Method Article
במאמר זה אנו מתארים שיטה לזיהוי בזמן אמת של ייצור מיני חמצן תגובתי אפופלסטי (ROS) ברקמות אורז בתגובה חיסונית מולקולרית המופעלת על ידי תבניות מולקולריות הקשורות לפתוגן. שיטה זו פשוטה, סטנדרטית ומייצרת תוצאות הניתנות לשחזור בתנאים מבוקרים.
מיני חמצן תגובתי (ROS) ממלאים תפקידים חיוניים במגוון תהליכים ביולוגיים, כולל חישה של עקה אביוטית וביוטית. עם זיהום פתוגן או אתגר עם כימיקלים הקשורים לפתוגן (דפוסים מולקולריים הקשורים לפתוגנים [PAMPs]), מערך של תגובות חיסוניות, כולל התפרצות ROS, מושרות במהירות בצמחים, אשר נקרא PAMP-triggered immunity (PTI). התפרצות ROS היא תגובת PTI בולטת, אשר מזרזת על ידי קבוצה של NADPH oxidases מקומי של קרום פלזמה - חלבונים ממשפחת RBOH. הרוב המכריע של ROS מורכב מי חמצן (H 2 O2), אשר ניתןלזהות בקלות ובהתמדה על ידי שיטת chemiluminescence מבוסס luminol. כימילומינסנציה היא תגובה המייצרת פוטונים שבה לומינול, או הנגזרת שלו (כגון L-012), עובר תגובת חמצון-חיזור עם ROS תחת פעולה של זרז. מאמר זה מתאר שיטה כימילומינסנציה אופטימלית מבוססת L-012 לזיהוי ייצור אפופלסט ROS בזמן אמת עם אליציטוט PAMP ברקמות אורז. השיטה קלה, יציבה, סטנדרטית וניתנת לשחזור בתנאים מבוקרים היטב.
מיני חמצן תגובתי (ROS) כוללים סדרה של נגזרות חמצן פעילות מבחינה כימית, כולל רדיקלים של אניון סופראוקסיד (O2-) ונגזרותיו, רדיקלים הידרוקסילים (OH-), מי חמצן, ותוצרים של חמצן סינגלט או תגובות חיזור חמצון, המיוצרים באופן קבוע בפלסטידים ובכלורופלסטים, מיטוכונדריה, פרוקסיזומים ומקומות תת-תאיים אחרים1 . ROS ממלא תפקידים חשובים בתהליכים ביולוגיים רבים והם חיוניים לכל הצמחים 2,3,4. הספקטרום הרחב של תפקודי ROS משתנה מוויסות גדילה והתפתחות ועד לתפיסה של עקה אביוטית וביוטית 5,6,7,8.
במערכת החיסון של הצמח, קולטנים מקומיים של קרום הפלזמה של תאי הצמח - מה שמכונה קולטני זיהוי תבניות (PRR) - תופסים כימיקלים שמקורם בפתוגן - תבניות מולקולריות הקשורות לפתוגנים (PAMPs). זיהוי זה מעורר סדרה של תגובות חיסוניות מהירות, כולל זרם סידן, התפרצות ROS ומפל MAPK; לכן, שכבת חסינות זו נקראת PAMP-triggered immunity (PTI). התפרצות ROS היא תגובת PTI בולטת, שקביעתה מיושמת באופן נרחב במחקרים הקשורים ל- PTI 9,10. ייצור ROS המופעל על ידי PAMPs מיוחס לחלבונים ממשפחת NADPH oxidase (הומולוג של קרום הפלזמה), או RBOH (Respiratory burst oxidase homolog), אשר מעבירים אלקטרונים מ-NADPH ציטוסולי או NADH לחמצן חוץ-תאי כדי לייצר סופראוקסיד (O 2-) אשר מומר באופן ספונטני למי חמצן (H 2 O 2) על ידי סופראוקסיד דיסמוטאז8 . פרץ ROS המופעל על ידי PAMP הוא מהיר למדי, מופיע רק כמה דקות לאחר טיפול PAMP ומגיע לשיא של ~ 10-12 דקות. הרוב המכריע של מולקולות ROS מכילות מי חמצן (H 2 O2), אשר ניתן לזהות בקלות ובהתמדה באמצעות בדיקת כימילומינסנציה.
בכימילומינסנציה, מגיב הכימילומינסנציה מגיב עם חמצן פעיל, תחת פעולה של זרז, כדי לייצר את מתווכי המצב הנרגש. לאחר מכן, האלקטרונים במכפלה חוזרים למצב הקרקע באמצעות מעבר לא קרינתי ופולטים פוטונים. ריאגנטים כימילומינסנטיים נפוצים כוללים luminol ו- L-012, כאשר luminol שולט ביישום11,12,13. עם זאת, חוקרים נוספים בוחרים ב- L-012 כדי לזהות ייצור ROS, מכיוון של- L-012 יש יעילות פליטת אור גבוהה בהרבה בתנאי pH ניטרליים או כמעט ניטרליים בהשוואה ללומינול.
מאמר זה מתאר שיטת כימילומינסנציה אופטימלית, המבוססת על L-012, לזיהוי בזמן אמת של ייצור ROS לאחר חיסול PAMPs בדיסקים ובמעטפת של רקמות-עלי אורז (Oryza sativa). השיטה המסופקת כאן היא פשוטה, יציבה וסטנדרטית, והיא ניתנת להתאמה גבוהה כדי לענות על צרכים ניסיוניים שונים. הנתונים המתקבלים בשיטה זו ניתנים לשחזור גבוה בתנאים מבוקרים היטב.
הערה: הפרוטוקול חל על רקמות צמחים שונות. נדן אורז ודיסקיות עלים שימשו בפרוטוקול זה לזיהוי ROS עם אליציטוט PAMP. מכיוון שהבדלים נובעים בעיקר משיטת הדגימה, רק ההליכים הנפוצים מתוארים להלן, כאשר שלבים ספציפיים מוזכרים במידת הצורך.
1. תרבות צמחים
2. הכנת רקמות וטיפול מקדים
איור 1: מצב הגידול והשלבים של שתילי אורז לדגימת נדן וחלקים מנדן האורז ועלי האורז ששימשו בבדיקה. (A) שתילי אורז הגדלים על 1/2 MS בינוני בתנאים סטריליים במשך 10 ימים ניתן לדגום עבור בדיקת ROS. זרעי אורז מעוקרים גודלו בתרבית בינונית של 1/2 MS וגודלו בפוטופריוד בהיר של 12 שעות / 12 שעות כהות בבקבוקון זכוכית שקוף, בקוטר 8.5 ס"מ ובגובה 15 ס"מ. (B) תרשים סכמטי של חלקי הדגימה של נדני עלים. נדני עלים נחתכו משתילי אורז בני 10 ימים. מיקומי נדן העלים היו מעל השורשים ומתחת לעלה הראשון. (C) תרשים סכמטי של מיקום הדגימה של דיסקיות עלים. ניתן לחתוך את דיסקיות העלים מהשליש האמצעי של העלה השני (ספירה מלמעלה) של המעבד הראשי של צמחי אורז בריאים בכל שלב צמיחה. קיצורים: ROS = מיני חמצן תגובתי; MS = Murashige ו Skoog. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
איור 2: תרשים סכמטי של מערך הלוחות למדידת ייצור ROS עם קווים שונים של Oryza sativa. טיפול מקדים ובדיקה של רקמות אורז באמצעות צלחת 96 באר. קו 1, קו 2 וקו 3 (עד שמונה קווים על צלחת אחת) יכולים להיות כל חומר מעניין, זנים שונים, מוטנטים או קווים טרנסגניים. הרקמות עוררו באמצעות תמיסות אליציטוט עם PAMP (PAMP, לבן) או ללא PAMP (ddH2O, אפור) כדי למדוד תגובת ROS. יש לציין כי ככל שהדגימות ייבדקו יותר, כך מרווח הזמן בין הקריאות ארוך יותר. קיצורים: ROS = מיני חמצן תגובתי; PAMP = תבנית מולקולרית הקשורה לפתוגן; ddH2O = מים מזוקקים כפול. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
3. הכנת פתרון האליציטוט
4. הפעלת התוכנה והגדרת הפרוטוקול עם קורא המיקרו-צלחות המופנה (ראה טבלת חומרים)
הערה: לוקח קצת זמן להגדיר את הפרמטרים של תוכנת קורא microplate. מומלץ להכין את המכונה והפרוטוקול (קליק אחד כדי להמשיך) לפני הוספת פתרון האליציטוט.
5. הקמת מערכת אליסיטציה ומדידת ייצור ROS בזמן אמת
כאן, אנו לוקחים חומר אורז כדוגמה כדי לקבוע את ROS המיוצר עם טיפול flg22. הדור של ROS לאחר אליציטוט הוא חולף. באורז, העלייה בייצור ROS זוהתה לראשונה תוך 1-2 דקות, הגיעה לשיא של 10-12 דקות, וחזרה לקו הבסיס תוך ~30-35 דקות (איור 3). בהשוואה למבחן הביקורת, שבו PAMP נעדר בתמיסת האליסיטציה וכתוצאה מכך לא היה אינדוקציה ברורה של ROS, פרץ ROS ספציפי נגרם רק כאשר תמיסת האליציטוט הכילה flg22, או PAMP אחר, כגון כיטין. בינתיים, ניתן לחשב את הסכום הכולל של ROS מהעקומה (איור 4).
איור 3: השראת ROS ברקמות אורז. (A) דיסקיות עלים (בקוטר 4 מ"מ) ו-(B) נדנים באורך 3 מ"מ שימשו להשראת ROS על ידי flg22. דור ROS מנוטר במשך 35 דקות. עמודות מציינות את אמצעי SD המחושבים מחמש חזרות טכניות. נתוני הקריאה יובאו לגיליון אלקטרוני. החל את הנוסחאות "AVERAGE" ו- "STDEV. P" לערכת הנתונים כדי לחשב את הערך הממוצע ואת שגיאת התקן, בהתאמה, מהעותקים המשוכפלים עבור כל נקודת נתונים. לאחר מכן, העקומות נוצרו מערכי ROS (ערך ממוצע ושגיאת תקן). קיצורים: ROS = מיני חמצן תגובתי; FLG22 = פפטיד 22-חומצת אמינו שוטון; ddH2O = מים מזוקקים כפול; RLU = יחידות הארה יחסיות. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
איור 4: הכמות הכוללת של ROS שנוצר עם הנדן. הסכום הכולל של ROS מחושב בדרך כלל מהעקומה המתקבלת מהבדיקה. סכומי ה-ROS הכוללים המוצגים כאן חושבו מהעקומה המתאימה לאיור 3A. כדי לקבל את הסכום הכולל של ערכי ROS, החל את הנוסחה "= (y̅ n+ n + 1) × מרווח זמן/2" על ערכות הנתונים המתאימות כדי לחשב את ה- ROS שנוצר בכל מרווח זמן, שניתן לשלב על-ידי החלת הנוסחה "SUM" כדי לחשב את הסכום הכולל שנוצר. קיצורים: ROS = מיני חמצן תגובתי; FLG22 = פפטיד 22-חומצת אמינו שוטון; ddH2O = מים מזוקקים כפול. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
איור 5: ייצור ROS בתאים החשופים של הקצה החתוך. חצאי שלם אחד או שניים של דיסקת עלה הוכנסו לבארות של צלחת מיקרוטיטר 96 בארות, טופלו מראש עם 100 μL של ddH2O במשך 10-12 שעות, ולאחר מכן טופלו עם flg22 עבור אינדוקציה ROS. ערכי הקריאה משתי דגימות חצאי הדיסק גבוהים בהרבה מאלה של דיסק העלה כולו (A). בממוצע, הערכים הכוללים משתי דגימות חצי הדיסק הם ~ פי 1.6 מכלל דיסק העלה (B), שהוא פרופורציונלי לאורך הקצה, לא לשטח, של הדגימות. תוצאה זו תומכת בכך ש-ROS נוצרים בעיקר בתאים באתר הפצע. קיצורים: ROS = מיני חמצן תגובתי; FLG22 = פפטיד 22-חומצת אמינו שוטון; ddH2O = מים מזוקקים כפול. אנא לחץ כאן כדי להציג גרסה גדולה יותר של איור זה.
מטרת מחקר זה הייתה לבסס שיטה יעילה ביותר לכימות ייצור מוקדם של ROS בתגובה ל-PAMP ברקמות אורז. שיטה זו מספקת הליך סטנדרטי לקביעה בזמן אמת של אפופלסט ROS המיוצר מרקמות אורז מטופלות. שיטה זו פשוטה בתפעול, נמוכה בעלות, ברורה בהרכב, ובלתי תלויה בערכות מסחריות. באמצעות שיטה זו, חוקרים יכולים לחקור את הייצור בזמן אמת של אפופלסט ROS כאשר צמחים נתונים לעקה ביוטית או אביוטית.
בפרוטוקול זה, L-012 נבחר כמגיב כימילומינסנציה מכיוון שהוא כימיקל לא רעיל. Luminol נמצא בשימוש נרחב במבחני chemiluminescence כדי לזהות ייצור ROS. עם זאת, ישנם שלושה חסרונות עם לומינול, מה שהופך אותו ללא מתאים לזיהוי ROS באורז וברקמות צמחים אחרות: מסיסות מים ירודה, משך תגובה קצר ו- pH תגובה קשה. לומינול מייצר אור רק בתנאים בסיסיים, עם pH אופטימלי של 9.5, שהוא קשה מדי לתאי צמח וגורם לתגובות לא רצויות. בנוסף, ללומינול יעילות פליטת אור נמוכה בהרבה מזו של L-012, בעל רגישות האור הגבוהה ביותר בתנאים פיזיולוגיים, ברמת חומציות ניטרלית או כמעט ניטרלית. לפיכך, L-012 משמש יותר ויותר ברקמות חיות או במערכות תאים כדי לזהות ייצור ROS.
ייצור ROS בתגובת PTI מושפע מגורמים פנימיים או חיצוניים רבים. לפיכך, השונות באינדוקציה של ROS בתגובת PTI היא גדולה. כדי למנוע וריאציות ככל האפשר, פרוטוקול זה נוקט אמצעים כדי לשלוט היטב בתנאי הבדיקה. ראשית, מערכת חיץ Tris-HCl של 50 mM יושמה על פתרון האליציטוט בפרוטוקול. למרות שחלק מהחוקרים משתמשים במערכות ללא אגירה כדי לבדוק ייצור ROS, מצאנו שלמערכת מאגר יש ביצועים טובים יותר ביחס לעקביות נתונים ויכולת שחזור וקו בסיס טוב יותר בקבוצת הביקורת. שנית, המחברים ממליצים בחום לקחת דגימות באופן עקבי ככל האפשר.
חוסר העקביות בין הרקמות הוא מקור עיקרי לשונות נתונים. פרוטוקול זה ממליץ לבחור רקמות מאותו מיקום של אותו עלה (מספר) או נדן של צמחים בריאים באותם תנאי תרבית. אנו תמיד חותכים דיסקיות עלים מהשליש האמצעי של העלה השני (ממוספר מלמעלה) של העלה הראשי ושומרים על עקביות בין קבוצות ניסוי שונות או גנוטיפים שונים. בעת שימוש בנדן כרקמת הבדיקה, יש לשמור על חתך הנדן אנכי במהלך תהליך הדגימה. אם החתך הוא אלכסוני, אזור הפצע שנוצר לא יכול להישמר עקבי, מה שיוביל לתוצאות ניסוי לא יציבות. שלישית, יש לנתח את הרקמות בעדינות ולטפל בהן באותו אופן. פצעים או פציעות על רקמות הבדיקה יש להימנע, שכן פצע יחשוף תאים רבים יותר לפתרון אליציטוט, אשר ללא ספק לגרום וריאציה נתונים. כפי שניתן לראות באיור 5, האליציטוט של ROS מיוחס בעיקר לתאים חשופים. בנוסף, הערך של ייצור ROS יופחת באופן דרמטי כאשר נזק חדש קורה ממש לפני הקריאה.
גורם חשוב נוסף שיש לקחת בחשבון בעת זיהוי ייצור בזמן אמת של ROS על ידי רקמות צמחים הוא ההשפעה של השעון הצירקדי. שמנו לב להבדלים בערכי הקריאה בשעות שונות של היום. הוכח כי השעון הביולוגי יכול להשפיע על הייצור והתגובה של ROS, כמו גם על ויסות השעתוק של גנים הקשורים ל- ROS. רמת ה-ROS משתנה לאורך היום, מגיעה לשיא בצהריים ויורדת בחצות14. לסיכום, הליך בעל תפוקה גבוהה זה מאפשר זיהוי סימולטני של דגימות מרובות, מה שיכול לסייע במניעת השפעת השעון הצירקדי על ייצור ROS. כדי להשיג תוצאות הניתנות לשחזור, אנו ממליצים לבצע שכפולים ביולוגיים באותה שעה ביום.
למחברים אין ניגודי עניינים לחשוף.
עבודה זו נתמכה על ידי מענקים מקרן שנחאי למדעי הטבע (מספר מענק: 21ZR1429300/BS1500016), אוניברסיטת שנגחאי ג'יאו טונג (תוכנית Agri-X, מספר מענק: AF1500088/002), מרכז החדשנות השיתופית של שנחאי של זרעים חקלאיים (מספר מענק: ZXWH2150201/001) לג'יאנגבו פאן, ועל ידי פרויקט שיתוף הפעולה הרפואי-הנדסי של אוניברסיטת ג'יאו טונג בשנגחאי (מספר מענק: 21X010301734) לקאן לי.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
96-well microtiter plate | WHB | WHB-96-01 | |
Ethanol absolute | Innochem | A43543 | |
flg22 | Sangon Biotech | p20973 | PAMP |
Gen5 | BioTek | software | |
L-012 | FUJIFILM | 120-04891 | 8-amino-5-chloro-7-phenyl-2,3-dihydropyrido [3,4-d] pyridazine-1,4-dione, CAS #:143556-24-5 |
Microplate reader | BioTek | Synergy 2 | |
MS Medium | Solarbio | M8521 | |
NaCLO | Aladdin | S101636 | |
Peroxidase from horseradish (HRP) | Sigma | P8375 | |
Phytagel | Sigma | P8169 | |
Sampler | Miltex | 15110-40 | |
Sucrose | Sangon Biotech | A502792 | |
Tris | Sangon Biotech | A610195 |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved