Method Article
L'obiettivo del presente protocollo è stato quello di sviluppare un metodo che permetterà analisi di genomica funzionale della secrezione mastociti. Il protocollo si basa sulla valutazione quantitativa del rilascio di un gene reporter fluorescente cotrasfected con il gene di interesse e l'analisi in tempo reale della morfologia del granulo secretorio.
Mastociti (MC) sono cellule secretorie del sistema immunitario che svolgono le loro funzioni fisiologiche e patologiche rilasciando mediatori allergici, infiammatorie e immunomodulanti preformati e di nuova sintesi. Mediatori MCs 'riguardano diversi tessuti e organi che culminano nelle risposte allergiche e immunitarie. La sintesi, lo stoccaggio e il rilascio dei mediatori MC sono altamente regolamentati. I mediatori preformati sono confezionati in granuli secretori citoplasmatici (SG), che si fondono con la membrana plasmatica e rilasciano il loro contenuto per esocitosi regolata. Presentiamo un protocollo, basata sulla co-espressione di un gene di interesse con un gene reporter che si rivolge alla SGS e viene rilasciato in modo regolato fianco dei mediatori endogeni SG. Il protocollo consente di alta risoluzione quattro confocale tridimensionale analisi del MC SGS e il controllo della loro linea temporale dal biogenesi a esocitosi innescato. Così, con questo protocollo per lo screening dei geni di Interest per il loro impatto fenotipica e funzionale permette di decifrare i meccanismi molecolari che regolano la biogenesi e esocitosi del MC SGS e identificare i regolatori coinvolti. In tal modo, dovrebbero essere fornite ulteriori informazioni sui meccanismi cellulari che rappresentano la funzione MCs in salute e malattia.
Mastociti (MC) sono cellule immunitarie che sono più noti per il loro coinvolgimento nelle reazioni allergiche e infiammatorie come l'artrite, l'asma, esofagite eosinofila, dermatite cronica e shock anafilattico 1,2 così come altre patologie tra cui la malattia coronarica e 3,5 cancro 3,4. Inoltre, MCs svolgono un ruolo importante in innata e adattativa, sia in difesa dell'ospite contro i batteri e parassiti e dalla soppressione delle risposte immunitarie, ad esempio inducendo la tolleranza dell'organo trapiantato 5,6.
MCs provengono dal midollo osseo, lo sviluppo di CD34 + / CD117 + cellule progenitrici pluripotenti 7. Committed midollo osseo MC progenitori vengono rilasciati nel sangue e migrano nei tessuti periferici localizzative prevalentemente all'interno dei tessuti connettivi e superfici epiteliali 8. Maturazione e differenziazione terminale vengono poi raggiunti sotto l'influenza of citochine all'interno l'ambiente circostante 8,9.
MCs possono essere attivati da un allergene (antigene, Ag), il cui incontro portato alla generazione di immunoglobulina E (IgE) tipo anticorpi. Il legame di tale IgE ai recettori FcεRI del MC, seguito da reticolazione di cellula legata IgE upon riesposizione allo stesso Ag, provoca l'aggregazione FcεRI e apertura di una cascata di segnalazione che culmina in degranulazione [recensione in 10,11] . MCs sono attivati, indipendentemente da IgE, da neuropeptidi 5,12, le tossine 13, batterica e antigeni virali 14,15, un numero di peptidi caricati positivamente collettivamente come secretagoghi di base, le cellule immunitarie e citochine 5,13,12,16 , 17. MCs sono anche attivati da molti dei propri mediatori rilasciati, che amplificano ulteriormente la risposta infiammatoria.
MCs sono confezionati con granuli di secreto (SGS) che contengono immunomediatori regolamentari, anche amine vasoattive, come l'istamina e la serotonina (in roditori), proteoglicani, proteasi, come chimasi e triptasi, fattore di crescita vascolare endoteliale e diverse citochine e chemochine 8,9. Questi mediatori sono "pronti a partire" e una volta MCs sono attivati da uno stimolo adeguato, questi mediatori vengono rilasciati dalle cellule di esocitosi regolata (degranulazione) in pochi secondi a minuti 18,19. Questo evento iniziale è seguita dalla sintesi de novo e il rilascio di una vasta gamma di sostanze biologicamente potenti, tra metaboliti dell'acido arachidonico, più citochine e chemochine 20,21,22. Rilascio di prodotti di nuova sintesi si verifica indipendentemente dal rilascio SG. Collettivamente, questi mediatori avviare prime e fase tardiva infiammatori e allergici risposte. Pertanto, la comprensione dei meccanismi che rappresentano per l'attivazione e la degranulazione MC sono entrambi di imp teorica e clinicaortance.
La difficoltà di manipolare geneticamente MCs primarie e coltivate ha ostacolato i tentativi di chiarire i meccanismi alla base MC degranulazione, che è rimasto mal risolti. Per ovviare a questo problema abbiamo sviluppato un giornalista saggio basato da co-trasfezione linea cellulare della mucosa mast, rat leucemia basofili (RBL) -2H3 (di seguito denominato RBL) o di midollo osseo derivate MCs (BMMCs) 30 con un gene di interesse e neuropeptide Y (NPY) fusa RFP monomero (MRFP), come SG giornalista.
NPY è stato precedentemente dimostrato di ricapitolare il comportamento dei marcatori SG endogeni in altri sistemi. Inoltre, perché MRFP fluorescenza è pH insensibile, espressione di NPY-MRFP consente la visualizzazione delle SG acidi e valutazione quantitativa di esocitosi utilizzando piastre da 96 pozzetti e un lettore di fluorescenza. Abbiamo dimostrato che NPY-MRFP viene consegnato al SGS acide delle cellule RBL e BMMCs e viene rilasciato dalle cellulein modo regolato lungo il SG carico endogena (cioè, β-esosaminidasi e serotonina) 30, 32. Questo protocollo fornisce una metodologia di imaging-based ad alta risoluzione che permette di geni di screening di interesse per la loro fenotipica e l'impatto funzionale su caratteristiche SG e degranulazione in cellule RBL 32. In particolare, questo protocollo permette il monitoraggio in tempo reale di MC SGS e quantificazione della loro area o dimensioni del volume, il loro numero, la cinetica di assemblaggio, il loro movimento lungo il citoscheletro cellulare e la loro ultima fusione con la membrana plasmatica in condizioni diverse. Ad esempio, sensibilizzando le cellule con DNP-IgE specifiche e innescando le cellule con un Ag polivalente (DNP coniugato albumina sierica) in diverse perturbazioni (ad esempio, l'abbattimento dei geni di interesse, oltre l'espressione di geni wt o mutanti, o manipolazioni farmacologiche) e confronto alle cellule di controllo.
1. Preparazione di RBL Cellulari Media Cultura
2. coltura di cellule RBL
3. Preparazione di Transfection media.
4. Trasfezione delle cellule RBL
5. Misura NPY-MRFP Esocitosi
6. Time-lapse Microscopia di Esocitosi
7. Analisi immagine
A causa della bassa efficienza di trasfezione di MC, manipolazioni genetiche è improbabile che lasciare un impatto sulle letture di secrezione media misurate dai mediatori endogeni SGS. Tuttavia, stabilendo completa co-espressione del gene reporter NPY-MRFP e il plasmide co-trasfettato nelle stesse cellule, monitoraggio dei risultati NPY-MRFP nel monitoraggio esclusivamente popolazione cellulare che esprime il gene di interesse. Pertanto, il vantaggio di questo test rispetto ai metodi convenzionali è la capacità di controllare selettivamente le cellule geneticamente manipolate (Figura 1).
Infatti, da questo test abbiamo proiettato i geni che regolano il traffico vescicolare tra cui NSF solubile del recettore proteina attacco (militare) proteine [sensibili fusione N-etilmaleimmide] e 44 membri della famiglia Rab GTPasi. Abbiamo identificato i geni che regolano SGsize, numero, la composizione del carico e esocitosi 23.
We identificato 30 Rabs che alterati (cioè, inibire o stimolare) esocitosi in cellule RBL stimolate da una Ag o dalla combinazione di un Ca 2+ ionoforo e l'estere del forbolo TPA (Ion / TPA) 23. Confocale ha rivelato insidie e Rabs che hanno causato fenotipi drammatici che alterano la morfologia delle cellule o SGS 30,32. Confocale di queste proteine ha rivelato 8 insidie e Rabs che hanno causato fenotipi drammatici sulle cellule o del SG morfologia 30,32. Usando questo protocollo abbiamo potuto tracciare singoli SGS e effettuare misure delle loro dimensioni, intensità di fluorescenza, il loro movimento e esocitosi. Ad esempio, abbiamo identificato Rab5 come regolatore di SG biogenesi 30. Rab5 è stato identificato come il principale regolatore di endocitosi e endosomiale fusion 24. Abbiamo dimostrato che la co-espressione di (CN) mutanti costitutivamente negativi PIL bloccato delle isoforme endogeno espresse Rab5 (Rab5A, Rab5B e Rab5C) o expression di Rab5A / B / C di targeting shRNAs, ha ridotto significativamente le dimensioni SGS 'con un concomitante aumento del loro numero 30. Al contrario, l'espressione di un GTP-locked, costitutivamente attivo (CA) Rab5A mutante (Rab5A Q79L, qui: "CA Rab5A"), che è noto per facilitare la fusione omotipica di endosomi precoci (SEO) 24, ha portato alla formazione di gigante vescicole Rab5A-decorato, che abbiamo identificato come SG in base al contenuto del secretoria cargo NPY-MRFP e la serotonina, e la loro capacità di esocitosi in modo regolamentato 30.
Figura 2 mostra le analisi morfometriche del NPY-MRFP contenenti SGS. Il volume medio SGs in cellule che esprimono Rab5A CA raggiunto il valore di 44 micron 3, che era> 20 volte maggiore del volume medio di SGS nel controllo-GFP cellule esprimenti mentre il loro numero è stato ridotto di 20 volte (Figura 2A). La relazione inversatra il numero e le dimensioni dei SGs (Figura 2A) ha suggerito che l'allargamento Rab5-mediata del SGs comporta la loro fusione omotipica. Il gigante NPY-MRFP contenenti SG formate da CA Rab5A microscopio confocale permette l'imaging di cellule viventi in una ad alta risoluzione che consente il monitoraggio SGS in dettagli che non potevano essere possibile altrimenti. Ad esempio, abbiamo rilevato Rab5A in fusione SG insieme strutture più piccole sparse tra il gigante SG, probabilmente corrispondenti a endosomi (Figura 2b). Inoltre, abbiamo dimostrato che Rab5 transitoriamente e preferibilmente associati con lo SGS di nuova formazione che suggeriscono che l'associazione selettiva e transitoria delle Rab5A con nuova formazione SGS è compatibile con un apparato fusogenica in cui solo granuli appena generati hanno la capacità di fondersi con altri SG 30.
La figura 3 mostra le immagini time-lapse rappresentativi di MC gigante SG che si sono formate per l'espressione di CARab5A e la cinetica di esocitosi nella risoluzione di un singolo SG dopo stimolazione. Durante MC esocitosi, SGS si muovono verso e si fondono con la membrana plasmatica. Come conseguenza il carico secretoria viene rilasciato dalle cellule nello spazio extracellulare. In questo sistema sperimentale, NPY-MRFP viene rilasciata dalle cellule e trova nelle cellule surnatanti. La fluorescenza di NPY-MRFP nei sovranatanti di cellule può essere misurata con un lettore di fluorescenza. Tuttavia, poiché NPY-MRFP è diluito nei sopranatanti suo segnale di fluorescenza può non essere rilevato o visualizzate al microscopio a fluorescenza. Il rilascio di NPY-MRFP dai granuli durante risultati esocitosi in una diminuzione rapida e drammatica in NPY-MRFP intensità di fluorescenza e ritiro del NPY-MRFP contenenti SGS e la loro disappearance.Therefore, imaging cellulare dal vivo di cellule e misure di NPY stimolate fluorescenza -mRFP o NPY-MRFP dimensioni contenente SG forniscono valutazioni accurate delle cinetiche di esocitosi disingoli granuli. Figura 3B mostra le intensità di fluorescenza di SG dopo stimolando le cellule con un Ca 2+ ionofori. SGS subiscono esocitosi a tempi diversi (ad esempio, 2, 3, 6, e 11 min di stimolazione postale), mentre l'intensità di fluorescenza di un singolo SG che non fonde con la membrana plasmatica è rimasta costante.
Figura 1:. Illustrazione delle principali fasi del protocollo RBL cellule sono cotrasfettate con NPY-MRFP e un secondo gene di interesse o corrispondente di controllo plasmide e subito seminate su vetrini, 8 pozzetti sistema coverglass borosilicato camera o piastre a 96 pozzetti. Il giorno dopo, Immagini della NPY-MRFP contenenti SGS di riposo e le cellule attivate vengono acquisiti mediante microscopia confocale (A). Inoltre, esocitosi di Resting e innescato cellsis quantificato misurando il rilascio di NPY-MRFP in un lettore di fluorescenza 96 pozzetti (B).
Figura 2:. Quantificazione delle dimensioni SGs 'RBL cellule sono state co-trasfettate con NPY-MRFP e sia GFP o GFP-CA Rab5A e seminate su 8 pozzetti sistema coprioggetti borosilicato camera. 24 ore più tardi, la camera 8 pozzetti è stata posta in microscopio confocale laser attrezzato camera riscaldata (37 ° C). Immagini Z-stack di immagini successive con fette ottiche 0,7 micron sono stati catturati con un / 1,4 obiettivo apertura numerica 63X olio. Le immagini sono state deconvoluto e tre immagini di dimensione sono stati costruiti dal software Imaris. Il volume della SGS e il loro numero sono stati calcolati usando il software Imaris (A). Parte della Granu NPY-MRFP contenentiles sembra essere incorporato all'interno Rab5A (punte di freccia). Altri sono nudi o ponte con Rab5A (frecce). Bar Scala = 5 micron (B). Cliccate qui per vedere una versione più grande di questa figura.
Figura 3:. Misura la portata e cinetica di esocitosi nella risoluzione di una singola SG in cellule activatedRBL RBL cellule sono state co-trasfettate con NPY-MRFP e GFP-CA Rab5A e sistema coverglass seminato in8-bene borosilicato camera. 24 ore più tardi camera IN8-pozzo è stato collocato in un microscopio confocale laser dotato di una camera riscaldata (37 ° C) e le cellule sono state innescato con 10 mM Ca2 + ionoforo. Le immagini sono state acquisite ogni 15 secondi con un / 1,4 obiettivo apertura numerica 63X olio. Immaginierano deconvoluto e poi elaborati dal software Imaris. Bar Scala = 5 micron (A). L'intensità di fluorescenza media dei NPY-MRFP contenenti granuli è stato determinato dal software Imaris ei dati sono stati normalizzati in base al tempo 0 (tempo di aggiunta del Ca2 + ionoforo). Le frecce rappresentano i punti di tempo in cui il rilascio di SGcargo wasnoted (B). Cliccate qui per vedere una versione più grande di questa figura.
Descriviamo una strategia innovativa che combina la quantificazione di MCs esocitosi e quattro (x, y, z, t) quantificazioni dimensione da immagini tridimensionali e ritardi delle SG in cellule viventi con un gene reporter per esocitosi. Questa tecnica consente proiezione di famiglie di proteine per il loro impatto sulla funzione MC come SGs monitoraggio inizio già a loro uscita dal Golgi attraverso la loro maturazione, acquisizione di competenze esocitosi e degranulazione. La combinazione di misure di esocitosi insieme caratterizzazioni morfometriche e cinetici della SG fornisce informazioni sui meccanismi con cui le proteine testate mediano funzioni MC. Pertanto, con questa metodologia, la manipolazione genetica dei geni mirati può svelare nuovi meccanismi molecolari con cui il negozio MC SGS e rilasciare il loro carico. In particolare, NPY può servire come reporter per esocitosi in altre cellule secernenti quali MCF-7 cellule, una linea cellulare derivata from una ghiandola mammaria adenocarcinoma umano 31, cellule cromaffini 34 e pancreatiche β-cellule 35.
Manipolazioni genetiche sono gli strumenti più potenti attualmente disponibili per la ricerca di reti funzionali. Manipolazioni genetiche permettono l'identificazione di proteine essenziali in ogni rete, la cui eliminazione imporrà collasso del sistema, a differenza di altre proteine, la cui eliminazione imporrà diafonia tra reti parallele o non hanno alcun effetto dovuto alla ridondanza. Tuttavia, a causa della bassa efficienza di trasfezione di MC, quando si misura esocitosi di mediatori endogeni solo una piccola frazione di cellule esprime il 'manipolare' DNA test. Quindi, quando si misura esocitosi di mediatori endogeni, il contributo delle cellule trasfettate la lettura totale è minore. Pertanto, il tentativo di adottare tale approccio per esplorare le reti complesse associate alla esocitosi regolata in MCs era ettarimpered. Questa tecnica supera l'ostacolo della bassa efficienza di trasfezione e fornisce un modo semplice per osservare alternanze fenotipiche MC SG causate da over espressione, atterramento e mutagenesi di geni di interesse.
Questa tecnica può essere estesa per indagare la gerarchia e la modalità di interazione di reti funzionali utilizzando transitoria triple-trasfezione. I risultati saranno analizzati per determinare quale gene può salvare un certo fenotipo; causare un fenotipo più drammatico o non hanno alcun effetto. Sulla base di tali trasfezioni combinatorie, reti esocitosi possono essere costruiti. Ad esempio, utilizzando triple-trasfezione siamo stati in grado di identificare la proteina SNARE VAMP8 come mediatore a valle nel processo di Rab5-dipendente SG fusion 25.
Questo metodo permette la visualizzazione e la quantificazione della esocitosi nella risoluzione dei singoli SGS. Infatti siamo stati in grado di dimostrare che SGS risposte differenziali display STIMUli. La ragione per cui certe SG fuse con la membrana plasmatica, mentre altri non hanno fatto o la ragione per la cinetica differenziali di MC SG fusione restano da determinare. Futuri studi che utilizzano questo approccio sperimentale hanno il potenziale per rispondere a queste domande. Ad esempio, la quantificazione delle diverse SNAREs o Rabs sulle singole SGS e correlazione con competenze esocitosi e la cinetica del esocitosi nella risoluzione di una singola SG dovrebbe rivelare nuovi regolatori di esocitosi.
Il limite principale di questa tecnica è la manipolazione genetica causa sovraespressione di una proteina può influenzare la funzione delle cellule o la morfologia. Pertanto, è essenziale per convalidare i risultati con approcci complementari. Ad esempio, quando sovraespressione di un mutante costitutivamente attivo inibisce esocitosi, l'effetto di un costitutiva mutante negativo o abbattere del gene dovrebbe essere testato pure.
Usando questa tecnica, si IDENTIFIED nuovi regolatori di funzioni MC, che colpiscono MC esocitosi o alterano la morfologia del SG. La combinazione di misurazioni esocitosi insieme caratterizzazione morfometrica SG fornisce più profonde intuizioni sulla funzione e meccanismi di azione delle proteine testate.
The authors have no financial conflicts of interest.
Ringraziamo il Dr. U. Ashery per il dono di NPY-MRFP cDNA. Ringraziamo Drs. MJ Kofron, L. Mittleman, M. Shaharbani, e Y. Zilberstein per la preziosa assistenza di microscopia e analisi dell'immagine. Ringraziamo anche il Dr. Joseph Orly per la lettura critica di questo manoscritto. Questo lavoro è stato sostenuto da un finanziamento della Israel Science Foundation, fondata dall'Accademia di Israele per le Scienze (1139-1112 di RS-E.).
Name | Company | Catalog Number | Comments |
DMEM | Sigma-Aldrich | D6046-500ML | Warm in 37 °C water bath before use |
Fetal Bovine Serum | GE health care Life sciences | SH30071.01 | |
Penicillin-Streptomycin | Life technologies | ||
Cellulose acetate membrane, pore size 0.22 μm | Sigma-Aldrich | CLS430769-1EA | |
Corning tissue-culture treated culture dishes | Sigma-Aldrich | CLS430167 | |
Trypsin/EDTA Solution (TE) | Life technologies | R001100 | Warm in 37 °C water bath before use |
PIPES dipotassium salt | Sigma-Aldrich | 108321-27-3 | |
Calcium acetate hydrate | Sigma-Aldrich | 114460-21-8 | |
Magnesium acetate tetrahydrate | Sigma-Aldrich | M5661 | |
L-Glutamic acid potassium salt monohydrate (Potassium glutamate) | Sigma-Aldrich | G1501 | |
4 mm electroporation cuvettes | cell projects | EP-104 | |
GENE PULSER WITH PULSE CONTROLLER & CAPACITANCE | Bio rad | ||
Chambered coverglass | Thermo scientific | 155411 | |
24 well, flat bottom | Sigma-Aldrich | CLS3524 | |
Corning 96 well plates | Sigma-Aldrich | CLS3367 or CLS390 | |
96 well plate fluorescence reader- Infinite 200 | Tecan | ||
Calcium ionophore A23187 | Sigma-Aldrich | C7522 | Avoid from direct light exposure |
12-O-tetradecanoyl-13-acetate (TPA) | Calbiochem | P3766 | |
anti-DNP monoclonal IgE | Sigma-Aldrich | D8406 | |
DNP-BSA/ DNP-HAS | Sigma-Aldrich | A6661 | Avoid from direct light exposure |
Triton-x-100 | Sigma-Aldrich | T8787 | |
Confocal fluorescent microscope: | |||
Zeiss LSM 510 | |||
Leica | SP5 | ||
Nikon A1 inverted | |||
Imaris software | BITLANE | ||
Microsoft exel or Prism or other analyses software | |||
Other reagent: | |||
Magnesium Chloride | MERK | 5833 | |
Sodium chloride | MERK | 6404 | |
Calcium chloride | MERK | 2382 | |
Bovine serum albumin | Sigma-Aldrich | A4503 | |
Glucose | BDH Laboratories | 284515V | |
Monosodium phosphate | MERK | 5345 | |
Sterile water |
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