Method Article
מחקר במחוז יוזגת מצא כי גורמים ביוטיים, כגון מחלות פטרייתיות כמו נבילה וריקבון שורשים, מגבילים את ייצור העדשים. מבודדי פוסריום נמצאו ב-95.4% מהדגימות, מה שמרמז על סקרים מקומיים תקופתיים וניטור קבוע לפיתוח טכנולוגיה בת קיימא ואסטרטגיות בקרה יעילות.
עדשים הן צמח קטניות חשוב המאביק את עצמו. ייצורו מוגבל על ידי גורמים ביוטיים שונים, במיוחד חומרים פטרייתיים הגורמים לקומפלקס הנבילה וריקבון השורשים. המחקר נועד להבין את האפידמיולוגיה והאטיולוגיה האזורית של גורמים פטרייתיים פיטופתוגניים כדי לפתח אסטרטגיות בקרה נגד Fusarium spp הנישא בקרקע. מחקר זה חקר 83 יישובים לזריעת עדשים במחוז יוזגת עבור מחלות נבול, שורש וריקבון כתר הנגרמות על ידי מיני פוסריום נפוצים במהלך 2022 ו-2023. צמחי עדשים סימפטומטיים נאספו לבידוד וזיהוי פטרייתי. מבודדי הפוסריום קובצו לפי מורפולוגיה של המושבה ותורבו על מדיום PDA. יתר על כן, DNA גנומי שהתקבל מבודדי Fusarium נותח באמצעות PCR והושווה לבודדי Fusarium אחרים הרשומים ב-NCBI GenBank. הקשרים הגנטיים בין מבודדי Fusarium נקבעו בשיטת Maximum Parsimony (MP) בתוכנית Mega 11. התוצאות, השכיחות הממוצעת ושיעור חומרת המחלה של מחלות נבילה וריקבון שורשים במחוז יוזגת נקבעו כ-16.9% ו-38.6%, בהתאמה. מבודדי פוסריום נמצאו ב-95.4% מהדגימות. הייתה הומוגניות של רצף נוקלאוטידים של 99.5% עד 100% בקרב מבודדים של F. oxysporum, F. culmorum, F. graminearum, F. acuminatum ו-F. solani , והמין המבודד ביותר היה F. oxysporum. הדנדרוגרמה MP של מבודדי Fusarium חולקה לשני ענפים עיקריים, הענף הראשון כלל את כל מבודדי F. solani . הענף העיקרי השני כלל מיני Fusarium אחרים שבודדו במחקר הנוכחי וב-NCBI GenBank. המחקר מציע סקרים מקומיים תקופתיים כדי לקבוע את תדירות נבילת הפוסריום לדיכוי בעדשים. מומלץ מאוד לדכא בזמן נזקים מבוססי פוסריום כדי לשלוט במחלה ולשמר את מערכת ייצור העדשים.
עדשים (Lens culinaris Medik.), קטנית קטנה למאכל השייכת למשפחת Fabaceae, היא יבול המאביק את עצמו בעונה קרירה עם עלים דמויי מחט ופרחים לבנים עד סגולים בהירים או סגולים כהים1. הוא בוית על ידי בני אדם לפני כ-10,000 שנה בחלק המסופוטמי של הסהר הפורה והתפשט במהירות לעולם החדש, כולל אגן הים התיכון ומרכז אסיה, ומאוחר יותר התאזרח באמריקה2. שטח גידול העדשים העולמי הוא כ-5.5 מיליון דונם עם ייצור של 6.6 מיליון טון3. טורקיה מדורגתבמקום הרביעי בייצור עדשים אחרי קנדה, הודו ואוסטרליה. גידול עדשים בטורקיה חשוב מאוד ומהווה 6.7% מהייצור העולמי. סך ייצור העדשים של טורקיה הוא 474,000 טון והוא מיוצר בלפחות 40 מחוזות4. כ-89.5% מייצור העדשים בטורקיה מורכב מעדשים אדומות וירוקות, המהוות 10.5% מיבול החורף באזור דרום מזרח אנטוליה. שאר היבול גדל כגידולי קיץ. מחוזות יוזגאט (39.5%), קוניה (23.7%), קירשהיר (16.3%), צ'ורום (7.6%) ואנקרה (2.9%) תורמים במידה רבה לייצור העדשים הירוקות4. ייצור עדשים יכול להיות מוגבל על ידי גורמי לחץ ביוטיים ואביוטיים. כפור ובצורת הם גורמי הלחץ האביוטיים הנפוצים ביותר בייצור עדשים ירוקות בקיץ5. מחלות פטרייתיות כמו קומפלקס ריקבון נבול, שורש וכתר הנגרמות על ידי Ascochyta lentis, Rhizoctonia solani, R. bataticola, Aphanomyces euteiche, Pythium ומיני Fusarium הן המחלות הפטרייתיות החשובות ביותר, הגורמות לשילוב של מחלות כולל שיכוך, דלקת שתילים, נבילה וריקבון שורשים, בהתאם לעיתוי ההדבקה, רגישות המארח ותנאים מטאורולוגיים 6,7, 8.
פוסריום היא פטרייה חוטית לא מושלמת הנמצאת באדמה, בצמחים ובמצעים אורגניים והיא סוג קוסמופוליטי בין פתוגנים אלה9. הוא גורם למחלות שונות כגון נבילת פוסריום, ריקבון שורש וריקבון צווארון שורש, כמו גם דלקת ראש פוסריום בחיטה, נבילת פוסריום בקוקורביטים וריקבון שורשים ברוב הקטניות, כולל עדשים 10,11,12. ריקבון צווארון הנבילה של כלי הדם, השורש והשורש הנגרם על ידי Fusarium spp. היא המחלה החשובה ביותר של עדשים באזורי גידול עדשים רבים ברחבי העולם10. Fusarium oxysporum הוא מין הפוסריום הנפוץ ביותר הקשור לריקבון נבול, שורש ושורש בעדשים. ברחבי העולם, מחלות נבולה, שורש וריקבון כתר נגרמות על ידי F. graminearum, F. sporotrichioides, F. equity, F. acuminatum, F. redolent, F. avenaceum, F. culmorum, F. solani ו- F. verticillioides באזורי שתילת עדשים7. מחלות ריקבון שורש וכתר הנגרמות על ידי Fusarium spp. מתרחשות הן בשלבי השתיל והן בשלבי הבגרות וגורמות לנבילה פתאומית, ייבוש ובסופו של דבר מוות של העלים. תסמיני המחלה כוללים ריקבון זרעים, ריקבון שורשים, עלעלים עליונים נבולים, עיכוב, התכווצות וסלסול עלים. בשלבים האמצעיים והמאוחרים של מילוי התרמילים, הזרעים בדרך כלל מתכווצים, ותסמיני השורש כוללים עיכוב בצמיחה, שינוי צבע חום, קצות שורשים פגומים והתפשטות של שורשים משניים. ייתכן שלא נראה שינוי צבע של רקמת כלי הדם בכל המקרים13.
