Method Article
מאמר זה מדגים טכניקות הרומן שפותחו עבור משלוח אוראלי של זוגיות גדילי RNA (dsRNA) דרך הרקמות וסקולריים הצמחים עבור התערבות RNA (RNAi) מהצינורות האכלה חרקים.
שיפה וצמח sap האכלה חרקים לפלוש השלמות של גידולי פירות כדי לאחזר חומרים מזינים, תוך כדי פגיעה גידולי מזון. חרקים hemipteran בחשבון מספר מזיקים מבחינה כלכלית משמעותית של צמחים לגרום נזק לצמח על ידי ניזון מהצינורות. החרק המסריח חום marmorated (BMSB), Halyomorpha האליס (פשפשים: Pentatomidae), את אסיה הדרים psyllid (ACP), Kuwayama Diaphorina קמחית (פשפשאים: Liviidae) מזיקים חרקים hemipteran הציג בצפון אמריקה, היכן הם הם של הדברה חקלאיים פולשנית מיוחדים בעלי ערך גבוה, שורה, ואת היבולים סיכות פירות הדר, כמו גם נודניק מטרד כאשר הם מצטברים בתוך הבית. עמידות חרקים מינים רבים הובילה לפיתוח שיטות חלופיות של אסטרטגיות ניהול בפשט. זוגיות-גדילי RNA (dsRNA)-RNA בתיווך הפרעה (RNAi) הוא גן להשתיק מנגנון פונקציונלי גנומית מחקרים כי יש יישומים פוטנציאליים ככלי לניהול של חרקים מזיקים. DsRNA exogenously מסונתז או RNA קטנים מפריעות (siRNA) יכולה לעורר יעילים ביותר ג'ין להחרשת דרך ההשפלה של RNA אנדוגני, אשר זה הומולוגי ל מוצג. יעיל וסביבתי השימוש RNAi בתור biopesticides המולקולרי עבור הייצור של חרקים hemipteran דורש ויוו המסירה של dsRNAs באמצעות האכלה. כאן נוכל להדגים שיטות מסירת dsRNA חרקים: טעינה של dsRNA לתוך שעועית ירוקה על ידי טבילה, וקליטת של גנים ספציפיים dsRNA עם משלוח אוראלי דרך בליעה. לנו יש גם המתוארים צמח שאינו הטרנסגניים גישות משלוח באמצעות תרסיסים בריסוס, שורש הירטבות, תא המטען זריקות וכן קליי בגרגרים, אשר עשוי להיות חיוני לשחרור מתמשכת של dsRNA. משלוח יעיל על ידי ingested dsRNA אושר כמו מינון יעיל לזירוז ירידה משמעותית בביטוי של יישוב גנים, כגון חומצה הורמון נעורים O-methyltransferase (JHAMT), vitellogenin (Vg). שיטות חדשניות אלה מייצגים אסטרטגיות עבור משלוח של dsRNA להשתמש בהגנת הצומח, להתגבר על אתגרים סביבתיים על ההדברה.
חרקים hemipteran מהווים חלק המזיקים ביותר מבחינה כלכלית משמעותית של agriculturebecause יכולתם להשיג גידול האוכלוסייה מוגברות ולהפיץ מחלות בצמחים. BMSB, ח' האליס פלדה, הוא המזיק פולשני זה הוצג בטעות עם גילויו הראשון דיווחה בשנת 19961בחצי הכדור המערבי ב אלנטאון פנסילבניה מאסיה (סין, טייוואן, קוריאה ויפן). מאז השקתו, BMSB זוהה 43 מדינות, עם האוכלוסיות הגבוהה ביותר באוקיינוס האטלנטי (דה, MD, הרשות הפלסטינית, NJ, אמפר, ו WV), כמו גם בקנדה ובארצות אירופה, והוא מייצג איום פוטנציאלי על החקלאות2. כמו מטרד רב, BMSB יכול לעורר נזק למארחים כ 300 צמחים מוכרים, כולל ערך גבוה גידולים כגון תפוחים, ענבים, צמחי נוי, זריעה, סויה, תירס. נזק נגרם בעיקר בשל המצב של האכלה המכונה lacerate, סומק שם החיה מפלח את היבול מארח עם שלו stylet דמוי מחט כדי לקבל גישה אל החומרים המזינים רקמות וסקולריים2,3. BMSB הוא גם המזיק מקורה כמו הם עשויים למצוא מגורים באזורי מגורים כגון בתי ספר, בתים במהלך סתיו חורף2. כימיקלים, aeroallergens שפורסמו על ידי BMSB דווחו על תגובה אלרגית איליקיט עובדים חיתוך פירות. BMSB עשוי גם לתרום למחלות אלרגיות שמוביל ממגע, דלקת הלחמית דלקת אנשים רגישים4,5. עוד חרק hemipteran, ACP, קמחית ד Kuwayama (פשפשאים: Liviidae), היא מטרד רציני של פירות הדר, ומעבירה את החיידקים שיפה מוגבל (טיריה LiberibacterCandidatus ) גורמת Huanglongbing (HLB), הידוע יותר כמו מחלת ירוק הדר6,7. HLB דווחה לראשונה מסין הדרומית, התפשט 40 שונים אסיה אפריקה, האוקיאנית, דרום, צפון אמריקה מדינות7. ירוק הדר היא בעיה ברחבי העולם עם איום כלכלי הפסדים בשל אובדן פרי הדר; לפיכך, הנהלת ACP נחשב בעל חשיבות עליונה כדי למנוע ולשלוט HLB.
