Method Article
Here, a quadriceps muscle specimen is taken from an anaesthetized pig and mitochondria are isolated by differential centrifugation. Then, the respiratory rates of mitochondrial respiratory chain complexes I, II and IV are determined using high-resolution respirometry.
Mitochondria are involved in cellular energy metabolism and use oxygen to produce energy in the form of adenosine triphosphate (ATP). Differential centrifugation at low- and high-speed is commonly used to isolate mitochondria from tissues and cultured cells. Crude mitochondrial fractions obtained by differential centrifugation are used for respirometry measurements. The differential centrifugation technique is based on the separation of organelles according to their size and sedimentation velocity. The isolation of mitochondria is performed immediately after tissue harvesting. The tissue is immersed in an ice-cold homogenization medium, minced using scissors and homogenized in a glass homogenizer with a loose-fitting pestle. The differential centrifugation technique is efficient, fast and inexpensive and the mitochondria obtained by differential centrifugation are pure enough for respirometry assays. Some of the limitations and disadvantages of isolated mitochondria, based on differential centrifugation, are that the mitochondria can be damaged during the homogenization and isolation procedure and that large amounts of the tissue biopsy or cultured cells are required for the mitochondrial isolation.
ミトコンドリア生体エネルギーと呼吸容量は透過性細胞または繊維ではなく、また、単離されたミトコンドリアだけでなく研究することができます。本研究では、高解像度の呼吸計測測定のために分画遠心法を用いて、無傷の骨格筋のミトコンドリアを単離するためのプロトコルを説明します。
呼吸計測のための完全なミトコンドリアを単離するために、組織が均質化され、ミトコンドリアは、従来の分画遠心法により単離されます。遠心分離法は、組織ホモジネートの連続遠心分離(増速の直列)に基づいて差は最初、ほぼ70年前に1 Palladeおよび共同研究者によって導入されました。組織は、最初にハサミを使って細かく刻み、ゆったり乳棒でガラスホモジナイザーで機械的に均質化されます。その後、ホモジネートを低速と切れ目のない組織が含まれている得られたペレットを、携帯で遠心分離され、破片および核は破棄されます。その後、上清を高速で数回遠心分離し、ミトコンドリア富化画分が回収されます。ミトコンドリアを単離するための差動遠心分離法の利点は、ということです:ⅰ)メソッドは高速であり、ミトコンドリアは(呼吸実験は可能な限り迅速として行われるべきである)1〜1.5時間以内に単離することができます。 ⅱ)それは安価です。そしてiii)それは非常に効率的であり、微分遠心分離によって得られたミトコンドリアは、呼吸計測分析のために十分に純粋です。ミトコンドリアを単離するための差動遠心分離法の欠点は、ⅰ)ミトコンドリアが均質化中に損傷し、非結合を受ける可能性があることです。 ⅱ)他の細胞成分とミトコンドリアの汚染は()、さらに追加の遠心分離工程でミトコンドリアのペレットを洗浄することにより解決することができます。 ⅲ)差動遠心分離工程の間に、異なるミトコンドリア亜集団、 例えばを選択する可能性を、MIT下の密なとochondriaは7除外することができます。およびiv)ミトコンドリアの細胞周囲の不足しているとだけ理論的な最大の呼吸を測定することができます。呼吸計測分析のためにミトコンドリアを単離するための別の方法は、密度勾配遠心分離2です。この技術では、組織抽出物(遠心管の底部でのより高い密度を有する)スクロース溶液またはPercoll勾配の上に積層され、一定の速度で遠心分離し、ミトコンドリアが、それらに応じて、他の細胞成分から分離することを引き起こします密度。この方法は、多くの場合、シナプトソームから非常に低い汚染に脳ミトコンドリアを単離するために使用されます。しかしながら、密度勾配遠心分離によって単離されたラット肝ミトコンドリアは非常に他の細胞小器官3で汚染されています。この方法の制限の一つは、遠心分離管に存在するショ糖勾配がそう破裂かもしれないということです私ミトコンドリア(浸透圧ショック)。
組織の種類に応じ。差動遠心分離による無傷ミトコンドリアの単離のために考慮すべきいくつかの重要な要因があります。最初の必要性は穏やかな方法で組織を均質化することです。例えば、腎臓、脳や肝臓などの軟組織は、均質化の間に適用される穏やかな機械的な力を必要とします。これは、はるかに強い機械的な力を必要とし、心臓および骨格筋などの硬組織とは対照的です。細分化した組織は、通常、組織を柔らかくするために均質化前にプロテアーゼで処理されます。均質化および遠心分離の間に使用されるすべての緩衝液は、冷たい氷であると細胞質ゾル4、5と互換性のイオン性及び浸透強度と生理的に適切なpHを有していなければなりません。
分離されたミトコンドリアの生体エネルギーを研究する利点の一つは、細胞形質膜はpermeabiである必要はないということですこのようなミトコンドリア外膜の完全性を損なう可能性がありますジギトニンまたはサポニン4、6、などの界面活性剤とlized。単離ミトコンドリアの別の利点は、酸素消費量としてミトコンドリアの機能の分析を妨害し得る他のサイトゾル因子の欠如です。単離されたミトコンドリアを用いての欠点は、単離されたミトコンドリア7,8の良好な収率を得るために遠心分離工程中のあるミトコンドリアの集団の可能な選択、均質化の間にミトコンドリアの損傷、および生物学的サンプルの大量の要求です。
分離手順の後、ミトコンドリア複合体I、II-IV及び依存(状態2,3および4)の呼吸速度は、高解像度の呼吸計測を使用して決定されます。複合体I-駆動呼吸のために、グルタミン酸リンゴ酸は、アデノシン二リン酸(ADP)を加え、続いています。複合体II駆動型の呼吸のために、コハク酸は、ADPを添加し、続いています。複雑なIV-駆動呼吸については、アスコルビン酸及びtetramethylphenylendiamine(TMPD)はADP 9、10、11、12、続いて添加されます。状態2は、単独で、基質の存在下での酸素消費量を指します。状態3は、基板と、ADPの存在下での酸素消費量を指します。状態4は、ADPの枯渇後の酸素消費量を指します。呼吸調節比(RCR)は、酸素消費量のATP生産の結合の指標であり、状態3及び状態4 13、15との間の比として計算されます。
要約すると、我々は、差動遠心分離により、機能と無傷の骨格筋のミトコンドリアを単離し、これらの単離されたmitochonを使用するプロトコルを記述しますこのような高解像度の呼吸計測などの機能や生体エネルギー研究のためdria。
大腿四頭筋生検は、ミトコンドリアを分画遠心分離によって分離されて、そこから麻酔したブタから採取されます。豚は別の実験のために後で使用されます。研究は、実験動物の管理と使用のためにとベルン、スイスの動物ケア委員会の承認を得て国立衛生研究所のガイドラインに従って行われます。
1.骨格筋の均質化とミトコンドリアの単離
2.高解像度の呼吸計測
3.複合体I-依存呼吸
4.複合体II依存の呼吸
5.複合体IV依存の呼吸
6.チトクロームCテスト
複合体I-依存呼吸
単離されたミトコンドリア複合体I依存呼吸数(状態2、図3、図4)は、高解像度の呼吸計測( 図1、代表的な図)を用いて決定されます。ミトコンドリア複合体I基板、グルタミン酸とリンゴ酸は、ADPを加え、続いています。状態2は、単独で、基質の存在下での酸素消費量を指します。状態3は、基板と、ADPの存在下での酸素消費量を指します。状態4は、ADPの枯渇後の酸素消費量を指します。 RCRはATP生産に酸素消費の結合の指標であり、 図1に示すように、状態3及び状態4の間の比として計算される、ADPを添加すると、直ちにミトコンドリア呼吸速度が上昇する(状態3呼吸)、およびその後、非常にsのレベルに(状態4呼吸)を減少させますこれは、高RCRを示し、ミトコンドリアの完全性がよく分離手順中に保存される状態2の場合とimilar。 図2は、不適切と失敗ミトコンドリアの分離を示す、ハイ状態4呼吸速度と低い状態3呼吸速度とRCRの測定の代表的な図です。状態4で高い呼吸速度がミトコンドリアプロトン漏出15の指標です。
図1: 成功したミトコンドリアの単離:ミトコンドリアの完全性は十分に分離手順の間に保持されます。基材(複合体I-依存呼吸)としてグルタミン酸とリンゴ酸を使用した高解像度の呼吸計測からの追跡。青い線は、酸素濃度を表します。赤い線は、酸素流(酸素濃度の勾配)を表します。オキシ単離されたミトコンドリアが利用可能な酸素を使用するようGEN濃度が経時的に減少します。酸素消費量は、ピコモル/(SX mgのミトコンドリアタンパク質)として表されます。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
図2:失敗したミトコンドリアの単離:ミトコンドリアの整合性がよく、不適切なミトコンドリアの分離を示す単離手順の間に保持されません。基材(複合体I-依存呼吸)としてグルタミン酸とリンゴ酸を使用した高解像度の呼吸計測からの追跡。青い線は、酸素濃度を表します。赤い線は、酸素流(酸素濃度の勾配)を表します。単離されたミトコンドリアがご利用できますを使用するように酸素濃度が経時的に減少しますル酸素。酸素消費量は、ピコモル/(SX mgのミトコンドリアタンパク質)として表されます。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
複合体II依存性の呼吸
単離されたミトコンドリア複合体II依存性呼吸数(状態2、図3、図4)は、高解像度の呼吸計測( 図3、代表的な図)を用いて決定されます。このアッセイでは、ミトコンドリア複合体Iのロテノンの添加によって阻害され、その後コハク酸塩(複合体II基板)ADP、続いて添加されます。 図3は、すぐに、ADPを添加することは、ミトコンドリア呼吸の増加を示し、その後、状態2のものと非常に類似のレベルまで減少し、十分に結合されたミトコンドリアを示し、そのミトコンドリアの完全性は十分に分離手順の間に保持されます。この典型的な実験のために計算されたRCR値は、入手可能な文献10、11、23)に示す値とほぼ一致している、4.23です。 図4は、不適切な分離を示すハイ状態4呼吸速度と、低い状態3呼吸速度とRCRの測定の代表的な図です。
図3: 成功したミトコンドリアの単離:ミトコンドリアの完全性は十分に分離手順の間に保持されます。基板(複合体II-依存呼吸)としてコハク酸を用いて、高解像度の呼吸計測からの追跡。青い線は、酸素濃度を表します。赤い線は、酸素流量(の傾きを表し、酸素濃度)。単離されたミトコンドリアが利用可能な酸素を使用するように酸素濃度が経時的に減少します。酸素消費量は、ピコモル/(SX mgのミトコンドリアタンパク質)として表されます。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
図4: 失敗したミトコンドリアの単離:ミトコンドリアの整合性がよく、不適切な分離を示す単離手順の間に保持されません。基板(複合体II-依存呼吸)としてコハク酸を用いて、高解像度の呼吸計測からの追跡。青い線は、酸素濃度を表します。赤い線は、酸素流(酸素濃度の勾配)を表します。酸素濃度は、単離されたmitocとして経時的に減少しますhondriaは、利用可能な酸素を使用します。酸素消費量は、ピコモル/(SX mgのミトコンドリアタンパク質)として表されます。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
複合体IV依存の呼吸
単離されたミトコンドリア複合体IVに依存する呼吸数(状態2、3)は、高解像度の呼吸計測( 図5、代表図)を用いて決定されます。このアッセイのためにアスコルビン酸/ TMPDおよびADPは、複雑なIVを阻害するアジ化ナトリウム、続いて添加されます。
アジ化ナトリウムを添加する前と後の酸素消費量との差は、実際の複雑なIV呼吸として解釈されます。 図5は measurの代表的な図です。ミトコンドリアの完全性がよく分離手順中に保持されていることを示す高複雑なIV-依存状態3呼吸速度のement。対照的に、 図6は、不適切な分離を示すロー状態3の測定の代表的な図です。
図5: 成功したミトコンドリアの単離:ミトコンドリアの完全性は十分に分離手順の間に保持されます。基板(複雑なIV-依存呼吸)としてアスコルビン酸/ TMPDを使用して、高解像度の呼吸計測からの追跡。複合体IV呼吸(状態3)のアジ化ナトリウムを添加する前と後の酸素消費量を減算することによって解釈されます。青い線は、酸素濃度を表します。赤い線は、酸素流(酸素濃度の勾配)を表します。酸素濃度は、単離されたmitochoとして経時的に減少します利用可能な酸素を使用ndria。酸素消費量は、ピコモル/(SX mgのミトコンドリアタンパク質)として表されます。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
図6: 失敗したミトコンドリアの単離:ミトコンドリアの整合性がよく、不適切な分離を示す単離手順の間に保持されません。基板(複雑なIV-依存呼吸)としてアスコルビン酸/ TMPDを使用して、高解像度の呼吸計測からの追跡。複合体IV呼吸(状態3)のアジ化ナトリウムを添加する前と後の酸素消費量を減算することによって解釈されます。青い線は、酸素濃度を表します。赤い線は、酸素流(酸素濃度の勾配)を表します。酸素conce単離されたミトコンドリアが利用可能な酸素を使用するようntrationは、時間の経過とともに減少します。酸素消費量は、ピコモル/(SX mgのミトコンドリアタンパク質)として表されます。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
シトクロムcを用いて、ミトコンドリア外膜の完全性の評価
ミトコンドリア調製物の品質を評価するために、シトクロムc試験をグルタミン酸とリンゴ酸のその後の添加後にミトコンドリア呼吸を測定することによって、ミトコンドリア外膜の完全性を決定するために実行され、ADPおよびシトクロムc(ADPは、複雑なII依存状態3呼吸を刺激しましたシトクロムcの存在)。 図7に示すように、シトクロムcは、複素I依存状態3再増強しません単離ミトコンドリアのspiration、そこミトコンドリア外膜からシトクロムcの損失をしなかったし、ミトコンドリアの完全性が維持されていることを示します。
図 7: シトクロムcは、単離された ミトコンドリア の呼吸を増強しない : ミトコンドリアの完全性は十分に分離手順の間に保持されます。基板(複合体I-依存呼吸)としてグルタミン酸/リンゴ酸を使用した高解像度の呼吸計測からの追跡。青い線は、酸素濃度を表します。赤い線は、酸素流(酸素濃度の勾配)を表します。単離されたミトコンドリアが利用可能な酸素を使用するように酸素濃度が経時的に減少します。酸素消費量は、ピコモル/(SX mgのミトコンドリアタンパク質)として表されます。メートル/ファイル/ ftp_upload / 55251 / 55251fig7large.jpg "ターゲット=" _空白"> この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
ミトコンドリア分離バッファ | |
化学物質 | 濃度 |
塩化カリウム | 100 mMの |
硫酸マグネシウム | 10 mMの |
モルホリノスルホン酸(MOPS) | 50 mMの |
エチレンジ酢酸(EGTA) | 1.0 mMの |
ATP | 1.1 mMの |
pHが7.4 | |
ミトコンドリアの洗浄緩衝液 | |
化学物質 | 濃度 |
塩化カリウム | 100 mMの |
MOPS | 50 mMの |
EGTA | 0.5 mMの |
pHが7.4 | |
ミトコンドリア呼吸バッファ 16 | |
化学物質 | 濃度 |
スクロース | 110 mMの |
EGTA | 0.5 mMの |
MgCl 2 | 3.0 mMの |
塩化カリウム | 80 mMの |
K-ラクトビオン | 60 mMの |
KH 2 PO 4 | 10 mMの |
タウリン | 20 mMの |
ヘペス | 20 mMの |
BSA | 1.0g / L |
pHは7.1 |
表1:緩衝液の組成物。
本研究において、我々は、無傷でしっかりこのような高解像度の呼吸計測等の機能的研究のために使用することができる差動遠心分離によって骨格筋のミトコンドリアを結合、高品質を単離するためのプロトコルを説明します。
無傷と密結合ミトコンドリアを単離するために、本プロトコル内で考慮すべきいくつかの重要なポイントがあります。骨格組織を採取した後、直ちに氷冷したミトコンドリアの単離緩衝液中に浸漬する必要があります。全ての遠心操作は4℃で行われるべきであり、ミトコンドリア懸濁液は、単離の間に氷の上に常に保たれるべきです。単離手順は、可能な限り迅速に行われるべきです。ホモジネートは、クリーン界面活性剤を含まない遠心管中で遠心分離されるべきです。手順の終わりに、ミトコンドリア懸濁液を濃縮保たれるべきであり、呼吸計測直前に希釈します。呼吸計測データは、第二のPEあたりピコモルとして表されているのでミトコンドリアタンパク質のRミリグラム、正確に分離した後、ミトコンドリアタンパク質の濃度を測定するために良好な技術を使用することが重要です。
いくつかのミトコンドリアの単離手順では、ミトコンドリアが非結合であるか、または高解像度の呼吸計測を使用して適切に酸素を消費しないことが起こるかもしれません。これらの問題を克服するために、組織は常にゆったり乳棒(ステップ1.12)でホモジナイザーを用いて同様(ストロークの数が同じ)で均質化されるべきです。ここで、我々は常に10ストロークで自動化されたホモジナイザーを用いて骨格筋組織を均質化。ストローク数が多いほど、ミトコンドリアを損傷し、切り離すことができます。手動で(および主観)ガラスホモジナイザーでホモジナイズした組織試料は、単離されたミトコンドリアの異なる品質を生成することができます。ミトコンドリアの凍結することも、非結合ミトコンドリアになることがあり、もう一方は遠心分離がなく、このテの下に4°Cで行われていることを確認する必要がありますmperature。緩衝溶液のpHが間違っているか、遠心分離管がきれいでない場合はミトコンドリアの完全性は、同様に損なわれる可能性があります。一つは、遠心分離管が界面活性剤を含まない、適切に洗浄されていることを確認する必要があります。
分離時に考慮すべき最初の重要な要因の一つは、穏やかな方法で組織を均質化することです。硬組織は、はるかに強い機械的な力を必要とするのに対し、軟組織は、均質化の間に適用される穏やかな機械的な力を必要とします。均質化および遠心分離の際に使用される緩衝液は、冷たい氷であると細胞質ゾルと互換性のイオン性及び浸透強度と生理的に適切なpHを有していなければなりません。例えば、骨格筋などの硬組織のために、機械的な均質化の後、トリプシンなどのプロテアーゼは、組織4,5を脱凝集するために添加することができます。
Dに基づいて、単離ミトコンドリアのいくつかの制限、ifferential遠心私は均質化中の特定のミトコンドリアの電子伝達鎖複合体のサブユニットでⅲ)損失の可能性や変更、ミトコンドリアの単離のために必要な組織標本のii)の大量、均質化および単離手順19の間に)可能性が損傷したミトコンドリアであり、遠心分離は、18ステップ 、およびiv)ミトコンドリア機能18と干渉することができる均質化および遠心分離工程の間、反応性酸素種の産生の増加します。ダウンス均質化および分画遠心法の利点は、密度勾配遠心分離20として既存の方法に対して呼吸実験のために、粗ミトコンドリアを単離する方法は迅速であり、ミトコンドリアを短時間で分離されていることです。したがって、呼吸の実験は、1内で実行することができます時間。また、手順は非常に効率的で、安価であり、分画遠心分離によって得られたミトコンドリアは、呼吸計測分析のために使用することができます。単離ミトコンドリアを用いたミトコンドリア酸素消費の調査は、透過性繊維や細胞に比べていくつかの利点を提供しています:ミトコンドリア機能と生体エネルギーを妨げる可能性がサイトゾルタンパク質との有意な干渉を。携帯透過性は必要ありません。ミトコンドリア呼吸鎖複合体の基質は、単離されたミトコンドリアに直接添加することができます。
骨格筋ミトコンドリア呼吸を測定するための別の方法の一つは、使用は、筋線維9を透過性です。単離ミトコンドリアを超える透過性筋線維の利点のいくつかされているi)は、機械的均質化工程が必要でないと、ⅱ)組織(数mg)の非常に少量が呼吸計測アッセイのために必要とされます。 Pの欠点ermeabilized筋肉の繊維が繊維束中のミトコンドリアに低い酸素拡散です。この拡散制限は、呼吸計測アッセイ中のADPのより大きな金額を必要とします。他の代替方法は、非常に迅速な方法であり、ミトコンドリアを単離するための差動遠心分離工程を必要としない、全組織ホモジネート22、の使用です。全組織ホモジネートの使用は、それらの単離の間にいくつかのミトコンドリアの損失を防止することができるが、このような酸素消費量としてミトコンドリアの機能の分析を妨害する可能性が存在する他のサイトゾル因子が存在してもよいです。
呼吸アッセイのために、粗ミトコンドリアを単離するために、差動遠心分離を習得した後、将来のアプリケーションは、ミトコンドリア外膜抗TOM22(ミトコンドリア外膜22ホモログのカーゼ)抗体couplを使用するなど、新興技術により単離されたミトコンドリアの呼吸能力を調査することですエド磁気ビーズ21。
The authors have nothing to disclose.
This study was supported by the Swiss National Science Foundation (Grant 32003B_127619).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
ADP | Sigma | A 4386 | Chemical |
Antimycin A | Sigma | A 8674 | Chemical, dissolve in ethanol |
Ascorbate | Merck | 1.00127 | Chemical |
ATP | Sigma | A 7699 | Chemical |
BSA | Sigma | A 6003 | Chemical |
EGTA | fluka | 3779 | Chemical |
Glutamate | Sigma, | G 1626 | Chemical |
Hepes | Sigma | H 7523 | Chemical |
KCl | Merck | 1.04936 | Chemical |
KH2PO4 | Merck | 1.04873 | Chemical |
K-lactobionate | Sigma | L 2398 | Chemical |
MgCl2 | Sigma | M 9272 | Chemical |
Morpholinopropane sulphonic acid (MOPS) | Merck | 1.06129 | Chemical |
O2k-Core: Oxygraph-2k | Oroboros Instruments | 10000-02 | High-resolution respirometry instrument |
Proteinase, bacterial | Sigma | P 8038 | Chemical |
Sodium azide | Sigma | S2002 | Chemical |
Rotenone | Sigma | R 8875 | Chemical, dissolve in ethanol |
Succinate | Sigma | S 2378 | Chemical |
Schuett homogen-plus semiautomatic homogeniser | schuett-biotec GmbH | 3.201 011 | Tissue homogenizer |
Taurine | Sigma | T 8691 | Chemical |
TMPD | Sigma | T 3134 | Chemical |
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