Method Article
Here, we describe a method of long-term time-lapse microscopy to longitudinally track single cells in response to anti-cancer therapeutics.
La risposta di singole cellule di farmaci anti-cancro contribuiscono a determinare la risposta della popolazione, e quindi è un importante fattore nel risultato complessivo. Immunoblotting, citometria a flusso e esperimenti sulle cellule fisse sono spesso utilizzati per studiare come le cellule rispondono ai farmaci anti-cancro. Questi metodi sono importanti, ma hanno diversi difetti. La variabilità della risposta ai farmaci tra il cancro e cellule normali, e tra le cellule di origine diversa cancro, e transitori e le risposte rare sono difficili da capire usando saggi popolazione calcolo della media e senza essere in grado di monitorare direttamente e analizzarli in senso longitudinale. Il microscopio è particolarmente adatto a cellule vive di immagine. Gli avanzamenti nella tecnologia ci permettono di ordinariamente celle di immagine con una risoluzione che consente non solo di inseguimento cellulare, ma anche l'osservazione di una varietà di risposte cellulari. Descriviamo un approccio in dettaglio che permette di imaging continuo time-lapse dicellule durante la risposta ai farmaci essenzialmente per il tempo desiderato, in genere fino a 96 ore. Utilizzando varianti dell'approccio, le cellule possono essere monitorati per settimane. Con l'impiego di organismi geneticamente codificati biosensori fluorescenti processi numerosi, i percorsi e le risposte possono essere seguite. Mostriamo esempi che includono il monitoraggio e la quantificazione della crescita cellulare e la progressione del ciclo cellulare, la dinamica dei cromosomi, danni al DNA, e la morte cellulare. Discuteremo anche le variazioni della tecnica e la sua flessibilità, e mettere in evidenza alcuni problemi comuni.
microscopia Live-cell e il monitoraggio longitudinale di singole cellule, non è una nuova tecnica. Fin dai primi microscopi, gli appassionati e gli scienziati hanno osservato e studiato singole cellule e organismi, i loro comportamenti, e lo sviluppo 1-3. Un esempio famoso della fine del David Rogers alla Vanderbilt University nel 1950 mostra un neutrofili umano in uno striscio di sangue a caccia di un batterio Staphylococcus aureus e, infine, il processo di fagocitosi 4. Questo film live-cell è un eccellente esempio di come i processi multipli possono essere osservati e correlati in un singolo esperimento: rilevamento di un gradiente di chimica, la meccanica e la velocità della motilità cellulare, cellule forme dinamiche, l'adesione e la fagocitosi di un agente patogeno.
L'avvento di microscopi completamente automatizzati e fotocamere digitali ad alta sensibilità ha portato ad un crescente numero di ricercatori che utilizzano la microscopia di porre domande fondamentali nel campo della biologia delle cellule che vanno from come le cellule si muovono 5,6 e 7,8 per dividono organelli dinamica e traffico di membrana 9-11. Non fluorescente, in campo chiaro microscopia, tra cui contrasto di fase (PC), che ha ottenuto il premio Nobel per Frits Zernike nel 1953, e il contrasto di interferenza differenziale (DIC) consentire l'osservazione di cellule e nuclei ma anche strutture sub-cellulari, tra cui fasci microtubuli , cromosomi, nucleoli, dinamica organelli, e fibre di actina spessore 12. Geneticamente codificato proteine fluorescenti e lo sviluppo di coloranti fluorescenti contro organelli hanno notevolmente influenzato time-lapse microscopia a 13-15. Pur non essendo il focus di questo articolo, l'imaging in sferoidi di cellule e in situ (microscopia intravitale) utilizzando la microscopia confocale e multiphoton rappresentano un'altra espansione dell'approccio, e non ci sono articoli in sospeso che usano e trattano questi approcci 16-19.
Le risposte delle cellule di anti-cancfarmaci er o prodotti naturali sono determinate sulla scala molecolare e cellulare. Comprensione delle risposte cellulari e sorti in seguito al trattamento spesso comporta saggi popolazione della media (ad es., Immunoblotting, misure e integrali), o il tempo-punti fissi con il rilevamento di immunofluorescenza e citometria a flusso, che misurano singole cellule. L'eterogeneità nelle risposte delle cellule singole a farmaci all'interno di una popolazione, in particolare nei tumori, può spiegare alcune delle variabilità nella risposta visto attraverso le linee cellulari e tumori che vengono trattati con lo stesso farmaco a saturazione. A lungo termine approcci longitudinali seguire una determinata cella singola o di una popolazione di cellule è un approccio meno comune ma molto potente che consente lo studio diretto di percorsi risposta molecolare, diversi fenotipi (ad es., Morte cellulare o divisione cellulare), osservazione cella-a-cella di variabilità all'interno di una popolazione, e come questi fattori contribuiscono alla dinamica di risposta della popolazione 20-22. Ottimisticamente, essendo in gradodi osservare e quantificare le risposte delle cellule singole contribuirà a migliorare la nostra comprensione di come funzionano le droghe, il motivo per cui a volte falliscono, e come li utilizzano al meglio.
La tecnica di lungo termine microscopia time-lapse, il monitoraggio longitudinale, e l'analisi delle risposte farmaco è disponibile per molti ricercatori e può essere semplice, utilizzando solo la luce trasmessa per osservare le risposte fenotipo 20,21. I componenti principali del metodo sono: la corretta preparazione delle cellule di interesse, un microscopio automatizzato con camera ambientale, una fotocamera integrata con un computer per acquisire e memorizzare le immagini, e il software di rivedere il time-lapse e misurare e analizzare le cellule e qualsiasi biosensori fluorescenti. Forniamo un protocollo dettagliato con molti suggerimenti per lo svolgimento di time-lapse microscopia di cellule in coltura per tutto il tempo diversi giorni con campo chiaro e / o la microscopia epifluorescente widefield. Questo protocollo può essere utilizzato per qualsiasi linea cellulare che può essere coltivata in colturaper studiare le loro risposte alle terapie anti-cancro. Forniamo esempi di dati acquisiti e analizzati utilizzando più biosensori fluorescenti geneticamente codificati diversi e un esempio di microscopio a contrasto di fase, discutere brevemente i diversi tipi di sonde, i vantaggi e gli svantaggi di lungo termine time-lapse e il monitoraggio longitudinale, ciò che può essere imparato a questo approccio che è difficile da capire da approcci non-diretti, e alcune variazioni che speriamo essere di interesse e valore per i ricercatori inesperti che non hanno pensato di utilizzare l'approccio, e di ricercatori esperti.
Il seguente protocollo utilizza parametri definiti dagli esperimenti nelle figure 4 e 6 impostazioni di acquisizione relative e delle condizioni sperimentali. Molti di questi parametri possono essere modificati per adattarsi altri esperimenti (ad esempio, i tempi di esposizione, categorizzazione, canali fluorescenti, ecc.). Tutte le procedure devono rispettare le linee guida e regolamenti istituzionali ed essere approvati dal comitato di biosicurezza istituzionale. siti web produttore microscopio contengono informazioni eccellente per l'imaging cellulare dal vivo.
1. microscopi e software di imaging
2. Visualizzare i processi cellulari e fenotipici Risposte
3. Preparazione di campioni
4. Camera ambientale Set-up
5. Microscopio Set-up
6. Il trasporto di cellule al microscopio e nella Camera
7. Impostazione del Imaging
8. Terminare la Time-lapse
9. longitudinale di monitoraggio e analisi dei dati Time-lapse
A lungo termine time-lapse microscopia e di monitoraggio longitudinale diretta consente per lo studio di molti effetti anti-cancro durante la risposta ai farmaci. Seguendo lo schema generale della figura 1, più esempi di cellule sono mostrati esprimere reporter fluorescenti convalidati trattata con farmaci antitumorali, cingolati e analizzati utilizzando approcci diversi.
Fase microscopio a contrasto da solo è molto istruttivo e robusto rapporti sul interfase contro la mitosi, la durata mitotico e l'arresto, la divisione cellulare anormale, e la morte cellulare 21,23,24. I farmaci che hanno come target la divisione cellulare, i farmaci anti-mitotico spesso definito, continuano ad essere sviluppato. Figura 2 e Video 1 e 2 mostrano esempi di un paio di linee di cellule MCF7 abbinate da tumore della mammella-derivati che differiscono solo per il loro stato di p53, trattati con 500 nM di un tipo di farmaco anti-cancro che obiettivie inibisce la proteina del motore mitotico, Kinesin-5 (KSP1, Kif11, Eg5), con conseguente mitosi protratta 20. Cellule wild MCF7 tipo (Figura 2A) sono un paradigma per lo studio p53-dipendente arresto del ciclo cellulare 25-27. Cellule wild type entrano mitosi, rimangono per diverse ore, poi lascia e in gran parte arresto con l'induzione di p53 25. Quando p53 è rimosso dal knockdown p53 stabile (MCF7 sh p53), invece di arrestare dopo che lasciano mitosi, le cellule passano attraverso cicli ripetuti (Figura 2B). Le cellule sono stati monitorati manualmente e l'indice mitotico e la percentuale di cellule che entrano in un secondo mitosi stati segnati (Figura 2C, D). Osserviamo che la cellula p53 sh rintracciato divide quando si entra in un secondo round di mitosi, piuttosto che arrestare e lasciando mitosi senza divisione. Sebbene non illustrato la durata degli eventi mitotici, tempo tra mitosi successive, cento di divisioni cellulari ed eventi di morte cellulare associati può anche essere sanimato 20,21.
I taxani, per esempio paclitaxel e docetaxel, sono la chemioterapia comune per molti tipi di cancro, compresi quelli che sono difficili da trattare come il seno al pancreas e avanzato. Paclitaxel lega alla dinamica plus-end di microtubuli e li stabilizza, impedendo loro normale funzione. Paclitaxel ha notato effetti dose-dipendenti, e anche a basse concentrazioni può perturbare il normale progressione mitotico e la segregazione cromosoma 16. Segregazione fedele di cromosomi è essenziale per il normale proliferazione cellulare e quando anormali possono provocare aneuploidia che possono innescare l'arresto del ciclo cellulare, ma anche agire come un driver di progressione del cancro. Figura 3 e film 3 mostra cervicali cellule HeLa carcinoma derivate esprimono stabilmente la cromatina marcatore istone-2b fuso al mCherry e beta-tubulina fusa EGFP (non mostrato) in mezzo di crescita normale trattato con 1 nM paclitaxel. In questoad esempio, l'ingresso e la progressione attraverso la mitosi può essere seguito. I tempi di mitosi appare normale in questa cella, però l'allineamento dei cromosomi e la segregazione non è, con conseguente rigonfiamenti nucleari e micronuclei, che sono strutture che indicano scarsa segregazione dei cromosomi. Micronuclei sono inclini a danni al DNA e cromotripsi, che è la frammentazione su larga scala di cromosomi o cromatina - questo ha importanti implicazioni per l'evoluzione del tumore 28,29. Anche se non è mostrato qui, l'origine dei micronuclei in relazione ad altre strutture mitotici e il destino di queste cellule può essere direttamente monitorati tramite a lungo termine time-lapse. Inoltre, un marker cromatina espressa con un giornalista danni al DNA potrebbe essere utilizzato per stabilire la relazione tra la segregazione dei cromosomi, micronuclei e danni al DNA.
reporter fluorescenti consentono di processi cellulari enumerabili di tenere traccia e nuovi giornalisti sono continuamente in fase di sviluppo. per exampio, il ciclo cellulare è costituito da fasi che sono di particolare interesse per lo sviluppo mirato terapie anti-cancro. Figura 4 e Movie 4 mostra una linea cellulare fibrosarcoma-derivato (HT1080) che stabilmente co-esprime due giornalisti chiamati, gli indicatori del ciclo cellulare ubiquitina fluorescente (FUCCI) 30. Nel sistema qui, una porzione del polipeptide CDT1 è fuso mKO2 (monomerico Kusabira arancione 2) ed aumenta in G1-fase e viene degradato all'inizio della fase S, ed una porzione di Geminin è fuso MAG (monomerica Azami verde) e aumenti di mid-S-fase e viene degradato su anaphase. Questa cella è normale mezzo di crescita e progredisce attraverso il ciclo cellulare in 15 ore. Figura 5A, B e Movie 5 mostrano le stesse cellule in terreno normale trattati con 10 PD0332991 micron, un Cdk4 / 6 inibitore. Le cellule progrediscono G2-fase e dividono normalmente, e arrestano fortemente nella successiva fase G1, indicando la possibilità di effettoive effetti citostatici nei tumori in crescita. La figura 5C, D e Movie 6 mostrano le stesse cellule in terreno normale trattato con una piccola molecola chiamata selinexor (KPT-330), un potente inibitore della proteina nucleare export, exportin-1 (XPO1, aka CRM1 ). Questi composti sono chiamati inibitori selettivi di esportazione nucleare (SINE) ed i loro effetti anti-cancro sono attualmente sotto inchiesta 31,32. I risultati del trattamento SINE a forti fenotipi del ciclo cellulare e la morte cellulare 33,34. Questo esempio mostra una cella che procede attraverso G1-fase con cinetiche normali (circa 6 ore), ma sperimenta ritardo nella progressione fase S come indicato dal termine con il segnale sia rosso e verde (circa 3 ore in controllo ma 10 in SINE trattati ). Questa cellula muore alla fine di S o G2-fase, dopo 21 ore 30 min; un ciclo cellulare normale è di circa 15 ore. Gli effetti di selinexor sono allo studio per il sangue diverso e tumori solidi 35.
un pilastro della terapia anti-cancro è la citotossicità attraverso danni al DNA catastrofici. danno al DNA può essere indotta attraverso molte terapie, tra cui le radiazioni, addotti a base di platino, e piccola molecola di droga - ad esempio, quelli che colpiscono la topoisomerasi I e / o II. Molte terapie combinate anche attaccare l'asse danni al DNA da entrambe inducendo danni attraverso percorsi separati o bloccando la capacità delle cellule di riparare i danni. La cinetica e il livello di danni e se e come questo provoca la morte delle cellule è di una diffusa importanza nelle terapie di sviluppo. Figura cellule HT1080 6 e 7 mostrano film che esprimono stabilmente un danno al DNA a doppio filamento giornalista, mCherry-BP1-2 36 in crescita normale media trattata con 10 pM etoposide (VP-16), un veleno topoisomerasi II. Questo reporter comprende una porzione della proteina sito rottura del DNA a doppio filamento, 53BP1 che è fuso con mCherry. Il nucleo di questa cellula è stato rintracciato USIng il plugin Analizzare Particelle in ImageJ e il segnale mCherry-BP1-2 integrato è stata misurata in ogni fotogramma dopo thresholding i valori che ha eliminato la sonda nucleare solubile. danno al DNA è minimo per il primo 10 ore e quindi aumenta costantemente. Inibitori della topoisomerasi II sono noti per influenzare particolarmente S e G2-fase, quando l'enzima è più attivo 37,38. La cinetica osservate in questo esempio potrebbe indicare ciclo cellulare danni associati; combinando mCherry-BP1-2 con i giornalisti Fucci ha potuto dimostrare la tempistica dei danni che possono poi essere collegata alla cella destino.
Figura 1. Introduzione all'uso a lungo termine microscopia time-lapse e longitudinale di monitoraggio per studiare la risposta ai farmaci anti-cancro. Le cellule in appositi piatti live-cell imaging etichettati, se lo desideri vengono esposte, cellule o regioni di interesse sono tracciati, ed i dati sono analizzato. Molti metodi esistono per monitorare e quantificare le cellule, alcuni sono indicati qui. Cliccate qui per vedere una versione più grande di questa figura.
Figura 2. Fase contrasto Microscopia time-lapse mostra p53-dipendenza dopo Anti-mitotico Drug Treatment. Wildtype (A) e p53-atterramento (B) MCF7 cellule sono state trattate con 500 nM Kinesin-5 inibitori e ripreso ogni 10 minuti per 96 hr usando la microscopia a contrasto di fase con un obiettivo NA 20X PH2 0,70. Le singole celle sono stati monitorati manualmente e la mitosi per cento e se la cella progredisce a un altro mitosi di nuovo durante il time-lapse sono stati segnati. Le frecce indicano cellule che viene monitorato. La cella sh p53 (B) divide entrando un secondo mitosi. (C) Entrambe le linee cellulari show arresto mitotico prolungato come indicato dalla percentuale mitosi picco (primo blu e frecce rosse). (C, D) Circa il 90% di celle senza p53 (sh p53, n = 87) mostra progressione continua (frecce rosse) rispetto al 20% di tipo selvatico (n = 130). Le barre di errore indicano la deviazione standard. Bar = 20 micron. Film 1 e 2. Cliccate qui per vedere una versione più grande di questa figura.
Figura 3. La cromatina Marker Histone 2b rivela prova di segregazione cromosomica Anomalie dopo basso dosaggio Paclitaxel trattamento. Paclitaxel è un farmaco mirato microtubuli che si traduce in difetti complessi, concentrazione-dipendente in crescita e divisione cellulare. L'organizzazione della cromatina informa sui diversi stati cellulari, tra cui lo stadiodella mitosi e la morte cellulare. cellule HeLa che esprimono stabilmente sia H2b-mCherry e β-tubulina-EGFP sono stati trattati con 1 nM paclitaxel. Questa cella è inizialmente in interfase, procede attraverso le fasi della mitosi e divide. Mentre il tempo in mitosi appare normale, ci sono prove di errori di collegamento dei cromosomi e di segregazione che si risolvono (frecce). Il destino di queste cellule può essere determinata direttamente dal monitoraggio longitudinale. A contrasto di fase (non mostrato) e le immagini fluorescenti sono stati acquisiti a 1 frame per 10 min con una lente NA 20X Ph2 0,70. Bar = 10 micron. Film 3. Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.
Figura 4. I marcatori del ciclo cellulare fluorescenti permettere il monitoraggio diretto della progressione del ciclo cellulare.(A) Un campo di cellule HT1080 fibrosarcoma vive che esprimono il sistema FUCCI ripreso dal contrasto di fase e fluorescenza. (B, C) La cella mitotica nella casella tratteggiata nella pannello A è seguito. Normalmente progredire attraverso il ciclo cellulare in circa 15 ore. Dopo la mitosi, le cellule sono brevemente debole, e quindi diventano rossi mentre progrediscono in e attraverso G1-fase. Quando le cellule entrano fase S, la sonda rossa CDT1 è degradata e le verdi aumenta sonda Geminin. Il breve periodo di circa 3 ore in cui entrambe le sonde sono presenti, indica precoce fase S. Come le cellule progressi attraverso S e G2-fase e nel prossimo mitosi rimangono verde. La sonda verde è degradato su anaphase della divisione cellulare. A contrasto di fase e le immagini fluorescenti sono state acquisite a 1 fotogramma al 10 min con una lente NA 20X PH2 0,70. Bar = 10 micron. Film 4. Clicca qui a view una versione più grande di questa figura.