האמצעים לבקרה יעילה של מזיקים חרקים אלו בדרך כלל דורש היישום של הדברה כימית קצרות יחסית חי. הדברה כימית אסטרטגיות שליטה לעיתים קרובות חוסר אסטרטגיות ניהול הסביבה בטוח או פחתו הרגישות עקב עמידות לחומרי הדברה הדברה אוכלוסיות8,9. לפיכך, הדברה ביולוגית של מזיקים עם biopesticides מולקולרית היא חלופה אפשרית, אבל השימוש בה באופן גלובלי נשאר צנוע, מינים שונים של צירעת האפידיוס (למשל, Trisolcus ג'אפוניכאס) יכול להיות גם יעיל כמו ביולוגית טבעית פקדים. RNAi הוא פוטנציאל המתעוררים טכנולוגיות לניהול פולשנית חרקים מזיקים עם biopesticides מולקולרית10. RNAi היא מנגנון רגולטורי ג'ין תיאר היטב מקלה את יעילות posttranscriptional ג'ין להחרשת של אנדוגני כמו גם פולשים dsRNAs באופן ספציפי רצף, שמוביל בסופו של דבר בקרת גנים ב mRNA רמה11,12. בקצרה, כאשר dsRNA אקסוגני הוא הפנימו לתא שזה שהוא מעובד siRNAs על-ידי חבר superfamily RNase השלישי נוקלאז bidentate, נקרא לטעמים, אשר אבולוציונית כולו בתולעים זבובים, צמחים, פטריות, יונקים13, 14 , 15. אלה דופלקסים siRNA נוקלאוטיד 21-25 ואז לשחרר ממנו, משולב בתוך המתחם שתיקה RNA-induced (RISC) כמו מדריך RNAs. מתחם RISC-RNA זה מאפשר זיווג הבסיס של ווטסון-קריק ל משלימים היעד mRNA; זה מוביל בסופו של דבר המחשוף של החלבון Argonaute, תחום רב חלבון המכיל תחום RNase H דמוי, אשר מדרדרת את ה-mRNA המתאימים ומפחית תרגום החלבון, ובכך מוביל ג'ין posttranscriptional להשתיק16 , 17 , 18.
RNAi לניהול הדברה מחייבת המבוא של dsRNA ויוו להשתיק את הגן של עניין, ובכך הפעלת מסלול siRNA. שיטות שונות בהן השתמשו למסירה dsRNA חרקים, חרקים תאים לזירוז RNAi מערכתית כוללת האכלה10,19, טבילה20,21, microinjection22, נשאים כגון ליפוזומים 23, טכניקות אחרות24. RNAi היה הראשון הפגינו Caenorhabditis elegans להשתיק unc-22 גנים מאש מלו25, ואחריו נוקאאוט ביטוי של גנים עלי דרוזופילה melanogaster26. מחקרים ראשוניים פונקציונלי מנוצל microinjection כדי לספק dsRNA חרקים, כגון בומבוס22,27, Acyrthosiphon אפון28, במיוחד גרמנית29, האליס ה30, וחרקים lepidopteran (נבדקה על ידי. Terenius et al. 31). microinjection יש יתרון לספק מנה ומדויקים לאתר של עניין החרק. אמנם דקירות ספיגה כזה עשוי להפיק ביטוי של גנים הקשורים החיסון עקב טראומה32, לפיכך, שוללים את המעשיות שלה בפיתוח חקלאי biopesticides.
שיטה נוספת להעברת dsRNA ויוו היא למסמס, אשר כרוך בליעה או קליטה של dsRNA מאת השעיה של חיות או תאים בדרך כלל במדיום חוץ-תאית שמכילה dsRNA. השריית שימש לזירוז ביעילות RNAi בתאים תרביות רקמה דרוזופילה S2 לעכב במורד הנחל-של-Raf1 (DSOR1) מופעל mitogen חלבון קינאז קינאז (MAPKK)20, כמו גם ב- C. elegans להשתיק את pos-1 ג'ין33. אולם, dsRNA מועברת באמצעות השריית היא פחות יעילה לזירוז RNAi בהשוואה microinjection20. RNAi בתיווך מצרי להשתיק בחרק הלעיסה הוצג לראשונה rootworm תירס המערבי (WCR) (Diabrotica virgifera virgifera) על ידי הלוגיסטים של dsRNA לתוך דיאטה אגר מלאכותי10. דו חות קודמים יש סיכם שיטות לאספקת dsRNA חדורים בתזונה טבעית ספיציפית פרוקי רגליים34. שיטות משלוח אלה נקבעו עוד יותר יעיל וזהובה באמצעים מלאכותיים מסירה; כמו במקרה של זבובים (Glossina morsitans morsitans), שבו שווה נוקאאוט הגנים הקשורים החיסון נצפתה כאשר dsRNA נמסרה או באמצעות ארוחת דם או microinjected35. באופן דומה, משלוח של dsRNA דרך טיפות תפוח חום בהיר עש (Epiphyas postvittana)36, הזחלים diamondback עש (Plutella xylostella)37, כמו גם דבש דבורים38,39 המושרה RNAi יעיל. ניסויים RNAi היעילה ביותר hemipteran נעזרו הזרקה של dsRNA40 כי משלוח אוראלי של dsRNA בחרקים hemipteran מפרך מאז שצריכים להישלח דרך רקמות וסקולריים של הצמח הפונדקאי. RNAi יעיל נצפתה גם ACP, צלף מזוגגות-כנף leafhopper (GWSS), Homalodisca vitripennis: dsRNA נמסר דרך הדרים וגפנים שקלטה dsRNA לרקמות וסקולריים דרך השורש הירטבות, בריסוס תרסיסים, תא המטען זריקות או הספיגה על ידי ייחורים41,42,43,44,45,46. זה הביא גם הפטנט הראשון על dsRNA נגד ACP (2016, לנו 20170211082 A1). משלוח של siRNA ו dsRNA באמצעות נשאים כגון חלקיקים, ליפוזומים מקנה יציבות, העלאות dsRNA ונמסרו יעילות במהירות מתגלים23,47,48,49 ,50. מחלקה חדשה של כלי רכב מבוססי ננו-חלקיק משלוח עבור חומצות גרעין במבחנה , ויוו היה מסוכם במיוחד עבור יישומים טיפוליים שעשוי להקנות פוטנציאל עצום כמו צורת המשלוח המומנט51. חלקיקים כרכב משלוח עבור dsRNA אולי חסרונות כולל מסיסות, hydrophobicity או bioaccumulation מוגבלת52, אבל משלוח עזר פולימר מתאים עשוי לפצות את החסרונות. פיתוח ושימוש עצמי להעברת נוקלאוטידים מתגלים גם בשם 'antisense oligonucleotides', אשר בודד נטושים RNA/DNA דופלקסים46.
Vitellogenesis של פרוקי רגליים הוא מפתח תהליך השליטה רבייה ומוסדרת על ידי הורמון נעורים (JH) או ecdysone, אשר הם inducers מפתח של סינתזה Vg מאת שומן הגוף; Vg הוא נלקח בסופו של דבר על ידי oocyte לפתח דרך Vg-קולטן בתיווך מצרי-אנדוציטוזה-53. Vg היא קבוצה של polypeptides מסונתז extraovarially, שהיא הכרחית להתפתחות של החלבון חלמון ביצה גדולה,54,vitellin55, לכן חשוב רבייה, הזדקנות56. Vg הושתקה בהצלחה בנמטודות57 , כמו גם בדבורת הדבש (בומבוס) איפה RNAi בתיווך מצרי דלדול של Vg נצפתה מבוגרים וביצים22. RNAi בתיווך posttranscriptional ג'ין להחרשת Vg נבדקה מכיוון שהאמינה שדלדול שלה יוביל אפקט פנוטיפי הנצפה כגון מופחתת פוריות ופריון, פוטנציאל לסייע בשליטה BMSB. הגן JHAMT מקודד את S-adenosyl-L-מתיונין (SAM)-תלוי JH חומצה O-methyltransferase, מזרז את השלב הסופי של מסלול ביוסינטזה JH58. ב- farnesyl מסלול זה רב-תכליתי (FPP) ברצף כשהופכים מן farnesol, חומצה farnesoic, ואחריו ההמרה של מתיל farnesoate JH על-ידי JHAMT. מסלול זה כולו חרקים, פרוקי רגליים במיוחד עבור מטמורפוזה, תהליך התפתחותי מוסדר על ידי הורמונים-59,-60,-61. ב מורי דרב, ביטוי גנים JHAMT ואת הפעילות biosynthetic הוחלף נגזר JH allata הקורפוסים מראים כי הדיכוי תעתיק של הגן JHAMT הוא קריטי עבור הסיום של JH ביוסינטזה58. לכן, הגנים JHAMT ו- Vg נבחרו עבור דלדול ממוקד באמצעות RNAi. RNAi נבחנה גם עצי הדר על השליטה ACP ו- GWSS. עצי הדר שטופלו dsRNA דרך השורש הירטבות, הגבעול הקשה (המטען זריקות), כמו גם בריסוס תרסיסים עם dsRNAs נגד חרקים ארגינין ספציפי קינאז (אי קאי) תעתיקים42,44. יישום אקטואלי של dsRNA זוהה על החופה של עצי הדר, המציין משלוחים יעיל דרך הרקמות צמחים עילאיים, וכתוצאה תמותה מוגברת ACP, GWSS41,42, 45.
במחקר הנוכחי, זיהינו שיטת משלוח דיאטה טבעית עבור טיפולים כגון dsRNA. טכניקה זו פיתח שימש לאחר מכן להשתיק את JHAMT ואת Vg mRNA באמצעות גנים ספציפיים dsRNAs ב BMSB נימפות כמו הפגינו קודמות62. פרוטוקולים אלה-משלוח חדש המודגמות כאן מחליף קונבנציונאלי מערכות אספקה RNA המשתמשות תרסיסים אקטואלי או microinjections. ירקות, פירות, גזע הקשה אדמה קפה, ופעולות חימר. סופגים ב עשוי לשמש עבור משלוח של dsRNA, אשר הינה קריטית להמשך התפתחותו של המזיק biopesticide וניהול הפתוגן.
1. BMSB לגידול
2. מבחר של ג'ין אזורים, ב חוץ גופית סינתזה של dsRNA
3. מסירת dsRNA שימוש שעועית ירוקה
4. בזמן אמת כמותי (qPCR) ניתוח של ג'ין הביטוי הבא RNAi בתיווך מצרי להחרשת ב- BMSB
5. בריסוס ספריי ביישום עצי הדר בעציץ גדול ושתילים
הערה: צמחים זנים הדרים citrange 'Carrizo' (הדר סיננסיס XPoncirus trifoliata, פיגמיים), היו בהשתתפות של החממה תחת אור טבעי וטמפרטורה, גדלו במיכלים 1.2 L. הצמחים היו לסילוק כל הזמן כדי לקדם את הצמיחה של נבטים בריסוס, שנקרא 'יישור'. ACP מעדיף להאכיל וגם ההטלה על גידול חדש של הדר64.