באזור מרכז אנטוליה נערכו מחקרים על מצב מחלות נבילה וריקבון שורשים בעדשים במספרים מוגבלים. ליוזגת יש אקלים מתון ומתון עם שפע גשמים בחורף בהשוואה לקיץ והיא מסווגת כ-Dsb (אקלים יבשתי חם ולח) על ידי קופן וגייגר14. הטמפרטורה הממוצעת היא 9.6 מעלות צלזיוס עם משקעים ממוצעים של 512 מ"מ. יוזגת ממוקמת בחצי הכדור הצפוני. הקיץ מתרחש ביוני, יולי, אוגוסט וספטמבר. חשוב מאוד שיהיה מידע על האפידמיולוגיה והאטיולוגיה האזורית של הגורמים הפטרייתיים הפיטופתוגניים הגורמים למחלה לפיתוח אסטרטגיות בקרה שונות נגד Fusarium spp. הנישאים באדמה, כדי לשלוט במחלה15. בהקשר זה, מטרות המחקר הנוכחי הן לקבוע ולזהות - את פרמטרי המחלה (שכיחות, שכיחות וחומרת המחלה) של מחלות נבולה, שורש וריקבון כתר בעדשים על ידי ביצוע סקר במחוז יוזגת, שם כ-40% מכלל ייצור העדשים הירוקות נעשה לבד, הפוסריום הפתוגני מינים הגורמים לנבילה וריקבון שורשים בעדשים על ידי ניתוחים מורפולוגיים ומולקולריים, ולקבוע את רמות האלימות האישיות של מיני הפוסריום על ידי ביצוע בדיקות פתוגניות.
הערה: פרטי הריאגנטים והציוד המשמש במחקר מפורטים בטבלת החומרים.
1. סקר שדה, דגימה ובידוד פטרייתי
הערה: עבודות הסקר בוצעו בשנים 2022 ו-2023, על פי Endes16. בסך הכל נצפו 83 אזורי שתילת עדשים המכסים תשעה מחוזות במחוז יוזגת עבור מחלת ריקבון צווארון נבול, שורש ושורש (איור 1).
2. נתונים מטאורולוגיים
3. זיהוי מורפולוגי
4. זיהוי מולקולרי
הערה: ה-DNA הגנומי הכולל של מבודדי הפוסריום חולץ בשיטה הבאה, ששונתה מעט מהפרוטוקול של Cenis23. ניתוחי PCR ואלקטרופורזה של מבודדי פוסריום בוצעו באמצעות הפרוטוקול שתואר על ידי אראס ואנדס24.
5. מבחן פתוגניות
קביעת פרמטרים של מחלה
בסך הכל נסקרו 83 אזורי זריעת עדשים המכסים תשעה אזורים שונים של יוזגת במונחים של תסמיני מחלת נבול, שורש וריקבון עטרה, המשתרעים על פני שטח של 1.1984 x 106 מ"ר (טבלה 2). תסמיני מחלת נבילה או ריקבון שורשים נתקלו בכל התחומים. עם זאת, שכיחות מחלת הנבילה וריקבון השורשים ביוזגת נקבעה כ-16.9%, עם חומרת מחלה של 38.6% במחוזות סורגון וסריקאיה. שכיחות ניכרת של המחלה נקבעה גם במחוזות שפאטלי (26.4%), בוגאזליאן (23.0%) וסורגון (20.1%). באופן פרדוקסלי, אחוז חומרת המחלה הגבוה ביותר נקבע במחוז סורגון עם 45.2%, ואחריו בוגאזליאן עם 36.0% וסאריקאיה עם 35.4%. יתר על כן, 679 צמחים הראו תסמיני מחלה בדגימות שנאספו משדות העדשים של האזורים המסומנים שנבדקו (טבלה 3). לאחר מכן בוצע זיהוי מורפולוגי של החומרים הפטרייתיים המבודדים המופצים בשתי קבוצות. מבודדי פוסריום שסווגו בקבוצה הראשונה כללו פתוגנים או ספרופיטים כגון Alternaria sp, Ascochyta sp. ו-Rhizoctonia sp. אחוז שיעור הבידוד של מבודדי פוסריום היה 95.4%. F. oxysporum נקבע כמין הפטרייה המבודד ביותר מצמחי עדשים המראה תסמיני מחלה ב-Yozgat עם אחוז בידוד של 59.5%. אחרי מין Fusarium פתוגני זה הגיעו F. graminearum (15.8%) ו-F. culmorum (10.2%). באופן פרדוקסלי, F. solani (4.4%) ו-F. acuminatum (5.5%) בודדו ברמות נמוכות יותר מצמחים שהראו תסמיני מחלה. F. oxysporum התקבל מכל המחוזות שבהם נערך מחקר הסקר, ואחוז שיעור הבידוד לפי המחוזות התחלק בין 45.3% ל-72.2%. F. oxysporum בודד הכי הרבה במחוזות המרכז (72.2%), שפאטלי (71.9%), אקדאמדני (68.3%) וסורגון (62.2%) של יוזגת. לעומת זאת, F. solani ו-F. acuminatum היו מיני הפוסריום הכי פחות מבודדים ב-Yozgat. פ. סולאני לא היה מבודד ממחוזות צ'קרק ומרכז; F. acuminatum גם לא בודד ממחוזות Akdağmadeni, Central ו-Şefaatli (טבלה 3).
זיהוי מורפולוגי
תרביות טהורות של מבודדי פוסריום זוהו מורפולוגית על פי מאפייני המושבה שלהם, כמו גם מבני מיקרו-קונידיה, מקרו-קונידיה וכלמידוספור. מחקרי זיהוי בוצעו ברמת המינים, על פי לסלי וסאמרל22. כל המבודדים הפטרייתיים שהתקבלו מצמחים המראים תסמיני ריקבון נבול, שורש ושורש על עדשים נאספו בשש קבוצות על פי המושבה והמיקרו-מורפולוגיה שלהם (טבלה 3). בעוד שחמש הקבוצות הראשונות כללו מבודדים השייכים למיני Fusarium, הקבוצה השנייה כללה מבודדים פטרייתיים פתוגניים שאינם הסוג Fusarium, כגון Alternaria, Rhizoctonia ו-Ascochyta.
