Method Article
Here, a quadriceps muscle specimen is taken from an anaesthetized pig and mitochondria are isolated by differential centrifugation. Then, the respiratory rates of mitochondrial respiratory chain complexes I, II and IV are determined using high-resolution respirometry.
Mitochondria are involved in cellular energy metabolism and use oxygen to produce energy in the form of adenosine triphosphate (ATP). Differential centrifugation at low- and high-speed is commonly used to isolate mitochondria from tissues and cultured cells. Crude mitochondrial fractions obtained by differential centrifugation are used for respirometry measurements. The differential centrifugation technique is based on the separation of organelles according to their size and sedimentation velocity. The isolation of mitochondria is performed immediately after tissue harvesting. The tissue is immersed in an ice-cold homogenization medium, minced using scissors and homogenized in a glass homogenizer with a loose-fitting pestle. The differential centrifugation technique is efficient, fast and inexpensive and the mitochondria obtained by differential centrifugation are pure enough for respirometry assays. Some of the limitations and disadvantages of isolated mitochondria, based on differential centrifugation, are that the mitochondria can be damaged during the homogenization and isolation procedure and that large amounts of the tissue biopsy or cultured cells are required for the mitochondrial isolation.
线粒体生物能量学和呼吸能力不仅可以在透化的细胞或纤维,而且在分离线粒体进行研究。在本研究中,我们描述了一个协议,使用隔离差速离心高分辨率呼吸测量测量完整骨骼肌线粒体。
为了分离完整的线粒体为呼吸测量,组织是均质和线粒体通过常规差速离心法分离。的差速离心的方法是基于连续的离心(在一系列增加速度的)组织匀浆首先由Pallade引入和同事近70年前1。将组织用剪刀第一切碎并在玻璃匀浆用宽松杵机械匀化。之后将匀浆在低速和包含完整的组织中得到的沉淀,细胞离心碎片和细胞核被丢弃。然后,将上清液在高速离心几次和线粒体富集馏分被收集。的差速离心方法的优点来分离线粒体是:i)该方法是快速的和线粒体可以1-1.5小时内(呼吸实验应尽可能快地进行)来分离; ii)其是便宜;和iii)它是非常有效的,并通过差速离心获得的线粒体是呼吸测量测定足够纯的。差速离心方法的缺点以分离线粒体是ⅰ)线粒体可能损坏和均化过程中脱开; ii)与其它细胞组分线粒体(的污染可能由进一步洗涤线粒体沉淀用另外的离心步骤)来解决; iii)选择不同的线粒体亚群, 例如 ,在差分离心步骤的可能性,麻省理工学院ochondria较低致密可以排除7;和iv)线粒体细胞周围缺少和仅理论最大呼吸可以被测量。分离线粒体为呼吸测量测定法的另一种方法是在密度梯度离心2。在该技术中,组织提取物层叠在蔗糖或Percoll密度梯度(具有较高密度在离心管的底部)中的溶液,并在一定的速度离心,使线粒体根据从其他细胞组分中分离出来的密度。这种方法经常被用于脑线粒体与来自突触体非常低的污染隔离。然而,通过密度梯度离心分离大鼠肝线粒体是高度污染的其他细胞器3。这种方法的局限性是,存在于离心管中的蔗糖梯度可能破裂,以便我线粒体(渗透冲击)。