6. אדמה/שורש היישום הירטבות בגדולים או קטנים בעציצים שתילים ועצי הדרים
7. גזע ברז (הזרקת גזע עץ) יישום גדול עצי הדר בעציץ ושתילים
8. dsRNA אלייך בגרגרים קליי למסירה חרקים דרך האדמה
משלוח ירקות dsRNA מתווכת באמצעות האכלה ב BMSB 4th לחלל נימפות נבחנה לפיתוח biopesticides מולקולרית באמצעות RNAi עבור מזיקים חרקים פולשני. BMSBs הזנה באמצעות stylets דמוי מחט שלהם על-ידי מנגנון המכונה lacerate, סומק, הגורמת להרס יבולים. שעועית ירוקה אורגנית ודק, דלקתית פ ל', שימשו כדי לבדוק אם מזינים או dsRNA יכול להישלח ויוו BMSB באמצעות האכלה3. מקטעים של שעועית ירוקה שטבלו במים חינם DNase/RNase או פתרון של מים וצבע מאכל ירוק כדי לבדוק את המשלוח ב- BMSB (איור 1 א'). מאכל ירוק שימש ציון ויזואלי לחקות dsRNA. הרקמה וסקולריים של השעועית הירוקה היו רווי צבע מאכל ירוק בשל הזרימה של פתרון בצבע ירוק באמצעות שיפה מאת נימיות62. נימפות BMSB נראו ניזון המקטעים של שעועית ירוקה על-ידי הוספת stylets שלהם לתוך רקמות וסקולריים השעועית הירוקה (איור 1B). הפרשות בצבע ירוק טיפות נצפו לאחר ימי 2 ו- 3 חרקים מוזנים על שעועית רווי אוכל ירוק צביעה המציין החומר ונמסרו בלע בעל פה, עברו דרך הבטן לפני הפרשה (איור 1C, D ).
לאחר מכן בדקנו אם דלדול משמעותי של ביטוי גנים יישוב הושג באמצעות מסירה שעועית ירוקה מתווכת של dsRNA ספציפי BMSB דרך בליעה ב- BMSB. שעועית ירוקה מקטעי שטבלו ולא נספג פתרון של 0.067 µg/µL (20 µg ב µL 300 DNase/RNase מים חינם) או 0.017 µg/µL (5 µg ב 300 µL של מים בחינם DNase/RNase) של dsRNA חוץ גופית בתוך מסונתז ספיציפית BMSB JHAMT ו- Vg , בהתאמה. שעועית ירוקה היו גם שקוע במים לבד, µg 0.067/µL או µg/µL 0.017 LacZ dsRNA (מעושה) כפקדים בהתאמה. התעתיק רמות הוערכו באמצעות qPCR המציין את הביטוי הזה של JHAMT והיה Vg mRNA מופחתת באופן משמעותי ויוו מאת כמעט 4.5 - ו 2.2-fold, בהתאמה (איור 2 א, ב'). כתוצאה מכך, התוצאות מצביעות על ש-dsrna הזה עשוי להיות מועברת דרך הרקמות וסקולריים של שעועית ירוקה לזירוז RNAi מוצלחת.
עוד מזיקים hemipteran, הבאג ארלקינו (HB) (Murgantia histrionica), הגורמת לפגיעה קול יבולים נבדקו גם אם מסירה מוצלחת של חומרים מזינים או טיפולים dsRNA יכולה להיות מועברת באמצעות הירק מתווכת משלוח. הנימפות HB 4th לחלל הורשו ניזון התינוק ראמוס (כרוב הבר var. דגולה) שקוע במים או פתרון של מים עם צבע מאכל ירוק. התוצאות הצביעו על כי HB האכיל, בלע את צבע מאכל ירוק, אשר היה ברור מן הפרשות בצבע ירוק שלהם, לעומת HB זה אכל את הירקות שקוע במים, אשר היה ברור הפרשות (איור 3).
שיטות נוספות למסירה ארעית של dsRNA ריסוס או שורש/אדמה לספוג את תוצאות dsRNA ספיגת כל65,רקמות הצמח66. מוצרים מבוססי-RNAi מותז נמצאים בשלבי פיתוח, עשויים להיות זמינים בקרוב ממתין לאישור. משלוח של dsRNA בשדות באמצעות תרסיסים או שורש הירטבות עשויים לסייע בניהול חרקים פולשנית42,67. בגודל מלא בעצי הדר ושתילים נחשפו dsRNA ספריי בריסוס, או באמצעות קרקע או חשוף שורש קפה, בהתאמה (איור 4). התוצאות הצביעו על כי dsRNAs מועברים על ידי או תרסיסים או אדמה/חשוף שורש הירטבות יכול להתגלות בצמחים הדרים (2.5 מ') 7 שבועות פוסט החשיפה יחיד של 2 גר' dsRNA42. משלוח, בליעה של psyllid dsRNA-AK (20 ng/µL) גדל התמותה psyllid 30-45% (איור 4D)42.
במבחנה עיבד dsRNA יכול להיות מועברת בצורה יעילה כדי רב חרקים באמצעות ברז גזע (המטען זריקות) של גנים ספציפיים dsRNA ישירות לתוך הרקמות וסקולריים של הצמח, אשר ניתן לרכוש באמצעות החרקים כאשר ובעידן צמחים כאלו44 (איור 5). עצי הדר זה נחשפו על ידי זריקות המטען dsRNA, dsRNA יכול להתגלות בצמחים הדר גיל (כ 1 מ') במשך 7 שבועות פוסט החשיפה יחיד באמצעות 6 מ של 1.7 מ"ג/מ"ל של dsRNA בפתרון של DNase/RNase מים חינם (איור 5A B). האכלה שיפה חרקים hemipteran הורשו אז ניזונים אלה צמחים פונדקאים שטופלו dsRNA. ההנחה היא כי dsRNA בהצלחה חלוט, עברה דרך מערכת כלי הדם של הצמחים הדר עבור בליעה על ידי ACP, אשר הפגינו התמותה בעת ניזונו dsRNA-AK42.
Bioassays התפתח 2008 עד 2012, יש כבר הוקרן על פני מגוון רחב של עציצים, שמוצג כדי לספק משלוח dsRNA באופן שבו צמחים יכול לספוג, translocate של dsRNA עבור dsRNA מערכתית הפצתו41,42 . שיטה אחת משתמשת רכיב סופג חימר עם dsRNA ספיחה לתוך מאטריקס חימר; זה כולל מגוון רחב של חרסיות, פולר של כדור הארץ, זאוליט, ואחרים, כמו יתר חומרי ספיגה, תאית, agars, bioplastics, וכו חימר חלקיקים הם נשאים של חומצת גרעין בחינם אבק העשויות לשמש להעברת חומרים פעילים כגון dsRNA כדי קרקעות עבור הצמח ספיגת ובסופו של דבר משלוח. חרקים (איור 6). החימר מורכבים ניתן גם מבחינה כימית להגדיר כדי לשחרר את dsRNA תחת pH ספציפי או תנאים יוניים. קליי שיטות משלוח של dsRNA לתוך צמחים הוכחו לספק dsRNA לתוך עצי הדר בעציץ, וצמחים אחרים מעל 14 חודשים (נתונים לא מוצג). מערכת משלוח זו ניתן לשנות את תכונות הצמח, כגון צבעי הפרחים, גובה הצמח (שלמרגלותיהן) או אחרים. כיום, השימוש העיקרי של שיטה זו הוא פיתוח של מזיקים חרקים יעיל של פתוגן (וירוס) שליטה או ניהול. הגישה יכול להיות חסכוני עבור משתלות, בעלי בתים, היא שיטה שאינה מהונדס.
איור 1 . מסירה של חומרים מזינים או dsRNA דרך שעועית ירוקה- (א) מקטעים של שעועית ירוקה אורגנית ודק שטבלו ולא נספג הפתרון צינור microcentrifuge 2 מ"ל המכיל 300 µL של ddH2O לבד או ddH2O עם צבע מאכל ירוק, עבור 3 שעות. 3 4th לחלל BMSB נימפות היו ברעב עבור 24 שעות והניח בכלי תרבות יחד עם שעועית ירוקה 3 לכל כלי. BMSB (B) ניזונים מקטעים של שעועית ירוקה הושקע במים על ידי פירסינג דרך השעועית הירוקה כדי להגיע את החומרים המזינים עם stylets שלהם. (ג) יום 2 של BMSB האכלה bioassay, החיצים מציינות הפרשות. היום (ד') 3; הפרשות BMSB מוגברת (מסומן בחץ) נצפתה פוסט בליעה של פתרון של ddH2O וירוק מאכל דרך שעועית ירוקה. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.
איור 2 . ניתוח RT-PCR כמותי כדי למדוד את רמת התעתיק לאחר מציאה RNAi בתיווך דלדול של JHAMT ו- Vg ב- BMSB. RNA הכולל מ- 3 נימפות לחלל BMSB 4th בודדים ניזונו JHAMT (א) 20 µg (0.067 µg/µL), ו- Vg (B) dsRNAs 5 µg (0.017 µg/µL) ב- 300 µL של ddH2O מועברת באמצעות מקטעים של שעועית ירוקה, הופרדה ו התעתיק רמות נמדדו על ידי qPCR. DsRNA LacZ (מעושה) שימש פקד שלילי. BMSB 18s RNA שימש תקן פנימי לתיקון הבדלים RNA התאוששות הרקמות. התוצאות שדווחו הן מן משכפל ביולוגי שלוש, קווי שגיאה מציינים ב- SEM. שונות של ניתוח בכיוון אחד (ANOVA) בוצע כדי לבדוק מובהקות סטטיסטית של הנתונים, 0.0001 < p . תוצאות לשכפל מ גוש. et al. 62 אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.
איור 3 . משלוח אוראלי של טיפול בבאג ארלקינו (M. histrionica ) באמצעות התינוק ראמוס. תינוקות אורגניים כרוב ירוק היו לשטוף 0.2% נתרן תת-כלורי, גזוז, שקוע בתוך צינור microcentrifuge קאפ-פחות מ 2 ל המכיל 300 µL של פתרון של (A) DNase/RNase ddH חינם2O או DNase (B) / RNase ddH חינם2 O פתרון עם צבע מאכל ירוק, לתקופה של 3 שעות. 3-4 לחלל HB נימפות היו ברעב עבור 24 שעות ואז מניחים בכלי תרבות, מותר להאכיל על אלה כרוב ירוק במשך 3 ימים. החצים הלבנים מצביעים על הפרשות מובחנים האכלה פוסט יום 3. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.
איור 4 . תרסיס בריסוס ושורש משפריצה על יישום עצי הדר ושתילים. הצמחים שנבחרו או שתילים מוקדמת לשימוש לא להשקות 2-3 ימים לתת הקרקע להתייבש לחים אך לא יבש לחלוטין. (א) העצים היו קודם עקף וחלים 200 מ של dsRNA פתרון (0.5 מ"ג/מ"ל) מים חינם היה DNase/RNase ביד בקבוק ריסוס משאבת החופה נמוכה יותר. (B) 100 מ של dsRNA פתרון (1 מ"ג/מ"ל) מים חינם DNase/RNase הוחל על האדמה של שתילי בקרקעות חלקית יבש. (ג) 100 מ של dsRNA פתרון (1 מ"ג/מ"ל) מים חינם היה מוחל על שורשי השתילים עבור 3 ח' (D) חשופות DNase/RNase ACP ניזון שתילים שקלטה dsRNA על ידי השורשים חשופות, הראו תמותה מוגברת ACP. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.
איור 5 . הדר שתיל עץ המטען הזרקת. שתילי הדר גבוה כ- 1 מ' הוזרקו 1.7 מ"ג/מ"ל של dsRNA. חורים לקדוח (א) בשתילי הדר באמצעות מקדחה בקוטר 10 מ מ כדי להוסיף את מזרק לתוך הגבעול של הצמח. קצה נחושת חשוף כל מזרק היה עטוף עם רצועה רחבה 0.6 ס"מ (¼ אינץ ') של איטום הסרט למניעת דליפה. מרססים (B) מלא 6 מ של הפתרון צבעוניות הוחלו על הגבעול (המטען) השתילים. מרססים נותרו במקומם כ 6-10 h עבור ספיגה מלאה של הפתרון. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.
איור 6 . קליי אדמה משלוח התיקון של dsRNA לתוך צמחים דרך האדמה. קו חדש של העברת חומר: קליי זה נושאת חומצת גרעין בחינם אבק לשימוש אספקת חומרים פעילים כגון dsRNA קרקעות עבור ספיגת בצמחים, ובסופו של דבר לתוך חרקים. קליי שנהגו (A) ו- (B) אפוי קליי המתארים סובלנות/החזקת מים. אנא לחץ כאן כדי להציג גירסה גדולה יותר של הדמות הזאת.
פוטנציאל ה האליס היעד גנים | |||
ההצטרפות | גודל | שם הגן/הומולוגיה | |
XP_014293026.1 | 491 | Vitellogenin-דמוי-A1 (Vg) (איזופורמים אפשרי: vitellogenin-2-כמו isoform X1 XP_014291483.1; vitellogenin-2-כמו isoform X2 XP_014291484.1). | |
XP_014290953.1 | 545 | הורמון נעורים חומצה methyltransferase, O-כמו (JHAMT) (אפשרי homolog: הורמון נעורים חומצה XP_014283772.1 O-methyltransferase). | |
תחל | |||
ה-PCR | |||
שם הגן/הומולוגיה | פריימר שם | רצף | |
Vg | BMSB F Vitellog P2 | CAATTTGATCCACCGACTGTT | |
Vg | BMSB Vitellog P2 R | CCGCATGAATCTTACTCTGGA | |
JHAMT | BMSB JH P1 F | GGATGCTTATGAATAATCCAG | |
JHAMT | BMSB JH P1 R | GTATAGGATTGCCATTTTGG | |
T7 PCR | |||
Vg | T7 BMSB Vitellog P2 4263 F | GAATTAATACGACTCACTATAGGGAGACCAAAGTTGGAAGGGAATGA | |
Vg | T7 BMSB Vitellog P2 4753 R | GAATTAATACGACTCACTATAGGGAGACCGCATGAATCTTACTCTGGA | |
JHAMT | BMSB JH T7 P1 F | GAATTAATACGACTCACTATAGGGAGAGGATGCTTATGAATAATCCAG | |
JHAMT | BMSB JH T7 P1 R | GAATTAATACGACTCACTATAGGGAGAGTATAGGATTGCCATTTTGG | |
LacZ | T7 LacZ RNAi F | GAATTAATACGACTCACTATAGGGAGATGAAAGCTGGCTACAGGA | |
LacZ | T7 LacZ RNAi R | GAATTAATACGACTCACTATAGGGAGAGCAGGCTTCTGCTTCAAT | |
AK | dsAK-F | TAATACGACTCACTATAGGGAGTGGCATTCTTGTATGGCGTA | |
AK | dsAK-R | TAATACGACTCACTATAGGGAGGCCTGCAAGAATCTGTCTCC | |
AK | dsAK 50-F | TAATACGACTCACTATAGGGAGTGGCATTCTTGTATGGCGTA | |
AK | dsAK 50-R | TAATACGACTCACTATAGGGAGTGAAGCCCTTGTGGTAGTC | |
AK | dsAK 30-F | TAATACGACTCACTATAGGGAGACCCGGACTCTGGAGTAGG | |
AK | dsAK 30-R | TAATACGACTCACTATAGGGAGGCCTGCAAGAATCTGTCTCC | |
GFP | dsGFP-F | TAATACGACTCACTATAGGGAGCCAACACTTGTCACTACTTTCTCTT | |
GFP | dsGFP-R | TAATACGACTCACTATAGGGAGGTAATGGTTGTCTGGTAAAAGGA | |
qPCR | |||
Vg | RT Vitellog P2 F | TTGATAGTTGTTTGGATTTTGAAGGT | |
Vg | RT Vitellog P2 R | TCTTACTTGATCAGCGCTCAGAA | |
JHAMT | BMSB JH RT P1 F | AGGAAAACCCAAAATGGCAAT | |
JHAMT | BMSB JH RT P1 R | ATGTATTCTTCTTTTGGATCTTTTCTTGAG | |
486 | BMSB 18S F3 | ATGCCCCCGCCTGTCCTTATT | |
486 | BMSB 18S R3 | TGAAAGCAGCCTGAATAGTGG | |
GFP | GFP-F | GGTAAAAGGACAGGGCCATC | |
GFP | GFP-R | TCAAGGAGGACGGAAACATC | |
AK | AK חשבים-F | CGGACTTGAGGGAGAACTGA | |
AK | AK חשבים-R | GTGGTAGATACCGCGACCAG | |
-ג'קוזי | a-אמבטיה-F | GCGTCTCTTCGGTTTGACGG | |
-ג'קוזי | -אמבטיה-R | CACTTCACCATCTGGTTGGC |
טבלה 1. Oligonucleotide רצפי RNAi. המפורטים הם גנים ו oligonucleotides המשמש ליצירת PCR שברי dsRNA, תחל qPCR כדי לנתח את רמות תעתיק.
1 וידאו משלימים: Agars וג'ל כמו סופגים עבור משלוח ושחרור מתמשכת של dsRNA. Agars סינטטי או טבעי רטוב, ג'לים עם פתרון dsRNA זה עשוי לשמש בתור פיתיון או דיאטות פרוקי רגליים שונים. לחץ כאן כדי להוריד וידאו זה
RNAi הוכיחה להיות כלי חשוב לחקור פונקציה ביולוגית ג'ין ורגולציה, עם פוטנציאל גדול כדי להיות מנוצל עבור ניהול של חרקים מזיקים19,68,69,70, 71. מבחר gene (s) המתאימות עבור להשתיק זן חרקים נתון, שיטת מסירת dsRNA(s) התואמת החרק ועיצוב הן בעל חשיבות עליונה. השיטה אופטימלית עבור אספקת dsRNA לתוך חרק להיקבע מדעית, יחד עם הבחירה המינון היחסי עבור משלוח, כמו שיטות מסוימות עשויות להציע יתרונות ומגבלות אחרות. פיתוח biopesticide מולקולרית בסופו של דבר העלול להיות מתאימים לשחרור סביבתיים, נדרש שיטת משלוח ריאלי. יעילים, יתרון. לדוגמה, dsRNA למריחה הוכיחו להיות אפקטיבית עבור משלוח dsRNA פקד חרקים הדרים, גפנים42,44. אסטרטגיות חדשניות כגון שימוש של פיתיונות, פתרונות סוכרוז, שמרים או חיידקי dsRNA הייצור עבור בליעה ישירה, יישום מקומי של dsRNA על גבי צמחים, או ייצור של dsRNAs ספציפית על ידי הצמחים הטרנסגניים ששונה, קידמו את התפתחות 19,יעיל מבוסס RNAi שולטת72.
דוגמה טובה היא המודגמות כאן עם השימוש של שעועית ירוקה לספק dsRNA (איור 1 ו- 2 איור) שנועדו במיוחד להשפיע ולהפחית מזיקים חרקים חשיבות גלובלית. הירקות פיתח פרוטוקול מסירה dsRNA מתווכת באמצעות מקטעים של שעועית ירוקה שקוע, רווי dsRNA שימש כדי ביעילות היעד גנים ספציפיים לפיתוח זחל BMSB. שעועית ירוקה הם אחד הירקות רבים כי הם טרפו על ידי BMSB, אז אלה שימשו כאמצעי להעברת dsRNA. מדיומים אחרים של dsRNA משלוח שנבדקו (נתונים לא מוצג) אך החמיץ באספקת באמצעות תזונה BMSB כנראה עקב הבדלים מרקם לכלי הדם. לכן, השתמשנו מקטעים של שעועית ירוקה למסור במבחנה מסונתז dsRNA הנימפות BMSB. חומצות גרעין מועברת באמצעות צמח או טכניקה בתיווך ירקות פוטנציאלי יוכל לזירוז RNAi ב החרק של בחירה כפי שרואים כאן עם דלדול של גנים JHAMT ו- Vg BMSB (איור 2)62.
פרוטוקול מסירה זה ירקות dsRNA בתיווך שימש בהצלחה לזירוז RNAi לא רק BMSB אלא גם HB באמצעות ראמוס (איור 3), אבל משלוח אסטרטגיות, שיטות חייב להיות מותאם לכל גן ולכל חרק. לפיכך, מומלץ כי שיטות שונות להיבדק למסירה גם לגבי היעד גנים מרובים עניין אינדיבידואלי או על-ידי הערימה dsRNAs לפחות שני על מנת לקבל יותר פנוטיפי penetrance. יש כבר לסכם מספר שיטות למסירה dsRNA חרקים, חרקים התאים כולל האכלה13,22, השריית73,74, microinjection75וטכניקות אחרות76 המשמש ספיגת dsRNA לזירוז RNAi מערכתית. שיטות חדשות יותר עבור משלוח אוראלי של dsRNA לזירוז RNAi ב חרקים אחרים על ידי בליעה על צמחים שאינם הטרנסגניים התייחס גם כבר בחנו (איור 4, איור 5 ואיור 6). עצי הדר הוכחו לספוג dsRNAs גם דרך השורשים, הגבעול הקשה (המטען זריקות), או תרסיסים בריסוס42,44. בעבר, עצי הדרים וגפנים בוגרת שטופלו עם חרקים dsRNA ספציפי התואם הגן AK ACP והן GWSS. צמחים אלה שטופלו גרם לעלייה בתמותה עבור ACP והן GWSS עבור עד אורכים שונים של זמן41,45. יחד תוצאות אלו מדגימים ש-dsrna הזה לטרפד את הביטוי של גנים ספציפיים של החרקים למד.
אתגרים המשפיעות מוצלחת להחרשת גנים לכלול קבוצות ייחודיות של dsRNA nucleases (dsRNases) באה לידי ביטוי בעיקר בתחום הרקמה הבטן של חרקים, הפרשות הרוק, או את רמת החומציות במעיים אשר, עשוי להיות אחראי על השפלה של dsRNA47 77, ,78. עם זאת, כדי להתגבר על השפלה כזאת, RNAi מערכתית עלולה להיגרם ביעילות בחרקים ניצול ריכוז גבוה של dsRNA ו/או באמצעות PEG בתזונה עבור משלוח אוראלי של dsRNA גנים ספציפיים כדי להתגבר על השפלה כזאת62, 79. ספיגת של dsRNA והספקת עשוי גם להיות התייצב עם העזרה של מולקולות נושאת, כמו חלקיקי80 כמו משקם48, ליפוזומים כמו Lipofectamine 2000 ו- Metafectene76, פוליאתילן גליקול79, קליי nanosheets81, נקודה קוונטית פחמן50. המחקר מתבצע כדי לשפר את מסירת dsRNA באמצעות פיסות אגר, ג'ל רווי גנים ספציפיים dsRNA יעיל (נתונים לא מוצג, ראה 4 וידאו משלימה). ניתן להשתמש בטכניקה זו למסירה של מנה אפקטיבית של dsRNA נמלים שיכול לשאת את dsRNA חדורים שרף או אגר אל הקן כמזון.
בנוסף, היציבות של dsRNA ההתמדה לטווח ארוך של dsRNA ברקמות הצמח הוא בעל חשיבות, במיוחד עבור גידולים חקלאיים. dsRNA המופצים וסקולריים רקמות של צמחים, פירות או ירקות עלולים להצטבר עצה, שיפה עם פעילות אנזים מופחת לפני להיות בלע על-ידי חרקים לזירוז מנגנון RNAi. ייתכן צורך בוודאות יישומים יש dsRNA להימשך לתקופה קצרה, כגון 6 ימים בשעועית ירוקה או יותר, 36 h ב-62,אדמת82 כך ההצטברות של חומצות גרעין הסביבה הופכת לא סביר. עם זאת, נינה et al. הדגימו כי nanosheets יכול להגן על dsRNAs גדול מכל השפלה מוקדמת כמו גם התחלקות שחרורם מתמשכת על משטחים עלה על פני תקופה של 30 יום לפחות81.
באופן כללי האסטרטגיות משלוח dsRNA שנדונו כאן יכול לשמש להשתקת גנים ספציפיים חרקים על ההדברה. אספקה של dsRNA צמחים באמצעות המים להשקיה, שורש הירטבות או הזרקת תא המטען יכול להיות אסטרטגיית יעיל עבור חרקים מזיקים, כגון שורש מזינים, אשר אין שיטה בקרה יעיל זמין כעת. משלוח של dsRNA באמצעות נשא או ייצוב בינוני כגון חימר או אגר ניתן להוסיף ישירות על-ידי צמחים אל הקרקע עבור ספיגת. אחד הגורמים העיקריים עבור התקדמות איטית בפיתוח של biopesticides מולקולרית RNAi בתיווך מצרי לא העדר משלוח אוראלי יעיל טכניקות ליזום RNAi יעיל ויציבות תחת תנאים סביבתיים83. משלוח אוראלי שמפורטות כאן בעתיד ייעשה שימוש בשיטות להעברת חומצות גרעין בתיווך גנים להשתיק טיפולים לשתול sap האכלה, כמו גם ללעוס חרקים להקטין את הנזק חרקים בייצור המזון העולמי ולפתח המזיק אקולוגי בר קיימא ניהול.
המחברים אין לחשוף.
המחברים בתודה להכיר דונלד וובר, מייגן הרליהי (USDA, ארס Beltsville, MD) מתן BMSB על בסיס חצי פנסיון ניסויים ולשמירה על המושבות; מריה גונזאלס טי סלבדור עמ' לופז, (משרד החקלאות, ארס, בפורט פירס, פלורידה), ג'קי ל' מץ (אוניברסיטת פלורידה, בפורט פירס, פלורידה) תחזוקה המושבה, הכנת הדוגמא של ניתוחים.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
BMSB (H. halys) insects | USDA | ||
ACP (D. citri) insects | USDA | ||
organic green beans | N/A | ||
Citrus plants | USDA | ||
sodium hypochlorite solution | J.T. Baker | ||
green food coloring | McCormick & Co., Inc | ||
Thermo Forma chambers | Thermo Fisher Scientific | ||
Magenta vessel (Culture) | Sigma | ||
Primers | IDT DNA | ||
SensiMix SYBR | Bioline | ||
qPCR ABI 7500 | Applied Biosystems | ||
Spray bottle | N/A | ||
Parafilm | American Can Company | ||
TaKaRa Ex Taq | Clontech | ||
QIAquick | Qiagen |
Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article
Request PermissionThis article has been published
Video Coming Soon
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved