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このプロトコルは追跡による活力パラメーターと枯草菌胞子を低圧プラズマ治療後復活で DNA 修復プロセスの監視の関連性を評価するために必要な重要な連続した手順を示しています蛍光標識された DNA は、時間分解共焦点顕微鏡と走査電子顕微鏡でタンパク質を修復します。
プラズマ滅菌は、工業、医療、および宇宙飛行の目的の従来の殺菌法に有望な代替手段です。低圧プラズマ (LPP) 放電には、急速な微生物の不活化につながる活性種の広範なスペクトルが含まれています。効率と LPP による殺菌のメカニズムを研究、従来の滅菌手順に対する異常な抵抗のため試験生物枯草菌の胞子を使用します。B. 枯草菌胞子膜、二重誘導結合プラズマ反応器、走査型電子顕微鏡 (SEM) を用いて胞子形態の評価低圧プラズマによる滅菌処理の生産について述べると、発芽と生細胞顕微鏡検査によって胞子の副産物の分析。プラズマ種の主要なターゲットはゲノム物質 (DNA)、胞子復活時にプラズマ照射誘起 DNA 傷害の修復は生物の生存のため重要です。ここでは、胞子の発芽能力を研究および DNA の役割が追跡する蛍光標識 DNA 修復タンパク質 (RecA) 時間分解共焦点蛍光顕微鏡を用いた LPP 治療後胞子の発芽および伸長中に修復します。扱われ、未処理胞子膜の発芽の活性化し個々 の胞子の反応に従うことに時間をかけて倒立共焦点ライブセル顕微鏡で可視化します。我々 の観察が種子の発芽と手狭になったため胞子の割合 LPP 治療後 120 秒 RecA YFP (黄色蛍光タンパク質) 蛍光がいくつかの胞子でのみ検出され、すべてで開発された最小値に達する期間の依存を明らかにLPP 扱われる胞子のわずかな上昇と細胞は手狭になった。また、栄養の細菌のいくつかは LPP 扱われる胞子細胞質の増加を示したから派生し、溶解する傾向があった。個々 の胞子の分析記述されている方法は、胞子の発芽および伸長の他の側面に関する模範的な可能性があります。
宇宙開発の主要な目標は、生命と他の惑星や太陽系の衛星生体分子の署名の検索です。微生物の伝達や生体関連物質探査の重要な領域への地球の起源の開発と惑星火星、エウロパの1などの生命検出ミッションの整合性に影響を与える特定のリスクです。他の惑星、その衛星、小惑星、および他の天体への有人とロボット ミッションに厳格な規制を課すの空間研究委員会 (日本) によってを 1967 年に設立、惑星保護の国際ガイドラインと規制、クリーニングおよび地球の微生物の汚染を排除し、天体2の交差汚染を防止するために起動する宇宙船と重要なハードウェア コンポーネントの事前の滅菌。最後の 10 年間、非熱平衡プラズマ中のアプリケーションは、医学・栄養の研究だけでなく宇宙飛行アプリケーション3,4、5ワイドの注目を集めています。プラズマ滅菌は、機密にやさしい、熱に不安定な物質でありながら迅速かつ効率的な微生物不活化6を提供しています従来の滅菌法に有望な代替手段です。プラズマ放電には、フリーラジカル、荷電粒子、中立/励起原子、急速な微生物不活化3につながる uv (紫外線) と真空紫外 (VUV) スペクトルの光子などの反応剤の混合物が含まれています。本研究では枯草endospores ガラス試料の表面上に分散を不活化するのに二重低圧誘導結合プラズマ (DICP) ソース7,8によって生成された低圧プラズマを使用します。
家族同定のグラム陽性菌は土壌、堆積物、空気とクリーン ルーム設備、国際宇宙ステーションの9,10 など異常な環境の自然の生息地に広く分布します。 ,11。属細菌の最も明確な特徴は、栄養枯渇12などの不利な条件を生き残るために強い休眠 endospores (以下、胞子) を形成する能力です。胞子は、様々 なトリートメント、熱、紫外線、γ 線照射、乾燥、機械的な混乱、強力な酸化剤などの有害化学物質などの環境ストレスに植物細胞により一般的にはるかに耐性や(参照13,14の見直し) pH 変更エージェント微生物不活化手法の有効性をテストするための理想的なオブジェクトであるためです。ゲノム DNA は細菌15,16, プラズマ照射誘起 DNA 傷害の修復のプラズマ治療の主要な目標 (例えば DNA 二重鎖切断) 胞子に復活は細菌13の生存のために重要な 17。