לבודדים של F. oxysporum עם שיעור הבידוד הגבוה ביותר יש מושבות לבנות עד צהובות ופיגמנטציה לילך-סגולה. המקרוקוניה קצרה עד בינונית, מעוקלת מעט, ובדרך כלל יש לה 3-5 מחיצות. מבנה הנבגים של חלק מהמבודדים מחובר מעט לממדי מקרוקונידיה שנקבעו כ-33.8 עד 71.5 מיקרומטר x 3.1 עד 4.5 מיקרומטר. מיקרוקונידיות הן בדרך כלל לא מחורצות, סגלגלות, אליפטיות או בצורת כליה. היווצרות כלמידוספור התרחשה באיטיות (4-6 שבועות). הוא נצפה באשכולות כפולים ובמבנה שרשרת קצר16.
המין השני בעל שיעור הבידוד הגבוה ביותר, F. graminearum מבודד, הוא בעל תפטיר אווירי לבן-ורוד ופיגמנטציה אדומה כהה. המקרוקונידיות דקות, ישרות או מעוקלות מעט, עם חמש עד שבע מחיצות. המחיצות נבדלות למדי. יש לו תא אפיקלי מחודד ותא בסיס בצורת כף רגל מובהקת. הממדים הם 25.7 עד 97.3 מיקרומטר x 3.5 עד 5.5 מיקרומטר. היווצרות מיקרוקונידיה וכלמידוספור לא נצפו28.
מושבות של F. culmorum מבודדים בקבוצה השלישית היו בתחילה לבנות, אך עם הגיל נצפה מבנה תפטיר ורוד בהיר עד ורוד כהה. מקרוקונידיות קצרות, 4-6 מחיצות ומעוקלות מעט. מידות Macrospore; 15.8 - 60.0 מיקרומטר x 3.2 - 5.1 מיקרומטר. הם רבים. מיקרוספורים לא נצפו. היווצרות כלמידוספור מהירה בהשוואה למינים אחרים (3-5 שבועות). הם נמצאים בודדים או באשכולות שלשניים 29.
המושבות של המין הרביעי, F. acuminatum isolates, הן כתומות בהירות, כתומות ובורדו בהיר. זהו מין שגדל לאט יחסית. המקרוקונידיה שלו דקה, בעלת עקמומיות מובהקת ובעלת מבנה מחיצה של 3-5. מידות המקרוקונידיה נקבעו כ-31.0-65.5 ×-4.3-6.6 מיקרומטר. למיקרוקונידיה יש 0 ו-1 מחיצה. הוא נצפה לעתים רחוקות בתמונות מיקרוסקופיות. היווצרות כלמידוספור איטית מאוד (יותר מ-6 שבועות). הוא נוצר בשרשראות ובאשכולות22.
צבע המושבה של המין הפתוגני האחרון שזוהה, F. solani isolate, הוא לבן וצבע קרם. המקרוקוניה שלו רחבה, שטוחה ומעוקלת מעט. קורים הם 3-7 מחיצות ושופעים. מידות המקרוספור נקבעות כ-20.2 עד 50.6 מיקרומטר x 3.1 עד 6.2 מיקרומטר. מיקרוקונידיות אינן מחולקות או מחולקות 1. הם סגלגלים ואליפסואידים במבנה. כלמידוספורים נמצאים באופן סופי בשרשראות קצרות במדיום CLA תוך 2-4 שבועות30.
זיהוי מולקולרי
PCR בוצע באמצעות פריימרים ITS4/ITS5 עם DNA גנומי כולל שהתקבל מבודדי Fusarium . רצפי הבסיס הדו-כיווניים (5'-3' ו-3'-5') נרשמו והושוו ל-NCBI GenBank אחרים באמצעות תוכנית Blast (טבלה 4 וטבלה 5). מבודדי F. oxysporum הראו הומוגניות של 99.5% עד 100% ברצף נוקלאוטידים עם מבודדים מהודו (MT740398), ליטא (KF646094) וגרמניה (MT453296). מבודדי F. culmorum הראו הומוגניות של 100% רצף נוקלאוטידים עם מבודדים מקנדה (AY147290), צרפת (OW983123) וצ'כיה (MT453296). מבודדי F. graminearum הראו הומוגניות של 99.5% עד 100% ברצף נוקלאוטידים עם מבודדים מקולומביה (MT598163) וסין (ON527490). מבודדי F. acuminatum הראו הומוגניות של 99.5% עד 100% ברצף נוקלאוטידים עם מבודדים מאוזבקיסטן (OR975902) וסין (MZ424810, PP336554). מבודדי F. solani הראו הומוגניות של 100% רצף נוקלאוטידים עם מבודדים ממצרים (OR713084), סין (PQ482231) והודו (OP848138). לאחר מכן, הקשר הגנטי בין מבודדי Fusarium נקבע על ידי העץ הפילוגנטי שהתקבל על פי שיטת Maximum Parsimony (MP) באמצעות תוכנית Mega 11 (איור 3). בעץ הפילוגנטי MP נעשה שימוש ב-638 תווי נוקלאוטידים, כולל פערים, ו-145 מהנוקלאוטידים הללו נקבעו כאזורים אינפורמטיביים המספקים חסכון. ניתוחי MP הניבו את אחד העצים החסכוניים ביותר (איור 3; אורך העץ: 172; מדד עקביות (ConI): 0.974; מדד שימור (RI): 0.961; מדד משולב (ComI): 0.7600). כאשר נבדקה דנדרוגרמה MP זו של מבודדי פוסריום , עץ המשפחה חולק תחילה לשני ענפים עיקריים. הראשון מביניהם תאם את כל מבודדי F. solani הנתמכים על ידי ערך אתחול של 100%. הענף העיקרי השני נאסף בתוך עצמו עם ערך אתחול של 78% וארבע תת-קבוצות F. acuminatum, F. redolens, F. proliferatum ו-F. acutatum. הענף העיקרי השני חולק לחמש תת-קבוצות: F. oxysporum, F. culmorum, F. graminarum, F. pseudograminearum ו-F. equiseti, עם ערך אתחול של 97%.
קביעת רמות האלימות של מבודדי פוסריום
תוצאות מחקרי הפתוגניות של Fusarium spp. שבודדו מעדשים המראים נבילה וריקבון שורשים, שעבורם הושלמו מחקרי אפיון מורפולוגיים ומולקולריים, מסוכמים בטבלה 6 ובאיור 4. באופן כללי, כל מבודדי הפוסריום הראו הבדלים ברמות החומרה של המחלות שהם גרמו בזן העדשים Kayı 91 F(19-60; 0.05) = 43.06; עמ< 0.0001). המבודדים האלימים ביותר היו F. oxysporum (YBUFol4), F. culmorum (YBUFc1, YBUFc2) ו-F. graminearum (YBUFg1, YBUFg3). חמשת המבודדים הללו נמצאו בעלי רמת אלימות גבוהה מאוד. מצד שני, בודד אחד של F. oxysporum (YBUFol2), F. solani (YBUFs1) ו-F . graminearum (YBUFg2) נמצא כבעל אלימות בינונית. בנוסף, מבודדי F. acuminatum (YBUFa1, YBUFa2, YBUFa3 ו-YBUFa4) נמצאו בעלי אלימות חלשה או נמוכה. כל המבודדים ששימשו במחקרי פתוגניות נעו בין 42.5% ל-97.5% והתקבלו לאחר חיסון שתילי עדשים.
איור 1: צמחי עדשים שהושפעו ממיני Fusarium. (A) מבט כללי על אזורים חולים מקומיים בשדה עדשים עם חומרת מחלה גבוהה. (B) מבט על צמחים עם חומרת מחלה 4. (C) מבט על צמחים עם חומרת מחלה 3. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
איור 2: מבט על צמחי עדשים ברמות חומרת מחלה 0-4. רמה 0 = לא הראתה תסמינים, 1 = תסמיני העלים ב-25%; 2 = 26%-50%; 3 = 51%-75% מהעלים; 4 = יותר מ-75% באותו סדר. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
איור 3: העץ החסכוני ביותר ללא שורשים המבוסס על אזור ITS של Fusarium sp. באמצעות MEGA 11. המבודדים מסומנים בכוכביות. השאר נלקחו מבנק הגנים. אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
איור 4: בידוד מחדש (%) ושיעורי חומרת המחלה (%) של Fusarium spp. מבודד מצמחי עדשים. קווים אנכיים מייצגים את שגיאת התקן בסרגל (n = 16). אנא לחץ כאן לצפייה בגרסה גדולה יותר של איור זה.
טמפרטורה (°C) | לחות יחסית (%) | משקעים (מ"מ) | |||||||
חודש | 2022 | 2023 | לטווח ארוך | 2022 | 2023 | לטווח ארוך | 2022 | 2023 | לטווח ארוך |
Akdağmadeni | |||||||||
מרץ | 11.1 | 7.4 | 3.8 | 45.1 | 68.8 | 71.1 | 21.4 | 78.7 | 60.6 |
אפריל | 11.1 | 11.4 | 8.8 | 59.2 | 67 | 61.5 | 56.5 | 109.8 | 42.6 |
מאי | 16.3 | 15.1 | 12.9 | 64.3 | 73.9 | 64.8 | 48.5 | 83.6 | 74.1 |
יוני | 16.5 | 18.4 | 16.2 | 63.4 | 53.2 | 69.1 | 0.3 | 20.1 | 57.2 |
יולי | 22 | 22.2 | 18.7 | 48 | 40.5 | 60.5 | 1.4 | 0 | 7 |
Boğazlıyan | |||||||||
מרץ | 12.3 | 9.9 | 5.2 | 47.8 | 65.5 | 66 | 13 | 64 | 40.1 |
אפריל | 12.8 | 13.5 | 10.2 | 62.6 | 66.6 | 59.3 | 20.2 | 24.2 | 24.4 |
מאי | 18.7 | 17.7 | 14.6 | 62.5 | 67.4 | 61.2 | 65.4 | 20 | 35.1 |
יוני | 19.7 | 20.6 | 18.6 | 52.9 | 49.9 | 59.9 | 0 | 2.4 | 35.5 |
יולי | 24.3 | 24 | 21.7 | 42.5 | 39.5 | 50 | 0 | 0 | 3.9 |
Çekerek | |||||||||
מרץ | 13.5 | 10.8 | 6.6 | 52.8 | 70.4 | 69 | 24.3 | 111.3 | 48.7 |
אפריל | 14.1 | 13.9 | 11.5 | 63.9 | 72.3 | 61 | 48.1 | 73.4 | 32 |
מאי | 19.3 | 18.6 | 15.8 | 69.1 | 72.7 | 65.4 | 80.3 | 69 | 59.3 |
יוני | 20.1 | 21.8 | 19.4 | 61.5 | 57.5 | 67.8 | 0 | 16.4 | 62.8 |
יולי | 24.6 | 24.7 | 22 | 57.8 | 52.4 | 57.5 | 33.2 | 0 | 10.9 |
יוזגת | |||||||||
מרץ | 11.5 | 8.4 | 4 | 47.3 | 68.7 | 67.5 | 14.6 | 84.8 | 87.3 |
אפריל | 12.4 | 12.7 | 9.3 | 60.1 | 65.2 | 58.7 | 47.4 | 54.4 | 41.9 |
מאי | 17.5 | 16.8 | 13.7 | 64.2 | 68 | 60.2 | 92.6 | 61.6 | 72.2 |
יוני | 18.3 | 20.3 | 17.4 | 57.9 | 50.7 | 61.2 | 1 | 4.8 | 63.6 |
יולי | 22.9 | 23.6 | 20.5 | 50.9 | 44.3 | 52.7 | 7 | 0.2 | 8.8 |
סרייקנט | |||||||||
מרץ | 14.8 | 9 | 6.2 | 50.9 | 71.1 | 71 | 11.1 | 77.3 | 55.3 |
אפריל | 12.5 | 12.3 | 10.5 | 64.6 | 73.2 | 60.7 | 35.3 | 36.1 | 29 |
מאי | 17.6 | 16.4 | 14.2 | 69.1 | 76.7 | 65.9 | 47.8 | 72.4 | 57 |
יוני | 18.2 | 19.2 | 18.2 | 63.8 | 61 | 69.6 | 0 | 28.6 | 56.1 |
יולי | 23.2 | 23.1 | 21.6 | 54.2 | 51.7 | 57.9 | 0 | 0 | 7.4 |
סאריקאיה | |||||||||
מרץ | 12.9 | 9.6 | 5.6 | 47 | 68.2 | 66.5 | 18.4 | 75.5 | 53.6 |
אפריל | 13.2 | 13.1 | 10.7 | 59 | 68.8 | 56.5 | 24.8 | 60.6 | 27.2 |
מאי | 18.5 | 17.3 | 14.7 | 63.2 | 71.6 | 60.6 | 57.6 | 64.5 | 47.2 |
יוני | 18.9 | 20.5 | 18.4 | 59 | 53.9 | 62 | 0 | 16.1 | 50.6 |
יולי | 24 | 24 | 21.3 | 48.6 | 45.4 | 51.5 | 0 | 0 | 6.4 |
שפאאטלי | |||||||||
מרץ | 13.1 | 10.6 | 6.2 | 48.2 | 61.1 | 67 | 12.6 | 71.5 | 50.2 |
אפריל | 11.2 | 14.3 | 11.1 | 61.6 | 60.9 | 58.6 | 48.4 | 50.5 | 26 |
מאי | 19.9 | 18.6 | 15.4 | 66.7 | 61.9 | 62.3 | 65.2 | 95.4 | 53.7 |
יוני | 20.4 | 22.2 | 19.7 | 55.8 | 45.5 | 61.2 | 1.2 | 2.5 | 46.8 |
יולי | 25 | 25.3 | 23.2 | 47.9 | 39.5 | 47.1 | 0 | 0 | 4.1 |
סורגון | |||||||||
מרץ | 12.2 | 9.4 | 4.8 | 48.4 | 68.2 | 67 | 21.6 | 104.2 | 49.8 |
אפריל | 13 | 13.3 | 10.1 | 59.7 | 66.1 | 58.9 | 53.2 | 33.8 | 31.7 |
מאי | 18.3 | 17.4 | 14.5 | 63.7 | 69.1 | 60.9 | 56.6 | 89.6 | 44.2 |
יוני | 18.9 | 20.3 | 18.3 | 56.8 | 53.4 | 61.5 | 0 | 16.6 | 55.2 |
יולי | 23.7 | 23.7 | 21.2 | 50 | 44.9 | 52.9 | 4 | 0 | 7.5 |
ירקוי | |||||||||
מרץ | 15 | 12.1 | 6 | 41.2 | 60.5 | 61.3 | 4.4 | 46.1 | 60.1 |
אפריל | 16.2 | 16.2 | 13.5 | 54.8 | 60.4 | 50.9 | 40.9 | 46.8 | 23 |
מאי | 21.5 | 20.6 | 17.4 | 55.4 | 59.6 | 52.2 | 57 | 23.6 | 35.1 |
יוני | 23 | 24.5 | 20.9 | 45.2 | 41.4 | 56.4 | 0.2 | 0 | 39.1 |
יולי | 27.5 | 27.7 | 24.4 | 38.2 | 35.5 | 42.2 | 0.2 | 0 | 3.5 |
טבלה 1: נתונים מטאורולוגיים של המקום שנסקר בעונת גידול העדשים לפי שנה.
מחוז | מספר שדות | שטח זריעה שנסקר (Decare) | שכיחות המחלה (%) | שכיחות המחלה (%) | חומרת המחלה (%) |
Akdağmadeni | 4 | 43.2 | 100 | 7 | 21.8 |
Boğazlıyan | 4 | 86.4 | 100 | 23 | 36 |
Çekerek | 1 | 2.7 | 100 | 1.6 | 14.4 |
מרכז | 3 | 24.3 | 100 | 5.8 | 23 |
סרייקנט | 6 | 53.3 | 100 | 8.1 | 28.2 |
סאריקאיה | 12 | 189.3 | 100 | 17 | 35.4 |
סורגון | 48 | 683.2 | 100 | 20.1 | 45.2 |
שפאאטלי | 2 | 73.7 | 100 | 26.4 | 23.4 |
ירקוי | 3 | 42.3 | 100 | 9.1 | 32.9 |
הכולל | 83 | 1198.4 | 100 | 16.9 | 38.6 |
טבלה 2: פרמטרים של מחלה, שכיחות, שכיחות וחומרת ריקבון נבול, שורש ושורש בשדות עדשים.
מחוז | מספר הצמחים המשמשים לבידוד | תדירות הבידוד (%) | |||||
ו. אוקסיספורום | ו. קולמורום | פ. סולאני | פ. אקומינאטום | פ. גרמינרום | אחר | ||
Akdağmadeni | 41 | 68.3 | 9.8 | 2.4 | 0 | 14.6 | 4.9 |
Boğazlıyan | 57 | 54.4 | 1.8 | 12.3 | 7 | 15.8 | 8.8 |
Çekerek | 21 | 52.4 | 4.8 | 0 | 23.8 | 9.5 | 9.5 |
מרכז | 36 | 72.2 | 11.1 | 0 | 0 | 13.9 | 2.8 |
סרייקנט | 64 | 45.3 | 12.5 | 7.8 | 4.7 | 21.9 | 7.8 |
סאריקאיה | 148 | 56.8 | 11.5 | 7.4 | 5.4 | 15.5 | 3.4 |
סורגון | 233 | 62.2 | 9.4 | 1.3 | 7.3 | 16.3 | 3.4 |
שפאאטלי | 32 | 71.9 | 15.6 | 3.1 | 0 | 9.4 | 0 |
ירקוי | 47 | 57.4 | 14.9 | 4.3 | 2.1 | 14.9 | 6.4 |
הכולל | 679 | 59.5 | 10.2 | 4.4 | 5.5 | 15.8 | 4.6 |
טבלה 3: מידע על עדשים שנדגמו לתדירות בידוד פטרייתי ממחוז יוזגת בטורקיה.
