Method Article
Dieses Protokoll beschreibt den Arbeitsablauf zur Gewinnung von Monozyten-abgeleiteten Makrophagen (MDM) aus menschlichen Blutproben, eine einfache Methode zur effizienten Einführung von BiFC-Reportern (Bimolecular Fluorescence Complementation) in das menschliche MDM, ohne die Lebensfähigkeit und das Verhalten der Zellen zu beeinträchtigen, und einen bildgebenden Ansatz zur Messung der entzündlichen Caspase-Aktivierung in lebenden Zellen.
Entzündliche Caspasen umfassen Caspase-1, -4, -5, -11 und -12 und gehören zur Untergruppe der Initiator-Caspasen. Caspase-1 ist erforderlich, um eine korrekte Regulation der Entzündungssignale zu gewährleisten und wird durch näherungsinduzierte Dimerisierung nach der Rekrutierung zu Inflammasomen aktiviert. Caspase-1 ist in der monozytären Zelllinie reichlich vorhanden und induziert die Reifung der entzündungsfördernden Zytokine Interleukin (IL)-1β und IL-18 zu aktiven sezernierten Molekülen. Die anderen entzündlichen Caspasen, Caspase-4 und -5 (und ihre murine homologe Caspase-11) fördern die IL-1β-Freisetzung durch Induktion von Pyroptose. Caspase Bimolecular Fluorescence Complementation (BiFC) ist ein Werkzeug zur Messung der entzündlichen Caspase-induzierten Nähe als Auslesung der Caspase-Aktivierung. Die Caspase-1-, -4- oder -5-Prodomain, die die Region enthält, die an das Inflammasom bindet, ist mit nicht-fluoreszierenden Fragmenten des gelben fluoreszierenden Proteins Venus (Venus-N [VN] oder Venus-C [VC]) verschmolzen, die sich mit der Reform des fluoreszierenden Venuskomplexes verbinden, wenn die Caspasen induzierte Nähe erfahren. Dieses Protokoll beschreibt, wie diese Reporter mittels Nukleofektion in primäre humane Monozyten-abgeleitete Makrophagen (MDM) eingeführt werden, die Zellen behandeln, um eine entzündliche Caspase-Aktivierung zu induzieren, und die Caspase-Aktivierung mittels Fluoreszenz und konfokaler Mikroskopie messen. Der Vorteil dieses Ansatzes besteht darin, dass er verwendet werden kann, um die Komponenten, Anforderungen und Lokalisation des entzündlichen Caspase-Aktivierungskomplexes in lebenden Zellen zu identifizieren. Es müssen jedoch sorgfältige Kontrollen in Betracht gezogen werden, um die Lebensfähigkeit und das Verhalten der Zellen nicht zu beeinträchtigen. Diese Technik ist ein leistungsfähiges Werkzeug für die Analyse dynamischer Caspase-Interaktionen auf Inflammasomenebene sowie für die Abfrage der entzündlichen Signalkaskaden in lebenden MDM und Monozyten, die aus menschlichen Blutproben stammen.
Die Caspasen sind eine Familie von Cystein-Aspartat-Proteasen, die in Initiator-Caspasen und Scharfrichter-Caspases gruppiert werden können. Scharfrichter-Caspasen umfassen Caspase-3, -6 und -7. Sie kommen natürlicherweise in Zellen als Dimere vor und werden von den Initiator-Caspasen gespalten, um Apoptose1 auszuführen. Initiator-Caspasen umfassen menschliche Caspase-1, -2, -4, -5, -8, -9, -10 und -12. Sie werden als inaktive Zymogene (Pro-Caspasen) gefunden, die durch näherungsinduzierte Dimerisierung aktiviert und durch autoproteolytische Spaltung stabilisiert werden 2,3. Die entzündlichen Caspasen sind eine Teilmenge der Initiator-Caspasen2 und umfassen Caspase-1, -4, -5 und -12 beim Menschen sowie Caspase-1, -11 und -12 bei Maus 4,5. Sie spielen keine apoptotische Rolle, sondern eine zentrale Rolle bei Entzündungen. Sie vermitteln die proteolytische Verarbeitung und Sekretion von Pro-Interleukin (IL)-1β und Pro-IL-186,7, den ersten Zytokinen, die als Reaktion aufpathogene Eindringlinge 8,9 freigesetzt werden. Caspase-1 wird bei der Rekrutierung für seine Aktivierungsplattform aktiviert; ein Proteinkomplex mit hohem Molekulargewicht, der als Inflammasom bezeichnet wird (Abbildung 1A)10. Die Dimerisierung von Caspase-4, -5 und -11 erfolgt unabhängig von diesen Plattformen durch einen nicht-kanonischen Inflammasom-Weg11,12.
Kanonische Inflammasomen sind zytosolische multimere Proteinkomplexe, die aus einem Inflammasom-Sensorprotein, dem Adapterprotein ASC (Apoptose-assoziiertes Speck-ähnliches Protein, das eine CARD enthält) und dem Effektorprotein Caspase-110 bestehen. Die am besten untersuchten kanonischen Inflammasomen sind die NOD-ähnliche Rezeptorfamilie, die eine Pyrindomäne (NLRP), NLRP1 und NLRP3 enthält, die NLR-Familie, die eine CARD (NLRC), NLRC4 enthält, und die fehlenden in Melanom 2 (AIM2). Sie enthalten jeweils eine Pyrindomäne, eine CARD oder beide Domänen. Die CARD-Domäne vermittelt die Interaktion zwischen CARD-haltigen Caspasen und ihren Upstream-Aktivatoren. Daher wird das Gerüstmolekül ASC, das aus einer N-terminalen Pyrindomäne (PYD) und einem C-terminalen CARD-Motiv 13,14 besteht, für die Rekrutierung von Caspase-1 zu den NLRP1 10-, NLRP3 15- und AIM2 16-Inflammasomen benötigt.
Jedes Inflammasom ist nach seinem einzigartigen Sensorprotein benannt, das unterschiedliche entzündungsfördernde Reize erkennt (Abbildung 1B). Aktivatoren dieses Pfades werden als kanonische Reize bezeichnet. Inflammasomen dienen als Sensoren für mikrobielle Komponenten und Gewebestress und lösen durch Aktivierung der Entzündungskaspasen eine robuste Entzündungsreaktion aus17. Die Inflammasom-Assemblierung initiiert die Caspase-1-Aktivierung, um die Reifung und Sekretion ihrer Hauptsubstrate pro-IL-1β und pro-IL-18 zu vermitteln. Dieser Prozess erfolgt über einen zweistufigen Mechanismus. Erstens reguliert ein Priming-Stimulus die Expression bestimmter Inflammasom-Proteine und Pro-IL-1β durch Aktivierung des NF-κB-Signalwegs. Zweitens induziert ein intrazellulärer (kanonischer) Reiz die Inflammasom-Assemblierung und Rekrutierung von Prochasase-1 6,7.
Caspase-4 und Caspase-5 sind die menschlichen Orthologe der murinen Caspase-1111. Sie werden inflammasomenunabhängig durch intrazelluläres Lipopolysaccharid (LPS), ein Molekül, das in der äußeren Membran von gramnegativen Bakterien18,19,20 vorkommt, und durch extrazelluläres Häm, ein Produkt der Hämolyse roter Blutkörperchen 21, aktiviert. Es wurde vorgeschlagen, dass LPS direkt an das CARD-Motiv dieser Proteine bindet und ihre Oligomerisierung induziert20. Die Aktivierung von Caspase-4 oder Caspase-5 fördert die IL-1β-Freisetzung, indem sie eine entzündliche Form des Zelltods namens Pyroptose durch Spaltung des porenbildenden Proteins Gasdermin D (GSDMD) 18,19 induziert. Darüber hinaus induziert der Ausfluss von Kaliumionen, die aus Caspase-4 und GSDMD-vermitteltem pyroptotischem Tod resultieren, die Aktivierung des NLRP3-Inflammasoms und die anschließende Aktivierung von Caspase-122,23. Daher gelten Caspase-4, -5 und -11 als intrazelluläre Sensoren für LPS, die in der Lage sind, Pyroptose und Caspase-1-Aktivierung als Reaktion auf spezifische Reize11,24 zu induzieren.
Abbildung 1: Entzündliche Caspasen und Caspase-bimolekulare Fluoreszenzkomplementierung (BiFC) Assay. (A) Diagramm des Caspase-BiFC-Systems, bei dem zwei Caspase-1-Prodomänen (C1-pro), die mit jedem nicht-fluoreszierenden Fragment der Venus (Venus-C oder Venus-N) verbunden sind, für die NLRP3-Aktivierungsplattform rekrutiert werden, wodurch die Venus gezwungen wird, sich zu verformen und zu fluoreszieren. Dieser Komplex erscheint als grüner Fleck unter dem Mikroskop und dient als Auslese für entzündliche Caspase-induzierte Nähe, die der erste Schritt bei der Aktivierung der Initiator-Caspase ist. (B) Schematische Darstellung der Domänenorganisation von Inflammasom-Komponenten und entzündlichen Caspasen. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.
Die Messung der Aktivierung spezifischer Initiatorkaspasen ist schwierig, und es gibt nicht viele Methoden, um dies durch bildgebende Ansätze zu tun. Die bimolekulare Fluoreszenzkomplementation (BiFC) von Caspase kann verwendet werden, um die entzündliche Caspase-Aktivierung direkt in lebenden Zellen sichtbar zu machen (Abbildung 1A)25. Diese Technik wurde kürzlich für den Einsatz in humanen Monozyten-abgeleiteten Makrophagen (MDM) angepasst21. Caspase BiFC misst den ersten Schritt in der entzündlichen Caspase-Aktivierung, induzierte Nähe, um die Dimerisierung zu erleichtern. Es wird die Expression von Plasmiden verwendet, die für die CARD-haltige Caspase-Prodomain kodieren, die mit nicht-fluoreszierenden Fragmenten des photostablen gelben fluoreszierenden Proteins Venus (Venus-C [VC]) und Venus-N [VN] verschmolzen sind. Wenn die beiden Caspase-Prodomänen für ihre Aktivierungsplattform rekrutiert werden oder induzierte Nähe erfahren, werden die beiden Venushälften in die Nähe gebracht und gezwungen, sich umzuformen und zu fluoreszieren (siehe Abbildung 1A,B). Dies bietet eine Echtzeit-Anzeige der spezifischen entzündlichen Caspase-Aktivierung.
Humanes MDM exprimiert reichlich Inflammasom-Gene und Mustererkennungsrezeptoren, die Gefahrensignale und pathogene Produkte identifizieren. Dies bietet einen idealen Zelltyp für die Abfrage von entzündlichen Caspasebahnen. Darüber hinaus können sie aus peripherem Blut und sogar aus Patientenproben gewonnen werden, um die entzündliche Caspase-Aktivierung in einem bestimmten Krankheitszustand zu beurteilen. Dieses Protokoll beschreibt, wie die BiFC-Caspase-Reporter mit Nukleofektion, einer auf Elektroporation basierenden Transfektionsmethode, in MDM eingeführt werden, wie die Zellen behandelt werden, um eine entzündliche Caspase-Aktivierung zu induzieren, und wie die aktiven Caspase-Komplexe mit mikroskopischen Ansätzen sichtbar gemacht werden. Darüber hinaus kann diese Methodik angepasst werden, um die molekulare Zusammensetzung dieser Komplexe, die subzelluläre Lokalisation, die Kinetik und die Größe dieser hochgeordneten Strukturenzu bestimmen 25,26,27.
Dieses Protokoll folgt den Richtlinien der Ethikkommission für Humanforschung des Baylor College of Medicine für die Manipulation menschlicher Proben. Blutproben werden gemäß den institutionellen Sicherheitsrichtlinien für menschliche Proben behandelt. Blutproben werden in einer regionalen Blutbank entnommen, wo sie mit Citratphosphatdextrose (CPD) -Lösung entnommen werden. Blut, das mit anderen Antikoagulanzien wie Natriumheparin, Lithiumheparin oder EDTA gesammelt wird, kann jedoch auch für dieses Protokoll28,29 verwendet werden.
1. Isolierung menschlicher Monozyten und Differenzierung in Makrophagen
Abbildung 2: Schematische Übersicht über den experimentellen Workflow. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
2. Herstellung von Elektroporationskomponenten
HINWEIS: Dieses Protokoll ist für eine 10 μL-Neonspitze (Table of Materials) ausgelegt. Verwenden Sie für jede Transfektion 1-2 x 105 Zellen. Es wird empfohlen, transfizierte Zellen auf einer 48-Well-Platte oder 8-Well-Kammerschale (10 μL-transfizierte Zellen pro Well) zu säen. 1x sterile DPBS (ohne Ca 2+ und Mg2+) können anstelle von PBS verwendet werden.
3. Vorbereitung von Zellen für die Elektroporation
HINWEIS: Die Ausbeute an MDM aus einer 10 cm Schale am Ende der 7-tägigen Differenzierungsperiode beträgt ca. 1,5 x 106 Zellen. 1x sterile DPBS (ohne Ca 2+ und Mg2+) können anstelle von PBS verwendet werden. Dieses Protokoll wurde so optimiert, dass sich die meisten Makrophagen unter Aufrechterhaltung der Lebensfähigkeit und Integrität der Zellen von der Platte lösen. MDM lassen sich nur schwer von Zellkulturplatten lösen. Daher kann es notwendig sein, die Schritte 3.2 und 3.3 zweimal auszuführen, um die Zellen zu dissoziieren. Stellen Sie sicher, dass jede Inkubationszeit mit Trypsin-EDTA (0,25%) 5 Minuten nicht überschreitet.
4. Nukleofektion von Caspase-BiFC-Komponenten in humane Monozyten-abgeleitete Makrophagen
HINWEIS: Dieser Abschnitt des Protokolls wird mit dem Neon Transfection System (Table of Materials) durchgeführt. Dieses Protokoll beschreibt die Schritte zur Transfekt von 1-2 x 105 Zellen mit einer 10 μL Neonspitze (Table of Materials). Wenn Sie eine 100 μL Neonspitze verwenden, skalieren Sie entsprechend nach oben. Vermeiden Sie es, Zellen länger als 15 Minuten dem Respensionspuffer R auszusetzen, da dies die Zelllebensfähigkeit und die Transfektionseffizienz verringern kann.
5. Behandlung der transfizierten MDM- und Caspase-BiFC-Datenerfassung
HINWEIS: Wenn Sie planen, die Zellen mit einem Epifluoreszenz- oder Konfokalmikroskop abzubilden, wird eine Behandlung mit qVD-OPh (20 μM) für 1 h vor der Behandlung mit dem gewählten Reiz empfohlen, um einen caspaseabhängigen Zelltod (vorwiegend Apoptose) zu verhindern. Dies wird in der Bildgebung verwendet, um zu verhindern, dass Zellen aufgrund von Apoptose abheben, was es sehr schwierig macht, sie abzubilden, wenn sie sich aus der Fokusebene bewegen. Beachten Sie, dass die Caspase-Rekrutierung für die Aktivierungsplattform und die damit verbundene Caspase-BiFC nicht von der katalytischen Aktivität der Caspase abhängt und folglich die Caspase-Hemmung diesen Schritt nicht beeinflusst.
Das in Abbildung 2 gezeigte Schema gibt einen Überblick darüber, wie humanes MDM erhalten, transfekt und abgebildet werden kann. Nach der Inkubation der ausgewählten CD14+-Monozyten mit GM-CSF für 7 Tage ändert sich die Zellmorphologie im Laufe der Differenzierungsperiode (Abbildung 3A) von sphärischen Suspensionszellen zu spindeldürren und vollständig gebundenen (Tage 3 und 4), und schließlich zu mehr verteilten Zellen, wenn sie vollständig differenziert sind (Tag 7). Vollständig differenzierte Zellen werden dann von der Platte gelöst und mit den Caspase-BiFC-Paaren (VC und VN) zusammen mit dem Reporterplasmid (z. B. dsRedmito, einem Plasmid, das für ein rotfluoreszierendes Protein kodiert, das auf die Mitochondrien abzielt) transfiziert, das zur Markierung der transfizierten Zellen verwendet wird (Abbildung 3B) und zur Beurteilung der Effizienz der Transfektion nach 24 h verwendet wird. Abbildungen 3B-D zeigt ein Beispiel für BiFC-Ergebnisse unter Verwendung der caspase-1 pro BiFC-transfizierten Zellen, die 20 h lang mit Nigericin (5 μM) behandelt wurden, einem bekannten entzündungsfördernden Reiz, der die Montage des NLRP3-Inflammasoms30,31 auslöst. Unbehandelte Zellen zeigen keine Venusfluoreszenz (Abbildung 3B), und in mit Nigericin behandelten Zellen erscheint Caspase-1 BiFC als einzelnes Punctum mit der typischen Form von ASC-Flecken 32,33,25 (Abbildung 3C). Abbildung 3D zeigt ein Beispiel für die Quantifizierung von Venus-positivem MDM. Der höchste Prozentsatz an Caspase-1 BiFC wird in der LPS + Nigericin-Behandlungsgruppe beobachtet (Abbildung 3D). Dieses Ergebnis steht im Einklang mit der Aktivierung eines kanonischen Inflammasoms, bei dem sowohl ein Priming-Signal (LPS) als auch ein intrazelluläres Signal (Nigericin für die Aktivierung von Capase-1) erforderlich sind.
Abbildung 3: Differenzierung von CD14-Monozyten und Transfektion von humanem MDM. (A) Repräsentative Hellfeldbilder von CD14+-Monozyten aus peripherem Blut, die an den Tagen 1, 3, 4 und 7 der Differenzierung bei GM-CSF exponiert wurden (Skalenbalken, 100 μm). (B-C) Humanes MDM wurde mit Caspase-1 pro BiFC-Paaren und dem Transfektionsreporter dsRedmito (50 ng, rot) transfiziert. 24 h später wurden die Zellen mit und ohne LPS (100 ng/ml) für 3 h grundiert und 20 h lang mit Nigericin (5 μM) in Bildgebungsmedium behandelt. Es werden repräsentative konfokale Bilder von unbehandelten und mit Nigericin behandelten Zellen gezeigt (Maßstabsstab, 10 μm). Der BiFC ist grün dargestellt. (D) Zellen von (C) wurden auf den Prozentsatz der dsRedmito-positiven Zellen (rote, transfizierte Zellen) untersucht, die Venus-positiv (grün, Caspase-1 BiFC-Komplex) bei 20 h waren. Fehlerbalken stellen SD von mindestens zwei unabhängigen Zählungen pro Bohrloch dar. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung zu sehen.
Ein Beispiel für die Plasmidtitration ist in Abbildung 4 dargestellt, wo zunehmende Mengen jedes BiFC-Plasmids transfiziert werden. Dies ermöglicht die Auswahl der optimalen Plasmiddosis, was zu einem spezifischen Signal und einem minimalen Hintergrund führt. Abbildung 4A zeigt die Ergebnisse von humanem MDM, das mit steigenden Konzentrationen der Caspase-1-, -4- und -5-Pro-BiFC-Paare (VC und VN) transfiziert wurde, die mit Häm behandelt wurden, einem stark entzündungsfördernden Molekül, das aus der Zerstörung roter Blutkörperchen resultiert34. Der höchste Prozentsatz an Venus-positiven Zellen für Caspase-1-, -4- und -5-Pro-BiFC-Paare ergibt sich aus 400 ng, 500 ng bzw. 1000 ng transfiziertem Plasmid. Die Verwendung der höchsten Menge an Plasmid birgt jedoch auch das Risiko, den unspezifischen Hintergrund zu erhöhen (Abbildung 4B). Zum Beispiel führt die Transfektion von 1000 ng des Caspase-5 pro BiFC-Paares zu fast 40% unspezifischem Hintergrund. Daher wird die Verwendung der unteren 700 ng-Menge für dieses Plasmidpaar als optimal angesehen (Abbildung 4B). In Abbildung 4C sind repräsentative konfokale Bilder gezeigt, die mit einem 20-fachen Objektiv eines Zellfeldes von 24 h nach der Transfektion erhalten wurden. In diesem Bild kann man sehen, dass die unbehandelten transfizierten Zellen aufgrund des Aussehens der Mitochondrien (Mitochondrien in toten Zellen sind stark fragmentiert) und der Morphologie der Zellen (apoptotische Zellen werden geschrumpft) lebensfähig sind. Nach der Behandlung mit Häm erscheint der Caspase-1-Komplex als ein einzelnes grünes Punctum, das dem durch Nigericin in Abbildung 3C induzierten Punctum ähnelt, und sein Auftreten wurde von einer Zellschrumpfung begleitet.
Abbildung 4: Humanes MDM, transfiziert mit unterschiedlichen Mengen an entzündlichen Caspase pro BiFC-Paaren. (A) Titration von Caspase-1 pro; Caspase-4 Pro; oder caspase-5 pro BiFC Paare. Humanes MDM wurde mit den angegebenen Mengen der Caspase pro BiFC-Paare mit dsRedmito als Transfektionsreporter (50 ng) transfiziert und über Nacht inkubiert. Am nächsten Tag wurde das Kulturmedium aus allen Vertiefungen entfernt und die Zellen mit und ohne Häm (50 μM) in 0,1% FBS-Medium behandelt. Nach 1 h wurde eine gleiche Menge an vollständigem Medium in alle Vertiefungen gegeben, um die FBS-Konzentration auf 5% zu rekonstruieren und zu verhindern, dass Häm die Zellen abtötet. Nach einer Gesamtbehandlung von 20 h wurden die Zellen auf den Prozentsatz der dsRedmito-positiven transfizierten Zellen untersucht, die Venus-positiv waren, bestimmt aus einem Minimum von 300 Zellen pro Well. Fehlerbalken stellen SD von mindestens drei unabhängigen Zählungen pro Bohrloch dar. (B) Humanes MDM wurde mit ausgewählten Mengen von Caspase-1 pro transfiziert; Caspase-4 Pro; oder caspase-5 pro BiFC-Paare, zusammen mit dsRedmito (50 ng) als Reporter für Transfektion. 24 h nach der Transfektion wurden die Zellen mit oder ohne Häm (50 μM) in 0,1% FBS behandelt. Nach 1 h wurde FBS zu 5% rekonstituiert, um extrazelluläres Häm zu hemmen. Die Zellen wurden auf den Prozentsatz der dsRedmito-positiven Zellen (rote, transfizierte Zellen) untersucht, die Venus-positiv waren (grüner, caspase BiFC-Komplex) bei 20 h aus einem Minimum von 300 Zellen pro Well. Die Ergebnisse werden als Prozentsatz der Venus-positiven Zellen dargestellt. Fehlerbalken stellen SD von mindestens drei unabhängigen Zählungen pro Bohrloch dar. (C) Repräsentative konfokale Bilder, die mit einem 20-fachen Objektiv eines Zellfeldes 24 h nach der Transfektion aufgenommen und mit und ohne Häm gemäß (B) behandelt wurden. Rot: dsRedmito-positive Zellen; Grün: Venus-positive Zellen; Maßstabsstab, 20 μm. Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieser Abbildung anzuzeigen.
Dieses Protokoll beschreibt den Arbeitsablauf zur Gewinnung von Makrophagen aus Monozyten, die aus menschlichen Blutproben isoliert wurden, und eine Methode, um die entzündlichen Caspase-BiFC-Reporter effizient in das menschliche MDM einzuführen, ohne die Lebensfähigkeit und das Verhalten der Zellen zu beeinträchtigen.
Dieses Protokoll nutzt die BiFC-Technik35, um die entzündlichen Caspasen an der Caspase-Rekrutierungsdomäne (CARD) mit nicht-fluoreszierenden Fragmenten des gespaltenen fluoreszierenden Proteins Venus zu markieren. Entzündliche Caspasen kodieren eine katalytische Domäne, die aus einer großen (p20) und einer kleinen (p10) Untereinheit besteht, und einem konservierten Protein-Protein-Interaktionsmotiv, das an ihrem N-Terminus oder Prodomäne36 als CARD bezeichnet wird (Abbildung 1B). Die Rekrutierung von entzündlichen Caspasen zu ihren Aktivierungsplattformen ist abhängig von einer intakten CARD. Für diesen Ansatz werden zwei Caspase-Prodomain-Konstrukte (kodiert das CARD-Motiv) erzeugt, die jeweils mit den nicht-fluoreszierenden Fragmenten des fotostabilen gelben Proteins Venus (Venus-C [VC]) und Venus-N [VN]) verknüpft sind, zusammen mit einem fluoreszierenden Transfektionsreporter, um die Visualisierung der Zellen vor oder in Abwesenheit der Aktivierung des Caspase-BiFC-Reporters zu ermöglichen. Fluoreszenz wird nur beobachtet, wenn wechselwirkende Proteine nahe genug kommen, um eine Dimerisierung und Aktivierung zu ermöglichen (siehe Abbildung 1A). Die Effizienz dieses Prozesses kann mit einer Standard-Epifluoreszenz oder einem konfokalen Mikroskop quantifiziert werden. In Kombination mit der Einzelzellbildgebung ermöglicht dieses Protokoll die Visualisierung asynchroner Ereignisse, die in Massenpopulationen möglicherweise nicht unterscheidbar sind, und kann je nach Auflösung der Bilder verwendet werden, um die Größe und Lokalisierung des BiFC-Komplexes zu bestimmen, der jeder Caspase zugeordnet ist.
Dieses Protokoll kann an eine Reihe von Proteinen angepasst werden, die durch Oligomerisierung aktiviert werden, und seine Anwendbarkeit ist nicht auf Mikroskopiemethoden beschränkt. Dieser Ansatz ermöglicht auch die Untersuchung der differentiellen Anforderungen an die Assemblierung von entzündlichen Caspasen. Zum Beispiel kann siRNA verwendet werden, um vorgelagerte Komponenten/Anforderungen für eine spezifische entzündliche Caspase-Aktivierung zu identifizieren. Die Caspase-BiFC-Sonden und der siRNA-Oligo (der verwendet wird, um ein Zielprotein zum Schweigen zu bringen) können gleichzeitig in MDM transfiziert werden. Dies kann potenzielle Proteinpartner oder wesentliche Komponenten jeder Aktivierungsplattform identifizieren. Zum Beispiel wurde ein siRNA-Oligo, der auf das ASC-Adaptermolekül abzielt, das für die Montage der NLRP1-, NLRP3- und AIM2-Inflammasomen benötigt wird, verwendet, um zu zeigen, dass die Häm-induzierte Aktivierung von Caspase-1 diese kanonischen Inflammasomen erfordert, während Caspase-4 und -5 nicht21 waren. Diese Methodik kann auch an die Zeitraffermikroskopie angepasst werden, so dass die Kinetik der entzündlichen Kaspaseaktivierung in einzelnen Zellen bestimmt werden kann. Mit einem solchen Ansatz kann man beurteilen, wann eine Caspase-Dimerisierung auftritt, indem man den Zeitpunkt des Auftretens des BiFC-Beginns relativ zu dem Zeitpunkt, zu dem die Zelle den Tod erleidet, genau erkennt, indem der Fluoreszenzverlust des Transfektionsreporters (mCherry) als Hinweis auf eine Zelllyse überwacht wird. Es gibt mehrere Möglichkeiten, Caspase-BiFC-Daten zu erfassen und zu analysieren. Die Wahl hängt von der zu beantwortenden Frage und der Art des verfügbaren Mikroskops und der verfügbaren Software ab. Zum Beispiel können Einzelzeitpunktdaten, die zur Bestimmung der Effizienz der Aktivierung sowie zur Zeitrafferanalyse verwendet werden, besonders effektiv sein, wenn eine von einer Mikroskopsoftware bereitgestellte automatische Erfassungsfunktion verfügbar ist. Dies ermöglicht eine objektive Bildgebung, da vorgegebene Positionen Arrays aus jedem Bohrloch einer Multi-Well-Platte erfasst werden. Bilder können sowohl durch visuelle Inspektion als auch durch die Verwendung automatisierter Bildgebungssoftware wie CellProfiler, ImageJ oder MATLAB quantifiziert werden, um die Genauigkeit und Objektivität zu erhöhen.
Die Untersuchung von Caspase-Signalwegen in Primärzellen ist unerlässlich, um die physiologischen Rollen dieser Proteine vollständig zu verstehen. Da Caspase-4 und Caspase-5 in Mäusen durch eine einzige Caspase-11 ersetzt werden, ist es außerdem wichtig, menschliche Zellen beurteilen zu können. Aufgrund der geringen Transfektionseffizienzen und Toxizitäten, die mit vielen Abgabesystemen in Primärzellen verbunden sind, kann es jedoch schwierig sein, den Einsatz verfügbarer plasmidbasierter Reporter zu maximieren. Das Entzündungskaspase-BiFC-Protokoll beschreibt eine einfache Methode zur Transfektierung von MDM aus peripherem Blut von Patienten oder gesunden Probanden, wodurch die Anzahl der pro Transfektion erforderlichen Zellen reduziert wird. Dies ermöglicht es den Forschern, komplexere Experimente mit wertvollen Zellen wie Makrophagen durchzuführen, ohne die Zelllebensfähigkeit und die zellulären Eigenschaften zu beeinträchtigen. Die Möglichkeit, Patientenproben zu verwenden, bietet einen großen Vorteil, wenn es darum geht, die entzündliche Caspase-Aktivierung in bestimmten Krankheitszuständen beurteilen zu können. In der Tat könnte dieses Protokoll mit einigen kleineren Optimierungen leicht an andere murine oder menschliche Primärzellen angepasst werden.
Dieses Protokoll verwendet einen auf Elektroporation basierenden Ansatz zur Transfektion von MDM. Das Neon-System ist besonders vorteilhaft, da es keine IFN-γ-Antwort im MDM induziert, die die spezifische Immunantwort der Zellenstören könnte 37. Dies ist ein kleines Elektroporationssystem, das ein Transfektionsvolumen von 10 μL mit einer hohen Zelldichte verwendet, um den effizienten Transfer exogener DNA auf eine große Anzahl von Zellen zu ermöglichen. Es erzeugt temporäre Poren in der Zellmembran, so dass Plasmide schnell passieren können, wodurch die späte Endozytose vermieden wird, die während der chemischen Transfektion auftritt und den Plasmidabbau auslösen kann. Dieses Protokoll verwendet eine Pufferformulierung auf organischer Säurebasis (Puffer R), die im Vergleich zu anderen Puffern mit Chloridionen38 eine minimale Zelltoxizität einführt. Das geringe Volumen und das Design der Pipettenspitzenkammer tragen dazu bei, ein gleichmäßiges elektrisches Feld zu erzeugen, um physiologische Bedingungen aufrechtzuerhalten, was zu hohen Überlebensraten führt. Transfektionseffizienz und Zellüberleben hängen stark von der chemischen Zusammensetzung des Puffers, der Zelldichte, der Stärke des Pulses und der Plasmidkonzentrationab 39. Daher ist es wichtig, diese Bedingungen für jeden Zelltyp und jedes eingeführte Plasmid zu optimieren. Im MDM lieferten niedrigere Spannungen mit längeren Pulsdauern Plasmide effizienter und hielten die Zellen lebensfähig und gesund. Folglich waren die für dieses Protokoll verwendeten Einstellungen 1000 V und 2 Impulse von 40 ms, was zu Transfektionseffizienzen zwischen 40-60% mit einer Zelllebensfähigkeit von mehr als 90% führte, basierend auf der Fähigkeit der Zellen, sich nach der Transfektion wieder an die Platte zu heften. Während dieses Protokoll für menschliches MDM optimiert ist, können die Spannungseinstellungen von 500 V bis 1700 V, die Erhöhung der Anzahl der Impulse von 1 auf 3 und das Testen der Länge von Impulsen im Bereich von 10 bis 40 ms die Transfektionseffizienz und die Zelllebensfähigkeit in zusätzlichen Zelltypen und experimentellen Umgebungen ausgleichen.
Es gibt mehrere wichtige Überlegungen für den optimalen Einsatz der BiFC-Technik. 1) Es ist wichtig, dass der Benutzer die optimale Menge jedes einzubringenden Caspaseplasmids bestimmt, da dies für verschiedene Proteine und Zelltypen variieren kann. Dies ist erforderlich, um eine maximale Sensitivität und Spezifität des Assays zu gewährleisten. Es wird empfohlen, eine Pilottitration der Caspase-BiFC-Plasmide (VC- und VN-Fragmente) zwischen 200 ng und 1000 ng durchzuführen, wie in den Abbildungen 4A-B dargestellt. Der optimale Bereich des eingeführten Plasmids unterscheidet sich für jede einzelne Caspase und muss daher individuell beurteilt werden. Wählen Sie eine Plasmidmenge, die das höchste spezifische Signal mit minimalem Hintergrund liefert. Idealerweise sollte der Hintergrundpegel weniger als 10% betragen, aber bis zu 20% können verwendet werden, wenn das spezifische Signal hoch ist. Es ist auch wichtig, raue Bedingungen und übermäßige Manipulation dieser Zellen während der Differenzierung, Transfektion und Behandlung zu vermeiden. Dies kann auch zu einer spontanen Aktivierung und hohen Hintergrundwerten der Caspase-Aktivierung führen, die die spezifischen Ergebnisse verschleiern können, da die Aktivierung von Immunzellen wie Monozyten oder Makrophagen ein natürlicher Prozess ist, bei dem sie entzündungsfördernde Funktionen erwerbenkönnen 40. Bei der Verwendung von Patientenzellen kann es schwierig sein, eine inhärente Variation der Inflammasom-Aktivierung und des genetischen Hintergrunds zu kontrollieren, die sie für Reize und Veränderungen in ihrer lokalen Mikroumgebung sensibilisieren oder desensibilisieren kann. Zum Beispiel kann die Makrophagenfunktion bei immungeschwächten Personen oder Personen, die eine Infektion bekämpfen, beeinträchtigt werden, da diese Art von Zelle wichtige homöostatische Funktionen erfüllt und unter anderem an der Kontrolle von Entzündungen beteiligt ist. Diese genetischen und Umweltfaktoren müssen berücksichtigt werden, wenn festgestellt wird, ob ein hoher Hintergrund unspezifisch oder eine biologische Wirkung ist. Die Verwendung eng aufeinander abgestimmter gesunder Kontrollen (z. B. abgestimmt auf Geschlecht und Alter) kann helfen, die biologische Bedeutung eines hohen Hintergrundgehalts an Caspase BiFC zu beurteilen. 2) Es ist wichtig, dass die VC- und VN-Fragmente in gleichen Mengen eingeführt werden, da eine ungleiche Expression eines Venusfragments zu einer Rekrutierung auf der Plattform bei höheren Frequenzen führen und das volle fluoreszierende Signal maskieren könnte, was zu einem falsch negativen Ergebnis führt. Daher sollte die Integrität und Konzentration jedes einzelnen Plasmids vor jeder Transfektion validiert werden, um zu vermeiden, dass unterschiedliche Mengen der VC- und VN-Fragmente eingeführt werden. 3) Da dieser Ansatz auf der exogenen Expression der Caspase-Reporter basiert, sollten zusätzliche Kontrollen für die Spezifität einbezogen werden. Caspase-BiFC-Konstrukte, die Einzelpunktmutationen enthalten, die die Bindung zwischen der Caspase und ihrer Aktivierungsplattform oder das Stummschalten einer der Komponenten der Aktivierungsplattform unter Verwendung von siRNA stören, können verwendet werden, um zu bestätigen, dass das Fluoreszenzsignal auf eine spezifische Bindung der Caspase an das Inflammasom zurückzuführen ist. Dieses Kontrollexperiment sollte zu verminderten Spiegeln von Venus-positiven Zellen führen. 4) Die Expression der Caspase-BiFC-Konstrukte könnte nachgelagerte Ereignisse wie den Zelltod auslösen oder beeinflussen. Um dies zu umgehen, werden für die BiFC-Reporter nicht-enzymatische Versionen der Caspase empfohlen, wie die Caspase-Prodomäne oder die Full-Length-Caspase, bei der der katalytische Cysteinrest mutiert und inaktiviert wird. Um dies weiter zu kontrollieren, sollten nicht transfizierte behandelte und unbehandelte Kontrollbrunnen in das Experiment einbezogen werden und ein ähnliches Verhalten wie die transfizierten Vertiefungen zeigen. 5) Die endogene Caspase-Aktivität könnte sich möglicherweise auf die BiFC-Anzeige auswirken. Um dies zu kontrollieren, kann man den Caspase-Reporter in Zellen ausdrücken, die für die untersuchte Caspase mangelhaft sind, mit der Erwartung, dass die BiFC-Effizienz gleich wäre.
Einer der Hauptnachteile dieses Ansatzes besteht darin, dass er nicht die Caspaseaktivierung an sich misst, sondern den induzierten Annäherungsschritt, der für die Aktivierung erforderlich ist. Dies ist eine subtile, aber wichtige Unterscheidung. Die Prodomäne enthält nicht die katalytischen Domänen der Caspase, die tatsächlich dimerisieren. Daher wirken die Umfaltung und Fluoreszenz der Venusfragmente als Stellvertreter für die Caspase-Dimerisierung, da sie sich nur dann zurückbilden können, wenn die Caspasen nahe genug sind, um zu dimerisieren. Somit misst der BiFC gezielt die induzierte Nähe. Es ist möglich, dass posttranslationale Modifikationen in den katalytischen Domänen die Dimerisierung behindern könnten, ohne das BiFC-Signal zu beeinflussen. Zum Beispiel wird Caspase-2 auf seiner katalytischen Domäne phosphoryliert, was die Dimerisierung behindert, ohne die Rekrutierung von Caspase-2 auf seiner Aktivierungsplattform41 zu verhindern. Daher müssen Beobachtungen mit dem BiFC-Ansatz durch funktionelle Studien ergänzt werden, um zu bestätigen, dass die beobachtete Fluoreszenz repräsentativ für die Caspase-Aktivierung ist. Trotz dieses Nachteils kann die Messung der induzierten Nähe durch Caspase BiFC, wenn die hier diskutierten Kontrollen einbezogen werden, eine genaue Darstellung der spezifischen Caspase-Aktivierung liefern.
Zusammenfassend lässt sich sagen, dass Caspase BiFC ein leistungsfähiges Werkzeug für die Analyse dynamischer Caspase-Interaktionen auf der Inflammasom-Ebene ist. Dieses Protokoll ermöglicht die Abfrage der entzündlichen Caspase-Signalkaskaden in lebenden Immunzellen. Dieser Ansatz bietet nicht nur eine Technik, um den ersten Schritt in der Caspase-Aktivierung spezifisch und genau zu messen, sondern hat durch die Anwendung auf primäre Immunzellen auch das Potenzial, Eigenschaften von entzündlichen Caspasen aufzudecken, die mit herkömmlichen Methoden nicht identifiziert werden konnten.
Die Autoren erklären, dass sie keine konkurrierenden finanziellen Interessen haben.
Wir danken den Mitgliedern des LBH-Labors in Vergangenheit und Gegenwart, die zur Entwicklung dieser Technik beigetragen haben. Dieses Lab wird unterstützt von NIH/NIDDK T32DK060445 (BEB), NIH/NIDDK F32DK121479 (BEB), NIH/NIGMS R01GM121389 (LBH). Abbildung 2 wurde mit der Biorender-Software gezeichnet.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
48 well tissue culture2:34 plates | Genesee Scientific | 25-108 | |
10 cm Tissue Culture Dishes | VWR | 25382-166 | |
2 Mercaptoethanol 1000x | Thermo Fisher Scientific | 21985023 | |
8 well chambered coverglass with 1.5 HP coverglass | Cellvis | c8-1.5H-N | |
AutoMACS columns | Miltenyi (Biotec) | 130-021-101 | For automated separation using AutoMACS Pro Separator only |
AutoMACS Pro Separator | Miltenyi (Biotec) | 130-092-545 | For automated separation using AutoMACS Pro Separator only |
AutoMACS Pro Washing Solution | Miltenyi (Biotec) | 130-092-987 | For automated separation using AutoMACS Pro Separator only |
AutoMACS Rinsing Solution | Miltenyi (Biotec) | 130-091-222 | For automated separation using AutoMACS Pro Separator only |
AutoMacs running buffer | Miltenyi (Biotec) | 130-091-221 | For manual or automated separation using QuadroMACS or AutoMACS pro Separator |
Axio Observer Z1 motorized inverted microscope equipped with a CSU-X1A 5000 spinning disk unit | Zeiss | Any confocal microscope equipped with a laser module fitted with laser lines of 568 nm (RFP) and 488 or 512 nm (GFP or YFP) wavelengths can be used | |
AxioObserver A1, Research Grade Inverted Microscope | Zeiss | Any epifluorescence microscope with fluorescence filters capable of exciting 568 nm (RFP) and 488 or 512 nm (GFP or YFP) wavelengths can be used | |
CD14+ MICROBEADS | Miltenyi (Biotec) | 130-050-201 | For manual or automated separation using QuadroMACS or AutoMACS pro Separator |
DPBS without calcium chloride and magnesium chloride | Sigma | D8537-6x500ML | |
DsRed mito plasmid | Clontech | 632421 | Similar plasmids that can be used as fluorescent reporters can be found on Addgene |
Fetal Bovine Serum | Thermo Fisher Scientific | 10437028 | |
Ficoll-Paque PLUS 6 x 100 mL | Sigma | GE17-1440-02 | |
GlutaMAX Supplement (100x) | Thermo Fisher Scientific | 35050079 | |
GM-CSF | Thermo Fisher Scientific | PHC2011 | |
Hemin BioXtra, from Porcine, ≥96.0% (HPLC) | Sigma | 51280-1G | |
HEPES | Thermo Fisher Scientific | 15630106 | |
Inflammatory caspase BiFC plasmids | Available by request from LBH lab | ||
LPS-EB Ultrapure | Invivogen | TLRL-3PELPS | |
LS Columns | Miltenyi (Biotec) | 130-042-401 | For manual separation using QuadroMACS Separator only |
MACS 15 mL Tube Rack | Miltenyi (Biotec) | 130-091-052 | For manual separation using QuadroMACS Separator only |
MACS MultiStand | Miltenyi (Biotec) | 130-042-303 | For manual separation using QuadroMACS Separator only |
mCherry plasmid | Yungpeng Wang Lab | Similar plasmids that can be used as fluorescent reporters can be found on Addgene | |
Neon Transfection System | Thermo Fisher Scientific | MPK5000 | Includes Neon electroporation device, pipette and pipette station |
Neon Transfection System 10 µL Kit | Thermo Fisher Scientific | MPK1096 | Includes resuspension buffer R, resuspension buffer T, electrolytic buffer E, 96 x 10 µL Neon tips and Neon electroporation tubes |
Nigericin sodium salt, ready made solution | Sigma | SML1779-1ML | |
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | |
Poly-D-Lysine Hydrobromide | Sigma | P7280-5mg | |
QuadroMACS Separator | Miltenyi (Biotec) | 130-090-976 | For manual separation using QuadroMACS Separator only |
qVD-OPh | Fisher (ApexBio) | 50-101-3172 | |
RPMI 1640 Medium | Thermo Fisher Scientific | 11875119 | |
Trypsin-EDTA (0.25%), phenol red | Thermo Fisher Scientific | 25200072 | |
UltraPure 0.5 M EDTA, pH 8.0 | Thermo Fisher Scientific | 15575020 | |
Zeiss Zen 2.6 (blue edition) software | Zeiss | Any software used to operate the confocal microscope of choice |
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