したがって、我々 は次の個々 の胞子によって低圧アルゴン プラズマを用いた胞子の治療後胞子の発芽および伸長中に胞子の発芽能力と DNA 修復の役割を研究し、蛍光標識された DNA の発現を修復時間分解共焦点蛍光顕微鏡を用いたタンパク質 RecA。我々 は、再現性のあるテスト結果、殺菌用低圧プラズマを用いた胞子膜の処理、プラズマ処理胞子のための準備を達成するため単分子膜におけるB. 枯草菌芽胞の準備のステップバイ ステップの説明を与えるアクティブな DNA の監視と連携して個々 の胞子のレベルで走査型電子顕微鏡 (SEM) と生細胞顕微鏡による解析を用いた微細構造の評価は、プラズマ治療への反応で細胞内で発生するプロセスを修復します。
1枯草菌胞子生産と精製。
2. 試料エアロゾル堆積枯草菌の胞子の
注: 蓄積し胞子が重なる可能性があります治療中の遮蔽効果に最終的に偽造された不活性の結果します。、この問題を最小限に抑えるエアロゾルデ ポジション法テクニック20胞子サンプルを準備します。簡単に言えば、コンサートの流れの液体のスループットを調節する電気のタイマー制御高精度 2 物質ノズルは、キャリアガス (ここで N2) 加圧。窒素ガス流を用いたノズル吹出口から注入された液体サンプルを分散させます。
3. 低圧プラズマ処理
4. 回復と胞子の生存率の評価
5 ライブ携帯顕微鏡と胞子の発芽における DNA 修復過程の追跡
図 1: プラズマ処理胞子の生きているセルの共焦点蛍光顕微鏡の中に潜在的な問題が観察。(A, B)単色の高用量で胞子の発芽の抑制 (514 nm) レーザーの照明。(A) 概要 (3 ステッチ フレーム x 3)枯草(LAS72、RecA YFP) の胞子の発芽開始後 180 分。周辺地域 (= フレーム) が点灯していないに対し、途中でフレームが (514 nm、70% レーザ) レーザ光の高用量の 30 秒間隔で公開された (明視野チャネルおよび RecA YFP 蛍光; のマージされた画像の構造を注文35 mm プリント 500 μ m のグリッドが付いている皿をイメージングを使用してによって引き起こされる).(B) に示します 4 X では胞子に対し単色レーザー照明の高用量にさらされた胞子はないに発芽し、成長を示す点灯・非点灯の地域間のボーダーの拡大表示非照射領域は完全に明るい RecA YFP 蛍光 (緑の信号) を表現する生長する細菌に回復します。(C, D)汚染粒子で覆われた胞子または胞子 (矢印) の複数の層が基になる胞子をプラズマ処理による不活化から保護し、発芽、伸長 (「遮蔽」) を許可するようです。(C) 胞子が発芽のまたは (D) 開始後 60 s やイメージ 180 分のプラズマ治療 120 s 240 分後イメージとこの図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。
6. 走査型電子顕微鏡 (SEM)
7. データ解析
プラズマ処理による枯草生存胞子します。
B. 枯草菌芽胞のプラズマ処理が、プラズマ処置 (図 2) の持続期間の増加とともに生存率の低下をこの研究ショーで使用されます。RecAを表現するひずみの胞子-YFP 融合遺伝子は、遺伝子組み換えに細菌の生命力に大きな影響がないことを示す野生型株の胞子と同様生存曲線を示した。RecA 欠損株の胞子は、RecA 遺伝子の存在は活力のプラズマ誘起損失を低減していることを示す、野生型株の胞子と比較してプラズマ処理への高い感受性を示します。特に 15 のプラズマ処理を短い s (P <0.003) と 30 s (P < 0.004) 野生型と比較して RecA 欠損株と RecA YFP 株の活力の低下を引き起こします。90 後プラズマ処理、すべての株の活力の s は、約 3 桁減します。
図 2:枯草の生存は低圧アルゴン プラズマ治療後別系統から胞子します。生存 (プラズマ処理胞子/平均真空処理胞子の CFU の平均个; エラーバーは標準偏差を表す) は、プラズマ治療期間に対してプロットされます。PY79 (野生型; 閉じた円)、LAS72 (RecA YFP; 灰色の円) と LAS24 (ΔrecA; サークルを開く)。統計解析 PY79 間胞子の生存に有意差を認めなかった (RecA 未変更の状態) と LAS72 (RecA YFP 融合)。
SEM によるプラズマ処理による胞子の微細構造の解析
プラズマの形態学的影響のアイデアを得るため真空処理胞子 (コントロール) と比較するとプラズマ処理胞子の表面の形態を分析する使用した胞子は、走査電子顕微鏡 (SEM) の治療法。B. 枯草菌胞子の外側の表面は、常にすべての処理と未処理の胞子 (図 3) に表示されている特徴的な縦リッジのような構造を明らかにします。30 までプラズマ s 誘導コントロール (図 3A ~ C) と比較すると胞子の表面形態の大幅な変更がないです。詳細な胞子表面 (図 3D F) と小さな亀裂につながるプラズマ (60 240 秒) の期間を増やすと 120 または 240 s の扱われる胞子の亀裂を観察できます。小さな球が胞子の表面に発生するさらに、(120 s と 240 s トリートメント、図 3E, F)、コートからリリースされた材料によって引き起こされる皮質または内側からコア22。これらの球は全体の胞子をカバーし、静脈状構造に関する中間サーフェスに見つけることができます。
図 3: SEM の枯草(LAS72、RecA YFP) 胞子の散布ガラス coverslips 低圧プラズマ処理後。胞子のみ真空にさらされ、プラズマ (コントロール) に示すように(A).(B・F)増加する持続期間とプラズマ処理をした胞子 (15、30、60、120 と 240 s)。胞子のプラズマ処理した 60 s またはもはやコントロール胞子や胞子のプラズマ-扱われた 15 と 30 s の亀裂と亀裂 (白い矢印) は 120 または 240 s.のプラズマ処理による胞子の表面に表示されるよりも表面でより詳細な表示この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。
プラズマ処理による枯草の細胞の顕微鏡観察を住んでいる胞子
発芽能力と個々 の胞子の RecA YFP の表現を分析するために蛍光標識修復タンパク質 RecA (RecA YFP) を表現する枯草菌胞子を復活の生細胞顕微鏡検査を実行します。プラズマ処理に応答します。ここで、プラズマ処理による胞子 (図 4) 例えば遮蔽効果の可能性のある既知の問題に関しての植物状態に発芽、伸長、および進行に従う時間分解共焦点レーザー走査顕微鏡を使用したり、単色レーザー照射 (図 1) の高用量で発芽の抑制。真空のみ (コントロール、図 4A ~ C) にさらされる胞子は、胞子復活 (0 - 65 分、示されていない) の初期状態でほとんどの蛍光信号を します。おそらく、RecA YFP の蓄積のための蛍光強度の増加が ≥ 65 分で観測栄養細胞が形成され、最初のセルを分割する開始するとき。これらすべてのセルは、各セル内の少なくとも 1 つの位置に蓄積された蛍光信号を港します。ほぼすべての胞子 (98 ± 2%; 589 ± 14、n = 4) として扱われ真空コントロール発芽、個々 の細胞 (図 4B C) のではなく一定の長さの棒状細胞の形態を開発。15 扱われる胞子胞子真空コントロールと対照をなしてプラズマ s は既に 4% 未満 75 ± の減らされた発芽能力を示す (197 ± 8 胞子、n = 3、図 4D F)、プラズマ処理が休眠胞子の損傷を誘導することを示す発芽を防止します。さらに、手狭になったため細胞の形態はコントロールにおける細胞の形態とは異なるです。細胞成長に広く長い棒 (制御に比べてより長い) いずれか小さいままや胞子コートでスティック (図 4G-私)。また、最も細長い細胞が増加するセル サイズ (白い矢印ヘッド、図 4F) の溶解します。細胞内 RecA YFP の蛍光信号制御の細胞 (図 4C, F) の信号と比較して若干増加するようであるが、有意差が見られる (示されていない)。プラズマであった胞子処理 30 s 発芽まで 25 ± 6% (99 ± 4 胞子、n = 3) 栄養細胞が特に 15 後コントロール胞子、胞子と比較して成長の遅延とプラズマ処理の s。栄養細胞はむしろ小さく、棒状が、長さは異なります (図 4G-私)。すべてのサイズのセルがインキュベーション時間が長く 15 後にサンプル見られる中に溶解させます。 ただし、プラズマ処理の s。60 歳以降後 2 ± 2% 未満のプラズマ処理の s (8 ± 8 胞子、n = 3) の胞子が栄養細胞 (図 4J L) を形成することができます。90 のプラズマ処理されます胞子、120 または 240 s を分析するが、(表示されていません) RecA YFP の蛍光レベルでない突起または任意の変更を表示します。
図 4: 共焦点のレーザー スキャンB. 枯草菌胞子の細胞の顕微鏡をライブプラズマ処理と発芽開始後 RecA YFP を表現するひずみから。時間をかけて胞子が続いていた (30 1 つのイメージ s)、タイム ポイント 0、2、4 h 用の画像が表示されます。(A ~ C)胞子真空のみで治療しプラズマ (コントロール) ではなく発芽し栄養細胞 (B) に出て成長し、指数成長期 (C) を入力します。(D L)低圧アルゴン プラズマの異なる期間扱われる胞子表示コントロールの胞子と比較してその伸長に有意差 (詳細は本文を参照してください)。(D F) 15 の治療 (白い矢印の頭は最近によって植物細胞を表す)、(G-私) 30 s (黒矢印の頭小さかった植物細胞を可視化して胞子コートの棒) および (J L) 60 の施術後の 0 h、2 h と 4 h の胞子回復時間。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。
低温を使用して表面の殺菌、低圧プラズマは、電離放射線、化学物質による治療などではなく従来の滅菌手順に有望な代替手段 (例えばガスのように H2O2または酸化エチレン) または乾燥及び湿潤熱23。普通の滅菌方法ほとんど効果的な殺菌がオペレーターの潜在的なリスクを示し、治療材料に影響を与える知られています。低圧プラズマは紫外線の光子、電子、イオンなどのいくつかのコンポーネントの構成を使用して急速な同種生物の不活性化を提供していて、原子や分子 (例えばROS) を終了しました。したがって、LPP は、インプラント、電子楽器や複雑な 3 D 構造用熱可塑性ポリマーなど、耐熱・耐食性の敏感な材料に適用できます。本稿では、そのようなテスト システムのアプリケーションを示す、溶射枯草が単分子膜胞子20の詳細7の最近記述されていたある特定の低圧プラズマ炉で扱われます。プラズマ処理による胞子の顕微鏡明視野検査は、殺菌効率の全体的な見積もりを取得するための十分な可能性があります。ただし、低圧プラズマの機構と分子レベルで胞子不活性化の影響をターゲットに興味を持っております。蛍光を発する追跡顕微鏡との組み合わせでプラズマ処理による胞子のこの特定の分子応答の詳細に光を当てるし、私たちに低圧プラズマの基礎的不活性化のメカニズムに洞察力を与える可能性がありますすることできます。
ここでは、後個々 の胞子の発芽の開始を可能にする生細胞顕微鏡によるプラズマ処理効率と効果の解析に着目します。驚くことに、この特定のアプローチはセル数または CFU の測定による全体胞子人口の活性を測定することによって提供することはできません新しい結果のいくつかを明らかにします。まず第一に、胞子のプラズマ処理だけでなく容量に影響、副産物の用量依存的で、CFUs の決定もできない大きな棒は、しばしば開発栄養細胞の形態の生存率の測定から期待どおりに小さな細胞胞子の付着と共に適切な細胞分裂によるとフォームの隔壁に (15 プラズマ処理の s) または減らされた長さでセル (30 プラズマ処理の s)。期間の短縮と細胞の観察は、後の時点では正常な細胞の長さに回復を示さなかった。また、ライブ イメージング観測の後の段階での形態学的変化の細胞溶解を明らかに。つまり、プラズマ処理中に、胞子によって取得した損傷のみ、DNA 損傷のためにおそらく、胞子の活性化の後の段階で有効であること、発芽、伸長に使用される機械はよりプラズマ滅菌の方より堅牢です生長に必要な機械。驚くことに、RecA の DNA 修復タンパク質の発現と思われる低、ほとんど欠席胞子の RecA YFP 蛍光17の増加によって示されるように伸長、生長段階の間に成長します。ただし、ほとんどの細胞溶解または伸長後の 3 時間以上後特にバーストのために細胞活力を定量的に救出を手狭になったプラズマ処理による胞子のコントロールの胞子と比較してでもわずかに増加 RecA 式が助けないインキュベーション。この効果は、発芽胞子の時間経過イメージからライブ携帯ムービーを用いて可視化することができます。我々 は、寒天の薄いオーバーレイを使用して単分子膜の細胞が強制されている特定栽培条件によってこの効果は言うまでもないことを除外できません。
顕微鏡による生細胞分析の別の結果は胞子膜表面の粒子状汚染 (例えばダスト粒子、他の胞子) がプラズマの有害な影響から基になる胞子をシールドすることができます。このような場合でも、もはやプラズマ処理は効率的にようです。このような汚染は完全に避けることは困難なので、治療期間の延長と組み合わせてプラズマ治療中に惑星の回転を使用するなど、代替プラズマ治療戦略はテストする必要があります。SEM による分析では、胞子コート問題22,24にプラズマを介した効果の理論に沿ってであるプラズマ処理の期間の増加と穴があいていることを示します。長時間露光時間 (> 240 s) プラズマに可能性がありますも汚染粒子を穿孔したがって可能性があります損傷し、根本的な芽胞を不活化します。
胞子の発芽および伸長の生細胞顕微鏡検査の提案するプロトコルは、他の同様の研究に適してできます。寒天培地の薄層を持つ胞子をカバー異なる光学的平面に胞子を強制的に、横方向の動きを制限します。両方の効果は、胞子と手狭になったセルが選択された画像フレーム内でとどまることを保証します。同様のアプローチ25前に記載されているが、提供の方法よりも柔軟性は低く記載 (例えばスライド ガラス、coverslip またはペトリ皿) ほぼすべてのサンプルのキャリアを選択することができます。私たちの手で他の生長する細菌によって解析寒天被覆法を用いた生細胞の顕微鏡検査)。いずれの場合も、単色レーザー光の高用量は、完全に胞子の発芽を抑制することがわかったために、ライブセル イメージング、中に写真損傷の可能性のある影響を評価する注意の制御実験を行わなければなりません。、すなわち観測間隔を増やすことによって照明時間の短縮から離れてレーザー強度を削減および/または共焦点絞り (ピンホール) のオープニングでこの現象を防ぐことができます。
要約すると、溶射枯草モデルのプラズマ処理の効率化を研究するために使用される技術の中で胞子膜、顕微鏡による生細胞胞子復活中携帯電話イベントのユニークな洞察を提供し、可能性を提供しています蛍光標識蛋白質のダイナミクスを分析。また、特定のサンプルの準備、すなわち胞子の寒天の薄い層で覆いは生細胞顕微鏡検査によって他の微生物の画像のパラダイムである可能性があります。
利害の対立が宣言されていません。
著者はアンドレア ・ シュレーダーのビデオの撮影中に彼女の援助のためのこの仕事と Nikea ・ j ・ ウルリッヒの部分の間に彼女の優秀な技術的な支援をありがちましょう。枯草菌の彼の寛大な寄付のライル ・ A. シモンズに感謝したいと思います: LAS72 と LAS24。この仕事支えられて部分で補助金ドイツ研究振興協会 (DFG) Paketantrag (PlasmaDecon 朴 728) から PA (AW 7/3-1) に、RM (MO 2023/2-1) と DLR (F.M.F、原産地、r. m.) に Teilprogramm 475, Programm RF FuW DLR FuW Projekt ISS 生命を付与します。F.M.F. は、ヘルムホルツ協会 (ヘルムホルツ Gemeinschaft) (6 年の期間にわたって資金が供給されたケルン、ドイツでドイツ航空宇宙センター (DLR) でヘルムホルツ宇宙生命科学研究学校 (SpaceLife) の博士課程奨学金によって支えられました。グラント号VH-KO-300) 理事航空宇宙航空宇宙医学研究所など、DLR から追加の資金を受け取ったとします。本研究の結果はフェリックス ・ m. フックス博士論文の中に表示されます。
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Two substance nozzle (model 970-8) | Schlick | 14,404 | 230 V, 50 Hz, D 4.484/8, 0.8 mm bore diameter |
Luria Bertani Medium | Sigma Aldrich | 70122-100G | |
Tube connectors | Festo | n/a | G 1/8 |
Magnetvalve DO35-3/2NC-G018-230AC | Bosch Rexroth | 820005100 | |
PLN Polyamid tube | Festo | 558206 | d = 6 mm |
Glass slides | VWR | 48300-026 | |
Electric Timer 550-2-C | Gefran | F000074 | 220 V |
attofluor cell chamber | Menzel, Fisher Ref. | 3406816 | d=25 mm, round |
MgSO4*7 H2O | Sigma Aldrich | 13152 | |
Ca(NO3)2 | Sigma Aldrich | 202967 | |
MnCl2 * 4 H2O | Sigma Aldrich | 244589 | |
FeSO4 * 7H2O | AppliChem | 13446-34-9 | |
Glucose | Merck | 215422 | |
KCl | Sigma Aldrich | P9541-500G | |
Nutrient Broth (NB) | Merck | 105443 | |
Luria-Bertani (LB) | Merck | 110283 | |
96-wellplate | ThermoFisher | 243656 | |
Zeiss LSM 780, Axio Observer Z1 | Carl Zeiss Microscopy GmbH | n/a | |
Leo 1530 Gemini | Carl Zeiss Microscopy GmbH | n/a | |
ZEN 2 and ZEN lite 2012 (Software) | Carl Zeiss Microscopy GmbH | n/a | |
SigmaPlot, version 13.0 (Statistic software) | Systat GmbH, Erkrath, Germany | n/a | |
Attofluor cell chamber | Invitrogen | A7816 | |
µ-Dish 35 mm, high Grid-500 Glass Bottom | ibidi | 81168 |
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