מיני פוסריום | לבודד | מחוז | מקור בידוד | מספר הצטרפות לבנק הגנים |
ו. אוקסיספורום | YBUFol1 | סורגון | שורש | PQ573109 |
YBUFol2 | בוגזליאן | צווארון שורש | PQ573110 | |
YBUFol3 | סאריקאיה | שורש | PQ573111 | |
YBUFol4 | אקדגמדני | שורש | PQ573112 | |
ו. קולמורום | YBUFc1 | סורגון | שורש | PQ573113 |
YBUFc2 | ירקוי | שורש | PQ573114 | |
YBUFc3 | סאריקאיה | שורש | PQ573115 | |
YBUFc4 | סרייקנט | צווארון שורש | PQ573116 | |
פ. סולאני | YBUFs1 | יוזגת | שורש | PQ573117 |
YBUFs2 | סורגון | שורש | PQ573118 | |
YBUFs3 | צפאטלי | שורש | PQ573119 | |
YBUFs4 | סאריקאיה | שורש | PQ573120 | |
פ. אקומינאטום | יבופ1 | צ'קרק | שורש | PQ573121 |
יבופ2 | בוגזליאן | צווארון שורש | PQ573122 | |
יבופ3 | סאריקאיה | צווארון שורש | PQ573123 | |
YBUFa4 | סורגון | שורש | PQ573124 | |
פ. גרמינרום | YBUFg1 | יוזגת | שורש | PQ573125 |
YBUFg2 | סורגון | שורש | PQ573126 | |
YBUFg3 | סרייקנט | שורש | PQ573127 | |
YBUFg4 | סאריקאיה | צווארון שורש | PQ573128 |
טבלה 4: Fusarium spp. מבודדים מעדשים (Lens culinaris) ממחוז יוזגט, מרכז טורקיה ששימשו במחקר הפילוגנטי.
מיני פוסריום | לבודד | מדינה | מקור בידוד | מספר ההצטרפות של GenBank |
פ. אקומינאטום | AAG4 | לא ישים | Prunus persica | OR975902 |
WHWNSHJ1 | סין | Malus domestica | PP336553 | |
פ. אקוטאטום | סי.בי.אס 739.97 | הודו | לא ישים | MH862669 |
NSF1 | מצרים | טטרנה אלבה | PP038127 | |
ו. קולמורום | 2090 | הודו | לא ישים | KC577191 |
G49 | פולין | Pisum sativum | MH681147 | |
F. equiseti | Fusarium equiseti א577 | סין | פצ'ולי | KX463031 |
Fusarium equiseti א571 | סין | פצ'ולי | KX463025 | |
פ. גרמינרום | Wm-233 | סין | לא ישים | MZ267014 |
טז א | לא ישים | לא ישים | KY272768 | |
ו. אוקסיספורום | YBUFoc4 | טורקיה | Cicer arietinum | OQ954786 |
לוק-8 | סין | חרצית x morifolium | PQ481995 | |
F. proliferatum | סי.בי.אס 246.61 | גרמניה | לא ישים | MH858039 |
סי.בי.אס 186.56 | לא ישים | לא ישים | MH857573 | |
F. pseudograminearum | WZ-8A | סין | חיטה | JN862235 |
GAAET080 | סין | תירס | OK017464 | |
ו. רדולנס | M11 | לא ישים | פטריה | FJ441013 |
2008 | לא ישים | פטריה | FJ467370 | |
פ. סולאני | עונה 2-27 | צרפת | לא ישים | JX537966 |
UENFCF279 | ברזיל | גויאבה | JN006818 |
טבלה 5: רצפים של מיני Fusarium ששימשו מ-GenBank במחקר פילוגנטי.
מיני פוסריום | לבודד | חומרת המחלה (%) א | רמת האלימות של הבידוד | בידוד מחדש (%) |
(ממוצע ± שגיאת תקן) | ||||
ו. אוקסיספורום | YBUFol1 | 20. 0 ± 1.1 i | חלש | 62.5 |
YBUFol2 | 56.9 ± 1.2 cde | למדי | 85 | |
YBUFol3 | 42.5 ± 1.0 EFG | פחות | 77.5 | |
YBUFol4 | 73.1 ± 3.9 AB | מאוד | 90 | |
ו. קולמורום | YBUFc1 | 72.5 ± 1.0 AB | מאוד | 95 |
YBUFc2 | 72.5 ± 2.7 ab | מאוד | 95 | |
YBUFc3 | 23.6 ± 1.6 היי | חלש | 60 | |
YBUFc4 | 48.1 ± 2.6 איכות | פחות | 77.5 | |
פ. סולאני | YBUFs1 | 58.8 ± 1.6 BCD | למדי | 97.5 |
YBUFs2 | 46.9 ± 2.1 איכות | פחות | 75 | |
YBUFs3 | 17.5 ± 2.3 i | חלש | 65 | |
YBUFs4 | 36.3 ± 1.6 FGH | פחות | 80 | |
פ. אקומינאטום | יבופ1 | 42.5 ± 2.3 EFG | פחות | 65 |
יבופ2 | 16.9 ± 2.8 i | חלש | 42.5 | |
יבופ3 | 30.6 ± 6.1 היי | פחות | 62.5 | |
YBUFa4 | 44.1 ± 7.1 דפ | פחות | 67.5 | |
פ. גרמינרום | YBUFg1 | 76.3 ± 2.2 א | מאוד | 97.5 |
YBUFg2 | 50.6 ± 3.3 באיכות | למדי | 92.5 | |
YBUFg3 | 68.1 ± 2.1 ABC | למדי | 95 | |
YBUFg4 | 35.6 ± 1.9 FGH | פחות | 87.5 |
טבלה 6: בדיקות פתוגניות של מיני פוסריום על צמחי עדשים. ממוצע מבודדים <10% = לא אגרסיבי; 11%-25% = אגרסיבי חלש; 26%-50% = פחות אגרסיבי; 51%-70% = אגרסיבי בינוני; >70% = אגרסיבי מאוד. א הבדל סטטיסטי בין מבודדים על פי מבחן Tukey HSD (עמ' < 0.05).
ידוע כי נבילת פוסריום גורמת לאובדן תשואה כלכלי חמור בחלקים מסוימים של העולם31. המחלה דווחה לראשונה בהונגריה32 ומאוחר יותר דווחה במדינות רבות כמו מצרים, הודו, מיאנמר, נפאל, פקיסטן, טורקיה, סוריה וארה"ב33. Kumar et al.34 דיווחו על תפוצה רחבה של נבילת עדשים, שורש וריקבון צווארון שורש עם דיווחים על התרחשות בלפחות 26 מדינות ברחבי העולם. במחקר שנערך לאחרונה, בודדו 12 מיני פטריות מצמחי עדשים חולים שנאספו ממדינות שונות בהודו, ו-F. oxysporum f. sp. lentis זוהה כפתוגן החשוב ביותר (30%), ואחריו Rhizoctonia bataticola (17.5%) ו-Sclerotium rolfsii (15.7%)31. באופן דומה, במחקר הנוכחי, סוג הפטרייה המבודד בתדירות הגבוהה ביותר היה Fusarium (95.4%). על פי Zitnick-Anderson et al.7, Fusarium (50%) היה סוג הפטרייה הדומיננטי שגרם לריקבון נבול, שורש ושורש במטעי עדשים בצפון דקוטה. הם גם דיווחו כי F. oxysporum, F. solani, F. culmorum, F. equiseti, F. acuminatum, F. graminearum, F. redolens ו-F. avenaceum הם פתוגנים בסוג זה.
המאפיינים המורפולוגיים של חמשת מיני הפוסריום שזוהו במחקר זה היו דומים לאלה של מחקרים אחרונים35. על פי Rathod et al.36, מבודדי F. oxysporum דיווחו שהם הראו התפתחות מחיצה, מסועפת, בתחילה לבנה, ולאחר מכן התפתחות מושבה מוגבהת או שקועה על PDA, שהפכה לצבועה בפיגמנטציות שונות. באופן דומה, במחקר הנוכחי, מבודדי F. oxysporum יצרו בתחילה מושבות לבנות, מאוחר יותר צהובות, סגולות או ורודות. מצד שני, כלמידוספורים בצורת שתיים או שלוש שרשראות, ששימשו כקריטריון מורפולוגי לזיהוי מבודדים של F. oxysporum , נצפו במושבות שהיו בנות כ -30 יום. למעשה, אנדס15 דיווח כי כלמידוספורים של מבודדי F. oxysporum שהוחזקו במשך >30 יום שהושגו היו בעלי נטייה גבוהה יותר להדביק צמחים באזורי גידול חומוס במחוז יוזגת נצפו בדרך כלל בסביבות ישנות.
ריקבון שורש פוסריום בחומוס ובעדשים נגרם על ידי מינים רבים של פוסריום, כגון F. solani, F. oxysporum ו-F. graminearum37. כפי שדווח על ידי דין ואחרים 38, F. graminearum ו- F. oxysporum הם בין הפתוגנים הפטרייתיים המבודדים ביותר על ידי מיקולוגים של צמחים ברחבי העולם. עם זאת, Aydın et al.6 דיווחו כי F. graminearum הוא בין הגורמים הגורמים לריקבון נבול, שורש וכתר באזורי גידול עדשים באזור דרום מזרח אנטוליה בטורקיה. בנוסף, F. graminearum ידוע כגורם לריקבון שורש וכתר בעדשים במדינת דקוטה הצפונית, ארה"ב7.
פלטשר ואחרים דיווחו כי לעתים רחוקות ניתן לבודד את F. culmorum כפתוגן באזורי גידול עדשים. בנוסף, במחקר שנערך לאחרונה על ידי Zitnick-Anderson et al.7, דווח כי F. culmorum קשור לריקבון נבול, שורש ושורש בצמחי עדשים. עם זאת, Aydın et al.6 זיהו מינים רבים של Fusarium הגורמים לנבילה וריקבון שורשים באזורי גידול עדשים, אך לא דיווחו על F. culmorum כפתוגן. מצב זה, השונה מהמחקר הנוכחי, עשוי לנבוע ממספר האזורים השונים שנסקרו או מתמיכה במחקרים מורפולוגיים בשיטות מולקולריות במחקר הנוכחי.
Zitnick-Anderson et al.7 דיווחו כי F. acuminatum הוא בין מיני הפוסריום הגורמים לנבילה ולריקבון שורשים וצווארון שורשים בשדות עדשים בצפון דקוטה. מצד שני, Aydın et al.6 תיעדו כי F. solani הוא בין הגורמים הגורמים לנבילה וריקבון שורשים באזורי גידול עדשים. ידוע גם כי F. solani מבודד מאזורי גידול עדשים כפתוגן חלש7.
מיני פוסריום הם טפילים פקולטטיביים. זיהומים עקב הסוג Fusarium בעדשים עלולים לגרום להרס מוחלט של צמחים, במיוחד בטמפרטורות קיצוניות בסוף האביב או בתחילת הקיץ. אל-אחמד ומוסלי40 דיווחו כי F. oxysporum ו-F. solani גרמו לתסמיני הצהבה, נשירת עלים והתייבשות במטעי עדשים בדרום סוריה. F. solani גורם לריקבון שורשים ומחלות נבילה במרכז אנטוליה, כולל Yozgat16. בנוסף, כמה מינים אחרים של פוסריום נמצאו גם הם פתוגניים בשיעורים מסוימים. Zitnick-Anderson et al.7 דיווחו כי מחלת נבילת Fusarium נגרמת על ידי Fusarium oxysporum f. sp lentis, אך מיני F. culmorum, F. solani, F. graminearum יכולים גם לגרום למחלת נבילה על פי מאפיינים מורפולוגיים, פיזיולוגיים ופתולוגיים. בנוסף, פלטשר ואחרים דיווחו כי ל-F. acuminatum, הגורם לנבילה ולריקבון שורשים בעדשים, יש אלימות חלשה או נמוכה.
המחקר גילה כי 95.4% מבודדי הפוסריום שהתקבלו משדות העדשים שנבדקו היו מיני פוסריום והיו בעלי שכיחות של 1.6% - 26.4% וחומרת מחלה של 14.4% - 45.2% בצמחי עדשים. תנאי אקלים שליליים כמו חום חם ויבש באביב ובתחילת הקיץ מחלישים את צמיחת הצמחים והופכים את הצמחים לרגישים למיני פוסריום . רוב מיני הפוסריום הם פתוגנים חלשים, וכאשר תנאי הסביבה מחלישים את הצמח המארח, הם גורמים לעלייה בנבילת הפוסריום , במיוחד בתנאי בצורת.
המחברים מצהירים שאין ניגודי אינטרסים.
