Method Article
Врожденная иммунная реакция защищает организмы от патогенной инфекции. Одним из важнейших компонентов врожденного иммунного ответа, респираторный взрыв фагоцитов, генерирует активные формы кислорода, которые убивают вторгшиеся микроорганизмы. Мы описываем респираторный взрыв анализа, который количественно активные формы кислорода, произведенные при врожденной иммунной реакции химически индуцированных.
Респираторный взрыв фагоцитов является частью врожденного иммунного ответа к патогенной инфекции и включает в себя производство активных форм кислорода (АФК). АФК являются токсичными и функционировать убить фагоцитируются микроорганизмы. В естественных условиях количественное фагоцитов полученных АФК предоставляет информацию о способности организма поддержать активную врожденную иммунную реакцию. Здесь мы опишем протокол для количественной и сравнить ROS в целых эмбрионов данио на химической индукции дыхательного взрыва фагоцитов. Этот метод использует не-флуоресцентным соединением, которое становится люминесцентные от окисления АФК. Отдельные данио эмбрионов пипеткой в лунки микропланшета и инкубировали в этом флюорогенного субстрата с или без химического индуктора дыхательного взрыва. Флуоресценции в каждой лунке количественно в нужных точках времени с помощью микропланшет-ридера. Показания флуоресценции корректируются для устранения фоновой флуоресценции, а затем совместноmpared помощью непарного т-тест. Этот метод позволяет для сравнения респираторный взрыв потенциала эмбрионов данио рерио на разных стадиях развития и в ответ на экспериментальных манипуляций, таких как белка нокдаун, избыточная экспрессия или лечения фармакологических агентов. Этот метод также может быть использован для мониторинга ответа респираторный взрыв в целых расчлененный почек или клеточных препаратов из почек взрослых данио и некоторых других видов рыб. Мы считаем, что относительная простота и технологичность этого протокола будет дополнять существующие протоколы и будет представлять интерес для исследователей, которые стремятся лучше понять врожденную иммунную реакцию.
Иммунная система состоит из двух ветвей: врожденного и адаптивного иммунитета. Врожденный иммунитет является эволюционно более древняя, чем адаптивного иммунитета. Беспозвоночные в настоящее время полагают, только врожденный иммунитет, тогда как позвоночные обладают как врожденные и адаптивные ветви. В то время как адаптивный иммунитет дает конкретные и длительный иммунитет к определенным патогенов, врожденный иммунитет является непосредственным ответом на вторжение бактерий, вирусов и грибков. Одним из важнейших аспектов врожденного иммунного ответа связан с высвобождением цитокинов и хемокинов, что приводит к воспалению и найма фагоцитов (например макрофаги, нейтрофилы), чтобы поглотить и уничтожить иноземных захватчиков.
Успешные врожденные иммунные реакции включают: (1) признание вторжения микроорганизмов; (2) индукция соответствующих сигнальных каскадов (например высвобождение цитокинов и хемокинов); (3) надлежащее развитие / необходимого числа фагоцитов; (4) Миграция фагоцитов в местах инфекции; (5) охвате патогенов, и (6) уничтожение охвативших микроорганизмов. Дефицит в любом из этих шагов может привести к хосту быть раздавленными, а поддавшись, инфекции. Надежная врожденного иммунного ответа является жизненно важным для здоровья организмов, потому что это первая линия обороны против патогенов во всех растений и животных. У позвоночных, он также усиливает адаптивный иммунный ответ 1. Поэтому очень важно, чтобы мы в состоянии оценить все аспекты врожденного иммунного ответа, с тем, чтобы лучше понять его и оптимизации его функции.
Многие модельные организмы используются для изучения врожденного иммунитета, начиная от Arabadopsis к С. Элеганс в дрозофилы до мышей к культуре клеток человека. Преимущество использования данио (Danio рерио) модель системы для изучения врожденного иммунитета является то, что данио является позвоночным, как с врожденного и адаптивного имсообщества, но развитие врожденного и адаптивного иммунитета временно отделены. Данио рерио полагаться исключительно на врожденного иммунитета для защиты от инфекций, пока адаптивный иммунитет не станет полностью функциональной, которое происходит вокруг 4-6 недель после оплодотворения 2. Кроме инструментов для генетических манипуляций, оптической прозрачности и быстрого, внешнего развития, врожденный иммунитет как принцип режиме обороны у эмбрионов рыбок данио обеспечивает упрощенную модель, в которой для изучения сложности врожденного иммунного ответа в естественных условиях.
Несколько протоколы были разработаны для оценки различных аспектов врожденного иммунного ответа у эмбрионов рыбок данио. Microarrays и RNAseq быть подтверждено, что цитокин профили вызываемые данио врожденного иммунного ответа аналогичны у людей и также показали участие неожиданных генов в врожденного иммунитета 3,4. Прозрачность эмбрионов рыбок данио и люминесцентные, трансгеннойштаммы ИЦ патогенов и рыбок данио позволяют для визуализации динамических взаимодействий хозяин-патоген в естественных условиях в режиме реального времени. Трансгенные эмбрионы рыбок данио, выражающие GFP под контролем нейтрофилов конкретных миелопероксидазы промоутер 5,6 или макрофагов конкретных mpeg1 промоутер 7 сделали возможным визуализировать и количественно фагоцитов миграцию к местам локализованных инфекций 8, а также визуализировать фагоцитоз и разрушение флуоресцентно меченных патогены 8,9. Эмбрионы рыбок данио также поддаются генерации высокой пропускной анализов и химических экранов. Соответственно, недавно были разработаны методы высокой пропускной из транскриптома анализа при инфекции 10 и фагоцитов миграции к местам химически индуцированного повреждения 11.
Из методов, перечисленных выше, ни один количественно не оценить заключительный этап уничтожения возбудителя фагоцитами. Это заключительный этапвключает в себя респираторный взрыв (то есть производства АФК и других токсичных соединений), убивающих охвативших патогенов. Фермент НАДФН оксидазы является основным источником АФК в фагоцитирующих клеток. Ассамблея субъединиц НАДФН энзима приводит к переносу электронов к кислороду, генерации супероксид-анионы. Через последующих ферментативных реакций, супероксид затем могут быть преобразованы в перекиси водорода и хлорноватистой кислоты (фигура 1А). Это респираторный взрыв фагоцитов, который убивает болезнетворные микроорганизмы и, таким образом, количественное определение респираторный взрыв потенциала эмбрионов данио рерио является показателем общей врожденной иммунной здоровья. Мы разработали флуоресценции основе анализа для количественной оценки респираторный взрыв в группах отдельных эмбрионов рыбок данио 12. Этот анализ использует не-флуоресцентный, восстановленную форму коммерчески доступной, проникающий в клетку краситель. Этот краситель, 2 ',7-диацетат dichlorodihydrofluorescein (H2DCFDA), преобразуется в флуоресценциицент соединение, 2 ',7-дихлорфлуоресцеина (DCF), при окислении. Различные ROS, генерируемые дыхательного взрыва фагоцитов может окислять H2DCFDA и генерировать флуоресценции 24. Появление флуоресценции могут быть использованы для количественного определения и сравнить ответ респираторный взрыв между группами данио. Протеинкиназы С ацетат агонист форбол-миристат (PMA) используется для химически индуцировать НАДФН-оксидазы, чтобы произвести ROS и тем самым увеличить показания флуоресценции (рис. 1b). При этом мы предоставляем подробный протокол модифицированной и оптимизированной версии этого данио эмбрионов респираторный взрыв анализа. Этот анализ может быть использован для сравнения респираторный взрыв между группами отдельных эмбрионов данио рерио с течением времени и / или в ответ на экспериментальных манипуляций (например, морфолино-опосредованного белком нокдаун). Использование этого метода, в сочетании с другими данио врожденных анализов иммунитета, обеспечит более полное представление о сложной и критическойврожденного иммунного ответа.
1. Данио рерио Уход и техническое обслуживание
2. Подготовка решения
3. Считыватель микропланшетов Программирование
4. 96 Ну Микропланшетный Настройка (см. рисунок 2)
5. Флуоресценции Количественное
6. Анализ данных
Здесь мы предоставляем данные, сравнивающие ответ респираторный взрыв в эмбрионов рыбок данио (дикого типа, А. Б. фон) на 48 и 72 часа после оплодотворения (ФВЧ). Эмбрионы 48 HPF действовал как наш контрольной группе и эмбрионов 72 оплодотворения как нашей экспериментальной группы. Размер выборки использовали 24 ООН-индуцированной эмбрионы и 24 PMA-индуцированные эмбрионы в стадии развития. Сырье Измерение флюоресценции (в относительных единицах флуоресценции (RFU)) были получены путем считывания микропланшетов 4 часа после добавления ФМА. Сырье значения флуоресценции приведены в таблице 1. Сырье значения флуоресценции была выше в 48 HPF не-индуцированной эмбрионов в чем HPF не-индуцированной эмбрионов 72, за исключением одного 72 HPF эмбриона (означает: 48 оплодотворения = 758 РФС, 72 HPF = 230 РФС). Изменчивость в пределах этих двух образцов был приблизительно равен (стандартные отклонения: 48 HPF = ± 549 РФС, 72 HPF = ± 513 РФС), но 72 HPF группа варьировать более по отношению к средней (стандарт deviatioн в процентах от среднего: 48 HPF = 72%, 72 HPF = 223%). В PMA-индуцированных групп, сырые значения флуоресценции были в основном выше в ФВЧ населения 72 (средства: 48 оплодотворения PMA = 3798 РФС, 72 оплодотворения PMA = 5825 РФС). Был более изменчивость в 72 HPF PMA-индуцированную группы чем 48 HPF PMA-индуцированную группы (стандартных отклонений: 48 HPF PMA = 831 RFU, 72 HPF PMA = 1365 РФС), но изменчивость по отношению к среднему была приблизительно равна (48 HPF PMA = 22%, 72 HPF PMA = 23%).
Для учета изменчивости фоновых уровней флуоресценции, были рассчитаны нормированные значения флуоресценции (PMA-индуцированной значение минус среднее значение не-индуцированных значений соответствующей стадии развития). Эти нормализованные значения флуоресценции приведены в таблице 2 вместе с помощью стандартных отклонений, и п-значение для групп 48 и 72 HPF. График этой данных обеспечивается на рисунке 2. Приведенные значения флуоресценции последовательно приветGher в 72 HPF группе, чем в группе HPF 48 (означает: 48 HPF = 3040 РФС, 72 HPF = 5596 RFU) и изменчивость аналогично по отношению к среднему (48 HPF = 27%, 72 HPF = 24%). Это респираторный взрыв анализ показал, что эмбрионы 72 оплодотворения данио в состоянии производить больше ROS и поэтому смонтировать более надежный ответ респираторный взрыв, чем 48 часов после оплодотворения эмбрионов после индукции с PMA. Этот вывод может быть связано с увеличением числа клеток, в том числе к увеличению числа гранулоцитов 18, в 72 HPF эмбрионов по сравнению с 48 эмбрионов HPF. Непарный т-тест, чтобы статистически сравнить данные подтвердили, что ответ респираторный взрыв значительно отличается в 72 HPF эмбрионов, чем за 48 часов после оплодотворения эмбрионов (* р = 2 х 10 -9).
В более общем смысле, в момент времени T = 0 ч после добавления PMA, значения сырья флуоресценции не должно быть статистически отличаются между РМА-индуцированной и ООН-индуцированной групп. Исходные значения флуоресценции будет повышее с течением времени как в не-индуцированных и индуцированных образцов, с гораздо большее увеличение происходит в PMA-индуцированных эмбрионов 12. Увеличение сырьевых значений флуоресценции в PMA-индуцированной группы, по сравнению с не-индуцированной группы, станет статистически значимы на примерно 1-2 часов после добавления PMA (в зависимости от стадии развития из эмбрионов данио рерио, с старше эмбрионы монтажа ответа быстрее респираторный взрыв, чем молодые эмбрионов). Нормированные значения флуоресценции (индуцированной минус не-индуцированной) должна возрастать с увеличением стадии развития эмбрионов данио рерио, с самой большой разницей, произошедшим между 48 и 72 ч после оплодотворения и меньшей разницей, произошедшим между 72 и 96 часов после оплодотворения. Сырье цифры флуоресценции должно быть от 5 до 60 раз выше, в PMA-индуцированной группы относительно не-индуцированной группы, в зависимости от стадии развития из эмбрионов рыбок данио (между 48 и 96 часов после оплодотворения). Изменениебудет происходить между отдельными образцами данио эмбриона Таким образом, рекомендуется, чтобы примерно 24 образцов эмбрионов в лечении быть использованы.
Рисунок 1. Схема химической индукции дыхательного взрыва внутри фагоцитов. (A) В этом анализе респираторный взрыв, PMA используется, чтобы вызвать производство супероксидных анионов НАДФН-оксидазы. Супероксид преобразуется в кислорода и перекиси водорода на супероксиддисмутазы. Перекиси водорода и хлорид-анионы преобразуются в хлорноватистой кислоты по миелопероксидазы. Не-флуоресцентный краситель, H2DCFDA, преобразуется в флуоресцентным соединением, DCF, при окислении многими различными АФК. (B) Схема как количественное определение флуоресценции для чтения из ответ респираторный взрыв.
л = "Рисунок 2" FO: содержание-шир = "4.5in" Первоначально "/ files/ftp_upload/50667/50667fig2.jpg" />
Рисунок 2. Схема экспериментальной конструкции для серийной анализа дыхания. Индивидуальный dechorionated эмбрионы рыбок данио переносятся в лунки а микропланшет 96. Скважины, изложенные в белом содержат эмбрионы управления и колодцы, изложенные в черном содержат эмбрионы из экспериментальной группы. Дозирования решения H2DCFDA или H2DCFDA + PMA добавляются в соответствующие лунки (цветные оранжевый или красный, соответственно). Флуоресценции количественно с помощью микропланшет-ридера. Данные анализа дыхательного взрыва затем анализируется, по сравнению, и представлены. В таблице на этой фигуре является подмножеством нормированных значений флуоресценции, отображаемых в таблице 2. График на рисунке включает в себя средства, стандартные отклонения и р-значение для всего набора данных, представленных в этой рукописи, которая также отображается в таблице 2. * Р = 2 X 10 - 9.
Таблица 1. Сырье значения флуоресценции от не-индуцированной (оранжевый фон) и индуцированной (красный фон) 48 или 72 часа после оплодотворения (ФВЧ) эмбрионы рыбок данио (белый или черный числа, соответственно) на 4 ч после добавления PMA. Среднее рассчитывается для не-индуцированных образцов.
48 HPF эмбрионы | 72 HPF эмбрионы | ||||
408 | 326 | 358 | 92 | 83 | 208 |
276 | 381 | 1124 | 473 | 106 | 86 |
518 | 180 | 1085 | 110 | 93 | 109 |
1196 | 232 | 380 | 143 | 152 | 81 |
1416 | 339 | 735 | 123 | 85 | 81 |
489 | 390 | 347 | 110 | 98 | 118 |
2139 | 1183 | 1015 | 95 | 97 | 2609 |
1660 | 385 | 1630 | 111 | 115 | 136 |
Означать | 758 | 230 | |||
48 HPF embroys + РМА | 72 HPF эмбрионы + РМА | ||||
4713 | 2868 | 5144 | 3051 | 4868 | 4880 |
2978 | 4768 | 1998 | 5662 | 6144 | 4635 |
4460 | 3733 | 2984 | 7052 | 4429 | 6672 |
4026 | 3978 | 3311 | 4848 | 8489 | 6154 |
3169 | 5024 | 3543 | 5783 | 5621 | 5504 |
3742 | 2970 | 4628 | 6765 | 6016 | 5958 |
3728 | 3711 | 4637 | 5678 | 7638 | 5831 |
2525 | 4232 | 4288 | 3272 | 6123 | 8735 |
Таблица 2. Нормализация и статистическое сравнение данных. Чтобы получить нормированные значения флуоресценции, вычислить разницу между каждой PMA-индуцированной флуоресценции значения и соответствующего среднего значения не-индуцированной. Статистически сравнить эти два набора данных помощью непарного т-теста. Рассчитать средние и стандартные отклонения. Дисплей средства, стандартные отклонения и п-значение (я) в графическом виде (как показано на рисунке 2).
Основная функция фагоцитов является выявление, поглотить, а уничтожить болезнетворные микроорганизмы. Способность фагоцитов производить адекватную респираторный взрыв имеет решающее значение для этой функции. Таким образом, количественная оценка ответ респираторный взрыв является одним из методов, чтобы позволить сравнение общей врожденной иммунной здоровья и функции между группами лиц и / или в ответ на экспериментальных манипуляций. Здесь мы опишем протокол индуцировать, количественно и сравнить реакцию дыхательного взрыва между группами отдельных эмбрионов рыбок данио. Короче говоря, PMA приводит к получению АФК с помощью фермента NADPH-оксидаза. Эти ROS действовать на не-флуоресцентным красителем и окислять его, чтобы сформировать флуоресцентное соединение. Микропланшет-ридера используется для обнаружения относительную флуоресценцию в каждую лунку. Флуоресценции генерируется при индукции PMA свидетельствует о дыхательных потенциала на разрыв и общего врожденной иммунной здоровья эмбрионов данио рерио. Сравнение нормализованного уровня флуоресценциилюминесценции между PMA индуцированных групп, использующих непарный т-тест может быть использован для определения, есть ли существенная разница в пакетном потенциала дыхательных между группами рыбок данио. Экспериментальные манипуляции, приводящие к существенным различиям в ответ респираторный взрыв помогут прояснить механизмы врожденного иммунитета, например генных продуктов, необходимых для дыхательного взрыва фагоцитов, препаратов, которые потенцируют или антагонистами ответ респираторный взрыв.
Протоколы для анализа различных аспектов врожденной иммунной реакции в модели данио были разработаны (см. введение). Относительно немногие из этих методов измерения производство АФК. Методика подробно в этой статье количественно производство АФК у эмбрионов данио рерио после стимуляции врожденного иммунного ответа с PMA. Эта методика аналогична респираторных анализах пакетных выполненных на изолированных образцах цельной крови, в которых PMA также используется для промсе ответа респираторный взрыв, а затем ROS генерируются оцениваются при помощи флюорогенного субстрата (например, Phagoburst, ORPEGEN Pharma). Описанный здесь метод может быть использован с целых эмбрионов данио рерио, а также рассеченных почек от взрослых данио 13, как данио рерио переднего почки аналогичен костного мозга человека, которая является участком взрослого гемопоэза 19. Метод, описанный здесь также достаточно универсален для использования с другими видами рыб и клеточных системах, таких как сотовые препаратов из толстоголов почек 20.
Альтернативный метод для обнаружения ROS в целых эмбрионов данио использует в естественных условиях датчика перекиси водорода в. РНК для окислительно-восстановительного чувствительных флуоресцентного белка инжектируют в эмбрионов данио рерио и отношение флуоресценции контролируют с течением времени после поражающего киле 21. Это генетически закодированы датчик окислительно-восстановительный позволяет визуализацию временного иПространственная динамика производства перекиси водорода в естественных условиях. Применение этого метода показало удивительный результат, что перекись водорода производится первоначально предшествует прибытие первых врожденных иммунных клеток, предполагая, что перекись водорода, выпущенный раненых эпителиальных клеток выступает в качестве сигнала набирать фагоциты 21. Этот метод, в то время как мощный и информативный, включает в себя много времени и технически сложные эмбриологические и микроскопии процедуры. Этот датчик окислительно-восстановительного также специфичны для перекиси водорода, который является только одним из многих ROS, функционирующих в течение врожденной иммунной реакции.
По сравнению с подходом, описанного выше, наш метод также измеряет в естественных ROS, и все же технически менее требовательны и использует химические чтобы вызвать врожденную иммунную реакцию, а не физическим раны. В отличие от указанного выше способа, который специфически измеряет производства перекиси водорода, наша процедура измеряетОбщий уровень АФК. Преимущество обнаружения одного ROS в том, что роли для только этого соединения в врожденного иммунитета может быть выяснены. По аналогии с методом говорилось выше, наш подход также разделяет свои преимущества и недостатки выполняется на животное в целом. Взаимодействия между фагоцитов и их окружения, которые устранены, когда респираторный взрыв анализы выполняются на отдельных образцах крови, сохранились в этих целых анализов животных. Тем не менее, использование целого животного, вероятно, приводит к обнаружению АФК от источников, не связанных фагоцитов (например, митохондрии, полученных АФК, nonphagocyte NADPH оксидазы). В попытке решить специфику нашего метода для обнаружения фагоцитов, полученных АФК, мы ссылались на исследования, в котором это респираторный взрыв был выполнен анализ у эмбрионов данио рерио хватает фагоцитов конкретных NADPH оксидазы 9. Фагоцитоза конкретных НАДФН оксидазы ингибировалось через морфолинозамещенной опосредованной сбить из p47phox или p91pHox белка. В эмбрионов данио рерио, на стадии развития анализируемой, выражение этих НАДФН оксидазы субъединиц ограничивается подмножества клеток крови, вероятно, макрофагов 22,23. Респираторный взрыв потенциал эмбрионов, лишенных фагоцитов конкретных NADPH оксидазы был примерно треть, что из управления 9 (личное общение, доктор Роберт Уилер). Данный результат показывает, что в то время как наша респираторный взрыв анализ делает обнаружить ROS из других источников, чем фагоцитов, большинство флуоресценции обнаруженного можно отнести к дыхательной взрыв через фагоцитарной NADPH-оксидаза. Далее специфичность этого анализа была продемонстрирована с использованием бис-indolylmaleimide я (BisI), фармакологическая ингибитор протеинкиназы С, чтобы предотвратить действие PMA, агониста протеинкиназы С, на НАДФН-оксидазы. Предварительная обработка PMA-индуцированных данио почек или эмбрионов с BisI привело уровней флуоресценции, подобных ООН-индуцированных управления 12. Идеальный дыханияворвался анализ будет в естественных условиях высокой пропускной анализ, где фагоцитов конкретных АФК может быть как количественно и визуализированы с течением времени. Пока это не возможно, быстрое природы и технических простота способа, описанного здесь обеспечивает полезную альтернативу.
Авторы не имеют ничего раскрывать.
Авторы хотели бы выразить признательность прошлые и нынешние члены лаборатории Ким, Марк Нилан для рыбок данио ухода и обслуживания, д-р Роберт Уилер за полезные обсуждения и обмена данными, и NIH гранты 3RO1GM087308-02S1 и 1P20RR024475-01A2 и Мэн сельскохозяйственных и лесных опытная станция (номер публикации 3303) для финансирования.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Instant Ocean Sea Salt | Instant Ocean | SS15-10 | |
H2DCFDA | Sigma Aldrich | 35845-1G | |
PMA | Fisher | BP6851 | |
DMSO | Sigma Aldrich | D2438-5X10ML | |
Tricaine S MS222 | Western Chemical | 100 grams | |
DMEM/F-12, No Phenol Red | Life Technologies | 11039-021 | |
Deep Petri Dishes | VWR | 89107-632 | |
Plastic Transfer Pipettes | Fisher | 13-711-7M | |
#5 Dumont Forceps | Electron Microscopy Sciences | 72700-D | |
1.7 ml Micro Centrifuge Tubes | Axygen | 10011-724 | |
15 ml Conical Centrifuge Tubes | VWR | 21008-918 | |
5 ml Serological Pipettes | Greiner Bio One | 606180 | |
Synergy 2 Multi-Mode Microplate Reader | BioTek | Contact BioTek | |
Black 96 Well Microplate | VWR | 82050-728 | |
25 ml Sterile Reservoirs | VistaLab | 3054-2003 | |
P200 Pipettor | Gilson | F123601 | |
Multichannel Pipettor | VWR | 89079-948 | |
Pipette Tips | VWR | 89079-478 |
Запросить разрешение на использование текста или рисунков этого JoVE статьи
Запросить разрешениеThis article has been published
Video Coming Soon
Авторские права © 2025 MyJoVE Corporation. Все права защищены