Figura 5. Cell Cycle effetti specifici e associati morte cellulare. La stessa linea di cellule come in Figura 4, ma trattati con due molecole diverse che rappresentano diversi obiettivi anti-cancro. Volte dopo il trattamento sono indicati. (A, B) Dopo il trattamento di un ritardo cellule / G2 fase S con 10 pM PD0332991 Cdk4 / 6 inibitore, si procede cellule normalmente mitosi (M) e divide. Una cellula figlia viene monitorato misurando intensità di fluorescenza rossa e verde nella regione di interesse nel nucleo. La cella rimane arrestato in G1-fase per circa 40 ore. (C, D) Dopo il trattamento di una cella tardiva G2-fase con 1 pM selinexor, essa cella progredisce normalmente mitosi (M) e divide. Una cellula figlia viene monitorato ed entra G1-fase, progredisce attraversouna precoce fase S prolungata (segnale rosso e verde), transizioni per il solo verde e muore dopo 21 ore 30 min. I dati suggeriscono progressione fase S è influenzato dal trattamento selinexor. A contrasto di fase e le immagini fluorescenti sono state acquisite a 1 fotogramma al 10 min con una lente NA 20X PH2 0,70. Bar = 10 micron. Film 5 e 6. Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.
Figura 6. Dynamics danni al DNA dopo trattamento farmacologico. Molte terapie anti-cancro provocano danni al DNA che possono avere un impatto profondo risposta delle cellule e il successo del trattamento. cellule HT1080 stabilmente che esprimono sia il marcatore danni al DNA a doppio filamento mCherry-BP1-2 e H2b-EGFP (non mostrato) sono stati trattati con 10 mM della topoisomerasi II etoposide droga e DNA dAmage è stato rintracciato. (A) Il numero e l'intensità della crescita focolai dopo etoposide. Vi è inizialmente un certo ritardo, indicando i possibili effetti del ciclo cellulare coerenti con il meccanismo noto di etoposide. Con 22 hr 50 min questa cella ha accumulato un alto livello di danni. Sebbene non illustrato, il destino di questa cella può essere determinata mediante rilevamento diretto. (B) Un ROI corrispondente al nucleo ottenuto attraverso il segnale H2b-EGFP è stato rintracciato utilizzando il monitoraggio di particelle in ImageJ e il segnale BP1-2 mCherry integrato è stata quantificata e tracciati nel corso del tempo. Il ritardo del segnale fino a circa 10 ore è notato, seguito da un aumento persistente. immagini fluorescenti sono state acquisite a 1 fotogramma al 10 min con una lente NA 40X PH2 0.75. Bar = 10 micron. Film 7. Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.
Film 1. Fase contrasto Microscopia time-lapse di tipo selvatico cellule MCF7 dopo. Tipo selvatico cellule MCF7 anti-mitotico trattamento farmacologico sono stati trattati con 500 nM Kinesin-5 inibitori e ripreso ogni 10 minuti per 96 ore usando la microscopia a contrasto di fase con un 20X PH2 0,70 lente NA. Arresto mitotico prolungato e l'uscita dalla mitosi possono essere osservati, come descritto nella Figura 2. Cliccate qui per scaricare questo file.
Movie 2. Fase contrasto Microscopia time-lapse di p53-knockdown cellule MCF7 dopo che le cellule anti-mitotico Drug Treatment. MCF7 esprimono stabilmente un piccolo RNA tornante mira p53 per la degradazione sono stati trattati con 500 nM Kinesin-5 inibitori e ripreso ogni 10 minuti per 96 ore usando la microscopia a contrasto di fase con un obiettivo NA 20X PH2 0,70. Arresto mitotico prolungato e vari cicli di mitosi si possono osservare, come descritto nella Figura 2. Cliccate qui per scaricare questo file.
Movie 3. Fluorescente Microscopia time-lapse di cellule HeLa dopo Basse dosi di cellule Paclitaxel trattamento. HeLa che esprimono stabilmente H2B-mCherry e β-tubulina-EGFP sono stati trattati con 1 nM paclitaxel. Attaccamento cromosomiche e problemi di segregazione possono essere osservati, come descritto nella Figura 3. Le immagini sono state acquisite ogni 10 min con una lente NA 20X PH2 0,70. Cliccate qui per scaricare questo file.
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Film cellulare 5. HT1080 Esprimendo marcatori del ciclo cellulare fluorescenti dopo il trattamento con un inibitore G1-fase. Le cellule che esprimono il sistema HT1080 FUCCI sono stati trattati con 10 micron PD0332991, un Cdk4 / 6 inibitore. La cella rintracciato progredisce normalmente mitosi e divide. Una figlia è monitorato, e rimane rosso in G1 per la durata del film. La quantificazione è mostrato in Figura 5. Le immagini sono state acquisite ogni 10 min con una lente NA 20X PH2 0,70. Clicca qui per scaricare questo file.
Film 6. HT1080 cellulari che esprimono fluorescenti marcatori del ciclo cellulare dopo il trattamento con il Exportin-1 Inhibitor, Selinexor. Le cellule che esprimono il sistema HT1080 FUCCI erano treatEd con 1 micron selinexor. Questa cella ritardo G2-fase è stato rintracciato attraverso la mitosi. Una cellula figlia procede poi attraverso G1-fase (rosso) ed entra fase S (giallo). La cella progredisce lentamente attraverso S-fasi fino alla sua entrata-S tardo / G2-fase e muore dopo 21 ore 30 minuti di trattamento. La quantificazione è mostrato in Figura 5. Le immagini sono state acquisite ogni 10 min con una lente NA 20X PH2 0,70. Clicca qui per scaricare questo file.
Film 7. DNA Dynamics danni dopo il trattamento con un topoisomerasi II cellule HT1080 inibitori. Esprimono stabilmente il marcatore danni al DNA a doppio filamento mCherry-BP1-2 e H2B-EGFP sono stati trattati con 10 micron etoposide, un inibitore della topoisomerasi II. Il mCherry-BP1-2 viene visualizzata nel film. Poiché il trattamento continuas, il segnale di aumenti mCherry-BP1-2, indicando un aumento doppio filamento danni al DNA. La quantificazione è mostrato in Figura 6. Le immagini sono state acquisite ogni 10 min con una lente NA 40X PH2 0.75. Clicca qui per scaricare questo file.
Vantaggi di Microscopia time-lapse e monitoraggio longitudinale
Il microscopio è uno strumento ideale per gli studi longitudinali di risposta ai farmaci in quanto consente ai ricercatori di monitorare le singole cellule e il loro destino, nonché l'intera popolazione. La variabilità della risposta ai farmaci all'interno di una popolazione di cellule è una questione importante per l'anti-cancro disegno terapeutico. monitoraggio longitudinale di singole cellule permette ai ricercatori di osservare questa variabilità e cominciare a comprendere i meccanismi alla base e le conseguenze in quanto riguarda la popolazione di cellule. Utilizzando una varietà di sonde fluorescenti fornisce una moltitudine di modi di osservare e comprendere sia fenotipi di risposta comuni e rare. La tempistica e il contributo di destini diversi cellulari per la risposta della popolazione, le relazioni tra fenotipi specifici e destino, e le differenze di risposta tra le linee cellulari o lo stato in seguito al trattamento sono esempi di ciò che può essere appreso. Molti processi connessi con il cancro possono essere studiati. Alcuni che non sono evidenziati in questo articolo includono la morte delle cellule con l'apoptosi, autofagia e giornalisti necrosi 39-42, invasione delle cellule 43,44, e la dinamica p53 che determinano le decisioni destino delle cellule 27. Inoltre, questo approccio non è limitata a studi nelle terapie studi anti-cancro. Gli stessi principi possono essere utilizzati per studiare molti altri processi biologici, tra cui la mitosi 45 dinamiche del citoscheletro 46,47 e intracellulare di segnalazione 48.
microscopia a fluorescenza time-lapse può anche fornire localizzazione e intensità di dati di proteine e molecole di interesse. Non solo le variazioni del livello della proteina importante risposta ai farmaci, ma la corretta (o improprio) localizzazione delle proteine all'interno della cellula è critica per la risposta comprensione. Time-lapse microscopia fornisce i dati su dove sono localizzate le proteine (ad es., Nucleo, citoplasma, organelli specifici,ecc.) dopo il trattamento farmacologico e come la localizzazione e livelli totali cambiano nel tempo a livello di singola cellula e la popolazione.
Sfide e limiti
Nonostante i punti di forza di time-lapse microscopia ed analisi longitudinale di singole cellule, ci sono delle limitazioni. reporter fluorescenza sono limitati dalla loro stabilità e specificità. Nel progettare proteine di fusione fluorescenti, è fondamentale scegliere una sonda che è foto-stabile e luminose, ma è anche necessario considerare gli effetti del tag fluorescenti essere attaccati alla proteina di interesse in relazione alla sua normale funzione e capacità di localizzare correttamente . Questi problemi sono stati discussi in dettaglio altrove e ci sono molte proteine fluorescenti tag disponibili che sono stati pubblicati 15,49,50. Altre etichette fluorescenti o tag possono essere aggiunti alle cellule, e la cura devono essere prese per garantire che non sono tossici. Nella nostra esperienza, questi pabiti, per esempio le etichette mitocondriali (potenziale di membrana) o cellulari permeabili coloranti DNA, tendono a candeggina più facile e saranno diluiti a causa di proliferazione cellulare.
In aggiunta, ci sono molte sfide tecniche con crescente e osservando le cellule su un microscopio. Instabilità per quanto riguarda la temperatura, l'umidità, l'atmosfera, e la luce avrà grandi effetti sulle cellule, con conseguente perdita di dati o addirittura l'intero esperimento. Problemi di stabilità riguardanti acquisizione dell'immagine può essere visto in Film 1 e 2. Questo effetto può essere minimizzato attraverso l'uso di pellicola di paraffina (vedere 4.2). Ci sono anche gli algoritmi di stabilizzazione dell'immagine disponibili per l'elaborazione post-acquisizione, ad esempio utilizzando ImageJ (NIH). Un aspetto di lungo termine time-lapse che viene spesso trascurato è la gestione dei dati e la dimensione del file. Anche quando binning dei dati, un singolo esperimento time-lapse è spesso superiore a 30 gigabyte. Alta capacità, ad alta velocità, la memorizzazione dei dati affidabile e di trasferimento sono fortimente incoraggiata. A seconda del biosensore fluorescente (s) essendo ripreso, spesso non è necessario acquisire immagini a piena risoluzione, per esempio nucleare o sensori citoplasmatici. Si consiglia, quando possibile, a prendere misure per mantenere file di dimensioni ridotte, con conseguente più facile lavorare con i dati, esigenze di elaborazione meno esigenti, e il miglioramento del flusso di lavoro.
Fototossicità è una delle principali preoccupazioni durante l'esecuzione di microscopia time-lapse lungo termine. intensità luminosa alta e lunghe esposizioni possono portare a photobleaching di sonde fluorescenti, lo stress cellulare e la morte cellulare. Questi effetti possono avere grandi effetti sui dati e portare a false dichiarazioni di questo esperimento. binning obiettivo e il guadagno possono essere utilizzati per ridurre i tempi di esposizione. filtri di densità neutri nel percorso della luce riducono l'intensità della luce nel campione. Le lunghezze d'onda della luce utilizzati per immagine influirà anche le cellule. lunghezze d'onda più corte (UV, nei pressi di UV) sono più dannosi per le cellule e causare fotometabolismo a tassi più veloci rispettolunghezze d'onda più lunghe (ad es., rosso, rosso lontano). Scelta di obiettivo può anche influenzare le condizioni di imaging. Superiori apertura numerica (NA) lenti produrranno immagini ad alta risoluzione, ma più elevato ingrandimento permette meno luce da trasmettere dal campione con conseguente tempi di esposizione più elevati o luce più intensa. Un obiettivo deve essere scelto con una NA e l'ingrandimento opportuno che risolverà il vostro oggetto di interesse, senza sovracampionamento. In molti casi, l'obiettivo più elevato può non essere la scelta più appropriata. Con sonde nucleari (figure 4, 5), un obiettivo a basso ingrandimento permette un più ampio campo da catturare, aumentando efficacemente la dimensione del campione, senza compromettere la risoluzione dell'oggetto desiderato. A lungo termine time-lapse in tre dimensioni deve essere effettuata con cautela a causa di esposizione alla luce integrata. Utilizzando un disco rotante microscopio confocale, macchina fotografica sensibile (ad es., EM-CCD), guadagno della telecamera, e un motore piezoelettrico veloce per z-Series è suggested per ridurre l'esposizione alla luce. Acquisizione rapida z-serie è anche importante minimizzare artefatti da movimento dovuti al movimento delle cellule e dinamiche che si verificano durante il periodo di acquisizione. Analisi empirica delle cellule non trattate con diverse impostazioni può essere utile per determinare gli effetti di luce fluorescente su una data linea cellulare o giornalista. Inoltre, un controllo non trattato dovrebbe essere incluso in ogni esperimento per determinare gli effetti citotossici di regolazioni sperimentali.
Variazioni della Tecnica
A lungo termine time-lapse è robusto e molto flessibile. Utilizzando tecniche di co-coltura, diverse linee cellulari o le stesse linee cellulari esprimenti differenti reporter può essere utilizzato. Un esempio eccezionale di questo stia esponendo fagociti con cellule bersaglio che stanno morendo in risposta ad un farmaco anti-cancro. Un altro esempio potrebbe essere quello di studiare l'impatto di rispondere cellule in cellule vicine naive droga. Accoppiato con la foto-activateable, foto-cabriolet, e proteine fluorescenti foto-commutabile, e proteine ingegnerizzate che possono essere attivati dalla luce per innescare effetti specifici (ad es., KillerRed), ci sono molte possibilità. Più approcci complessi possono essere utilizzati che impiegano vari tipi specializzati di microscopia come la ridistribuzione a fluorescenza dopo photobleaching, Förster trasferimento di energia di risonanza (FRET), e la risoluzione super (ad es., Stocastico microscopia ricostruzione ottica (Storm), illuminazione microscopia strutturale (SIM), o deplezione di emissione stimolata (STED)), e molti altri e ci sono vantaggi e limitazioni di ogni approccio.
A lungo termine (ad es., Settimane, mesi) risposte e il recupero delle cellule dopo la rimozione della droga è fondamentale per la comprensione anti-cancro azione del farmaco. piatti con fondo di vetro a griglia sono uno strumento prezioso per monitorare celle o regioni specifiche all'interno di una popolazione / zona ripetutamente. Ad esempio, con un piatto a griglia, il dr inizialerisposta ug può essere ripreso con un time-lapse, il farmaco può essere rimosso, e le aree specifiche nella griglia può essere ripreso nel tempo o sottoposto ad ulteriore time-lapse al momento desiderato. Il fondo di vetro sui piatti può essere rimosso o di taglio con un utensile scrivano o usando un reagente commerciale, e le celle del vetro può essere colorato per altri marcatori di interesse, per esempio senescenza associato attività β-galactocidase, e confrontata il time-lapse per capire la storia di come le cellule hanno raggiunto questo stato. Se la popolazione cellulare è sufficientemente grande può anche essere sottoposto a immunoblotting o citometria a flusso.
campioni spessi sono stati tradizionalmente difficile immaginare, per esempio sferoidi in vari materiali in gel e matrici. Newer avvicina compresi confocale a fluorescenza o multi-photon microscopia 16,18,19,51 può essere utilizzato per estendere l'approccio in situ comprensione di come le cellule rispondono a terapie anti-cancro. Ilstudi SE e un numero crescente di scienziati utilizzando time-lapse per studiare la risposta ai farmaci anti-cancro 24,52-54 dimostrano chiaramente che ci stiamo muovendo verso lo sviluppo di una comprensione della farmacodinamica singola cellula che contribuirà a migliorare la nostra capacità di utilizzare farmaci anti-cancro in modo più efficace e forse prevedere la risposta ai farmaci anti-cancro.
The authors have no conflicts of interest to disclose.
We thank Joshua Marcus for technical support and Jolien Tyler, Ph.D., Director of the Richard J. McIntosh Light Microscopy Core Facility, for technical advice. This work was supported by funds from the University of Colorado Boulder and the University of Colorado Boulder Graduate School to J.D.O. R.T.B. is partially supported by pre-doctoral training grant from the NIH (T32 GM008759). We thank Karyopharm Therapeutics, Inc. for selinexor and Merck Serono for Kinesin-5 inhibitor. FUCCI plasmids are from Atsushi Miyawaki (RIKEN, Japan) via MTA. mCherry-BP1-2 was from Addgene. HeLa expressing H2b-mCherry and β-tubulin-EGFP are from Daniel Gerlich (IMBA, Austrian Academy of Sciences, Austria).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Taxol (paclitaxel) | Sigma | T7191 | microtubule stabilizing drug |
Etoposide | Selleckchem | S1225 | topoisomerase II inhibitor |
Selinexor | Karyopharm Therapeutics | na | XPO1/CRM1 inhibitor, gift |
Kinesin-5 inhibitor | Merck Serono | na | gift, also available from American Custom Chemicals Corporation. CAS 858668-07-2 |
Cell growth medium | HyClone (Fisher) or Mediatech | many companies available | |
5% CO2/balance air, certified | Airgas | Z03NI7222004379 | |
35 mm Dish, 20 mm glass bottom | Cellvis | D35-20-1.5-N | many companies available |
35 mm 4-well Dish, 20 mm glass bottom | Cellvis | D35C4-20-1.5-N | many companies available |
35 mm Dish, gridded glass bottom | MatTek | P35G-2-14-CGRD | many companies available |
Multi-well, glass bottom | Cellvis | P12-1.5H-N | many companies available |
Olympus IX81 inverted epifluorescence microscope | Olympus | ||
Olympus IX2-UCB controller | Olympus | ||
PRIOR LumenPro200 | Prior Scientific | Lumen200PRO | |
PRIOR Proscan III motorized stage | Prio Scientific | H117 | |
STEV chamber | InVivo Scientific | STEV.ECU.HC5 STAGE TOP | |
Environmental Controller Unit | InVivo Scientific | STEV.ECU.HC5 STAGE TOP | |
Hamamatsu ORCA R2 CCD with controller | Hamamatsu | C10600 | |
Nikon Eclipse Ti | Nikon | ||
Nikon laser launch | Nikon | ||
SOLA light engine | lumencor | ||
iXon Ultra 897 EM-CCD | ANDOR | ||
TOKAI HIT inclubation chamber | TOKAI HIT | TIZSH |
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