מחקר זה נתמך על ידי מרכז הבקשה והמחקר לתיאום פרויקטים של אוניברסיטת בוזוק, יחידת BAP עם מספר פרויקט FÇD-2022-1096. מחקר זה הוא חלק ממחקר הדוקטורט של Sevim Atmaca.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
(S)-lactic acid | Merck | 100366 | Was used as an antibiotic in studies. |
2-propanol | Merck | 109634 | Used in molecular studies. |
Adjustable micro automatic pipette (0.1-2.5 µL) | Eppendorf Research | LB.EP.3123000012 | Used to measure small volumes of liquids. |
Adjustable micro automatic pipette set (2 – 20 µl, 20 – 200 µl, 100 – 1.000 µl) | Eppendorf Research | LB.EP.4924000916 | Used to measure small volumes of liquids. |
Agar | Merck | 110453 | For use in making fungal media. |
Agarose | Sigma-Aldrich | 18300012 | For use in gel preparation in electrophoresis. |
Air conditioning room | ?klimlab | Was used to grow plants under controlled conditions. | |
Ampisilin | Sigma-Aldrich | A9393 | Was used as an antibiotic in studies. |
Analytical precision balance | Shimadzu ATX224 | Was used to weigh the solid materials used in the study. | |
Autoclave sterilizer | Zealway | GF-120DR | It was used to sterilize solid and liquid materials at every stage of the study. |
Binocular microscope | Leica DM750 | For use in morphological diagnosis. | |
Biological safety cabinet | HFsafe Class II A2 | To ensure the safety of the work area, the user, the environment and the operation. | |
Centrifugal | DLAB DM1424 | LB.DL.903001124 | Used to separate particles in a sample based on their shape, size and density |
Chloramphenicol | Sigma-Aldrich | 220551 | Was used as an antibiotic in studies. |
Cork-borer set | Sigma-Aldrich | Z165220 | It was used to take samples from fungus culture in petri dishes. |
Cover glass and slide | ISOLAB | 075.01.006 / 075.02.005 | Was used in the preparation process for microscope studies. |
D(+)-glucose monohydrate | Merck | 108342 | For use in making fungal media. |
DFC450 with digital camera | Leica | Digital microscope camera with c-mount interface and with a 5 megapixel ccd sensor. | |
Dm750 binocular microscope | Leica | MIC5246 | Was used for morphological identification of fungi. |
DNA gel electrophoresis | thermo fisher scientific | B2-UVT | |
Dna gel loading dye (6x) | Thermo Scientific | R0611 | For use in molecular diagnostics. |
dNTP mix | Thermo Scientific | R0192 | Used in molecular studies. |
Dreamtaq pcr master mixes (2x) | Thermo Scientific | K1082 | For use in molecular diagnostics. |
Drigalski spatule | ISOLAB | 082.03.001 | It was used to scrape and spread fungal cultures grown in petri dishes. |
Edta | Thermo Scientific | 17892 | For use in molecular diagnostics. |
Ethanol | Merck | 100983 | Used in molecular studies and surface disinfection studies. |
Ethidium bromide | Sigma-Aldrich | E7637 | Used to stain dna in gels during gel electrophoresis. |
Ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) | Sigma-Aldrich | E6758 | Used in molecular studies. |
Filter paper | ISOLAB | 107.58.158 | Used in stock culture studies. |
Forced air drying cabinet | ZHICHENG ZXDS-A-1090 | For use in incubation processes. | |
Fume hood | Elektromag EM1201 | LB.EM.EM1201 | It was used to control harmful chemical vapors, gases and dust. |
Gel imaging system | Syngene G:BOX Chemi XX6 | For use in molecular diagnostics. | |
Generuler 50 bp dna ladder | Thermo Scientific | SM0372 | For use in molecular diagnostics. |
Glacial acetic acid | Merck | 1005706 | Used in molecular studies. |
Glycerol | Merck | 104094 | For use in stock culture of fungi. |
Lancet | ISOLAB | 048.50.002 | Used to remove diseased tissue from plant samples. |
Magnesium chloride | Sigma-Aldrich | 814733 | Used in molecular studies. |
Measuring tape | ISOLAB | 016.07.500 | Used to measure liquid volumes. |
Microcentrifuge tubes | ISOLAB | 0778.03.001 / 0778.03.002 / 0778.03.003 | Used to store different volumes of liquids. |
PCR tube | ISOLAB | 123.01.002 | It was used to put dna mix in pcr studies. |
Petri dishes | ISOLAB | 120.13.090 | For use in growing fungus culture. |
Pipette tips | ISOLAB | 005.01.001 / 005.01.002 / 005.01.003 / 005.01.004 | To transfer liquid volumes used in analyses. |
Plastic bag | ISOLAB | 039.30.005 | Was used to transport samples to the laboratory. |
Plastic pot | ToXA | Was used for growing plants. | |
Pliers, clamps | ISOLAB | 048.08.130 | It was used to put filter papers into envelopes after the fungus grew in the petri dish. |
Porcelain mortar | ISOLAB | 038.02.150 | Was used to crush fungal mycelia. |
Potato dextrose agar | Condalab | 1022 | For the identification and cultivation and of fungi. |
Pure water system | human CORPORATION | LT.HC.NHP009 | Was used in solution preparation and analysis throughout the studies. |
Refrigerator (+4 °C / -20 °C) | Vestel | For use in the storage of stock materials. | |
Rifampicin | Sigma-Aldrich | 557303 | Was used as an antibiotic in studies. |
Sodium acetate | Merck | 106268 | Used in molecular studies. |
Sodium chloride | Merck | 1064041000 | Used in molecular studies. |
Sodium dodecyl sulfate | Sigma-Aldrich | 436143 | Used in molecular studies. |
Sodium hypochlorite solution | Merck | 105614 | Used for surface disinfection. |
Spatula | ISOLAB | 047.33.210 | It was used to scrape the fungus culture growing in petri dishes. |
Streptomyc?n sulfate | BioShop Canada | STP101 | To prevent contamination in fungal culture cultivation. |
Teksoll extra pure | Tekkim | TK.200650 | For use as a disinfectant in all stages of work. |
Tetrasiklin | Sigma-Aldrich | T3258 | Was used as an antibiotic in studies. |
Thermal cycler PCR | Bio?Rad T100 | For use in genomic analyses. | |
Thoma lam | ISOLAB | 075.03.002 | For use in spore counting. |
Tris HCL | Roche | 10812846001 | Used in molecular studies. |
Trizma | Sigma-Aldrich | T1503 | Used in molecular studies. |
Tween 80 | Merck | 822187 | For use in spore solution in pathogenicity testing. |
Vortex mixer vorteks | Velp WIZARD | LB.VLP.F202A0175 | Used to mix substances in liquid volumes. |
Water baths | Memmert WNB 22 | 1018-5702 | It was used during incubation in dna extraction studies. |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved