Method Article
Cet article explique les nouvelles techniques mises au point pour l’administration orale de l’ARN double brin (dsRNA) à travers les tissus vasculaires des plantes pour l’interférence ARN (ARNi) en sève nourrir les insectes.
Phloème et plantes sève alimentation insectes envahissent l’intégrité des cultures et des fruits pour récupérer des éléments nutritifs, dans le processus d’endommager les cultures vivrières. Insectes hémiptères représentent un certain nombre de ravageurs économiquement importantes des plantes qui causent des dégâts aux cultures en se nourrissant de la sève. La punaise brune marmorated (BMSB), Halyomorpha halys (Heteroptera : Pentatomidae) et le psylle asiatique agrume (ACP), Kuwayama Diaphorina citri (Hemiptera : Liviidae) sont des insectes hémiptères introduits en Amérique du Nord, où ils sont un ravageur envahissant de spécialité de haute valeur, rangée et cultures vivrières de base et d’agrumes, ainsi qu’un ravageur de nuisance quand ils regroupent à l’intérieur. Résistance aux insecticides chez de nombreuses espèces a conduit au développement de méthodes alternatives de stratégies de lutte antiparasitaire. Double-stranded RNA (dsRNA)-médiée par l’interférence ARN (ARNi) est un gène silencieux mécanisme pour des études de génomique fonctionnelles qui a des applications potentielles comme un outil pour la gestion des ravageurs. DsRNA exogène synthétisée ou petits ARN interférents (siARN) peut déclencher silençage de génétique très efficace par le biais de la dégradation de l’ARN endogène, qui est homologue à celui présenté. Utilisation efficace et environnementale de l’ARNi comme biopesticides moléculaire pour le contrôle biologique d’insectes hémiptères exige la livraison in vivo de l’ARNdb en se nourrissant. Nous démontrons ici les méthodes pour la livraison de dsRNA aux insectes : chargement d’ARNdb en haricots verts par immersion et d’absorber de dsRNA de gène-spécifiques avec la livraison par ingestion orale. Nous avons également défini les méthodes de prestation des plantes non transgéniques à l’aide de pulvérisations foliaires, bassinage racine, injections de tronc ainsi que des granules d’argile, qui peuvent être essentielles pour la LIBERATION PROLONGEE d’ARNdb. La prestation efficace de dsRNA ingéré par voie orale a été confirmée comme un dosage efficace pour induire une diminution significative de l’expression des gènes ciblés, tels que l’hormone juvénile l’acide O-méthyltransférase (JHAMT) et de la vitellogénine (Vg). Ces méthodes novatrices représentent des stratégies pour la délivrance de dsRNA à utiliser en protection des végétaux et de surmonter les défis environnementaux pour les ravageurs.
Insectes hémiptères comprennent certains des ravageurs plus économiquement significatifs d’agriculturebecause de leur capacité à atteindre la croissance démographique élevée et la propagation des maladies des plantes. Le BMSB, H. halys Stål, est un parasite envahissant introduite accidentellement dans l’hémisphère occidental à Allentown, en Pennsylvanie, d’Asie (Chine, Taiwan, Corée et Japon) avec la première observation en 19961. Depuis son introduction, BMSB a été détectée dans 43 États, avec des populations plus élevées dans le milieu de l’Atlantique (DE, MD, PA, New Jersey, Virginie et WV), ainsi qu’au Canada et en Europe et représente une menace potentielle pour l’agriculture2. Comme un parasite polyphage, BMSB peut susciter des dommages à environ 300 identifiés de plantes hôtes, y compris les cultures de grande valeur tels que des pommes, raisins, plantes ornementales, cultures de semences, le soja et maïs. Dommage est causé principalement due au mode d’alimentation dite de lacérer et chasse où l’animal perce la plante hôte avec son stylet aciculaires d’avoir accès aux nutriments entre les tissus vasculaires2,3. BMSB est aussi un parasite intérieur qu’ils peuvent trouver de résidence dans les bassins de vie tels que les écoles et les maisons en automne et hiver2. Produits chimiques et des aéroallergènes sortis BMSB auraient illicite réaction allergique chez les travailleurs de récolte de fruits. BMSB peuvent aussi contribuer à la maladie allergique conduisant à une dermatite de contact, conjonctivite et rhinite chez les personnes sensibles4,5. Un autre insecte hémiptère, l’ACP, d. citri Kuwayama (Hemiptera : Liviidae), est un ravageur important des agrumes et transmet les bactéries limitée dans le phloème (Candidatus Liberibacter asiaticus) provoquant le Huanglongbing (HLB), mieux connu comme citrus greening maladie6,7. HLB a été pour la première fois de la Chine du Sud et s’est propagé aux 40 différents asiatique, africain, océanien, du Sud et nord-américains pays7. Citrus greening est un problème dans le monde entier avec la menace des pertes économiques et financières en raison de la perte d’agrumes ; par conséquent, gestion des ACP est considéré comme primordial pour prévenir et contrôler la HLB.
Mesures pour un contrôle efficace de ces insectes nuisibles requiert habituellement l’application de pesticides chimiques qui sont relativement courtes a vécu. Stratégies de lutte insecticide chimique souvent manquent de stratégies de gestion de l’environnement sécuritaire ou ont diminué la sensibilité en raison de la résistance aux pesticides dans les populations de ravageurs8,9. Donc, le contrôle biologique des ravageurs avec biopesticides moléculaire est une alternative possible, mais son utilisation restera globalement modeste, et diverses espèces de parasitoïdes (p. ex., Trisolcus japonicus) peuvent également être efficaces comme biologiques naturels contrôles. Arni est un potentiel de nouvelles technologies pour la gestion des ravageurs envahissants avec biopesticides moléculaire10. Arni est un mécanisme de régulation génique bien décrite qui facilite le silence efficace génique post-transcriptionnel d’endogène ainsi que d’envahir les ARN doubles brins de façon séquence-spécifique, qui mène finalement à la régulation de l’expression génique à l’ARNm niveau11,12. En bref, lorsque dsRNA exogène est internalisé dans une cellule, qu'il est transformé en siARN par un membre de la superfamille de RNase III nucléase bidentates, appelée Dicer, évolutivement conservée en vers, mouches, plantes, champignons et mammifères13, 14 , 15. ces duplex siARN de 21 à 25 nucléotides est ensuite déroulé et intégré dans le complexe silencieux RNA-induced (RISC) comme guide RNAs. Ce complexe RISC-RNA permet l’appariement Watson-Crick base à complémentaires cibles ARNm ; Cela conduit finalement au clivage de la protéine Argonaute, une protéine de domaine multi contenant un domaine RNase H-like, qui dégrade l’ARNm correspondants et réduit la traduction des protéines, ce qui conduirait à post-transcriptionnel gene silencing16 , 17 , 18.
Arni pour la lutte antiparasitaire nécessite l’instauration d’ARNdb en vivo pour réduire au silence le gène d’intérêt, activant ainsi la voie de siARN. Diverses méthodes qui ont été utilisés pour la livraison de dsRNA aux insectes et aux cellules d’insecte pour induire RNAi systémique incluent nourrir10,19, tremper20,21,22de la microinjection, transporteurs comme les liposomes 23et autres techniques24. Arni a démontré chez Caenorhabditis elegans pour faire taire l’expression des gènes unc-22 par le feu et Mello25, suivi par précipitation dans l’expression des gènes crépus chez Drosophila melanogaster,26. Les premières études fonctionnelles utilisées microinjection pour livrer des dsRNA chez les insectes, tels que Apis mellifera22,27, Acyrthosiphon pisum,28,29de Blattella germanica, Halys H.30et lépidoptères (évaluées par Terenius et al. 31). microinjection est avantageuse pour livrer une dose précise et exacte sur le site d’intérêt chez l’insecte. Quoique ces piqûres septiques peuvent déclencher l’expression de gènes liés immunitaires due à un traumatisme32, par conséquent, écartant de sa pratique dans le développement agricole de biopesticides.
Une autre méthode de prestation des ARNdb en vivo est par trempage, qui implique ingestion ou absorption de dsRNA par suspension des animaux ou des cellules généralement dans le milieu extracellulaire contenant des ARNdb. Trempage a été utilisé pour induire efficacement Arni dans les cellules de culture de tissus Drosophila S2 pour inhiber en aval-de-Raf1 (DSOR1) mitogène-protéine kinase kinases (MAPKK)20, ainsi que chez c. elegans pour réduire au silence les POS-1 gène33. Cependant, dsRNA envoyée à l’aide de trempage est moins efficace pour induire l’ARNi contre microinjection20. Arni médiée silencieux chez un insecte à chiquer fut montrée à la chrysomèle des racines du maïs (WCR) (Diabrotica virgifera virgifera) en perfusant l’ARNdb dans une gélose artificiel alimentation10. De précédentes études ont résumé des méthodes permettant de livrer des ARNdb infusé dans les régimes naturels spécifiques aux arthropodes34. Ces méthodes de livraison ont été déterminées plus efficace comparativement à des moyens artificiels de livraison ; comme dans le cas de la mouche tsé-tsé (Glossina morsitans morsitans), où égale précipitation d’un gène du système immunitaire a été observée quand les ARNdb a été livré par la farine de sang ou micro-injection35. De même, la livraison de dsRNA par les gouttelettes dans apple brun léger moth (Epiphyas postvittana)36, larves de teigne des crucifères (Plutella xylostella)37, ainsi que miel abeilles38,39 induite par ARNi efficace. Des expériences d’Arni plus efficaces dans hémiptère ont utilisé des injection d’ARNdb40 parce que l’administration orale d’ARNdb en insectes hémiptères est ardue car il doit être livré à travers les tissus vasculaires de la plante hôte. RNAi efficace s’observe également dans les pays ACP et vitreux ailes sharpshooter cicadelle (GWSS), Homalodisca vitripennis: dsRNA a été livré à travers agrumes et de vignes qui avaient absorbé des ARNdb dans les tissus vasculaires par bassinage racine, foliaire vaporisateurs, des injections de tronc ou absorption par boutures41,42,43,44,45,46. Cela a également entraîné le premier brevet pour dsRNA contre les pays ACP (2016, nous 20170211082 A1). Livraison des siARN et dsRNA à l’aide de supports tels que des nanoparticules et liposomes confère une stabilité et augmentation inhabituelle de l’ARNdb livré émergent rapidement23,47,48,49 ,,50. Une nouvelle classe de vecteurs à base de nanoparticules d’acides nucléiques pour in vitro et in vivo qui ont été résumées spécifiquement pour des applications thérapeutiques peuvent transmettre un potentiel immense comme vecteurs de livraison adapté51. Nanoparticules comme un véhicule de livraison pour l’ARNdb peuvent avoir des inconvénients dont la solubilité, hydrophobie ou bioaccumulation limitée52, mais une livraison aider ã polymère adapté peut compenser ces inconvénients. Développement et l’utilisation de la prestation des nucléotides émergent aussi appelés « antisens », qui sont simple brin ARN/ADN duplex46.
La vitellogenèse chez les arthropodes est une clé processus contrôlant la reproduction et régulée par l’hormone juvénile (JH) ou l’ecdysone, qui sont les inducteurs principaux de synthèse de la Vg de la masse grasse ; le Vg est finalement repris par l’ovocyte en développement par l’intermédiaire de l’endocytose médiée par le récepteur Vg53. VG est un groupe de polypeptides synthétisés extraovarially, qui est essentiel pour le développement de la protéine grands oeufs jaune vitellin54,55, et par conséquent, il est important dans la reproduction et vieillissement56. VG a été réduit au silence avec succès dans les nématodes57 ainsi que dans l’abeille à miel (Apis mellifera) où par l’appauvrissement de la couche de Vg ARN a été observée chez les adultes et œufs22. Arni silençage de médiation génique post-transcriptionnel de Vg a été testé car on pensait que son appauvrissement conduirait à un effet phénotypique observable telles que réduit la fertilité et la fécondité, pour éventuellement aider à contrôle BMSB. Le gène JHAMT qui code pour la S-adénosyl-L-méthionine (SAM)-dépendante JH acide O-méthyltransférase, catalyse l’étape finale de la JH biosynthèse voie58. Dans cette voie farnésyl pyrophosphate (FPP) est séquentiellement transformé farnésol, acide farnesoic, suivie de la conversion de méthyle farnesoate JH par JHAMT. Cette voie est conservée chez les insectes et arthropodes spécifiquement pour la métamorphose, un processus développemental réglementé par hormones59,60,,61. Chez b. mori, expression des gènes JHAMT et l’activité biosynthétique JH dans les corps allates suggèrent que la répression transcriptionnelle du gène JHAMT est cruciale pour la terminaison de JH biosynthèse58. Par conséquent, les gènes JHAMT et Vg ont été sélectionnés pour épuisement ciblée utilisant l’ARNi. Arni a également été testé dans les arbres d’agrumes pour le contrôle de l’ACP et GWSS. Arbres d’agrumes ont été traités avec dsRNA par bassinage racine, la tige de robinet (injections de tronc), ainsi que les pulvérisations foliaires avec ARN doubles brins contre insectes spécifiques arginine kinase (AK) transcriptions42,44. L’application topique de dsRNA a été détectée dans la canopée des arbres d’agrumes, ce qui indique une livraison efficace à travers les tissus de plantes vasculaires et a entraîné une mortalité accrue dans les pays ACP et GWSS41,42, 45.
Dans la présente étude, nous avons identifié une méthode de livraison d’alimentation naturelle pour les traitements tels que l’ARNdb. Cette nouvelle technique a ensuite été utilisée pour faire taire le JHAMT et le Vg mRNA à l’aide de gènes spécifiques ARN doubles brins en nymphes BMSB comme démontré plus tôt62. Ces nouveaux protocoles de livraison démontrés ici remplacent des systèmes de livraison RNA conventionnels qui utilisent des sprays topiques ou des microinjections. Légumes et fruits, tige robinet, sol Drenchage et absorbants d’argile en peuvent servir pour la livraison de dsRNA, ce qui est essentiel à la poursuite du développement de la gestion des ravageurs et pathogènes des biopesticides.
1. BMSB élevage
2. sélection des régions des gènes et la synthèse In Vitro d’ARNdb
3. livraison de dsRNA haricots verts à l’aide
4. en temps réel Quantitative (qPCR) analyse d’Expression suivants Arni Mediated silençage génique dans BMSB
5. foliaire Application dans les grands arbres d’agrumes en pot et semis
Remarque : Les plantes du cultivar «Carrizo» citrange (Citrus sinensis XPoncirus trifoliata, Rutaceae), agrume ont été maintenus en serre sous la lumière naturelle et de la température, cultivés en contenants de 1,2 L. Les plantes ont été constamment taillés pour favoriser la croissance des nouvelles pousses foliaires, appelée « fleur ». ACP préfère l’alimentation et la ponte sur les nouvelles pousses des agrumes64.
6. sol/racines bassinage demande en gros ou petit en pot semis et agrumes
7. tige robinet (Injection de tronc d’arbre) demande, dans les grands arbres d’agrumes en pot et semis
8. dsRNA Granules argile traitée pour la livraison aux insectes par sol
Livraison de légumes dsRNA de médiation en se nourrissant de larves de stade BMSB 4ème a été testé pour le développement des biopesticides moléculaires à l’aide de RNAi de ravageurs envahissants. BMSBs flux à l’aide de leurs stylets aciculaires par un mécanisme appelé lacerate, puis rincez, qui provoque des dégâts considérables aux cultures. Mince de haricots verts biologiques, P. vulgaris L., ont servi à vérifier si les éléments nutritifs ou dsRNA pouvait être livré en vivo à BMSB à alimentation3. Segments de haricots verts ont été immergés dans l’eau libre de DNase/RNase ou une solution d’eau et le colorant alimentaire vert pour tester la livraison en BMSB (Figure 1 a). Le colorant alimentaire vert était utilisé comme un indicateur visuel d’imiter l’ARNdb. Le tissu vasculaire des haricots verts étaient saturés avec la coloration de nourriture verte en raison de l’écoulement de la solution de couleur verte par le phloème par action capillaire62. Nymphes BMSB ont été observées sur les segments des haricots verts d’alimentation en y insérant leurs stylets les tissus vasculaires des haricots verts (Figure 1 b). Gouttelettes d’excréments de couleur verte ont été observés après des jours 2 et 3 chez les insectes qui ont été nourris sur haricots imprégnées de nourriture verte coloration indiquant le matériel livré a été ingéré par voie orale et traversé l’intestin avant l’excrétion (Figure 1, D ).
Par la suite, nous avons testé si déplétion significative de l’expression des gènes ciblés a été réalisée à l’aide de la prestation de haricot vert médiée par des ARNdb spécifique BMSB par ingestion en BMSB. Segments de l’haricot vert ont été immergés et absorbé une solution de 0,067 µg/µL (20 µg dans 300 µL d’eau libre de DNase/RNase) ou 0,017 µg/µL (5 µg dans 300 µL d’eau libre de DNase/RNase) d' in vitro synthétisé ARNdb spécifique BMSB JHAMT et Vg , respectivement. Haricots verts étaient également immergés dans l’eau seul, 0,067 µg/µL ou 0,017 µg/µL LacZ dsRNA (Mock) comme témoins respectifs. Niveaux de transcription ont été évalués à l’aide de qPCR indiquant que l’expression de JHAMT et le Vg mRNA a été considérablement réduit en vivo de presque 4,5 - et 2.2-fold, respectivement (Figure 2 a, B). Par conséquent, les résultats indiquent que dsRNA peut être transmis à travers les tissus vasculaires des haricots verts pour induire RNAi réussie.
Un autre parasite hémiptère, le bug de l’arlequin (HB) (Murgantia histrionica), qui cause des dommages aux cultures ont aussi été testés si mise en œuvre réussie des nutriments ou des traitements de l’ARNdb ont pu être livré à l’aide de ce légume de cole médiée par livraison. Les larves de HB 4ème stade pouvaient se nourrir bébé chou vert (Brassica oleracea var. viridis) immergé dans l’eau ou une solution d’eau avec du colorant alimentaire vert. Résultats indiquent que HB nourris et ingéré la coloration de nourriture verte, qui ressortait de leurs excréments de couleurs verts, comparativement à HB qui ingéré les légumes plongés dans l’eau, qui avait clairement des excréments (Figure 3).
Techniques complémentaires pour la livraison transitoire de dsRNA de pulvérisation ou trempage résultats dsRNA absorption dans l’ensemble de l’usine tissus65,66de racine/sol. Produits à base de RNAi pulvérisables sont en développement et peuvent être disponibles bientôt en attendant l’approbation. Livraison d’ARNdb dans les champs à l’aide de sprays ou racine bassinage peut aider dans la gestion des insectes envahissants42,67. Semis et pleines de citronniers ont été exposés à l’ARNdb par pulvérisation foliaire, soit par terre ou à racines nues Drenchage, respectivement (Figure 4). Résultats indiquent qu’ARN doubles brins remises par deux pulvérisations ou sol/nu racine bassinage pu déceler dans les agrumes (2,5 m de haut) pour 7 semaines après une exposition unique de 2 g de dsRNA42. Livraison et ingestion de psylle dsRNA-AK (20 ng/µL) a augmenté la mortalité Psylle de 30 à 45 % (Figure 4)42.
In vitro transcrit ARNdb peut être fourni efficacement aux insectes polyphages à l’aide de tige de robinet (injections de tronc) du gène ARNdb spécifiques directement dans les tissus vasculaires de la plante, qui peuvent être acquis par les insectes, quand s’abattent sur ces plantes44 (Figure 5). Pour les citronniers qui ont été exposés à l’ARNdb par des injections de tronc, dsRNA pu déceler dans les agrumes âgés (environ 1 m de haut) pendant 7 semaines après une exposition unique à l’aide de 6 mL d’ARNdb 1,7 mg/ml dans une solution de DNase/RNase eau libre (Figure 5 a B). Phloème qui se nourrissent des insectes hémiptères pouvaient alors se nourrissent de ces plantes hôtes traitées avec l’ARNdb. Il est supposé que dsRNA a été infusé et traversé le système vasculaire des plantes agrumes pour l’ingestion par l’ACP, qui a démontré la mortalité lorsque se nourrissent de dsRNA-AK42avec succès.
Bioessais développé à partir de 2008 à 2012, ont été projetés à travers une grande variété de plantes en pot et semble donner des ARNdb livraison d’une manière par laquelle les plantes peuvent absorber et translocation dsRNA de dsRNA systémique diffusion41,42 . Une méthode utilise un élément absorbant de l’argile avec une adsorption d’ARNdb dans la matrice argileuse ; Cela inclut une grande variété d’argiles, de terre à foulon, zéolite et d’autres, comme ainsi que d’autres matériaux absorbants, bouillons, cellulose, bioplastiques, etc. Clay particules sont porteurs d’acides nucléiques libres de poussière qui peuvent être utilisés pour fournir les ingrédients actifs comme dsRNA aux sols pour absorption de la plante et en fin de compte la livraison aux insectes (Figure 6). L’argile complexe peut également être chimiquement configuré pour libérer l’ARNdb sous pH spécifique ou des conditions ioniques. Méthodes de prestation d’argile d’ARNdb en plantes ont démontré d’ARNdb en arbres d’agrumes en pot et autres plantes pendant plus de 14 mois (données non présentées). Ce système permet de modifier les traits de végétaux, tels que les couleurs de fleur, hauteur de la plante (nanisme) ou d’autres. Actuellement, l’utilisation principale de cette méthode est pour le développement d’un insecte efficace et le contrôle de l’agent pathogène (virus) ou la gestion. L’approche peut être rentable pour les pépinières et les propriétaires d’une maison et est une méthode non transgéniques.
Figure 1 . Livraison de nutriments ou de dsRNA par haricots verts. (A) Segments de haricots organiques minces ont été immergés et absorbé la solution dans un tube de microcentrifuge de 2 mL contenant 300 µL de ddH2O seul ou FD2O avec la coloration de nourriture verte, pendant 3 h. Trois 4ème stade larvaire BMSB nymphes étaient pendant 24 heures et placées dans des récipients de culture ainsi que 3 haricots verts par navire. (B) BMSB se nourrit des segments de haricots verts, immergés dans l’eau en perçant à travers les haricots verts pour atteindre les éléments nutritifs avec leurs stylets. (C) jour 2 de la BMSB alimentation biologique, flèches indiquent les excréments. (D) jour 3 ; Accrue des excréments BMSB (indiquées par la flèche) observés après ingestion d’une solution de ddH2O et vert colorant par le biais de haricots verts alimentaire. S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.
Figure 2 . Analyse de RT-PCR quantitative pour mesurer le niveau de transcription après épuisement véhiculée par ARNi de JHAMT et Vg dans BMSB. ARN total 3 individuels BMSB 4ème stade larvaire nymphes se nourrissent JHAMT (A) 20 µg (0,067 µg/µL) et Vg (B) 5 µg (0,017 µg/µL) ARNdb dans 300 µL de ddH2O offerts par l’entremise de tronçons de haricots verts, a été isolé et le niveaux de transcription ont été mesurés par qPCR. DsRNA LacZ (Mock) a servi de témoin négatif. L’ARN 18 s BMSB a été utilisé comme étalon interne pour corriger les différences dans la récupération de RNA de tissus. Les résultats fournis sont de trois réplicats biologiques et barres d’erreur indiquent SEM Une analyse de variance (ANOVA) a été effectuée pour tester la signification statistique des données, p < 0,0001. Résultats reproduits de Ghosh et al. 62 S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.
Figure 3 . Administration orale du traitement chez Harlequin bug (M. histrionica ) à l’aide de mesclun collard. Verts de collard biologiques pour bébés ont été lavés avec de l’hypochlorite de sodium 0,2 %, parés et immergés dans un tube de microcentrifuge cap-moins de 2 mL contenant 300 µL de solution de DNase et de (A) / RNase ddH gratuit2O, ou (B) DNase/RNase free ddH2 Solution de O avec la coloration de nourriture verte, pour une période de 3 h. Trois larves de HB stade 4e ont été pendant 24 heures puis placées dans des récipients de culture et a permis à ces feuilles de chou vert se nourrissent pendant 3 jours. Flèches blanches indiquent les excréments observées le jour 3 postes d’alimentation. S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.
Figure 4 . Racinaire et foliaire drench demande de semis et de citronniers. Les plantes sélectionnées ou semis préalables à utiliser ne sont pas arrosées pendant 2-3 jours laisser le sol sécher à l’humidité, mais pas complètement secs. (A) les arbres étaient d’abord surmontés et 200 mL de solution de dsRNA (0,5 mg/mL) à la DNase/RNase eau libre a été appliqué à la main flacon pulvérisateur pompe à l’aile inférieure. (B), 100 mL de dsRNA solution (1 mg/mL) en eau libre de DNase/RNase a été appliquée au sol des semis dans un sol partiellement sec. (C) 100 mL de solution de dsRNA (1 mg/mL) en eau libre a été appliqué aux racines nues de semis pendant environ 3 h (D) de DNase/RNase ACP se nourrissant de semis qui avaient absorbé dsRNA par les racines nues, ont montré une mortalité accrue ACP. S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.
Figure 5 . Injection de tronc agrume semis arbre. Agrumes semis environ 1 m de haut ont été injectés avec 1,7 mg/mL d’ARNdb. (A) percer les trous dans les agrumes semis à l’aide d’une mèche de 10 mm de diamètre pour insérer la tige de la plante de l’injecteur. La pointe de cuivre exposée de chaque injecteur était enveloppée avec une bande large de 0,6 cm (¼ po) de film pour éviter les fuites d’étanchéité. Injecteurs (B) remplis de 6 mL de la solution colorée ont été appliqués à la tige (tronc) des semis. Injecteurs ont été laissés en place pendant environ 6 à 10 h pour l’absorption complète de la solution. S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.
Figure 6 . Livraison d’Amendement de sol d’argile d’ARNdb dans les usines à travers le sol. Une nouvelle ligne de livraison matériel : argile qui est un transporteur d’acides nucléiques poussière devant servir à fournir des ingrédients actifs tels que l’ARNdb aux sols pour l’absorption chez les plantes et finalement en insectes. Argile non cuite (A) et (B) cuits au four d’argile dépeignant la tolérance/rétention d’eau. S’il vous plaît cliquez ici pour visionner une version agrandie de cette figure.
Gènes potentiels de la cible du halys H. | |||
Adhésion | Taille | Nom/homologie de gène | |
XP_014293026.1 | 491 | La vitellogénine-A1-like (Vg) (Isoformes possible : vitellogénine-2-comme l’isoforme X1 XP_014291483.1 ; la vitellogénine-2-comme l’isoforme X2 XP_014291484.1). | |
XP_014290953.1 | 545 | Acide de l’hormone juvénile type O-méthyltransférase (JHAMT) (Homologue possible : hormone juvénile acide O-méthyltransférase XP_014283772.1). | |
Amorces | |||
PCR | |||
Nom/homologie de gène | Nom de l’apprêt | Séquence | |
VG | BMSB Vitellog P2 F | CAATTTGATCCACCGACTGTT | |
VG | R Vitellog P2 BMSB | CCGCATGAATCTTACTCTGGA | |
JHAMT | BMSB JH P1 F | GGATGCTTATGAATAATCCAG | |
JHAMT | BMSB JH P1 R | GTATAGGATTGCCATTTTGG | |
T7 PCR | |||
VG | T7 BMSB Vitellog P2 4263 F | GAATTAATACGACTCACTATAGGGAGACCAAAGTTGGAAGGGAATGA | |
VG | T7 BMSB Vitellog P2 4753 R | GAATTAATACGACTCACTATAGGGAGACCGCATGAATCTTACTCTGGA | |
JHAMT | BMSB JH T7 P1 F | GAATTAATACGACTCACTATAGGGAGAGGATGCTTATGAATAATCCAG | |
JHAMT | BMSB JH T7 P1 R | GAATTAATACGACTCACTATAGGGAGAGTATAGGATTGCCATTTTGG | |
LacZ | T7 LacZ RNAi F | GAATTAATACGACTCACTATAGGGAGATGAAAGCTGGCTACAGGA | |
LacZ | T7 LacZ RNAi R | GAATTAATACGACTCACTATAGGGAGAGCAGGCTTCTGCTTCAAT | |
AK | dsAK-F | TAATACGACTCACTATAGGGAGTGGCATTCTTGTATGGCGTA | |
AK | dsAK-R | TAATACGACTCACTATAGGGAGGCCTGCAAGAATCTGTCTCC | |
AK | dsAK 50-F | TAATACGACTCACTATAGGGAGTGGCATTCTTGTATGGCGTA | |
AK | dsAK 50-R | TAATACGACTCACTATAGGGAGTGAAGCCCTTGTGGTAGTC | |
AK | dsAK 30-F | TAATACGACTCACTATAGGGAGACCCGGACTCTGGAGTAGG | |
AK | dsAK 30-R | TAATACGACTCACTATAGGGAGGCCTGCAAGAATCTGTCTCC | |
GFP | dsGFP-F | TAATACGACTCACTATAGGGAGCCAACACTTGTCACTACTTTCTCTT | |
GFP | dsGFP-R | TAATACGACTCACTATAGGGAGGTAATGGTTGTCTGGTAAAAGGA | |
qPCR | |||
VG | RT Vitellog P2 F | TTGATAGTTGTTTGGATTTTGAAGGT | |
VG | RT Vitellog P2 R | TCTTACTTGATCAGCGCTCAGAA | |
JHAMT | BMSB JH RT P1 F | AGGAAAACCCAAAATGGCAAT | |
JHAMT | BMSB JH RT P1 R | ATGTATTCTTCTTTTGGATCTTTTCTTGAG | |
486 | BMSB 18 S F3 | ATGCCCCCGCCTGTCCTTATT | |
486 | BMSB 18 S R3 | TGAAAGCAGCCTGAATAGTGG | |
GFP | GFP-F | GGTAAAAGGACAGGGCCATC | |
GFP | GFP-R | TCAAGGAGGACGGAAACATC | |
AK | AK quant-F | CGGACTTGAGGGAGAACTGA | |
AK | AK quant-R | GTGGTAGATACCGCGACCAG | |
a-Tub | a-Tub-F | GCGTCTCTTCGGTTTGACGG | |
a-Tub | a-Tub-R | CACTTCACCATCTGGTTGGC |
Tableau 1. Séquences d’oligonucléotides d’Arni. Énumérés sont les gènes et les oligonucléotides utilisés pour générer des fragments, dsRNA et qPCR amorces PCR afin d’analyser les niveaux de transcription.
Supplémentaire vidéo 1 : bouillons et gels comme absorbants pour livraison et LIBERATION PROLONGEE de dsRNA. Des bouillons synthétiques ou naturelles hydratées et gels avec solution de dsRNA qui peut être utilisé comme appât ou diètes pour divers arthropodes. Veuillez cliquer ici pour télécharger cette vidéo
Arni s’est avéré pour être un outil important pour explorer la fonction biologique du gène et la réglementation, avec un grand potentiel d’être utilisé pour la gestion des ravageurs19,68,69,70, 71. la conception et la sélection d’un ou plusieurs gènes appropriés pour faire taire dans une espèce donnée d’insectes et la méthode de livraison de le dsRNA(s) correspondant à l’insecte sont tous deux d’une importance capitale. La méthode optimale pour faire pénétrer des ARNdb dans un insecte doit être déterminée empiriquement, ainsi que la sélection de la dose relative pour la livraison, comme certaines méthodes peuvent offrir des avantages et autres limitations. Pour le développement d’un biopesticide à base moléculaire qui peut-être en définitive être adapté pour la dissémination dans l’environnement, il faut une méthode de livraison possible, efficace et avantageux. Par exemple, dsRNA appliqué topiquement a montré pour être efficace de dsRNA livraison pour la lutte contre les insectes aux agrumes et vigne42,44. Des stratégies novatrices telles que l’utilisation d’appâts, de solutions de saccharose, de levure ou de production de dsRNA bactérienne pour l’ingestion directe, l’application topique d’ARNdb sur les plantes, ou la production d’ARN doubles brins spécifique de plantes transgéniques modifiées, ont avancé le développement de des contrôles efficaces axées sur l’ARNi19,72.
Un bon exemple est montré ici avec l’utilisation des haricots verts pour livrer des ARNdb (Figure 1 et Figure 2) conçu spécifiquement un impact et réduire un ravageur d’importance mondiale. Le légume nouvellement développé dsRNA médiée par protocole de livraison à l’aide de segments de haricots verts immergé et imprégnée de dsRNA a servi à effectivement des gènes cibles spécifiques pour le développement larvaire dans BMSB. Haricots verts sont un des nombreux légumes qui sont dévorés par BMSB et donc ces ont été utilisés comme un moyen pour livrer l’ARNdb. Autres médiums de dsRNA livraison ont été testées (données non présentées), mais ont échoué dans la fourniture de nutrition à la BMSB probablement en raison de différences de texture vasculaire. Donc, nous avons utilisé des segments de haricots verts à livrer en vitro synthétisé dsRNA aux nymphes BMSB. Les acides nucléiques envoyées dans une usine ou une technique de médiation végétale peut être potentiellement capables d’induire des Arni chez l’insecte de choix tel qu’observé ici avec l’appauvrissement des gènes JHAMT et Vg dans BMSB (Figure 2)62.
Ce protocole de livraison légumes dsRNA de médiation a été utilisée avec succès pour induire RNAi non seulement en BMSB, mais aussi en DP à l’aide de feuilles de chou vert (Figure 3), bien que des stratégies de prestation et les méthodes doivent être optimisées pour chaque gène et les insectes. Par conséquent, il est recommandé que diverses méthodes soient testés pour livraison aussi bien quant à cibler plusieurs gènes d’intérêt individuellement ou par cumul au moins deux ARN doubles brins afin d’obtenir mieux phénotypique pénétrance. Plusieurs méthodes ont été résumées pour la livraison de dsRNA aux insectes et aux cellules d’insectes y compris l’alimentation13,22, trempage73,74,75de la microinjection et autres techniques76 utilisé pour dsRNA absorption d’induire RNAi systémique. Des méthodes plus récentes pour l’administration orale de dsRNA pour induire l’ARNi chez d’autres insectes par ingestion sur les plantes non transgéniques traitées ont également été explorés (Figure 4, Figure 5et Figure 6). Arbres d’agrumes ont été démontrés d’absorber des ARN doubles brins soit par le biais de racines, la tige du robinet (injections de tronc), ou des pulvérisations foliaires42,44. Auparavant, les citronniers et les vignes matures ont été traités avec insecte ARNdb spécifique correspondant au gène AK ACP et GWSS. Ces plantes traitées provoqua une augmentation dans la mortalité pour les ACP et GWSS pour jusqu'à diverses longueurs de temps41,45. Ensemble, ces résultats démontrent qu’ARNdb peut entraver l’expression de gènes spécifiques dans les insectes étudiés.
Les défis qui affectent le succès silencing de l’expression génique comprennent des groupes particuliers de dsRNA nucléases (dsRNases) exprimés principalement dans les tissus de l’intestin des insectes et des sécrétions salivaires ou le pH de l’intestin qui, peut être responsable de la dégradation de l’ARNdb47 ,77,,78. Cependant, pour remédier à cette dégradation, Arni systémique peut être induite efficacement chez les insectes en utilisant des concentrations plus élevées d’ARNdb et/ou en utilisant PEG dans le régime alimentaire, pour l’administration orale de dsRNA de gène-spécifique, pour surmonter cette dégradation62, 79. livraison et absorption d’ARNdb peuvent également être stabilisés à l’aide de molécules de transporteur, telles que les nanoparticules80 comme Chitosan48, liposomes comme Lipofectamine 2000 et Metafectene76, polyéthylèneglycol79, argile nanofeuillets81et carbone quantum dot50. La recherche est en cours afin d’améliorer la prestation efficace des ARNdb en utilisant des morceaux agar et gel infusés avec gène ARNdb spécifiques (données non présentées, consultez Supplemental vidéo 4). Cette technique peut être utilisée pour la livraison d’une dose efficace de dsRNA fourmis pouvant transporter l’ARNdb imprégné de résine ou la gélose au nid comme nourriture.
En plus de la stabilité des ARNdb, persistance à long terme d’ARNdb dans des tissus végétaux est d’importance, surtout pour les cultures agricoles. dsRNA distribué à travers les tissus vasculaires des plantes, des fruits ou des légumes peut-être s’accumuler dans le xylème et le phloème avec activité enzymatique réduite avant d’être ingéré par les insectes pour induire le mécanisme d’Arni. Il peut être nécessaire pour certaines applications d’avoir dsRNA persistent pendant une courte période, comme pendant 6 jours de haricots verts ou plus longs, pendant 36 h dans le sol62,82 afin que l’accumulation d’acides nucléiques dans le milieu devient peu probable. Cependant, Neena et coll. ont démontré que nanofeuillets pourrait protéger grand ARN doubles brins de dégradation prématurée comme ainsi que médiat leur libération prolongée sur la surface des feuilles sur une période d’au moins 30 jours81.
Dans l’ensemble des stratégies de livraison de dsRNA abordées ici pourraient servir à faire taire les insectes gènes spécifiques pour la lutte antiparasitaire. Approvisionnement de dsRNA aux plantes par le biais de l’eau d’irrigation, bassinage racine ou injection de tronc pourrait être une stratégie efficace pour les insectes nuisibles, tels que les mangeoires de racine, pour lesquels aucune méthode efficace de contrôle n’est actuellement disponible. Livraison d’ARNdb en utilisant un transporteur ou stabiliser le support tel que l’argile ou gélose peut être ajouté directement au sol pour l’absorption par les plantes. Une des principales causes de la lenteur des progrès dans le développement de biopesticides moléculaire Arni médiée par a été l’absence de techniques de prestation orale efficace pour initier RNAi efficace et stabilité dans des conditions environnementales83. Administration orale méthodes décrites ici peuvent à l’avenir utiliserait pour décerner acide nucléique médiation gène silencieux traitements planter sap d’alimentation ainsi que mâcher des insectes afin de réduire les dégâts d’insectes dans la production alimentaire mondiale et développement durable écologique antiparasitaire gestion.
Les auteurs n’ont rien à divulguer.
Les auteurs tiennent à remercier Donald Weber et Megan Herlihy (USDA, ARS Beltsville, MD) pour offrir des BMSB et HB pour l’expérimentation et à maintenir les colonies ; et Maria T. Gonzalez, Salvador P. Lopez, (USDA, ARS, Fort Pierce, FL) et Jackie L. Metz (Université de la Floride, Fort Pierce, FL) pour l’entretien de la colonie, préparation des échantillons et des analyses.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
BMSB (H. halys) insects | USDA | ||
ACP (D. citri) insects | USDA | ||
organic green beans | N/A | ||
Citrus plants | USDA | ||
sodium hypochlorite solution | J.T. Baker | ||
green food coloring | McCormick & Co., Inc | ||
Thermo Forma chambers | Thermo Fisher Scientific | ||
Magenta vessel (Culture) | Sigma | ||
Primers | IDT DNA | ||
SensiMix SYBR | Bioline | ||
qPCR ABI 7500 | Applied Biosystems | ||
Spray bottle | N/A | ||
Parafilm | American Can Company | ||
TaKaRa Ex Taq | Clontech | ||
QIAquick | Qiagen |
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