מקור: מעבדות של ד"ר איאן פפר וד"ר צ'ארלס גרבה - אוניברסיטת אריזונה
מחבר מפגין: בראדלי שמיץ
האדמה כוללת את השכבה הדקה על פני כדור הארץ, המכילה גורמים ביוטיים ואביוטיים התורמים לחיים. החלק האביוטי כולל חלקיקים אנאורגניים הנעים בגודלם ובצורתם הקובעים את מרקם הקרקע. החלק הביוטי משלב שאריות צמחים, שורשים, חומר אורגני ומיקרואורגניזמים. שפע חיידקי הקרקע ומגוון הוא נרחב, כמו גרם אחד של אדמה מכיל 107-8 חיידקים, 106-8 actinomycetes, 105-6 פטריות, 103 שמרים, 104-6 פרוטוזואה, 103-4 אצות, ו 53 נמטודות. יחד, הגורמים הביוטיים והאביוטיים יוצרים ארכיטקטורות סביב שורשי הצמח, המכונה הריזוספירה, המספקות תנאים נוחים למיקרואורגניזמים בקרקע.
גורמים ביוטיים ואביוטיים מקדמים את החיים בקרקעות. עם זאת, הם גם תורמים דינמיקה מלחיצה המגבילה חיידקים. מתח ביוטי כרוך בתחרות בין החיים כדי להסתגל ולשרוד בתנאים סביבתיים. לדוגמה, חיידקים יכולים להפריש חומרים מעכבים או רעילים כדי לפגוע במיקרואורגניזמים שכנים. פניציליום נוטטום הוא פטרייה ידועה לשמצה, כפי שהוא מפחית את התחרות על חומרים מזינים על ידי ייצור מיקרוביאלית, אשר בני אדם לקצור כדי ליצור פניצילין התרופות. לחצים אביוטיים נובעים ממאפיינים פיזיים או כימיים המגבילים את ההישרדות המיקרוביאלית, כגון אור, לחות, טמפרטורה, pH, חומרים מזינים ומרקם.
התבוננות ישירה בקשרי הגומלין בין אורגניזמים, חלקיקים והתנהגויות בקרקע בסביבות קרקע שונות היא קשה, אך בדיקת שקופיות המגע, הידועה גם כניקת הגלישה הקבורה, שפותחה על ידי רוסי ואח ' (1936) מספקת נקודת מבט למיקרוביולוגיה של הקרקע. שיטה זו שימושית לצפייה בפטריות קרקע, אקטינומיצטים וחיידקים באמצעות מיקרוסקופיה. אמנם, זה לא מיועד לכימותים מיקרוביאליים, כפי שהוא מרמז רק חלק קטן אחד של סביבה הטרוגנית גדולה יותר.
שיטה זו מבוצעת בקלות על ידי קבורת שקופית זכוכית לתוך האדמה במשך מספר ימים, ולאחר מכן תיקון המיקרואורגניזמים על השקופית עם חומצה אצטית. החיידקים מוכתמים בצבע רוז בנגלי ונצפתם באמצעות מיקרוסקופיה באמצעות טבילת שמן במטרה 100X. ניתן להבחין בין שלוש קבוצות מיקרוביאליות, שכן חיידקים מופיעים כצורות מעוגלות קטנות, חוטי אקטינומיצ'ט כחוטות דקות, והייפ פטרייתי כחוטים עבים. בקרקע, כמעט כל החיידקים קטנים ועגולים יותר מאלה בתרבות הטהורה בשל מתח תזונתי, מה שגורם להתכווצות ועיגול למשטח נוח יותר: יחס נפח. הצורות הכהות הלא סדירות שאינן מוכתמות הן חלקיקי אדמה. ניתן להוסיף תיקונים תזונתיים שונים לקרקע כדי לספק מקורות פחמן וגלוקוז המקדמים צמיחה מיקרוביאלית ואינטראקציות. טכניקה זו מאפשרת תצפית קלה על מיקרוביולוגיה הקרקע ומסייעת לזהות מספר אורגניזמים הקיימים בסביבה.
1. הכנת מיקרוקוסמוס של שקופית הקרקע
2. כתמי שקופיות ומיקרוסקופיה
איור 1. שקופית מתחת למיקרוסקופ.
פטריות מציגות הייהה עבה, חוטית(איור 2). Actinomycetes להציג hyphae דק, filamentous. חיידקים מציגים צורות קטנות של קוצ'י או מוט. הם נמצאים לעתים קרובות בגושים, על חלקיקי אדמה, או רירית hyphae פטרייתי. חלקיקי קרקע מציגים צורות כהות ולא סדירות(איור 3).
איור 2. תמונת שקופית מגע באמצעות עדשה אובייקטיבית 100X.
התמונה באדיבות ו.ה. פולר.
איור 3. תמונת שקופית מגע באמצעות עדשה אובייקטיבית 100X.
התמונה באדיבות ו.ה. פולר.
בדיקת שקופיות המגע, המכונה גם שקופית קבורה, היא טכניקה פשוטה המשמשת להתבוננות איכותית בביוטה הקרקע. בדיקת אסקור זו מראה באופן איכותי את האינטראקציות המרחביות בין hyphae פטרייתי, חוטי actinomycete, חיידקים, וחלקיקי קרקע. יחידים או תעשייה יכולים להשתמש בבחינה זו כדי לאסוף ידע על בריאות האדמה הספציפית בכל הנוגע לחקלאות, גינון, קומפוסט, הוראה ולימוד. עם זאת, טכניקה זו אינה לכמת את ביוטה מיקרו הקרקע, כפי שהוא מקיף רק דיוקן קטן של סביבה הטרוגנית גדולה יותר.
ניתן להבחין ביחסי אורגניזם קרקע על ידי ביצוע בדיקות שקופיות מגע וצפייה בתוצאות באמצעות מיקרוסקופיה טבילת שמן 100X(איורים 2 ו -3). הפשטות והקלות בביצוע בדיקת ההסתה הזו הופכת אותה לטכניקת התחלה נהדרת עבור אלה שמעולם לא נחשפו למיקרוביולוגיה ועשויים לצפות במיקרואורגניזמים דרך מיקרוסקופ בפעם הראשונה.
Skip to...
Videos from this collection:
Now Playing
Environmental Microbiology
42.2K Views
Environmental Microbiology
359.4K Views
Environmental Microbiology
126.4K Views
Environmental Microbiology
100.3K Views
Environmental Microbiology
57.3K Views
Environmental Microbiology
28.8K Views
Environmental Microbiology
44.6K Views
Environmental Microbiology
40.4K Views
Environmental Microbiology
47.8K Views
Environmental Microbiology
29.5K Views
Environmental Microbiology
39.3K Views
Environmental Microbiology
40.7K Views
Environmental Microbiology
184.4K Views
Environmental Microbiology
296.0K Views
Environmental Microbiology
13.8K Views
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved