, что образцы исследуют непосредственно после сублимационной перелома и покрытия без каких-либо последовательных шагов. Это особенно актуально для исследования растений при различных относительного содержания воды (RWC), так как их состояние гидратации поддерживается в процессе подготовки. Каккогда-либо, один критический недостаток состоит в том, что замороженные гидратированных образцы могут пострадать от повреждения луча во время формирования изображения, особенно при сканировании при больших увеличениях, необходимых для точного измерения размера фотосинтетических комплексов. Чтобы преодолеть это, метод , называемый "двойной слой покрытия '(DLC) 27,28 в сочетании с использовались специфические условия формирования изображения крио-SEM. Они привели в образцах, которые значительно меньше света чувствительных и позволила выяснении ценную информацию о фотосинтетической белка надмолекулярной организации и других клеточных компонентов Воскрешение растений C. pumilum при высоких увеличениях на месте.
1. Крио-фиксация листьев ТКАНЕЙ при замораживании высокого давления
Примечание: В данном разделе описывается, как проводить замораживание высокого давления тканей листьев для эксперимента сублимационной перелома. По соображениям , связанным с образцами растений см 29. Это может быть адаптирована для других типов тканей или образцов с некоторыми изменениями.
2. Замораживание-трещины и двухслойные покрытия 27,28
3. Cryo-сканирующей электронной микроскопии
Анализ 4. Изображение
Примечание: В данном разделе описывается короткая процедура для сегментации мембранных частиц от замораживанием разрушения SEM изображений с использованием открытого исходного кода пакета Фиджи 31. Аналогичные результаты можно получить с помощью другого программного обеспечения для анализа изображений.
На рисунке 1 показана крио-SEM изображения пластинок , содержащих высокого давления заморожен, сублимационной трещиноватых Craterostigma pumilum кусочки листьев. В некоторых образцах, большие участки трещиноватых клеток получаются (Рис . 1А) В других кусок листа остается тесно связан с верхним диском и сбит вместе с ним (рис 1В). Тем не менее, даже во втором случае, некоторые из ткани листьев может оставаться присоединенным к ножу пазами на тромбоциты (рис 1B, Arrowheads) и изрядное количество данных по- прежнему могут быть собраны с помощью получения изображения листьев «остатки», при условии , что они были сломаны. После успешного разрушения найдена, изображения с низким увеличением клеток приобретаются для выявления областей интереса, в данном случае хлоропластов (рисунок 2).
Высшее коэффициент увеличения изображения тилакоидного мембран в С. pumilum листья показаны на рисунках 3 и 4. Четыре различных поверхности разрыва, ЭФ, EFU, КХ и ОРП, можно выделить (рисунок 3). Фотосистемы II (ФС II), который является самым крупным белковый комплекс находится в мембранах, находится в обоих ЭФ (Грана) и EFU (стромы ламелей). В гидратированных условиях PSII плотности в ЭФ ~ 3 раза выше , чем в EFU (~ 1,550 мкм комплексы -2 против ~ 550 мкм -2 комплексов, рис 3). Это одна основа для дифференциации между этими двумя непрерывными гранями. Другим примером является разница в их фоне. В то время как фон ЭФ кажется гладкой, лицо EFU неровная и содержит отверстия , которые являются следы отдельных PSI комплексов, перелом комплементарной лица, ОРП 10 (рисунок 3). Примером сегментации комплексов ФС II от Efs поверхности мембраны тилакоидов показано на рисунке 5.
ove_content "ВОК: Keep-together.within-страницу =" 1 "> При дегидратации С. pumilum, плотность PSII в гранулах мембран (EFS) постепенно уменьшается, достигая примерно половину (~ 700 мкм -2 комплексов при ~ 15 % RWC, рис 4C) их плотности в гидратированных условиях (100% RWC, рис 4А) Следует отметить, что при дальнейшем обезвоживания, 5 -. 10% RWC, PSII комплексы организовать в строки и массивы (стрелки, цифры 4D и 4E). для получения полного набора данных, см 24. Формирование таких ФС II массивов требует , чтобы некоторые из них связанных антенных комплексов, LHCII, отделяться от PSII. пример для LHCII комплексов , организованных в строки в КФХ , которые будут дополнять организованных ФС II комплексов (в ЭФ ) показан на рисунке 4E (стрелки). PSII комплексы в массивах, а также снятую LHCII, вероятно, будут в фотохимических закаленном состоянии, выступающей фото-защитную роль. Эти структурные перестройки являются часть механизмов , используемых Воскрешение растений C. pumilum , чтобы защитить себя в обезвоженном состоянии 24.
Рисунок 1. Низкая Увеличение крио-SEM Изображения Тромбоциты с Фриз-раздробленной C. pumilum Кусочки листьев. (A) большая область трещиноватых клеток (пунктирная контур) из C. pumilum лист. (Б) кусок листа был сбит с верхней тромбоцита, но некоторые из листовой ткани оставалось прикреплены к ножу отметок на нижней тромбоцита (Наконечники отметить некоторые из них). Области, окружающие кусочки листьев замораживают 1-гексадецен (звездочки). Шкала баров:. 200 мкм Пожалуйста , нажмите здесь , чтобы посмотреть увеличенную версию этой фигуры.
Рисунок 3. Супрамолекулярная Организация мембранах тилакоидов в тканях растений раздробленной хлоропласта , в котором можно увидеть различные тилакоидов грани разрушения:. Exoplasmic на поверхности разрыва (EF) обоих сложенных (EFS) и разобран (ВФУ) мембранных регионов содержат фотосистемы II (PSII) комплексы; Протоплазмы лицо перелом сложенных областей (PFS) содержит периферические светособирающей антенны комплексы PSII, LHCII; Фотосистемы I (PSI) и АТФ-синтазы перелом к протоплазмы поверхности разрушения штабеля областей (БОЕ); Цитохром Ь 6 е переломы обоих ФД и ОРП. Изображение сканировали при увеличении 203 КХ (горизонтальное поле зрения = 1,45 мкм). Шкала бар:. 100 нм Пожалуйста , нажмите здесь , чтобы посмотреть увеличенную версию этой фигуры.
Рисунок 4. Изменения в фотосистемы II Организации при обезвоживании С. pumilum Эф лица тилакоидного мембран растений при различных RWC: (А) 100% (В) ~ 40%, (С) ~ 15%, и (D и E) , 5 - 10%.. При дегидратации, плотность PSII в ЭФ лицу постепенно уменьшается от ~ 1500 комплексов мкм -2 (А) до ~ 700 мкм комплексы -2 (~ 15% RWC, С). Следует отметить, что в более сухих условиях (5 - 10% RWC), некоторые PSкомплексы II организовать в виде строк и массивов (D и E, стрелки). Стрелолист (Е) обозначает лицо PFS, с LHCII антенны появляясь быть также организованы рядами, между которыми PSII строки будут найдены в дополнительных EFS. Для получения дополнительной информации по этим данным см 24. Шкала баров:. 100 нм Пожалуйста , нажмите здесь , чтобы посмотреть увеличенную версию этой фигуры.
Рисунок 5. Пример Сегментация фотосистемы II частиц. Использование пакета с открытым исходным кодом Фиджи, белковые комплексы могут быть сегментирован из изображений с помощью нескольких шагов (завершить детальную процедуру содержится в части 4 раздела Протокола). Изображения (A, оригинальное изображение) размыты с фильтром Гаусса (B); изображение порогами с помощью автоматического местного тысreshold инструмент (C); изображение инвертируется и алгоритм водораздела применяется для того , чтобы отделить объекты , найденные в тесном контакте (D); интересующей области выбирается и снаружи очищается (Е); частицы (в пределах заданного пользователем диапазона размеров) выбираются с помощью функции анализатора частиц. Полученная маска показана на (F). Частицы добавляются в ROI Manager , и наложить на исходное изображение (G) , чтобы проверить на наличие ошибок или ошибочных или пропущенных частиц. Список трансформирования может быть отредактирован вручную, заменив, удаления или добавления новых трансформирования, в зависимости от обстоятельств. Окончательный выбор отредактированный показан в (H). Шкала бар:. 200 нм Пожалуйста , нажмите здесь , чтобы посмотреть увеличенную версию этой фигуры.
Техника, описанная в данной статье позволяет исследовать замораживанием сломана мембран в контексте хорошо сохранившимися высокого давления замороженных тканей растений с помощью крио-сканирующей электронной микроскопии. Основное преимущество использования этих процедур является то, что подготовка образца является чисто физическим; никаких шагов связанных с химикатами или обезвоживание не требуется. Таким образом, это позволяет изучать биологические структуры на почти родном штате 26,32. Преимущество использования тканей листьев является то , что можно получить информацию о клеточной организации в целом, а также изучения конкретных мембран, таких как мембраны тилакоидов, в пределах их родного физиологического контекста, то есть в пределах хлоропластов. Еще одно преимущество, необходимо , чтобы изучать C. pumilum растений при различных относительного содержания воды (RWC), является то , что их гидратация состояние не изменяется в процессе подготовки. Это в отличие от использования выделенные хлоропласты или мембранах тилакоидов в качестве исходного материаладля эксперимента сублимационной перелома. В последнем случае, также надо учитывать, что некоторые структурные и / или супрамолекулярными изменения, вероятно, имеют место в процессе выделения органелл / мембраны.
Работа с образцами тканей растений, которые являются относительно толстые [> 50 - 100 мкм, и может быть значительно толще, в зависимости от типа ткани и вида], диктует использование высокого давления замораживания (ФВЧ) для образца витрификации. Применение высокого давления [2,100 бар], при котором температура плавления воды составляет около -22 ° C, влияет на сеть водородных связей воды таким образом, что он замедляет скорость образования кристаллов льда. Таким образом, вероятность получения витрифицированном образца высока даже при относительно медленных скоростях охлаждения. ФВЧ в настоящее время единственный доступный метод для витрификации толщиной, но не более 200 мкм, образцы. Важным шагом для ФВЧ растительных тканей является инфильтрация их межклеточных пространств воздуха с инертным4;. Пространство наполнитель "до замораживания, чтобы предотвратить разрушение ткани под высоким давлением (см обзоры 29,33) В случае C. pumilum листьев, толщина которых может составлять до 1 мм, листья также должны быть обрезаны или разбавлять до ФВЧ.
По сути, методика подготовки реплики 18 также может быть применен к сублимационной сломана ткани листа. Тем не менее, в нашем опыте, достаточный выход интактных трещиноватых областей не было получено, так как точные копии часто фрагментировать на мелкие кусочки. Кроме того, в поисках конкретной области, представляющей интерес, такие как хлоропласты могут быть непрактичным в раздробленном репликами растительных тканей. Это происходит главным образом потому , что мезофильные (фотосинтетический) клетки состоят из большого центрального вакуоли , окруженной узкой полосой цитоплазмы (рис 2А), который включает в себя ядро, хлоропласты и все другие органеллы. Таким образом, хлоропласты представляют собой лишь очень малую часть от общей площади раздробленноймезофильные ткани. Крио-SEM визуализация замораживанием сломана образцов предлагает решение этой проблемы, так как образцы непосредственно визуализировать следующие разрушения (и покрытия / затенение). Тем не менее, этот метод страдает от ограничения, что замороженные увлажненной образцы пучка чувствительны и, таким образом, сканирование при больших увеличениях с готовностью повреждает образец при первом сканировании. Дважды слой покрытия (DLC) 27,28 предлагает решение на этот серьезный недостаток.
В DLC, образцы, разрушенные покрыты таким образом, подобно тому, как они предназначены для подготовки реплики. Во-первых, тонкий слой (1 - 3 нм) Pt / C упаривают на образец, обеспечивая контраст и проводимость. За этим следует более толстым (5 - 10 нм), защитный слой углерода. DLC в сочетании с высоким ускоряющего напряжения (10 кВ) использовали для образцов изображения с использованием сигнала 28 обратного рассеяния электронов (BSE). Сигнала ОЭ, происходящих из слоя платины позволяет получить информацию поверхности через углероди, возможно, вода загрязнителем слой пара, который практически прозрачен для BSE при высоких напряжениях ускорения (загрязнение воды накапливается в экспериментах, в которых вакуум-крио блок передачи не используется и раздробленная поверхность подвергается воздействию атмосферы, даже если это это за доли секунды). Кроме того, визуализация с помощью BSE сигнала сведено к минимуму проблему зарядки эффекты , которые проявляются в вторичных электронов (SE) обнаружения 27. При установке микроскопа, описанного здесь, визуализации сигнала SE с In-объективом детектора SE на 10 кВ получали информацию, эквивалентную той, которая получается, когда образцы были покрыты исключительно 2 - 3 нм Pt / C и при низких отображены ускоряющих напряжений. Разница заключается в том, что образцы, полученные с помощью DLC и изображаемого, как описано было значительно меньше света чувствительны к регистру. Это дало нам возможность сканировать их при высоких увеличениях и во многих случаях даже неоднократно, и позволили получить ценную информацию о фотосинтетической белка supramoleculорганизация аг и другие клеточные компоненты (Рисунки 2 - 4) 24.
И, наконец, процедуры, описанные здесь, могут быть модифицированы для изучения структуры и / или мембранную организацию белка в других типах образцов. Мы успешно использовали технику для изучения надмолекулярной организации фотосинтетических мембран в цианобактерий и водорослевых клеток (Shperberg-Авни и др. Неопубликованные данные). Основное соображение заключается в нахождении баланса между наличием в качестве тонкого образца, насколько это возможно, для того, чтобы увеличить вероятность для витрификации, сохраняя при этом образец интактность. Для различных типов образцов, которые могут быть суспензии или тканей животных / растений, различные упаковки должны быть использованы (например, с точки зрения типа тромбоцитов , используемых для замораживания под высоким давлением). После успешной крио-иммобилизации достигается, сочетание сублимационной перелома, DLC и визуализации крио-SEM обеспечивает превосходное средство для получения инфорформацию по мембранной организации белка при большом увеличении с минимальным повреждением пучка.
The authors declare they have no competing financial interests.
Мы благодарим Андрес Kaech (Университет Цюриха) за полезные советы по сканирующей электронной микроскопии изображений. Эта работа была поддержана исследований и развития Фонда США-Израиль Двусторонней сельского хозяйства (грант №. US-4334-10, ZR), Израильского научного фонда (грант №. 1034/12, ZR) и Научном программы Human Frontier (RGP0005 / 2013, ZR). Исследования электронной микроскопии проводились на Ирвинга и Черна Московиц Центра нано- и био-нано изображений в институте Вейцмана.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Ethanol abs | Bio-Lab | 052505 | |
Isopropanol | Bio-Lab | 162605 | |
1-hexadecene | Sigma-Aldrich | H7009 | |
0.1/0.2 Platelets | Engineering Office M. Wohlwend GmbH, Switzerland | 241 | Platelets are of 3-mm diameter and 0.5-mm-thick (Type A) with 0.1/0.2-mm-deep cavities (of diamater 2 mm). Similar platelets can be obtained from Leica Microsystems. |
High-precision-grade tweezers | Electron Microscopy Sciences | 72706-01 | Dumont (Switzerland) Durostar style #5 tweezers; Can be substituted with other high-precision tweezers. |
High-pressure freezing machine | Bal-Tec | HPM 010 | High-pressure freezing alternatives: 1. HPF Compact 02, Wohlwend GmbH; 2. HPM 010, RMC Boeckeler; 3. EM PACT2, Leica Microsystems; 4. EM HPM 100, Leica Microsystems; 5. EM ICE, Leica Microsystems. |
Freeze-fracture system | Leica Microsystems | EM BAF 060 | |
Cryo preparation loading stage | Leica Microsystems | 16770228 | |
Specimen holder for univeral freeze fracturing | Leica Microsystems | 16LZ04746VN | Clamp holder for specimen carriers of diameter 3 mm |
Vacuum cryo-transfer shuttle | Leica Microsystems | EM VCT 100 | |
Scanning electron microscope | Zeiss | Ultra 055 | |
Cryo SEM stage | Leica Microsystems | 16770299905 | |
Image acquisiton software | SmartSEM, Carl Zeiss Microscopy GmbH | ||
Image analysis software | Fiji/Image J, National Institute of Health | http://fiji.sc/Fiji |
Запросить разрешение на использование текста или рисунков этого JoVE статьи
Запросить разрешениеThis article has been published
Video Coming Soon
Авторские права © 2025 MyJoVE Corporation. Все права защищены