根据组织的类型;还有要考虑完整的线粒体通过差速离心分离有些重要的因素。首先需要在一个温和的方式来组织均匀。软组织,如肾,脑和肝需要均化期间施加温和的机械力。与此相反,硬组织如需要更强的机械力心肌和骨骼肌。组织糜通常与蛋白酶的同质软化组织之前处理。均化和离心分离期间使用的所有缓冲液应该是冰冷的,并有一个生理相关pH与胞浆4,5兼容离子和渗透强度。
一项研究中分离线粒体生物能量学的一个优点是,蜂窝质膜不需要是permeabilized用洗涤剂如毛地黄皂苷或皂苷4,6,这可能会危及线粒体外膜的完整性。分离的线粒体的另一个优点是不存在的其他胞质因子,这可能与线粒体功能,如氧消耗干扰分析。使用分离的线粒体的缺点是某些线粒体种群在离心步骤的可能的选择,均化过程中损坏线粒体,并且为了获得分离的线粒体7,8的良好产率的高量生物样品的要求。
分离过程后,线粒体复合物的呼吸速率I-,II-和IV依赖性(状态2,3和4)使用高分辨率呼吸测量确定的。对于复杂的I-驱动的呼吸,谷氨酸和苹果酸中,随后加入二磷酸腺苷(ADP)。对于复杂的Ⅱ-驱动呼吸,琥珀酸盐,然后加入由ADP。为复合物IV驱动呼吸,抗坏血酸和tetramethylphenylendiamine(TMPD)接着加入ADP 9,10,11,12。状态2是指氧消耗在单独基板的存在。状态3是指氧消耗在衬底和ADP的存在。国家4指的耗氧量ADP耗尽后。的呼吸控制率(RCR)是氧消耗ATP产生的耦合的索引,并且被计算为状态3和状态4 13,15之间的比率。
总之,我们描述了一种协议通过差速离心分离功能和完整的骨骼肌线粒体和使用这些分离mitochondria用于功能和生物能量研究,例如高分辨率呼吸测量。
股四头肌肌肉活检是从麻醉的猪,从线粒体通过差速离心分离出服用。猪是后来用于另一个实验。这项研究是根据健康指引全国学院为照顾和使用实验动物,并与广州瑞士伯尔尼的动物保健委员会批准执行。
1.骨骼肌同质化和线粒体隔离
2.高分辨率呼吸测量
3.复杂我依赖呼吸
4.复合物II依赖呼吸
5.复合物IV依赖呼吸
6.细胞色素C测试
复杂的I-依赖呼吸
分离的线粒体复合物I依赖呼吸速率(状态2,3和4)使用高分辨率呼吸测量( 图1,一个代表性的图表)来确定。线粒体复合物I底物,谷氨酸和苹果酸盐,接着加入加入的ADP。状态2是指氧的消耗,仅在基片的存在。状态3是指氧消耗在衬底和ADP的存在。国家4指的耗氧量ADP耗尽后。 RCR是氧气消耗对ATP产生的耦合的索引,并且被计算为状态3和状态4之间的比率。 如图1所示,在加入ADP,线粒体呼吸速率增加立即(状态3呼吸)的,并然后下降(状态4呼吸)的水平非常小号imilar到该状态2.这表明高RCR和线粒体完整性隔离过程中保存完好。 图2是低态3呼吸速率和RCR的测量的代表图,具有很高的状态4呼吸速率,指示不恰当的和不成功的线粒体隔离。在国家4A高呼吸速率是线粒体质子泄漏15的指标。
图1: 成功线粒体隔离:线粒体完整性分离过程中保存完好。使用谷氨酸和苹果酸作为底物(络合物I依赖呼吸)从高分辨率呼吸测量描。蓝线代表氧气浓度。红线代表氧流量(氧气浓度的斜率)。该氧作为孤立的线粒体使用可用的氧气随着时间的推移根浓度降低。氧消耗表示为皮摩尔/(SX毫克线粒体蛋白)。 请点击此处查看该图的放大版本。
图2:不成功线粒体隔离:线粒体完整性指示不当线粒体隔离的隔离过程中不保存完好。使用谷氨酸和苹果酸作为底物(络合物I依赖呼吸)从高分辨率呼吸测量描。蓝线代表氧气浓度。红线代表氧流量(氧气浓度的斜率)。中的氧浓度随着时间的推移而减小作为分离线粒体使用availab乐氧气。氧消耗表示为皮摩尔/(SX毫克线粒体蛋白)。 请点击此处查看该图的放大版本。
复合物II依赖呼吸
分离的线粒体复合物II依赖呼吸速率(状态2,3和4)使用高分辨率呼吸测量( 图3中 ,代表图)测定的。对于该测定法,线粒体复合物I通过加入鱼藤酮的抑制,然后琥珀酸酯(复合体II衬底),然后加入由ADP。 图3表明,在加入ADP的,紧接在线粒体呼吸的增加,然后降低到水平非常相似,状态2,表明良好的耦合线粒体和线粒体完整性分离过程中保存完好。这个典型的实验中所计算的RCR值是4.23,这与在现有的文献10,11,23)中所示的值接近一致。 图4是一个低状态3呼吸速率和RCR的测量的代表图,与表示不适当隔离高状态4呼吸速率。
图3: 成功线粒体隔离:线粒体完整性分离过程中保存完好。使用琥珀酸盐作为底物(复合体II依赖呼吸)高分辨率呼吸测量描。蓝线代表氧气浓度。红线代表氧流量(的斜率氧浓度)。作为分离线粒体使用可用氧气随时间的氧浓度降低。氧消耗表示为皮摩尔/(SX毫克线粒体蛋白)。 请点击此处查看该图的放大版本。
图4: 不成功线粒体隔离:线粒体完整性指示不合适隔离分离过程期间不保存完好。使用琥珀酸盐作为底物(复合体II依赖呼吸)高分辨率呼吸测量描。蓝线代表氧气浓度。红线代表氧流量(氧气浓度的斜率)。中的氧浓度随着时间的推移孤立mitoc减小hondria使用可用的氧。氧消耗表示为皮摩尔/(SX毫克线粒体蛋白)。 请点击此处查看该图的放大版本。
复合物IV依赖呼吸
分离的线粒体复合物IV依赖性呼吸速率(状态2,3)使用高分辨率呼吸测量( 图5,一个代表图)来确定。对于该测定抗坏血酸/ TMPD和ADP添加,随后叠氮化钠来抑制复合物IV。
之前和加入叠氮化钠后氧耗之间的差值被解释为真实复合物IV呼吸。 图5是测量电的代表图高复合物IV相关状态3呼吸,表明线粒体完整性隔离过程中保存完好率键相。与此相反, 图6是表示不适当隔离低状态3的测量的代表图。
图5: 成功线粒体隔离:线粒体完整性分离过程中保存完好。使用抗坏血酸盐/ TMPD作为底物(复合物IV依赖性呼吸)高分辨率呼吸测量描。复合物IV呼吸(状态3)由前和加入叠氮化钠后减去耗氧解释。蓝线代表氧气浓度。红线代表氧流量(氧气浓度的斜率)。中的氧浓度随着时间的推移孤立mitocho减小ndria使用可用的氧。氧消耗表示为皮摩尔/(SX毫克线粒体蛋白)。 请点击此处查看该图的放大版本。
图6: 不成功线粒体隔离:线粒体完整性指示不当隔离隔离过程中不保存完好。使用抗坏血酸盐/ TMPD作为底物(复合物IV依赖性呼吸)高分辨率呼吸测量描。复合物IV呼吸(状态3)由前和加入叠氮化钠后减去耗氧解释。蓝线代表氧气浓度。红线代表氧流量(氧气浓度的斜率)。氧concentration作为分离线粒体使用可用氧气随时间降低。氧消耗表示为皮摩尔/(SX毫克线粒体蛋白)。 请点击此处查看该图的放大版本。
使用细胞色素C线粒体外膜的完整性的评价
以评估线粒体制剂的质量,进行色素c测试以确定随后加入谷氨酸和苹果酸盐,ADP和细胞色素C的后线粒体外膜的完整性,通过线粒体呼吸测量(ADP刺激复合物II依赖性状态3呼吸中色素c的存在下)。 如图7中所示,细胞色素C不增强复合物I相关状态3重分离的线粒体的spiration,这表明没有细胞色素c损失从线粒体外膜和线粒体完整性被保存下来。
图 7: 细胞色素c的不增强的分离的 线粒体 的呼吸 : 线粒体完整性在隔离过程中很好地保存。使用谷氨酸/苹果酸盐作为底物(络合物I依赖呼吸)高分辨率呼吸测量描。蓝线代表氧气浓度。红线代表氧流量(氧气浓度的斜率)。作为分离线粒体使用可用氧气随时间的氧浓度降低。氧消耗表示为皮摩尔/(SX毫克线粒体蛋白)。M /文件/ ftp_upload / 55251 / 55251fig7large.jpg"目标="_空白"> 点击此处查看该图的放大版本。
线粒体隔离缓冲区 | |
化学 | 浓度 |
氯化钾 | 100毫米 |
硫酸镁 | 10毫 |
吗啉磺酸(MOPS) | 50毫米 |
乙二胺乙酸(EGTA) | 1.0毫米 |
ATP | 1.1毫米 |
pH值7.4 | |
线粒体洗涤液 | |
化学 | 浓度 |
氯化钾 | 100毫米 |
MOPS | 50毫米 |
EGTA | 0.5毫米 |
pH值7.4 | |
线粒体呼吸缓冲区 16 | |
化学 | 浓度 |
蔗糖 | 110毫米 |
EGTA | 0.5毫米 |
氯化镁 | 3.0毫米 |
氯化钾 | 80毫米 |
K-乳糖 | 60毫米 |
KH 2 PO 4 | 10毫 |
牛磺酸 | 20毫米 |
HEPES | 20毫米 |
BSA | 为1.0μg/μl |
pH值7.1 |
表1:缓冲剂的组合物。
在本研究中,我们描述一个协议以分离高品质的,完整和差速离心紧密耦合骨骼肌线粒体可用于功能性研究,例如高分辨率呼吸测量。
为了分离完整和紧耦合线粒体,有要在本协议中考虑的一些关键点。收获骨骼组织后,应立即浸入冰冷线粒体隔离缓冲器。所有离心步骤应在4℃进行,并线粒体悬浮液应该总是在冰上分离过程中被保持。分离过程应尽可能快地完成。将匀浆应干净无洗涤剂离心管离心。在该过程结束时,线粒体悬浮液应保持浓缩并稀释至呼吸运动刚刚之前。因为呼吸测量数据表示为每秒的pe皮摩尔线粒体蛋白中的R毫克,它是用一个很好的技术来精确测量隔离后线粒体蛋白浓度非常重要。
在一些线粒体分离步骤,它可能发生在线粒体是未偶联或适当使用高分辨率呼吸测量不消耗氧气。为了克服这些问题,该组织应始终以相同的方式(相同数量的笔画)使用与宽松杵(步骤1.12)的匀浆。在这里,我们总是使用自动均化10招均匀的骨骼肌组织。较高的笔画数可能会损坏和脱开线粒体。手动(主观和)的玻璃匀浆组织匀浆样品可能会产生分离线粒体的不同特质。线粒体的冻结也可能导致非耦合线粒体和一个应该确保离心在4℃下完成,不低于本德温度。线粒体完整性可能受到损害,以及如果该缓冲溶液的pH值是不正确或在离心管是不干净。每个人都应该确保离心管是清洁剂和无洗净。
一的分离过程中要考虑的第一个重要的因素是在温和的方式匀化的组织。软组织需要在同质化应用温和的机械力,而硬组织需要更强大的机械力。同质化和离心过程中使用的缓冲液应该是冰冷的,有一个生理相关pH与细胞质兼容离子和渗透力。用于硬组织如骨骼肌,机械均化后,可加入蛋白酶,如胰蛋白酶,进一步分解所述组织4,5。
一些分离的线粒体的限制,基于对D。微分离心是i)所述均质化和分离步骤19期间可能损坏线粒体,ii)所述大量的线粒体隔离所需的组织标本,ⅲ)中均化可能发生的损失和改变在某些线粒体电子传递链复合体亚基和离心步骤18,以及iv)在生产过程中均化和离心步骤的活性氧,这可能与线粒体功能18干扰的增加。的DOUNCE匀浆和差速离心方法的优点为呼吸实验粗线粒体隔离相对于现有的方法,如密度梯度离心20是,该方法是快速和线粒体的时间很短的时间内分离。因此,呼吸实验可以在1进行H。此外,该过程是廉价的,非常有效的并通过差速离心获得的线粒体可用于呼吸测量测定。用分离的线粒体的线粒体的氧消耗量的调查提供超过透纤维或细胞几个优点:与可能与线粒体功能和生物能干扰胞质蛋白无显著干扰;不需要细胞透化;和线粒体呼吸链复合物的底物,可直接加入到分离线粒体。
之一的替代方法来测量骨骼肌线粒体呼吸是采用透肌纤维9。某些透化肌纤维过度分离线粒体的优点是:i)不需要机械均质化步骤和ii)所需要的呼吸测量测定组织(几毫克)的极少量。 p的缺点ermeabilized肌纤维是低级氧扩散到在纤维束中的线粒体。这种扩散限制要求时呼吸计量检测更大量的ADP的。另一替代方法是使用整个组织匀浆22的,这是一种非常快速的方法,并且不需要差速离心步骤以分离线粒体。整个组织匀浆的使用可能阻止一些线粒体的丧失其隔离期间,但也可以存在其他胞质因子,这可能与线粒体功能,如氧消耗干扰分析。
掌握了差速离心分离线粒体原油呼吸试验后,未来的应用是通过研究新兴技术分离线粒体的呼吸能力,如使用线粒体外膜抗TOM22(线粒体外膜22同源物的移位)抗体coupl编磁珠21。
The authors have nothing to disclose.
This study was supported by the Swiss National Science Foundation (Grant 32003B_127619).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
ADP | Sigma | A 4386 | Chemical |
Antimycin A | Sigma | A 8674 | Chemical, dissolve in ethanol |
Ascorbate | Merck | 1.00127 | Chemical |
ATP | Sigma | A 7699 | Chemical |
BSA | Sigma | A 6003 | Chemical |
EGTA | fluka | 3779 | Chemical |
Glutamate | Sigma, | G 1626 | Chemical |
Hepes | Sigma | H 7523 | Chemical |
KCl | Merck | 1.04936 | Chemical |
KH2PO4 | Merck | 1.04873 | Chemical |
K-lactobionate | Sigma | L 2398 | Chemical |
MgCl2 | Sigma | M 9272 | Chemical |
Morpholinopropane sulphonic acid (MOPS) | Merck | 1.06129 | Chemical |
O2k-Core: Oxygraph-2k | Oroboros Instruments | 10000-02 | High-resolution respirometry instrument |
Proteinase, bacterial | Sigma | P 8038 | Chemical |
Sodium azide | Sigma | S2002 | Chemical |
Rotenone | Sigma | R 8875 | Chemical, dissolve in ethanol |
Succinate | Sigma | S 2378 | Chemical |
Schuett homogen-plus semiautomatic homogeniser | schuett-biotec GmbH | 3.201 011 | Tissue homogenizer |
Taurine | Sigma | T 8691 | Chemical |
TMPD | Sigma | T 3134 | Chemical |
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